FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6645, 285 aa 1>>>pF1KE6645 285 - 285 aa - 285 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4648+/-0.000889; mu= 13.7929+/- 0.053 mean_var=62.3679+/-12.568, 0's: 0 Z-trim(104.9): 25 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.162403 statistics sampled from 8119 (8132) to 8119 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16 Scan time: 1.910 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS44210.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 ( 285) 1951 465.8 1.6e-131 CCDS44209.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 ( 464) 1907 455.6 3.1e-128 CCDS926.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 ( 533) 1907 455.6 3.6e-128 CCDS1293.2 FMO2 gene_id:2327|Hs108|chr1 ( 535) 1271 306.6 2.6e-83 CCDS1295.1 FMO4 gene_id:2329|Hs108|chr1 ( 558) 1183 286.0 4.3e-77 CCDS1292.1 FMO3 gene_id:2328|Hs108|chr1 ( 532) 1163 281.3 1.1e-75 CCDS1294.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 ( 532) 1159 280.3 2e-75 CCDS60351.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 ( 469) 631 156.6 3.1e-38 >>CCDS44210.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 (285 aa) initn: 1951 init1: 1951 opt: 1951 Z-score: 2474.7 bits: 465.8 E(32554): 1.6e-131 Smith-Waterman score: 1951; 100.0% identity (100.0% similar) in 285 aa overlap (1-285:1-285) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRSKDIALTE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRSKDIALTE 250 260 270 280 >>CCDS44209.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 (464 aa) initn: 1943 init1: 1907 opt: 1907 Z-score: 2415.6 bits: 455.6 E(32554): 3.1e-128 Smith-Waterman score: 1907; 99.6% identity (100.0% similar) in 278 aa overlap (1-278:1-278) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS44 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRSKDIALTE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::. 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CCDS12 RSMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKV 240 250 260 270 280 290 CCDS12 KSTVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPA 300 310 320 330 340 350 >>CCDS1295.1 FMO4 gene_id:2329|Hs108|chr1 (558 aa) initn: 1183 init1: 1183 opt: 1183 Z-score: 1497.6 bits: 286.0 E(32554): 4.3e-77 Smith-Waterman score: 1183; 58.7% identity (84.4% similar) in 269 aa overlap (4-272:3-271) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI :..::::.::::::::::::.: :::.::::.:::::::.: :. ..: . .:::.. 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CCDS12 QNMLRNSLPTPIVTWLMERKINNWLNHANYGLIPEDRTQLKEFVLNDELPGRIITGKVFI 240 250 260 270 280 290 CCDS12 RPSIKEVKENSVIFNNTSKEEPIDIIVFATGYTFAFPFLDESVVKVEDGQASLYKYIFPA 300 310 320 330 340 350 >>CCDS60351.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 (469 aa) initn: 876 init1: 631 opt: 631 Z-score: 799.8 bits: 156.6 E(32554): 3.1e-38 Smith-Waterman score: 736; 44.2% identity (63.0% similar) in 276 aa overlap (4-279:3-215) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI ::.:..:.:::::.:::::.::::::.::::.::.:::::: CCDS60 MAKRVAIVGAGVSGLASIKCCLEEGLEPTCFERSDDLGGLWRF---------------- 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF :.: :::: : : CCDS60 --TTK---------------------------------------------VCSVTKCSDS 50 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP :.:::::::: : :.: .::.:::::: :: .:::.:::::. :::::::::.::.: CCDS60 AVSGQWEVVTMHEEKQESAIFDAVMVCTGFLTNPYLPLDSFPGINAFKGQYFHSRQYKHP 60 70 80 90 100 110 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL . : :::..::.:::: :.::: :. :..::::: :.:...:. : ::: :..: .:. CCDS60 DIFKDKRVLVIGMGNSGTDIAVEASHLAEKVFLSTTGGGWVISRIFDSGYPWDMVFMTRF 120 130 140 150 160 170 250 260 270 280 pF1KE6 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRSKDIALTE ... . ... .:.:::. ..: .:: :. :.. CCDS60 QNMLRNSLPTPIVTWLMERKINNWLNHANYGLIPEDRTQLKEFVLNDELPGRIITGKVFI 180 190 200 210 220 230 CCDS60 RPSIKEVKENSVIFNNTSKEEPIDIIVFATGYTFAFPFLDESVVKVEDGQASLYKYIFPA 240 250 260 270 280 290 285 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 15:04:25 2016 done: Tue Nov 8 15:04:25 2016 Total Scan time: 1.910 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]