FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6255, 762 aa 1>>>pF1KB6255 762 - 762 aa - 762 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9250+/-0.00106; mu= 16.8513+/- 0.063 mean_var=69.9209+/-14.166, 0's: 0 Z-trim(103.3): 19 B-trim: 24 in 2/46 Lambda= 0.153381 statistics sampled from 7359 (7367) to 7359 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16 Scan time: 3.070 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS861.1 PHTF1 gene_id:10745|Hs108|chr1 ( 762) 5031 1123.0 0 CCDS81359.1 PHTF1 gene_id:10745|Hs108|chr1 ( 637) 4216 942.6 0 CCDS47622.1 PHTF2 gene_id:57157|Hs108|chr7 ( 747) 1782 404.0 4.4e-112 CCDS47621.1 PHTF2 gene_id:57157|Hs108|chr7 ( 751) 1782 404.0 4.5e-112 CCDS47624.1 PHTF2 gene_id:57157|Hs108|chr7 ( 352) 822 191.5 2e-48 CCDS47623.1 PHTF2 gene_id:57157|Hs108|chr7 ( 356) 804 187.5 3.2e-47 >>CCDS861.1 PHTF1 gene_id:10745|Hs108|chr1 (762 aa) initn: 5031 init1: 5031 opt: 5031 Z-score: 6011.0 bits: 1123.0 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5031; 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CCDS47 EVSSEEGPETGYS---LRRHVDRTS--EGV-LRNRKS----H---HYKK------HYPNE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KB6 SDSLAESEFESAAFSQGSRSGVSGGSRSLNMSRRDSESTRHDSETEDMLWDDLLHGPECR . . .::.: .:: . ::.::::.: .:::::.::.:::: ::. CCDS47 D---------------APKSGTSCSSRC-SSSRQDSESARPESETEDVLWEDLLHCAECH 340 350 360 370 400 410 420 430 440 450 pF1KB6 SSVTSDSEGAHVNTLHSGTKRDPKEDVFQQNHLFWLQNSSPSSDRVSAIIWEGNECKKMD :: ::... .. . .. .:.. ..: :.:.:: ::..: :. ...:::.::::.::: : CCDS47 SSCTSETD-VENHQINPCVKKEYRDDPFHQSHLPWLHSSHPGLEKISAIVWEGNDCKKAD 380 390 400 410 420 430 460 470 480 490 500 510 pF1KB6 MSVLEISGIIMSRVNAYQQGVGYQMLGNVVTIGLAFFPFLHRLFREKSLDQLKSISAEEI ::::::::.::.:::.. :.:::..::.:.. :.. ::. :: . .:.:: . :: :. CCDS47 MSVLEISGMIMNRVNSHIPGIGYQIFGNAVSLILGLTPFVFRLSQATDLEQLTAHSASEL 440 450 460 470 480 490 520 530 540 550 560 570 pF1KB6 LTLFCGAPPVTPIIVLSIINFFERLCLTWMFFFMMCVAERTYKQRFLFAKLFSHITSARK .. :. . .. . ::.: :. :.:.:::..::::::::::.::::::.:.::::. CCDS47 YVIAFGSNEDVIVLSMVIISFVVRVSLVWIFFFLLCVAERTYKQRLLFAKLFGHLTSARR 500 510 520 530 540 550 580 590 600 610 620 630 pF1KB6 ARKYEIPHFRLKKVENIKIWLSLRSYLKRRGPQRSVDVVVSSVFLLTLSIAFICCAQVLQ ::: :.::::::::.:::.:::::::::::::::::::.:::.::::.:..::::::.:. 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