Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4232
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4232, 825 aa
1>>>pF1KE4232 825 - 825 aa - 825 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9824+/-0.000935; mu= 8.3499+/- 0.056
mean_var=145.5356+/-29.449, 0's: 0 Z-trim(110.2): 77 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.106314
statistics sampled from 11373 (11449) to 11373 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.698), E-opt: 0.2 (0.352), width: 16
Scan time: 3.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS745.1 BCAR3 gene_id:8412|Hs108|chr1 ( 825) 5569 866.4 0
CCDS58010.1 BCAR3 gene_id:8412|Hs108|chr1 ( 734) 4739 739.0 6.6e-213
CCDS76181.1 BCAR3 gene_id:8412|Hs108|chr1 ( 501) 3346 525.3 9.9e-149
CCDS48028.1 SH2D3C gene_id:10044|Hs108|chr9 ( 506) 1140 187.0 7.1e-47
CCDS12173.1 SH2D3A gene_id:10045|Hs108|chr19 ( 576) 849 142.4 2.2e-33
CCDS6877.1 SH2D3C gene_id:10044|Hs108|chr9 ( 860) 792 133.7 1.3e-30
CCDS6878.1 SH2D3C gene_id:10044|Hs108|chr9 ( 703) 780 131.8 3.9e-30
CCDS59145.1 SH2D3C gene_id:10044|Hs108|chr9 ( 792) 780 131.8 4.4e-30
CCDS48027.1 SH2D3C gene_id:10044|Hs108|chr9 ( 700) 770 130.3 1.1e-29
CCDS48026.1 SH2D3C gene_id:10044|Hs108|chr9 ( 702) 766 129.7 1.7e-29
>>CCDS745.1 BCAR3 gene_id:8412|Hs108|chr1 (825 aa)
initn: 5569 init1: 5569 opt: 5569 Z-score: 4623.1 bits: 866.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5569; 99.9% identity (99.9% similar) in 825 aa overlap (1-825:1-825)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAGKFASLPRNMPVNHQFPLASSMDLLSSRSPLAEHRPDAYQDVSIHGTLPRKKKGPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MAAGKFASLPRNMPVNHQFPLASSMDLLSSRSPLAEHRPDAYQDVSIHGTLPRKKKGPPP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 IRSCDDFSHMGTLPHSKSPRQNSPVTQDGIQESPWQDRHGETFTFRDPHLLDPTVEYVKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IRSCDDFSHMGTLPHSKSPRQNSPVTQDGIQESPWQDRHGETFTFRDPHLLDPTVEYVKF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 SKERHIMDRTPEKLKKELEEELLLSSEDLRSHAWYHGRIPRQVSENLVQRDGDFLVRDSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SKERHIMDRTPEKLKKELEEELLLSSEDLRSHAWYHGRIPRQVSENLVQRDGDFLVRDSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SSPGNFVLTCQWKNLAQHFKINRTVLRLSEAYSRVQYQFEMESFDSIPGLVRCYVGNRRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SSPGNFVLTCQWKNLAQHFKINRTVLRLSEAYSRVQYQFEMESFDSIPGLVRCYVGNRRP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 ISQQSGAIIFQPINRTVPLRCLEEHYGTSPGQAREGSLTKGRPDVAKRLSLTMGGVQARE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ISQQSGAIIFQPINRTVPLRCLEEHYGTSPGQAREGSLTKGRPDVAKRLSLTMGGVQARE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QNLPRGNLLRNKEKSGSQPACLDHMQDRRALSLKAHQSESYLPIGCKLPPQSSGVDTSPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QNLPRGNLLRNKEKSGSQPACLDHMQDRRALSLKAHQSESYLPIGCKLPPQSSGVDTSPC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 PNSPVFRTGSEPALSPAVVRRVSSDARAGEALRGSDSQLCPKPPPKPCKVPFLKVPSSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PNSPVFRTGSEPALSPAVVRRVSSDARAGEALRGSDSQLCPKPPPKPCKVPFLKVPSSPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 AWLNSEANYCELNPAFATGCGRGAKLPSCAQGSHTELLTAKQNEAPGPRNSGVNYLILDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AWLNSEANYCELNPAFATGCGRGAKLPSCAQGSHTELLTAKQNEAPGPRNSGVNYLILDD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 DDRERPWEPAAAQMEKGQWDKGEFVTPLLETVSSFRPNEFESKFLPPENKPLETAMLKRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 DDRERPWEPAAAQMEKGQWDKGEFVTPLLETVSSFRPNEFESKFLPPENKPLETAMLKRA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 KELFTNNDPKVIAQHVLSMDGRVARILGVSEEMRRNMGVSSGLELITLPHGHQLRLDIIE
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KELFTNNDPKVIAQHVLSMDCRVARILGVSEEMRRNMGVSSGLELITLPHGHQLRLDIIE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 RHNTMAIGIAVDILGCTGTLEDRAATLSKIIQVAVELKDSMGDLYSFSALMKALEMPQIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RHNTMAIGIAVDILGCTGTLEDRAATLSKIIQVAVELKDSMGDLYSFSALMKALEMPQIT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 RLEKTWTALRHQYTQTAILYEKQLKPFSKLLHEGRESTCVPPNNVSVPLLMPLVTLMERQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RLEKTWTALRHQYTQTAILYEKQLKPFSKLLHEGRESTCVPPNNVSVPLLMPLVTLMERQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 AVTFEGTDMWEKNDQSCEIMLNHLATARFMAEAADSYRMNAERILAGFQPDEEMNEICKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AVTFEGTDMWEKNDQSCEIMLNHLATARFMAEAADSYRMNAERILAGFQPDEEMNEICKT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KE4 EFQMRLLWGSKGAQVNQTERYEKFNQILTALSRKLEPPPVKQAEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EFQMRLLWGSKGAQVNQTERYEKFNQILTALSRKLEPPPVKQAEL
790 800 810 820
>>CCDS58010.1 BCAR3 gene_id:8412|Hs108|chr1 (734 aa)
initn: 4739 init1: 4739 opt: 4739 Z-score: 3935.8 bits: 739.0 E(32554): 6.6e-213
Smith-Waterman score: 4739; 99.9% identity (99.9% similar) in 708 aa overlap (118-825:27-734)
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 DGIQESPWQDRHGETFTFRDPHLLDPTVEYVKFSKERHIMDRTPEKLKKELEEELLLSSE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MPKECSAFHALSAALCCFYHRKSFIGVKFSKERHIMDRTPEKLKKELEEELLLSSE
10 20 30 40 50
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 DLRSHAWYHGRIPRQVSENLVQRDGDFLVRDSLSSPGNFVLTCQWKNLAQHFKINRTVLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DLRSHAWYHGRIPRQVSENLVQRDGDFLVRDSLSSPGNFVLTCQWKNLAQHFKINRTVLR
60 70 80 90 100 110
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 LSEAYSRVQYQFEMESFDSIPGLVRCYVGNRRPISQQSGAIIFQPINRTVPLRCLEEHYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LSEAYSRVQYQFEMESFDSIPGLVRCYVGNRRPISQQSGAIIFQPINRTVPLRCLEEHYG
120 130 140 150 160 170
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 TSPGQAREGSLTKGRPDVAKRLSLTMGGVQAREQNLPRGNLLRNKEKSGSQPACLDHMQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TSPGQAREGSLTKGRPDVAKRLSLTMGGVQAREQNLPRGNLLRNKEKSGSQPACLDHMQD
180 190 200 210 220 230
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 RRALSLKAHQSESYLPIGCKLPPQSSGVDTSPCPNSPVFRTGSEPALSPAVVRRVSSDAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RRALSLKAHQSESYLPIGCKLPPQSSGVDTSPCPNSPVFRTGSEPALSPAVVRRVSSDAR
240 250 260 270 280 290
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 AGEALRGSDSQLCPKPPPKPCKVPFLKVPSSPSAWLNSEANYCELNPAFATGCGRGAKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AGEALRGSDSQLCPKPPPKPCKVPFLKVPSSPSAWLNSEANYCELNPAFATGCGRGAKLP
300 310 320 330 340 350
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 SCAQGSHTELLTAKQNEAPGPRNSGVNYLILDDDDRERPWEPAAAQMEKGQWDKGEFVTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SCAQGSHTELLTAKQNEAPGPRNSGVNYLILDDDDRERPWEPAAAQMEKGQWDKGEFVTP
360 370 380 390 400 410
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 LLETVSSFRPNEFESKFLPPENKPLETAMLKRAKELFTNNDPKVIAQHVLSMDGRVARIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS58 LLETVSSFRPNEFESKFLPPENKPLETAMLKRAKELFTNNDPKVIAQHVLSMDCRVARIL
420 430 440 450 460 470
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 GVSEEMRRNMGVSSGLELITLPHGHQLRLDIIERHNTMAIGIAVDILGCTGTLEDRAATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GVSEEMRRNMGVSSGLELITLPHGHQLRLDIIERHNTMAIGIAVDILGCTGTLEDRAATL
480 490 500 510 520 530
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 SKIIQVAVELKDSMGDLYSFSALMKALEMPQITRLEKTWTALRHQYTQTAILYEKQLKPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SKIIQVAVELKDSMGDLYSFSALMKALEMPQITRLEKTWTALRHQYTQTAILYEKQLKPF
540 550 560 570 580 590
690 700 710 720 730 740
pF1KE4 SKLLHEGRESTCVPPNNVSVPLLMPLVTLMERQAVTFEGTDMWEKNDQSCEIMLNHLATA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SKLLHEGRESTCVPPNNVSVPLLMPLVTLMERQAVTFEGTDMWEKNDQSCEIMLNHLATA
600 610 620 630 640 650
750 760 770 780 790 800
pF1KE4 RFMAEAADSYRMNAERILAGFQPDEEMNEICKTEFQMRLLWGSKGAQVNQTERYEKFNQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RFMAEAADSYRMNAERILAGFQPDEEMNEICKTEFQMRLLWGSKGAQVNQTERYEKFNQI
660 670 680 690 700 710
810 820
pF1KE4 LTALSRKLEPPPVKQAEL
::::::::::::::::::
CCDS58 LTALSRKLEPPPVKQAEL
720 730
>>CCDS76181.1 BCAR3 gene_id:8412|Hs108|chr1 (501 aa)
initn: 3346 init1: 3346 opt: 3346 Z-score: 2783.7 bits: 525.3 E(32554): 9.9e-149
Smith-Waterman score: 3346; 99.8% identity (99.8% similar) in 501 aa overlap (325-825:1-501)
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 GVQAREQNLPRGNLLRNKEKSGSQPACLDHMQDRRALSLKAHQSESYLPIGCKLPPQSSG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MQDRRALSLKAHQSESYLPIGCKLPPQSSG
10 20 30
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 VDTSPCPNSPVFRTGSEPALSPAVVRRVSSDARAGEALRGSDSQLCPKPPPKPCKVPFLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VDTSPCPNSPVFRTGSEPALSPAVVRRVSSDARAGEALRGSDSQLCPKPPPKPCKVPFLK
40 50 60 70 80 90
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 VPSSPSAWLNSEANYCELNPAFATGCGRGAKLPSCAQGSHTELLTAKQNEAPGPRNSGVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VPSSPSAWLNSEANYCELNPAFATGCGRGAKLPSCAQGSHTELLTAKQNEAPGPRNSGVN
100 110 120 130 140 150
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 YLILDDDDRERPWEPAAAQMEKGQWDKGEFVTPLLETVSSFRPNEFESKFLPPENKPLET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 YLILDDDDRERPWEPAAAQMEKGQWDKGEFVTPLLETVSSFRPNEFESKFLPPENKPLET
160 170 180 190 200 210
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 AMLKRAKELFTNNDPKVIAQHVLSMDGRVARILGVSEEMRRNMGVSSGLELITLPHGHQL
:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AMLKRAKELFTNNDPKVIAQHVLSMDCRVARILGVSEEMRRNMGVSSGLELITLPHGHQL
220 230 240 250 260 270
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 RLDIIERHNTMAIGIAVDILGCTGTLEDRAATLSKIIQVAVELKDSMGDLYSFSALMKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RLDIIERHNTMAIGIAVDILGCTGTLEDRAATLSKIIQVAVELKDSMGDLYSFSALMKAL
280 290 300 310 320 330
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 EMPQITRLEKTWTALRHQYTQTAILYEKQLKPFSKLLHEGRESTCVPPNNVSVPLLMPLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EMPQITRLEKTWTALRHQYTQTAILYEKQLKPFSKLLHEGRESTCVPPNNVSVPLLMPLV
340 350 360 370 380 390
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 TLMERQAVTFEGTDMWEKNDQSCEIMLNHLATARFMAEAADSYRMNAERILAGFQPDEEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TLMERQAVTFEGTDMWEKNDQSCEIMLNHLATARFMAEAADSYRMNAERILAGFQPDEEM
400 410 420 430 440 450
780 790 800 810 820
pF1KE4 NEICKTEFQMRLLWGSKGAQVNQTERYEKFNQILTALSRKLEPPPVKQAEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NEICKTEFQMRLLWGSKGAQVNQTERYEKFNQILTALSRKLEPPPVKQAEL
460 470 480 490 500
>>CCDS48028.1 SH2D3C gene_id:10044|Hs108|chr9 (506 aa)
initn: 1110 init1: 704 opt: 1140 Z-score: 955.0 bits: 187.0 E(32554): 7.1e-47
Smith-Waterman score: 1171; 42.2% identity (69.3% similar) in 502 aa overlap (343-825:24-506)
320 330 340 350 360
pF1KE4 EKSGSQPACLDHMQDRRALSLKAHQSESYLPIGCKLP-PQSS------GVDTSP---CPN
: . .:: :..: ..: : :
CCDS48 MKRRSVTMTDGLTADKVTRSDGCPTSTSLPRPRDSIRSCALSMDQIPDLHSPM
10 20 30 40 50
370 380 390 400 410
pF1KE4 SPVFRTGSEPALSPAVVRRVSSDARAGEAL-------RGSDSQLCPKPPPKPCKVPFLKV
::. .. : :: : .. ... : .. :: :.:. :::: :: . :
CCDS48 SPISESPSSPAYSTVTRVHAAPAAPSATALPASPVARRSSEPQLCPGSAPKT-HGESDKG
60 70 80 90 100 110
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 P-SSPSAWLNSEANYCELNPAFATGCGRGAKLPSCAQGSHTELLTAKQNEAPGPRNSGVN
: .::: :.. . :. :. .: ..::. .: .. . :. :
CCDS48 PHTSPSHTLGKASPSPSLSSYSDPDSGHYCQLQPPVRGSRE--WAATETSSQQARSYG--
120 130 140 150 160
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 YLILDDDDRERPWEPAAAQMEKGQWDKGEFVTPLLETVSSFRPNEFESKFLPPENKPLET
:: : . .:.: : :..:..:..::: : :.: ..: .:.:::.
CCDS48 ---------ERLKELSENGAPEGDWGK-TFTVPIVEVTSSFNPATFQSLLIPRDNRPLEV
170 180 190 200 210
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 AMLKRAKELFTNNDPKVIAQHVLSMDGRVARILGVSEEMRRNMGVSSGLELITLPHGHQL
..:...:::... : ...:.:: ..: :::::::..::. ::: :.::.:::::.::
CCDS48 GLLRKVKELLAEVDARTLARHVTKVDCLVARILGVTKEMQTLMGVRWGMELLTLPHGRQL
220 230 240 250 260 270
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 RLDIIERHNTMAIGIAVDILGCTGTLEDRAATLSKIIQVAVELKDSMGDLYSFSALMKAL
:::..:: .::.: .:::::::::. :.::: : : ::.:.::. .::...::.:.: ::
CCDS48 RLDLLERFHTMSIMLAVDILGCTGSAEERAALLHKTIQLAAELRGTMGNMFSFAAVMGAL
280 290 300 310 320 330
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 EMPQITRLEKTWTALRHQYTQTAILYEKQLKPFSKLLHEGRESTCVPP-NNVSVPLLMPL
.: ::.:::.::..::...:. ::::::.:::: : :.::.:. :: .:.. : ..::
CCDS48 DMAQISRLEQTWVTLRQRHTEGAILYEKKLKPFLKSLNEGKEG---PPLSNTTFPHVLPL
340 350 360 370 380 390
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 VTLMERQAVTFEGTDMWEKNDQSCEIMLNHLATARFMAEAADSYRMNAERILAGFQPDEE
.::.: ... :: . : ..... :..: :: .:: .:. . :. ::: : ::: :
CCDS48 ITLLECDSAPPEGPEPWGSTEHGVEVVLAHLEAARTVAHHGGLYHTNAEVKLQGFQARPE
400 410 420 430 440 450
780 790 800 810 820
pF1KE4 MNEICKTEFQMRLLWGSKGAQVNQTERYEKFNQILTALSRKLEPPPVKQAEL
. :. .:::::::::::.::. .:..:::::...:::::.:::: :...::
CCDS48 LLEVFSTEFQMRLLWGSQGASSSQARRYEKFDKVLTALSHKLEPA-VRSSEL
460 470 480 490 500
>>CCDS12173.1 SH2D3A gene_id:10045|Hs108|chr19 (576 aa)
initn: 1267 init1: 399 opt: 849 Z-score: 712.9 bits: 142.4 E(32554): 2.2e-33
Smith-Waterman score: 1236; 36.8% identity (61.0% similar) in 674 aa overlap (147-817:8-574)
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 YVKFSKERHIMDRTPEKLKKELEEELLLSSEDLRSHAWYHGRIPRQVSENLVQRDGDFLV
::: .. :::: . :: .: :.:..:::::
CCDS12 MQVPQDGEDLAGQPWYHGLLSRQKAEALLQQNGDFLV
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 RDSLSSPGNFVLTCQWKNLAQHFKINRTVLRLSEAYSRVQYQFEMESFDSIPGLVRCYVG
: : : :: :..:.:.. : ::.. :..:: . . .:.: :.: :::.::. :.
CCDS12 RASGSRGGNPVISCRWRGSALHFEVFRVALRPRPGRPTALFQLEDEQFPSIPALVHSYMT
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 NRRPISQQSGAIIFQPINRTVPLRCLEEHYGTSPGQAREGSLTKGRPDVAKRLSLTMGGV
.:::.:: .::.. .:.. ::: . : .: : :
CCDS12 GRRPLSQATGAVVSRPVTWQGPLR----------RSFSEDTLMDG-P-------------
100 110 120 130
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 QAREQNLPRGNLLRNKEKSGSQPACLDHMQDRRALSLKAHQSESYLPIGCKLPPQSSGVD
:: . : :: .. :.:::: : :: : : .:..
CCDS12 -ARIE--P----LRARKWSNSQPADLAHMGRSRE------------------DP--AGME
140 150 160
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 TSPCPNSPVFRTGSEPAL--SPAVVRRVSSDARAGEALRGSDSQLCPKPPPKPCKVPFLK
.: : : . ::.:.:.: .:: . :. ..::.::.:: : : :: ..: ..
CCDS12 ASTMPISALPRTSSDPVLLKAPAPLGTVA------DSLRASDGQLQAKAPTKPPRTPSFE
170 180 190 200 210 220
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 VPSSPSAWLNSEANYCELNPAFATGCGRGAKLPSCAQGSHTELLTAKQNEAPGPRNSGVN
.:.. . .:::: : ..:: .:: :. .. : :
CCDS12 LPDAS----ERPPTYCELVP----------RVPS-VQG------TSPSQSCPEP------
230 240 250
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 YLILDDDDRERPWEPAAAQMEKGQWDKGEFVTPLLETVSSFRPNEFESKFLPPENKPLET
: :: : . :. .. :. : : :: :.. : .: :.:.:::
CCDS12 ---------EAPWWEAEEDEEE---ENRCFTRPQAEI--SFCPHDAPSCLLGPQNRPLEP
260 270 280 290
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 AMLKRAKELFTNNDPKVIAQHVLSMDGRVARILGVSEEMRRNMGVSSGLELITLPHGHQL
.:. . :: .. : : :.: .: ... .:::....: ::::::::::.::::::.:
CCDS12 QVLHTLRGLFLEHHPGSTALHLLLVDCQATGLLGVTRDQRGNMGVSSGLELLTLPHGHHL
300 310 320 330 340 350
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 RLDIIERHNTMAIGIAVDILGCTGTLEDRAATLSKIIQVAVELKD-SMGDLYSFSALMKA
::...:::.:.:.. :. .:::.: ::.:::.: ....:. :. . ::: ...:.: :
CCDS12 RLELLERHQTLALAGALAVLGCSGPLEERAAALRGLVELALALRPGAAGDLPGLAAVMGA
360 370 380 390 400 410
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 LEMPQITRLEKTWTALRHQYTQTAILYEKQLKPFSKLLHEGRESTCVPPNNVSVPLLMPL
: :::..:::.:: ::...:..:. .:..:::. . : :: . : :..:..: . :.
CCDS12 LLMPQVSRLEHTWRQLRRSHTEAALAFEQELKPLMRALDEG-AGPC-DPGEVALPHVAPM
420 430 440 450 460 470
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 VTLMERQAVTFEGTDMWEKNDQSCEIMLNHLATARFMAEAADSYRMNAERILAGFQPDEE
: :.: : .. :.::: .: : :: :.. : ..: : . : ::.:. :
CCDS12 VRLLE-------GEEVAGPLDESCERLLRTLHGARHMVRDAPKFRKVAAQRLRGFRPNPE
480 490 500 510 520 530
780 790 800 810 820
pF1KE4 MNEICKTEFQMRLLWGSKGAQVNQTERYEKFNQILTALSRKLEPPPVKQAEL
. : : : ::::::.:: . ..::.:::...: .::..:::
CCDS12 LREALTTGFVRRLLWGSRGAGAPRAERFEKFQRVLGVLSQRLEPDR
540 550 560 570
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10 20 30
pF1KE4 MAAGKFASLPRNMPV-NHQFPLASSMDLLSSRSPLAE
..:.. :. .. . : : . :
CCDS68 SFTLRRSSASISRQSHLEPDTFEATQDDMVTVPKSPPAYARSSDMYSHMGTMPRPSIKKA
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80
pF1KE4 HRPDAYQDVSIHGTLPRKKKG----PPPIRSCDDFSHMGTLPHSKSPRQN---SPVTQDG
. .: .... : : : :: ... . .: : .: .. : : :
CCDS68 QNSQAARQAQEAGPKPNLVPGGVPDPPGLEAAKEVMVKATGPLEDTPAMEPNPSAVEVDP
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 IQ--ESPWQDRHGETFTFRDPHLL----DPTV--EYVKFSKERHIMDRTPEKLKKELEEE
:. : : : . : :: : .: . .:::::::..:.: .::::.::::::
CCDS68 IRKPEVPTGDVEEER-PPRDVHSERAAGEPEAGSDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEE
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 LLLSSEDLRSHAWYHGRIPRQVSENLVQRDGDFLVRDSLSSPGNFVLTCQWKNLAQHFKI
: ::: ::::::::::::::.:::.::::.::::.::::.: :..::::.:.: : ::::
CCDS68 LKLSSTDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKI
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 NRTVLRLSEAYSRVQYQFEMESFDSIPGLVRCYVGNRRPISQQSGAIIFQPINRTVPLRC
:..:.. .:.:...:: ::.:::: .:.::: .::.:. .:.::::::. :.::: :::
CCDS68 NKVVVKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRY
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310
pF1KE4 LEEHYGTSPGQAREGS-LTKGRPDVA--KRLSLTM-GGVQA----REQNLPRGNLL-RNK
:: :: . :... .: .. . : . :: :.:: :. : : .. : .. : : .
CCDS68 LEASYGLGQGSSKPASPVSPSGPKGSHMKRRSVTMTDGLTADKVTRSDGCPTSTSLPRPR
330 340 350 360 370 380
320 330 340 350 360
pF1KE4 EKSGSQPACLDHMQDRRA-LS--LKAHQSESYLPIGCKLPPQSSGVDTSPCPNSPVFRTG
.. : .:.. : .. .: .. .: .: . .. .. ... : ::: : .
CCDS68 DSIRSCALSMDQIPDLHSPMSPISESPSSPAYSTV-TRVHAAPAAPSATALPASPVARRS
390 400 410 420 430 440
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SEPALSPAVVRRVSSDARAGEALRGSDSQLCPKPPPKPCKVPFLKVPSSPSAWLNSEANY
::: : :. . .. ... : . : :. : :.: :. :.:.. ..:
CCDS68 SEPQLCPGSAPKTHGESDKGP--HTSPSHTLGKASPSPS----LSSYSDPDS-----GHY
450 460 470 480 490
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 CELNPAFATGCGRGAKLPSCAQGSHTELLTAKQNEAPGPRNSGVNYLILDDDDRERPWEP
:.:.: ::.. . . :: ...: .. : :: :
CCDS68 CQLQPPV-----RGSR-----EWAATET-SSQQARSYG----------------ERLKEL
500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 AAAQMEKGQWDKGEFVTPLLETVSSFRPNEFESKFLPPENKPLETAMLKRAKELFTNNDP
. .:.: : :..:..:..::: : :.: ..: .:.:::...:...:::... :
CCDS68 SENGAPEGDWGK-TFTVPIVEVTSSFNPATFQSLLIPRDNRPLEVGLLRKVKELLAEVDA
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 KVIAQHVLSMDGRVARILGVSEEMRRNMGVSSGLELITLPHGHQLRLDIIERHNTMAIGI
...:.:: ..: :::::::..::. ::: :.::.:::::.:::::..:: .::.: .
CCDS68 RTLARHVTKVDCLVARILGVTKEMQTLMGVRWGMELLTLPHGRQLRLDLLERFHTMSIML
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 AVDILGCTGTLEDRAATLSKIIQVAVELKDSMGDLYSFSALMKALEMPQITRLEKTWTAL
:::::::::. :.::: : : ::.:.::. .::...::.:.: ::.: ::.:::.::..:
CCDS68 AVDILGCTGSAEERAALLHKTIQLAAELRGTMGNMFSFAAVMGALDMAQISRLEQTWVTL
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670 680 690 700 710 720
pF1KE4 RHQYTQTAILYEKQLKPFSKLLHEGRESTCVPP-NNVSVPLLMPLVTLMERQAVTFEGTD
:...:. ::::::.:::: : :.::.:. :: .:.. : ..::.::.: ... :: .
CCDS68 RQRHTEGAILYEKKLKPFLKSLNEGKEG---PPLSNTTFPHVLPLITLLECDSAPPEGPE
710 720 730 740 750 760
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 MWEKNDQSCEIMLNHLATARFMAEAADSYRMNAERILAGFQPDEEMNEICKTEFQMRLLW
: ..... :..: :: .:: .:. . :. ::: : ::: :. :. .:::::::::
CCDS68 PWGSTEHGVEVVLAHLEAARTVAHHGGLYHTNAEVKLQGFQARPELLEVFSTEFQMRLLW
770 780 790 800 810 820
790 800 810 820
pF1KE4 GSKGAQVNQTERYEKFNQILTALSRKLEPPPVKQAEL
::.::. .:..:::::...:::::.:::: :...::
CCDS68 GSQGASSSQARRYEKFDKVLTALSHKLEPA-VRSSEL
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.:::::::..:.: .::::.::::::: ::
CCDS68 MTAVGRRCPALGSRGAAGEPEAGSDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLS
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pF1KE4 SEDLRSHAWYHGRIPRQVSENLVQRDGDFLVRDSLSSPGNFVLTCQWKNLAQHFKINRTV
: ::::::::::::::.:::.::::.::::.::::.: :..::::.:.: : :::::..:
CCDS68 STDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVV
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.. .:.:...:: ::.:::: .:.::: .::.:. .:.::::::. :.::: ::: ::
CCDS68 VKAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEAS
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:: . :... .: .. . : . :: :.:: :. : : .. : .. : : ...
CCDS68 YGLGQGSSKPASPVSPSGPKGSHMKRRSVTMTDGLTADKVTRSDGCPTSTSLPRPRDSIR
180 190 200 210 220 230
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: .:.. : .. .: .. .: .: . .. .. ... : ::: : .:::
CCDS68 SCALSMDQIPDLHSPMSPISESPSSPAYSTV-TRVHAAPAAPSATALPASPVARRSSEPQ
240 250 260 270 280 290
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pF1KE4 LSPAVVRRVSSDARAGEALRGSDSQLCPKPPPKPCKVPFLKVPSSPSAWLNSEANYCELN
: :. . .. ... : . : :. : :.: :. :.:.. ..::.:.
CCDS68 LCPGSAPKTHGESDKGP--HTSPSHTLGKASPSPS----LSSYSDPDS-----GHYCQLQ
300 310 320 330 340
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pF1KE4 PAFATGCGRGAKLPSCAQGSHTELLTAKQNEAPGPRNSGVNYLILDDDDRERPWEPAAAQ
: ::.. . . :: :..:. :. : :: : .
CCDS68 PPV-----RGSR-----EWAATE--TSSQQA----RSYG-----------ERLKELSENG
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pF1KE4 MEKGQWDKGEFVTPLLETVSSFRPNEFESKFLPPENKPLETAMLKRAKELFTNNDPKVIA
.:.: : :..:..:..::: : :.: ..: .:.:::...:...:::... : ...:
CCDS68 APEGDWGK-TFTVPIVEVTSSFNPATFQSLLIPRDNRPLEVGLLRKVKELLAEVDARTLA
380 390 400 410 420 430
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pF1KE4 QHVLSMDGRVARILGVSEEMRRNMGVSSGLELITLPHGHQLRLDIIERHNTMAIGIAVDI
.:: ..: :::::::..::. ::: :.::.:::::.:::::..:: .::.: .::::
CCDS68 RHVTKVDCLVARILGVTKEMQTLMGVRWGMELLTLPHGRQLRLDLLERFHTMSIMLAVDI
440 450 460 470 480 490
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 LGCTGTLEDRAATLSKIIQVAVELKDSMGDLYSFSALMKALEMPQITRLEKTWTALRHQY
:::::. :.::: : : ::.:.::. .::...::.:.: ::.: ::.:::.::..::...
CCDS68 LGCTGSAEERAALLHKTIQLAAELRGTMGNMFSFAAVMGALDMAQISRLEQTWVTLRQRH
500 510 520 530 540 550
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pF1KE4 TQTAILYEKQLKPFSKLLHEGRESTCVPP-NNVSVPLLMPLVTLMERQAVTFEGTDMWEK
:. ::::::.:::: : :.::.:. :: .:.. : ..::.::.: ... :: . : .
CCDS68 TEGAILYEKKLKPFLKSLNEGKEG---PPLSNTTFPHVLPLITLLECDSAPPEGPEPWGS
560 570 580 590 600 610
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pF1KE4 NDQSCEIMLNHLATARFMAEAADSYRMNAERILAGFQPDEEMNEICKTEFQMRLLWGSKG
.... :..: :: .:: .:. . :. ::: : ::: :. :. .:::::::::::.:
CCDS68 TEHGVEVVLAHLEAARTVAHHGGLYHTNAEVKLQGFQARPELLEVFSTEFQMRLLWGSQG
620 630 640 650 660 670
800 810 820
pF1KE4 AQVNQTERYEKFNQILTALSRKLEPPPVKQAEL
:. .:..:::::...:::::.:::: :...::
CCDS68 ASSSQARRYEKFDKVLTALSHKLEPA-VRSSEL
680 690 700
>>CCDS59145.1 SH2D3C gene_id:10044|Hs108|chr9 (792 aa)
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pF1KE4 SLPRNMPVNHQFPLASSMDLLSSRSPLAEHRPDAYQDVSIHGTLPRKKKGPPPIRSCDDF
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CCDS59 MAPALPSPHKAVARPELLLDTAAHSG---KLRAPDGGEGAECA
10 20 30 40
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pF1KE4 SHMGTLPHSKSPRQNSPVTQDGIQESPW----QDRHGETFTF-------------RDPHL
.: : . . :.. ...:: ..:: : : .: : : :
CCDS59 GHNGGPSWGVGQGQSQEPSRQGIPQAPWLVSWQRRGFPPSSFCPGPLRTEKLRAGRCPLL
50 60 70 80 90 100
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pF1KE4 L------DPTV--EYVKFSKERHIMDRTPEKLKKELEEELLLSSEDLRSHAWYHGRIPRQ
: .: . .:::::::..:.: .::::.::::::: ::: ::::::::::::::.
CCDS59 LCGGAAGEPEAGSDYVKFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSSTDLRSHAWYHGRIPRE
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 VSENLVQRDGDFLVRDSLSSPGNFVLTCQWKNLAQHFKINRTVLRLSEAYSRVQYQFEME
:::.::::.::::.::::.: :..::::.:.: : :::::..:.. .:.:...:: ::.:
CCDS59 VSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVVVKAGESYTHIQYLFEQE
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SFDSIPGLVRCYVGNRRPISQQSGAIIFQPINRTVPLRCLEEHYGTSPGQAREGS-LTKG
::: .:.::: .::.:. .:.::::::. :.::: ::: :: :: . :... .: .. .
CCDS59 SFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASYGLGQGSSKPASPVSPS
230 240 250 260 270 280
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pF1KE4 RPDVA--KRLSLTM-GGVQA----REQNLPRGNLL-RNKEKSGSQPACLDHMQDRRA-LS
: . :: :.:: :. : : .. : .. : : ... : .:.. : .. .:
CCDS59 GPKGSHMKRRSVTMTDGLTADKVTRSDGCPTSTSLPRPRDSIRSCALSMDQIPDLHSPMS
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 --LKAHQSESYLPIGCKLPPQSSGVDTSPCPNSPVFRTGSEPALSPAVVRRVSSDARAGE
.. .: .: . .. .. ... : ::: : .::: : :. . .. ... :
CCDS59 PISESPSSPAYSTV-TRVHAAPAAPSATALPASPVARRSSEPQLCPGSAPKTHGESDKGP
350 360 370 380 390
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pF1KE4 ALRGSDSQLCPKPPPKPCKVPFLKVPSSPSAWLNSEANYCELNPAFATGCGRGAKLPSCA
. : :. : :.: :. :.:.. ..::.:.: ::..
CCDS59 --HTSPSHTLGKASPSPS----LSSYSDPDS-----GHYCQLQPPV-----RGSR-----
400 410 420 430
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pF1KE4 QGSHTELLTAKQNEAPGPRNSGVNYLILDDDDRERPWEPAAAQMEKGQWDKGEFVTPLLE
. . :: ...: .. : :: : . .:.: : :..:..:
CCDS59 EWAATET-SSQQARSYG----------------ERLKELSENGAPEGDWGK-TFTVPIVE
440 450 460 470 480
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pF1KE4 TVSSFRPNEFESKFLPPENKPLETAMLKRAKELFTNNDPKVIAQHVLSMDGRVARILGVS
..::: : :.: ..: .:.:::...:...:::... : ...:.:: ..: :::::::.
CCDS59 VTSSFNPATFQSLLIPRDNRPLEVGLLRKVKELLAEVDARTLARHVTKVDCLVARILGVT
490 500 510 520 530 540
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 EEMRRNMGVSSGLELITLPHGHQLRLDIIERHNTMAIGIAVDILGCTGTLEDRAATLSKI
.::. ::: :.::.:::::.:::::..:: .::.: .:::::::::. :.::: : :
CCDS59 KEMQTLMGVRWGMELLTLPHGRQLRLDLLERFHTMSIMLAVDILGCTGSAEERAALLHKT
550 560 570 580 590 600
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pF1KE4 IQVAVELKDSMGDLYSFSALMKALEMPQITRLEKTWTALRHQYTQTAILYEKQLKPFSKL
::.:.::. .::...::.:.: ::.: ::.:::.::..::...:. ::::::.:::: :
CCDS59 IQLAAELRGTMGNMFSFAAVMGALDMAQISRLEQTWVTLRQRHTEGAILYEKKLKPFLKS
610 620 630 640 650 660
700 710 720 730 740
pF1KE4 LHEGRESTCVPP-NNVSVPLLMPLVTLMERQAVTFEGTDMWEKNDQSCEIMLNHLATARF
:.::.:. :: .:.. : ..::.::.: ... :: . : ..... :..: :: .::
CCDS59 LNEGKEG---PPLSNTTFPHVLPLITLLECDSAPPEGPEPWGSTEHGVEVVLAHLEAART
670 680 690 700 710
750 760 770 780 790 800
pF1KE4 MAEAADSYRMNAERILAGFQPDEEMNEICKTEFQMRLLWGSKGAQVNQTERYEKFNQILT
.:. . :. ::: : ::: :. :. .:::::::::::.::. .:..:::::...::
CCDS59 VAHHGGLYHTNAEVKLQGFQARPELLEVFSTEFQMRLLWGSQGASSSQARRYEKFDKVLT
720 730 740 750 760 770
810 820
pF1KE4 ALSRKLEPPPVKQAEL
:::.:::: :...::
CCDS59 ALSHKLEPA-VRSSEL
780 790
>>CCDS48027.1 SH2D3C gene_id:10044|Hs108|chr9 (700 aa)
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90 100 110 120 130 140
pF1KE4 QDGIQESPWQDRHGETFTFRDPHLLDPTVEYVKFSKERHIMDRTPEKLKKELEEELLLSS
.:.::::..:.: .::::.::::::: :::
CCDS48 MTERCSLWSALSAAACCFYRGSFVQFSKEKYILDSSPEKLHKELEEELKLSS
10 20 30 40 50
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pF1KE4 EDLRSHAWYHGRIPRQVSENLVQRDGDFLVRDSLSSPGNFVLTCQWKNLAQHFKINRTVL
::::::::::::::.:::.::::.::::.::::.: :..::::.:.: : :::::..:.
CCDS48 TDLRSHAWYHGRIPREVSETLVQRNGDFLIRDSLTSLGDYVLTCRWRNQALHFKINKVVV
60 70 80 90 100 110
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 RLSEAYSRVQYQFEMESFDSIPGLVRCYVGNRRPISQQSGAIIFQPINRTVPLRCLEEHY
. .:.:...:: ::.:::: .:.::: .::.:. .:.::::::. :.::: ::: :: :
CCDS48 KAGESYTHIQYLFEQESFDHVPALVRYHVGSRKAVSEQSGAIIYCPVNRTFPLRYLEASY
120 130 140 150 160 170
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pF1KE4 GTSPGQAREGS-LTKGRPDVA--KRLSLTM-GGVQA----REQNLPRGNLL-RNKEKSGS
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