FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5768, 943 aa 1>>>pF1KE5768 943 - 943 aa - 943 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8552+/- 0.001; mu= 17.9462+/- 0.061 mean_var=72.9948+/-14.789, 0's: 0 Z-trim(104.9): 22 B-trim: 54 in 1/46 Lambda= 0.150116 statistics sampled from 8128 (8137) to 8128 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16 Scan time: 4.360 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS708.1 CLCA2 gene_id:9635|Hs108|chr1 ( 943) 6273 1368.6 0 CCDS709.1 CLCA1 gene_id:1179|Hs108|chr1 ( 914) 2532 558.4 2.3e-158 CCDS41355.1 CLCA4 gene_id:22802|Hs108|chr1 ( 919) 2472 545.4 1.9e-154 >>CCDS708.1 CLCA2 gene_id:9635|Hs108|chr1 (943 aa) initn: 6273 init1: 6273 opt: 6273 Z-score: 7335.1 bits: 1368.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6273; 100.0% identity (100.0% similar) in 943 aa overlap (1-943:1-943) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MTQRSIAGPICNLKFVTLLVALSSELPFLGAGVQLQDNGYNGLLIAINPQVPENQNLISN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 MTQRSIAGPICNLKFVTLLVALSSELPFLGAGVQLQDNGYNGLLIAINPQVPENQNLISN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 IKEMITEASFYLFNATKRRVFFRNIKILIPATWKANNNSKIKQESYEKANVIVTDWYGAH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 IKEMITEASFYLFNATKRRVFFRNIKILIPATWKANNNSKIKQESYEKANVIVTDWYGAH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 GDDPYTLQYRGCGKEGKYIHFTPNFLLNDNLTAGYGSRGRVFVHEWAHLRWGVFDEYNND :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 GDDPYTLQYRGCGKEGKYIHFTPNFLLNDNLTAGYGSRGRVFVHEWAHLRWGVFDEYNND 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 KPFYINGQNQIKVTRCSSDITGIFVCEKGPCPQENCIISKLFKEGCTFIYNSTQNATASI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 KPFYINGQNQIKVTRCSSDITGIFVCEKGPCPQENCIISKLFKEGCTFIYNSTQNATASI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 MFMQSLSSVVEFCNASTHNQEAPNLQNQMCSLRSAWDVITDSADFHHSFPMNGTELPPPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 MFMQSLSSVVEFCNASTHNQEAPNLQNQMCSLRSAWDVITDSADFHHSFPMNGTELPPPP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 TFSLVQAGDKVVCLVLDVSSKMAEADRLLQLQQAAEFYLMQIVEIHTFVGIASFDSKGEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 TFSLVQAGDKVVCLVLDVSSKMAEADRLLQLQQAAEFYLMQIVEIHTFVGIASFDSKGEI 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 RAQLHQINSNDDRKLLVSYLPTTVSAKTDISICSGLKKGFEVVEKLNGKAYGSVMILVTS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 RAQLHQINSNDDRKLLVSYLPTTVSAKTDISICSGLKKGFEVVEKLNGKAYGSVMILVTS 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 GDDKLLGNCLPTVLSSGSTIHSIALGSSAAPNLEELSRLTGGLKFFVPDISNSNSMIDAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 GDDKLLGNCLPTVLSSGSTIHSIALGSSAAPNLEELSRLTGGLKFFVPDISNSNSMIDAF 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 SRISSGTGDIFQQHIQLESTGENVKPHHQLKNTVTVDNTVGNDTMFLVTWQASGPPEIIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 SRISSGTGDIFQQHIQLESTGENVKPHHQLKNTVTVDNTVGNDTMFLVTWQASGPPEIIL 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE5 FDPDGRKYYTNNFITNLTFRTASLWIPGTAKPGHWTYTLNNTHHSLQALKVTVTSRASNS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 FDPDGRKYYTNNFITNLTFRTASLWIPGTAKPGHWTYTLNNTHHSLQALKVTVTSRASNS 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE5 AVPPATVEAFVERDSLHFPHPVMIYANVKQGFYPILNATVTATVEPETGDPVTLRLLDDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 AVPPATVEAFVERDSLHFPHPVMIYANVKQGFYPILNATVTATVEPETGDPVTLRLLDDG 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE5 AGADVIKNDGIYSRYFFSFAANGRYSLKVHVNHSPSISTPAHSIPGSHAMYVPGYTANGN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 AGADVIKNDGIYSRYFFSFAANGRYSLKVHVNHSPSISTPAHSIPGSHAMYVPGYTANGN 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE5 IQMNAPRKSVGRNEEERKWGFSRVSSGGSFSVLGVPAGPHPDVFPPCKIIDLEAVKVEEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 IQMNAPRKSVGRNEEERKWGFSRVSSGGSFSVLGVPAGPHPDVFPPCKIIDLEAVKVEEE 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE5 LTLSWTAPGEDFDQGQATSYEIRMSKSLQNIQDDFNNAILVNTSKRNPQQAGIREIFTFS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 LTLSWTAPGEDFDQGQATSYEIRMSKSLQNIQDDFNNAILVNTSKRNPQQAGIREIFTFS 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KE5 PQISTNGPEHQPNGETHESHRIYVAIRAMDRNSLQSAVSNIAQAPLFIPPNSDPVPARDY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 PQISTNGPEHQPNGETHESHRIYVAIRAMDRNSLQSAVSNIAQAPLFIPPNSDPVPARDY 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 pF1KE5 LILKGVLTAMGLIGIICLIIVVTHHTLSRKKRADKKENGTKLL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 LILKGVLTAMGLIGIICLIIVVTHHTLSRKKRADKKENGTKLL 910 920 930 940 >>CCDS709.1 CLCA1 gene_id:1179|Hs108|chr1 (914 aa) initn: 2084 init1: 581 opt: 2532 Z-score: 2956.7 bits: 558.4 E(32554): 2.3e-158 Smith-Waterman score: 2623; 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CCDS70 MGPFKSSVFILILHLLEGALS--NSLIQLNNNGYEGIVVAIDPNVPEDETLIQQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE5 IKEMITEASFYLFNATKRRVFFRNIKILIPATWKANNNS-KIKQESYEKANVIVTDWYGA ::.:.:.::.::..:: .: .:.:. :::: :::.. . . : :.:..:.:.:.. CCDS70 IKDMVTQASLYLLEATGKRFYFKNVAILIPETWKTKADYVRPKLETYKNADVLVAESTPP 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 HGDDPYTLQYRGCGKEGKYIHFTPNFLLNDNLTAGYGSRGRVFVHEWAHLRWGVFDEYNN .:.::: :. .::..:. ::.::.:. . .: : :: .::.:::::::::::::::::: CCDS70 GNDEPYTEQMGNCGEKGERIHLTPDFIAGKKL-AEYGPQGRAFVHEWAHLRWGVFDEYNN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DKPFYI-NGQNQIKVTRCSSDITGIFV---CEKGPCPQENCIISK---LFKEGCTFIYNS :. ::. ::. :...:::. ::: : :. : : . : ..: :...:: :. .: CCDS70 DEKFYLSNGR--IQAVRCSAGITGTNVVKKCQGGSCYTKRCTFNKVTGLYEKGCEFVLQS 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TQNATASIMFMQSLSSVVEFCNASTHNQEAPNLQNQMCSLRSAWDVITDSADFHHSFPMN :. ::::: : ..:.::::. ..::.:::: ::: :.:::.:.:: :: ::... :: CCDS70 RQTEKASIMFAQHVDSIVEFCTEQNHNKEAPNKQNQKCNLRSTWEVIRDSEDFKKTTPM- 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 GTELPPPPTFSLVQAGDKVVCLVLDVSSKMAEADRLLQLQQAAEFYLMQIVEIHTFVGIA : :: :::::.: :...:::::: :..:: ..:: .:.::....:.: ::. ..::.. CCDS70 -TTQPPNPTFSLLQIGQRIVCLVLDKSGSMATGNRLNRLNQAGQLFLLQTVELGSWVGMV 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 SFDSKGEIRAQLHQINSNDDRKLLVSYLPTTVSAKTDISICSGLKKGFEVVEKLNGKAYG .::: .... .: ::::..:: :.. ::...:. : ::::::...: :..: . . : CCDS70 TFDSAAHVQNELIQINSGSDRDTLAKRLPAAASGGT--SICSGLRSAFTVIRK-KYPTDG 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 SVMILVTSGDDKLLGNCLPTVLSSGSTIHSIALGSSAAPNLEELSRLTGGLKFFVPDISN : ..:.:.:.:. ...:. : .::. ::..::: ::: .:::::..::::. .. : . CCDS70 SEIVLLTDGEDNTISGCFNEVKQSGAIIHTVALGPSAAQELEELSKMTGGLQTYASDQVQ 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 SNSMIDAFSRISSGTGDIFQQHIQLESTGENVKPHHQLKNTVTVDNTVGNDTMFLVTWQA .:..::::. .:::.: . :. ::::: : ... . ...:: ::.:::.::.::.:: CCDS70 NNGLIDAFGALSSGNGAVSQRSIQLESKGLTLQNSQWMNGTVIVDSTVGKDTLFLITWTM 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 SGPPEIILFDPDGRKYYTNNFITNLTFRTASLWIPGTAKPGHWTYTLNNTHHSLQALKVT . ::.:.:.::.:.: ..:... . . : : ::: :: : : :.:. : :.: .: CCDS70 Q-PPQILLWDPSGQKQ--GGFVVDKNTKMAYLQIPGIAKVGTWKYSLQA---SSQTLTLT 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 650 pF1KE5 VTSRASNSAVPPATVEAFVERDSLHFPHPVMIYANVKQGFYPILNATVTATVEPETGDPV :::::::...:: :: . ...:. .:: :...:::..:: ::: :.::: .: .: : CCDS70 VTSRASNATLPPITVTSKTNKDTSKFPSPLVVYANIRQGASPILRASVTALIESVNGKTV 580 590 600 610 620 630 660 670 680 690 700 710 pF1KE5 TLRLLDDGAGADVIKNDGIYSRYFFSFAANGRYSLKVHVNHSPSISTPAHSIPG-SHAMY ::.:::.:::::. :.::.::::: .. .:::::.::.. . . . . :: : :.: CCDS70 TLELLDNGAGADATKDDGVYSRYFTTYDTNGRYSVKVRALGGVNAAR-RRVIPQQSGALY 640 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 pF1KE5 VPGYTANGNIQMNAPRKSVGRNEEERKW-GFSRVSSGGSFSVLGVPAGPHPDVFPPCKII .::. : .:: : :: ..... ..: :::.:::::: . :: .: ::.::: .: CCDS70 IPGWIENDEIQWNPPRPEINKDDVQHKQVCFSRTSSGGSFVASDVPNAPIPDLFPPGQIT 700 710 720 730 740 750 780 790 800 810 820 pF1KE5 DLEA-VKVEEELTLSWTAPGEDFDQGQATSYEIRMSKSLQNIQDDFNNAILVNTSKRNPQ ::.: .. ..:.:::::.:.:.: : .: ::.: :. ...: ::... :::. :. CCDS70 DLKAEIHGGSLINLTWTAPGDDYDHGTAHKYIIRISTSILDLRDKFNESLQVNTTALIPK 760 770 780 790 800 810 830 840 850 860 870 880 pF1KE5 QAGIREIFTFSPQIST--NGPEHQPNGETHESHRIYVAIRAMDRNSLQSAVSNIAQAPLF .:. .:.: :.:. : :: . ...::.:.:. .:.: .::::.. :: CCDS70 EANSEEVFLFKPENITFENGTD------------LFIAIQAVDKVDLKSEISNIARVSLF 820 830 840 850 860 890 900 910 920 930 940 pF1KE5 IPPNSDP-VPARDYLILKGVLTAMGLIGIICLIIVVTHHTLSRKKRADKKENGTKLL :::.. : .:. : CCDS70 IPPQTPPETPSPDETSAPCPNIHINSTIPGIHILKIMWKWIGELQLSIA 870 880 890 900 910 >>CCDS41355.1 CLCA4 gene_id:22802|Hs108|chr1 (919 aa) initn: 2090 init1: 793 opt: 2472 Z-score: 2886.4 bits: 545.4 E(32554): 1.9e-154 Smith-Waterman score: 2555; 43.6% identity (74.2% similar) in 908 aa overlap (33-922:24-911) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 QRSIAGPICNLKFVTLLVALSSELPFLGAGVQLQDNGYNGLLIAINPQVPENQNLISNIK ..:..::.. ..:.:.:.:::....: .:. CCDS41 MGLFRGFVFLLVLCLLHQSNTSFIKLNNNGFEDIVIVIDPSVPEDEKIIEQIE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EMITEASFYLFNATKRRVFFRNIKILIPATWKANNNSK-IKQESYEKANVIVTDWYGAHG .:.: :: :::.::..: ::.:..:::: .:: : . : :.:....:.:::. CCDS41 DMVTTASTYLFEATEKRFFFKNVSILIPENWKENPQYKRPKHENHKHADVIVAPPTLPGR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 DDPYTLQYRGCGKEGKYIHFTPNFLLNDNLTAGYGSRGRVFVHEWAHLRWGVFDEYNNDK :.::: :. ::..:.::::::..::. . . :: :..:::::::::::::::::.:. CCDS41 DEPYTKQFTECGEKGEYIHFTPDLLLGKKQNE-YGPPGKLFVHEWAHLRWGVFDEYNEDQ 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 PFYINGQNQIKVTRCSSDITG---IFVCEKGPCPQENCII---SKLFKEGCTFIYNSTQN ::: ...:..::::. :.: .. :. : : .. : : .::. . : :. ...:. CCDS41 PFYRAKSKKIEATRCSAGISGRNRVYKCQGGSCLSRACRIDSTTKLYGKDCQFFPDKVQT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 ATASIMFMQSLSSVVEFCNASTHNQEAPNLQNQMCSLRSAWDVITDSADFHHSFPMNGTE ::::::::..::::::: .:::::::.::: :..::.:.::..: ::....:: . CCDS41 EKASIMFMQSIDSVVEFCNEKTHNQEAPSLQNIKCNFRSTWEVISNSEDFKNTIPM--VT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 LPPPPTFSLVQAGDKVVCLVLDVSSKMAEADRLLQLQQAAEFYLMQIVEIHTFVGIASFD ::::.:::.. ....:::::: :..:. ::: ...:::. .:.: :: ..::.. :: CCDS41 PPPPPVFSLLKISQRIVCLVLDKSGSMGGKDRLNRMNQAAKHFLLQTVENGSWVGMVHFD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 SKGEIRAQLHQINSNDDRKLLVSYLPTTVSAKTDISICSGLKKGFEVVEKLNGKAYGSVM : . : .: ::.:.:.:. :.. ::: . : :::::.: .:.:. .:... :: . CCDS41 STATIVNKLIQIKSSDERNTLMAGLPTYPLGGT--SICSGIKYAFQVIGELHSQLDGSEV 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 ILVTSGDDKLLGNCLPTVLSSGSTIHSIALGSSAAPNLEELSRLTGGLKFFVPDISNSNS .:.:.:.:. ..:. : .::. .: :::: .: . :.:..::: .:.: : ...:. CCDS41 LLLTDGEDNTASSCIDEVKQSGAIVHFIALGRAADEAVIEMSKITGGSHFYVSDEAQNNG 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 MIDAFSRISSGTGDIFQQHIQLESTGENVKPHHQLKNTVTVDNTVGNDTMFLVTWQASGP .::::. ..::. :. :. .:::: : ... . ...:: .:.:::.::.::.::. : : CCDS41 LIDAFGALTSGNTDLSQKSLQLESKGLTLNSNAWMNDTVIIDSTVGKDTFFLITWN-SLP 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 PEIILFDPDGRKYYTNNFITNLTFRTASLWIPGTAKPGHWTYTLNNTHHSLQALKVTVTS : : :.::.: .:: .. : . : : :::::: : :.:.:. . ..: .:::: CCDS41 PSISLWDPSGT--IMENFTVDATSKMAYLSIPGTAKVGTWAYNLQAKANP-ETLTITVTS 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE5 RASNSAVPPATVEAFVERDSLHFPHPVMIYANVKQGFYPILNATVTATVEPETGDPVTLR ::.::.::: ::.: ...: :: :...::.. ::. :.:.:.::: .: ..: .:. CCDS41 RAANSSVPPITVNAKMNKDVNSFPSPMIVYAEILQGYVPVLGANVTAFIESQNGHTEVLE 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KE5 LLDDGAGADVIKNDGIYSRYFFSFAANGRYSLKVHVNHSPSISTPAHSIPGSHAMYVPGY :::.::::: .::::.::::: ... ::::::::... . . . : ..: :.::. CCDS41 LLDNGAGADSFKNDGVYSRYFTAYTENGRYSLKVRAHGGANTARLKLRPPLNRAAYIPGW 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KE5 TANGNIQMNAPRKSVGRNEEERKWGFSRVSSGGSFSVLGVPAGPHPDVFPPCKIIDLEAV ..::.:. : :: . .. . :::..:::.: : ::. : :: .:: .: ::.:. CCDS41 VVNGEIEANPPRPEIDEDTQTTLEDFSRTASGGAFVVSQVPSLPLPDQYPPSQITDLDAT 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 830 pF1KE5 KVEEELTLSWTAPGEDFDQGQATSYEIRMSKSLQNIQDDFNNAILVNTSKRNPQQAGIRE :... :.:::::..:: :.. : ::.: :. ...:.:..:. :::. .:..:. .: CCDS41 VHEDKIILTWTAPGDNFDVGKVQRYIIRISASILDLRDSFDDALQVNTTDLSPKEANSKE 770 780 790 800 810 820 840 850 860 870 880 pF1KE5 IFTFSPQ-ISTNGPEHQPNGETHESHRIYVAIRAMDRNSLQSAVSNIAQAPLFIP----- :.:.:. :: .. : :..::...:...: : ::::::. :::: CCDS41 SFAFKPENISEENATH-----------IFIAIKSIDKSNLTSKVSNIAQVTLFIPQANPD 830 840 850 860 870 890 900 910 920 930 940 pF1KE5 -----PNSDPVPARDYLILKGVLTAMGLIGIICLIIVVTHHTLSRKKRADKKENGTKLL :. :.:. : .:: . ....: ...: CCDS41 DIDPTPTPTPTPTPDKSHNSGVNISTLVLSVIGSVVIVNFILSTTI 880 890 900 910 943 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 05:01:08 2016 done: Tue Nov 8 05:01:09 2016 Total Scan time: 4.360 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]