Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3329
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3329, 937 aa
1>>>pF1KE3329 937 - 937 aa - 937 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.5944+/-0.0013; mu= -18.5677+/- 0.076
mean_var=546.1122+/-120.374, 0's: 0 Z-trim(111.3): 286 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.054882
statistics sampled from 11976 (12252) to 11976 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.376), width: 16
Scan time: 3.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 937) 6461 527.7 4.1e-149
CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9 ( 943) 3656 305.6 3e-82
CCDS41344.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 393) 2724 231.5 2.5e-60
CCDS75874.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 ( 783) 930 89.7 2.4e-17
CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 ( 869) 930 89.7 2.6e-17
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 760) 861 84.2 1.1e-15
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 790) 861 84.2 1.1e-15
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 796) 861 84.2 1.1e-15
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 860 84.1 1.2e-15
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 860 84.1 1.2e-15
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 841 82.6 3.3e-15
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 841 82.6 3.4e-15
CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1 ( 855) 727 73.6 1.8e-12
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 723 73.5 3.1e-12
CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2 (1620) 726 73.8 3.1e-12
CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 803) 706 71.9 5.4e-12
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 705 71.8 5.5e-12
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 705 71.9 5.7e-12
CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 864) 706 72.0 5.7e-12
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 691 70.7 1.2e-11
CCDS7200.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1114) 695 71.2 1.3e-11
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 697 71.4 1.3e-11
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 697 71.4 1.3e-11
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 686 70.3 1.5e-11
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 686 70.4 1.6e-11
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 686 70.4 1.6e-11
CCDS75419.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 767) 685 70.3 1.7e-11
CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 876) 685 70.3 1.8e-11
CCDS56411.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 894) 685 70.3 1.9e-11
CCDS34385.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6 ( 913) 685 70.3 1.9e-11
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 681 70.2 3.2e-11
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 681 70.2 3.2e-11
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 668 68.8 3.5e-11
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 670 69.0 3.6e-11
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 670 69.1 3.7e-11
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 668 68.9 3.9e-11
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 670 69.1 3.9e-11
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 668 68.9 4e-11
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 668 68.9 4e-11
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 668 68.9 4e-11
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 670 69.1 4e-11
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 670 69.1 4e-11
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 668 68.9 4e-11
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 670 69.1 4e-11
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 668 68.9 4.1e-11
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 670 69.1 4.1e-11
CCDS53525.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1072) 673 69.4 4.1e-11
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 668 68.9 4.2e-11
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 819) 668 68.9 4.4e-11
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 821) 668 68.9 4.4e-11
>>CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 (937 aa)
initn: 6461 init1: 6461 opt: 6461 Z-score: 2790.5 bits: 527.7 E(32554): 4.1e-149
Smith-Waterman score: 6461; 100.0% identity (100.0% similar) in 937 aa overlap (1-937:1-937)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MHRPRRRGTRPPLLALLAALLLAARGAAAQETELSVSAELVPTSSWNISSELNKDSYLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MHRPRRRGTRPPLLALLAALLLAARGAAAQETELSVSAELVPTSSWNISSELNKDSYLTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DEPMNNITTSLGQTAELHCKVSGNPPPTIRWFKNDAPVVQEPRRLSFRSTIYGSRLRIRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 DEPMNNITTSLGQTAELHCKVSGNPPPTIRWFKNDAPVVQEPRRLSFRSTIYGSRLRIRN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 LDTTDTGYFQCVATNGKEVVSSTGVLFVKFGPPPTASPGYSDEYEEDGFCQPYRGIACAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LDTTDTGYFQCVATNGKEVVSSTGVLFVKFGPPPTASPGYSDEYEEDGFCQPYRGIACAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 FIGNRTVYMESLHMQGEIENQITAAFTMIGTSSHLSDKCSQFAIPSLCHYAFPYCDETSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 FIGNRTVYMESLHMQGEIENQITAAFTMIGTSSHLSDKCSQFAIPSLCHYAFPYCDETSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VPKPRDLCRDECEILENVLCQTEYIFARSNPMILMRLKLPNCEDLPQPESPEAANCIRIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VPKPRDLCRDECEILENVLCQTEYIFARSNPMILMRLKLPNCEDLPQPESPEAANCIRIG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 IPMADPINKNHKCYNSTGVDYRGTVSVTKSGRQCQPWNSQYPHTHTFTALRFPELNGGHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 IPMADPINKNHKCYNSTGVDYRGTVSVTKSGRQCQPWNSQYPHTHTFTALRFPELNGGHS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 YCRNPGNQKEAPWCFTLDENFKSDLCDIPACDSKDSKEKNKMEILYILVPSVAIPLAIAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 YCRNPGNQKEAPWCFTLDENFKSDLCDIPACDSKDSKEKNKMEILYILVPSVAIPLAIAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 LFFFICVCRNNQKSSSAPVQRQPKHVRGQNVEMSMLNAYKPKSKAKELPLSAVRFMEELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LFFFICVCRNNQKSSSAPVQRQPKHVRGQNVEMSMLNAYKPKSKAKELPLSAVRFMEELG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 ECAFGKIYKGHLYLPGMDHAQLVAIKTLKDYNNPQQWTEFQQEASLMAELHHPNIVCLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 ECAFGKIYKGHLYLPGMDHAQLVAIKTLKDYNNPQQWTEFQQEASLMAELHHPNIVCLLG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 AVTQEQPVCMLFEYINQGDLHEFLIMRSPHSDVGCSSDEDGTVKSSLDHGDFLHIAIQIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 AVTQEQPVCMLFEYINQGDLHEFLIMRSPHSDVGCSSDEDGTVKSSLDHGDFLHIAIQIA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 AGMEYLSSHFFVHKDLAARNILIGEQLHVKISDLGLSREIYSADYYRVQSKSLLPIRWMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 AGMEYLSSHFFVHKDLAARNILIGEQLHVKISDLGLSREIYSADYYRVQSKSLLPIRWMP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 PEAIMYGKFSSDSDIWSFGVVLWEIFSFGLQPYYGFSNQEVIEMVRKRQLLPCSEDCPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 PEAIMYGKFSSDSDIWSFGVVLWEIFSFGLQPYYGFSNQEVIEMVRKRQLLPCSEDCPPR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 MYSLMTECWNEIPSRRPRFKDIHVRLRSWEGLSSHTSSTTPSGGNATTQTTSLSASPVSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MYSLMTECWNEIPSRRPRFKDIHVRLRSWEGLSSHTSSTTPSGGNATTQTTSLSASPVSN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 LSNPRYPNYMFPSQGITPQGQIAGFIGPPIPQNQRFIPINGYPIPPGYAAFPAAHYQPTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LSNPRYPNYMFPSQGITPQGQIAGFIGPPIPQNQRFIPINGYPIPPGYAAFPAAHYQPTG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 PPRVIQHCPPPKSRSPSSASGSTSTGHVTSLPSSGSNQEANIPLLPHMSIPNHPGGMGIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 PPRVIQHCPPPKSRSPSSASGSTSTGHVTSLPSSGSNQEANIPLLPHMSIPNHPGGMGIT
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KE3 VFGNKSQKPYKIDSKQASLLGDANIHGHTESMISAEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VFGNKSQKPYKIDSKQASLLGDANIHGHTESMISAEL
910 920 930
>>CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9 (943 aa)
initn: 2748 init1: 1334 opt: 3656 Z-score: 1590.2 bits: 305.6 E(32554): 3e-82
Smith-Waterman score: 3656; 57.6% identity (79.2% similar) in 947 aa overlap (4-936:8-942)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MHRPRRRGTRPPLLALLAALLLAARGAAAQETELSVSAELVPTSSWNISSELNKDS
::: : . :::::.. .... :. . : : .. . :
CCDS66 MARGSALPRRPLLCIPAVWAAAALLLSVSRTSGEVEVLDPNDPLGPLDGQDGPIPTLKGY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 YLTLDEPMNNITTSLGQTAELHCKVSGNPPPTIRWFKNDAPVVQEPRRLSFRSTIYGSRL
.:.. ::.:::: :::: :::::.:::::..::.::::::::::::. .:.: :::::
CCDS66 FLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWLKNDAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 RIRNLDTTDTGYFQCVATNGKEVVSSTGVLFVKFGPPPTASPGYSDEYEEDGFCQPYRGI
::..::::::::.::::::: .....::::::..:: . . ...:.:.:::::::::::
CCDS66 RIQDLDTTDTGYYQCVATNGMKTITATGVLFVRLGPTHSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 ACARFIGNRTVYMESLHMQGEIENQITAAFTMIGTSSHLSDKCSQFAIPSLCHYAFPYCD
::::::::::.:..::.:::::::.:::::::::::.::::.::::::::.::..:: ::
CCDS66 ACARFIGNRTIYVDSLQMQGEIENRITAAFTMIGTSTHLSDQCSQFAIPSFCHFVFPLCD
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 ETSSVPKPRDLCRDECEILENVLCQTEYIFARSNPMILMRLKLPNCEDLPQPESPEAANC
: .::::.:::::::.::. ::. :: .:::::.:::::.::.:: ::.::::.::::
CCDS66 ARSRTPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIARSNPLILMRLQLPKCEALPMPESPDAANC
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 IRIGIPMADPINKNHKCYNSTGVDYRGTVSVTKSGRQCQPWNSQYPHTHTFTALRFPELN
.::::: :. ... :.:::..:.:::::.:.::::.::::: :.::.: ... ::::.
CCDS66 MRIGIP-AERLGRYHQCYNGSGMDYRGTASTTKSGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELG
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 GGHSYCRNPGNQKEAPWCFTLDENFKSDLCDIPACDSKDSKEKNKMEILYILVPSVAIPL
:::.::::::.: :.::::: ..: . .:::.:.:. .:: .:: ::::::::.::::
CCDS66 GGHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVRMELCDVPSCSPRDS---SKMGILYILVPSIAIPL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 AIALLFFFICVCRNNQKSS-SAPVQRQPKHVRGQNVEMSMLNAYKPKSKAKELPLSAVRF
.:: :::..:.:::.::.: :.: .:: .:..:: ..: .: ..: ::. ::::::
CCDS66 VIACLFFLVCMCRNKQKASASTPQRRQLMASPSQDMEMPLINQHK-QAKLKEISLSAVRF
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 MEELGECAFGKIYKGHLYLPGM-DHAQLVAIKTLKDYNNPQQWTEFQQEASLMAELHHPN
:::::: :::.:::::. :. ...: :::::::: . ::..:: : :.:.:::
CCDS66 MEELGEDRFGKVYKGHLFGPAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPN
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 IVCLLGAVTQEQPVCMLFEYINQGDLHEFLIMRSPHSDVGCSSDEDGTVKSSLDHGDFLH
.:::::.::..::. :.: : ..:::::::.::::::::: :.:.: ::::.:. ::.:
CCDS66 VVCLLGVVTKDQPLSMIFSYCSHGDLHEFLVMRSPHSDVG-STDDDRTVKSALEPPDFVH
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 IAIQIAAGMEYLSSHFFVHKDLAARNILIGEQLHVKISDLGLSREIYSADYYRVQSKSLL
.. :::::::::::: ::::::.::.:. ..:.:::::::: ::.:.::::.. ..:::
CCDS66 LVAQIAAGMEYLSSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLL
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 PIRWMPPEAIMYGKFSSDSDIWSFGVVLWEIFSFGLQPYYGFSNQEVIEMVRKRQLLPCS
::::: :::::::::: ::::::.::::::.::.::::: :.:::.:.::.:.::.:::
CCDS66 PIRWMAPEAIMYGKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCP
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 EDCPPRMYSLMTECWNEIPSRRPRFKDIHVRLRSWEGLSSHTSSTTPSGGNATTQTTSLS
.::: .:.:: :::::.::::::::::: :::.: .::...::. ::.. ::::.:::
CCDS66 DDCPAWVYALMIECWNEFPSRRPRFKDIHSRLRAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLS
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820
pF1KE3 ASPVSNLSNPRY--PNYMFPSQGITPQGQ---IAGFIGPPIPQNQRFIPINGYPIPPGYA
.:::::.:: :: :. : :: : . : : : .: : ..:.::: :.:.
CCDS66 TSPVSNVSNARYVGPKQKAPP---FPQPQFIPMKGQIRPMVPPPQLYVPVNGYQPVPAYG
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 AFPAAHYQPTGPPRVI-QHCPP---PKSRSPSSASGSTSTGHVTSLPSSGSNQEANIPLL
:. : : .. :. :: :: : :.:::::::.::. ::. : . ::
CCDS66 AYLPNFYPVQIPMQMAPQQVPPQMVPKPSSHHSGSGSTSTGYVTTAPSNTSMAD-RAALL
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930
pF1KE3 PHMS--IPNHP-GGMGITVFGNKSQKPYKIDSKQASLLGDANIHGHTESMISAEL
. . : : : :: ..... . . .. :::: . :.... :
CCDS66 SEGADDTQNAPEDGAQSTV--QEAEEEEEGSVPETELLGDCDTLQVDEAQVQLEA
900 910 920 930 940
>>CCDS41344.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 (393 aa)
initn: 2724 init1: 2724 opt: 2724 Z-score: 1196.5 bits: 231.5 E(32554): 2.5e-60
Smith-Waterman score: 2724; 100.0% identity (100.0% similar) in 391 aa overlap (1-391:1-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MHRPRRRGTRPPLLALLAALLLAARGAAAQETELSVSAELVPTSSWNISSELNKDSYLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MHRPRRRGTRPPLLALLAALLLAARGAAAQETELSVSAELVPTSSWNISSELNKDSYLTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DEPMNNITTSLGQTAELHCKVSGNPPPTIRWFKNDAPVVQEPRRLSFRSTIYGSRLRIRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DEPMNNITTSLGQTAELHCKVSGNPPPTIRWFKNDAPVVQEPRRLSFRSTIYGSRLRIRN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 LDTTDTGYFQCVATNGKEVVSSTGVLFVKFGPPPTASPGYSDEYEEDGFCQPYRGIACAR
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CCDS41 LDTTDTGYFQCVATNGKEVVSSTGVLFVKFGPPPTASPGYSDEYEEDGFCQPYRGIACAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 FIGNRTVYMESLHMQGEIENQITAAFTMIGTSSHLSDKCSQFAIPSLCHYAFPYCDETSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FIGNRTVYMESLHMQGEIENQITAAFTMIGTSSHLSDKCSQFAIPSLCHYAFPYCDETSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VPKPRDLCRDECEILENVLCQTEYIFARSNPMILMRLKLPNCEDLPQPESPEAANCIRIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VPKPRDLCRDECEILENVLCQTEYIFARSNPMILMRLKLPNCEDLPQPESPEAANCIRIG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 IPMADPINKNHKCYNSTGVDYRGTVSVTKSGRQCQPWNSQYPHTHTFTALRFPELNGGHS
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CCDS41 IPMADPINKNHKCYNSTGVDYRGTVSVTKSGRQCQPWNSQYPHTHTFTALRFPELNGGHS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 YCRNPGNQKEAPWCFTLDENFKSDLCDIPACDSKDSKEKNKMEILYILVPSVAIPLAIAL
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YCRNPGNQKEAPWCFTLDENFKSDLCDIPACGK
370 380 390
430 440 450 460 470 480
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30 40 50 60 70 80
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. .: :. : : : : . ::: :..
CCDS75 DDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMKPKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNPKPSV
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 RWFKNDAPVVQEPRRLSFRSTIYGSRLRIRNLDTTDTGYFQCVATNGKEVVSSTGVLFVK
:.:.:.:. .. : ..: :: :::.:.. :.: ..::: :. .. : ::
CCDS75 SWIKGDSPLRENSRIAVLES---GS-LRIHNVQKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSK---VVK
160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 FGPPPTASPGYSDEYEEDGFCQPY-RGIACARFIG-NRTVYMESLHMQGEIEN--QITAA
. . : . . . : .... . :. . :. . ::: ....
CCDS75 LEVEEESEPEQDTKVFARILRAPESHNVTFGSFVTLHCTATGIPVPTITWIENGNAVSSG
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250
pF1KE3 FTMIGTSSHLSDKCSQFAI--PSL--CHYAFPYCDETSSVPKPRDLC----RDECEILEN
. ...... :. :. : :.: : . . .. :.. . :. : ...
CCDS75 SIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAATISIAEWREYCLAVKE
270 280 290 300 310 320
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 VLCQTEY-IFARSNPMILMR-----LKLPNCEDLPQPE-SPEAANCIRIGIPMADPINKN
..: :. .. ... :.: :..:.: ::. . .: : : :. .: : .
CCDS75 LFCAKEWLVMEEKTHRGLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTA--CARLP-HLAFPPMTS
330 340 350 360 370 380
320 330 340 350 360
pF1KE3 HKCYNSTGVDYRGTVSVTKSGRQCQPWNSQYPHTHTFTALR-FPELNGGHSYCRNPGNQK
: .:: . : ..:. . .: :. .... : :. :: ..
CCDS75 SK----PSVDIPNLPSSSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYC----CRR
390 400 410 420 430
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EAPWCFTLDENFKSDLCDIPACDSKDSKEKNKMEILYILVPSVAIPLAIALLFFFICVCR
. : .:.... . .:: ::.
CCDS75 RKQW---------------------KNKKRESAAVTLTTLPS-------ELLL-------
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430 440 450 460 470 480
pF1KE3 NNQKSSSAPV-QRQPKHVRGQNVEMSMLNAYKPKSKAKELPLSAVRFMEELGECAFGKIY
.. :. ::.: .:: :: . : : . .......:: :::...
CCDS75 --DRLHPNPMYQRMP----------LLLN---PKLLSLEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVF
460 470 480 490 500
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 KGHLYLPGM---DHAQLVAIKTLKDYNNPQQWTEFQQEASLMAELHHPNIVCLLGAVTQE
... ::. . .::.: ::. . .. ..::.::.::::. .:::: :::. .
CCDS75 QAR--APGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVG
510 520 530 540 550 560
550 560 570 580 590
pF1KE3 QPVCMLFEYINQGDLHEFLIMRSPHSDVGCS-SDEDGTVKSS--------LDHGDFLHIA
.:.:.::::. :::.::: :::. :: : : ..... :. .. : ::
CCDS75 KPMCLLFEYMAYGDLNEFLRSMSPHTV--CSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIA
570 580 590 600 610 620
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 IQIAAGMEYLSSHFFVHKDLAARNILIGEQLHVKISDLGLSREIYSADYYRVQSKSLLPI
:.:::: ::: . :::.:::.:: :.::.. :::.:.::::.:::::::... .. .::
CCDS75 RQVAAGMAYLSERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPI
630 640 650 660 670 680
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 RWMPPEAIMYGKFSSDSDIWSFGVVLWEIFSFGLQPYYGFSNQEVIEMVRKRQLLPCSED
::::::.:.:......::.:..:::::::::.:::::::....::: .:: ..: : :.
CCDS75 RWMPPESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPEN
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720 730 740 750 760 770
pF1KE3 CPPRMYSLMTECWNEIPSRRPRFKDIHVRLRSWEGLSSHTSSTTPSGGNATTQTTSLSAS
:: ..:.:: ::...:. :: : .::
CCDS75 CPVELYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV
750 760 770 780
>>CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 (869 aa)
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pF1KE3 SVSAELVPTSSWNISSELNKDSYLTLDEPMNNITTSLGQTAELHCKVSGNPPPTIRWFKN
.:.: .:. . ::: ..: : ::: :..:
CCDS48 VAKNSLGTAYSKVVKLEVEVFARILRAPESHNVT--FGSFVTLHCTATGIPVPTITWIEN
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: . . : .. . :::. : : : . :.::: . ::. . ..
CCDS48 GNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQ---LFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAATISIAE
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pF1KE3 TASPGYSDEYEEDGFCQPYRGIAC-ARFIGNRTVYMESLHMQGEIENQITAAFTMIGTSS
..: . .. :.: ::: .: : . . :.... . . : : : . : . .
CCDS48 WSKP----QKDNKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPE-EAQELLVHTAWNELK
310 320 330 340 350 360
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 HLSDKCSQFAIPSLCHYAFPYCDETSSVPKPRDLCRDECEILENVLCQTEY-IFARSNPM
.: : : ::.. : :. . :: : .::. : .....: :. .. ...
CCDS48 VVSPVCRPAAEALLCNHIFQECSP-GVVPTPIPICREYCLAVKELFCAKEWLVMEEKTHR
370 380 390 400 410
280 290 300 310 320
pF1KE3 ILMR-----LKLPNCEDLPQPE-SPEAANCIRIGIPMADPINKNHKCYNSTGVDYRGTVS
:.: :..:.: ::. . .: : : :. : : ..: : .
CCDS48 GLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTA--CARL--PHLDYNKENLKTF------------
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330 340 350 360 370 380
pF1KE3 VTKSGRQCQPWNSQYPHTHTFTALRFPELNGGHSYCRNPGNQKEAPWCFTLDENFKSDLC
: .:. : .. .:.: :.... . :... ...
CCDS48 --------PPMTSSKP------SVDIPNL---------PSSSSSS---FSVSPTYS----
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390 400 410 420 430 440
pF1KE3 DIPACDSKDSKEKNKMEILYILVPSVAIPLAIALLFFFICVCRN---NQKSSSAPVQ--R
: .. .. : :: . ... .. : :. :.: :: :
CCDS48 ---------------MTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYCCRRRKQWKNKKRESAAVTLTT
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450 460 470 480 490
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:. : . .: .: .:: . : : . .......:: :::......
CCDS48 LPSELLLDRLHPNPMYQRMPLL--LNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVFQAR--A
540 550 560 570 580 590
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 PGM---DHAQLVAIKTLKDYNNPQQWTEFQQEASLMAELHHPNIVCLLGAVTQEQPVCML
::. . .::.: ::. . .. ..::.::.::::. .:::: :::. . .:.:.:
CCDS48 PGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLL
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560 570 580 590 600
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:::. :::.::: :::. :: : : ..... :. .. : :: :.:::
CCDS48 FEYMAYGDLNEFLRSMSPHT--VCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAG
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pF1KE3 MEYLSSHFFVHKDLAARNILIGEQLHVKISDLGLSREIYSADYYRVQSKSLLPIRWMPPE
: ::: . :::.:::.:: :.::.. :::.:.::::.:::::::... .. .::::::::
CCDS48 MAYLSERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPE
720 730 740 750 760 770
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pF1KE3 AIMYGKFSSDSDIWSFGVVLWEIFSFGLQPYYGFSNQEVIEMVRKRQLLPCSEDCPPRMY
.:.:......::.:..:::::::::.:::::::....::: .:: ..: : :.:: ..:
CCDS48 SIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVELY
780 790 800 810 820 830
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 SLMTECWNEIPSRRPRFKDIHVRLRSWEGLSSHTSSTTPSGGNATTQTTSLSASPVSNLS
.:: ::...:. :: : .::
CCDS48 NLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV
840 850 860
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:.: : ::..: :. . ::
CCDS30 GLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTL------GGSSL
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pF1KE3 APVQRQPKHVRGQNVEMSMLNAYKPKSKAKELPLSAVRFMEELGECAFGKIY--KGHLYL
.:.. . . ..:. .: . : . .... . . :::: ::::.. . : :
CCDS30 SPTEGKGSGLQGHIIENPQ---YFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLL
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: .:. .:::.:.::. .. . .::.:: :.. :.: .:: ..:. :. .:. :.:::
CCDS30 PEQDK-MLVAVKALKEASESARQ-DFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEY
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pF1KE3 INQGDLHEFLIMRSPHSDVGCSSDEDGTVKSSLDHGDFLHIAIQIAAGMEYLSSHFFVHK
. .:::..:: :: :. . . .. . : :..: .: :.:::: ::.. :::.
CCDS30 MRHGDLNRFL--RSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHR
560 570 580 590 600 610
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pF1KE3 DLAARNILIGEQLHVKISDLGLSREIYSADYYRVQSKSLLPIRWMPPEAIMYGKFSSDSD
:::.:: :.:. : :::.:.:.::.:::.::::: ....:::::::::.:.: ::...::
CCDS30 DLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESD
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pF1KE3 IWSFGVVLWEIFSFGLQPYYGFSNQEVIEMVRKRQLLPCSEDCPPRMYSLMTECWNEIPS
.:::::::::::..: ::.: .:: :.:. . . . : . :::..:..: ::.. :.
CCDS30 VWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQ
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pF1KE3 RRPRFKDIHVRLRSWEGLSSHTSSTTPSGGNATTQTTSLSASPVSNLSNPRYPNYMFPSQ
.: .::.:.::..
CCDS30 QRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
740 750 760
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pF1KE3 NFKSDLCDIPACDSKDSKEKNKMEILYILVPSVAIP---LAIALLFFFICVCRNNQKSSS
:.: : ::..: :. . ::
CCDS30 GLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTL------GGSSL
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440 450 460 470 480 490
pF1KE3 APVQRQPKHVRGQNVEMSMLNAYKPKSKAKELPLSAVRFMEELGECAFGKIY--KGHLYL
.:.. . . ..:. .: . : . .... . . :::: ::::.. . : :
CCDS30 SPTEGKGSGLQGHIIENPQ---YFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLL
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pF1KE3 PGMDHAQLVAIKTLKDYNNPQQWTEFQQEASLMAELHHPNIVCLLGAVTQEQPVCMLFEY
: .:. .:::.:.::. .. . .::.:: :.. :.: .:: ..:. :. .:. :.:::
CCDS30 PEQDK-MLVAVKALKEASESARQ-DFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEY
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pF1KE3 INQGDLHEFLIMRSPHSDVGCSSDEDGTVKSSLDHGDFLHIAIQIAAGMEYLSSHFFVHK
. .:::..:: :: :. . . .. . : :..: .: :.:::: ::.. :::.
CCDS30 MRHGDLNRFL--RSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHR
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pF1KE3 DLAARNILIGEQLHVKISDLGLSREIYSADYYRVQSKSLLPIRWMPPEAIMYGKFSSDSD
:::.:: :.:. : :::.:.:.::.:::.::::: ....:::::::::.:.: ::...::
CCDS30 DLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESD
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680 690 700 710 720 730
pF1KE3 IWSFGVVLWEIFSFGLQPYYGFSNQEVIEMVRKRQLLPCSEDCPPRMYSLMTECWNEIPS
.:::::::::::..: ::.: .:: :.:. . . . : . :::..:..: ::.. :.
CCDS30 VWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQ
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pF1KE3 RRPRFKDIHVRLRSWEGLSSHTSSTTPSGGNATTQTTSLSASPVSNLSNPRYPNYMFPSQ
.: .::.:.::..
CCDS30 QRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
770 780 790
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270 280 290 300 310
pF1KE3 QTEYIFARSNPMILMRLKLPNCEDLPQPESPEAANCIRIG-IPMADPINKNHKCYNSTGV
: : . .: : . . .: . :. :. ..
CCDS11 VDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCLRLNQPTHVNNGNYTLLAA
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320 330 340 350 360 370
pF1KE3 DYRGTVSVT-KSGRQCQPW--NSQYPHTHTFTALRFPELNGGHSYCRNPGNQK-EAPWCF
. : .:.. .. . .:. : . : .:. . .: .: ..: :.:.
CCDS11 NPFGQASASIMAAFMDNPFEFNPEDPIPVSFSPVDTNSTSG------DPVEKKDETPFGV
370 380 390 400 410
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pF1KE3 TLDENFKSDLCDIPACDSKDSKEKNKMEILYILVPSVAIP---LAIALLFFFICVCRNNQ
.. .. : . . .. .. . . : :.: : ::..: :. .
CCDS11 SVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSLHFMTL------G
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440 450 460 470 480 490
pF1KE3 KSSSAPVQRQPKHVRGQNVEMSMLNAYKPKSKAKELPLSAVRFMEELGECAFGKIY--KG
:: .:.. . . ..:. .: . : . .... . . :::: ::::.. .
CCDS11 GSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQ---YFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAEC
480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 HLYLPGMDHAQLVAIKTLKDYNNPQQWTEFQQEASLMAELHHPNIVCLLGAVTQEQPVCM
: :: .:. .:::.:.::. .. . .::.:: :.. :.: .:: ..:. :. .:. :
CCDS11 HNLLPEQDK-MLVAVKALKEASESARQ-DFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLM
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 LFEYINQGDLHEFLIMRSPHSDVGCSSDEDGTVKSSLDHGDFLHIAIQIAAGMEYLSSHF
.:::. .:::..:: :: :. . . .. . : :..: .: :.:::: ::..
CCDS11 VFEYMRHGDLNRFL--RSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLH
590 600 610 620 630 640
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pF1KE3 FVHKDLAARNILIGEQLHVKISDLGLSREIYSADYYRVQSKSLLPIRWMPPEAIMYGKFS
:::.:::.:: :.:. : :::.:.:.::.:::.::::: ....:::::::::.:.: ::.
CCDS11 FVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFT
650 660 670 680 690 700
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pF1KE3 SDSDIWSFGVVLWEIFSFGLQPYYGFSNQEVIEMVRKRQLLPCSEDCPPRMYSLMTECWN
..::.:::::::::::..: ::.: .:: :.:. . . . : . :::..:..: ::.
CCDS11 TESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQ
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740 750 760 770 780 790
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. :..: .::.:.::..
CCDS11 REPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
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. :.:. . .. . .:: . : :. . . .. :: ..:..
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: .. :: . .... . . .:::: ::::.. .. : : .:. ::
CCDS35 FGITNSQL------KPDTFVQHIKRHNIVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKI-LV
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570 580 590 600 610 620
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CCDS35 GENLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLW
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. :..
CCDS35 TLLQNLAKASPVYLDILG
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CCDS66 GNLVS--KHMNETSHTQGS-LRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVN--LTVHFAP
240 250 260 270 280
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pF1KE3 PPT--ASPGYSDEYEEDGFCQPYRGIACARFIGNRTVYMESLHMQGEIENQITAAFTMIG
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CCDS66 VTNHTEYHGCLQLDNPT--HMN---NGDYTLIAK-NEYGKDEKQISAHFMGW--------
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270 280 290 300 310 320
pF1KE3 NPMILMRLKLPNCEDLPQPESPEAANCIRIGIPMADPINKNHKCYNSTGVDYRGTVSVTK
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CCDS66 -PGIDDGAN-PNYPDVIYEDYGTAAN--DIG----DTTNRSNEIPSTDVTD--------K
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CCDS66 TGRE---------HLSVYAVVVIASVVG---FCLLVMLFLLKLARHSKFGMKDFSW-FGF
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820 830
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]