FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1923, 460 aa 1>>>pF1KE1923 460 - 460 aa - 460 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3280+/-0.000503; mu= 4.3513+/- 0.031 mean_var=217.9400+/-43.773, 0's: 0 Z-trim(115.3): 77 B-trim: 73 in 1/52 Lambda= 0.086877 statistics sampled from 25619 (25695) to 25619 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.301), width: 16 Scan time: 9.670 The best scores are: opt bits E(85289) NP_055310 (OMIM: 604774,605019) angiopoietin-relat ( 460) 3080 399.3 1.1e-110 NP_647475 (OMIM: 605910,615881) angiopoietin-relat ( 406) 699 100.9 6.9e-21 NP_004664 (OMIM: 603874) angiopoietin-related prot ( 491) 618 90.8 9e-18 XP_005245634 (OMIM: 603874) PREDICTED: angiopoieti ( 491) 618 90.8 9e-18 NP_001138 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform a ( 496) 589 87.2 1.1e-16 NP_001112360 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform ( 444) 583 86.4 1.7e-16 NP_001186788 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform ( 497) 581 86.2 2.3e-16 NP_001137 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform 1 ( 498) 580 86.0 2.5e-16 NP_001112359 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform ( 495) 577 85.7 3.2e-16 XP_016868807 (OMIM: 601922) PREDICTED: angiopoieti ( 443) 571 84.9 4.9e-16 XP_011527541 (OMIM: 603705) PREDICTED: angiopoieti ( 451) 560 83.5 1.3e-15 NP_057069 (OMIM: 603705) angiopoietin-4 isoform 1 ( 503) 555 82.9 2.2e-15 NP_036230 (OMIM: 605001) angiopoietin-related prot ( 493) 533 80.1 1.5e-14 XP_005272541 (OMIM: 605910,615881) PREDICTED: angi ( 424) 523 78.8 3.1e-14 NP_001300980 (OMIM: 601667) angiopoietin-1 isoform ( 298) 520 78.3 3.1e-14 NP_001034756 (OMIM: 605910,615881) angiopoietin-re ( 368) 516 77.9 5.1e-14 NP_006673 (OMIM: 605351) fibroleukin precursor [Ho ( 439) 488 74.5 6.7e-13 NP_001138578 (OMIM: 613357) fibrinogen C domain-co ( 461) 486 74.2 8.2e-13 NP_116232 (OMIM: 613357) fibrinogen C domain-conta ( 461) 486 74.2 8.2e-13 NP_001308340 (OMIM: 609336) angiopoietin-related p ( 470) 465 71.6 5.2e-12 XP_011526649 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 470) 465 71.6 5.2e-12 XP_016882836 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 470) 465 71.6 5.2e-12 XP_011526652 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 470) 465 71.6 5.2e-12 NP_114123 (OMIM: 609336) angiopoietin-related prot ( 470) 465 71.6 5.2e-12 XP_011526651 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 537) 465 71.7 5.7e-12 XP_011526650 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 537) 465 71.7 5.7e-12 XP_005260148 (OMIM: 609336) PREDICTED: angiopoieti ( 551) 465 71.7 5.8e-12 XP_006717078 (OMIM: 601624) PREDICTED: ficolin-2 i ( 264) 448 69.2 1.5e-11 NP_056652 (OMIM: 601624) ficolin-2 isoform b precu ( 275) 448 69.3 1.5e-11 XP_011516694 (OMIM: 601624) PREDICTED: ficolin-2 i ( 302) 448 69.3 1.6e-11 NP_004099 (OMIM: 601624) ficolin-2 isoform a precu ( 313) 448 69.3 1.7e-11 NP_002395 (OMIM: 600596) microfibril-associated gl ( 255) 443 68.6 2.2e-11 NP_001185624 (OMIM: 600596) microfibril-associated ( 279) 443 68.6 2.4e-11 NP_001994 (OMIM: 601252) ficolin-1 precursor [Homo ( 326) 442 68.6 2.9e-11 NP_003656 (OMIM: 604973,613860) ficolin-3 isoform ( 299) 406 64.0 6.3e-10 NP_001315564 (OMIM: 601995) tenascin-R isoform 2 [ (1025) 410 65.0 1.1e-09 XP_011508251 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R (1199) 410 65.1 1.2e-09 NP_775628 (OMIM: 604973,613860) ficolin-3 isoform ( 288) 398 63.0 1.2e-09 XP_016857708 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R (1358) 410 65.1 1.3e-09 XP_016857707 (OMIM: 601995) PREDICTED: tenascin-R (1358) 410 65.1 1.3e-09 NP_003276 (OMIM: 601995) tenascin-R isoform 1 prec (1358) 410 65.1 1.3e-09 XP_005252032 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1564) 400 63.9 3.5e-09 XP_006717164 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1655) 400 64.0 3.6e-09 XP_005252031 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1655) 400 64.0 3.6e-09 XP_011516931 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1746) 400 64.0 3.8e-09 XP_011516930 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1746) 400 64.0 3.8e-09 XP_005252030 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1837) 400 64.0 3.9e-09 XP_011516928 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1929) 400 64.0 4.1e-09 XP_006717161 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (2019) 400 64.0 4.2e-09 XP_011516927 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (2019) 400 64.0 4.2e-09 >>NP_055310 (OMIM: 604774,605019) angiopoietin-related p (460 aa) initn: 3080 init1: 3080 opt: 3080 Z-score: 2108.1 bits: 399.3 E(85289): 1.1e-110 Smith-Waterman score: 3080; 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NP_647 RSQLSALERRLSACGSACQGTEGSTDLPLAPESRVDPEVLHSLQTQLKAQNSRIQQLFHK 70 80 90 100 110 120 190 200 210 220 230 pF1KE1 VEDQYKQLNQQHSQIKEIENQLRRTSIQEPTEISLSSKPRAPRTTPFLQ-LNEIRNVKH- : .: ..:..:: .:.....:. . .. . ... : : . : .. .::.. NP_647 VAQQQRHLEKQHLRIQHLQSQFGLLD-HKHLDHEVAKPARRKRLPEMAQPVDPAHNVSRL 130 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 DGIPAECTTIYNRGEHTSGMYAIRPSNSQVFHVYCDVISGSPWTLIQHRIDGSQNFNETW .: .: ... ::. ::.. :.:..: : : : . : . ::.::.: ::: .::. : NP_647 HRLPRDCQELFQVGERQSGLFEIQPQGSPPFLVNCKMTSDGGWTVIQRRHDGSVDFNRPW 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 ENYKYGFGRLDGEFWLGLEKIYSIVKQSNYVLRIELEDWKDNKHYIEYSFYLGNHETNYT : :: ::: :::::::::..::. . : : ..:.:: : . ...: .::...: :. NP_647 EAYKAGFGDPHGEFWLGLEKVHSITGDRNSRLAVQLRDWDGNAELLQFSVHLGGEDTAYS 250 260 270 280 290 300 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 LHLVA-ITGNVPNAI--PENKDLVFSTWD--HKAKGHFNCPEGYSGGWWWHDECGENNLN :.:.: ..:.. . : . .. ::::: : . :: .. :::::. :...::: NP_647 LQLTAPVAGQLGATTVPPSGLSVPFSTWDQDHDLRRDKNCAKSLSGGWWF-GTCSHSNLN 310 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 pF1KE1 GKYNKPRAKSKPERRRGLSWKSQNGRLYSIKSTKMLIHPTDSESFE :.: . ... . ..:. ::. :: : ...: :::.: .:. NP_647 GQYFRSIPQQRQKLKKGIFWKTWRGRYYPLQATTMLIQPMAAEAAS 370 380 390 400 >>NP_004664 (OMIM: 603874) angiopoietin-related protein (491 aa) initn: 392 init1: 315 opt: 618 Z-score: 440.1 bits: 90.8 E(85289): 9e-18 Smith-Waterman score: 623; 30.8% identity (60.6% similar) in 419 aa overlap (57-455:88-491) 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 DSLSPEPKSRFAMLDDVKILANGLLQLGHGLKDFVHKTKGQINDIFQKLNIFDQSFYDLS ::: . . : .: :..: . : .. . NP_004 QRITGPICVNTKGQDASTIKDMITRMDLENLKDVLSRQKREI-DVLQLVVDVDGNIVN-- 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 pF1KE1 LQTSEIKEEEKEL--RRTTYKLQVKNEEVK--NMSLELN---SKLESLLEEKILLQQKVK ... ...: ... : : .:. .: .. . ::::. .:. .. : . . . . NP_004 -EVKLLRKESRNMNSRVTQLYMQLLHEIIRKRDNSLELSQLENKILNVTTEMLKMATRYR 120 130 140 150 160 170 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 YLEEQ---LTNLIQNQPETPEHPEVTSLKTFVEKQDNSIKDLLQTVEDQYKQLNQQHSQI :: . ::.:..:: : :. : .::. .. : : :. .::.. NP_004 ELEVKYASLTDLVNNQSVMITLLEEQCLRIF-SRQDTHVSPPLVQVVPQHIPNSQQYTPG 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 KEIENQLRRT-----SIQEPTEISLSSKPRAPRTTPFLQLNEIRNVKHDGIPAECTTIYN :...: ... : ... : : .:: .. . . ..: .: . NP_004 LLGGNEIQRDPGYPRDLMPPPDLATS-----PTKSPF-KIPPVTFI-NEGPFKDCQQAKE 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 pF1KE1 RGEHTSGMYAIRPSNSQ-VFHVYCD-VISGSPWTLIQHRIDGSQNFNETWENYKYGFGRL :. .::.: :.: ::. ....:. .. . ::.::.: ::: :: ..::::: ::: . NP_004 AGHSVSGIYMIKPENSNGPMQLWCENSLDPGGWTVIQKRTDGSVNFFRNWENYKKGFGNI 290 300 310 320 330 340 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 DGEFWLGLEKIYSIVKQSNYVLRIELEDWKDNKHYIEYS-FYLGNHETNYTLHLVAITGN :::.:::::.:: . .:.:: : ::::::.:.: : ::: : : . : :.: . :: NP_004 DGEYWLGLENIYMLSNQDNYKLLIELEDWSDKKVYAEYSSFRLEPESEFYRLRLGTYQGN 350 360 370 380 390 400 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 VPNAIPENKDLVFSTWDHKAKGHF--NCPEGYSGGWWWHDECGENNLNGKYNKPRAKSKP . ... .. :.: : . : . :: . ..::::. . :...:::: . . .. . NP_004 AGDSMMWHNGKQFTTLD-RDKDMYAGNCAHFHKGGWWY-NACAHSNLNGVWYRG-GHYRS 410 420 430 440 450 460 430 440 450 460 pF1KE1 ERRRGLSWKSQNGRLYSIKSTKMLIHPTDSESFE ... :. : : ::.....:.:.: : NP_004 KHQDGIFWAEYRGGSYSLRAVQMMIKPID 470 480 490 >>XP_005245634 (OMIM: 603874) PREDICTED: angiopoietin-re (491 aa) initn: 392 init1: 315 opt: 618 Z-score: 440.1 bits: 90.8 E(85289): 9e-18 Smith-Waterman score: 623; 30.8% identity (60.6% similar) in 419 aa overlap (57-455:88-491) 30 40 50 60 70 80 pF1KE1 DSLSPEPKSRFAMLDDVKILANGLLQLGHGLKDFVHKTKGQINDIFQKLNIFDQSFYDLS ::: . . : .: :..: . : .. . XP_005 QRITGPICVNTKGQDASTIKDMITRMDLENLKDVLSRQKREI-DVLQLVVDVDGNIVN-- 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 pF1KE1 LQTSEIKEEEKEL--RRTTYKLQVKNEEVK--NMSLELN---SKLESLLEEKILLQQKVK ... ...: ... : : .:. .: .. . ::::. .:. .. : . . . . XP_005 -EVKLLRKESRNMNSRVTQLYMQLLHEIIRKRDNSLELSQLENKILNVTTEMLKMATRYR 120 130 140 150 160 170 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 YLEEQ---LTNLIQNQPETPEHPEVTSLKTFVEKQDNSIKDLLQTVEDQYKQLNQQHSQI :: . ::.:..:: : :. : .::. .. : : :. .::.. XP_005 ELEVKYASLTDLVNNQSVMITLLEEQCLRIF-SRQDTHVSPPLVQVVPQHIPNSQQYTPG 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 KEIENQLRRT-----SIQEPTEISLSSKPRAPRTTPFLQLNEIRNVKHDGIPAECTTIYN :...: ... : ... : : .:: .. . . ..: .: . XP_005 LLGGNEIQRDPGYPRDLMPPPDLATS-----PTKSPF-KIPPVTFI-NEGPFKDCQQAKE 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 pF1KE1 RGEHTSGMYAIRPSNSQ-VFHVYCD-VISGSPWTLIQHRIDGSQNFNETWENYKYGFGRL :. .::.: :.: ::. ....:. .. . ::.::.: ::: :: ..::::: ::: . XP_005 AGHSVSGIYMIKPENSNGPMQLWCENSLDPGGWTVIQKRTDGSVNFFRNWENYKKGFGNI 290 300 310 320 330 340 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 DGEFWLGLEKIYSIVKQSNYVLRIELEDWKDNKHYIEYS-FYLGNHETNYTLHLVAITGN :::.:::::.:: . .:.:: : ::::::.:.: : ::: : : . : :.: . :: XP_005 DGEYWLGLENIYMLSNQDNYKLLIELEDWSDKKVYAEYSSFRLEPESEFYRLRLGTYQGN 350 360 370 380 390 400 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 VPNAIPENKDLVFSTWDHKAKGHF--NCPEGYSGGWWWHDECGENNLNGKYNKPRAKSKP . ... .. :.: : . : . :: . ..::::. . :...:::: . . .. . XP_005 AGDSMMWHNGKQFTTLD-RDKDMYAGNCAHFHKGGWWY-NACAHSNLNGVWYRG-GHYRS 410 420 430 440 450 460 430 440 450 460 pF1KE1 ERRRGLSWKSQNGRLYSIKSTKMLIHPTDSESFE ... :. : : ::.....:.:.: : XP_005 KHQDGIFWAEYRGGSYSLRAVQMMIKPID 470 480 490 >>NP_001138 (OMIM: 601922) angiopoietin-2 isoform a prec (496 aa) initn: 439 init1: 252 opt: 589 Z-score: 420.4 bits: 87.2 E(85289): 1.1e-16 Smith-Waterman score: 605; 30.2% identity (62.0% similar) in 450 aa overlap (36-455:79-495) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 LLLFIVPLVISSRIDQDNSSFDSLSPEPKSRFAMLDDVKILANG---LLQLGHGLKDFVH :. .:.. :. :. :..: . ..: .. 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XP_016 GDNDKCICKCSQMLTGGWWF-DACGPSNLNGMYYPQRQNTN--KFNGIKWYYWKGSGYSL 380 390 400 410 420 430 450 460 pF1KE1 KSTKMLIHPTDSESFE :.: :.:.:.: XP_016 KATTMMIRPADF 440 460 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 19:18:30 2016 done: Sun Nov 6 19:18:31 2016 Total Scan time: 9.670 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]