FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7846, 620 aa 1>>>pF1KB7846 620 - 620 aa - 620 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0517+/-0.00111; mu= -15.0826+/- 0.066 mean_var=520.3428+/-110.030, 0's: 0 Z-trim(117.4): 666 B-trim: 1092 in 1/52 Lambda= 0.056225 statistics sampled from 17390 (18153) to 17390 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.827), E-opt: 0.2 (0.558), width: 16 Scan time: 4.330 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS582.1 GLIS1 gene_id:148979|Hs108|chr1 ( 620) 4412 372.5 9e-103 CCDS6451.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 ( 775) 1337 123.2 1.3e-27 CCDS43784.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 ( 930) 1337 123.3 1.5e-27 CCDS33283.1 GLI2 gene_id:2736|Hs108|chr2 (1586) 775 77.9 1.2e-13 CCDS53806.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1065) 767 77.1 1.4e-13 CCDS8940.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1106) 767 77.1 1.4e-13 CCDS53807.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 ( 978) 763 76.7 1.6e-13 CCDS5465.1 GLI3 gene_id:2737|Hs108|chr7 (1580) 765 77.1 2e-13 CCDS10511.1 GLIS2 gene_id:84662|Hs108|chr16 ( 524) 750 75.4 2.1e-13 >>CCDS582.1 GLIS1 gene_id:148979|Hs108|chr1 (620 aa) initn: 4412 init1: 4412 opt: 4412 Z-score: 1958.5 bits: 372.5 E(32554): 9e-103 Smith-Waterman score: 4412; 100.0% identity (100.0% similar) in 620 aa overlap (1-620:1-620) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MAEARTSLSAHCRGPLATGLHPDLDLPGRSLATPAPSCYLLGSEPSSGLGLQPETHLPEG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MAEARTSLSAHCRGPLATGLHPDLDLPGRSLATPAPSCYLLGSEPSSGLGLQPETHLPEG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 SLKRCCVLGLPPTSPASSSPCASSDVTSIIRSSQTSLVTCVNGLRSPPLTGDLGGPSKRA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 SLKRCCVLGLPPTSPASSSPCASSDVTSIIRSSQTSLVTCVNGLRSPPLTGDLGGPSKRA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 RPGPASTDSHEGSLQLEACRKASFLKQEPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQLPPGPSLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 RPGPASTDSHEGSLQLEACRKASFLKQEPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQLPPGPSLG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 GLGLGLAGRVVAGRQACRWVDCCAAYEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 GLGLGLAGRVVAGRQACRWVDCCAAYEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRY 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 KPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCMFEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 KPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCMFEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQ 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 KAFSNSSDRAKHQRTHLDTKPYACQIPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKKLHAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 KAFSNSSDRAKHQRTHLDTKPYACQIPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKKLHAG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 PDTEADVLTECLVLQQLHTSTQLAASDGKGGCGLGQELLPGVYPGSITPHNGLASGLLPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 PDTEADVLTECLVLQQLHTSTQLAASDGKGGCGLGQELLPGVYPGSITPHNGLASGLLPP 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 AHDVPSRHHPLDATTSSHHHLSPLPMAESTRDGLGPGLLSPIVSPLKGLGPPPLPPSSQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 AHDVPSRHHPLDATTSSHHHLSPLPMAESTRDGLGPGLLSPIVSPLKGLGPPPLPPSSQS 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 HSPGGQPFPTLPSKPSYPPFQSPPPPPLPSPQGYQGSFHSIQSCFPYGDCYRMAEPAAGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 HSPGGQPFPTLPSKPSYPPFQSPPPPPLPSPQGYQGSFHSIQSCFPYGDCYRMAEPAAGG 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB7 DGLVGETHGFNPLRPNGYHSLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDVVSSGPEDCGF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 DGLVGETHGFNPLRPNGYHSLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDVVSSGPEDCGF 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KB7 FPNGAFDHCLGHIPSIYTDT :::::::::::::::::::: CCDS58 FPNGAFDHCLGHIPSIYTDT 610 620 >>CCDS6451.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 (775 aa) initn: 1184 init1: 1184 opt: 1337 Z-score: 609.2 bits: 123.2 E(32554): 1.3e-27 Smith-Waterman score: 1394; 41.6% identity (62.1% similar) in 659 aa overlap (4-619:141-774) 10 20 30 pF1KB7 MAEARTSLSAHCRGPLATGLHPDLDLPGRSLAT ::.. : .::. :. :.. :. : CCDS64 SNSLPSYLFGTESSHSPYPSPRHSSTRSHSARSKKRALSLSPLSDGIGIDFNTIIRTSPT 120 130 140 150 160 170 40 50 60 70 80 90 pF1KB7 PAPSCYLLGSEPS-SGLGLQPETHLPEGSLKRCCVLGLPPTSPASSSPC--ASSDVTSII . :. ::. : ..:. :::.. ... :. : :.:.. : . .. 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CCDS64 -RSGAEDATFLQISTVDRCPSQLSSVYTEG 750 760 770 >>CCDS43784.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 (930 aa) initn: 1184 init1: 1184 opt: 1337 Z-score: 608.2 bits: 123.3 E(32554): 1.5e-27 Smith-Waterman score: 1394; 41.6% identity (62.1% similar) in 659 aa overlap (4-619:296-929) 10 20 30 pF1KB7 MAEARTSLSAHCRGPLATGLHPDLDLPGRSLAT ::.. : .::. :. :.. :. : CCDS43 SNSLPSYLFGTESSHSPYPSPRHSSTRSHSARSKKRALSLSPLSDGIGIDFNTIIRTSPT 270 280 290 300 310 320 40 50 60 70 80 90 pF1KB7 PAPSCYLLGSEPS-SGLGLQPETHLPEGSLKRCCVLGLPPTSPASSSPC--ASSDVTSII . :. ::. : ..:. :::.. ... :. : :.:.. : . .. CCDS43 SLVA-YINGSRASPANLSPQPEVYGHFLGVRGSCI-PQPRPVPGSQKGVLVAPGGLALPA 330 340 350 360 370 380 100 110 120 130 140 pF1KB7 RSSQTSLV-----TCVNGLRSPPLTGDLGGPSKRARPGPASTDSHEGSLQLEACRK--AS . . .: .: .: :.. . ... ::: : .. : .. : .. .: CCDS43 YGEDGALEHERMQQLEHGGLQPGLVNHM--VVQHGLPGPDSQSA--GLFKTERLEEFPGS 390 400 410 420 430 150 160 170 180 190 pF1KB7 FLKQEPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQLPPGPSLGGLGLGLA---------GRV--VA . :: . : : : :::: : :: . :: :.. .. CCDS43 TVDLPPAPPLPPL--PPPPGPPPPYHAHAHLHHPELGPHAQQLALPQATLDDDGEMDGIG 440 450 460 470 480 490 200 210 220 230 240 250 pF1KB7 GRQACRWVDCCAAYEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIH :.. :::.:: : :.::::::::::: ::::::::::::::::: ::::::::::::::: CCDS43 GKHCCRWIDCSALYDQQEELVRHIEKVHIDQRKGEDFTCFWAGCPRRYKPFNARYKLLIH 500 510 520 530 540 550 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 MRVHSGEKPNKCMFEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKH :::::::::::: :::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS43 MRVHSGEKPNKCTFEGCEKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKH 560 570 580 590 600 610 320 330 340 350 360 370 pF1KB7 QRTHLDTKPYACQIPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKKLHAGPDTEADVLTECL :::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::.::::... . . :.::.:: CCDS43 QRTHLDTKPYACQIPGCTKRYTDPSSLRKHVKAHSSKEQQARKKLRSSTELHPDLLTDCL 620 630 640 650 660 670 380 390 400 410 420 pF1KB7 VLQQLH--TSTQLAASDGKGGC--GLGQELLPG-VYPGSITPHNGLASGLLPPAHDV--P ..:.:. :: . ::..: : : : .: . .. .. . ..: :.: .:: : : : CCDS43 TVQSLQPATSPRDAAAEGTVGRSPGPGPDLYSAPIFSSNYSSRSGTAAGAVPPPHPVSHP 680 690 700 710 720 730 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 SRHHPLDATTSS-HHHLSPLPMAESTRDGLGPGLLSPI-VSPLKGLGPPPLPPSS-QSHS : : .... . .: :: ... . ..:. :: .:: . : : : : . CCDS43 SPGHNVQGSPHNPSSQLPPLTAVDAGAERFAPSAPSPHHISPRR----VPAPSSILQRTQ 740 750 760 770 780 790 490 500 510 520 530 pF1KB7 PGGQPFPTLPSKPSYPPFQSPPPPPLPSPQGYQ--GSFHSIQS-CFP-YGDCYRMAEPAA : :. :: .: : .:.: . : . ..:. : : : : :.. :.. CCDS43 P---PYTQQPSGSHLKSYQ-PETNSSFQPNGIHVHGFYGQLQKFCPPHYPDSQRIVPPVS 800 810 820 830 840 540 550 560 570 580 590 pF1KB7 GG-------DGLVGETHGFNPLRPNGYH-SLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDV . : :: . : . . .: ..:: : :. :.. . .:.. CCDS43 SCSVVPSFEDCLVPTSMGQASF--DVFHRAFSTHSGITVYDL------PSSSSSLFGESL 850 860 870 880 890 900 600 610 620 pF1KB7 VSSGPEDCGFFPNGAFDHCLGHIPSIYTDT :: :: :. .. :.: ... :.::. CCDS43 -RSGAEDATFLQISTVDRCPSQLSSVYTEG 910 920 930 >>CCDS33283.1 GLI2 gene_id:2736|Hs108|chr2 (1586 aa) initn: 653 init1: 483 opt: 775 Z-score: 358.8 bits: 77.9 E(32554): 1.2e-13 Smith-Waterman score: 810; 33.1% identity (54.2% similar) in 649 aa overlap (1-572:260-869) 10 20 pF1KB7 MAEARTSLSAH-CRGPLATG-LHPDLDLPG . ..:.: .: : :..: : : . .: CCDS33 KRALSISPLSDASLDLQRMIRTSPNSLVAYINNSRSSSAASGSYGHLSAGALSPAFTFP- 230 240 250 260 270 280 30 40 50 60 70 80 pF1KB7 RSLATPAPSCYLLGSEPSSG--LGLQPETHLPEGSLKRCCVLGLP-----PTSPASSSPC .:. .:... . : .: : : .. ..: ::. .::: : CCDS33 -HPINPVAYQQILSQQRGLGSAFGHTPPLIQPSPTFLAQQPMALTSINATPTQLSSSSNC 290 300 310 320 330 340 90 100 110 120 130 140 pF1KB7 ASSDVTSIIRSSQTSLVTCVNGLRSPPLTGDLGGPSKRARPGPASTDSHEGSLQLEACRK : :... .::.... . :: :.. ::.. ..:. :. : CCDS33 LS-DTNQNKQSSESAVSSTVN-----PVA-----IHKRSK---VKTEP-------EGLRP 350 360 370 380 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 ASFLKQEPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQLPP-GPSLGGLGLGLAGRVVAGRQACRWV :: : : ... : . : : :: .: ..:: . :.: CCDS33 ASPL----ALTQGQVSGHGSCGCALPLSQEQLADLKEDLDRDDCKQEAEVVIYETNCHWE 390 400 410 420 430 440 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 DCCAAYEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEK :: :. ::.::.::.. :: .: : :.: : .:.:. :::.:.: :..::: :.::: CCDS33 DCTKEYDTQEQLVHHINNEHIHGEKKE-FVCRWQACTREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEK 450 460 470 480 490 500 270 280 290 300 310 pF1KB7 PNKCMFEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ-RTHLDT :.:: :::::::.::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.::::::: ::: . CCDS33 PHKCTFEGCSKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNE 510 520 530 540 550 560 320 330 340 350 pF1KB7 KPYACQIPGCSKRYTDPSSLRKHVK------AHSAKEQQ----VRKKL------------ ::: :.::::.:::::::::::::: :: .:.:. .: : CCDS33 KPYICKIPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKKQRNDVHLRTPLLKENGDSEAGTE 570 580 590 600 610 620 360 370 380 390 pF1KB7 HAGPD-TEAD----VLTECLVLQQLHT-STQLAASD--GKGGCG-----LGQE------- .::. :::. .. .:: .. ..: :. : :. ....:. ::. CCDS33 PGGPESTEASSTSQAVEDCLHVRAIKTESSGLCQSSPGAQSSCSSEPSPLGSAPNNDSGV 630 640 650 660 670 680 400 410 420 430 440 pF1KB7 LLPGVYPGSITPHNGLASGLLPPAHDVPSRHHPLDATTSSHHHLSPLPMAE--------S .::. :::. ..: . ::. :. . : . . ..:.. . : : CCDS33 EMPGTGPGSLGDLTALDD--TPPGADTSALAAPSAGGLQLRKHMTTMHRFEQLKKEKLKS 690 700 710 720 730 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 TRDGLGPGLLSPIVSPLKGLGPPPLPPSSQ-----SHSPGGQPFPTLPSKPSYPPFQSPP .:. . . .: . : :::: :.. : : :: : ::. : ... CCDS33 LKDSCSWAGPTPHTRNTKL---PPLPGSGSILENFSGSGGGGPAGLLPN-PRLSELSASE 740 750 760 770 780 790 510 520 530 540 550 pF1KB7 PPPLPSPQGYQGSFHS-IQSCF----------PYGDCYRMAEPAAGGDGLVGETHGFNPL : . : . : : ..: . :: . : .: . : .:. : : CCDS33 VTMLSQLQERRDSSTSTVSSAYTVSRRSSGISPYFSSRRSSEASPLG---AGRPH--NAS 800 810 820 830 840 850 560 570 580 590 600 610 pF1KB7 RPNGYHSLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDVVSSGPEDCGFFPNGAFDHCLGHI ..: .:: . :: CCDS33 SADSYDPISTDASRRSSEASQCSGGSGLLNLTPAQQYSLRAKYAAATGGPPPTPLPGLER 860 870 880 890 900 910 >>CCDS53806.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1065 aa) initn: 617 init1: 481 opt: 767 Z-score: 357.5 bits: 77.1 E(32554): 1.4e-13 Smith-Waterman score: 803; 32.9% identity (52.7% similar) in 583 aa overlap (36-570:16-546) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 TSLSAHCRGPLATGLHPDLDLPGRSLATPAPSCYLLGSEPSSGLGLQPETHLPEGSLKRC : : : ::.: : . : .: . CCDS53 MFNSMTPPPISSYGEPCC--LRPLPSQG---APSVGT-EVKLTKK 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KB7 CVLGLPPTSPASSSPCASSDVTSIIRSSQTSLVTCVNGLRSPP-----------LTGDLG .:.. : : :: :. ..::.: .:::. .:. . : .. .:: CCDS53 RALSISPLSDASL------DLQTVIRTSPSSLVAFINSRCTSPGGSYGHLSIGTMSPSLG 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 pF1KB7 GPSKRA-RPGPAST---------DSHEGSLQLEACRKASFLKQEPADEFSELFGPHQQGL :.. . ::. . :: .:.. . .. : . .:.. : : .. CCDS53 FPAQMNHQKGPSPSFGVQPCGPHDSARGGMIPHPQSRGPFPTCQLKSELDMLVGKCRE-- 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 pF1KB7 PPPYPLSQLPPGPSLGGLG---LG-LAGRVVAGRQA-----------CRWVDCCAAYEQQ :: .:. :. :: : :: :. ::: : ...: CCDS53 ---EPLEGDMSSPNSTGIQDPLLGMLDGREDLEREEKREPESVYETDCRWDGCSQEFDSQ 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 EELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCMFEGC :.::.::.. :: .. : :.: :.:: :. .::.:.: :..::: :.::::.:: :::: CCDS53 EQLVHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGC 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 SKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ-RTHLDTKPYACQIPG :..::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.::::::: ::: . :::.:..:: CCDS53 RKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKLPG 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 CSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKKLHA-GPDTEADVLTECLVLQQLHTSTQLAASD :.::::::::::::::. . . .: :. .. :: .: . :: . CCDS53 CTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSI-----------STVEPKRE 330 340 350 360 370 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 GKGGCGLGQELLPGVYPGSITPHNGLASGLLPPAHD-VPSRHHPLDATTSSHHHLSPLPM .:: . .: : :.. :. . : :.. : : : ..... . CCDS53 REGG-PIREESRLTVPEGAMKPQPS------PGAQSSCSSDHSPAGSAANTDSGVEMTGN 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 pF1KB7 AESTRDGL-----GPGLLSPIVSPLKGLGPPPLPPSSQSHSPG--GQPFPTLPSKPSYPP : .. . : :: . . .: :. : : : . : : .:.: . CCDS53 AGGSTEDLSSLDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTRGLKLPSLSHTGTTVS 430 440 450 460 470 480 500 510 520 530 540 550 pF1KB7 FQSPPPPPLPSPQGYQGSFHSIQSCFPYGDCYRMAEPAAGGDGLVGETHGFNPLRP--NG . :: : . ..: ::.: . . .: : : : : :: CCDS53 RRVGPPVSL---ERRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASP-------------FPPGSPPENG 490 500 510 520 530 560 570 580 590 600 610 pF1KB7 YHSLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDVVSSGPEDCGFFPNGAFDHCLGHIPSIY :: .:: : CCDS53 ASSLPGLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPPWRSRAEYPGYNPNAG 540 550 560 570 580 590 >>CCDS8940.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1106 aa) initn: 572 init1: 481 opt: 767 Z-score: 357.3 bits: 77.1 E(32554): 1.4e-13 Smith-Waterman score: 821; 33.3% identity (51.9% similar) in 615 aa overlap (12-570:18-587) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAEARTSLSAHCRGPLATGLHPDLDLPGRSLATPAPSCYL--LGSEPSSGLGLQ : :: . :.. : :. : : :. : : : : : CCDS89 MFNSMTPPPISSYGEPCCLRPLPSQGAPSVGTEG--LSGP-PFCHQANLMSGPHS-YGPA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 PETH-LPEGSL---KRCCVLGLPPTSPASSSPC--ASSDVTSIIRSSQTSLVTCVNGLRS ::. :: : : : : : :: :: :. ..::.: .:::. .:. . CCDS89 RETNSCTEGPLFSSPRSAV-KLTKKRALSISPLSDASLDLQTVIRTSPSSLVAFINSRCT 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 pF1KB7 PP-----------LTGDLGGPSKRA-RPGPAST---------DSHEGSLQLEACRKASFL : .. .:: :.. . ::. . :: .:.. . .. : CCDS89 SPGGSYGHLSIGTMSPSLGFPAQMNHQKGPSPSFGVQPCGPHDSARGGMIPHPQSRGPFP 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 pF1KB7 KQEPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQLPPGPSLGGLG---LG-LAGRVVAGRQA----- . .:.. : : .. :: .:. :. :: : :: :. CCDS89 TCQLKSELDMLVGKCRE-----EPLEGDMSSPNSTGIQDPLLGMLDGREDLEREEKREPE 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KB7 ------CRWVDCCAAYEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLL ::: : ...::.::.::.. :: .. : :.: :.:: :. .::.:.: :. CCDS89 SVYETDCRWDGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLV 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 IHMRVHSGEKPNKCMFEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRA .::: :.::::.:: :::: :..::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.:::: CCDS89 VHMRRHTGEKPHKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRA 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 pF1KB7 KHQ-RTHLDTKPYACQIPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKKLHA-GPDTEADVL ::: ::: . :::.:..:::.::::::::::::::. . . .: :. .. :: .: . CCDS89 KHQNRTHSNEKPYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSI 350 360 370 380 390 400 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 TECLVLQQLHTSTQLAASDGKGGCGLGQELLPGVYPGSITPHNGLASGLLPPAHD-VPSR :: . .:: . .: : :.. :. . : :.. : CCDS89 -----------STVEPKREREGG-PIREESRLTVPEGAMKPQPS------PGAQSSCSSD 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 HHPLDATTSSHHHLSPLPMAESTRDGL-----GPGLLSPIVSPLKGLGPPPLPPSSQSHS : : ..... . : .. . : :: . . .: :. : : : . CCDS89 HSPAGSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRP 460 470 480 490 500 510 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 PG--GQPFPTLPSKPSYPPFQSPPPPPLPSPQGYQGSFHSIQSCFPYGDCYRMAEPAAGG : : .:.: . . :: : . ..: ::.: . . .: : CCDS89 IGTRGLKLPSLSHTGTTVSRRVGPPVSL---ERRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASP---- 520 530 540 550 560 550 560 570 580 590 pF1KB7 DGLVGETHGFNPLRP--NGYHSLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDVVSSGPEDC : : : :: :: .:: : CCDS89 ---------FPPGSPPENGASSLPGLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIGGL 570 580 590 600 610 600 610 620 pF1KB7 GFFPNGAFDHCLGHIPSIYTDT CCDS89 PMPPWRSRAEYPGYNPNAGVTRRASDPAQAADRPAPARVQRFKSLGCVHTPPTVAGGGQN 620 630 640 650 660 670 >>CCDS53807.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (978 aa) initn: 617 init1: 481 opt: 763 Z-score: 356.3 bits: 76.7 E(32554): 1.6e-13 Smith-Waterman score: 776; 34.7% identity (54.8% similar) in 478 aa overlap (108-570:28-459) 80 90 100 110 120 130 pF1KB7 SSPCASSDVTSIIRSSQTSLVTCVNGLRSPPLTGDLGG--PSKRAR-PGPASTDSHEGSL : . :: : ..: : :. . : .. CCDS53 MSPSLGFPAQMNHQKGPSPSFGVQPCGPHDSARGGMIPHPQSRGPFPTCQLKSELDM 10 20 30 40 50 140 150 160 170 180 190 pF1KB7 QLEACRKASFLKQEPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQLPPGPSLGGLGLGLAGRVVAGR . :: .:: . ... .:.. :. : :..: .: : . CCDS53 LVGKCR------EEPLE--GDMSSPNSTGIQDPL-LGMLDGREDLEREEKREPESVY--E 60 70 80 90 100 200 210 220 230 240 250 pF1KB7 QACRWVDCCAAYEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIHMR ::: : ...::.::.::.. :: .. : :.: :.:: :. .::.:.: :..::: CCDS53 TDCRWDGCSQEFDSQEQLVHHINSEHIHGERKE-FVCHWGGCSRELRPFKAQYMLVVHMR 110 120 130 140 150 160 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 VHSGEKPNKCMFEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ- :.::::.:: :::: :..::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.::::::: CCDS53 RHTGEKPHKCTFEGCRKSYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEHEGCSKAFSNASDRAKHQN 170 180 190 200 210 220 320 330 340 350 360 370 pF1KB7 RTHLDTKPYACQIPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKKLHA-GPDTEADVLTECL ::: . :::.:..:::.::::::::::::::. . . .: :. .. :: .: . CCDS53 RTHSNEKPYVCKLPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPDAHVTKRHRGDGPLPRAPSI---- 230 240 250 260 270 280 380 390 400 410 420 430 pF1KB7 VLQQLHTSTQLAASDGKGGCGLGQELLPGVYPGSITPHNGLASGLLPPAHD-VPSRHHPL :: . .:: . .: : :.. :. . : :.. : : : CCDS53 -------STVEPKREREGG-PIREESRLTVPEGAMKPQPS------PGAQSSCSSDHSPA 290 300 310 320 440 450 460 470 480 pF1KB7 DATTSSHHHLSPLPMAESTRDGL-----GPGLLSPIVSPLKGLGPPPLPPSSQSHSPG-- ..... . : .. . : :: . . .: :. : : : . : CCDS53 GSAANTDSGVEMTGNAGGSTEDLSSLDEGPCIAGTGLSTLRRLENLRLDQLHQLRPIGTR 330 340 350 360 370 380 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 GQPFPTLPSKPSYPPFQSPPPPPLPSPQGYQGSFHSIQSCFPYGDCYRMAEPAAGGDGLV : .:.: . . :: : . ..: ::.: . . .: : CCDS53 GLKLPSLSHTGTTVSRRVGPPVSL---ERRSSSSSSISSAYTVSRRSSLASP-------- 390 400 410 420 430 550 560 570 580 590 600 pF1KB7 GETHGFNPLRP--NGYHSLSTPLPATGYEALAEASCPTALPQQPSEDVVSSGPEDCGFFP : : : :: :: .:: : CCDS53 -----FPPGSPPENGASSLPGLMPAQHYLLRARYASARGGGTSPTAASSLDRIGGLPMPP 440 450 460 470 480 490 >>CCDS5465.1 GLI3 gene_id:2737|Hs108|chr7 (1580 aa) initn: 612 init1: 481 opt: 765 Z-score: 354.4 bits: 77.1 E(32554): 2e-13 Smith-Waterman score: 788; 41.7% identity (60.9% similar) in 348 aa overlap (71-398:344-679) 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 LGSEPSSGLGLQPETHLPEGSLKRCCVLGLPPTSPASSSPCASSDVTSIIRSSQTSLVTC : : . :: .: . . : : : :: . CCDS54 PNSLVTILNNSRSSSSASGSYGHLSASAISPALSFTYSSAPVSLHMHQQILSRQQSLGSA 320 330 340 350 360 370 110 120 130 140 150 pF1KB7 VNGLRSPPLTGDLGG-PSKRARPG------PASTDS--HEGSLQLEACRKASFLKQEPAD . .:::: :..: :: :....: :.: . . ..: .: CCDS54 FG--HSPPLIHPAPTFPTQRPIPGIPTVLNPVQVSSGPSESSQNKPTSESAVSSTGDPMH 380 390 400 410 420 430 160 170 180 190 200 pF1KB7 EFSELFGPHQQGLPPPYPLSQL--PPGPSL----GGLGLGLAGRVVAGRQACRWVDCCAA . . : .. :: : .: : : .: : . : . :.: : CCDS54 NKRSKIKPDED-LPSPGARGQQEQPEGTTLVKEEGDKDESKQEPEVIYETNCHWEGCARE 440 450 460 470 480 490 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 YEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCM .. ::.::.::...:: .: : :.: : : :. :::.:.: :..::: :.::::.:: CCDS54 FDTQEQLVHHINNDHIHGEKKE-FVCRWLDCSREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCT 500 510 520 530 540 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 FEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQ-RTHLDTKPYAC ::::.::.::::::: :::::::::::.:.: ::.:::::.::::::: ::: . :::.: CCDS54 FEGCTKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVC 550 560 570 580 590 600 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 QIPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHSAKEQQVRKK----LHAGPDTEADVLTECLVLQQLHTS .::::.::::::::::::::. . : .: :: .: : : . :.. CCDS54 KIPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPEAHVTKKQRGDIHPRPPPPRDSGS--------HSQ 610 620 630 640 650 660 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 TQLAASDGKGGCGLGQELLPGVYPGSITPHNGLASGLLPPAHDVPSRHHPLDATTSSHHH .. . .:. : :.: CCDS54 SRSPGRPTQGALGEQQDLSNTTSKREECLQVKTVKAEKPMTSQPSPGGQSSCSSQQSPIS 670 680 690 700 710 720 >>CCDS10511.1 GLIS2 gene_id:84662|Hs108|chr16 (524 aa) initn: 814 init1: 434 opt: 750 Z-score: 354.1 bits: 75.4 E(32554): 2.1e-13 Smith-Waterman score: 764; 36.7% identity (58.1% similar) in 439 aa overlap (68-491:40-431) 40 50 60 70 80 90 pF1KB7 CYLLGSEPSSGLGLQPETHLPEGSLKRCCVLGLPPTSPASSSPCASSDVTSIIRSSQTSL ::: ::. .:: .: .... .:. . CCDS10 LKLSITKLRAAREKRERTLGVVRPRALHRELGLVDDSPTPGSP--GSPPSGFLLNSK--F 10 20 30 40 50 60 100 110 120 130 140 pF1KB7 VTCVNG-LRSPPLTG-DLGGPSKRARPGPASTDSHE--GSLQLEACRKAS------FLKQ :.: . . ::. .:. :: :. .:. : : :. .: .:: .: CCDS10 PEKVEGRFSAAPLVDLSLSPPSGLDSPNGSSSLSPERQGNGDLPPVPSASDFQPLRYLDG 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 EPADEFSELFGPHQQGLPPPYPLSQL--PPGPSLGGLGLGLAGRVVAGRQACRWVDCCAA :.. : ..: : .: : :.. :: . . : : ..: :::. : CCDS10 VPSS-F-QFFLPLGSGGALHLPASSFLTPPKDKCLSPDLPLPKQLV-----CRWAKCNQL 130 140 150 160 170 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 YEQQEELVRHIEKSHIDQRKGEDFTCFWAGCVRRYKPFNARYKLLIHMRVHSGEKPNKCM .: ..:: :.. :. .: . : : ::.:. . ::::::.:::.:.:..:::..: CCDS10 FELLQDLVDHVNDYHVKPEKDAGYCCHWEGCARHGRGFNARYKMLIHIRTHTNEKPHRC- 180 190 200 210 220 230 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 FEGCSKAFSRLENLKIHLRSHTGEKPYLCQHPGCQKAFSNSSDRAKHQRTHLDTKPYACQ :::.:::::::::: :::::::::.: . ::.: .:::::: :: ::: ::: :. CCDS10 -PTCSKSFSRLENLKIHNRSHTGEKPYVCPYEGCNKRYSNSSDRFKHTRTHYVDKPYYCK 240 250 260 270 280 290 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 IPGCSKRYTDPSSLRKHVKAHS---AKEQQVRKKLHAGPDTEADVLTECLVLQQLHTSTQ .::: ::::::::::::.:::. ..::: .:. : . CCDS10 MPGCHKRYTDPSSLRKHIKAHGHFVSHEQQELLQLRPPP------------------KPP 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 LAASDGKGGCGLGQELLPGVYPGSITPHNGLASGLLPPAHDVPSRHHPLDATTSSHHHLS : : :: . .: ..:. :... :: :. .: ::: .. . . . CCDS10 LPAPDGGPYVSGAQIIIPN--PAALFGGPGL------PGLPLPLAPGPLDLSALACGNGG 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 PLPMAESTRDGLGPGLLSPIVSPLKGLGPPPLPPSSQSHSPGGQPFPTLPSKPSYPPFQS . . :.:::: .:.. ::. :. :: :: . :: .:.. CCDS10 ----GSGGGGGMGPGLPGPVL-PLN-LAKNPLLPSP--FGAGGLGLPVVSLLAGAAGGKA 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 pF1KB7 PPPPPLPSPQGYQGSFHSIQSCFPYGDCYRMAEPAAGGDGLVGETHGFNPLRPNGYHSLS CCDS10 EGEKGRGSVPTRALGMEGHKTPLERTESSCSRPSPDGLPLLPGTVLDLSTGVNSAASSPE 450 460 470 480 490 500 620 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 19:19:38 2016 done: Sun Nov 6 19:19:39 2016 Total Scan time: 4.330 Total Display time: 0.140 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]