Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3693
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3693, 955 aa
1>>>pF1KE3693 955 - 955 aa - 955 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.9659+/-0.000481; mu= -8.0794+/- 0.030
mean_var=414.2998+/-82.955, 0's: 0 Z-trim(121.3): 211 B-trim: 37 in 1/60
Lambda= 0.063011
statistics sampled from 37479 (37731) to 37479 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.442), width: 16
Scan time: 10.970
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001308400 (OMIM: 603809) thyroid hormone recept ( 955) 6393 596.2 2.5e-169
NP_005110 (OMIM: 603809) thyroid hormone receptor- ( 955) 6393 596.2 2.5e-169
NP_001308402 (OMIM: 603809) thyroid hormone recept ( 954) 6374 594.5 8.4e-169
XP_005271428 (OMIM: 603809) PREDICTED: thyroid hor ( 568) 3830 363.1 2.4e-99
NP_001287967 (OMIM: 612588) bcl-2-associated trans ( 918) 1250 128.7 1.4e-28
NP_055554 (OMIM: 612588) bcl-2-associated transcri ( 920) 1247 128.4 1.6e-28
NP_001070908 (OMIM: 612588) bcl-2-associated trans ( 869) 1232 127.0 4e-28
XP_005267294 (OMIM: 612588) PREDICTED: bcl-2-assoc ( 871) 1229 126.8 4.9e-28
XP_016867018 (OMIM: 612588) PREDICTED: bcl-2-assoc ( 745) 741 82.4 9.8e-15
NP_001070909 (OMIM: 612588) bcl-2-associated trans ( 747) 741 82.4 9.9e-15
XP_016867021 (OMIM: 612588) PREDICTED: bcl-2-assoc ( 309) 716 79.8 2.4e-14
XP_016867020 (OMIM: 612588) PREDICTED: bcl-2-assoc ( 696) 723 80.7 2.9e-14
XP_016867019 (OMIM: 612588) PREDICTED: bcl-2-assoc ( 698) 723 80.7 2.9e-14
XP_005255283 (OMIM: 606032) PREDICTED: serine/argi (2751) 369 49.0 0.0004
NP_057417 (OMIM: 606032) serine/arginine repetitiv (2752) 369 49.0 0.0004
NP_055885 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domain-c (1564) 356 47.6 0.00059
XP_005266369 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1564) 356 47.6 0.00059
NP_001317495 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1668) 356 47.6 0.00062
NP_001317494 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1668) 356 47.6 0.00062
NP_001317496 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1668) 356 47.6 0.00062
XP_016875968 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669) 356 47.6 0.00062
NP_001317493 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1669) 356 47.6 0.00062
XP_005266367 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669) 356 47.6 0.00062
NP_001070256 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1669) 356 47.6 0.00062
XP_016875969 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669) 356 47.6 0.00062
XP_016875967 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669) 356 47.6 0.00062
XP_016875966 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1669) 356 47.6 0.00062
NP_005617 (OMIM: 601940) serine/arginine-rich spli ( 494) 326 44.5 0.0016
XP_011540253 (OMIM: 601940) PREDICTED: serine/argi ( 464) 323 44.2 0.0019
NP_061173 (OMIM: 600938) E3 ubiquitin-protein liga (1758) 327 45.0 0.004
NP_008841 (OMIM: 600938) E3 ubiquitin-protein liga (1792) 327 45.0 0.0041
XP_016855516 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 820) 311 43.3 0.0062
XP_016855503 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 864) 311 43.3 0.0064
XP_016855507 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 903) 311 43.3 0.0067
XP_016855508 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 901) 310 43.2 0.0071
NP_002007 (OMIM: 135940,146700,605803) filaggrin [ (4061) 328 45.4 0.0071
XP_016855514 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 821) 306 42.8 0.0085
XP_016855515 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 821) 306 42.8 0.0085
XP_016855502 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 865) 306 42.9 0.0088
XP_016855521 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 803) 305 42.7 0.0089
XP_016855519 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 804) 305 42.7 0.0089
XP_016855520 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 804) 305 42.7 0.0089
XP_011538785 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 805) 305 42.7 0.0089
XP_016855517 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 819) 305 42.8 0.009
XP_016855518 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 819) 305 42.8 0.009
NP_005830 (OMIM: 605975) serine/arginine repetitiv ( 904) 306 42.9 0.0091
XP_016855506 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 848) 305 42.8 0.0093
XP_016855504 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 863) 305 42.8 0.0094
XP_016855510 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 886) 305 42.8 0.0096
XP_016855509 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 887) 305 42.8 0.0096
>>NP_001308400 (OMIM: 603809) thyroid hormone receptor-a (955 aa)
initn: 6393 init1: 6393 opt: 6393 Z-score: 3160.8 bits: 596.2 E(85289): 2.5e-169
Smith-Waterman score: 6393; 100.0% identity (100.0% similar) in 955 aa overlap (1-955:1-955)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSKTNKSKSGSRSSRSRSASRSRSRSFSKSRSRSRSLSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSKTNKSKSGSRSSRSRSASRSRSRSFSKSRSRSRSLSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 ERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 KSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWPDATYGTGSASRASAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWPDATYGTGSASRASAVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ELSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTSQMGSTLPSGAGYQSGTHQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTSQMGSTLPSGAGYQSGTHQG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPSTGSTYGSSQKEESAASGGAAYTKRYLEEQKTENGKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPSTGSTYGSSQKEESAASGGAAYTKRYLEEQKTENGKDK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKSDSFAPKTDSEKPFRGSQSPKRYKLRDDFEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKSDSFAPKTDSEKPFRGSQSPKRYKLRDDFEK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKVIGANKNQEEEKSGKWEGLVYAPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKVIGANKNQEEEKSGKWEGLVYAPPG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 KEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRGFVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRGFVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 TSESRDKLGAKGDFPTGKSSFSITREAQVNVRMDSFDEDLARPSGLLAQERKLCRDLVHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSESRDKLGAKGDFPTGKSSFSITREAQVNVRMDSFDEDLARPSGLLAQERKLCRDLVHS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 NKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 GTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 IERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRERSAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRERSAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 SSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 RGWGRGNYSGNNNNNSNNDFQKRNREEEWDPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSRGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGWGRGNYSGNNNNNSNNDFQKRNREEEWDPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSRGRG
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910 920 930 940 950
pF1KE3 RGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEEGEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEEGEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE
910 920 930 940 950
>>NP_005110 (OMIM: 603809) thyroid hormone receptor-asso (955 aa)
initn: 6393 init1: 6393 opt: 6393 Z-score: 3160.8 bits: 596.2 E(85289): 2.5e-169
Smith-Waterman score: 6393; 100.0% identity (100.0% similar) in 955 aa overlap (1-955:1-955)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSKTNKSKSGSRSSRSRSASRSRSRSFSKSRSRSRSLSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MSKTNKSKSGSRSSRSRSASRSRSRSFSKSRSRSRSLSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNR
10 20 30 40 50 60
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pF1KE3 ERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEK
130 140 150 160 170 180
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pF1KE3 KSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWPDATYGTGSASRASAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWPDATYGTGSASRASAVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ELSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTSQMGSTLPSGAGYQSGTHQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ELSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTSQMGSTLPSGAGYQSGTHQG
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pF1KE3 QFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPSTGSTYGSSQKEESAASGGAAYTKRYLEEQKTENGKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPSTGSTYGSSQKEESAASGGAAYTKRYLEEQKTENGKDK
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pF1KE3 EQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKSDSFAPKTDSEKPFRGSQSPKRYKLRDDFEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKSDSFAPKTDSEKPFRGSQSPKRYKLRDDFEK
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pF1KE3 KMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKVIGANKNQEEEKSGKWEGLVYAPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKVIGANKNQEEEKSGKWEGLVYAPPG
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pF1KE3 KEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRGFVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRGFVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRK
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pF1KE3 TSESRDKLGAKGDFPTGKSSFSITREAQVNVRMDSFDEDLARPSGLLAQERKLCRDLVHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TSESRDKLGAKGDFPTGKSSFSITREAQVNVRMDSFDEDLARPSGLLAQERKLCRDLVHS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 NKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKR
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pF1KE3 GTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 IERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRERSAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRERSAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 SSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 RGWGRGNYSGNNNNNSNNDFQKRNREEEWDPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSRGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RGWGRGNYSGNNNNNSNNDFQKRNREEEWDPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSRGRG
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910 920 930 940 950
pF1KE3 RGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEEGEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEEGEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE
910 920 930 940 950
>>NP_001308402 (OMIM: 603809) thyroid hormone receptor-a (954 aa)
initn: 5536 init1: 5536 opt: 6374 Z-score: 3151.5 bits: 594.5 E(85289): 8.4e-169
Smith-Waterman score: 6374; 99.9% identity (99.9% similar) in 955 aa overlap (1-955:1-954)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSKTNKSKSGSRSSRSRSASRSRSRSFSKSRSRSRSLSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSKTNKSKSGSRSSRSRSASRSRSRSFSKSRSRSRSLSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 ERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 KSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWPDATYGTGSASRASAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWPDATYGTGSASRASAVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ELSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTSQMGSTLPSGAGYQSGTHQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTSQMGSTLPSGAGYQSGTHQG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPSTGSTYGSSQKEESAASGGAAYTKRYLEEQKTENGKDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPSTGSTYGSSQKEESAASGGAAYTKRYLEEQKTENGKDK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKSDSFAPKTDSEKPFRGSQSPKRYKLRDDFEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKSDSFAPKTDSEKPFRGSQSPKRYKLRDDFEK
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pF1KE3 KMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKVIGANKNQEEEKSGKWEGLVYAPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKVIGANKNQEEEKSGKWEGLVYAPPG
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pF1KE3 KEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRGFVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRGFVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRK
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pF1KE3 TSESRDKLGAKGDFPTGKSSFSITREAQVNVRMDSFDEDLARPSGLLAQERKLCRDLVHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSESRDKLGAKGDFPTGKSSFSITREAQVNVRMDSFDEDLARPSGLLAQERKLCRDLVHS
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pF1KE3 NKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKR
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pF1KE3 GTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLD
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pF1KE3 IERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRERSAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRERSAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSS
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pF1KE3 SSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
NP_001 SSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTF-FRARG
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pF1KE3 RGWGRGNYSGNNNNNSNNDFQKRNREEEWDPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSRGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGWGRGNYSGNNNNNSNNDFQKRNREEEWDPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSRGRG
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pF1KE3 RGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEEGEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEEGEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE
900 910 920 930 940 950
>>XP_005271428 (OMIM: 603809) PREDICTED: thyroid hormone (568 aa)
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Smith-Waterman score: 3830; 100.0% identity (100.0% similar) in 568 aa overlap (388-955:1-568)
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 KDKEQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKSDSFAPKTDSEKPFRGSQSPKRYKLRDD
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MKSDSFAPKTDSEKPFRGSQSPKRYKLRDD
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pF1KE3 FEKKMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKVIGANKNQEEEKSGKWEGLVYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FEKKMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKVIGANKNQEEEKSGKWEGLVYA
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pF1KE3 PPGKEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRGFVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 PRKTSESRDKLGAKGDFPTGKSSFSITREAQVNVRMDSFDEDLARPSGLLAQERKLCRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PRKTSESRDKLGAKGDFPTGKSSFSITREAQVNVRMDSFDEDLARPSGLLAQERKLCRDL
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pF1KE3 VHSNKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VHSNKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKY
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pF1KE3 LKRGTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LKRGTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDL
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pF1KE3 RLDIERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRERSAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RLDIERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRERSAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRS
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pF1KE3 RSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFR
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pF1KE3 ARGRGWGRGNYSGNNNNNSNNDFQKRNREEEWDPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ARGRGWGRGNYSGNNNNNSNNDFQKRNREEEWDPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSR
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pF1KE3 GRGRGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEEGEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GRGRGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEEGEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE
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>>NP_001287967 (OMIM: 612588) bcl-2-associated transcrip (918 aa)
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Smith-Waterman score: 1902; 40.9% identity (66.0% similar) in 971 aa overlap (10-949:2-911)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSKTNKSKSGSRSSRSRSASRSRSRSFSKSRSRSRSLSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNR
: .:::.: :::.::: :.::::::: .:::.: :::::.:: ...:
NP_001 MGRSNSRSHS-SRSKSRSQSSSRSRSRS--HSRKKRY--RSRSRTYSRSRSR
10 20 30 40
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pF1KE3 ERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWG--QYNRGGYGNYRSNWQNYRQAY
.: . : :. ::.: .:::.:::: .:::.::.: : .:.:::: : : : :..
NP_001 DRMYSRDYR-RDYR-NNRGMRRPYGYRGRGRGYYQGGGGRYHRGGY---RPVW-NRRHSR
50 60 70 80 90 100
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pF1KE3 SPRRGRSRSRSPKRRS-PSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSA
:::::::::::::::: : ::::.:: : .:: :: ::::::::: .:. :::...
NP_001 SPRRGRSRSRSPKRRSVSSQRSRSRSRRSYRSS--RSPRSSSSRSSSPYSKSPVSKRRGS
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 KEKKSSSKDSRPSQAAG-DNQGDEAKEQTFSGGTSQD----TKASESSKP-WPDATYGTG
.::.... ...:.. . ....: ..:: :.. .:.: .: :: . .
NP_001 QEKQTKKAEGEPQEESPLKSKSQEEPKDTFEHDPSESIDEFNKSSATSGDIWPGLSAYDN
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KE3 SASRASAVSELS--PRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTSQMGS-TLP
: . : .. : . : .:. :.: .: . .: . : . :: ..
NP_001 SPRSPHSPSPIATPPSQSSSCSDAPMLSTV---HSAKNTPSQHSHSIQHSPERSGSGSVG
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 SGAGYQSGTHQGQFDHGSGSLSPSKKSPVGKSP--PSTG--STYGSSQKEESAASGGAAY
.:.. : .... . : . ::.: ..: : : : : .. .:.: .: .
NP_001 NGSSRYSPSQNSPIHHIPSRRSPAKTIAPQNAPRDESRGRSSFYPDGGDQETAKTG--KF
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 TKRYLEEQKTENGKDKEQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKS----DSFAPKTDSE
::. .:.. :. . . ::: :::: :. : ..:. .. : :. : ...
NP_001 LKRFTDEESRVFLLDRGNTR---DKEASKEKG--SEKGRAEGEWEDQEALDYFSDKESGK
340 350 360 370 380
410 420 430 440 450
pF1KE3 KPFRGSQSPKRYKLRDDFEKKMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKV-IGA
. : :.. . .:... :.: . :: :. : . ... .. :. ::: . .
NP_001 QKFNDSEGDDTEET-EDYRQ----FRKSVLADQGKSFATASHRNTEEEGLKYKSKVSLKG
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 NKNQE---EEKSGKWE--GLVYAPPGKEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRG
:.... :::. : . : : :. :... :: ...: ::: ..
NP_001 NRESDGFREEKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEE-DKNSERITVKKETQS---------
450 460 470 480 490
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 FVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRKTSESRDKLGAKGDFPTG-KSSFSITREAQVNVRM
::. : . : . . ::: .:. ..:.: . . : : : ... .:...:
NP_001 --PEQ---VKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKM
500 510 520 530 540
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 DSFD-EDLARPSGLLAQERKLCRDLVHSNKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIV
.: ::..: ...: : :::: ::::::::::.::. :...: :: : ::::
NP_001 APVPLDDSNRPASL-TKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIV
550 560 570 580 590 600
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 TIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKRGTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLA
..::::::..: :..:::.::::.: ...::..... .:::::::::::::::.:::
NP_001 SLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSY-QKATEEHSTR-QKSPEIHRRIDISPSTLRKHTRL
610 620 630 640 650 660
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 HDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLDIERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRER
: . .: . :.. : . : .::: ::.::.: ::. .:: :. ::.:: ::..
NP_001 AGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRK--ERSKERGDSK---GSRESSGSRKQ
670 680 690 700 710 720
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 -SAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDK
.. : : .:. : ..::.: .:.:::::::.. : : ...: : .:::: : :
NP_001 EKTPKDYKEYKSYKDDSKHKREQDHSRSSSSSASPS-SPSSREEKESKKEREEE---F-K
730 740 750 760 770
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pF1KE3 SRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARGRGWGRGNYSGNNN--NNSNNDFQKRNREEEW
.. :.. : . : .: :::: :: :::: .:: ..:.:. ::::. :::: .::::
NP_001 THHEMKEYSGFA--GVSRPRGTF-FRIRGRGRARGVFAGTNTGPNNSNTTFQKRPKEEEW
780 790 800 810 820 830
870 880 890 900 910 920
pF1KE3 DPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSRGRGRGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSG
:::::::::::.:::::. .: : :..::::::.: :::::: :.::..::::.:::..:
NP_001 DPEYTPKSKKYFLHDDRD-DGVDYWAKRGRGRGTFQRGRGRFNFKKSGSSPKWTHDKYQG
840 850 860 870 880 890
930 940 950
pF1KE3 EEGEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE
. : .::.: :: ::: .
NP_001 D-GIVEDEEETMENNEEKKDRRKEEKE
900 910
>>NP_055554 (OMIM: 612588) bcl-2-associated transcriptio (920 aa)
initn: 850 init1: 358 opt: 1247 Z-score: 632.9 bits: 128.4 E(85289): 1.6e-28
Smith-Waterman score: 1926; 41.1% identity (66.2% similar) in 971 aa overlap (10-949:2-913)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSKTNKSKSGSRSSRSRSASRSRSRSFSKSRSRSRSLSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNR
: .:::.: :::.::: :.::::::: .:::.: :::::::.:: ...:
NP_055 MGRSNSRSHS-SRSKSRSQSSSRSRSRS--HSRKKRYSSRSRSRTYSRSRSR
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE3 ERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWG--QYNRGGYGNYRSNWQNYRQAY
.: . : :. ::.: .:::.:::: .:::.::.: : .:.:::: : : : :..
NP_055 DRMYSRDYR-RDYR-NNRGMRRPYGYRGRGRGYYQGGGGRYHRGGY---RPVW-NRRHSR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 SPRRGRSRSRSPKRRS-PSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSA
:::::::::::::::: : ::::.:: : .:: :: ::::::::: .:. :::...
NP_055 SPRRGRSRSRSPKRRSVSSQRSRSRSRRSYRSS--RSPRSSSSRSSSPYSKSPVSKRRGS
110 120 130 140 150 160
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pF1KE3 KEKKSSSKDSRPSQAAG-DNQGDEAKEQTFSGGTSQD----TKASESSKP-WPDATYGTG
.::.... ...:.. . ....: ..:: :.. .:.: .: :: . .
NP_055 QEKQTKKAEGEPQEESPLKSKSQEEPKDTFEHDPSESIDEFNKSSATSGDIWPGLSAYDN
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE3 SASRASAVSELS--PRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTSQMGS-TLP
: . : .. : . : .:. :.: .: . .: . : . :: ..
NP_055 SPRSPHSPSPIATPPSQSSSCSDAPMLSTV---HSAKNTPSQHSHSIQHSPERSGSGSVG
230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 SGAGYQSGTHQGQFDHGSGSLSPSKKSPVGKSP--PSTG--STYGSSQKEESAASGGAAY
.:.. : .... . : . ::.: ..: : : : : .. .:.: .: .
NP_055 NGSSRYSPSQNSPIHHIPSRRSPAKTIAPQNAPRDESRGRSSFYPDGGDQETAKTG--KF
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 TKRYLEEQKTENGKDKEQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKS----DSFAPKTDSE
::. .:.. :. . . ::: :::: :. : ..:. .. : :. : ...
NP_055 LKRFTDEESRVFLLDRGNTR---DKEASKEKG--SEKGRAEGEWEDQEALDYFSDKESGK
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450
pF1KE3 KPFRGSQSPKRYKLRDDFEKKMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKV-IGA
. : :.. . .:... :.: . :: :. : . ... .. :. ::: . .
NP_055 QKFNDSEGDDTEET-EDYRQ----FRKSVLADQGKSFATASHRNTEEEGLKYKSKVSLKG
400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 NKNQE---EEKSGKWE--GLVYAPPGKEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRG
:.... :::. : . : : :. :... :: ...: ::: ..
NP_055 NRESDGFREEKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEE-DKNSERITVKKETQS---------
450 460 470 480 490
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 FVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRKTSESRDKLGAKGDFPTG-KSSFSITREAQVNVRM
::. : . : . . ::: .:. ..:.: . . : : : ... .:...:
NP_055 --PEQ---VKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKM
500 510 520 530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 DSFD-EDLARPSGLLAQERKLCRDLVHSNKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIV
.: ::..: ...: : :::: ::::::::::.::. :...: :: : ::::
NP_055 APVPLDDSNRPASL-TKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIV
560 570 580 590 600 610
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 TIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKRGTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLA
..::::::..: :..:::.::::.: ...::..... .:::::::::::::::.:::
NP_055 SLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSY-QKATEEHSTR-QKSPEIHRRIDISPSTLRKHTRL
620 630 640 650 660
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 HDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLDIERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRER
: . .: . :.. : . : .::: ::.::.: ::. .:: :. ::.:: ::..
NP_055 AGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRK--ERSKERGDSK---GSRESSGSRKQ
670 680 690 700 710 720
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 -SAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDK
.. : : .:. : ..::.: .:.:::::::.. : : ...: : .:::: : :
NP_055 EKTPKDYKEYKSYKDDSKHKREQDHSRSSSSSASPS-SPSSREEKESKKEREEE---F-K
730 740 750 760 770
820 830 840 850 860
pF1KE3 SRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARGRGWGRGNYSGNNN--NNSNNDFQKRNREEEW
.. :.. : . : .: :::: :: :::: .:: ..:.:. ::::. :::: .::::
NP_055 THHEMKEYSGFA--GVSRPRGTF-FRIRGRGRARGVFAGTNTGPNNSNTTFQKRPKEEEW
780 790 800 810 820 830
870 880 890 900 910 920
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. : .::.: :: ::: .
NP_055 D-GIVEDEEETMENNEEKKDRRKEEKE
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pF1KE3 -SAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDK
.. : : .:. : ..::.: .:.:::::::.. : : ...: : .:::: : :
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.. :.. : . : .: ::::
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pF1KE3 GEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE
: .::.: :: ::: .
NP_001 GIVEDEEETMENNEEKKDRRKEEKE
850 860
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: . : .. : . : .:. :.: .: . .: . : . :: ..
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. : :.. . .:... :.: . :: :. : . ... .. :. ::: . .
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XP_005 --PEQ---VKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKM
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pF1KE3 -SAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDK
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XP_005 EKTPKDYKEYKSYKDDSKHKREQDHSRSSSSSASPS-SPSSREEKESKKEREEE---F-K
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XP_005 THHEMKEYSGFA--GVSRPRGTF-------------------------------------
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pF1KE3 EYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSRGRGRGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEE
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XP_005 -----------HDDRD-DGVDYWAKRGRGRGTFQRGRGRFNFKKSGSSPKWTHDKYQGD-
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pF1KE3 GEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE
: .::.: :: ::: .
XP_005 GIVEDEEETMENNEEKKDRRKEEKE
850 860 870
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XP_016 SPRRGRSRSRSPKRRSVSSQRSRSRSRRSYRSS--RSPRSSSSRSSSPYSKSPVSKRRGS
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pF1KE3 KEKKSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWPDATYGTGSASRAS
.::.... ...:.. :. .. : .:: . :. . .. .::. ..
XP_016 QEKQTKKAEGEPQE--------ESPLKSKSQEEPKDTFEHDPSESIDE--FNKSSATSGD
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:: . :: :::. :: : .:: .:.: : : . : .
XP_016 IWPGLSAYDNSP-------------RSPH-SPSPIATPPSQSSSC------SDAPMLSTV
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: .: : ::..: ...: :
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XP_016 LVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIVSLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTS
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pF1KE3 YLKRGTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVD
: ...::..... .:::::::::::::::.::: : . .: . :.. : . : .:
XP_016 Y-QKATEEHSTR-QKSPEIHRRIDISPSTLRKHTRLAGEERVFKEENQKGDKKLRCDSAD
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pF1KE3 LRLDIERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRER-SAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARD
:: ::.::.: ::. .:: :. ::.:: ::.. .. : : .:. : ..::.: .:
XP_016 LRHDIDRRRK--ERSKERGDSK---GSRESSGSRKQEKTPKDYKEYKSYKDDSKHKREQD
520 530 540 550 560 570
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pF1KE3 RSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQ
.:::::::.. : : ...: : .:::: : :.. :.. : . : .: ::::
XP_016 HSRSSSSSASPS-SPSSREEKESKKEREEE---F-KTHHEMKEYSGFA--GVSRPRGTF-
580 590 600 610 620
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pF1KE3 FRARGRGWGRGNYSGNNN--NNSNNDFQKRNREEEWDPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDK
:: :::: .:: ..:.:. ::::. :::: .:::::::::::::::.:::::. .: :
XP_016 FRIRGRGRARGVFAGTNTGPNNSNTTFQKRPKEEEWDPEYTPKSKKYFLHDDRD-DGVDY
630 640 650 660 670 680
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pF1KE3 WVSRGRGRGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEEGEIEDDESGTENREEKDNIQPT
:..::::::.: :::::: :.::..::::.:::..:. : .::.: :: ::: .
XP_016 WAKRGRGRGTFQRGRGRFNFKKSGSSPKWTHDKYQGD-GIVEDEEETMENNEEKKDRRKE
690 700 710 720 730 740
pF1KE3 TE
XP_016 EKE
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pF1KE3 MSKTNKSKSGSRSSRSRSASRSRSRSFSKSRSRSRSLSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNR
: .:::.: :::.::: :.::::::: .:::.: :::::::.:: ...:
NP_001 MGRSNSRSHS-SRSKSRSQSSSRSRSRS--HSRKKRYSSRSRSRTYSRSRSR
10 20 30 40
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pF1KE3 ERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWG--QYNRGGYGNYRSNWQNYRQAY
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NP_001 DRMYSRDYR-RDYR-NNRGMRRPYGYRGRGRGYYQGGGGRYHRGGY---RPVW-NRRHSR
50 60 70 80 90 100
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NP_001 SPRRGRSRSRSPKRRSVSSQRSRSRSRRSYRSS--RSPRSSSSRSSSPYSKSPVSKRRGS
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.::.... ...:.. :. .. : .:: . :. . .. .::. ..
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:: . :: :::. :: : .:: .:.: : : . : .
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: :.. .::..: . .:: .:: ::
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: .: .. .:...::. : . : :.. :: :.::. .
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.:: ... . :. .: :.: . . :.. :: :: .... .:
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:::: ::::::::::.::. :...: :: : ::::..::::::..: :..:::.::::.
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: ...::..... .:::::::::::::::.::: : . .: . :.. : . : .:
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