Result of FASTA (ccds) for pFN21AE3693
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3693, 955 aa
  1>>>pF1KE3693 955 - 955 aa - 955 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2715+/-0.0011; mu= -3.8768+/- 0.067
 mean_var=368.2906+/-75.642, 0's: 0 Z-trim(113.3): 76  B-trim: 9 in 1/52
 Lambda= 0.066831
 statistics sampled from 13896 (13962) to 13896 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.429), width:  16
 Scan time:  3.100

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS405.1 THRAP3 gene_id:9967|Hs108|chr1           ( 955) 6393 631.2  3e-180
CCDS75525.1 BCLAF1 gene_id:9774|Hs108|chr6         ( 918) 1250 135.3 5.4e-31
CCDS5177.1 BCLAF1 gene_id:9774|Hs108|chr6          ( 920) 1247 135.0 6.6e-31
CCDS47486.1 BCLAF1 gene_id:9774|Hs108|chr6         ( 869) 1232 133.5 1.7e-30
CCDS47485.1 BCLAF1 gene_id:9774|Hs108|chr6         ( 747)  741 86.1 2.7e-16


>>CCDS405.1 THRAP3 gene_id:9967|Hs108|chr1                (955 aa)
 initn: 6393 init1: 6393 opt: 6393  Z-score: 3349.6  bits: 631.2 E(32554): 3e-180
Smith-Waterman score: 6393; 100.0% identity (100.0% similar) in 955 aa overlap (1-955:1-955)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MSKTNKSKSGSRSSRSRSASRSRSRSFSKSRSRSRSLSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 MSKTNKSKSGSRSSRSRSASRSRSRSFSKSRSRSRSLSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 ERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 ERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWGQYNRGGYGNYRSNWQNYRQAYSP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 RRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 RRGRSRSRSPKRRSPSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSAKEK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 KSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWPDATYGTGSASRASAVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWPDATYGTGSASRASAVS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 ELSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTSQMGSTLPSGAGYQSGTHQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 ELSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTSQMGSTLPSGAGYQSGTHQG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 QFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPSTGSTYGSSQKEESAASGGAAYTKRYLEEQKTENGKDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 QFDHGSGSLSPSKKSPVGKSPPSTGSTYGSSQKEESAASGGAAYTKRYLEEQKTENGKDK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 EQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKSDSFAPKTDSEKPFRGSQSPKRYKLRDDFEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 EQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKSDSFAPKTDSEKPFRGSQSPKRYKLRDDFEK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 KMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKVIGANKNQEEEKSGKWEGLVYAPPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKVIGANKNQEEEKSGKWEGLVYAPPG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 KEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRGFVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRGFVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 TSESRDKLGAKGDFPTGKSSFSITREAQVNVRMDSFDEDLARPSGLLAQERKLCRDLVHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 TSESRDKLGAKGDFPTGKSSFSITREAQVNVRMDSFDEDLARPSGLLAQERKLCRDLVHS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 NKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 NKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 GTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 GTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLD
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 IERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRERSAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 IERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRERSAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 SSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 RGWGRGNYSGNNNNNSNNDFQKRNREEEWDPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSRGRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 RGWGRGNYSGNNNNNSNNDFQKRNREEEWDPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSRGRG
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950     
pF1KE3 RGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEEGEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 RGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEEGEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE
              910       920       930       940       950     

>>CCDS75525.1 BCLAF1 gene_id:9774|Hs108|chr6              (918 aa)
 initn: 830 init1: 358 opt: 1250  Z-score: 669.9  bits: 135.3 E(32554): 5.4e-31
Smith-Waterman score: 1902; 40.9% identity (66.0% similar) in 971 aa overlap (10-949:2-911)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MSKTNKSKSGSRSSRSRSASRSRSRSFSKSRSRSRSLSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNR
                :  .:::.: :::.::: :.:::::::  .:::.:   :::::.:: ...:
CCDS75         MGRSNSRSHS-SRSKSRSQSSSRSRSRS--HSRKKRY--RSRSRTYSRSRSR
                       10         20          30          40       

               70        80        90         100       110        
pF1KE3 ERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWG--QYNRGGYGNYRSNWQNYRQAY
       .: . : :. ::.: .:::.:::: .:::.::.:  :  .:.::::   :  : : :.. 
CCDS75 DRMYSRDYR-RDYR-NNRGMRRPYGYRGRGRGYYQGGGGRYHRGGY---RPVW-NRRHSR
        50         60         70        80        90           100 

      120       130        140       150       160       170       
pF1KE3 SPRRGRSRSRSPKRRS-PSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSA
       ::::::::::::::::  : ::::.:: : .::  :: ::::::::: .:.   :::...
CCDS75 SPRRGRSRSRSPKRRSVSSQRSRSRSRRSYRSS--RSPRSSSSRSSSPYSKSPVSKRRGS
             110       120       130         140       150         

       180       190        200       210           220        230 
pF1KE3 KEKKSSSKDSRPSQAAG-DNQGDEAKEQTFSGGTSQD----TKASESSKP-WPDATYGTG
       .::.... ...:.. .   ....:  ..::    :..    .:.: .:   ::  .   .
CCDS75 QEKQTKKAEGEPQEESPLKSKSQEEPKDTFEHDPSESIDEFNKSSATSGDIWPGLSAYDN
     160       170       180       190       200       210         

             240         250       260       270       280         
pF1KE3 SASRASAVSELS--PRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTSQMGS-TLP
       :     . : ..  : . :    .:. :.:   .: . .:  .      :  . :: .. 
CCDS75 SPRSPHSPSPIATPPSQSSSCSDAPMLSTV---HSAKNTPSQHSHSIQHSPERSGSGSVG
     220       230       240          250       260       270      

      290       300       310       320           330       340    
pF1KE3 SGAGYQSGTHQGQFDHGSGSLSPSKKSPVGKSP--PSTG--STYGSSQKEESAASGGAAY
       .:..  : .... . :  .  ::.:     ..:   : :  : : ..  .:.: .:   .
CCDS75 NGSSRYSPSQNSPIHHIPSRRSPAKTIAPQNAPRDESRGRSSFYPDGGDQETAKTG--KF
        280       290       300       310       320       330      

          350       360       370       380       390           400
pF1KE3 TKRYLEEQKTENGKDKEQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKS----DSFAPKTDSE
        ::. .:..     :. . .   :::  ::::  :. : ..:. ..    : :. : ...
CCDS75 LKRFTDEESRVFLLDRGNTR---DKEASKEKG--SEKGRAEGEWEDQEALDYFSDKESGK
          340       350          360         370       380         

              410       420       430       440       450          
pF1KE3 KPFRGSQSPKRYKLRDDFEKKMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKV-IGA
       . :  :..    .  .:...    :.:  . :: :. : . ...  ..  :. ::: . .
CCDS75 QKFNDSEGDDTEET-EDYRQ----FRKSVLADQGKSFATASHRNTEEEGLKYKSKVSLKG
     390       400            410       420       430       440    

     460          470         480       490       500       510    
pF1KE3 NKNQE---EEKSGKWE--GLVYAPPGKEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRG
       :....   :::. : .  : :   :.  :... :: ...:     ::: ..         
CCDS75 NRESDGFREEKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEE-DKNSERITVKKETQS---------
          450       460       470        480       490             

          520       530       540       550        560       570   
pF1KE3 FVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRKTSESRDKLGAKGDFPTG-KSSFSITREAQVNVRM
         ::.   : . :  .  . ::: .:. ..:.:   . . :   :   : ... .:...:
CCDS75 --PEQ---VKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKM
               500       510       520       530       540         

            580       590       600       610       620       630  
pF1KE3 DSFD-EDLARPSGLLAQERKLCRDLVHSNKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIV
            .:  ::..: ...: :   :::: ::::::::::.::.  :...: :: : ::::
CCDS75 APVPLDDSNRPASL-TKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIV
     550       560        570       580       590       600        

            640       650       660       670       680       690  
pF1KE3 TIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKRGTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLA
       ..::::::..: :..:::.::::.: ...::..... .:::::::::::::::.:::   
CCDS75 SLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSY-QKATEEHSTR-QKSPEIHRRIDISPSTLRKHTRL
      610       620       630        640        650       660      

            700       710       720       730       740       750  
pF1KE3 HDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLDIERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRER
         : .  .: . :.. : . : .::: ::.::.:  ::. .:: :.    ::.:: ::..
CCDS75 AGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRK--ERSKERGDSK---GSRESSGSRKQ
        670       680       690       700         710          720 

             760       770       780       790       800       810 
pF1KE3 -SAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDK
        .. :  : .:. : ..::.: .:.:::::::.. : : ...:  :  .::::    : :
CCDS75 EKTPKDYKEYKSYKDDSKHKREQDHSRSSSSSASPS-SPSSREEKESKKEREEE---F-K
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pF1KE3 SRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARGRGWGRGNYSGNNN--NNSNNDFQKRNREEEW
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CCDS75 THHEMKEYSGFA--GVSRPRGTF-FRIRGRGRARGVFAGTNTGPNNSNTTFQKRPKEEEW
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pF1KE3 DPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSRGRGRGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSG
       :::::::::::.:::::. .: : :..::::::.: :::::: :.::..::::.:::..:
CCDS75 DPEYTPKSKKYFLHDDRD-DGVDYWAKRGRGRGTFQRGRGRFNFKKSGSSPKWTHDKYQG
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pF1KE3 EEGEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE 
       . : .::.:   :: ::: .       
CCDS75 D-GIVEDEEETMENNEEKKDRRKEEKE
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       ::::::::::::::::  : ::::.:: : .::  :: ::::::::: .:.   :::...
CCDS51 SPRRGRSRSRSPKRRSVSSQRSRSRSRRSYRSS--RSPRSSSSRSSSPYSKSPVSKRRGS
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       .::.... ...:.. .   ....:  ..::    :..    .:.: .:   ::  .   .
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       .:..  : .... . :  .  ::.:     ..:   : :  : : ..  .:.: .:   .
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pF1KE3 TKRYLEEQKTENGKDKEQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKS----DSFAPKTDSE
        ::. .:..     :. . .   :::  ::::  :. : ..:. ..    : :. : ...
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pF1KE3 KPFRGSQSPKRYKLRDDFEKKMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKV-IGA
       . :  :..    .  .:...    :.:  . :: :. : . ...  ..  :. ::: . .
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pF1KE3 NKNQE---EEKSGKWE--GLVYAPPGKEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRG
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CCDS51 NRESDGFREEKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEE-DKNSERITVKKETQS---------
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pF1KE3 FVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRKTSESRDKLGAKGDFPTG-KSSFSITREAQVNVRM
         ::.   : . :  .  . ::: .:. ..:.:   . . :   :   : ... .:...:
CCDS51 --PEQ---VKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKM
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            .:  ::..: ...: :   :::: ::::::::::.::.  :...: :: : ::::
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pF1KE3 TIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKRGTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLA
       ..::::::..: :..:::.::::.: ...::..... .:::::::::::::::.:::   
CCDS51 SLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSY-QKATEEHSTR-QKSPEIHRRIDISPSTLRKHTRL
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pF1KE3 HDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLDIERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRER
         : .  .: . :.. : . : .::: ::.::.:  ::. .:: :.    ::.:: ::..
CCDS51 AGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRK--ERSKERGDSK---GSRESSGSRKQ
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pF1KE3 -SAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDK
        .. :  : .:. : ..::.: .:.:::::::.. : : ...:  :  .::::    : :
CCDS51 EKTPKDYKEYKSYKDDSKHKREQDHSRSSSSSASPS-SPSSREEKESKKEREEE---F-K
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pF1KE3 DPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSRGRGRGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSG
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CCDS51 DPEYTPKSKKYFLHDDRD-DGVDYWAKRGRGRGTFQRGRGRFNFKKSGSSPKWTHDKYQG
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pF1KE3 EEGEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE 
       . : .::.:   :: ::: .       
CCDS51 D-GIVEDEEETMENNEEKKDRRKEEKE
           900       910       920

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CCDS47 DRMYSRDYR-RDYR-NNRGMRRPYGYRGRGRGYYQGGGGRYHRGGY---RPVW-NRRHSR
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pF1KE3 SPRRGRSRSRSPKRRS-PSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSA
       ::::::::::::::::  : ::::.:: : .::  :: ::::::::: .:.   :::...
CCDS47 SPRRGRSRSRSPKRRSVSSQRSRSRSRRSYRSS--RSPRSSSSRSSSPYSKSPVSKRRGS
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pF1KE3 KEKKSSSKDSRPSQAAG-DNQGDEAKEQTFSGGTSQD----TKASESSKP-WPDATYGTG
       .::.... ...:.. .   ....:  ..::    :..    .:.: .:   ::  .   .
CCDS47 QEKQTKKAEGEPQEESPLKSKSQEEPKDTFEHDPSESIDEFNKSSATSGDIWPGLSAYDN
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pF1KE3 SASRASAVSELS--PRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTSQMGS-TLP
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CCDS47 SPRSPHSPSPIATPPSQSSSCSDAPMLSTV---HSAKNTPSQHSHSIQHSPERSGSGSVG
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       .:..  : .... . :  .  ::.:     ..:   : :  : : ..  .:.: .:   .
CCDS47 NGSSRYSPSQNSPIHHIPSRRSPAKTIAPQNAPRDESRGRSSFYPDGGDQETAKTG--KF
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pF1KE3 TKRYLEEQKTENGKDKEQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKS----DSFAPKTDSE
        ::. .:..     :. . .   :::  ::::  :. : ..:. ..    : :. : ...
CCDS47 LKRFTDEESRVFLLDRGNTR---DKEASKEKG--SEKGRAEGEWEDQEALDYFSDKESGK
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pF1KE3 KPFRGSQSPKRYKLRDDFEKKMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKV-IGA
       . :  :..    .  .:...    :.:  . :: :. : . ...  ..  :. ::: . .
CCDS47 QKFNDSEGDDTEET-EDYRQ----FRKSVLADQGKSFATASHRNTEEEGLKYKSKVSLKG
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pF1KE3 NKNQE---EEKSGKWE--GLVYAPPGKEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRG
       :....   :::. : .  : :   :.  :... :: ...:     ::: ..         
CCDS47 NRESDGFREEKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEE-DKNSERITVKKETQS---------
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CCDS47 --PEQ---VKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKM
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CCDS47 APVPLDDSNRPASL-TKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIV
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pF1KE3 TIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKRGTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLA
       ..::::::..: :..:::.::::.: ...::..... .:::::::::::::::.:::   
CCDS47 SLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSY-QKATEEHSTR-QKSPEIHRRIDISPSTLRKHTRL
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pF1KE3 HDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLDIERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRER
         : .  .: . :.. : . : .::: ::.::.:  ::. .:: :.    ::.:: ::..
CCDS47 AGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRK--ERSKERGDSK---GSRESSGSRKQ
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pF1KE3 -SAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDK
        .. :  : .:. : ..::.: .:.:::::::.. : : ...:  :  .::::    : :
CCDS47 EKTPKDYKEYKSYKDDSKHKREQDHSRSSSSSASPS-SPSSREEKESKKEREEE---F-K
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       ..   :.. : .  : .: ::::                                     
CCDS47 THHEMKEYSGFA--GVSRPRGTF-------------------------------------
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                  ::::. .: : :..::::::.: :::::: :.::..::::.:::..:. 
CCDS47 -----------HDDRD-DGVDYWAKRGRGRGTFQRGRGRFNFKKSGSSPKWTHDKYQGD-
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       : .::.:   :: ::: .       
CCDS47 GIVEDEEETMENNEEKKDRRKEEKE
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                :  .:::.: :::.::: :.:::::::  .:::.: :::::::.:: ...:
CCDS47         MGRSNSRSHS-SRSKSRSQSSSRSRSRS--HSRKKRYSSRSRSRTYSRSRSR
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       .: . : :. ::.: .:::.:::: .:::.::.:  :  .:.::::   :  : : :.. 
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       ::::::::::::::::  : ::::.:: : .::  :: ::::::::: .:.   :::...
CCDS47 SPRRGRSRSRSPKRRSVSSQRSRSRSRRSYRSS--RSPRSSSSRSSSPYSKSPVSKRRGS
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       .::.... ...:..        :.  .. :    .::   . :.   .  .. .::. ..
CCDS47 QEKQTKKAEGEPQE--------ESPLKSKSQEEPKDTFEHDPSESIDE--FNKSSATSGD
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           ::  . ::             :::. :: :  .:: .:.:       : : . : .
CCDS47 IWPGLSAYDNSP-------------RSPH-SPSPIATPPSQSSSC------SDAPMLSTV
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       :       :.. .::..:  . .::  .::  ::                          
CCDS47 H-------SAKNTPSQHSHSIQHSPERSGS--GS--------------------------
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                                 .:.:   :. ..:. .:  :..  . :.:   :.
CCDS47 --------------------------VGNG---SSRYSPSQNS--PIH--HIPSR---RS
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          : .:       ..  .:...::. : . :         :..  ::  :.::.   . 
CCDS47 P-AKTIAP------QNAPRDESRGRS-SFYPD---------GGD--QETAKTGKF---LK
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       .::    ... .  :. .: :.:  . .   :.. ::   :: ....           .:
CCDS47 SPP---LHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDS-HR---PEVKLKM-----------AP
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CCDS47 VP----------------------------------LD----DSNRPASL-TKDRLLAST
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       : ...::..... .:::::::::::::::.:::     : .  .: . :.. : . : .:
CCDS47 Y-QKATEEHSTR-QKSPEIHRRIDISPSTLRKHTRLAGEERVFKEENQKGDKKLRCDSAD
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CCDS47 LRHDIDRRRK--ERSKERGDSK---GSRESSGSRKQEKTPKDYKEYKSYKDDSKHKREQD
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pF1KE3 RSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQ
       .:::::::.. : : ...:  :  .::::    : :..   :.. : .  : .: :::: 
CCDS47 HSRSSSSSASPS-SPSSREEKESKKEREEE---F-KTHHEMKEYSGFA--GVSRPRGTF-
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CCDS47 FRIRGRGRARGVFAGTNTGPNNSNTTFQKRPKEEEWDPEYTPKSKKYFLHDDRD-DGVDY
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CCDS47 WAKRGRGRGTFQRGRGRFNFKKSGSSPKWTHDKYQGD-GIVEDEEETMENNEEKKDRRKE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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