FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3693, 955 aa 1>>>pF1KE3693 955 - 955 aa - 955 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2715+/-0.0011; mu= -3.8768+/- 0.067 mean_var=368.2906+/-75.642, 0's: 0 Z-trim(113.3): 76 B-trim: 9 in 1/52 Lambda= 0.066831 statistics sampled from 13896 (13962) to 13896 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.429), width: 16 Scan time: 3.100 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS405.1 THRAP3 gene_id:9967|Hs108|chr1 ( 955) 6393 631.2 3e-180 CCDS75525.1 BCLAF1 gene_id:9774|Hs108|chr6 ( 918) 1250 135.3 5.4e-31 CCDS5177.1 BCLAF1 gene_id:9774|Hs108|chr6 ( 920) 1247 135.0 6.6e-31 CCDS47486.1 BCLAF1 gene_id:9774|Hs108|chr6 ( 869) 1232 133.5 1.7e-30 CCDS47485.1 BCLAF1 gene_id:9774|Hs108|chr6 ( 747) 741 86.1 2.7e-16 >>CCDS405.1 THRAP3 gene_id:9967|Hs108|chr1 (955 aa) initn: 6393 init1: 6393 opt: 6393 Z-score: 3349.6 bits: 631.2 E(32554): 3e-180 Smith-Waterman score: 6393; 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CCDS75 D-GIVEDEEETMENNEEKKDRRKEEKE 900 910 >>CCDS5177.1 BCLAF1 gene_id:9774|Hs108|chr6 (920 aa) initn: 850 init1: 358 opt: 1247 Z-score: 668.3 bits: 135.0 E(32554): 6.6e-31 Smith-Waterman score: 1926; 41.1% identity (66.2% similar) in 971 aa overlap (10-949:2-913) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MSKTNKSKSGSRSSRSRSASRSRSRSFSKSRSRSRSLSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNR : .:::.: :::.::: :.::::::: .:::.: :::::::.:: ...: CCDS51 MGRSNSRSHS-SRSKSRSQSSSRSRSRS--HSRKKRYSSRSRSRTYSRSRSR 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE3 ERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWG--QYNRGGYGNYRSNWQNYRQAY .: . : :. ::.: .:::.:::: .:::.::.: : .:.:::: : : : :.. CCDS51 DRMYSRDYR-RDYR-NNRGMRRPYGYRGRGRGYYQGGGGRYHRGGY---RPVW-NRRHSR 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 SPRRGRSRSRSPKRRS-PSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSA :::::::::::::::: : ::::.:: : .:: :: ::::::::: .:. :::... 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CCDS51 LKRFTDEESRVFLLDRGNTR---DKEASKEKG--SEKGRAEGEWEDQEALDYFSDKESGK 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 pF1KE3 KPFRGSQSPKRYKLRDDFEKKMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKV-IGA . : :.. . .:... :.: . :: :. : . ... .. :. ::: . . CCDS51 QKFNDSEGDDTEET-EDYRQ----FRKSVLADQGKSFATASHRNTEEEGLKYKSKVSLKG 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 NKNQE---EEKSGKWE--GLVYAPPGKEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRG :.... :::. : . : : :. :... :: ...: ::: .. CCDS51 NRESDGFREEKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEE-DKNSERITVKKETQS--------- 450 460 470 480 490 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 FVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRKTSESRDKLGAKGDFPTG-KSSFSITREAQVNVRM ::. : . : . . ::: .:. ..:.: . . : : : ... .:...: CCDS51 --PEQ---VKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKM 500 510 520 530 540 550 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 DSFD-EDLARPSGLLAQERKLCRDLVHSNKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIV .: ::..: ...: : :::: ::::::::::.::. :...: :: : :::: CCDS51 APVPLDDSNRPASL-TKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIV 560 570 580 590 600 610 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 TIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKRGTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLA ..::::::..: :..:::.::::.: ...::..... .:::::::::::::::.::: CCDS51 SLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSY-QKATEEHSTR-QKSPEIHRRIDISPSTLRKHTRL 620 630 640 650 660 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 HDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLDIERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRER : . .: . :.. : . : .::: ::.::.: ::. .:: :. ::.:: ::.. CCDS51 AGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRK--ERSKERGDSK---GSRESSGSRKQ 670 680 690 700 710 720 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 -SAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDK .. : : .:. : ..::.: .:.:::::::.. : : ...: : .:::: : : CCDS51 EKTPKDYKEYKSYKDDSKHKREQDHSRSSSSSASPS-SPSSREEKESKKEREEE---F-K 730 740 750 760 770 820 830 840 850 860 pF1KE3 SRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARGRGWGRGNYSGNNN--NNSNNDFQKRNREEEW .. :.. : . : .: :::: :: :::: .:: ..:.:. ::::. :::: .:::: CCDS51 THHEMKEYSGFA--GVSRPRGTF-FRIRGRGRARGVFAGTNTGPNNSNTTFQKRPKEEEW 780 790 800 810 820 830 870 880 890 900 910 920 pF1KE3 DPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSRGRGRGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSG :::::::::::.:::::. .: : :..::::::.: :::::: :.::..::::.:::..: CCDS51 DPEYTPKSKKYFLHDDRD-DGVDYWAKRGRGRGTFQRGRGRFNFKKSGSSPKWTHDKYQG 840 850 860 870 880 890 930 940 950 pF1KE3 EEGEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE . : .::.: :: ::: . CCDS51 D-GIVEDEEETMENNEEKKDRRKEEKE 900 910 920 >>CCDS47486.1 BCLAF1 gene_id:9774|Hs108|chr6 (869 aa) initn: 853 init1: 355 opt: 1232 Z-score: 660.8 bits: 133.5 E(32554): 1.7e-30 Smith-Waterman score: 1575; 37.5% identity (61.8% similar) in 969 aa overlap (10-949:2-862) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MSKTNKSKSGSRSSRSRSASRSRSRSFSKSRSRSRSLSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNR : .:::.: :::.::: :.::::::: .:::.: :::::.:: ...: CCDS47 MGRSNSRSHS-SRSKSRSQSSSRSRSRS--HSRKKRY--RSRSRTYSRSRSR 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE3 ERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWG--QYNRGGYGNYRSNWQNYRQAY .: . : :. ::.: .:::.:::: .:::.::.: : .:.:::: : : : :.. CCDS47 DRMYSRDYR-RDYR-NNRGMRRPYGYRGRGRGYYQGGGGRYHRGGY---RPVW-NRRHSR 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 SPRRGRSRSRSPKRRS-PSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSA :::::::::::::::: : ::::.:: : .:: :: ::::::::: .:. :::... CCDS47 SPRRGRSRSRSPKRRSVSSQRSRSRSRRSYRSS--RSPRSSSSRSSSPYSKSPVSKRRGS 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 KEKKSSSKDSRPSQAAG-DNQGDEAKEQTFSGGTSQD----TKASESSKP-WPDATYGTG .::.... ...:.. . ....: ..:: :.. .:.: .: :: . . CCDS47 QEKQTKKAEGEPQEESPLKSKSQEEPKDTFEHDPSESIDEFNKSSATSGDIWPGLSAYDN 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 pF1KE3 SASRASAVSELS--PRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTSQMGS-TLP : . : .. : . : .:. :.: .: . .: . : . :: .. CCDS47 SPRSPHSPSPIATPPSQSSSCSDAPMLSTV---HSAKNTPSQHSHSIQHSPERSGSGSVG 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 SGAGYQSGTHQGQFDHGSGSLSPSKKSPVGKSP--PSTG--STYGSSQKEESAASGGAAY .:.. : .... . : . ::.: ..: : : : : .. .:.: .: . CCDS47 NGSSRYSPSQNSPIHHIPSRRSPAKTIAPQNAPRDESRGRSSFYPDGGDQETAKTG--KF 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 TKRYLEEQKTENGKDKEQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKS----DSFAPKTDSE ::. .:.. :. . . ::: :::: :. : ..:. .. : :. : ... CCDS47 LKRFTDEESRVFLLDRGNTR---DKEASKEKG--SEKGRAEGEWEDQEALDYFSDKESGK 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 pF1KE3 KPFRGSQSPKRYKLRDDFEKKMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKV-IGA . : :.. . .:... :.: . :: :. : . ... .. :. ::: . . CCDS47 QKFNDSEGDDTEET-EDYRQ----FRKSVLADQGKSFATASHRNTEEEGLKYKSKVSLKG 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 NKNQE---EEKSGKWE--GLVYAPPGKEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRG :.... :::. : . : : :. :... :: ...: ::: .. CCDS47 NRESDGFREEKNYKLKETGYVVERPSTTKDKHKEE-DKNSERITVKKETQS--------- 450 460 470 480 490 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 FVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSPPPRKTSESRDKLGAKGDFPTG-KSSFSITREAQVNVRM ::. : . : . . ::: .:. ..:.: . . : : : ... .:...: CCDS47 --PEQ---VKSEKLKDLFDYSPPLHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDSHRPEVKLKM 500 510 520 530 540 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 DSFD-EDLARPSGLLAQERKLCRDLVHSNKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIV .: ::..: ...: : :::: ::::::::::.::. :...: :: : :::: CCDS47 APVPLDDSNRPASL-TKDRLLASTLVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIV 550 560 570 580 590 600 640 650 660 670 680 690 pF1KE3 TIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTKYLKRGTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLA ..::::::..: :..:::.::::.: ...::..... .:::::::::::::::.::: CCDS47 SLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTSY-QKATEEHSTR-QKSPEIHRRIDISPSTLRKHTRL 610 620 630 640 650 660 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 HDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVDLRLDIERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRER : . .: . :.. : . : .::: ::.::.: ::. .:: :. ::.:: ::.. CCDS47 AGEERVFKEENQKGDKKLRCDSADLRHDIDRRRK--ERSKERGDSK---GSRESSGSRKQ 670 680 690 700 710 720 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 -SAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARDRSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDK .. : : .:. : ..::.: .:.:::::::.. : : ...: : .:::: : : CCDS47 EKTPKDYKEYKSYKDDSKHKREQDHSRSSSSSASPS-SPSSREEKESKKEREEE---F-K 730 740 750 760 770 820 830 840 850 860 870 pF1KE3 SRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQFRARGRGWGRGNYSGNNNNNSNNDFQKRNREEEWDP .. :.. : . : .: :::: CCDS47 THHEMKEYSGFA--GVSRPRGTF------------------------------------- 780 790 880 890 900 910 920 930 pF1KE3 EYTPKSKKYYLHDDREGEGSDKWVSRGRGRGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEE ::::. .: : :..::::::.: :::::: :.::..::::.:::..:. CCDS47 -----------HDDRD-DGVDYWAKRGRGRGTFQRGRGRFNFKKSGSSPKWTHDKYQGD- 800 810 820 830 840 940 950 pF1KE3 GEIEDDESGTENREEKDNIQPTTE : .::.: :: ::: . CCDS47 GIVEDEEETMENNEEKKDRRKEEKE 850 860 >>CCDS47485.1 BCLAF1 gene_id:9774|Hs108|chr6 (747 aa) initn: 845 init1: 358 opt: 741 Z-score: 405.9 bits: 86.1 E(32554): 2.7e-16 Smith-Waterman score: 1604; 39.6% identity (60.6% similar) in 947 aa overlap (10-949:2-740) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MSKTNKSKSGSRSSRSRSASRSRSRSFSKSRSRSRSLSRSRKRRLSSRSRSRSYSPAHNR : .:::.: :::.::: :.::::::: .:::.: :::::::.:: ...: CCDS47 MGRSNSRSHS-SRSKSRSQSSSRSRSRS--HSRKKRYSSRSRSRTYSRSRSR 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KE3 ERNHPRVYQNRDFRGHNRGYRRPYYFRGRNRGFYPWG--QYNRGGYGNYRSNWQNYRQAY .: . : :. ::.: .:::.:::: .:::.::.: : .:.:::: : : : :.. CCDS47 DRMYSRDYR-RDYR-NNRGMRRPYGYRGRGRGYYQGGGGRYHRGGY---RPVW-NRRHSR 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 SPRRGRSRSRSPKRRS-PSPRSRSHSRNSDKSSSDRSRRSSSSRSSSNHSRVESSKRKSA :::::::::::::::: : ::::.:: : .:: :: ::::::::: .:. :::... CCDS47 SPRRGRSRSRSPKRRSVSSQRSRSRSRRSYRSS--RSPRSSSSRSSSPYSKSPVSKRRGS 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 KEKKSSSKDSRPSQAAGDNQGDEAKEQTFSGGTSQDTKASESSKPWPDATYGTGSASRAS .::.... ...:.. :. .. : .:: . :. . .. .::. .. CCDS47 QEKQTKKAEGEPQE--------ESPLKSKSQEEPKDTFEHDPSESIDE--FNKSSATSGD 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 AVSELSPRERSPALKSPLQSVVVRRRSPRPSPVPKPSPPLSSTSQMGSTLPSGAGYQSGT :: . :: :::. :: : .:: .:.: : : . : . CCDS47 IWPGLSAYDNSP-------------RSPH-SPSPIATPPSQSSSC------SDAPMLSTV 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 HQGQFDHGSGSLSPSKKS-PVGKSPPSTGSTYGSSQKEESAASGGAAYTKRYLEEQKTEN : :.. .::..: . .:: .:: :: CCDS47 H-------SAKNTPSQHSHSIQHSPERSGS--GS-------------------------- 260 270 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 GKDKEQKQTNTDKEKIKEKGSFSDTGLGDGKMKSDSFAPKTDSEKPFRGSQSPKRYKLRD .:.: :. ..:. .: :.. . :.: :. CCDS47 --------------------------VGNG---SSRYSPSQNS--PIH--HIPSR---RS 280 290 300 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 DFEKKMADFHKEEMDDQDKDKAKGRKESEFDDEPKFMSKVIGANKNQEEEKSGKWEGLVY : .: .. .:...::. : . : :.. :: :.::. . CCDS47 P-AKTIAP------QNAPRDESRGRS-SFYPD---------GGD--QETAKTGKF---LK 310 320 330 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 APPGKEKQRKTEELEEESFPERSKKEDRGKRSEGGHRGFVPEKNFRVTAYKAVQEKSSSP .:: ... . :. .: :.: . . :.. :: :: .... .: CCDS47 SPP---LHKNLDAREKSTFREESPLRIKMIASDS-HR---PEVKLKM-----------AP 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 PPRKTSESRDKLGAKGDFPTGKSSFSITREAQVNVRMDSFDEDLARPSGLLAQERKLCRD : .: : ::..: ...: : CCDS47 VP----------------------------------LD----DSNRPASL-TKDRLLAST 390 400 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 LVHSNKKEQEFRSIFQHIQSAQSQRSPSELFAQHIVTIVHHVKEHHFGSSGMTLHERFTK :::: ::::::::::.::. :...: :: : ::::..::::::..: :..:::.::::. CCDS47 LVHSVKKEQEFRSIFDHIKLPQASKSTSESFIQHIVSLVHHVKEQYFKSAAMTLNERFTS 410 420 430 440 450 460 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 YLKRGTEQEAAKNKKSPEIHRRIDISPSTFRKHGLAHDEMKSPREPGYKAEGKYKDDPVD : ...::..... .:::::::::::::::.::: : . .: . :.. : . : .: CCDS47 Y-QKATEEHSTR-QKSPEIHRRIDISPSTLRKHTRLAGEERVFKEENQKGDKKLRCDSAD 470 480 490 500 510 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 LRLDIERRKKHKERDLKRGKSRESVDSRDSSHSRER-SAEKTEKTHKGSKKQKKHRRARD :: ::.::.: ::. .:: :. ::.:: ::.. .. : : .:. : ..::.: .: CCDS47 LRHDIDRRRK--ERSKERGDSK---GSRESSGSRKQEKTPKDYKEYKSYKDDSKHKREQD 520 530 540 550 560 570 780 790 800 810 820 830 pF1KE3 RSRSSSSSSQSSHSYKAEEYTEETEEREESTTGFDKSRLGTKDFVGPSERGGGRARGTFQ .:::::::.. : : ...: : .:::: : :.. :.. : . : .: :::: CCDS47 HSRSSSSSASPS-SPSSREEKESKKEREEE---F-KTHHEMKEYSGFA--GVSRPRGTF- 580 590 600 610 620 840 850 860 870 880 890 pF1KE3 FRARGRGWGRGNYSGNNN--NNSNNDFQKRNREEEWDPEYTPKSKKYYLHDDREGEGSDK :: :::: .:: ..:.:. ::::. :::: .:::::::::::::::.:::::. .: : CCDS47 FRIRGRGRARGVFAGTNTGPNNSNTTFQKRPKEEEWDPEYTPKSKKYFLHDDRD-DGVDY 630 640 650 660 670 680 900 910 920 930 940 950 pF1KE3 WVSRGRGRGAFPRGRGRFMFRKSSTSPKWAHDKFSGEEGEIEDDESGTENREEKDNIQPT :..::::::.: :::::: :.::..::::.:::..:. : .::.: :: ::: . CCDS47 WAKRGRGRGTFQRGRGRFNFKKSGSSPKWTHDKYQGD-GIVEDEEETMENNEEKKDRRKE 690 700 710 720 730 740 pF1KE3 TE CCDS47 EKE 955 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 19:04:06 2016 done: Mon Nov 7 19:04:07 2016 Total Scan time: 3.100 Total Display time: 0.110 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]