FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1294, 475 aa 1>>>pF1KE1294 475 - 475 aa - 475 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4601+/-0.00117; mu= 4.2583+/- 0.069 mean_var=222.2447+/-46.158, 0's: 0 Z-trim(109.0): 143 B-trim: 78 in 1/52 Lambda= 0.086032 statistics sampled from 10461 (10604) to 10461 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.681), E-opt: 0.2 (0.326), width: 16 Scan time: 2.910 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS376.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 475) 3213 412.0 6.8e-115 CCDS81297.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 354) 2256 293.1 3.1e-79 CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 862 120.2 4.8e-27 CCDS32220.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 500) 835 116.9 5e-26 CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7 ( 487) 779 109.9 6.1e-24 CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 743 105.5 1.3e-22 CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8 ( 493) 663 95.5 1.3e-19 CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 648 93.7 4.7e-19 CCDS10114.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 341) 635 91.9 1.1e-18 CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 613 89.3 9.5e-18 CCDS73719.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 296) 603 87.9 1.6e-17 CCDS32437.1 TRIM72 gene_id:493829|Hs108|chr16 ( 477) 573 84.4 3e-16 CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 562 83.0 8e-16 CCDS76745.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 263) 544 80.5 2.3e-15 CCDS76746.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 279) 544 80.5 2.4e-15 CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 538 80.0 6.4e-15 CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 481) 536 79.8 7.2e-15 CCDS4462.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 511) 534 79.5 9e-15 CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 529 78.9 1.3e-14 CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 529 78.9 1.4e-14 CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1 ( 475) 527 78.6 1.6e-14 CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 482 73.1 7.4e-13 CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 478 72.6 1.1e-12 CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 395) 476 72.2 1.1e-12 CCDS10498.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16 ( 781) 479 72.9 1.4e-12 CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 473 72.0 1.7e-12 CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 472 71.8 1.7e-12 CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 472 71.8 1.8e-12 CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 468 71.4 2.6e-12 CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 466 71.1 3e-12 CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 466 71.3 4.5e-12 CCDS4466.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 630) 463 70.8 4.7e-12 CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 584) 438 67.7 3.8e-11 CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 425 66.0 1e-10 >>CCDS376.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 (475 aa) initn: 3213 init1: 3213 opt: 3213 Z-score: 2176.1 bits: 412.0 E(32554): 6.8e-115 Smith-Waterman score: 3213; 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33.5% identity (61.7% similar) in 472 aa overlap (4-470:22-481) 10 20 30 40 pF1KE1 MACSLKDELLCSICLSIYQDPVSLGCEHYFCRRCITEHWVRQ .:. : ::.:: ..:: . : : ::. :::. : CCDS34 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 pF1KE1 EAQGARD--CPECRRTFAEPALAPSLKLANIVERYSSFPLDAILNARRAARPC-QAHDKV : :: :: ::.: .: :. .:...:: .. :.:. : : : :. . CCDS34 E----RDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQ--LQAVKRKIRDESLCPQHHEAL 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 KLFCLTDRALLCFFCDEPALHEQHQVTGIDDAFDELQRELKDQLQALQDSEREHTEALQL .::: :. .:..: :. : :. .::: .: ...:. :. :... .: :. . CCDS34 SLFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSS 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 LKRQLAETKSSTKSLRTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKVQRYS ... .: : ..: : : . ::.::: : :.:...: .:: . : ..... . . CCDS34 EEKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLG 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 QQLRKVQEGAQILQERLAETDRHTFLAGVASLSERLKGKIHETNLTYEDFPTSKYTG--P .. : . . : .. . .. .: : : :. . :.. ..: .. : . : CCDS34 DKRRDLAHLAAEVEGKCLQSG-FEMLKDVKSTLEKCE-KVKTMEVTSVSIELEKNFSNFP 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 LQYTIWKSLFQDIHPVPAALTLDPGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSPKRFDVE :: ....... : .:::: ::: :.::.: : . . . . : :.:.:: CCDS34 RQYFALRKILKQL---IADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFY 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 VSVLGSEAFSSGVHYWEVVVAEKTQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGNQY ::..:.:.:: ::::: :..::.:..:. ....:::: . : :.. . . .:..: CCDS34 PCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKY 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 SACTEPWTRLNVRDKLDKVGVFLDYDQGLLIFYNADDMSWLYTFREKFPGKLCSYFSPGQ .: : :.: :... : .::.::::. : : :::. : : .::: . : :: : :: CCDS34 AATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGI 410 420 430 440 450 460 460 470 pF1KE1 SHANGKNVQPLRINTVRI .:. ::. :: : CCDS34 -RAGRKNAAPLTIRPPTDWE 470 480 >>CCDS32220.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 (500 aa) initn: 751 init1: 368 opt: 835 Z-score: 580.7 bits: 116.9 E(32554): 5e-26 Smith-Waterman score: 835; 32.2% identity (60.8% similar) in 469 aa overlap (8-470:38-496) 10 20 30 pF1KE1 MACSLKDELLCSICLSIYQDPVSLGCEHYFCRRCITE :: : .: . ..::. :.: : ::. :: . CCDS32 SSNIDPGDYVEMNDSITHLPSKVVIQDITMELHCPLCNDWFRDPLMLSCGHNFCEACIQD 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE1 HWVRQEAQGARDCPECRRTFAEPALAPSLKLANIVERYSSFPLDAILNARRAARPCQAH- : : .:. . ::::. . . : ..::. ...:: .. : : CCDS32 FW-RLQAKETF-CPECKMLCQYNNCTFNPVLDKLVEKIKKLPL------LKGHPQCPEHG 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE1 DKVKLFCLTDRALLCFFCDEPALH--EQHQVTGIDDAFDELQRELKDQLQALQDSEREHT ...::: : :.:: : . : .... :.:: . .:: : :. . .: CCDS32 ENLKLFSKPDGKLICFQCKDARLSVGQSKEFLQISDAVHFFTEELAIQQGQLETTLKELQ 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 EALQLLKRQLAETKSSTKSLRTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQK .. :. .: : . :. .. : .::..:. ..: .: ::. . ..: . CCDS32 TLRNMQKEAIAAHKENKLHLQQHVSMEFLKLHQFLHSKEKDILTELREEGKALNEEMELN 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 VQRYSQQLRKVQEGAQILQERLAETDRHTFLAGVASLSERL-KG-KIHET-NLTYEDFPT ... ..: ... .: . . . :: ...: . : .: :. : .: . . CCDS32 LSQLQEQCLLAKDMLVSIQAKTEQQNSFDFLKDITTLLHSLEQGMKVLATRELISRKLNL 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 SKYTGPLQYTIWKSLFQDIHPVPAALTLDPGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSP ..: ::.:: .:. . . . : . ::::: ::: :.:: . : : .:... . . :.: CCDS32 GQYKGPIQYMVWREMQDTLCPGLSPLTLDPKTAHPNLVLSKSQTSVWHGDIK-KIMPDDP 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 KRFDVEVSVLGSEAFSSGVHYWEVVVAEKTQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVM .::: :.::::..:.:: :::: ::.::.:..:...:. :::: . : .::. . . CCDS32 ERFDSSVAVLGSRGFTSGKWYWEVEVAKKTKWTVGVVRESIIRKGSCPLTPEQGFWLLRL 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 HDGNQYSACTEPWTRLNVRDKLDKVGVFLDYDQGLLIFYNADDMSWLYTFREKFPGKLCS .. .. .: : :.. ..:::::..:::. : : :::: :. .::: . : :: CCDS32 RNQTDLKALDLPSFSLTLTNNLDKVGIYLDYEGGQLSFYNAKTMTHIYTFSNTFMEKLYP 420 430 440 450 460 470 460 470 pF1KE1 YFSPGQSHANGKNVQPLRINTVRI :: : . . :.: .::.: CCDS32 YFCPCLNDG-GENKEPLHILHPQ 480 490 500 >>CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7 (487 aa) initn: 653 init1: 286 opt: 779 Z-score: 543.3 bits: 109.9 E(32554): 6.1e-24 Smith-Waterman score: 779; 29.9% identity (60.7% similar) in 471 aa overlap (5-468:10-468) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MACSLKDELLCSICLSIYQDPVSLGCEHYFCRRCITEHWVRQEAQGARDCPECRR :.:.: : ::: ....:. : : : .:. :.. . .:. :: ::. CCDS34 MAWQVSLPELEDRLQCPICLEVFKEPLMLQCGHSYCKGCLVSLSCHLDAE--LRCPVCRQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 TFAEPALAPSLKLANIVERYSSFPLDAILNARRAARPCQAH-DKVKLFCLTDRALLCFFC . . :...:: ..: .: : . : : . ..::: :. :.: .: CCDS34 AVDGSSSLPNVSLARVIEALR-LPGDP------EPKVCVHHRNPLSLFCEKDQELICGLC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 DEPALHEQHQVTGIDDAFDELQRELKDQLQALQDSEREHTEALQLLKRQLAETKSSTKSL . :..: :: .. .......:: .. :.. ... : . : . .. . . . CCDS34 GLLGSHQHHPVTPVSTVYSRMKEELAALISELKQEQKKVDELIAKLVNNRTRIVNESDVF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 RTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKVQRYSQQLRKVQEGAQILQE .: . :..::.:. :.. :: . . : .......... .: :. :. . : CCDS34 SWVIRREFQELHHLVDEEKARCLEGIGGHTRGLVASLDMQLEQ-AQGTRERLAQAECVLE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 RLAETDRHTFLA---GVASLSERLKGKIHETNLTYEDFPTSKYTGPLQYTIWKSLFQDIH .... :.: :. ..:: .: ... : .. .: . . . .. :.:: ::. . CCDS34 QFGNEDHHKFIRKFHSMASRAEMPQARPLEGAFSPISFKPGLHQADIKLTVWKRLFRKVL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 PVPAALTLDPGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSPKRFDVEVSVLGSEAFSSGVH :.: : :::.::: : :: :.: : : : ..:.::: . ::.:..:: : : CCDS34 PAPEPLKLDPATAHPLLELSKGNTVVQCG-LLAQRRASQPERFDYSTCVLASRGFSCGRH 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 YWEVVVAEKTQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGNQYSACTEPWTRLNVRD ::::::. :..: .:. . .:::::... .: .: . : ...: : : . : . : : CCDS34 YWEVVVGSKSDWRLGVIKGTASRKGKLNRSPEHGVWLIGLKEGRVYEAFACPRVPLPVAG 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KE1 KLDKVGVFLDYDQGLLIFYNAD---DMSWLYTFREKFPGKLCSYFSPGQSHANGKNVQPL . ..:..: :.:: : :..:: :. ::::. : ::: .. : :.: :. CCDS34 HPHRIGLYLHYEQGELTFFDADRPDDLRPLYTFQADFQGKLYPILDTCW-HERGSNSLPM 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 RINTVRI CCDS34 VLPPPSGPGPLSPEQPTKL 470 480 >>CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 (485 aa) initn: 644 init1: 250 opt: 743 Z-score: 519.2 bits: 105.5 E(32554): 1.3e-22 Smith-Waterman score: 750; 30.6% identity (62.0% similar) in 484 aa overlap (7-473:12-481) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MACSLKDELLCSICLSIYQDPVSLGCEHYFCRRCITEHW-VRQEAQG-ARDCPEC .:. : ::... ..:.:. : : ::. :.. : . :.:. . :: : CCDS31 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIPGESQNWGYTCPLC 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 RRTFAEPALAPSLKLANIVERYSSFPLDAILNARRAARPCQAH-DKVKLFCLTDRALLCF : : :. .:::.::. . : .. . . :. : .:.:.:: : ..: CCDS31 RAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLK--GDLCERHGEKLKMFCKEDVLIMCE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 FCDEPALHEQHQVTGIDDAFDELQRELKDQLQALQDSEREHTEALQLLKRQLAET-KSST :.. :: :.:. ..:. : . ::.. :. :. .:.:.. :.. .:. . : : .. CCDS31 ACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLK-KEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 KSLRTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKVQRYSQQLR----KVQE .. . .: ::. .:::...: ..: :..: .:....... . :.:. .. . CCDS31 ETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPH-RQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQ 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 GAQILQERLAETDRHT------FLAGVASLSERLKG-KIHETNLTYEDFPTSKYTGPLQY .:.: . .:: ... .: . . .: :. .... . .. :. . :. CCDS31 QSQVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVLGLR- 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 TIWKSLFQDIHPVPAALTLDPGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSPKRFDVEVSV : :. :.. ::: ::..:::.:.: : ::. . : : :.:.:: : CCDS31 EILKTYAADVR-------LDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTN-QKLPDNPERFYRYNIV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 LGSEAFSSGVHYWEVVVAEKTQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGNQYSAC :::. .::: ::::: :.....: .:. .. ..:: . ..: ::. : .. ::.: : CCDS31 LGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAG 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 TEPWTRLNVRDKLDKVGVFLDYDQGLLIFYNADDM-SWLYTF-REKFPGKLCSYFSPGQS :. . :.. .::.:.::. . :::. : : ..:: : :::.: :::: : CCDS31 TDEYPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYS 410 420 430 440 450 460 460 470 pF1KE1 HANGKNVQPLRINTVRI . .:. :: : .. CCDS31 -IGTNNTAPLAICSLDGED 470 480 >>CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8 (493 aa) initn: 521 init1: 219 opt: 663 Z-score: 465.4 bits: 95.5 E(32554): 1.3e-19 Smith-Waterman score: 663; 29.1% identity (58.4% similar) in 488 aa overlap (4-475:14-485) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MACSLKDELLCSICLSIYQDPVSLGCEHYFCRRCITEHWVRQEAQGARDC :.:.::::..: . ..: :.: : : ::: :... : :.: . : CCDS60 MERSPDVSPGPSRSFKEELLCAVCYDPFRDAVTLRCGHNFCRGCVSRCW---EVQVSPTC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 PECRRTFAEPA-LAPSLKLANIVERYSSFPLD-AILNARRAARPCQAH-DKVKLFCLTDR : :. : :: : . : :.::. . : .. : .: :. : ...:::: :. CCDS60 PVCKDR-ASPADLRTNHTLNNLVEKLLREEAEGARWTSYRFSRVCRLHRGQLSLFCLEDK 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 ALLCFFCDEPALHEQHQVTGIDDAFDELQRELKDQLQALQDSEREHTEALQLLKRQLAET ::: :. :. :.: . :. ... . ... .:: ::...:. ..:. CCDS60 ELLCCSCQADPRHQGHRVQPVKDTAHDFRAKCRNMEHAL----REKAKAFWAMRRSYEAI 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 KSSTKS----LRTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKVQRYSQQLR . .. :. : . :..:...:: ...:.:. . .: . ..:... ... . CCDS60 AKHNQVEAAWLEGRIRQEFDKLREFLRVEEQAILDAMAEETRQKQLLADEKMKQLTEETE 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 KVQEGAQILQERLAETDRHTFLAGVASLSERLKGKIH-ETNLTYEDFPTSKYTGPLQYTI . . . :: .. : : .:: : ..:: .. : . . :: : ::: . CCDS60 VLAHEIERLQMEMKEDDV-SFLMKHKSRKRRLFCTMEPEPVQPGMLIDVCKYLGSLQYRV 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 WKSLFQDIHPVPAALTLDPGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQ-DSPKRFDVEVSVL ::... ... :: ...::.:: : .::: : :. : .: ..:.::. .: CCDS60 WKKMLASVESVP--FSFDPNTAAGWLSVSDDLTSVTN---HGYRVQVENPERFSSAPCLL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 GSEAFSSGVHYWEVVVAEKTQWVIGLAHE-----AASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGNQ ::..::.: : :::... .: .:... : ... : . ::. . .: . CCDS60 GSRVFSQGSHAWEVALGGLQSWRVGVVRVRQDSGAEGHSHSCYHDTRSGFWYVCRTQGVE 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 YSAC--TEPWTRLNVRDKLDKVGVFLDYDQGLLIFYNADDMSWLYTFREKFPGKLCSYFS . : ..: : : .. : :. ..: : ::.:. ::::. .: :.. :: CCDS60 GDHCVTSDPATSPLVLAIPRRLRVELECEEGELSFYDAERHCHLYTFHARF-GEVRPYFY 410 420 430 440 450 460 460 470 pF1KE1 PGQSHANGKNVQPLRINTVRI : ... : .:::: ..: CCDS60 LGGARGAGPP-EPLRICPLHISVKEELDG 470 480 490 >>CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 (471 aa) initn: 568 init1: 277 opt: 648 Z-score: 455.6 bits: 93.7 E(32554): 4.7e-19 Smith-Waterman score: 648; 28.8% identity (57.8% similar) in 479 aa overlap (4-473:9-466) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MACSLKDELLCSICLSIYQDPVSLGCEHYFCRRCITEHWVRQEAQGARDCPECRR .:..: : ::: .:::...: : ::: :.. : .. . . :: :: CCDS38 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSW--KDLDDTFPCPVCRF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 TFAEPALAPSLKLANIVERYSSFPLDAILNARRAARP-CQAHDK-VKLFCLTDRALLCFF : .. . .: :..: ... . :. :. :.. . :::. : .:: CCDS38 CFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEILCTQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 CDEPALHEQHQVTGIDDAFDELQRELKDQLQALQDSEREHTEALQLLKRQLAETKSSTKS :. . :..: . : : . .. :. .:. :... .. ... : . .: :.... CCDS38 CSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKKVEY 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 LRTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKVQRYSQQLRKVQEGAQILQ : :. ::... .:...:. .:.... . :. . ...: .... .. :. CCDS38 KREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILA-------KLNENLVELSDYVSTLK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 ERLAETDRHTFLAGVASLSERLKGKIHETNLTYED---FPTSKY--TGPLQYTIWKSLFQ . : :.. .. ... :.. . . . :: . : .:: . : ::. .: . CCDS38 HLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKCPELFSFRLTKYGFSLPPQYS---GLDR 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 DIHPVPAALTLDPGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSPKRFDVEVSVLGSEAFSS :.: . . :: .::: .:..:.: : : . . : :.:: : .::::. ::: CCDS38 IIKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYD-PRRFYVCPAVLGSQRFSS 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 GVHYWEVVVAEKTQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSR--GFYCIVMHDGNQYSACTEPWTR : ::::: :..: .:..:. .. : . : ::: ::. : . . : : :. CCDS38 GRHYWEVEVGNKPKWILGVCQDCLLR--NWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTTQ 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 LNVRDKLDKVGVFLDYDQGLLIFYNADDMSWLYTFREKFPGKLCSYFSPGQSHANGKNVQ : : .:.:.::::. : : ::: .: : :::: . : . :: .: . . CCDS38 LLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDCFTEAVWPYFY------TGTDSE 410 420 430 440 450 470 pF1KE1 PLRINTVRI ::.: .: CCDS38 PLKICSVSDSER 460 470 >>CCDS10114.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 (341 aa) initn: 524 init1: 368 opt: 635 Z-score: 448.7 bits: 91.9 E(32554): 1.1e-18 Smith-Waterman score: 635; 33.0% identity (63.4% similar) in 339 aa overlap (135-470:1-337) 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 TDRALLCFFCDEPALHEQHQVTGIDDAFDELQRELKDQLQALQDSEREHTEALQLLKRQL ...:: : :. . .: .. :. . CCDS10 MEEELAIQQGQLETTLKELQTLRNMQKEAI 10 20 30 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 AETKSSTKSLRTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKVQRYSQQLRK : : . :. .. : .::..:. ..: .: ::. . ..: .... ..: CCDS10 AAHKENKLHLQQHVSMEFLKLHQFLHSKEKDILTELREEGKALNEEMELNLSQLQEQCLL 40 50 60 70 80 90 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 VQEGAQILQERLAETDRHTFLAGVASLSERL-KG-KIHET-NLTYEDFPTSKYTGPLQYT ... .: . . . :: ...: . : .: :. : .: . . ..: ::.:: CCDS10 AKDMLVSIQAKTEQQNSFDFLKDITTLLHSLEQGMKVLATRELISRKLNLGQYKGPIQYM 100 110 120 130 140 150 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 IWKSLFQDIHPVPAALTLDPGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSPKRFDVEVSVL .:. . . . : . ::::: ::: :.:: . : : .:... . . :.:.::: :.:: CCDS10 VWREMQDTLCPGLSPLTLDPKTAHPNLVLSKSQTSVWHGDIK-KIMPDDPERFDSSVAVL 160 170 180 190 200 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 GSEAFSSGVHYWEVVVAEKTQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGNQYSACT ::..:.:: :::: ::.::.:..:...:. :::: . : .::. . ... .. .: CCDS10 GSRGFTSGKWYWEVEVAKKTKWTVGVVRESIIRKGSCPLTPEQGFWLLRLRNQTDLKALD 210 220 230 240 250 260 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 EPWTRLNVRDKLDKVGVFLDYDQGLLIFYNADDMSWLYTFREKFPGKLCSYFSPGQSHAN : :.. ..:::::..:::. : : :::: :. .::: . : :: :: : . . CCDS10 LPSFSLTLTNNLDKVGIYLDYEGGQLSFYNAKTMTHIYTFSNTFMEKLYPYFCPCLNDG- 270 280 290 300 310 320 470 pF1KE1 GKNVQPLRINTVRI :.: .::.: CCDS10 GENKEPLHILHPQ 330 340 >>CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 (477 aa) initn: 344 init1: 155 opt: 613 Z-score: 432.1 bits: 89.3 E(32554): 9.5e-18 Smith-Waterman score: 613; 26.7% identity (55.6% similar) in 468 aa overlap (1-456:6-459) 10 20 30 40 pF1KE1 MACSLKDELLCSICLSIYQDPVSLGCEHYFCRRCITEHWV-------RQEAQGAR .: .:..: :::::. . ::: : : ::: :: : :.. .:. CCDS15 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 DCPECRRTFAEPALAPSLKLANIVERYSSFPLDAILNARRAARPCQAH-DKVKLFCLTDR :::::. . : :. :....: .. : . . :: : . .:::: :. CCDS15 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQHP------GLQKQDLCQEHHEPLKLFCQKDQ 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 ALLCFFCDEPALHEQHQVTGIDDAFDELQRELKDQLQALQDSEREHTEALQLLKRQ-LAE . .: : : :. :.: ..: . . .:..... :.. . .: :: ..: ::: CCDS15 SPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLRE-QITRTGNLQAREEQSLAE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 TKSSTKSLRTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKVQRYSQQLRKVQ ....: : : ::... : :... .:. ::.. .: . ....: ..: .... CCDS15 WQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLE 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 EGAQILQERLAETDRHTFLAGVASLSERLKGKIHETNLTYEDFPTSKYTGPLQYTIWKSL :.:: .. . . ::.. . ... ... : . : : . ... CCDS15 LLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGF 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 FQDIHPVPAALTLDPGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSPKRFDVEVSVLGSEAF ..:. : : .:. :.: .. :. : :: . ..:. :: CCDS15 LEDVVP-------DATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAF 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 SSGVHYWEV--VVAEKTQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGNQYSACTEPW ::: ::::: .. . :..:. .. .::: . : ::. . . :..: . CCDS15 SSGRHYWEVGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSAL 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 TRLNVRDKLDKVGVFLDYDQGLLIFYNADDMSWLYTFREK-FPGKLCSYFSPGQSHANGK : . . . ...:.:::.. : . ::...: : :.:. . ::: : .: : CCDS15 TPVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQM 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 NVQPLRINTVRI CCDS15 VISTVTMWVKG 470 475 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 19:23:28 2016 done: Sun Nov 6 19:23:28 2016 Total Scan time: 2.910 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]