FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1942, 496 aa 1>>>pF1KE1942 496 - 496 aa - 496 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7611+/-0.00117; mu= 15.8129+/- 0.069 mean_var=98.1933+/-18.713, 0's: 0 Z-trim(104.8): 132 B-trim: 10 in 2/48 Lambda= 0.129430 statistics sampled from 7909 (8062) to 7909 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16 Scan time: 3.110 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS336.1 MATN1 gene_id:4146|Hs108|chr1 ( 496) 3190 606.8 1.7e-173 CCDS46226.1 MATN3 gene_id:4148|Hs108|chr2 ( 486) 931 185.0 1.6e-46 CCDS13348.1 MATN4 gene_id:8785|Hs108|chr20 ( 581) 859 171.6 2.1e-42 CCDS46607.1 MATN4 gene_id:8785|Hs108|chr20 ( 540) 823 164.8 2.1e-40 CCDS83309.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 915) 805 161.7 3.2e-39 CCDS55265.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 937) 805 161.7 3.2e-39 CCDS55264.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 956) 805 161.7 3.3e-39 CCDS83099.1 COL21A1 gene_id:81578|Hs108|chr6 ( 954) 506 105.8 2.1e-22 CCDS55025.1 COL21A1 gene_id:81578|Hs108|chr6 ( 957) 506 105.9 2.1e-22 CCDS43482.1 COL12A1 gene_id:1303|Hs108|chr6 (3063) 490 103.3 4e-21 CCDS34938.1 COL14A1 gene_id:7373|Hs108|chr8 (1796) 481 101.4 8.6e-21 CCDS43481.1 COL12A1 gene_id:1303|Hs108|chr6 (1899) 472 99.8 2.9e-20 CCDS6376.1 COL22A1 gene_id:169044|Hs108|chr8 (1626) 447 95.0 6.5e-19 CCDS46628.1 COL20A1 gene_id:57642|Hs108|chr20 (1284) 421 90.1 1.6e-17 CCDS2773.1 COL7A1 gene_id:1294|Hs108|chr3 (2944) 421 90.4 2.9e-17 CCDS54349.1 VIT gene_id:5212|Hs108|chr2 ( 656) 393 84.6 3.6e-16 CCDS54348.1 VIT gene_id:5212|Hs108|chr2 ( 657) 393 84.6 3.6e-16 CCDS54347.1 VIT gene_id:5212|Hs108|chr2 ( 678) 393 84.6 3.7e-16 CCDS33180.1 VIT gene_id:5212|Hs108|chr2 ( 693) 393 84.6 3.7e-16 CCDS43553.1 COL28A1 gene_id:340267|Hs108|chr7 (1125) 374 81.3 6.3e-15 CCDS46911.1 COL6A6 gene_id:131873|Hs108|chr3 (2263) 350 77.0 2.4e-13 CCDS7589.2 VWA2 gene_id:340706|Hs108|chr10 ( 755) 329 72.7 1.6e-12 CCDS27.1 VWA1 gene_id:64856|Hs108|chr1 ( 445) 318 70.5 4.4e-12 CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1152) 319 71.0 7.9e-12 CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1153) 319 71.0 7.9e-12 CCDS9640.1 COCH gene_id:1690|Hs108|chr14 ( 550) 313 69.6 9.9e-12 CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs108|chr16 (1161) 317 70.6 1e-11 CCDS10711.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1163) 306 68.6 4.3e-11 CCDS67014.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1169) 306 68.6 4.3e-11 CCDS32433.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1170) 302 67.8 7.2e-11 CCDS54439.1 COL6A3 gene_id:1293|Hs108|chr2 (1036) 299 67.2 9.7e-11 >>CCDS336.1 MATN1 gene_id:4146|Hs108|chr1 (496 aa) initn: 3190 init1: 3190 opt: 3190 Z-score: 3228.1 bits: 606.8 E(32554): 1.7e-173 Smith-Waterman score: 3190; 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CCDS46 QCQHVCISDGEGKHHCECSQGYTLNADKKTCSALDRCALN--THGCEHICVNDRSGSYHC 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 ENFELVKKFISQIVDTLDVSDKLAQVGLVQYSSSVRQEFPLGRFHTKKDIKAAVRNMSYM : .: CCDS46 ECYEGYTLNEDRKTCSAQDKCALGTHGCQHICVNDRTGSHHCECYEGYTLNADKKTCSVR 340 350 360 370 380 390 >>CCDS13348.1 MATN4 gene_id:8785|Hs108|chr20 (581 aa) initn: 1567 init1: 618 opt: 859 Z-score: 874.8 bits: 171.6 E(32554): 2.1e-42 Smith-Waterman score: 1333; 45.0% identity (66.1% similar) in 522 aa overlap (10-448:4-521) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MRVLSGTSLMLC--SLLLLLQALCSPGLAPQSRGHLCRTRPTDLVFVVDSSRSVRPVEFE .:: :::::: . : : :.: : :::::.:::::::: ::: CCDS13 MRGLLCWPVLLLLLQPWETQL---QLTGPRCHTGPLDLVFVIDSSRSVRPFEFE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 KVKVFLSQVIESLDVGPNATRVGMVNYASTVKQEFSLRAHVSKAALLQAVRRIQPLSTGT .. :: ....:.:::::::::...:.: :.. : ::: . . .:.: . ::. :: CCDS13 TMRQFLMGLLRGLNVGPNATRVGVIQYSSQVQSVFPLRAFSRREDMERAIRDLVPLAQGT 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 MTGLAIQFAITKAFGDAEGGRSRSPDISKVVIVVTDGRPQDSVQDVSARARASGVELFAI :::::::.:.. ::. :::.: . .:...:::::::: : .:.:.::: :.:..:. CCDS13 MTGLAIQYAMNVAFSVAEGARPPEERVPRVAVIVTDGRPQDRVAEVAAQARARGIEIYAV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 GVGSVDKATLRQIASEPQDEHVDYVESYSVIEKLSRKFQEAFCVVSDLCATGDHDCEQVC :: .: ..:: .:: : :::: :::...:.... .:: .:.. :::: : : ::. : CCDS13 GVQRADVGSLRAMASPPLDEHVFLVESFDLIQEFGLQFQSRLCAI-DLCAEGTHGCEHHC 180 190 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 ISSPGSYTCACHEGFTLNSD---------------------------------------- ..::::: : :. ::.:..: CCDS13 VNSPGSYFCHCQVGFVLQQDQRSCRAIDYCSFGNHSCQHECVSTPGGPRCHCREGHDLQP 240 250 260 270 280 290 260 270 280 pF1KE1 -GKTCNV---CSG---------------------------GGGSSAT-------DLVFLI :..:.: :.: . :.: . :::.:. CCDS13 DGRSCQVRDLCNGVDHGCEFQCVSEGLSYRCLCPEGRQLQADGKSCNRCREGHVDLVLLV 300 310 320 330 340 350 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 DGSKSVRPENFELVKKFISQIVDTLDVSDKLAQVGLVQYSSSVRQEFPLGRFHTKKDIKA ::::::::.::::::.:..:::: :::: . ..:::::.:: :: ::::::. : ..: CCDS13 DGSKSVRPQNFELVKRFVNQIVDFLDVSPEGTRVGLVQFSSRVRTEFPLGRYGTAAEVKQ 360 370 380 390 400 410 350 360 370 380 390 pF1KE1 AVRNMSYMEKGTMTGAALKYLIDNSFTVSSGARPGA---QKVGIVFTDGRSQDYINDAAK :: . :::.::::: ::......::. ..:::: : .::.::::::::: :. : CCDS13 AVLAVEYMERGTMTGLALRHMVEHSFSEAQGARPRALNVPRVGLVFTDGRSQDDISVWAA 420 430 440 450 460 470 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 KAKDLGFKMFAVGVGNAVEDELREIASEPVAEHYFYTADFKTINQIGKKLQKKICVEEDP .::. :. :.:::::.::: :::::::::. : :. :: :.... ..:. CCDS13 RAKEEGIVMYAVGVGKAVEAELREIASEPAELHVSYAPDFGTMTHLLENLRGSICPEEGI 480 490 500 510 520 530 460 470 480 490 pF1KE1 CACESLVKFQAKVEGLLQALTRKLEAVSKRLAILENTVV CCDS13 SAGTELRSPCECESLVEFQGRTLGALESLTLNLAQLTARLEDLENQLANQK 540 550 560 570 580 >>CCDS46607.1 MATN4 gene_id:8785|Hs108|chr20 (540 aa) initn: 1567 init1: 618 opt: 823 Z-score: 838.9 bits: 164.8 E(32554): 2.1e-40 Smith-Waterman score: 1491; 47.5% identity (70.8% similar) in 520 aa overlap (10-478:4-519) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MRVLSGTSLMLC--SLLLLLQALCSPGLAPQSRGHLCRTRPTDLVFVVDSSRSVRPVEFE .:: :::::: . : : :.: : :::::.:::::::: ::: CCDS46 MRGLLCWPVLLLLLQPWET---QLQLTGPRCHTGPLDLVFVIDSSRSVRPFEFE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 KVKVFLSQVIESLDVGPNATRVGMVNYASTVKQEFSLRAHVSKAALLQAVRRIQPLSTGT .. :: ....:.:::::::::...:.: :.. : ::: . . .:.: . ::. :: CCDS46 TMRQFLMGLLRGLNVGPNATRVGVIQYSSQVQSVFPLRAFSRREDMERAIRDLVPLAQGT 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 MTGLAIQFAITKAFGDAEGGRSRSPDISKVVIVVTDGRPQDSVQDVSARARASGVELFAI :::::::.:.. ::. :::.: . .:...:::::::: : .:.:.::: :.:..:. CCDS46 MTGLAIQYAMNVAFSVAEGARPPEERVPRVAVIVTDGRPQDRVAEVAAQARARGIEIYAV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 GVGSVDKATLRQIASEPQDEHVDYVESYSVIEKLSRKFQEAFCVVSDLCATGDHDCEQVC :: .: ..:: .:: : :::: :::...:.... .:: .:.. : :. :.:.:.. : CCDS46 GVQRADVGSLRAMASPPLDEHVFLVESFDLIQEFGLQFQSRLCAI-DYCSFGNHSCQHEC 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KE1 ISSPGSYTCACHEGFTLNSDGKTCNV---CSG---------------------------G .:.::. : :.:: :. ::..:.: :.: . CCDS46 VSTPGGPRCHCREGHDLQPDGRSCQVRDLCNGVDHGCEFQCVSEGLSYRCLCPEGRQLQA 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE1 GGSSAT-------DLVFLIDGSKSVRPENFELVKKFISQIVDTLDVSDKLAQVGLVQYSS :.: . :::.:.::::::::.::::::.:..:::: :::: . ..:::::.:: CCDS46 DGKSCNRCREGHVDLVLLVDGSKSVRPQNFELVKRFVNQIVDFLDVSPEGTRVGLVQFSS 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 pF1KE1 SVRQEFPLGRFHTKKDIKAAVRNMSYMEKGTMTGAALKYLIDNSFTVSSGARPGA---QK :: ::::::. : ..: :: . :::.::::: ::......::. ..:::: : . CCDS46 RVRTEFPLGRYGTAAEVKQAVLAVEYMERGTMTGLALRHMVEHSFSEAQGARPRALNVPR 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 VGIVFTDGRSQDYINDAAKKAKDLGFKMFAVGVGNAVEDELREIASEPVAEHYFYTADFK ::.::::::::: :. : .::. :. :.:::::.::: :::::::::. : :. :: CCDS46 VGLVFTDGRSQDDISVWAARAKEEGIVMYAVGVGKAVEAELREIASEPAELHVSYAPDFG 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 pF1KE1 TINQIGKKLQKKICVEE---------DPCACESLVKFQAKVEGLLQALTRKLEAVSKRLA :.... ..:. .:: :: .:: :::::.::... : :..:: CCDS46 TMTHLLENLRGSICPEEGISAGTELRSPCECESLVEFQGRTLGALESLTLNLAQLTARLE 480 490 500 510 520 530 490 pF1KE1 ILENTVV CCDS46 DLENQLANQK 540 >>CCDS83309.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 (915 aa) initn: 1453 init1: 646 opt: 805 Z-score: 817.7 bits: 161.7 E(32554): 3.2e-39 Smith-Waterman score: 806; 46.2% identity (73.6% similar) in 273 aa overlap (12-264:8-279) 10 20 30 40 pF1KE1 MRVLSGTSLMLCSLLLLLQALCSPGLAPQ-------SRGHLCRTRP-------------T : ::.: : . :. : . :::. ::.: . CCDS83 MEKMLAGCFLLILGQIVLLPAEARERSRGRSISRGRHARTHPQTALLESSCENKRA 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 DLVFVVDSSRSVRPVEFEKVKVFLSQVIESLDVGPNATRVGMVNYASTVKQEFSLRAHVS ::::..:::::: .. ::: :. .... ::.::..::::...:.::::.::::.. CCDS83 DLVFIIDSSRSVNTHDYAKVKEFIVDILQFLDIGPDVTRVGLLQYGSTVKNEFSLKTFKR 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 KAALLQAVRRIQPLSTGTMTGLAIQFAITKAFGDAEGGRSRSPDISKVVIVVTDGRPQDS :. . .::.:.. ::::::::::::.:.. ::..:::.: .. .:...::::::::: CCDS83 KSEVERAVKRMRHLSTGTMTGLAIQYALNIAFSEAEGARPLRENVPRVIMIVTDGRPQDS 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 VQDVSARARASGVELFAIGVGSVDKATLRQIASEPQDEHVDYVESYSVIEKLSRKFQEAF : .:.:.:: .:. .::::::.:: ::..:.:::...:: : ..: :: :. ::. . CCDS83 VAEVAAKARDTGILIFAIGVGQVDFNTLKSIGSEPHEDHVFLVANFSQIETLTSVFQKKL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 CVVSDLCATGDHDCEQVCISSPGSYTCACHEGFTLNSDGKTCNVCSGGGGSSATDLVFLI :. . .:.: .:.: . ::. ::::.: :..:. :::: :: . CCDS83 CT-AHMCSTLEHNCAHFCINIPGSYVCRCKQGYILNSDQTTCRIQDLCAMEDHNCEQLCV 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 DGSKSVRPENFELVKKFISQIVDTLDVSDKLAQVGLVQYSSSVRQEFPLGRFHTKKDIKA CCDS83 NVPGSFVCQCYSGYALAEDGKRCVAVDYCASENHGCEHECVNADGSYLCQCHEGFALNPD 300 310 320 330 340 350 >-- initn: 994 init1: 437 opt: 518 Z-score: 528.0 bits: 108.1 E(32554): 4.3e-23 Smith-Waterman score: 813; 51.1% identity (77.4% similar) in 235 aa overlap (221-452:564-794) 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 IASEPQDEHVDYVESYSVIEKLSRKFQEAFCVVSDLCATGDHDCEQVCISSPGSYTCACH : .:.: . : ::..:... .:: : : CCDS83 HGCEHICVNSDDSYTCECLEGFRLAEDGKRCRRKDVCKSTHHGCEHICVNNGNSYICKCS 540 550 560 570 580 590 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 EGFTLNSDGKTCNVCSGGGGSSATDLVFLIDGSKSVRPENFELVKKFISQIVDTLDVSDK :::.: ::. :. :. : ::::.::::::. ::::.::.:.. :.:.: .: : CCDS83 EGFVLAEDGRRCKKCTEG----PIDLVFVIDGSKSLGEENFEVVKQFVTGIIDSLTISPK 600 610 620 630 640 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 LAQVGLVQYSSSVRQEFPLGRFHTKKDIKAAVRNMSYMEKGTMTGAALKYLIDNSFTVSS :.:::.:::..:. :: : :.. ::.: :: .:.:: ::.::: :::.... ::: . CCDS83 AARVGLLQYSTQVHTEFTLRNFNSAKDMKKAVAHMKYMGKGSMTGLALKHMFERSFTQGE 650 660 670 680 690 700 380 390 400 410 420 pF1KE1 GARPGAQKV---GIVFTDGRSQDYINDAAKKAKDLGFKMFAVGVGNAVEDELREIASEPV :::: . .: .:::::::.:: ... :.::: :. :.:::::.:.:.::.::::::. CCDS83 GARPLSTRVPRAAIVFTDGRAQDDVSEWASKAKANGITMYAVGVGKAIEEELQEIASEPT 710 720 730 740 750 760 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 AEHYFYTADFKTINQIGKKLQKKICVEEDPCACESLVKFQAKVEGLLQALTRKLEAVSKR .: ::. ::.:...:..::.: :: CCDS83 NKHLFYAEDFSTMDEISEKLKKGICEALEDSDGRQDSPAGELPKTVQQPTESEPVTINIQ 770 780 790 800 810 820 >>CCDS55265.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 (937 aa) initn: 1608 init1: 646 opt: 805 Z-score: 817.5 bits: 161.7 E(32554): 3.2e-39 Smith-Waterman score: 806; 46.2% identity (73.6% similar) in 273 aa overlap (12-264:8-279) 10 20 30 40 pF1KE1 MRVLSGTSLMLCSLLLLLQALCSPGLAPQ-------SRGHLCRTRP-------------T : ::.: : . :. : . :::. ::.: . CCDS55 MEKMLAGCFLLILGQIVLLPAEARERSRGRSISRGRHARTHPQTALLESSCENKRA 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 DLVFVVDSSRSVRPVEFEKVKVFLSQVIESLDVGPNATRVGMVNYASTVKQEFSLRAHVS ::::..:::::: .. ::: :. .... ::.::..::::...:.::::.::::.. CCDS55 DLVFIIDSSRSVNTHDYAKVKEFIVDILQFLDIGPDVTRVGLLQYGSTVKNEFSLKTFKR 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 KAALLQAVRRIQPLSTGTMTGLAIQFAITKAFGDAEGGRSRSPDISKVVIVVTDGRPQDS :. . .::.:.. ::::::::::::.:.. ::..:::.: .. .:...::::::::: CCDS55 KSEVERAVKRMRHLSTGTMTGLAIQYALNIAFSEAEGARPLRENVPRVIMIVTDGRPQDS 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 VQDVSARARASGVELFAIGVGSVDKATLRQIASEPQDEHVDYVESYSVIEKLSRKFQEAF : .:.:.:: .:. .::::::.:: ::..:.:::...:: : ..: :: :. ::. . CCDS55 VAEVAAKARDTGILIFAIGVGQVDFNTLKSIGSEPHEDHVFLVANFSQIETLTSVFQKKL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 CVVSDLCATGDHDCEQVCISSPGSYTCACHEGFTLNSDGKTCNVCSGGGGSSATDLVFLI :. . .:.: .:.: . ::. ::::.: :..:. :::: :: . CCDS55 CT-AHMCSTLEHNCAHFCINIPGSYVCRCKQGYILNSDQTTCRIQDLCAMEDHNCEQLCV 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 DGSKSVRPENFELVKKFISQIVDTLDVSDKLAQVGLVQYSSSVRQEFPLGRFHTKKDIKA CCDS55 NVPGSFVCQCYSGYALAEDGKRCVAVDYCASENHGCEHECVNADGSYLCQCHEGFALNPD 300 310 320 330 340 350 >-- initn: 994 init1: 437 opt: 518 Z-score: 527.9 bits: 108.1 E(32554): 4.4e-23 Smith-Waterman score: 813; 51.1% identity (77.4% similar) in 235 aa overlap (221-452:605-835) 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 IASEPQDEHVDYVESYSVIEKLSRKFQEAFCVVSDLCATGDHDCEQVCISSPGSYTCACH : .:.: . : ::..:... .:: : : CCDS55 HGCEHICVNSDDSYTCECLEGFRLAEDGKRCRRKDVCKSTHHGCEHICVNNGNSYICKCS 580 590 600 610 620 630 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 EGFTLNSDGKTCNVCSGGGGSSATDLVFLIDGSKSVRPENFELVKKFISQIVDTLDVSDK :::.: ::. :. :. : ::::.::::::. ::::.::.:.. :.:.: .: : CCDS55 EGFVLAEDGRRCKKCTEG----PIDLVFVIDGSKSLGEENFEVVKQFVTGIIDSLTISPK 640 650 660 670 680 690 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 LAQVGLVQYSSSVRQEFPLGRFHTKKDIKAAVRNMSYMEKGTMTGAALKYLIDNSFTVSS :.:::.:::..:. :: : :.. ::.: :: .:.:: ::.::: :::.... ::: . CCDS55 AARVGLLQYSTQVHTEFTLRNFNSAKDMKKAVAHMKYMGKGSMTGLALKHMFERSFTQGE 700 710 720 730 740 750 380 390 400 410 420 pF1KE1 GARPGAQKV---GIVFTDGRSQDYINDAAKKAKDLGFKMFAVGVGNAVEDELREIASEPV :::: . .: .:::::::.:: ... :.::: :. :.:::::.:.:.::.::::::. CCDS55 GARPLSTRVPRAAIVFTDGRAQDDVSEWASKAKANGITMYAVGVGKAIEEELQEIASEPT 760 770 780 790 800 810 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 AEHYFYTADFKTINQIGKKLQKKICVEEDPCACESLVKFQAKVEGLLQALTRKLEAVSKR .: ::. ::.:...:..::.: :: CCDS55 NKHLFYAEDFSTMDEISEKLKKGICEALEDSDGRQDSPAGELPKTVQQPTVQHRYLFEED 820 830 840 850 860 870 >>CCDS55264.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 (956 aa) initn: 1608 init1: 646 opt: 805 Z-score: 817.4 bits: 161.7 E(32554): 3.3e-39 Smith-Waterman score: 806; 46.2% identity (73.6% similar) in 273 aa overlap (12-264:8-279) 10 20 30 40 pF1KE1 MRVLSGTSLMLCSLLLLLQALCSPGLAPQ-------SRGHLCRTRP-------------T : ::.: : . :. : . :::. ::.: . CCDS55 MEKMLAGCFLLILGQIVLLPAEARERSRGRSISRGRHARTHPQTALLESSCENKRA 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 DLVFVVDSSRSVRPVEFEKVKVFLSQVIESLDVGPNATRVGMVNYASTVKQEFSLRAHVS ::::..:::::: .. ::: :. .... ::.::..::::...:.::::.::::.. CCDS55 DLVFIIDSSRSVNTHDYAKVKEFIVDILQFLDIGPDVTRVGLLQYGSTVKNEFSLKTFKR 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 KAALLQAVRRIQPLSTGTMTGLAIQFAITKAFGDAEGGRSRSPDISKVVIVVTDGRPQDS :. . .::.:.. ::::::::::::.:.. ::..:::.: .. .:...::::::::: CCDS55 KSEVERAVKRMRHLSTGTMTGLAIQYALNIAFSEAEGARPLRENVPRVIMIVTDGRPQDS 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 VQDVSARARASGVELFAIGVGSVDKATLRQIASEPQDEHVDYVESYSVIEKLSRKFQEAF : .:.:.:: .:. .::::::.:: ::..:.:::...:: : ..: :: :. ::. . CCDS55 VAEVAAKARDTGILIFAIGVGQVDFNTLKSIGSEPHEDHVFLVANFSQIETLTSVFQKKL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 CVVSDLCATGDHDCEQVCISSPGSYTCACHEGFTLNSDGKTCNVCSGGGGSSATDLVFLI :. . .:.: .:.: . ::. ::::.: :..:. :::: :: . CCDS55 CT-AHMCSTLEHNCAHFCINIPGSYVCRCKQGYILNSDQTTCRIQDLCAMEDHNCEQLCV 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 DGSKSVRPENFELVKKFISQIVDTLDVSDKLAQVGLVQYSSSVRQEFPLGRFHTKKDIKA CCDS55 NVPGSFVCQCYSGYALAEDGKRCVAVDYCASENHGCEHECVNADGSYLCQCHEGFALNPD 300 310 320 330 340 350 >-- initn: 994 init1: 437 opt: 518 Z-score: 527.8 bits: 108.1 E(32554): 4.5e-23 Smith-Waterman score: 813; 51.1% identity (77.4% similar) in 235 aa overlap (221-452:605-835) 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 IASEPQDEHVDYVESYSVIEKLSRKFQEAFCVVSDLCATGDHDCEQVCISSPGSYTCACH : .:.: . : ::..:... .:: : : CCDS55 HGCEHICVNSDDSYTCECLEGFRLAEDGKRCRRKDVCKSTHHGCEHICVNNGNSYICKCS 580 590 600 610 620 630 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 EGFTLNSDGKTCNVCSGGGGSSATDLVFLIDGSKSVRPENFELVKKFISQIVDTLDVSDK :::.: ::. :. :. : ::::.::::::. ::::.::.:.. :.:.: .: : CCDS55 EGFVLAEDGRRCKKCTEG----PIDLVFVIDGSKSLGEENFEVVKQFVTGIIDSLTISPK 640 650 660 670 680 690 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 LAQVGLVQYSSSVRQEFPLGRFHTKKDIKAAVRNMSYMEKGTMTGAALKYLIDNSFTVSS :.:::.:::..:. :: : :.. ::.: :: .:.:: ::.::: :::.... ::: . CCDS55 AARVGLLQYSTQVHTEFTLRNFNSAKDMKKAVAHMKYMGKGSMTGLALKHMFERSFTQGE 700 710 720 730 740 750 380 390 400 410 420 pF1KE1 GARPGAQKV---GIVFTDGRSQDYINDAAKKAKDLGFKMFAVGVGNAVEDELREIASEPV :::: . .: .:::::::.:: ... :.::: :. :.:::::.:.:.::.::::::. CCDS55 GARPLSTRVPRAAIVFTDGRAQDDVSEWASKAKANGITMYAVGVGKAIEEELQEIASEPT 760 770 780 790 800 810 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 AEHYFYTADFKTINQIGKKLQKKICVEEDPCACESLVKFQAKVEGLLQALTRKLEAVSKR .: ::. ::.:...:..::.: :: CCDS55 NKHLFYAEDFSTMDEISEKLKKGICEALEDSDGRQDSPAGELPKTVQQPTESEPVTINIQ 820 830 840 850 860 870 >>CCDS83099.1 COL21A1 gene_id:81578|Hs108|chr6 (954 aa) initn: 419 init1: 277 opt: 506 Z-score: 515.7 bits: 105.8 E(32554): 2.1e-22 Smith-Waterman score: 506; 41.0% identity (71.7% similar) in 205 aa overlap (255-458:21-217) 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 DLCATGDHDCEQVCISSPGSYTCACHEGFTLNSDGKTCNVCSGGGGSSATDLVFLIDGSK : ::.. . : .. :::::..::: CCDS83 MAHYITFLCMVLVLLLQNSVLAEDGEVRSSCR----TAPTDLVFILDGSY 10 20 30 40 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 SVRPENFELVKKFISQIVDTLDVSDKLAQVGLVQYSSSVRQEFPLGRFHTKKDIKAAVRN :: :::::.:::.. .:. ..:.. :. :::.::::. :.::: . . . . :::.. CCDS83 SVGPENFEIVKKWLVNITKNFDIGPKFIQVGVVQYSDYPVLEIPLGSYDSGEHLTAAVES 50 60 70 80 90 100 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 MSYMEKGTMTGAALKYLIDNSFTVSSGARPGAQKVGIVFTDGRSQDYINDAAKKAKDLGF . :. .: :: :... .: :. :: :...:.:::.::: ..:::. :.: . CCDS83 ILYLGGNTKTGKAIQFALDYLFAKSSRF---LTKIAVVLTDGKSQDDVKDAAQAARDSKI 110 120 130 140 150 160 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 KMFAVGVGNAVED-ELREIASEPVAEHYFYTADFKTINQIGKKLQKKICVEEDPCACESL .::.:::. .:: ::: ::..: . . ::. :. .:..: . ...:.: ::. : CCDS83 TLFAIGVGSETEDAELRAIANKPSSTYVFYVEDYIAISKIREVMKQKLC-EESVCPTRIP 170 180 190 200 210 220 470 480 490 pF1KE1 VKFQAKVEGLLQALTRKLEAVSKRLAILENTVV CCDS83 VAARDERGFDILLGLDVNKKVKKRIQLSPKKIKGYEVTSKVDLSELTSNVFPEGLPPSYV 230 240 250 260 270 280 >>CCDS55025.1 COL21A1 gene_id:81578|Hs108|chr6 (957 aa) initn: 419 init1: 277 opt: 506 Z-score: 515.7 bits: 105.9 E(32554): 2.1e-22 Smith-Waterman score: 506; 41.0% identity (71.7% similar) in 205 aa overlap (255-458:21-217) 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 DLCATGDHDCEQVCISSPGSYTCACHEGFTLNSDGKTCNVCSGGGGSSATDLVFLIDGSK : ::.. . : .. :::::..::: CCDS55 MAHYITFLCMVLVLLLQNSVLAEDGEVRSSCR----TAPTDLVFILDGSY 10 20 30 40 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 SVRPENFELVKKFISQIVDTLDVSDKLAQVGLVQYSSSVRQEFPLGRFHTKKDIKAAVRN :: :::::.:::.. .:. ..:.. :. :::.::::. :.::: . . . . :::.. CCDS55 SVGPENFEIVKKWLVNITKNFDIGPKFIQVGVVQYSDYPVLEIPLGSYDSGEHLTAAVES 50 60 70 80 90 100 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 MSYMEKGTMTGAALKYLIDNSFTVSSGARPGAQKVGIVFTDGRSQDYINDAAKKAKDLGF . :. .: :: :... .: :. :: :...:.:::.::: ..:::. :.: . CCDS55 ILYLGGNTKTGKAIQFALDYLFAKSSRF---LTKIAVVLTDGKSQDDVKDAAQAARDSKI 110 120 130 140 150 160 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 KMFAVGVGNAVED-ELREIASEPVAEHYFYTADFKTINQIGKKLQKKICVEEDPCACESL .::.:::. .:: ::: ::..: . . ::. :. .:..: . ...:.: ::. : CCDS55 TLFAIGVGSETEDAELRAIANKPSSTYVFYVEDYIAISKIREVMKQKLC-EESVCPTRIP 170 180 190 200 210 220 470 480 490 pF1KE1 VKFQAKVEGLLQALTRKLEAVSKRLAILENTVV CCDS55 VAARDERGFDILLGLDVNKKVKKRIQLSPKKIKGYEVTSKVDLSELTSNVFPEGLPPSYV 230 240 250 260 270 280 >>CCDS43482.1 COL12A1 gene_id:1303|Hs108|chr6 (3063 aa) initn: 1432 init1: 487 opt: 490 Z-score: 492.7 bits: 103.3 E(32554): 4e-21 Smith-Waterman score: 490; 40.7% identity (75.8% similar) in 182 aa overlap (271-452:136-317) 250 260 270 280 290 300 pF1KE1 SPGSYTCACHEGFTLNSDGKTCNVCSGGGGSSATDLVFLIDGSKSVRPENFELVKKFISQ :. ::::::.::: :: .::. . ::. CCDS43 VIGQLTIQTGSSTKPVEKKPGKTEIQKCSVSAWTDLVFLVDGSWSVGRNNFKYILDFIAA 110 120 130 140 150 160 310 320 330 340 350 360 pF1KE1 IVDTLDVSDKLAQVGLVQYSSSVRQEFPLGRFHTKKDIKAAVRNMSYMEKGTMTGAALKY .:...:.... ..::.:::::..: :: :.... . .. ::.... : .:::: :. : CCDS43 LVSAFDIGEEKTRVGVVQYSSDTRTEFNLNQYYQRDELLAAIKKIPYKGGNTMTGDAIDY 170 180 190 200 210 220 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 LIDNSFTVSSGARPGAQKVGIVFTDGRSQDYINDAAKKAKDLGFKMFAVGVGNAVEDELR :. :.:: :.::: : ::.:..:::.::: .. :.. ...: ..:..:. : ::. 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CCDS43 FDIGPKRVQIALAQYSGDPRTEWQLNAHRDKKSLLQAVANLPYKGGNTLTGMALNFIRQQ 1230 1240 1250 1260 1270 1280 370 380 390 400 410 420 pF1KE1 SFTVSSGARPGAQKVGIVFTDGRSQDYINDAAKKAKDLGFKMFAVGVGNAVEDELREIAS .: ...: :: :.:.:...:::.::: .. .:: :: : ..::.:. :: : ::. ::. CCDS43 NFRTQAGMRPRARKIGVLITDGKSQDDVEAPSKKLKDEGVELFAIGIKNADEVELKMIAT 1290 1300 1310 1320 1330 1340 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 EPVAEHYFYTADFKTINQIGKKLQKKICVEEDPCACESLVKFQAKVEGLLQALTRKLEAV .: : . .:::.....: : ..: CCDS43 DPDDTHAYNVADFESLSRIVDDLTINLCNSVKGPGDLEAPSNLVISERTHRSFRVSWTPP 1350 1360 1370 1380 1390 1400 >-- initn: 410 init1: 410 opt: 421 Z-score: 423.1 bits: 90.4 E(32554): 3e-17 Smith-Waterman score: 421; 34.7% identity (63.3% similar) in 245 aa overlap (212-453:380-618) 190 200 210 220 230 240 pF1KE1 SVDKATLRQIASEPQDEHVDYVESYSVIEKLSRKFQEAFCVVSDLCATGDHDCEQVCISS :: : . : :: : .. :. .:. 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