Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7796
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7796, 518 aa
1>>>pF1KB7796 518 - 518 aa - 518 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2036+/-0.0009; mu= 1.5947+/- 0.054
mean_var=250.2312+/-52.630, 0's: 0 Z-trim(114.1): 172 B-trim: 354 in 1/50
Lambda= 0.081078
statistics sampled from 14524 (14720) to 14524 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.775), E-opt: 0.2 (0.452), width: 16
Scan time: 2.810
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44075.1 PAX7 gene_id:5081|Hs108|chr1 ( 518) 3543 427.5 1.8e-119
CCDS186.1 PAX7 gene_id:5081|Hs108|chr1 ( 520) 3529 425.9 5.5e-119
CCDS44074.1 PAX7 gene_id:5081|Hs108|chr1 ( 505) 3162 382.9 4.5e-106
CCDS42826.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 479) 2521 308.0 1.6e-83
CCDS42825.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 484) 2511 306.8 3.6e-83
CCDS2448.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 505) 2511 306.8 3.7e-83
CCDS46522.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 483) 2492 304.6 1.7e-82
CCDS2450.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 403) 2104 259.1 6.8e-69
CCDS2449.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 407) 2104 259.1 6.8e-69
CCDS46523.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 215) 1167 149.3 4.2e-36
CCDS2451.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 ( 206) 1165 149.0 4.8e-36
CCDS74709.1 PAX1 gene_id:5075|Hs108|chr20 ( 457) 659 90.1 5.7e-18
CCDS9662.1 PAX9 gene_id:5083|Hs108|chr14 ( 341) 656 89.7 5.8e-18
CCDS13146.2 PAX1 gene_id:5075|Hs108|chr20 ( 534) 659 90.2 6.4e-18
CCDS41561.1 PAX2 gene_id:5076|Hs108|chr10 ( 394) 654 89.5 7.6e-18
CCDS7499.1 PAX2 gene_id:5076|Hs108|chr10 ( 396) 654 89.5 7.6e-18
CCDS65042.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 319) 651 89.1 8.3e-18
CCDS65044.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 295) 650 88.9 8.5e-18
CCDS65043.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 348) 651 89.1 8.9e-18
CCDS65045.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 324) 650 89.0 9.1e-18
CCDS65046.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 328) 650 89.0 9.2e-18
CCDS6607.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 391) 651 89.1 9.7e-18
CCDS65047.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 357) 650 89.0 9.8e-18
CCDS65048.1 PAX5 gene_id:5079|Hs108|chr9 ( 362) 650 89.0 9.9e-18
CCDS42735.1 PAX8 gene_id:7849|Hs108|chr2 ( 287) 635 87.2 2.8e-17
CCDS42736.1 PAX8 gene_id:7849|Hs108|chr2 ( 321) 635 87.2 3e-17
CCDS46399.1 PAX8 gene_id:7849|Hs108|chr2 ( 398) 635 87.3 3.6e-17
CCDS46398.1 PAX8 gene_id:7849|Hs108|chr2 ( 450) 635 87.3 3.9e-17
CCDS31451.1 PAX6 gene_id:5080|Hs108|chr11 ( 422) 619 85.4 1.4e-16
CCDS5797.1 PAX4 gene_id:5078|Hs108|chr7 ( 343) 470 67.9 2.1e-11
>>CCDS44075.1 PAX7 gene_id:5081|Hs108|chr1 (518 aa)
initn: 3543 init1: 3543 opt: 3543 Z-score: 2258.6 bits: 427.5 E(32554): 1.8e-119
Smith-Waterman score: 3543; 100.0% identity (100.0% similar) in 518 aa overlap (1-518:1-518)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAALPGTVPRMMRPAPGQNYPRTGFPLEVSTPLGQGRVNQLGGVFINGRPLPNHIRHKIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAALPGTVPRMMRPAPGQNYPRTGFPLEVSTPLGQGRVNQLGGVFINGRPLPNHIRHKIV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EMAHHGIRPCVISRQLRVSHGCVSKILCRYQETGSIRPGAIGGSKPRQVATPDVEKKIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EMAHHGIRPCVISRQLRVSHGCVSKILCRYQETGSIRPGAIGGSKPRQVATPDVEKKIEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YKRENPGMFSWEIRDRLLKDGHCDRSTVPSVSSISRVLRIKFGKKEEEDEADKKEDDGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YKRENPGMFSWEIRDRLLKDGHCDRSTVPSVSSISRVLRIKFGKKEEEDEADKKEDDGEK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 KAKHSIDGILGDKGNRLDEGSDVESEPDLPLKRKQRRSRTTFTAEQLEELEKAFERTHYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KAKHSIDGILGDKGNRLDEGSDVESEPDLPLKRKQRRSRTTFTAEQLEELEKAFERTHYP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 DIYTREELAQRTKLTEARVQVWFSNRRARWRKQAGANQLAAFNHLLPGGFPPTGMPTLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DIYTREELAQRTKLTEARVQVWFSNRRARWRKQAGANQLAAFNHLLPGGFPPTGMPTLPP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 YQLPDSTYPTTTISQDGGSTVHRPQPLPPSTMHQGGLAAAAAAADTSSAYGARHSFSSYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YQLPDSTYPTTTISQDGGSTVHRPQPLPPSTMHQGGLAAAAAAADTSSAYGARHSFSSYS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 DSFMNPAAPSNHMNPVSNGLSPQVMSILGNPSAVPPQPQADFSISPLHGGLDSATSISAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DSFMNPAAPSNHMNPVSNGLSPQVMSILGNPSAVPPQPQADFSISPLHGGLDSATSISAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 CSQRADSIKPGDSLPTSQAYCPPTYSTTGYSVDPVAGYQYGQYGQSECLVPWASPVPIPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CSQRADSIKPGDSLPTSQAYCPPTYSTTGYSVDPVAGYQYGQYGQSECLVPWASPVPIPS
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KB7 PTPRASCLFMESYKVVSGWGMSISQMEKLKSSQMEQFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PTPRASCLFMESYKVVSGWGMSISQMEKLKSSQMEQFT
490 500 510
>>CCDS186.1 PAX7 gene_id:5081|Hs108|chr1 (520 aa)
initn: 3529 init1: 2489 opt: 3529 Z-score: 2249.7 bits: 425.9 E(32554): 5.5e-119
Smith-Waterman score: 3529; 99.6% identity (99.6% similar) in 520 aa overlap (1-518:1-520)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAALPGTVPRMMRPAPGQNYPRTGFPLEVSTPLGQGRVNQLGGVFINGRPLPNHIRHKIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MAALPGTVPRMMRPAPGQNYPRTGFPLEVSTPLGQGRVNQLGGVFINGRPLPNHIRHKIV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EMAHHGIRPCVISRQLRVSHGCVSKILCRYQETGSIRPGAIGGSKPRQVATPDVEKKIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 EMAHHGIRPCVISRQLRVSHGCVSKILCRYQETGSIRPGAIGGSKPRQVATPDVEKKIEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB7 YKRENPGMFSWEIRDRLLKDGHCDRSTVPS--VSSISRVLRIKFGKKEEEDEADKKEDDG
:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 YKRENPGMFSWEIRDRLLKDGHCDRSTVPSGLVSSISRVLRIKFGKKEEEDEADKKEDDG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 EKKAKHSIDGILGDKGNRLDEGSDVESEPDLPLKRKQRRSRTTFTAEQLEELEKAFERTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 EKKAKHSIDGILGDKGNRLDEGSDVESEPDLPLKRKQRRSRTTFTAEQLEELEKAFERTH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YPDIYTREELAQRTKLTEARVQVWFSNRRARWRKQAGANQLAAFNHLLPGGFPPTGMPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 YPDIYTREELAQRTKLTEARVQVWFSNRRARWRKQAGANQLAAFNHLLPGGFPPTGMPTL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 PPYQLPDSTYPTTTISQDGGSTVHRPQPLPPSTMHQGGLAAAAAAADTSSAYGARHSFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PPYQLPDSTYPTTTISQDGGSTVHRPQPLPPSTMHQGGLAAAAAAADTSSAYGARHSFSS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 YSDSFMNPAAPSNHMNPVSNGLSPQVMSILGNPSAVPPQPQADFSISPLHGGLDSATSIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 YSDSFMNPAAPSNHMNPVSNGLSPQVMSILGNPSAVPPQPQADFSISPLHGGLDSATSIS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 ASCSQRADSIKPGDSLPTSQAYCPPTYSTTGYSVDPVAGYQYGQYGQSECLVPWASPVPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ASCSQRADSIKPGDSLPTSQAYCPPTYSTTGYSVDPVAGYQYGQYGQSECLVPWASPVPI
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KB7 PSPTPRASCLFMESYKVVSGWGMSISQMEKLKSSQMEQFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PSPTPRASCLFMESYKVVSGWGMSISQMEKLKSSQMEQFT
490 500 510 520
>>CCDS44074.1 PAX7 gene_id:5081|Hs108|chr1 (505 aa)
initn: 3188 init1: 2122 opt: 3162 Z-score: 2017.9 bits: 382.9 E(32554): 4.5e-106
Smith-Waterman score: 3162; 99.4% identity (99.6% similar) in 468 aa overlap (1-466:1-468)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAALPGTVPRMMRPAPGQNYPRTGFPLEVSTPLGQGRVNQLGGVFINGRPLPNHIRHKIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAALPGTVPRMMRPAPGQNYPRTGFPLEVSTPLGQGRVNQLGGVFINGRPLPNHIRHKIV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EMAHHGIRPCVISRQLRVSHGCVSKILCRYQETGSIRPGAIGGSKPRQVATPDVEKKIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EMAHHGIRPCVISRQLRVSHGCVSKILCRYQETGSIRPGAIGGSKPRQVATPDVEKKIEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB7 YKRENPGMFSWEIRDRLLKDGHCDRSTVPS--VSSISRVLRIKFGKKEEEDEADKKEDDG
:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YKRENPGMFSWEIRDRLLKDGHCDRSTVPSGLVSSISRVLRIKFGKKEEEDEADKKEDDG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 EKKAKHSIDGILGDKGNRLDEGSDVESEPDLPLKRKQRRSRTTFTAEQLEELEKAFERTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EKKAKHSIDGILGDKGNRLDEGSDVESEPDLPLKRKQRRSRTTFTAEQLEELEKAFERTH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YPDIYTREELAQRTKLTEARVQVWFSNRRARWRKQAGANQLAAFNHLLPGGFPPTGMPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YPDIYTREELAQRTKLTEARVQVWFSNRRARWRKQAGANQLAAFNHLLPGGFPPTGMPTL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 PPYQLPDSTYPTTTISQDGGSTVHRPQPLPPSTMHQGGLAAAAAAADTSSAYGARHSFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PPYQLPDSTYPTTTISQDGGSTVHRPQPLPPSTMHQGGLAAAAAAADTSSAYGARHSFSS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 YSDSFMNPAAPSNHMNPVSNGLSPQVMSILGNPSAVPPQPQADFSISPLHGGLDSATSIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YSDSFMNPAAPSNHMNPVSNGLSPQVMSILGNPSAVPPQPQADFSISPLHGGLDSATSIS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 ASCSQRADSIKPGDSLPTSQAYCPPTYSTTGYSVDPVAGYQYGQYGQSECLVPWASPVPI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS44 ASCSQRADSIKPGDSLPTSQAYCPPTYSTTGYSVDPVAGYQYGQYGQTAVDYLAKNVSLS
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KB7 PSPTPRASCLFMESYKVVSGWGMSISQMEKLKSSQMEQFT
CCDS44 TQRRMKLGEHSAVLGLLPVETGQAY
490 500
>>CCDS42826.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 (479 aa)
initn: 2362 init1: 1079 opt: 2521 Z-score: 1613.0 bits: 308.0 E(32554): 1.6e-83
Smith-Waterman score: 2521; 77.3% identity (90.3% similar) in 484 aa overlap (1-472:1-477)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAALPGTVPRMMRPAPGQNYPRTGFPLEVSTPLGQGRVNQLGGVFINGRPLPNHIRHKIV
:..: :.:::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MTTLAGAVPRMMRPGPGQNYPRSGFPLEVSTPLGQGRVNQLGGVFINGRPLPNHIRHKIV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EMAHHGIRPCVISRQLRVSHGCVSKILCRYQETGSIRPGAIGGSKPRQVATPDVEKKIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::
CCDS42 EMAHHGIRPCVISRQLRVSHGCVSKILCRYQETGSIRPGAIGGSKPKQVTTPDVEKKIEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB7 YKRENPGMFSWEIRDRLLKDGHCDRSTVPSVSSISRVLRIKFGKKEEEDEAD---KKEDD
:::::::::::::::.::::. :::.::::::::::.:: :::: ::: ::: :. ..
CCDS42 YKRENPGMFSWEIRDKLLKDAVCDRNTVPSVSSISRILRSKFGKGEEE-EADLERKEAEE
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GEKKAKHSIDGILGDKGN--RLDEGSDVESEPDLPLKRKQRRSRTTFTAEQLEELEKAFE
.::::::::::::..... . :::::..:::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS42 SEKKAKHSIDGILSERASAPQSDEGSDIDSEPDLPLKRKQRRSRTTFTAEQLEELERAFE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RTHYPDIYTREELAQRTKLTEARVQVWFSNRRARWRKQAGANQLAAFNHLLPGGFPPTGM
::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :::::.:::::::.:
CCDS42 RTHYPDIYTREELAQRAKLTEARVQVWFSNRRARWRKQAGANQLMAFNHLIPGGFPPTAM
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 PTLPPYQLPDSTYPTTTISQ---DGGSTVHRPQPLPPSTMHQGGLAAAAAAADTSSAY--
:::: ::: ...: :.: : : .:::::::::::::.::. . . :.::::
CCDS42 PTLPTYQLSETSYQPTSIPQAVSDPSSTVHRPQPLPPSTVHQSTIPS---NPDSSSAYCL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB7 -GARHSFSSYSDSFMNPAAPSNHMNP-VSNGLSPQVMSILGNPSAVPPQPQADFSISPLH
..::.::::.:::. :..::: ::: ..::::::::..: : ..:: :::.:...:::
CCDS42 PSTRHGFSSYTDSFVPPSGPSNPMNPTIGNGLSPQVMGLLTNHGGVPHQPQTDYALSPLT
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 GGLDSATSISASCSQRADSIKPGDSLPTSQAYCPPTYSTTGYSVDPVAGYQYGQYGQSEC
:::. .:..::::::: : .: :::::::.::::::::::::.:::.::::::::::.
CCDS42 GGLEPTTTVSASCSQRLDHMKSLDSLPTSQSYCPPTYSTTGYSMDPVTGYQYGQYGQSK-
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KB7 LVPWASPVPIPSPTPRASCLFMESYKVVSGWGMSISQMEKLKSSQMEQFT
::
CCDS42 --PWTF
>>CCDS42825.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 (484 aa)
initn: 2365 init1: 1079 opt: 2511 Z-score: 1606.6 bits: 306.8 E(32554): 3.6e-83
Smith-Waterman score: 2511; 77.8% identity (90.8% similar) in 478 aa overlap (1-466:1-474)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAALPGTVPRMMRPAPGQNYPRTGFPLEVSTPLGQGRVNQLGGVFINGRPLPNHIRHKIV
:..: :.:::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MTTLAGAVPRMMRPGPGQNYPRSGFPLEVSTPLGQGRVNQLGGVFINGRPLPNHIRHKIV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EMAHHGIRPCVISRQLRVSHGCVSKILCRYQETGSIRPGAIGGSKPRQVATPDVEKKIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::
CCDS42 EMAHHGIRPCVISRQLRVSHGCVSKILCRYQETGSIRPGAIGGSKPKQVTTPDVEKKIEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB7 YKRENPGMFSWEIRDRLLKDGHCDRSTVPSVSSISRVLRIKFGKKEEEDEAD---KKEDD
:::::::::::::::.::::. :::.::::::::::.:: :::: ::: ::: :. ..
CCDS42 YKRENPGMFSWEIRDKLLKDAVCDRNTVPSVSSISRILRSKFGKGEEE-EADLERKEAEE
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GEKKAKHSIDGILGDKGN--RLDEGSDVESEPDLPLKRKQRRSRTTFTAEQLEELEKAFE
.::::::::::::..... . :::::..:::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS42 SEKKAKHSIDGILSERASAPQSDEGSDIDSEPDLPLKRKQRRSRTTFTAEQLEELERAFE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RTHYPDIYTREELAQRTKLTEARVQVWFSNRRARWRKQAGANQLAAFNHLLPGGFPPTGM
::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :::::.:::::::.:
CCDS42 RTHYPDIYTREELAQRAKLTEARVQVWFSNRRARWRKQAGANQLMAFNHLIPGGFPPTAM
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 PTLPPYQLPDSTYPTTTISQ---DGGSTVHRPQPLPPSTMHQGGLAAAAAAADTSSAY--
:::: ::: ...: :.: : : .:::::::::::::.::. . . :.::::
CCDS42 PTLPTYQLSETSYQPTSIPQAVSDPSSTVHRPQPLPPSTVHQSTIPSNP---DSSSAYCL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB7 -GARHSFSSYSDSFMNPAAPSNHMNP-VSNGLSPQVMSILGNPSAVPPQPQADFSISPLH
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CCDS42 HYLKPDIA
480
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pF1KB7 -GARHSFSSYSDSFMNPAAPSNHMNP-VSNGLSPQVMSILGNPSAVPPQPQADFSISPLH
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CCDS24 PSTRHGFSSYTDSFVPPSGPSNPMNPTIGNGLSPQVMGLLTNHGGVPHQPQTDYALSPLT
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pF1KB7 GGLDSATSISASCSQRADSIKPGDSLPTSQAYCPPTYSTTGYSVDPVAGYQYGQYGQSEC
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CCDS24 GGLEPTTTVSASCSQRLDHMKSLDSLPTSQSYCPPTYSTTGYSMDPVTGYQYGQYGQSAF
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CCDS24 HYLKPDIAWFQILLNTFDKSSGEEEDLEQ
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pF1KB7 -GARHSFSSYSDSFMNPAAPSNHMNP-VSNGLSPQVMSILGNPSAVPPQPQADFSISPLH
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CCDS46 PSTRHGFSSYTDSFVPPSGPSNPMNPTIGNGLSPQVMGLLTNHGGVPHQPQTDYALSPLT
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 GGLDSATSISASCSQRADSIKPGDSLPTSQAYCPPTYSTTGYSVDPVAGYQYGQYGQSEC
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CCDS46 GGLEPTTTVSASCSQRLDHMKSLDSLPTSQSYCPPTYSTTGYSMDPVTGYQYGQYGQSAF
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KB7 LVPWASPVPIPSPTPRASCLFMESYKVVSGWGMSISQMEKLKSSQMEQFT
CCDS46 HYLKPDIA
480
>>CCDS2450.1 PAX3 gene_id:5077|Hs108|chr2 (403 aa)
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.::::::::::::..... . :::::..:::::::::::::::::::::::::::.:::
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pF1KB7 -GARHSFSSYSDSFMNPAAPSNHMNP-VSNGLSPQVMSILGNPSAVPPQPQADFSISPLH
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pF1KB7 RTHYPDIYTREELAQRTKLTEARVQVWFSNRRARWRKQAGANQLAAFNHLLPGGFPPTGM
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CCDS24 RTHYPDIYTREELAQRAKLTEARVQVWFSNRRARWRKQAGANQLMAFNHLIPGGFPPTAM
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pF1KB7 PTLPPYQLPDSTYPTTTISQ---DGGSTVHRPQPLPPSTMHQGGLAAAAAAADTSSAY--
:::: ::: ...: :.: : : .:::::::::::::.::. . . :.::::
CCDS24 PTLPTYQLSETSYQPTSIPQAVSDPSSTVHRPQPLPPSTVHQSTIPSNP---DSSSAYCL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KB7 -GARHSFSSYSDSFMNPAAPSNHMNP-VSNGLSPQVMSILGNPSAVPPQPQADFSISPLH
..::.::::.:::. :..::: ::: ..::::::: :...
CCDS24 PSTRHGFSSYTDSFVPPSGPSNPMNPTIGNGLSPQVPFIISSQISLGFKSF
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 GGLDSATSISASCSQRADSIKPGDSLPTSQAYCPPTYSTTGYSVDPVAGYQYGQYGQSEC
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pF1KB7 EMAHHGIRPCVISRQLRVSHGCVSKILCRYQETGSIRPGAIGGSKPRQVATPDVEKKIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::
CCDS46 EMAHHGIRPCVISRQLRVSHGCVSKILCRYQETGSIRPGAIGGSKPKQVTTPDVEKKIEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB7 YKRENPGMFSWEIRDRLLKDGHCDRSTVPSVSSISRVLRIKFGKKEEEDEAD---KKEDD
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CCDS46 YKRENPGMFSWEIRDKLLKDAVCDRNTVPSVSSISRILRSKFGKGEEE-EADLERKEAEE
130 140 150 160 170
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pF1KB7 GEKKAKHSIDGILGDKGNRLDEGSDVESEPDLPLKRKQRRSRTTFTAEQLEELEKAFERT
.::::::::::::...:.: :
CCDS46 SEKKAKHSIDGILSERGKRWRLGRRTCWVTWRASAS
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]