Result of FASTA (omim) for pFN21AB4243
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4243, 1505 aa
  1>>>pF1KB4243 1505 - 1505 aa - 1505 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.2572+/-0.000685; mu= -27.2020+/- 0.042
 mean_var=349.3077+/-67.173, 0's: 0 Z-trim(111.6): 816  B-trim: 202 in 1/56
 Lambda= 0.068623
 statistics sampled from 19340 (20237) to 19340 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.237), width:  16
 Scan time: 11.890

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_570925 (OMIM: 601576) receptor-type tyrosine-pr (1505) 10161 1022.3       0
XP_016882565 (OMIM: 601576) PREDICTED: receptor-ty (1505) 10161 1022.3       0
NP_570923 (OMIM: 601576) receptor-type tyrosine-pr (1501) 10119 1018.2       0
XP_005259666 (OMIM: 601576) PREDICTED: receptor-ty (1501) 10119 1018.2       0
XP_005259667 (OMIM: 601576) PREDICTED: receptor-ty (1497) 10072 1013.5       0
XP_006716901 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1495) 7882 796.7       0
XP_016870484 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1501) 7860 794.5       0
XP_006716898 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1502) 7848 793.4       0
NP_001035802 (OMIM: 601598) receptor-type tyrosine (1502) 7848 793.4       0
XP_006716902 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1491) 7840 792.6       0
XP_016870481 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1503) 7838 792.4       0
NP_569077 (OMIM: 601598) receptor-type tyrosine-pr (1496) 7801 788.7       0
XP_006716900 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1496) 7801 788.7       0
XP_016870483 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1501) 7799 788.5       0
XP_016870482 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1502) 7789 787.5       0
XP_006716896 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1505) 6942 703.7 2.9e-201
NP_569075 (OMIM: 601598) receptor-type tyrosine-pr (1505) 6942 703.7 2.9e-201
XP_016870479 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1506) 6932 702.7 5.8e-201
XP_016870480 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1506) 6930 702.5 6.6e-201
NP_569076 (OMIM: 601598) receptor-type tyrosine-pr (1506) 6930 702.5 6.6e-201
XP_016870478 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1507) 6920 701.5 1.3e-200
XP_016882563 (OMIM: 601576) PREDICTED: receptor-ty (1521) 6200 630.2 3.8e-179
NP_570924 (OMIM: 601576) receptor-type tyrosine-pr (1910) 6195 629.7 6.7e-179
XP_005259663 (OMIM: 601576) PREDICTED: receptor-ty (1910) 6195 629.7 6.7e-179
XP_016882559 (OMIM: 601576) PREDICTED: receptor-ty (1923) 6195 629.7 6.8e-179
XP_016882560 (OMIM: 601576) PREDICTED: receptor-ty (1919) 6185 628.7 1.3e-178
XP_005259664 (OMIM: 601576) PREDICTED: receptor-ty (1906) 6181 628.3 1.8e-178
XP_016882561 (OMIM: 601576) PREDICTED: receptor-ty (1910) 6181 628.3 1.8e-178
XP_011526459 (OMIM: 601576) PREDICTED: receptor-ty (1517) 6158 626.0 6.8e-178
XP_016882564 (OMIM: 601576) PREDICTED: receptor-ty (1517) 6153 625.5 9.6e-178
XP_016870468 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1916) 5227 533.9 4.8e-150
XP_006716890 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1893) 5217 532.9 9.3e-150
XP_006716888 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1912) 5189 530.1 6.4e-149
XP_006716886 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1913) 5177 528.9 1.5e-148
NP_002830 (OMIM: 601598) receptor-type tyrosine-pr (1912) 5171 528.3 2.2e-148
XP_011516294 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1912) 5171 528.3 2.2e-148
XP_016870470 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1890) 5162 527.4 4.1e-148
XP_016870469 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1903) 5162 527.4 4.1e-148
XP_016870467 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1917) 5111 522.4 1.4e-146
XP_016870465 (OMIM: 601598) PREDICTED: receptor-ty (1918) 5098 521.1 3.3e-146
NP_001316069 (OMIM: 179590,616001) receptor-type t (1603) 4833 494.9 2.2e-138
XP_005271139 (OMIM: 179590,616001) PREDICTED: rece (1796) 4779 489.5  1e-136
XP_016857433 (OMIM: 179590,616001) PREDICTED: rece (1800) 4779 489.5  1e-136
NP_569707 (OMIM: 179590,616001) receptor-type tyro (1898) 4767 488.3 2.4e-136
XP_006710861 (OMIM: 179590,616001) PREDICTED: rece (1902) 4767 488.3 2.4e-136
NP_002831 (OMIM: 179590,616001) receptor-type tyro (1907) 4764 488.0  3e-136
XP_006710860 (OMIM: 179590,616001) PREDICTED: rece (1911) 4764 488.0  3e-136
NP_001316068 (OMIM: 179590,616001) receptor-type t (1623) 4391 451.1 3.3e-125
XP_016857438 (OMIM: 179590,616001) PREDICTED: rece (1623) 4391 451.1 3.3e-125
XP_016857435 (OMIM: 179590,616001) PREDICTED: rece (1627) 4391 451.1 3.3e-125


>>NP_570925 (OMIM: 601576) receptor-type tyrosine-protei  (1505 aa)
 initn: 10161 init1: 10161 opt: 10161  Z-score: 5456.6  bits: 1022.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10161; 99.9% identity (99.9% similar) in 1505 aa overlap (1-1505:1-1505)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 NGRIKQLRSGALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREVRRVAPRFSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 NGRIKQLRSGALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREVRRVAPRFSI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 LPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLELTDVKDSANY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 LPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLELTDVKDSANY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 TCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPVSYYVIEYKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 TCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPVSYYVIEYKS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 KSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTRTGEQAPASA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 KSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTRTGEQAPASA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 PRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNVDDSLLTTVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 PRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNVDDSLLTTVG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 SLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEARSETSITLSWSPPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 SLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEARSETSITLSWSPPR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 QESIIKYELLFREGDHGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAARSPQGLGAFTPVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 QESIIKYELLFREGDHGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAARSPQGLGAFTPVV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 RQRTLQSISPKNFKVKMIMKTSVLLSWEFPDNYNSPTPYKIQYNGLTLDVDGRTTKKLIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 RQRTLQSISPKNFKVKMIMKTSVLLSWEFPDNYNSPTPYKIQYNGLTLDVDGRTTKKLIT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 HLKPHTFYNFVLTNRGSSLGGLQQTVTAWTAFNLLNGKPSVAPKPDADGFIMVYLPDGQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 HLKPHTFYNFVLTNRGSSLGGLQQTVTAWTAFNLLNGKPSVAPKPDADGFIMVYLPDGQS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 PVPVQSYFIVMVPLRKSRGGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSLRHSRQLEVPRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 PVPVQSYFIVMVPLRKSRGGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSLRHSRQLEVPRP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 YIAARFSVLPPTFHPGDQKQYGGFDNRGLEPGHRYVLFVLAVLQKSEPTFAASPFSDPFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 YIAARFSVLPPTFHPGDQKQYGGFDNRGLEPGHRYVLFVLAVLQKSEPTFAASPFSDPFQ
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 LDNPDPQPIVDGEEGLIWVIGPVLAVVFIICIVIAILLYKNKPDSKRKDSEPRTKCLLNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 LDNPDPQPIVDGEEGLIWVIGPVLAVVFIICIVIAILLYKNKPDSKRKDSEPRTKCLLNN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB4 ADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDSLKLSQEYESIDPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 ADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDSLKLSQEYESIDPG
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB4 QQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVILQPIEGIMGSDYINANYVDGYRRQNAYIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
NP_570 QQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVILQPIEGIMGSDYINANYVDGYRCQNAYIA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB4 TQGPLPETFGDFWRMVWEQRSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTETYGFIQVTLLDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 TQGPLPETFGDFWRMVWEQRSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTETYGFIQVTLLDT
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB4 IELATFCVRTFSLHKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRVKTCNPPDAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 IELATFCVRTFSLHKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRVKTCNPPDAG
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB4 PIVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQTEDQYSFIHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 PIVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQTEDQYSFIHE
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB4 ALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSRFISANLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 ALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSRFISANLP
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             1270      1280      1290      1300      1310      1320
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 CNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETTED
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 FWRMLWENNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 KVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCSAG
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pF1KB4 VGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQAALEYLGSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 VGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQAALEYLGSF
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pF1KB4 DHYAT
       :::::
NP_570 DHYAT
            

>>XP_016882565 (OMIM: 601576) PREDICTED: receptor-type t  (1505 aa)
 initn: 10161 init1: 10161 opt: 10161  Z-score: 5456.6  bits: 1022.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10161; 99.9% identity (99.9% similar) in 1505 aa overlap (1-1505:1-1505)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
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               70        80        90       100       110       120
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NGRIKQLRSGALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREVRRVAPRFSI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLELTDVKDSANY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPVSYYVIEYKS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTRTGEQAPASA
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pF1KB4 PRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNVDDSLLTTVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNVDDSLLTTVG
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pF1KB4 SLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEARSETSITLSWSPPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEARSETSITLSWSPPR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QESIIKYELLFREGDHGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAARSPQGLGAFTPVV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RQRTLQSISPKNFKVKMIMKTSVLLSWEFPDNYNSPTPYKIQYNGLTLDVDGRTTKKLIT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HLKPHTFYNFVLTNRGSSLGGLQQTVTAWTAFNLLNGKPSVAPKPDADGFIMVYLPDGQS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PVPVQSYFIVMVPLRKSRGGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSLRHSRQLEVPRP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YIAARFSVLPPTFHPGDQKQYGGFDNRGLEPGHRYVLFVLAVLQKSEPTFAASPFSDPFQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LDNPDPQPIVDGEEGLIWVIGPVLAVVFIICIVIAILLYKNKPDSKRKDSEPRTKCLLNN
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pF1KB4 ADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDSLKLSQEYESIDPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDSLKLSQEYESIDPG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
XP_016 QQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVILQPIEGIMGSDYINANYVDGYRCQNAYIA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TQGPLPETFGDFWRMVWEQRSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTETYGFIQVTLLDT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IELATFCVRTFSLHKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRVKTCNPPDAG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PIVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQTEDQYSFIHE
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pF1KB4 ALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSRFISANLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSRFISANLP
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pF1KB4 CNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETTED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETTED
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pF1KB4 FWRMLWENNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FWRMLWENNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREF
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pF1KB4 KVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCSAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCSAG
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pF1KB4 VGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQAALEYLGSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQAALEYLGSF
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

            
pF1KB4 DHYAT
       :::::
XP_016 DHYAT
            

>>NP_570923 (OMIM: 601576) receptor-type tyrosine-protei  (1501 aa)
 initn: 8617 init1: 8617 opt: 10119  Z-score: 5434.2  bits: 1018.2 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10119; 99.7% identity (99.7% similar) in 1505 aa overlap (1-1505:1-1501)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB4 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_570 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
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pF1KB4 NGRIKQLRSGALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREVRRVAPRFSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::    ::::::::::
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Smith-Waterman score: 10072; 99.4% identity (99.4% similar) in 1505 aa overlap (1-1505:1-1497)

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       :...  :.  . ..:::::..:::: :.::. : :::.::.::::: :.:.:.::::.::
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       ::.:::::::.::..:::.:: :::: :.::::::::.: . :.::.:::: :: .::.:
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       .:. ..::.:.::::::.::::::. ::: :: ::::::.:..:: .::::: :::.:::
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XP_006 SFDHYAT
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pF1KB4 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
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XP_006 AALEYLGSFDHYAT
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       .:...::::::::..::::.::::...:.::::::::::::: .:::::.:.::::.: .
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        .::.:.:. ..::.:.::::::.::::::. ::: :: ::::::.:..:: .::::: :
NP_001 QITTIGNLVPQKTYSVKVLAFTSIGDGPLSSDIQVITQTGVPGQPLNFKAEPESETSILL
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NP_001 ASTAEISARTMQSMFAKNFHVKAVMKTSVLLSWEIPENYNSAMPFKILYDDGKMVEEVDG
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       :.:.:::..:::.  :.:::::::.: ::::. ::: :: ..:  ::.   : . ::.: 
NP_001 RATQKLIVNLKPEKSYSFVLTNRGNSAGGLQHRVTAKTAPDVLRTKPAFIGKTNLDGMIT
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NP_001 VQLPEVPANENIKGYYIIIVPLKKSRG-KFIKPWESPDEMELDELLKEISR-KRRSIRYG
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NP_001 REVEL-KPYIAAHFDVLPTEFTLGDDKHYGGFTNKQLQSGQEYVFFVLAVMEHAESKMYA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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