Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB4243
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4243, 1505 aa
1>>>pF1KB4243 1505 - 1505 aa - 1505 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5919+/-0.00166; mu= 12.1532+/- 0.098
mean_var=231.8868+/-46.788, 0's: 0 Z-trim(104.2): 246 B-trim: 2 in 1/49
Lambda= 0.084224
statistics sampled from 7530 (7799) to 7530 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 3.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1505) 10161 1250.4 0
CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1501) 10119 1245.3 0
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502) 7848 969.4 0
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496) 7801 963.7 0
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 6942 859.3 0
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1506) 6930 857.8 0
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 6195 768.7 0
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1912) 5171 644.2 1.1e-183
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 4767 595.1 6.5e-169
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 4764 594.8 8.4e-169
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 4055 508.5 6.2e-143
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1948) 3972 498.5 8e-140
CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 793) 2016 260.4 1.6e-68
CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 802) 2014 260.2 1.9e-68
CCDS7657.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 700) 1906 247.0 1.5e-64
CCDS7658.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 642) 1886 244.5 7.9e-64
CCDS58613.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1465) 1836 238.9 9e-62
CCDS11840.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1452) 1732 226.2 5.7e-58
CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1439) 1696 221.8 1.2e-56
CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1440) 1696 221.8 1.2e-56
CCDS47473.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1446) 1674 219.2 7.5e-56
CCDS78179.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1462) 1674 219.2 7.6e-56
CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1441) 1645 215.6 8.6e-55
CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1460) 1645 215.6 8.7e-55
CCDS335.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1436) 1557 204.9 1.4e-51
CCDS334.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1446) 1557 204.9 1.4e-51
CCDS44098.2 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1440) 1548 203.9 3e-51
CCDS53290.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1433) 1525 201.1 2.1e-50
CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (1448) 1311 175.1 1.4e-42
CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (2315) 1311 175.3 1.9e-42
CCDS2895.1 PTPRG gene_id:5793|Hs108|chr3 (1445) 1016 139.2 8.8e-32
CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1145) 933 129.0 8.2e-29
CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1306) 933 129.1 8.9e-29
CCDS55846.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 891 124.2 3.9e-27
CCDS44944.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1997) 886 123.6 6.1e-27
CCDS44943.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2215) 886 123.6 6.6e-27
CCDS73501.1 PTPRQ gene_id:374462|Hs108|chr12 (2299) 834 117.3 5.4e-25
CCDS54321.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 ( 937) 819 115.0 1.1e-24
CCDS33110.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 (1115) 811 114.2 2.3e-24
CCDS53754.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 377) 761 107.5 7.9e-23
CCDS44837.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 405) 757 107.1 1.2e-22
CCDS8674.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1188) 763 108.4 1.4e-22
CCDS8675.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1216) 757 107.7 2.3e-22
CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11 (1337) 710 102.0 1.3e-20
CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18 (1447) 666 96.7 5.6e-19
CCDS1422.1 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1 ( 399) 654 94.6 6.7e-19
CCDS55845.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 665 96.7 7.2e-19
CCDS81713.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2127) 665 96.8 7.8e-19
CCDS5949.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 ( 986) 659 95.6 7.9e-19
CCDS5947.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 (1015) 659 95.6 8e-19
>>CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1505 aa)
initn: 10161 init1: 10161 opt: 10161 Z-score: 6689.3 bits: 1250.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10161; 99.9% identity (99.9% similar) in 1505 aa overlap (1-1505:1-1505)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 NGRIKQLRSGALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREVRRVAPRFSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NGRIKQLRSGALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREVRRVAPRFSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLELTDVKDSANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLELTDVKDSANY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPVSYYVIEYKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPVSYYVIEYKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTRTGEQAPASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTRTGEQAPASA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 PRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNVDDSLLTTVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNVDDSLLTTVG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 SLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEARSETSITLSWSPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEARSETSITLSWSPPR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 QESIIKYELLFREGDHGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAARSPQGLGAFTPVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QESIIKYELLFREGDHGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAARSPQGLGAFTPVV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 RQRTLQSISPKNFKVKMIMKTSVLLSWEFPDNYNSPTPYKIQYNGLTLDVDGRTTKKLIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RQRTLQSISPKNFKVKMIMKTSVLLSWEFPDNYNSPTPYKIQYNGLTLDVDGRTTKKLIT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 HLKPHTFYNFVLTNRGSSLGGLQQTVTAWTAFNLLNGKPSVAPKPDADGFIMVYLPDGQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HLKPHTFYNFVLTNRGSSLGGLQQTVTAWTAFNLLNGKPSVAPKPDADGFIMVYLPDGQS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 PVPVQSYFIVMVPLRKSRGGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSLRHSRQLEVPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PVPVQSYFIVMVPLRKSRGGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSLRHSRQLEVPRP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 YIAARFSVLPPTFHPGDQKQYGGFDNRGLEPGHRYVLFVLAVLQKSEPTFAASPFSDPFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YIAARFSVLPPTFHPGDQKQYGGFDNRGLEPGHRYVLFVLAVLQKSEPTFAASPFSDPFQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 LDNPDPQPIVDGEEGLIWVIGPVLAVVFIICIVIAILLYKNKPDSKRKDSEPRTKCLLNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LDNPDPQPIVDGEEGLIWVIGPVLAVVFIICIVIAILLYKNKPDSKRKDSEPRTKCLLNN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 ADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDSLKLSQEYESIDPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDSLKLSQEYESIDPG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 QQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVILQPIEGIMGSDYINANYVDGYRRQNAYIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS74 QQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVILQPIEGIMGSDYINANYVDGYRCQNAYIA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 TQGPLPETFGDFWRMVWEQRSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTETYGFIQVTLLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TQGPLPETFGDFWRMVWEQRSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTETYGFIQVTLLDT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 IELATFCVRTFSLHKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRVKTCNPPDAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 IELATFCVRTFSLHKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRVKTCNPPDAG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 PIVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQTEDQYSFIHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PIVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQTEDQYSFIHE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB4 ALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSRFISANLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSRFISANLP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB4 CNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETTED
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB4 FWRMLWENNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FWRMLWENNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREF
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB4 KVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCSAG
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB4 VGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQAALEYLGSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQAALEYLGSF
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB4 DHYAT
:::::
CCDS74 DHYAT
>>CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1501 aa)
initn: 8617 init1: 8617 opt: 10119 Z-score: 6661.8 bits: 1245.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10119; 99.7% identity (99.7% similar) in 1505 aa overlap (1-1505:1-1501)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 NGRIKQLRSGALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREVRRVAPRFSI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS12 NGRIKQLRSGALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVR----VRRVAPRFSI
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLELTDVKDSANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLELTDVKDSANY
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPVSYYVIEYKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPVSYYVIEYKS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTRTGEQAPASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTRTGEQAPASA
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 PRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNVDDSLLTTVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNVDDSLLTTVG
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 SLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEARSETSITLSWSPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEARSETSITLSWSPPR
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 QESIIKYELLFREGDHGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAARSPQGLGAFTPVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QESIIKYELLFREGDHGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAARSPQGLGAFTPVV
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 RQRTLQSISPKNFKVKMIMKTSVLLSWEFPDNYNSPTPYKIQYNGLTLDVDGRTTKKLIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RQRTLQSISPKNFKVKMIMKTSVLLSWEFPDNYNSPTPYKIQYNGLTLDVDGRTTKKLIT
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 HLKPHTFYNFVLTNRGSSLGGLQQTVTAWTAFNLLNGKPSVAPKPDADGFIMVYLPDGQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HLKPHTFYNFVLTNRGSSLGGLQQTVTAWTAFNLLNGKPSVAPKPDADGFIMVYLPDGQS
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 PVPVQSYFIVMVPLRKSRGGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSLRHSRQLEVPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PVPVQSYFIVMVPLRKSRGGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSLRHSRQLEVPRP
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 YIAARFSVLPPTFHPGDQKQYGGFDNRGLEPGHRYVLFVLAVLQKSEPTFAASPFSDPFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YIAARFSVLPPTFHPGDQKQYGGFDNRGLEPGHRYVLFVLAVLQKSEPTFAASPFSDPFQ
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 LDNPDPQPIVDGEEGLIWVIGPVLAVVFIICIVIAILLYKNKPDSKRKDSEPRTKCLLNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LDNPDPQPIVDGEEGLIWVIGPVLAVVFIICIVIAILLYKNKPDSKRKDSEPRTKCLLNN
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 ADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDSLKLSQEYESIDPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDSLKLSQEYESIDPG
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 QQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVILQPIEGIMGSDYINANYVDGYRRQNAYIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS12 QQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVILQPIEGIMGSDYINANYVDGYRCQNAYIA
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 TQGPLPETFGDFWRMVWEQRSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTETYGFIQVTLLDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TQGPLPETFGDFWRMVWEQRSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTETYGFIQVTLLDT
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 IELATFCVRTFSLHKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRVKTCNPPDAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IELATFCVRTFSLHKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRVKTCNPPDAG
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 PIVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQTEDQYSFIHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PIVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQTEDQYSFIHE
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB4 ALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSRFISANLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSRFISANLP
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB4 CNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETTED
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB4 FWRMLWENNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FWRMLWENNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREF
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB4 KVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCSAG
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB4 VGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQAALEYLGSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQAALEYLGSF
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KB4 DHYAT
:::::
CCDS12 DHYAT
1500
>>CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502 aa)
initn: 6244 init1: 6244 opt: 7848 Z-score: 5170.4 bits: 969.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7848; 76.2% identity (90.8% similar) in 1506 aa overlap (9-1505:1-1502)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
:: :. . ::..... :: :::: . : :: :::::::::.:::::::
CCDS55 MVHVARLLLLLLTFFLR-TDAETPPRFTRTPVDQTGVSGGVASFICQATGDP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
.:...::::::::..::::.::::...:.::::::::::::: .:::::.:.::::.: .
CCDS55 RPKIVWNKKGKKVSNQRFEVIEFDDGSGSVLRIQPLRTPRDEAIYECVASNNVGEISVST
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
.::::::::.: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : .
CCDS55 RLTVLREDQIPRGFPTIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDTSNN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB4 NGRIKQLRSG------ALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREVRRV
:::::::::: :::::.:::.::::::::::::::.:::.:::::::::::::::
CCDS55 NGRIKQLRSGGTPIRGALQIEQSEESDQGKYECVATNSAGTRYSAPANLYVRELREVRRV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 APRFSILPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLELTDV
::::: : .:::::::.:::::::::::::::::: ::::::::::::.:::::::.::
CCDS55 PPRFSIPPTNHEIMPGGSVNITCVAVGSPMPYVKWMLGAEDLTPEDDMPIGRNVLELNDV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 KDSANYTCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPVSYY
..::::::::::.::::::.::::::.::: ::::.:::.::::::.:::::::.:::::
CCDS55 RQSANYTCVAMSTLGVIEAIAQITVKALPKPPGTPVVTESTATSITLTWDSGNPEPVSYY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 VIEYKSKSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTRTGE
.:..: :... :. . ..:::::..:::: :.::. : :::.::.::::: :.:.:.:
CCDS55 IIQHKPKNSEELYKEIDGVATTRYSVAGLSPYSDYEFRVVAVNNIGRGPPSEPVLTQTSE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 QAPASAPRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNVDDS
:::.::::.:::::::.::..:::.:: :::: :.::::::::.: . :.::.:::: ::
CCDS55 QAPSSAPRDVQARMLSSTTILVQWKEPEEPNGQIQGYRVYYTMDPTQHVNNWMKHNVADS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 LLTTVGSLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEARSETSITL
.::.:.:. ..::.:.::::::.::::::. ::: :: ::::::.:..:: .::::: :
CCDS55 QITTIGNLVPQKTYSVKVLAFTSIGDGPLSSDIQVITQTGVPGQPLNFKAEPESETSILL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 SWSPPRQESIIKYELLFREGDHGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAARSPQGLG
::.:::...: .:::....:.::.: :..: ::: .. ::::. : ::::::::::::
CCDS55 SWTPPRSDTIANYELVYKDGEHGEEQRITIEPGTSYRLQGLKPNSLYYFRLAARSPQGLG
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 AFTPVVRQRTLQSISPKNFKVKMIMKTSVLLSWEFPDNYNSPTPYKIQYNG--LTLDVDG
: : . ::.::. :::.:: .::::::::::.:.:::: :.:: :. .. .:::
CCDS55 ASTAEISARTMQSMFAKNFHVKAVMKTSVLLSWEIPENYNSAMPFKILYDDGKMVEEVDG
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 RTTKKLITHLKPHTFYNFVLTNRGSSLGGLQQTVTAWTAFNLLNGKPSVAPKPDADGFIM
:.:.:::..:::. :.:::::::.: ::::. ::: :: ..: ::. : . ::.:
CCDS55 RATQKLIVNLKPEKSYSFVLTNRGNSAGGLQHRVTAKTAPDVLRTKPAFIGKTNLDGMIT
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 VYLPDGQSPVPVQSYFIVMVPLRKSRGGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSLRHS
: ::. . ...:.:..:::.:::: .:. : ::..:.:.::...::: .:::.:..
CCDS55 VQLPEVPANENIKGYYIIIVPLKKSRG-KFIKPWESPDEMELDELLKEISR-KRRSIRYG
720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 RQLEVPRPYIAARFSVLPPTFHPGDQKQYGGFDNRGLEPGHRYVLFVLAVLQKSEPT-FA
:..:. .:::::.:.::: : ::.:.:::: :. :. :..::.:::::....: .:
CCDS55 REVEL-KPYIAAHFDVLPTEFTLGDDKHYGGFTNKQLQSGQEYVFFVLAVMEHAESKMYA
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 ASPFSDPFQLDNPDPQPIVDGEEGLIWVIGPVLAVVFIICIVIAILLYKNKPDSKRKDSE
.::.::: . :::::.: :::::::.::::::::::::::::::::.::: :: .:.
CCDS55 TSPYSDPVVSMDLDPQPITDEEEGLIWVVGPVLAVVFIICIVIAILLYKSKPDRKRAESD
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KB4 PRTKCLLNNADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDSLKLS
: . . :: .. ::: ::::.::.::::::: ::::::: ..:.: :::::::.::.:
CCDS55 SRKSSIPNNKEIPSHHPTDPVELRRLNFQTPGMASHPPIPILELADHIERLKANDNLKFS
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB4 QEYESIDPGQQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVILQPIEGIMGSDYINANYVDG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:. :::: ::::.::::.::
CCDS55 QEYESIDPGQQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVLLSAIEGIPGSDYVNANYIDG
950 960 970 980 990 1000
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB4 YRRQNAYIATQGPLPETFGDFWRMVWEQRSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTETYG
::.::::::::: :::::::::::.:::::::.::::.:::.::.:::::::.:::::.:
CCDS55 YRKQNAYIATQGSLPETFGDFWRMIWEQRSATVVMMTKLEERSRVKCDQYWPSRGTETHG
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB4 FIQVTLLDTIELATFCVRTFSLHKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRV
..:::::::.::::.:::::.:.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS55 LVQVTLLDTVELATYCVRTFALYKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEHPTPFLAFLRRV
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB4 KTCNPPDAGPIVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQT
::::::::::.::::::::::::::::::::::::: :::::.::::::::.::::::::
CCDS55 KTCNPPDAGPMVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKHEKTVDIYGHVTLMRAQRNYMVQT
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB4 EDQYSFIHEALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHT
:::: :::.:::::: :::::::::.::::::::.:.: ::.::::::::::::.:::::
CCDS55 EDQYIFIHDALLEAVTCGNTEVPARNLYAYIQKLTQIETGENVTGMELEFKRLASSKAHT
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KB4 SRFISANLPCNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SRFISANLPCNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQ
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KB4 GPLAETTEDFWRMLWENNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYN
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GPLAETTEDFWRMLWEHNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYN
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KB4 MPQYILREFKVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MPQYILREFKVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDG
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KB4 PISVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: :.
CCDS55 PISVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDQYQFSYR
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1500
pF1KB4 AALEYLGSFDHYAT
::::::::::::::
CCDS55 AALEYLGSFDHYAT
1490 1500
>>CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496 aa)
initn: 4222 init1: 4222 opt: 7801 Z-score: 5139.6 bits: 963.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7801; 76.1% identity (90.7% similar) in 1504 aa overlap (9-1505:1-1496)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
:: :. . ::..... :: :::: . : :: :::::::::.:::::::
CCDS75 MVHVARLLLLLLTFFLR-TDAETPPRFTRTPVDQTGVSGGVASFICQATGDP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
.:...::::::::..::::.::::...:.::::::::::::: .:::::.:.::::.: .
CCDS75 RPKIVWNKKGKKVSNQRFEVIEFDDGSGSVLRIQPLRTPRDEAIYECVASNNVGEISVST
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
.::::::::.: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : .
CCDS75 RLTVLREDQIPRGFPTIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDTSNN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB4 NGRIKQLRS---GALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREVRRVAPR
::::::::: ::::::.:::.::::::::::::::.:::.::::::::::::::: ::
CCDS75 NGRIKQLRSESIGALQIEQSEESDQGKYECVATNSAGTRYSAPANLYVRELREVRRVPPR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 FSILPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLELTDVKDS
::: : .:::::::.:::::::::::::::::: ::::::::::::.:::::::.::..:
CCDS75 FSIPPTNHEIMPGGSVNITCVAVGSPMPYVKWMLGAEDLTPEDDMPIGRNVLELNDVRQS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 ANYTCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPVSYYVIE
:::::::::.::::::.::::::.::: ::::.:::.::::::.:::::::.:::::.:.
CCDS75 ANYTCVAMSTLGVIEAIAQITVKALPKPPGTPVVTESTATSITLTWDSGNPEPVSYYIIQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 YKSKSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTRTGEQAP
.: :... :. . ..:::::..:::: :.::. : :::.::.::::: :.:.:.::::
CCDS75 HKPKNSEELYKEIDGVATTRYSVAGLSPYSDYEFRVVAVNNIGRGPPSEPVLTQTSEQAP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 ASAPRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNVDDSLLT
.::::.:::::::.::..:::.:: :::: :.::::::::.: . :.::.:::: :: .:
CCDS75 SSAPRDVQARMLSSTTILVQWKEPEEPNGQIQGYRVYYTMDPTQHVNNWMKHNVADSQIT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 TVGSLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEARSETSITLSWS
:.:.:. ..::.:.::::::.::::::. ::: :: ::::::.:..:: .::::: :::.
CCDS75 TIGNLVPQKTYSVKVLAFTSIGDGPLSSDIQVITQTGVPGQPLNFKAEPESETSILLSWT
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 PPRQESIIKYELLFREGDHGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAARSPQGLGAFT
:::...: .:::....:.::.: :..: ::: .. ::::. : ::::::::::::: :
CCDS75 PPRSDTIANYELVYKDGEHGEEQRITIEPGTSYRLQGLKPNSLYYFRLAARSPQGLGAST
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 PVVRQRTLQS-ISPKNFKVKMIMKTSVLLSWEFPDNYNSPTPYKIQYNG--LTLDVDGRT
. ::.:: . :::.:: .::::::::::.:.:::: :.:: :. .. .::::.
CCDS75 AEISARTMQSTVFAKNFHVKAVMKTSVLLSWEIPENYNSAMPFKILYDDGKMVEEVDGRA
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 TKKLITHLKPHTFYNFVLTNRGSSLGGLQQTVTAWTAFNLLNGKPSVAPKPDADGFIMVY
:.:::..:::. :.:::::::.: ::::. ::: :: ..: ::. : . ::.: :
CCDS75 TQKLIVNLKPEKSYSFVLTNRGNSAGGLQHRVTAKTAPDVLRTKPAFIGKTNLDGMITVQ
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 LPDGQSPVPVQSYFIVMVPLRKSRGGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSLRHSRQ
::. . ...:.:..:::.:::: .:. : ::..:.:.::...::: .:::.:..:.
CCDS75 LPEVPANENIKGYYIIIVPLKKSRG-KFIKPWESPDEMELDELLKEISR-KRRSIRYGRE
720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 LEVPRPYIAARFSVLPPTFHPGDQKQYGGFDNRGLEPGHRYVLFVLAVLQKSEPT-FAAS
.:. .:::::.:.::: : ::.:.:::: :. :. :..::.:::::....: .:.:
CCDS75 VEL-KPYIAAHFDVLPTEFTLGDDKHYGGFTNKQLQSGQEYVFFVLAVMEHAESKMYATS
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 PFSDPFQLDNPDPQPIVDGEEGLIWVIGPVLAVVFIICIVIAILLYKNKPDSKRKDSEPR
:.::: . :::::.: :::::::.:::::::::::::::::::: :: .:. :
CCDS75 PYSDPVVSMDLDPQPITDEEEGLIWVVGPVLAVVFIICIVIAILLYK----RKRAESDSR
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KB4 TKCLLNNADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDSLKLSQE
. . :: .. ::: ::::.::.::::::: ::::::: ..:.: :::::::.::.:::
CCDS75 KSSIPNNKEIPSHHPTDPVELRRLNFQTPGMASHPPIPILELADHIERLKANDNLKFSQE
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB4 YESIDPGQQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVILQPIEGIMGSDYINANYVDGYR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:. :::: ::::.::::.::::
CCDS75 YESIDPGQQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVLLSAIEGIPGSDYVNANYIDGYR
950 960 970 980 990 1000
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB4 RQNAYIATQGPLPETFGDFWRMVWEQRSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTETYGFI
.::::::::: :::::::::::.:::::::.::::.:::.::.:::::::.:::::.:..
CCDS75 KQNAYIATQGSLPETFGDFWRMIWEQRSATVVMMTKLEERSRVKCDQYWPSRGTETHGLV
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB4 QVTLLDTIELATFCVRTFSLHKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRVKT
:::::::.::::.:::::.:.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS75 QVTLLDTVELATYCVRTFALYKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEHPTPFLAFLRRVKT
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB4 CNPPDAGPIVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQTED
::::::::.::::::::::::::::::::::::: :::::.::::::::.::::::::::
CCDS75 CNPPDAGPMVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKHEKTVDIYGHVTLMRAQRNYMVQTED
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB4 QYSFIHEALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSR
:: :::.:::::: :::::::::.::::::::.:.: ::.::::::::::::.:::::::
CCDS75 QYIFIHDALLEAVTCGNTEVPARNLYAYIQKLTQIETGENVTGMELEFKRLASSKAHTSR
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KB4 FISANLPCNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FISANLPCNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGP
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KB4 LAETTEDFWRMLWENNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMP
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LAETTEDFWRMLWEHNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMP
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KB4 QYILREFKVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QYILREFKVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPI
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KB4 SVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQAA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: :.::
CCDS75 SVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDQYQFSYRAA
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1500
pF1KB4 LEYLGSFDHYAT
::::::::::::
CCDS75 LEYLGSFDHYAT
1490
>>CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505 aa)
initn: 7156 init1: 6244 opt: 6942 Z-score: 4575.4 bits: 859.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7842; 76.0% identity (90.7% similar) in 1509 aa overlap (9-1505:1-1505)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
:: :. . ::..... :: :::: . : :: :::::::::.:::::::
CCDS64 MVHVARLLLLLLTFFLR-TDAETPPRFTRTPVDQTGVSGGVASFICQATGDP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
.:...::::::::..::::.::::...:.::::::::::::: .:::::.:.::::.: .
CCDS64 RPKIVWNKKGKKVSNQRFEVIEFDDGSGSVLRIQPLRTPRDEAIYECVASNNVGEISVST
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
.::::::::.: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : .
CCDS64 RLTVLREDQIPRGFPTIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDTSNN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB4 NGRIKQLRS---------GALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREV
::::::::: ::::::.:::.::::::::::::::.:::.::::::::::::
CCDS64 NGRIKQLRSESIGGTPIRGALQIEQSEESDQGKYECVATNSAGTRYSAPANLYVRELREV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 RRVAPRFSILPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLEL
::: ::::: : .:::::::.:::::::::::::::::: ::::::::::::.:::::::
CCDS64 RRVPPRFSIPPTNHEIMPGGSVNITCVAVGSPMPYVKWMLGAEDLTPEDDMPIGRNVLEL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 TDVKDSANYTCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPV
.::..::::::::::.::::::.::::::.::: ::::.:::.::::::.:::::::.::
CCDS64 NDVRQSANYTCVAMSTLGVIEAIAQITVKALPKPPGTPVVTESTATSITLTWDSGNPEPV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 SYYVIEYKSKSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTR
:::.:..: :... :. . ..:::::..:::: :.::. : :::.::.::::: :.:.
CCDS64 SYYIIQHKPKNSEELYKEIDGVATTRYSVAGLSPYSDYEFRVVAVNNIGRGPPSEPVLTQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 TGEQAPASAPRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNV
:.::::.::::.:::::::.::..:::.:: :::: :.::::::::.: . :.::.::::
CCDS64 TSEQAPSSAPRDVQARMLSSTTILVQWKEPEEPNGQIQGYRVYYTMDPTQHVNNWMKHNV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 DDSLLTTVGSLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEARSETS
:: .::.:.:. ..::.:.::::::.::::::. ::: :: ::::::.:..:: .::::
CCDS64 ADSQITTIGNLVPQKTYSVKVLAFTSIGDGPLSSDIQVITQTGVPGQPLNFKAEPESETS
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 ITLSWSPPRQESIIKYELLFREGDHGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAARSPQ
: :::.:::...: .:::....:.::.: :..: ::: .. ::::. : :::::::::
CCDS64 ILLSWTPPRSDTIANYELVYKDGEHGEEQRITIEPGTSYRLQGLKPNSLYYFRLAARSPQ
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640
pF1KB4 GLGAFTPVVRQRTLQSISPKNFKVKMIMKTSVLLSWEFPDNYNSPTPYKIQYNG--LTLD
:::: : . ::.::. :::.:: .::::::::::.:.:::: :.:: :. .. .
CCDS64 GLGASTAEISARTMQSMFAKNFHVKAVMKTSVLLSWEIPENYNSAMPFKILYDDGKMVEE
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 VDGRTTKKLITHLKPHTFYNFVLTNRGSSLGGLQQTVTAWTAFNLLNGKPSVAPKPDADG
::::.:.:::..:::. :.:::::::.: ::::. ::: :: ..: ::. : . ::
CCDS64 VDGRATQKLIVNLKPEKSYSFVLTNRGNSAGGLQHRVTAKTAPDVLRTKPAFIGKTNLDG
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 FIMVYLPDGQSPVPVQSYFIVMVPLRKSRGGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSL
.: : ::. . ...:.:..:::.:::: .:. : ::..:.:.::...::: .:::.
CCDS64 MITVQLPEVPANENIKGYYIIIVPLKKSRG-KFIKPWESPDEMELDELLKEISR-KRRSI
720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 RHSRQLEVPRPYIAARFSVLPPTFHPGDQKQYGGFDNRGLEPGHRYVLFVLAVLQKSEPT
:..:..:. .:::::.:.::: : ::.:.:::: :. :. :..::.:::::....:
CCDS64 RYGREVEL-KPYIAAHFDVLPTEFTLGDDKHYGGFTNKQLQSGQEYVFFVLAVMEHAESK
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 -FAASPFSDPFQLDNPDPQPIVDGEEGLIWVIGPVLAVVFIICIVIAILLYKNKPDSKRK
.:.::.::: . :::::.: :::::::.::::::::::::::::::::.::: ::
CCDS64 MYATSPYSDPVVSMDLDPQPITDEEEGLIWVVGPVLAVVFIICIVIAILLYKSKPDRKRA
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KB4 DSEPRTKCLLNNADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDSL
.:. : . . :: .. ::: ::::.::.::::::: ::::::: ..:.: :::::::.:
CCDS64 ESDSRKSSIPNNKEIPSHHPTDPVELRRLNFQTPGMASHPPIPILELADHIERLKANDNL
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990 1000
pF1KB4 KLSQEYESIDPGQQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVILQPIEGIMGSDYINANY
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:. :::: ::::.::::
CCDS64 KFSQEYESIDPGQQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVLLSAIEGIPGSDYVNANY
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB4 VDGYRRQNAYIATQGPLPETFGDFWRMVWEQRSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTE
.::::.::::::::: :::::::::::.:::::::.::::.:::.::.:::::::.::::
CCDS64 IDGYRKQNAYIATQGSLPETFGDFWRMIWEQRSATVVMMTKLEERSRVKCDQYWPSRGTE
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB4 TYGFIQVTLLDTIELATFCVRTFSLHKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFL
:.:..:::::::.::::.:::::.:.:::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS64 THGLVQVTLLDTVELATYCVRTFALYKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEHPTPFLAFL
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB4 RRVKTCNPPDAGPIVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYM
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::: :::::.::::::::.:::::
CCDS64 RRVKTCNPPDAGPMVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKHEKTVDIYGHVTLMRAQRNYM
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB4 VQTEDQYSFIHEALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSK
::::::: :::.:::::: :::::::::.::::::::.:.: ::.::::::::::::.::
CCDS64 VQTEDQYIFIHDALLEAVTCGNTEVPARNLYAYIQKLTQIETGENVTGMELEFKRLASSK
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KB4 AHTSRFISANLPCNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AHTSRFISANLPCNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYI
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KB4 ATQGPLAETTEDFWRMLWENNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMA
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ATQGPLAETTEDFWRMLWEHNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMA
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KB4 EYNMPQYILREFKVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EYNMPQYILREFKVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFG
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KB4 QDGPISVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS64 QDGPISVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDQYQF
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1490 1500
pF1KB4 CYQAALEYLGSFDHYAT
:.::::::::::::::
CCDS64 SYRAALEYLGSFDHYAT
1490 1500
>>CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1506 aa)
initn: 5173 init1: 3918 opt: 6930 Z-score: 4567.6 bits: 857.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7830; 76.0% identity (90.6% similar) in 1510 aa overlap (9-1505:1-1506)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
:: :. . ::..... :: :::: . : :: :::::::::.:::::::
CCDS55 MVHVARLLLLLLTFFLR-TDAETPPRFTRTPVDQTGVSGGVASFICQATGDP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
.:...::::::::..::::.::::...:.::::::::::::: .:::::.:.::::.: .
CCDS55 RPKIVWNKKGKKVSNQRFEVIEFDDGSGSVLRIQPLRTPRDEAIYECVASNNVGEISVST
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
.::::::::.: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : .
CCDS55 RLTVLREDQIPRGFPTIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDTSNN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB4 NGRIKQLRS---------GALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREV
::::::::: ::::::.:::.::::::::::::::.:::.::::::::::::
CCDS55 NGRIKQLRSESIGGTPIRGALQIEQSEESDQGKYECVATNSAGTRYSAPANLYVRELREV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 RRVAPRFSILPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLEL
::: ::::: : .:::::::.:::::::::::::::::: ::::::::::::.:::::::
CCDS55 RRVPPRFSIPPTNHEIMPGGSVNITCVAVGSPMPYVKWMLGAEDLTPEDDMPIGRNVLEL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 TDVKDSANYTCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPV
.::..::::::::::.::::::.::::::.::: ::::.:::.::::::.:::::::.::
CCDS55 NDVRQSANYTCVAMSTLGVIEAIAQITVKALPKPPGTPVVTESTATSITLTWDSGNPEPV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 SYYVIEYKSKSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTR
:::.:..: :... :. . ..:::::..:::: :.::. : :::.::.::::: :.:.
CCDS55 SYYIIQHKPKNSEELYKEIDGVATTRYSVAGLSPYSDYEFRVVAVNNIGRGPPSEPVLTQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 TGEQAPASAPRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNV
:.::::.::::.:::::::.::..:::.:: :::: :.::::::::.: . :.::.::::
CCDS55 TSEQAPSSAPRDVQARMLSSTTILVQWKEPEEPNGQIQGYRVYYTMDPTQHVNNWMKHNV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 DDSLLTTVGSLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEARSETS
:: .::.:.:. ..::.:.::::::.::::::. ::: :: ::::::.:..:: .::::
CCDS55 ADSQITTIGNLVPQKTYSVKVLAFTSIGDGPLSSDIQVITQTGVPGQPLNFKAEPESETS
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 ITLSWSPPRQESIIKYELLFREGDHGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAARSPQ
: :::.:::...: .:::....:.::.: :..: ::: .. ::::. : :::::::::
CCDS55 ILLSWTPPRSDTIANYELVYKDGEHGEEQRITIEPGTSYRLQGLKPNSLYYFRLAARSPQ
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640
pF1KB4 GLGAFTPVVRQRTLQSISPKNFKVKMIMKTSVLLSWEFPDNYNSPTPYKIQYNG--LTLD
:::: : . ::.::. :::.:: .::::::::::.:.:::: :.:: :. .. .
CCDS55 GLGASTAEISARTMQSMFAKNFHVKAVMKTSVLLSWEIPENYNSAMPFKILYDDGKMVEE
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 VDGRTTKKLITHLKPHTFYNFVLTNRGSSLGGLQQTVTAWTAFNLLNGKPSVAPKPDADG
::::.:.:::..:::. :.:::::::.: ::::. ::: :: ..: ::. : . ::
CCDS55 VDGRATQKLIVNLKPEKSYSFVLTNRGNSAGGLQHRVTAKTAPDVLRTKPAFIGKTNLDG
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 FIMVYLPDGQSPVPVQSYFIVMVPLRKSRGGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSL
.: : ::. . ...:.:..:::.:::: .:. : ::..:.:.::...::: .:::.
CCDS55 MITVQLPEVPANENIKGYYIIIVPLKKSRG-KFIKPWESPDEMELDELLKEISR-KRRSI
720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 RHSRQLEVPRPYIAARFSVLPPTFHPGDQKQYGGFDNRGLEPGHRYVLFVLAVLQKSEPT
:..:..:. .:::::.:.::: : ::.:.:::: :. :. :..::.:::::....:
CCDS55 RYGREVEL-KPYIAAHFDVLPTEFTLGDDKHYGGFTNKQLQSGQEYVFFVLAVMEHAESK
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 -FAASPFSDPFQLDNPDPQPIVDGEEGLIWVIGPVLAVVFIICIVIAILLYKN-KPDSKR
.:.::.::: . :::::.: :::::::.::::::::::::::::::::. ::: ::
CCDS55 MYATSPYSDPVVSMDLDPQPITDEEEGLIWVVGPVLAVVFIICIVIAILLYKSSKPDRKR
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KB4 KDSEPRTKCLLNNADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDS
.:. : . . :: .. ::: ::::.::.::::::: ::::::: ..:.: :::::::.
CCDS55 AESDSRKSSIPNNKEIPSHHPTDPVELRRLNFQTPGMASHPPIPILELADHIERLKANDN
890 900 910 920 930 940
950 960 970 980 990 1000
pF1KB4 LKLSQEYESIDPGQQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVILQPIEGIMGSDYINAN
::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:. :::: ::::.:::
CCDS55 LKFSQEYESIDPGQQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVLLSAIEGIPGSDYVNAN
950 960 970 980 990 1000
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB4 YVDGYRRQNAYIATQGPLPETFGDFWRMVWEQRSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGT
:.::::.::::::::: :::::::::::.:::::::.::::.:::.::.:::::::.:::
CCDS55 YIDGYRKQNAYIATQGSLPETFGDFWRMIWEQRSATVVMMTKLEERSRVKCDQYWPSRGT
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB4 ETYGFIQVTLLDTIELATFCVRTFSLHKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAF
::.:..:::::::.::::.:::::.:.:::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS55 ETHGLVQVTLLDTVELATYCVRTFALYKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEHPTPFLAF
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB4 LRRVKTCNPPDAGPIVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNY
::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::: :::::.::::::::.::::
CCDS55 LRRVKTCNPPDAGPMVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKHEKTVDIYGHVTLMRAQRNY
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KB4 MVQTEDQYSFIHEALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANS
:::::::: :::.:::::: :::::::::.::::::::.:.: ::.::::::::::::.:
CCDS55 MVQTEDQYIFIHDALLEAVTCGNTEVPARNLYAYIQKLTQIETGENVTGMELEFKRLASS
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KB4 KAHTSRFISANLPCNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KAHTSRFISANLPCNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAY
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KB4 IATQGPLAETTEDFWRMLWENNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPM
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IATQGPLAETTEDFWRMLWEHNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPM
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KB4 AEYNMPQYILREFKVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AEYNMPQYILREFKVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQF
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KB4 GQDGPISVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS55 GQDGPISVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDQYQ
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1490 1500
pF1KB4 FCYQAALEYLGSFDHYAT
: :.::::::::::::::
CCDS55 FSYRAALEYLGSFDHYAT
1490 1500
>>CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910 aa)
initn: 8602 init1: 6116 opt: 6195 Z-score: 4083.7 bits: 768.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6813; 73.3% identity (73.3% similar) in 1537 aa overlap (378-1505:374-1910)
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 PDPVSYYVIEYKSKSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSES
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PDPVSYYVIEYKSKSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSES
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 VVTRTGEQAPASAPRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VVTRTGEQAPASAPRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQ
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 KHNVDDSLLTTVGSLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KHNVDDSLLTTVGSLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEAR
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 SETSITLSWSPPRQESIIKYELLFREGDHGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SETSITLSWSPPRQESIIKYELLFREGDHGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAA
530 540 550 560 570 580
590 600
pF1KB4 RSPQGLGAFTPVVRQRTLQS----------------------------------------
::::::::::::::::::::
CCDS12 RSPQGLGAFTPVVRQRTLQSKPSAPPQDVKCVSVRSTAILVSWRPPPPETHNGALVGYSV
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 ------------------------------------------------------------
CCDS12 RYRPLGSEDPEPKEVNGIPPTTTQILLEALEKWTQYRITTVAHTEVGPGPESSPVVVRTD
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 ------------------------------------------------------------
CCDS12 EDVPSAPPRKVEAEALNATAIRVLWRSPAPGRQHGQIRGYQVHYVRMEGAEARGPPRIKD
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 ------------------------------------------------------------
CCDS12 VMLADAQEMVITNLQPETAYSITVAAYTMKGDGARSKPKVVVTKGAVLGRPTLSVQQTPE
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 ------------------------------------------------------------
CCDS12 GSLLARWEPPAGTAEDQVLGYRLQFGREDSTPLATLEFPPSEDRYTASGVHKGATYVFRL
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 ------------------------------------------------------------
CCDS12 AARSRGGLGEEAAEVLSIPEDTPRGHPQILEAAGNASAGTVLLRWLPPVPAERNGAIVKY
890 900 910 920 930 940
pF1KB4 ------------------------------------------------------------
CCDS12 TVAVREAGALGPARETELPAAAEPGAENALTLQGLKPDTAYDLQVRAHTRRGPGPFSPPV
950 960 970 980 990 1000
610 620 630 640 650
pF1KB4 ---------ISPKNFKVKMIMKTSVLLSWEFPDNYNSPTPYKIQYNGLTLDVDGRTTKKL
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RYRTFLRDQVSPKNFKVKMIMKTSVLLSWEFPDNYNSPTPYKIQYNGLTLDVDGRTTKKL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 ITHLKPHTFYNFVLTNRGSSLGGLQQTVTAWTAFNLLNGKPSVAPKPDADGFIMVYLPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ITHLKPHTFYNFVLTNRGSSLGGLQQTVTAWTAFNLLNGKPSVAPKPDADGFIMVYLPDG
1070 1080 1090 1100 1110 1120
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 QSPVPVQSYFIVMVPLRKSRGGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSLRHSRQLEVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QSPVPVQSYFIVMVPLRKSRGGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSLRHSRQLEVP
1130 1140 1150 1160 1170 1180
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 RPYIAARFSVLPPTFHPGDQKQYGGFDNRGLEPGHRYVLFVLAVLQKSEPTFAASPFSDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RPYIAARFSVLPPTFHPGDQKQYGGFDNRGLEPGHRYVLFVLAVLQKSEPTFAASPFSDP
1190 1200 1210 1220 1230 1240
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 FQLDNPDPQPIVDGEEGLIWVIGPVLAVVFIICIVIAILLYKNKPDSKRKDSEPRTKCLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FQLDNPDPQPIVDGEEGLIWVIGPVLAVVFIICIVIAILLYKNKPDSKRKDSEPRTKCLL
1250 1260 1270 1280 1290 1300
900 910 920 930 940 950
pF1KB4 NNADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDSLKLSQEYESID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NNADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDSLKLSQEYESID
1310 1320 1330 1340 1350 1360
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB4 PGQQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVILQPIEGIMGSDYINANYVDGYRRQNAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS12 PGQQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVILQPIEGIMGSDYINANYVDGYRCQNAY
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB4 IATQGPLPETFGDFWRMVWEQRSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTETYGFIQVTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IATQGPLPETFGDFWRMVWEQRSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTETYGFIQVTLL
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB4 DTIELATFCVRTFSLHKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRVKTCNPPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DTIELATFCVRTFSLHKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRVKTCNPPD
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB4 AGPIVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQTEDQYSFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AGPIVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQTEDQYSFI
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KB4 HEALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSRFISAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HEALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSRFISAN
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KB4 LPCNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LPCNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETT
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KB4 EDFWRMLWENNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EDFWRMLWENNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILR
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KB4 EFKVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EFKVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCS
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KB4 AGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQAALEYLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQAALEYLG
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1500
pF1KB4 SFDHYAT
:::::::
CCDS12 SFDHYAT
1910
>--
initn: 2481 init1: 1520 opt: 2477 Z-score: 1642.1 bits: 316.9 E(32554): 3.8e-85
Smith-Waterman score: 2477; 98.9% identity (98.9% similar) in 377 aa overlap (1-377:1-373)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 NGRIKQLRSGALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREVRRVAPRFSI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS12 NGRIKQLRSGALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVR----VRRVAPRFSI
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLELTDVKDSANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLELTDVKDSANY
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPVSYYVIEYKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPVSYYVIEYKS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTRTGEQAPASA
:::::::::::::::::
CCDS12 KSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTRTGEQAPASA
360 370 380 390 400 410
>>CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1912 aa)
initn: 7295 init1: 3879 opt: 5171 Z-score: 3411.2 bits: 644.2 E(32554): 1.1e-183
Smith-Waterman score: 5203; 56.2% identity (75.8% similar) in 1523 aa overlap (37-1505:439-1912)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 PGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDPKPRVT-
:::.. .: . .. : :: .:.
CCDS43 LTQTSEQAPSSAPRDVQARMLSSTTILVQWKEPEEP---NGQIQGYRVYYTMDPTQHVNN
410 420 430 440 450 460
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 WNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHAKLTVL
: :.. : .... :: : .. :. . .: .:.:. . . . :.
CCDS43 WMKHN--VADSQITTI------GNLV-------PQKTYSVKVLAFTSIGDGPLSSDIQVI
470 480 490 500 510
130 140 150 160 170
pF1KB4 REDQLPSGFP-NIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITW---FKD-------FLP
. .: : : :. :. ..:. .: . : .. .:: .
CCDS43 TQTGVP-GQPLNFKAEPE------SETSILLSWTPPRSDTIANYELVYKDGEHGEEQRIT
520 530 540 550 560
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 VDPSASNGRIKQLRSGALQ-IESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREVRR
..:..: :.. :. ..: .. . .. :: .: :: . :.:. ...
CCDS43 IEPGTSY-RLQGLKPNSLYYFRLAARSPQGLGASTAEISARTMQSKPSA----PPQDISC
570 580 590 600 610
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 VAPRFSILPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLE--L
..: . . .: . : . : . . . :. ..: :: :.. . . .. . :
CCDS43 TSPSSTSILVSWQPPPVEKQN--GIITEYSIKYTA-VDG-EDDKPHEILGIPSDTTKYLL
620 630 640 650 660 670
300 310 320 330 340
pF1KB4 TDVKDSANY--TCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAP-GTPMVTENTA---TSITITWDS
... ..: : .: ...: .. ... .: : : .: : ::. ..: :
CCDS43 EQLEKWTEYRITVTAHTDVGPGPESLSVLIRTNEDVPSGPPRKVEVEAVNSTSVKVSWRS
680 690 700 710 720 730
350 360 370 380
pF1KB4 GNPDP----VSYYVIEY------KSKSQ---------DGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPN
:. . : ..: . :.: :. ... .: : . :.::.:.
CCDS43 PVPNKQHGQIRGYQVHYVRMENGEPKGQPMLKDVMLADAQWEF-DDTTEHDMIISGLQPE
740 750 760 770 780 790
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 SEYEIWVSAVNSIGQGPPSE-SVVTRTGEQAPASAPRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPN
. : . :.: .. :.: :. ..:. :: : . :: : . .: ..::. ::.
CCDS43 TSYSLTVTAYTTKGDGARSKPKLVSTTG--AVPGKPRLV-INHTQMNTALIQWHPPVDTF
800 810 820 830 840 850
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 GLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNVDDSLLTTVGSLLEDETYTVRVLAFTSVGDGP-LS
: ..:::. . . .:. . . . .: . .: .. . .:. :. : ..:: : .
CCDS43 GPLQGYRLKFGRKDMEPLTTLEFSEKEDHFTAT--DIHKGASYVFRLSARNKVGFGEEMV
860 870 880 890 900
510 520 530 540 550
pF1KB4 DPIQVKTQQGVP-GQPMNLRAEARSETSITLSWSPP----RQESIIKYELLFREGDHGR-
:.. . :: : :.::..:. . ::. :::.:: :. : :: ::.:. .
CCDS43 KEISIPEE--VPTGFPQNLHSEGTTSTSVQLSWQPPVLAERNGIITKYTLLYRDINIPLL
910 920 930 940 950 960
560 570 580 590 600 610
pF1KB4 EVGRTFDPT-TSYVVEDLKPNTEYAFRLAARSPQGLGAFTPVVRQRTL--QSISPKNFKV
. . . :. :.... :::.: : .. :.. .: : ..: :. ::: ... :::.:
CCDS43 PMEQLIVPADTTMTLTGLKPDTTYDVKVRAHTSKGPGPYSPSVQFRTLPVDQVFAKNFHV
970 980 990 1000 1010 1020
620 630 640 650 660 670
pF1KB4 KMIMKTSVLLSWEFPDNYNSPTPYKIQYNG--LTLDVDGRTTKKLITHLKPHTFYNFVLT
: .::::::::::.:.:::: :.:: :. .. .::::.:.:::..:::. :.::::
CCDS43 KAVMKTSVLLSWEIPENYNSAMPFKILYDDGKMVEEVDGRATQKLIVNLKPEKSYSFVLT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
680 690 700 710 720 730
pF1KB4 NRGSSLGGLQQTVTAWTAFNLLNGKPSVAPKPDADGFIMVYLPDGQSPVPVQSYFIVMVP
:::.: ::::. ::: :: ..: ::. : . ::.: : ::. . ...:.:..::
CCDS43 NRGNSAGGLQHRVTAKTAPDVLRTKPAFIGKTNLDGMITVQLPEVPANENIKGYYIIIVP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
740 750 760 770 780 790
pF1KB4 LRKSRGGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSLRHSRQLEVPRPYIAARFSVLPPTF
:.:::: .:. : ::..:.:.::...::: .:::.:..:..:. .:::::.:.::: :
CCDS43 LKKSRG-KFIKPWESPDEMELDELLKEISR-KRRSIRYGREVEL-KPYIAAHFDVLPTEF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
800 810 820 830 840 850
pF1KB4 HPGDQKQYGGFDNRGLEPGHRYVLFVLAVLQKSEPT-FAASPFSDPFQLDNPDPQPIVDG
::.:.:::: :. :. :..::.:::::....: .:.::.::: . :::::.:
CCDS43 TLGDDKHYGGFTNKQLQSGQEYVFFVLAVMEHAESKMYATSPYSDPVVSMDLDPQPITDE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
860 870 880 890 900 910
pF1KB4 EEGLIWVIGPVLAVVFIICIVIAILLYKNKPDSKRKDSEPRTKCLLNNADLAPHHPKDPV
:::::::.:::::::::::::::::::: :: .:. : . . :: .. ::: :::
CCDS43 EEGLIWVVGPVLAVVFIICIVIAILLYK----RKRAESDSRKSSIPNNKEIPSHHPTDPV
1270 1280 1290 1300 1310
920 930 940 950 960 970
pF1KB4 EMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDSLKLSQEYESIDPGQQFTWEHSNLEV
:.::.::::::: ::::::: ..:.: :::::::.::.::::::::::::::::::::::
CCDS43 ELRRLNFQTPGMASHPPIPILELADHIERLKANDNLKFSQEYESIDPGQQFTWEHSNLEV
1320 1330 1340 1350 1360 1370
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KB4 NKPKNRYANVIAYDHSRVILQPIEGIMGSDYINANYVDGYRRQNAYIATQGPLPETFGDF
::::::::::::::::::.:. :::: ::::.::::.::::.::::::::: ::::::::
CCDS43 NKPKNRYANVIAYDHSRVLLSAIEGIPGSDYVNANYIDGYRKQNAYIATQGSLPETFGDF
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KB4 WRMVWEQRSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTETYGFIQVTLLDTIELATFCVRTFS
:::.:::::::.::::.:::.::.:::::::.:::::.:..:::::::.::::.:::::.
CCDS43 WRMIWEQRSATVVMMTKLEERSRVKCDQYWPSRGTETHGLVQVTLLDTVELATYCVRTFA
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KB4 LHKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRVKTCNPPDAGPIVVHCSAGVGR
:.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS43 LYKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEHPTPFLAFLRRVKTCNPPDAGPMVVHCSAGVGR
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KB4 TGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQTEDQYSFIHEALLEAVGCGNTE
::::::::::::::: :::::.::::::::.:::::::::::: :::.:::::: :::::
CCDS43 TGCFIVIDAMLERIKHEKTVDIYGHVTLMRAQRNYMVQTEDQYIFIHDALLEAVTCGNTE
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KB4 VPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSRFISANLPCNKFKNRLVNIM
::::.::::::::.:.: ::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VPARNLYAYIQKLTQIETGENVTGMELEFKRLASSKAHTSRFISANLPCNKFKNRLVNIM
1620 1630 1640 1650 1660 1670
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KB4 PYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETTEDFWRMLWENNSTI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS43 PYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETTEDFWRMLWEHNSTI
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KB4 VVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREFKVTDARDGQSRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREFKVTDARDGQSRT
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KB4 VRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCSAGVGRTGVFITLSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCSAGVGRTGVFITLSI
1800 1810 1820 1830 1840 1850
1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB4 VLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQAALEYLGSFDHYAT
::::::::::::::::::::::::::::::::.::: :.::::::::::::::
CCDS43 VLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDQYQFSYRAALEYLGSFDHYAT
1860 1870 1880 1890 1900 1910
>--
initn: 2227 init1: 1315 opt: 2215 Z-score: 1470.1 bits: 285.0 E(32554): 1.5e-75
Smith-Waterman score: 2215; 74.5% identity (90.4% similar) in 439 aa overlap (9-438:1-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAPTWGPGMVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDP
:: :. . ::..... :: :::: . : :: :::::::::.:::::::
CCDS43 MVHVARLLLLLLTFFLR-TDAETPPRFTRTPVDQTGVSGGVASFICQATGDP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 KPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITVHA
.:...::::::::..::::.::::...:.::::::::::::: .:::::.:.::::.: .
CCDS43 RPKIVWNKKGKKVSNQRFEVIEFDDGSGSVLRIQPLRTPRDEAIYECVASNNVGEISVST
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 KLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSAS
.::::::::.: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : .
CCDS43 RLTVLREDQIPRGFPTIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDTSNN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB4 NGRIKQLRS---------GALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREV
::::::::: ::::::.:::.::::::::::::::.:::.::::::::::::
CCDS43 NGRIKQLRSESIGGTPIRGALQIEQSEESDQGKYECVATNSAGTRYSAPANLYVRELREV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 RRVAPRFSILPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLEL
::: ::::: : .:::::::.:::::::::::::::::: ::::::::::::.:::::::
CCDS43 RRVPPRFSIPPTNHEIMPGGSVNITCVAVGSPMPYVKWMLGAEDLTPEDDMPIGRNVLEL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 TDVKDSANYTCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPV
.::..::::::::::.::::::.::::::.::: ::::.:::.::::::.:::::::.::
CCDS43 NDVRQSANYTCVAMSTLGVIEAIAQITVKALPKPPGTPVVTESTATSITLTWDSGNPEPV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 SYYVIEYKSKSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTR
:::.:..: :... :. . ..:::::..:::: :.::. : :::.::.::::: :.:.
CCDS43 SYYIIQHKPKNSEELYKEIDGVATTRYSVAGLSPYSDYEFRVVAVNNIGRGPPSEPVLTQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 TGEQAPASAPRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNV
:.::::.::::.:::::::.::..:::
CCDS43 TSEQAPSSAPRDVQARMLSSTTILVQWKEPEEPNGQIQGYRVYYTMDPTQHVNNWMKHNV
420 430 440 450 460 470
>>CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898 aa)
initn: 5842 init1: 3702 opt: 4767 Z-score: 3146.0 bits: 595.1 E(32554): 6.5e-169
Smith-Waterman score: 4767; 61.6% identity (79.9% similar) in 1210 aa overlap (318-1505:703-1898)
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 VLELTDVKDSANYTCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTEN-TATSITITWDSG
: ...:..: . .: ..:.. . :
CCDS49 GLEKWTEYRVWVRAHTDVGPGPESSPVLVRTDEDVPSGPPRKVEVEPLNSTAVHVYWKLP
680 690 700 710 720 730
350 360 370 380 390
pF1KB4 NPDP----VSYYVIEYKSKSQDGPY--QIKEDITTTRY---SIGGLSPNSEYEIWVSAVN
:. . : . : . : : .:. .. .:.::.:.. : . :.: .
CCDS49 VPSKQHGQIRGYQVTYVRLENGEPRGLPIIQDVMLAEAQETTISGLTPETTYSVTVAAYT
740 750 760 770 780 790
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 SIGQGPPSE-SVVTRTGEQAPASAPRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYT
. :.: :. ..:: :: .:. ... .. : ..::. : : : . :::. :
CCDS49 TKGDGARSKPKIVTTTGA-VPGRPTMMISTTAMN--TALLQWHPPKELPGELLGYRLQYC
800 810 820 830 840
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 MEPE-HPVGNWQKHNVDDSLLTTVGSLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGV
: .: : . ::. .:..: : . :: :. : . .: : . ...: . .
CCDS49 RADEARP--NTIDFGKDDQHFTVTG-LHKGTTYIFRLAAKNRAGLGEEFEK-EIRTPEDL
850 860 870 880 890 900
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 P-GQPMNLRAEARSETSITLSWSPP----RQESIIKYELLFREGDHGREVGRTFDPTTSY
: : :.::.. . . .. :.:.:: :. ::.: ..::. . .:. ... : .
CCDS49 PSGFPQNLHVTGLTTSTTELAWDPPVLAERNGRIISYTVVFRDINSQQEL-QNITTDTRF
910 920 930 940 950 960
580 590 600 610 620
pF1KB4 VVEDLKPNTEYAFRLAARSPQGLGAFTPVVRQRTL--QSISPKNFKVKMIMKTSVLLSWE
.. :::.: : ... : . .: : ..: ...::. ... :::.: ::::::::::
CCDS49 TLTGLKPDTTYDIKVRAWTSKGSGPLSPSIQSRTMPVEQVFAKNFRVAAAMKTSVLLSWE
970 980 990 1000 1010 1020
630 640 650 660 670 680
pF1KB4 FPDNYNSPTPYKIQYNGLTLDVDGRTTKKLITHLKPHTFYNFVLTNRGSSLGGLQQTVTA
::.:.: .:.:: ::: ...:::.. .:::. :.:.: :.::: ::::: ::::. :.
CCDS49 VPDSYKSAVPFKILYNGQSVEVDGHSMRKLIADLQPNTEYSFVLMNRGSSAGGLQHLVSI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
690 700 710 720 730 740
pF1KB4 WTAFNLLNGKPSVAPKPDADGFIMVYLPDGQSPVPVQSYFIVMVPLRKSRGGQFLTP-LG
:: .:: :: : :: . . .: :.: :. ..::.::. . ::..::: .
CCDS49 RTAPDLLPHKPLPASAYIEDGRFDLSMPHVQDPSLVRWFYIVVVPIDRV-GGSMLTPRWS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
750 760 770 780 790 800
pF1KB4 SPEDMDLEELIQDISRLQRRSLRHSRQLEVPRPYIAARFSVLPPTFHPGDQKQYGGFDNR
.::...:.::.. : . ... :. :: : .::.::...::: :: ::.:.: :: ::
CCDS49 TPEELELDELLEAIEQGGEEQRRRRRQAERLKPYVAAQLDVLPETFTLGDKKNYRGFYNR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
810 820 830 840 850 860
pF1KB4 GLEPGHRYVLFVLAVLQK--SEPTFAASPFSDPFQLDNPDPQPIVDGEEGLIWVIGPVLA
: : : :::: :.. .. .:.::.:: . .. : . : ..:: :::::
CCDS49 PLSPDLSYQCFVLASLKEPMDQKRYASSPYSDEIVVQVTPAQQQEEPE--MLWVTGPVLA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
870 880 890 900 910 920
pF1KB4 VVFIICIVIAILLYKNKPDSKRKDSEPRTKCLLNNADLAPHHPKDPVEMRRINFQTPGML
:..:: :::::::.: : .. .:. . . :... :: : .:::::::.:.:::::
CCDS49 VILIILIVIAILLFKRK-RTHSPSSKDEQSIGLKDSLLA--HSSDPVEMRRLNYQTPGMR
1270 1280 1290 1300 1310
930 940 950 960 970 980
pF1KB4 SHPPIPIADMAEHTERLKANDSLKLSQEYESIDPGQQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAY
.::::::.:.:.. :::::::.::.::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS49 DHPPIPITDLADNIERLKANDGLKFSQEYESIDPGQQFTWENSNLEVNKPKNRYANVIAY
1320 1330 1340 1350 1360 1370
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB4 DHSRVILQPIEGIMGSDYINANYVDGYRRQNAYIATQGPLPETFGDFWRMVWEQRSATIV
::::::: :.:. :::::::::.::::.::::::::::::::.:::::::::::.::.:
CCDS49 DHSRVILTSIDGVPGSDYINANYIDGYRKQNAYIATQGPLPETMGDFWRMVWEQRTATVV
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB4 MMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTETYGFIQVTLLDTIELATFCVRTFSLHKNGSSEKREVR
::::::::::.::::::: ::::: :.::::::::.::::. ::::.:::.:::::::.:
CCDS49 MMTRLEEKSRVKCDQYWPARGTETCGLIQVTLLDTVELATYTVRTFALHKSGSSEKRELR
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB4 QFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRVKTCNPPDAGPIVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLER
:::: :::::::::::::.::::::::.::: ::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS49 QFQFMAWPDHGVPEYPTPILAFLRRVKACNPLDAGPMVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLER
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KB4 IKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQTEDQYSFIHEALLEAVGCGNTEVPARSLYAYIQKL
.: :::::.::::: ::::::::::::::: :::::::::. ::.::::::.:::.::::
CCDS49 MKHEKTVDIYGHVTCMRSQRNYMVQTEDQYVFIHEALLEAATCGHTEVPARNLYAHIQKL
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KB4 AQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSRFISANLPCNKFKNRLVNIMPYESTRVCLQPIR
.:: ::: ::.:::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS49 GQVPPGESVTAMELEFKLLASSKAHTSRFISANLPCNKFKNRLVNIMPYELTRVCLQPIR
1620 1630 1640 1650 1660 1670
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KB4 GVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETTEDFWRMLWENNSTIVVMLTKLREMGRE
::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::.::::.::::::::::::
CCDS49 GVEGSDYINASFLDGYRQQKAYIATQGPLAESTEDFWRMLWEHNSTIIVMLTKLREMGRE
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KB4 KCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREFKVTDARDGQSRTVRQFQFTDWPEQG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS49 KCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREFKVTDARDGQSRTIRQFQFTDWPEQG
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KB4 VPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDI
:::.::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS49 VPKTGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPITVHCSAGVGRTGVFITLSIVLERMRYEGVVDM
1800 1810 1820 1830 1840 1850
1470 1480 1490 1500
pF1KB4 FQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQAALEYLGSFDHYAT
::::: :::::::::::::.::.::.::::::::::::::
CCDS49 FQTVKTLRTQRPAMVQTEDQYQLCYRAALEYLGSFDHYAT
1860 1870 1880 1890
>--
initn: 1485 init1: 1467 opt: 2811 Z-score: 1861.5 bits: 357.5 E(32554): 2.3e-97
Smith-Waterman score: 2811; 61.8% identity (81.5% similar) in 717 aa overlap (1-707:1-696)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAPTWGPG--MVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATG
::: .:: :: .: : .:... ::.: .. : ::: :.:: :.:::::::::::::
CCDS49 MAPEPAPGRTMVPLV-P-ALVMLGLVAGAHGDSKPVFIKVPEDQTGLSGGVASFVCQATG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 DPKPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITV
.::::.:: ::::::.:::::.::::..::.::::::::. ::: .:::.: ::.:::..
CCDS49 EPKPRITWMKKGKKVSSQRFEVIEFDDGAGSVLRIQPLRVQRDEAIYECTATNSLGEINT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 HAKLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPS
:::.::.:.::: :::.:::::::::::..:::::::::.:::::::.::::::::::.
CCDS49 SAKLSVLEEEQLPPGFPSIDMGPQLKVVEKARTATMLCAAGGNPDPEISWFKDFLPVDPA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 ASNGRIKQLRSGALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREVRRVAPRF
.::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:::.::::::: ::::::::
CCDS49 TSNGRIKQLRSGALQIESSEESDQGKYECVATNSAGTRYSAPANLYVR----VRRVAPRF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 SILPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLELTDVKDSA
:: : :.:.::::.::.::::::.::::::::.:::.:: ::.::::::::::..: ::
CCDS49 SIPPSSQEVMPGGSVNLTCVAVGAPMPYVKWMMGAEELTKEDEMPVGRNVLELSNVVRSA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 NYTCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPVSYYVIEY
::::::.::::.:::.::.:::.::: : .:::.::::.:.:::::: .::.:: :.:
CCDS49 NYTCVAISSLGMIEATAQVTVKALPKPPIDLVVTETTATSVTLTWDSGNSEPVTYYGIQY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 KSKSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTRTGEQAPA
.. . .::.: . ..::::::::::: ::: . : ::::::.:::::.: .:::::::.
CCDS49 RAAGTEGPFQEVDGVATTRYSIGGLSPFSEYAFRVLAVNSIGRGPPSEAVRARTGEQAPS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 SAPRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNVDDSLLTT
: :: ::::::::.::.:::: : :::::.:::::::: . ..: . :.:::.: .::::
CCDS49 SPPRRVQARMLSASTMLVQWEPPEEPNGLVRGYRVYYTPDSRRPPNAWHKHNTDAGLLTT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 VGSLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEARSETSITLSWSP
::::: ::..::::::.::::: : ::::::::::.:: ...::..:.: : :::
CCDS49 VGSLLPGITYSLRVLAFTAVGDGPPSPTIQVKTQQGVPAQPADFQAEVESDTRIQLSWLL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 PRQESIIKYELLFREG-DHGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAARSPQGLGAFT
: :: :: :::.. . :. .. :::::.::..:::::.: : :.::::: .:.:.::
CCDS49 PPQERIIMYELVYWAAEDEDQQHKVTFDPTSSYTLEDLKPDTLYRFQLAARSDMGVGVFT
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 PVVRQRTLQSIS---PKNFKVKMIMKTSVLLSWEFP--DNYNSP-TPYKIQYNGLTLDVD
:... :: :: :.. . .:.: .:: : :. :. : :.. :... .
CCDS49 PTIEARTAQSTPSAPPQKVMCVSMGSTTVRVSWVPPPADSRNGVITQYSVAYEAVDGEDR
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 GRTTKKLITHLKPHTFYNFVLTNRGSSLGGLQQTVTAWTAFNL-LNGKPSVAPKPDADGF
:: . :. . :. ...: ::.. :: . . . .. .:.: :..
CCDS49 GRHVVDGIS--REHSSWDLV---------GLEK----WTEYRVWVRAHTDVGPGPESSPV
660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 IMVYLPDGQSPVPVQSYFIVMVPLRKSRGGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSLR
CCDS49 LVRTDEDVPSGPPRKVEVEPLNSTAVHVYWKLPVPSKQHGQIRGYQVTYVRLENGEPRGL
700 710 720 730 740 750
>>CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907 aa)
initn: 5842 init1: 3702 opt: 4764 Z-score: 3144.0 bits: 594.8 E(32554): 8.4e-169
Smith-Waterman score: 4765; 52.8% identity (72.8% similar) in 1528 aa overlap (8-1505:470-1907)
10 20 30
pF1KB4 MAPTWGPGMVSVVGPM--GLLVVLLVGGCAA--EEPP
:....:: . :. : : . .: . ::
CCDS48 PNGLVRGYRVYYTPDSRRPPNAWHKHNTDAGLLTTVGSLLPGITYSLRVLAFTAVGDGPP
440 450 460 470 480 490
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 RFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATGDPKPRVTW--NKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVL
. : : :: . :.: .. .: . ...: . . . . ::. .
CCDS48 SPTIQVKTQQGVPAQPADFQAEVESDTRIQLSWLLPPQERIIMYELVYWAAEDEDQQHKV
500 510 520 530 540 550
100 110 120 130 140
pF1KB4 RIQPLRTPRDENV-------YECVAQNSVGEITVHAKLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLK
..: . :.. .. .:....: . : . : : . : :: :
CCDS48 TFDPTSSYTLEDLKPDTLYRFQLAARSDMG-VGVFTPTIEARTAQSTPSAP-----PQ-K
560 570 580 590 600 610
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 VVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPSASNGRIKQLRSGALQIESSEETDQGK
: .:.. :. ...: .: .. :: : : .. :. . :.:.
CCDS48 V---------MCVSMGSTTVRVSW----VPPPADSRNGVITQY---SVAYEAVDGEDRGR
620 630 640 650
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 YECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREVRRVAPRFSILPMSH-EIMPGGNVNITCVAVGSP
. .... . ..:: . ... : : . .: .. :: . .::
CCDS48 H---VVDGISREHSSWDLVGLEKWTEYR-------VWVRAHTDVGPGPE--------SSP
660 670 680 690
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 MPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVG--RNVLELTDVKDSANYTCVAMSSLGVIEAVAQITVKS
. :. ..:.: : :.: :. ....: ... .. : :
CCDS48 V-LVR---------TDEDVPSGPPRKV-EVEPLNSTA------------VHVYWKLPVPS
700 710 720 730
330 340 350 360 370
pF1KB4 LPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPD--PVSYYVIEYKSKSQDGPYQIKEDITTTRYS
: : .. .: . . ..:.: :. :. ...: : . .:: ::
CCDS48 --KQHG--QIRGYQVTYVRL--ENGEPRGLPIIQDVML--AEAQWRPEE-SEDYETT---
740 750 760 770 780
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 IGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSE-SVVTRTGEQAPASAPRNVQARMLSATTMIVQW
:.::.:.. : . :.: .. :.: :. ..:: :: .:. ... .. : ..::
CCDS48 ISGLTPETTYSVTVAAYTTKGDGARSKPKIVTTTGA-VPGRPTMMISTTAMN--TALLQW
790 800 810 820 830 840
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 EEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPE-HPVGNWQKHNVDDSLLTTVGSLLEDETYTVRVLAFTS
. : : : . :::. : : .: : . ::. .:..: : . :: :. : .
CCDS48 HPPKELPGELLGYRLQYCRADEARP--NTIDFGKDDQHFTVTG-LHKGTTYIFRLAAKNR
850 860 870 880 890
500 510 520 530 540 550
pF1KB4 VGDGPLSDPIQVKTQQGVP-GQPMNLRAEARSETSITLSWSPP----RQESIIKYELLFR
.: : . ...: . .: : :.::.. . . .. :.:.:: :. ::.: ..::
CCDS48 AGLGEEFEK-EIRTPEDLPSGFPQNLHVTGLTTSTTELAWDPPVLAERNGRIISYTVVFR
900 910 920 930 940 950
560 570 580 590 600 610
pF1KB4 EGDHGREVGRTFDPTTSYVVEDLKPNTEYAFRLAARSPQGLGAFTPVVRQRTL--QSISP
. . .:. ... : ... :::.: : ... : . .: : ..: ...::. ...
CCDS48 DINSQQEL-QNITTDTRFTLTGLKPDTTYDIKVRAWTSKGSGPLSPSIQSRTMPVEQVFA
960 970 980 990 1000 1010
620 630 640 650 660 670
pF1KB4 KNFKVKMIMKTSVLLSWEFPDNYNSPTPYKIQYNGLTLDVDGRTTKKLITHLKPHTFYNF
:::.: :::::::::: ::.:.: .:.:: ::: ...:::.. .:::. :.:.: :.:
CCDS48 KNFRVAAAMKTSVLLSWEVPDSYKSAVPFKILYNGQSVEVDGHSMRKLIADLQPNTEYSF
1020 1030 1040 1050 1060 1070
680 690 700 710 720 730
pF1KB4 VLTNRGSSLGGLQQTVTAWTAFNLLNGKPSVAPKPDADGFIMVYLPDGQSPVPVQSYFIV
:: ::::: ::::. :. :: .:: :: : :: . . .: :.: :. ..::
CCDS48 VLMNRGSSAGGLQHLVSIRTAPDLLPHKPLPASAYIEDGRFDLSMPHVQDPSLVRWFYIV
1080 1090 1100 1110 1120 1130
740 750 760 770 780
pF1KB4 MVPLRKSRGGQFLTP-LGSPEDMDLEELIQDISRLQRRSLRHSRQLEVPRPYIAARFSVL
.::. . ::..::: ..::...:.::.. : . ... :. :: : .::.::...::
CCDS48 VVPIDRV-GGSMLTPRWSTPEELELDELLEAIEQGGEEQRRRRRQAERLKPYVAAQLDVL
1140 1150 1160 1170 1180 1190
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 PPTFHPGDQKQYGGFDNRGLEPGHRYVLFVLAVLQK--SEPTFAASPFSDPFQLDNPDPQ
: :: ::.:.: :: :: : : : :::: :.. .. .:.::.:: . .. :
CCDS48 PETFTLGDKKNYRGFYNRPLSPDLSYQCFVLASLKEPMDQKRYASSPYSDEIVVQVTPAQ
1200 1210 1220 1230 1240 1250
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 PIVDGEEGLIWVIGPVLAVVFIICIVIAILLYKNKPDSKRKDSEPRTKCLLNNADLAPHH
. : ..:: ::::::..:: :::::::.: : .. .:. . . :... :: :
CCDS48 QQEEPE--MLWVTGPVLAVILIILIVIAILLFKRK-RTHSPSSKDEQSIGLKDSLLA--H
1260 1270 1280 1290 1300
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 PKDPVEMRRINFQTPGMLSHPPIPIADMAEHTERLKANDSLKLSQEYESIDPGQQFTWEH
.:::::::.:.::::: .::::::.:.:.. :::::::.::.::::::::::::::::.
CCDS48 SSDPVEMRRLNYQTPGMRDHPPIPITDLADNIERLKANDGLKFSQEYESIDPGQQFTWEN
1310 1320 1330 1340 1350 1360
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 SNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVILQPIEGIMGSDYINANYVDGYRRQNAYIATQGPLPE
::::::::::::::::::::::::: :.:. :::::::::.::::.:::::::::::::
CCDS48 SNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVILTSIDGVPGSDYINANYIDGYRKQNAYIATQGPLPE
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 TFGDFWRMVWEQRSATIVMMTRLEEKSRIKCDQYWPNRGTETYGFIQVTLLDTIELATFC
:.:::::::::::.::.:::::::::::.::::::: ::::: :.::::::::.::::.
CCDS48 TMGDFWRMVWEQRTATVVMMTRLEEKSRVKCDQYWPARGTETCGLIQVTLLDTVELATYT
1430 1440 1450 1460 1470 1480
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 VRTFSLHKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEYPTPFLAFLRRVKTCNPPDAGPIVVHCS
::::.:::.:::::::.::::: :::::::::::::.::::::::.::: ::::.:::::
CCDS48 VRTFALHKSGSSEKRELRQFQFMAWPDHGVPEYPTPILAFLRRVKACNPLDAGPMVVHCS
1490 1500 1510 1520 1530 1540
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 AGVGRTGCFIVIDAMLERIKPEKTVDVYGHVTLMRSQRNYMVQTEDQYSFIHEALLEAVG
::::::::::::::::::.: :::::.::::: ::::::::::::::: :::::::::.
CCDS48 AGVGRTGCFIVIDAMLERMKHEKTVDIYGHVTCMRSQRNYMVQTEDQYVFIHEALLEAAT
1550 1560 1570 1580 1590 1600
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB4 CGNTEVPARSLYAYIQKLAQVEPGEHVTGMELEFKRLANSKAHTSRFISANLPCNKFKNR
::.::::::.:::.::::.:: ::: ::.:::::: ::.:::::::::::::::::::::
CCDS48 CGHTEVPARNLYAHIQKLGQVPPGESVTAMELEFKLLASSKAHTSRFISANLPCNKFKNR
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB4 LVNIMPYESTRVCLQPIRGVEGSDYINASFIDGYRQQKAYIATQGPLAETTEDFWRMLWE
:::::::: :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS48 LVNIMPYELTRVCLQPIRGVEGSDYINASFLDGYRQQKAYIATQGPLAESTEDFWRMLWE
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB4 NNSTIVVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREFKVTDARD
.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HNSTIIVMLTKLREMGREKCHQYWPAERSARYQYFVVDPMAEYNMPQYILREFKVTDARD
1730 1740 1750 1760 1770 1780
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB4 GQSRTVRQFQFTDWPEQGVPKSGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPISVHCSAGVGRTGVF
:::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS48 GQSRTIRQFQFTDWPEQGVPKTGEGFIDFIGQVHKTKEQFGQDGPITVHCSAGVGRTGVF
1790 1800 1810 1820 1830 1840
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB4 ITLSIVLERMRYEGVVDIFQTVKMLRTQRPAMVQTEDEYQFCYQAALEYLGSFDHYAT
:::::::::::::::::.::::: :::::::::::::.::.::.::::::::::::::
CCDS48 ITLSIVLERMRYEGVVDMFQTVKTLRTQRPAMVQTEDQYQLCYRAALEYLGSFDHYAT
1850 1860 1870 1880 1890 1900
>--
initn: 2278 init1: 1157 opt: 2275 Z-score: 1509.5 bits: 292.3 E(32554): 9.3e-78
Smith-Waterman score: 2275; 71.5% identity (88.6% similar) in 474 aa overlap (1-472:1-468)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAPTWGPG--MVSVVGPMGLLVVLLVGGCAAEEPPRFIKEPKDQIGVSGGVASFVCQATG
::: .:: :: .: : .:... ::.: .. : ::: :.:: :.:::::::::::::
CCDS48 MAPEPAPGRTMVPLV-P-ALVMLGLVAGAHGDSKPVFIKVPEDQTGLSGGVASFVCQATG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 DPKPRVTWNKKGKKVNSQRFETIEFDESAGAVLRIQPLRTPRDENVYECVAQNSVGEITV
.::::.:: ::::::.:::::.::::..::.::::::::. ::: .:::.: ::.:::..
CCDS48 EPKPRITWMKKGKKVSSQRFEVIEFDDGAGSVLRIQPLRVQRDEAIYECTATNSLGEINT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 HAKLTVLREDQLPSGFPNIDMGPQLKVVERTRTATMLCAASGNPDPEITWFKDFLPVDPS
:::.::.:.::: :::.:::::::::::..:::::::::.:::::::.::::::::::.
CCDS48 SAKLSVLEEEQLPPGFPSIDMGPQLKVVEKARTATMLCAAGGNPDPEISWFKDFLPVDPA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 ASNGRIKQLRSGALQIESSEETDQGKYECVATNSAGVRYSSPANLYVRELREVRRVAPRF
.::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:::.::::::: ::::::::
CCDS48 TSNGRIKQLRSGALQIESSEESDQGKYECVATNSAGTRYSAPANLYVR----VRRVAPRF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 SILPMSHEIMPGGNVNITCVAVGSPMPYVKWMQGAEDLTPEDDMPVGRNVLELTDVKDSA
:: : :.:.::::.::.::::::.::::::::.:::.:: ::.::::::::::..: ::
CCDS48 SIPPSSQEVMPGGSVNLTCVAVGAPMPYVKWMMGAEELTKEDEMPVGRNVLELSNVVRSA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 NYTCVAMSSLGVIEAVAQITVKSLPKAPGTPMVTENTATSITITWDSGNPDPVSYYVIEY
::::::.::::.:::.::.:::.::: : .:::.::::.:.:::::: .::.:: :.:
CCDS48 NYTCVAISSLGMIEATAQVTVKALPKPPIDLVVTETTATSVTLTWDSGNSEPVTYYGIQY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 KSKSQDGPYQIKEDITTTRYSIGGLSPNSEYEIWVSAVNSIGQGPPSESVVTRTGEQAPA
.. . .::.: . ..::::::::::: ::: . : ::::::.:::::.: .:::::::.
CCDS48 RAAGTEGPFQEVDGVATTRYSIGGLSPFSEYAFRVLAVNSIGRGPPSEAVRARTGEQAPS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 SAPRNVQARMLSATTMIVQWEEPVEPNGLIRGYRVYYTMEPEHPVGNWQKHNVDDSLLTT
: :: ::::::::.::.:::: : :::::.:::::::: . ..: . :.:::.:
CCDS48 SPPRRVQARMLSASTMLVQWEPPEEPNGLVRGYRVYYTPDSRRPPNAWHKHNTDAGLLTT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 VGSLLEDETYTVRVLAFTSVGDGPLSDPIQVKTQQGVPGQPMNLRAEARSETSITLSWSP
CCDS48 VGSLLPGITYSLRVLAFTAVGDGPPSPTIQVKTQQGVPAQPADFQAEVESDTRIQLSWLL
480 490 500 510 520 530
1505 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 16:26:50 2016 done: Tue Nov 8 16:26:51 2016
Total Scan time: 3.730 Total Display time: 0.740
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]