Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6768
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6768, 532 aa
1>>>pF1KE6768 532 - 532 aa - 532 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6399+/-0.000955; mu= 16.1125+/- 0.057
mean_var=64.2115+/-12.860, 0's: 0 Z-trim(104.1): 25 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.160054
statistics sampled from 7737 (7754) to 7737 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 2.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1294.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 ( 532) 3601 840.6 0
CCDS60351.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 ( 469) 2867 671.1 7.6e-193
CCDS1293.2 FMO2 gene_id:2327|Hs108|chr1 ( 535) 2202 517.6 1.4e-146
CCDS1292.1 FMO3 gene_id:2328|Hs108|chr1 ( 532) 2083 490.1 2.7e-138
CCDS926.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 ( 533) 1909 449.9 3.3e-126
CCDS1295.1 FMO4 gene_id:2329|Hs108|chr1 ( 558) 1884 444.2 1.9e-124
CCDS44209.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 ( 464) 1614 381.8 9.5e-106
CCDS44210.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 ( 285) 1159 276.7 2.6e-74
>>CCDS1294.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 (532 aa)
initn: 3601 init1: 3601 opt: 3601 Z-score: 4490.7 bits: 840.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3601; 100.0% identity (100.0% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAKRVAIVGAGVSGLASIKCCLEEGLEPTCFERSDDLGGLWRFTEHVEEGRASLYKSVVS
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CCDS12 MAKRVAIVGAGVSGLASIKCCLEEGLEPTCFERSDDLGGLWRFTEHVEEGRASLYKSVVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NSCKEMSCYSDFPFPEDYPNYVPNSQFLEYLKMYANHFDLLKHIQFKTKVCSVTKCSDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NSCKEMSCYSDFPFPEDYPNYVPNSQFLEYLKMYANHFDLLKHIQFKTKVCSVTKCSDSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VSGQWEVVTMHEEKQESAIFDAVMVCTGFLTNPYLPLDSFPGINAFKGQYFHSRQYKHPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VSGQWEVVTMHEEKQESAIFDAVMVCTGFLTNPYLPLDSFPGINAFKGQYFHSRQYKHPD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IFKDKRVLVIGMGNSGTDIAVEASHLAEKVFLSTTGGGWVISRIFDSGYPWDMVFMTRFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IFKDKRVLVIGMGNSGTDIAVEASHLAEKVFLSTTGGGWVISRIFDSGYPWDMVFMTRFQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NMLRNSLPTPIVTWLMERKINNWLNHANYGLIPEDRTQLKEFVLNDELPGRIITGKVFIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NMLRNSLPTPIVTWLMERKINNWLNHANYGLIPEDRTQLKEFVLNDELPGRIITGKVFIR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 PSIKEVKENSVIFNNTSKEEPIDIIVFATGYTFAFPFLDESVVKVEDGQASLYKYIFPAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PSIKEVKENSVIFNNTSKEEPIDIIVFATGYTFAFPFLDESVVKVEDGQASLYKYIFPAH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LQKPTLAIIGLIKPLGSMIPTGETQARWAVRVLKGVNKLPPPSVMIEEINARKENKPSWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LQKPTLAIIGLIKPLGSMIPTGETQARWAVRVLKGVNKLPPPSVMIEEINARKENKPSWF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GLCYCKALQSDYITYIDELLTYINAKPNLFSMLLTDPHLALTVFFGPCSPYQFRLTGPGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GLCYCKALQSDYITYIDELLTYINAKPNLFSMLLTDPHLALTVFFGPCSPYQFRLTGPGK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE6 WEGARNAIMTQWDRTFKVIKARVVQESPSPFESFLKVFSFLALLVAIFLIFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WEGARNAIMTQWDRTFKVIKARVVQESPSPFESFLKVFSFLALLVAIFLIFL
490 500 510 520 530
>>CCDS60351.1 FMO1 gene_id:2326|Hs108|chr1 (469 aa)
initn: 2867 init1: 2867 opt: 2867 Z-score: 3575.6 bits: 671.1 E(32554): 7.6e-193
Smith-Waterman score: 3025; 88.2% identity (88.2% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-469)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAKRVAIVGAGVSGLASIKCCLEEGLEPTCFERSDDLGGLWRFTEHVEEGRASLYKSVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MAKRVAIVGAGVSGLASIKCCLEEGLEPTCFERSDDLGGLWRFT----------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NSCKEMSCYSDFPFPEDYPNYVPNSQFLEYLKMYANHFDLLKHIQFKTKVCSVTKCSDSA
:::::::::::::
CCDS60 -----------------------------------------------TKVCSVTKCSDSA
50
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VSGQWEVVTMHEEKQESAIFDAVMVCTGFLTNPYLPLDSFPGINAFKGQYFHSRQYKHPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VSGQWEVVTMHEEKQESAIFDAVMVCTGFLTNPYLPLDSFPGINAFKGQYFHSRQYKHPD
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IFKDKRVLVIGMGNSGTDIAVEASHLAEKVFLSTTGGGWVISRIFDSGYPWDMVFMTRFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IFKDKRVLVIGMGNSGTDIAVEASHLAEKVFLSTTGGGWVISRIFDSGYPWDMVFMTRFQ
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NMLRNSLPTPIVTWLMERKINNWLNHANYGLIPEDRTQLKEFVLNDELPGRIITGKVFIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 NMLRNSLPTPIVTWLMERKINNWLNHANYGLIPEDRTQLKEFVLNDELPGRIITGKVFIR
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 PSIKEVKENSVIFNNTSKEEPIDIIVFATGYTFAFPFLDESVVKVEDGQASLYKYIFPAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PSIKEVKENSVIFNNTSKEEPIDIIVFATGYTFAFPFLDESVVKVEDGQASLYKYIFPAH
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LQKPTLAIIGLIKPLGSMIPTGETQARWAVRVLKGVNKLPPPSVMIEEINARKENKPSWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LQKPTLAIIGLIKPLGSMIPTGETQARWAVRVLKGVNKLPPPSVMIEEINARKENKPSWF
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GLCYCKALQSDYITYIDELLTYINAKPNLFSMLLTDPHLALTVFFGPCSPYQFRLTGPGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GLCYCKALQSDYITYIDELLTYINAKPNLFSMLLTDPHLALTVFFGPCSPYQFRLTGPGK
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530
pF1KE6 WEGARNAIMTQWDRTFKVIKARVVQESPSPFESFLKVFSFLALLVAIFLIFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 WEGARNAIMTQWDRTFKVIKARVVQESPSPFESFLKVFSFLALLVAIFLIFL
420 430 440 450 460
>>CCDS1293.2 FMO2 gene_id:2327|Hs108|chr1 (535 aa)
initn: 2172 init1: 2172 opt: 2202 Z-score: 2744.8 bits: 517.6 E(32554): 1.4e-146
Smith-Waterman score: 2202; 57.7% identity (84.9% similar) in 529 aa overlap (1-528:1-529)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAKRVAIVGAGVSGLASIKCCLEEGLEPTCFERSDDLGGLWRFTEHVEEGRASLYKSVVS
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CCDS12 MAKKVAVIGAGVSGLISLKCCVDEGLEPTCFERTEDIGGVWRFKENVEDGRASIYQSVVT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NSCKEMSCYSDFPFPEDYPNYVPNSQFLEYLKMYANHFDLLKHIQFKTKVCSVTKCSDSA
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CCDS12 NTSKEMSCFSDFPMPEDFPNFLHNSKLLEYFRIFAKKFDLLKYIQFQTTVLSVRKCPDFS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VSGQWEVVTMHEEKQESAIFDAVMVCTGFLTNPYLPLDSFPGINAFKGQYFHSRQYKHPD
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CCDS12 SSGQWKVVTQSNGKEQSAVFDAVMVCSGHHILPHIPLKSFPGMERFKGQYFHSRQYKHPD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IFKDKRVLVIGMGNSGTDIAVEASHLAEKVFLSTTGGGWVISRIFDSGYPWDMVFMTRFQ
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CCDS12 GFEGKRILVIGMGNSGSDIAVELSKNAAQVFISTRHGTWVMSRISEDGYPWDSVFHTRFR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NMLRNSLPTPIVTWLMERKINNWLNHANYGLIPEDRTQLKEFVLNDELPGRIITGKVFIR
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CCDS12 SMLRNVLPRTAVKWMIEQQMNRWFNHENYGLEPQNKYIMKEPVLNDDVPSRLLCGAIKVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 PSIKEVKENSVIFNNTSKEEPIDIIVFATGYTFAFPFLDESVVKVEDGQASLYKYIFPAH
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CCDS12 STVKELTETSAIFEDGTVEENIDVIIFATGYSFSFPFLEDSLVKVENNMVSLYKYIFPAH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LQKPTLAIIGLIKPLGSMIPTGETQARWAVRVLKGVNKLPPPSVMIEEINARKENKPSWF
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CCDS12 LDKSTLACIGLIQPLGSIFPTAELQARWVTRVFKGLCSLPSERTMMMDIIKRNEKRIDLF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GLCYCKALQSDYITYIDELLTYINAKPNLFSMLLTDPHLALTVFFGPCSPYQFRLTGPGK
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CCDS12 GESQSQTLQTNYVDYLDELALEIGAKPDFCSLLFKDPKLAVRLYFGPCNSYQYRLVGPGQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE6 WEGARNAIMTQWDRTFKVIKARVVQESPSPFESFL-KVFSFLALLVAIFLIFL
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CCDS12 WEGARNAIFTQKQRILKPLKTRALKDSSNFSVSFLLKILGLLAVVVAFFCQLQWS
490 500 510 520 530
>>CCDS1292.1 FMO3 gene_id:2328|Hs108|chr1 (532 aa)
initn: 2033 init1: 1662 opt: 2083 Z-score: 2596.4 bits: 490.1 E(32554): 2.7e-138
Smith-Waterman score: 2083; 54.6% identity (82.6% similar) in 533 aa overlap (1-531:1-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAKRVAIVGAGVSGLASIKCCLEEGLEPTCFERSDDLGGLWRFTEHVEEGRASLYKSVVS
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CCDS12 MGKKVAIIGAGVSGLASIRSCLEEGLEPTCFEKSNDIGGLWKFSDHAEEGRASIYKSVFS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NSCKEMSCYSDFPFPEDYPNYVPNSQFLEYLKMYANHFDLLKHIQFKTKVCSVTKCSDSA
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CCDS12 NSSKEMMCFPDFPFPDDFPNFMHNSKIQEYIIAFAKEKNLLKYIQFKTFVSSVNKHPDFA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VSGQWEVVTMHEEKQESAIFDAVMVCTGFLTNPYLPLDSFPGINAFKGQYFHSRQYKHPD
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CCDS12 TTGQWDVTTERDGKKESAVFDAVMVCSGHHVYPNLPKESFPGLNHFKGKCFHSRDYKEPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IFKDKRVLVIGMGNSGTDIAVEASHLAEKVFLSTTGGGWVISRIFDSGYPWDMVFMTRFQ
.:. :::::.:.:::: :::.: :. ::.:..:. .:.::.::..:.::::::...:::
CCDS12 VFNGKRVLVVGLGNSGCDIATELSRTAEQVMISSRSGSWVMSRVWDNGYPWDMLLVTRFG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NMLRNSLPTPIVTWLMERKINNWLNHANYGLIPEDRTQLKEFVLNDELPGRIITGKVFIR
..:.:.::: : ::. ...: ..: ::::.: . . :: :.:::::. :. : : ..
CCDS12 TFLKNNLPTAISDWLYVKQMNARFKHENYGLMPLNGVLRKEPVFNDELPASILCGIVSVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 PSIKEVKENSVIFNNTSKEEPIDIIVFATGYTFAFPFLDESVVKVEDGQASLYKYIFPAH
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CCDS12 PNVKEFTETSAIFEDGTIFEGIDCVIFATGYSFAYPFLDESIIKSRNNEIILFKGVFPPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 LQKPTLAIIGLIKPLGSMIPTGETQARWAVRVLKGVNKLPPPSVMIEEINARKENKPSWF
:.: :.:.::... ::. ::: . :.:::..:.::. :: :...:: . :.: .::
CCDS12 LEKSTIAVIGFVQSLGAAIPTVDLQSRWAAQVIKGTCTLPSMEDMMNDINEKMEKKRKWF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GLCYCKALQSDYITYIDELLTYINAKPNLFSMLLTDPHLALTVFFGPCSPYQFRLTGPGK
: ...:.:::.:.::: ..:.::::. ..::::.::. :.:::::::::::.:::.
CCDS12 G--KSETIQTDYIVYMDELSSFIGAKPNIPWLFLTDPKLAMEVYFGPCSPYQFRLVGPGQ
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KE6 WEGARNAIMTQWDRTFKVIKARVVQ--ESPSPFESFLKVFSFLALLVAIFLIFL
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CCDS12 WPGARNAILTQWDRSLKPMQTRVVGRLQKPCFFFHWLKLFAIPILLIAVFLVLT
480 490 500 510 520 530
>>CCDS926.1 FMO5 gene_id:2330|Hs108|chr1 (533 aa)
initn: 1375 init1: 1375 opt: 1909 Z-score: 2379.2 bits: 449.9 E(32554): 3.3e-126
Smith-Waterman score: 1909; 51.4% identity (79.5% similar) in 531 aa overlap (3-528:4-533)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAKRVAIVGAGVSGLASIKCCLEEGLEPTCFERSDDLGGLWRFTEHVEEGRASLYKSVV
::.:..:.:::::.:::::.::::::.::::.::.:::::: :. ::::::.::::.
CCDS92 MTKKRIAVIGGGVSGLSSIKCCVEEGLEPVCFERTDDIGGLWRFQENPEEGRASIYKSVI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 SNSCKEMSCYSDFPFPEDYPNYVPNSQFLEYLKMYANHFDLLKHIQFKTKVCSVTKCSDS
:. ::: :.::.:.:. :::.. :.: :::..:::..:::::.:.::: :::: : :
CCDS92 INTSKEMMCFSDYPIPDHYPNFMHNAQVLEYFRMYAKEFDLLKYIRFKTTVCSVKKQPDF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 AVSGQWEVVTMHEEKQESAIFDAVMVCTGFLTNPYLPLDSFPGINAFKGQYFHSRQYKHP
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CCDS92 ATSGQWEVVTESEGKKEMNVFDGVMVCTGHHTNAHLPLESFPGIEKFKGQYFHSRDYKNP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DIFKDKRVLVIGMGNSGTDIAVEASHLAEKVFLSTTGGGWVISRIFDSGYPWDMVFMTRF
. : :::..::.:::: :.::: :. :..::::: :.:...:. : ::: :..: .:.
CCDS92 EGFTGKRVIIIGIGNSGGDLAVEISQTAKQVFLSTRRGAWILNRVGDYGYPADVLFSSRL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 QNMLRNSLPTPIVTWLMERKINNWLNHANYGLIPEDRTQLKEFVLNDELPGRIITGKVFI
... . ... .:.:::. ..: .:: :. :. .. .:::.::.:::.: : .
CCDS92 THFIWKICGQSLANKYLEKKINQRFDHEMFGLKPKHRALSQHPTLNDDLPNRIISGLVKV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 RPSIKEVKENSVIFNNTSKEEPIDIIVFATGYTFAFPFLDESVVKVEDGQASLYKYIFPA
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CCDS92 KGNVKEFTETAAIFEDGSREDDIDAVIFATGYSFDFPFLEDSV-KVVKNKISLYKKVFPP
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 HLQKPTLAIIGLIKPLGSMIPTGETQARWAVRVLKGVNKLPPPSVMIEEINARKENKPSW
.:..:::::::::.:::...: .: :.:::..:.::.. :: : :. ::. .:. .
CCDS92 NLERPTLAIIGLIQPLGAIMPISELQGRWATQVFKGLKTLPSQSEMMAEISKAQEEIDKR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 FGLCYCKALQSDYITYIDELLTYINAKPNLFSMLLTDPHLALTVFFGPCSPYQFRLTGPG
. ...:.::: ..:: ....:::.:. .:::.::: ...:::.: ..:. :::
CCDS92 YVESQRHTIQGDYIDTMEELADLVGVRPNLLSLAFTDPKLALHLLLGPCTPIHYRVQGPG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 KWEGARNAIMTQWDRTFKVIKARVVQESPSPFES-----FLKVFSFLALLVAIFLIFL
::.:::.::.: :: : . .:::..: : . :. ...:.:...: :
CCDS92 KWDGARKAILTTDDRIRKPLMTRVVERSSSMTSTMTIGKFMLALAFFAIIIAYF
480 490 500 510 520 530
>>CCDS1295.1 FMO4 gene_id:2329|Hs108|chr1 (558 aa)
initn: 1874 init1: 1159 opt: 1884 Z-score: 2347.7 bits: 444.2 E(32554): 1.9e-124
Smith-Waterman score: 1884; 51.2% identity (78.0% similar) in 533 aa overlap (1-530:1-530)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAKRVAIVGAGVSGLASIKCCLEEGLEPTCFERSDDLGGLWRFTEHVEEGRASLYKSVVS
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CCDS12 MAKKVAVIGAGVSGLSSIKCCVDEDLEPTCFERSDDIGGLWKFTESSKDGMTRVYKSLVT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NSCKEMSCYSDFPFPEDYPNYVPNSQFLEYLKMYANHFDLLKHIQFKTKVCSVTKCSDSA
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