FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6696, 400 aa 1>>>pF1KE6696 400 - 400 aa - 400 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9899+/-0.000836; mu= 9.8278+/- 0.050 mean_var=123.2246+/-24.759, 0's: 0 Z-trim(111.7): 125 B-trim: 179 in 2/50 Lambda= 0.115538 statistics sampled from 12451 (12594) to 12451 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.387), width: 16 Scan time: 1.860 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10666.1 DOC2A gene_id:8448|Hs108|chr16 ( 400) 2699 460.8 1e-129 CCDS31904.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12 ( 690) 1402 244.7 1.9e-64 CCDS44979.1 RPH3A gene_id:22895|Hs108|chr12 ( 694) 1402 244.7 1.9e-64 CCDS73934.1 DOC2B gene_id:8447|Hs108|chr17 ( 412) 803 144.7 1.5e-34 CCDS45121.1 SYT16 gene_id:83851|Hs108|chr14 ( 645) 385 75.2 2e-13 CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 419) 354 69.9 5e-12 CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 ( 422) 354 69.9 5e-12 CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 ( 419) 350 69.2 7.9e-12 CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 382) 340 67.5 2.3e-11 CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 ( 386) 340 67.5 2.4e-11 CCDS871.1 SYT6 gene_id:148281|Hs108|chr1 ( 425) 334 66.6 5.1e-11 CCDS31577.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 403) 332 66.2 6.1e-11 CCDS73298.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 447) 332 66.2 6.7e-11 CCDS58139.1 SYT7 gene_id:9066|Hs108|chr11 ( 478) 332 66.3 7e-11 >>CCDS10666.1 DOC2A gene_id:8448|Hs108|chr16 (400 aa) initn: 2699 init1: 2699 opt: 2699 Z-score: 2442.2 bits: 460.8 E(32554): 1e-129 Smith-Waterman score: 2699; 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CCDS73 RPAVAGAGRRSPSDGAREDDEDVDQLFGAYGSSPGPSPGPSPARPPAKPPEDEPDADGYE 70 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 SDDATALGTLEFDLLYDRASCTLHCSILRAKGLKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKANKL ::: ::::::.:.::::. . .:::.: .:::::::: :::::::::::::::: ::::: CCDS73 SDDCTALGTLDFSLLYDQENNALHCTITKAKGLKPMDHNGLADPYVKLHLLPGASKANKL 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 KTKTQRNTLNPVWNEDLTYSGITDDDITHKVLRIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKP .::: ::::::.::: ::: ::::.:. .:.:::.::::::. ::::::: ::::..::: CCDS73 RTKTLRNTLNPTWNETLTYYGITDEDMIRKTLRISVCDEDKFRHNEFIGETRVPLKKLKP 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 SQKKHFNICLERQVPLASPSSMSAALRGISCYLKELEQAEQGQGLLEERGRILLSLSYSS .. : :.::::.:.:. . . : ::::::::.::.::: CCDS73 NHTKTFSICLEKQLPVDKTEDKS----------------------LEERGRILISLKYSS 250 260 270 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 RRRGLLVGILRCAHLAAMDVNGYSDPYVKTYLRPDVDKKSKHKTCVKKKTLNPEFNEEFF ...::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::: CCDS73 QKQGLLVGIVRCAHLAAMDANGYSDPYVKTYLRPDVDKKSKHKTAVKKKTLNPEFNEEFC 280 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 YEIELSTLATKTLEVTVWDYDIGKSNDFIGGVSLGPGARGEARKHWSDCLQQPDAALERW :::. . :: :.:::::::::::::::::::: :: :.:: ::: :::.. : .::: CCDS73 YEIKHGDLAKKSLEVTVWDYDIGKSNDFIGGVVLGIHAKGERLKHWFDCLKNKDKRIERW 340 350 360 370 380 390 390 400 pF1KE6 HTLTSELPPAAGALSSA :::::::: : CCDS73 HTLTSELPGAVLSD 400 410 >>CCDS45121.1 SYT16 gene_id:83851|Hs108|chr14 (645 aa) initn: 221 init1: 120 opt: 385 Z-score: 354.6 bits: 75.2 E(32554): 2e-13 Smith-Waterman score: 385; 27.8% identity (58.1% similar) in 313 aa overlap (78-386:339-642) 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 SGGEAPAHLVPLALAPPAALLGATTPEDGAEVDSYDSDDATALGTLEFDLLYDRASCTLH .: : :. . : :. . : :: : CCDS45 TAFNSRGFEDSYATDSSSMWSPEEQDRTNLQVPSGVSEPISKCGDLDVIFEYRAASQKLT 310 320 330 340 350 360 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 CSILRAKGLKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKANKLKTKTQRNTLNPVWNEDLTYSGITD .:.::.:: : .:. . :.. :::: : .. .:. ::. :::. : .:.. . CCDS45 VTIVRAQGLPDKDRSGVNSWQVHVVLLPG--KKHRGRTNIQRGP-NPVFREKVTFAKLEP 370 380 390 400 410 420 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 DDITHKVLRIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKPSQKKHFNICLERQVPLASPSSMSA :.. ..:. . :.......:: : .:.: . . .. :: : .. :: .. CCDS45 RDVAACAVRFRLYAARKMTRERMMGEKLFYLSHLHPEGEMKVTLVLE---PRSNISSGGS 430 440 450 460 470 480 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 ALRGISCYLKELEQAEQGQGLLEERG--RILLSLSYSSRRRGLLVGILRCAHLAAMDVNG : . .. .. :. : . : ..:..:::.. : : ... .:. . :: CCDS45 PLSPSAVSHSDSTSSTQS---LSHGGAPELLVGLSYNATTGRLSVEMIKGSHFRNLAVNR 490 500 510 520 530 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 YSDPYVKTYLRPDVDKK-SKHKTCVKKKTLNPEFNEEFFYEIELSTLATKTLEVTVWDYD : : : .: .: .. :. :: ... :: ..: : ... : :. :: ..:.. CCDS45 APDTYGKLFLLNSVGQEMSRCKTSIRRGQPNPVYKETFVFQVALFQLSDVTLMISVYNRR 540 550 560 570 580 590 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 IGKSNDFIGGVSLGPGARGEARK-HWSDCLQQPDAALERWHTLTSELPPAAGALSSA : ...:: ..:: .. :: .. :: . . . ::::: CCDS45 TMKRKEMIGWIALGQNSSGEEEQDHWEEMKETKGQQICRWHTLLES 600 610 620 630 640 >>CCDS76582.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 (419 aa) initn: 686 init1: 326 opt: 354 Z-score: 329.4 bits: 69.9 E(32554): 5e-12 Smith-Waterman score: 558; 37.0% identity (59.2% similar) in 316 aa overlap (75-389:127-408) 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 GGGSGGEAPAHLVPLALAPPAALLGATTPEDGAEVDSYDSDDATALGTLEFDLLYDRASC :: : . . . :: :...: :: . CCDS76 GGKNAINMKDVKDLGKTMKDQDDDAETGLTDGEEKE--EPKEEEKLGKLQYSLDYDFQNN 100 110 120 130 140 150 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 TLHCSILRAKGLKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKANKLKTKTQRNTLNPVWNEDLTYSG : .:..: : .:..: .:::::. ::: : .:..::..:.:::::.::..:.. CCDS76 QLLVGIIQAAELPALDMGGTSDPYVKVFLLPD--KKKKFETKVHRKTLNPVFNEQFTFK- 160 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 ITDDDITHKVLRIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKPSQKKHFNICLERQVPLASPSS . ... :.: .:: : :..:....:::..::. . :. :. : : CCDS76 VPYSELGGKTLVMAVYDFDRFSKHDIIGEFKVPMNTVD------FGHVTEEWRDLQSA-- 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 MSAALRGISCYLKELEQAEQGQGLLEERGRILLSLSYSSRRRGLLVGILRCAHLAAMDVN :. :: :. : : .:: : : : ::. .: :::. CCDS76 ---------------EKEEQ-----EKLGDICFSLRYVPTAGKLTVVILEAKNLKKMDVG 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 GYSDPYVKTYLRPDVDKKSKHKTCVKKKTLNPEFNEEFFYEIELSTLATKTLEVTVWDYD : :::::: .: . . .:.:: .::.:::: .:: : .:. . . . ::: ::: CCDS76 GLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTIKKNTLNPYYNESFSFEVPFEQIQKVQVVVTVLDYD 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 -IGKSNDFIGGVSLGPGARGEARKHWSDCLQQPDAALERWHTLTSELPPAAGALSSA ::: :: :: : .: .. : .:::: : .: . .:::: : CCDS76 KIGK-NDAIGKVFVGYNSTGAELRHWSDMLANPRRPIAQWHTLQVEEEVDAMLAVKK 370 380 390 400 410 >>CCDS9017.1 SYT1 gene_id:6857|Hs108|chr12 (422 aa) initn: 686 init1: 326 opt: 354 Z-score: 329.4 bits: 69.9 E(32554): 5e-12 Smith-Waterman score: 559; 36.9% identity (58.0% similar) in 331 aa overlap (60-389:118-411) 30 40 50 60 70 80 pF1KE6 RQISDYFPRGPGPEGGGGSGGEAPAHLVPLALAPPAALLGATTPEDGAEVDSYDSDDATA :: : : : :: : . . . CCDS90 KNKKKGKEKGGKNAINMKDVKDLGKTMKDQALKDDDAETGLT---DGEEKE--EPKEEEK 90 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 LGTLEFDLLYDRASCTLHCSILRAKGLKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKANKLKTKTQR :: :...: :: . : .:..: : .:..: .:::::. ::: : .:..::..: CCDS90 LGKLQYSLDYDFQNNQLLVGIIQAAELPALDMGGTSDPYVKVFLLPD--KKKKFETKVHR 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 NTLNPVWNEDLTYSGITDDDITHKVLRIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKPSQKKHF .:::::.::..:.. . ... :.: .:: : :..:....:::..::. . : CCDS90 KTLNPVFNEQFTFK-VPYSELGGKTLVMAVYDFDRFSKHDIIGEFKVPMNTVD------F 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 NICLERQVPLASPSSMSAALRGISCYLKELEQAEQGQGLLEERGRILLSLSYSSRRRGLL . :. : : :. :: :. : : .:: : : CCDS90 GHVTEEWRDLQSA-----------------EKEEQ-----EKLGDICFSLRYVPTAGKLT 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 VGILRCAHLAAMDVNGYSDPYVKTYLRPDVDKKSKHKTCVKKKTLNPEFNEEFFYEIELS : ::. .: :::.: :::::: .: . . .:.:: .::.:::: .:: : .:. . CCDS90 VVILEAKNLKKMDVGGLSDPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTIKKNTLNPYYNESFSFEVPFE 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 TLATKTLEVTVWDYD-IGKSNDFIGGVSLGPGARGEARKHWSDCLQQPDAALERWHTLTS . . ::: ::: ::: :: :: : .: .. : .:::: : .: . .:::: CCDS90 QIQKVQVVVTVLDYDKIGK-NDAIGKVFVGYNSTGAELRHWSDMLANPRRPIAQWHTLQV 360 370 380 390 400 410 390 400 pF1KE6 ELPPAAGALSSA : CCDS90 EEEVDAMLAVKK 420 >>CCDS1427.1 SYT2 gene_id:127833|Hs108|chr1 (419 aa) initn: 733 init1: 336 opt: 350 Z-score: 325.8 bits: 69.2 E(32554): 7.9e-12 Smith-Waterman score: 558; 36.7% identity (58.5% similar) in 313 aa overlap (78-389:128-408) 50 60 70 80 90 100 pF1KE6 SGGEAPAHLVPLALAPPAALLGATTPEDGAEVDSYDSDDATALGTLEFDLLYDRASCTLH : .. . . :: :.:.: :: . : CCDS14 KGKGMKNAMNMKDMKGGQDDDDAETGLTEGEGEGEEEKEPENLGKLQFSLDYDFQANQLT 100 110 120 130 140 150 110 120 130 140 150 160 pF1KE6 CSILRAKGLKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKANKLKTKTQRNTLNPVWNEDLTYSGITD ..:.: : .:..: .:::::. ::: : .: .::..:.::::..:: .:.. . CCDS14 VGVLQAAELPALDMGGTSDPYVKVFLLPD--KKKKYETKVHRKTLNPAFNETFTFK-VPY 160 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 DDITHKVLRIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKPSQKKHFNICLERQVPLASPSSMSA ... :.: .:. : :..:....:::..::. : :..: CCDS14 QELGGKTLVMAIYDFDRFSKHDIIGEVKVPMNT----------------VDLGQPIEEWR 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 ALRGISCYLKELEQAEQGQGLLEERGRILLSLSYSSRRRGLLVGILRCAHLAAMDVNGYS :.: : :. :. : : :: : : : ::. .: :::.: : CCDS14 DLQG-----GEKEEPEK-------LGDICTSLRYVPTAGKLTVCILEAKNLKKMDVGGLS 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 DPYVKTYLRPDVDKKSKHKTCVKKKTLNPEFNEEFFYEIELSTLATKTLEVTVWDYD-IG ::::: .: . . .:.:: :::::::: ::: : .:: . . . ::: ::: .: CCDS14 DPYVKIHLMQNGKRLKKKKTTVKKKTLNPYFNESFSFEIPFEQIQKVQVVVTVLDYDKLG 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE6 KSNDFIGGVSLGPGARGEARKHWSDCLQQPDAALERWHTLTSELPPAAGALSSA : :. :: . .: .: : .:::: : .: . .::.: : CCDS14 K-NEAIGKIFVGSNATGTELRHWSDMLANPRRPIAQWHSLKPEEEVDALLGKNK 370 380 390 400 410 >>CCDS74455.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 (382 aa) initn: 697 init1: 296 opt: 340 Z-score: 317.4 bits: 67.5 E(32554): 2.3e-11 Smith-Waterman score: 548; 35.4% identity (57.3% similar) in 342 aa overlap (58-392:68-373) 30 40 50 60 70 80 pF1KE6 PIRQISDYFPRGPGPEGGGGSGGEAPAHLVPLALAPPAALLGATTPEDGAEVDSYDSD-- : : :.: : . . :.. : CCDS74 GTRVLECLCRKDSRTPPPCSRSPQPRGLHRPTRLPTPVASATAQVQPEVEELEPAPSGPG 40 50 60 70 80 90 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 ----DATALGTLEFDLLYDRASCTLHCSILRAKGLKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKAN : :: :...: :: : : .::.: :: .:..: .::::...::: : CCDS74 QQVADKHELGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMGLAALDLGGSSDPYVRVYLLPD--KRR 100 110 120 130 140 150 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 KLKTKTQRNTLNPVWNEDLTYSGITDDDITHKVLRIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRL . .::..:.:::: ..: .... . .. .:: .:: : :..:.:. :::.:::. 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CCDS74 FSFEVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGK-NEAIGRVAVGAAAGGAGLRHWADMLANPRRPI 310 320 330 340 350 360 390 400 pF1KE6 ERWHTLTSELPPAAGALSSA .::.: :: CCDS74 AQWHSLR---PPDRVRLLPAP 370 380 >>CCDS12919.1 SYT5 gene_id:6861|Hs108|chr19 (386 aa) initn: 697 init1: 296 opt: 340 Z-score: 317.3 bits: 67.5 E(32554): 2.4e-11 Smith-Waterman score: 547; 37.0% identity (59.7% similar) in 308 aa overlap (86-392:105-377) 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 LVPLALAPPAALLGATTPEDGAEVDSYDSDDATALGTLEFDLLYDRASCTLHCSILRAKG : :: :...: :: : : .::.: : CCDS12 KGLGQSYIDKVQPEVEELEPAPSGPGQQVADKHELGRLQYSLDYDFQSGQLLVGILQAMG 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 LKPMDFNGLADPYVKLHLLPGACKANKLKTKTQRNTLNPVWNEDLTYSGITDDDITHKVL : .:..: .::::...::: : . .::..:.:::: ..: .... . .. .:: CCDS12 LAALDLGGSSDPYVRVYLLPD--KRRRYETKVHRQTLNPHFGETFAFK-VPYVELGGRVL 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 RIAVCDEDKLSHNEFIGEIRVPLRRLKPSQKKHFNICLERQVPLASPSSMSAALRGISCY .:: : :..:.:. :::.:::. .. : : :. . ..:: : CCDS12 VMAVYDFDRFSRNDAIGEVRVPMS----------SVDLGR--PVQAWRELQAAPR----- 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 LKELEQAEQGQGLLEERGRILLSLSYSSRRRGLLVGILRCAHLAAMDVNGYSDPYVKTYL :: :. : : .:: : : : .:. .: :::.: ::::::..: CCDS12 ------EEQ-----EKLGDICFSLRYVPTAGKLTVIVLEAKNLKKMDVGGLSDPYVKVHL 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 RPDVDKKSKHKTCVKKKTLNPEFNEEFFYEIELSTLATKTLEVTVWDYD-IGKSNDFIGG : :.:: .::.:::: .:: : .:. . . .:.:: ::: .:: :. :: CCDS12 LQGGKKVRKKKTTIKKNTLNPYYNEAFSFEVPCDQVQKVQVELTVLDYDKLGK-NEAIGR 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 pF1KE6 VSLGPGARGEARKHWSDCLQQPDAALERWHTLTSELPPAAGALSSA :..: .: : . .::.: : .: . .::.: :: CCDS12 VAVGAAAGGAGLRHWADMLANPRRPIAQWHSLR---PPDRVRLLPAP 350 360 370 380 400 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 15:29:46 2016 done: Tue Nov 8 15:29:46 2016 Total Scan time: 1.860 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]