Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6481
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6481, 513 aa
1>>>pF1KE6481 513 - 513 aa - 513 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4854+/- 0.001; mu= 16.6778+/- 0.060
mean_var=59.6542+/-11.800, 0's: 0 Z-trim(102.1): 27 B-trim: 3 in 1/51
Lambda= 0.166056
statistics sampled from 6813 (6822) to 6813 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 2.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1912.1 ATP6V1B1 gene_id:525|Hs108|chr2 ( 513) 3386 820.1 0
CCDS6014.1 ATP6V1B2 gene_id:526|Hs108|chr8 ( 511) 2871 696.7 1.6e-200
CCDS58620.1 ATP5A1 gene_id:498|Hs108|chr18 ( 503) 393 103.0 8e-22
CCDS11927.1 ATP5A1 gene_id:498|Hs108|chr18 ( 553) 393 103.1 8.8e-22
CCDS8924.1 ATP5B gene_id:506|Hs108|chr12 ( 529) 361 95.4 1.7e-19
CCDS59315.1 ATP5A1 gene_id:498|Hs108|chr18 ( 531) 311 83.4 6.9e-16
CCDS2976.1 ATP6V1A gene_id:523|Hs108|chr3 ( 617) 289 78.2 3.1e-14
>>CCDS1912.1 ATP6V1B1 gene_id:525|Hs108|chr2 (513 aa)
initn: 3386 init1: 3386 opt: 3386 Z-score: 4380.2 bits: 820.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3386; 100.0% identity (100.0% similar) in 513 aa overlap (1-513:1-513)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAMEIDSRPGGLPGSSCNLGAAREHMQAVTRNYITHPRVTYRTVCSVNGPLVVLDRVKFA
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CCDS19 MAMEIDSRPGGLPGSSCNLGAAREHMQAVTRNYITHPRVTYRTVCSVNGPLVVLDRVKFA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 QYAEIVHFTLPDGTQRSGQVLEVAGTKAIVQVFEGTSGIDARKTTCEFTGDILRTPVSED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 QYAEIVHFTLPDGTQRSGQVLEVAGTKAIVQVFEGTSGIDARKTTCEFTGDILRTPVSED
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 MLGRVFNGSGKPIDKGPVVMAEDFLDINGQPINPHSRIYPEEMIQTGISPIDVMNSIARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 MLGRVFNGSGKPIDKGPVVMAEDFLDINGQPINPHSRIYPEEMIQTGISPIDVMNSIARG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 QKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKAVLDYHDDNFAIVFAAMGVNMETARFFKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 QKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKAVLDYHDDNFAIVFAAMGVNMETARFFKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 DFEQNGTMGNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 DFEQNGTMGNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGRGGSITQIPILTMPNDDITHPIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 LREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGRGGSITQIPILTMPNDDITHPIP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 DLTGFITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVSNQLYACY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 DLTGFITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVSNQLYACY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 AIGKDVQAMKAVVGEEALTSEDLLYLEFLQKFEKNFINQGPYENRSVFESLDLGWKLLRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 AIGKDVQAMKAVVGEEALTSEDLLYLEFLQKFEKNFINQGPYENRSVFESLDLGWKLLRI
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE6 FPKEMLKRIPQAVIDEFYSREGALQDLAPDTAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 FPKEMLKRIPQAVIDEFYSREGALQDLAPDTAL
490 500 510
>>CCDS6014.1 ATP6V1B2 gene_id:526|Hs108|chr8 (511 aa)
initn: 2870 init1: 2870 opt: 2871 Z-score: 3713.5 bits: 696.7 E(32554): 1.6e-200
Smith-Waterman score: 2871; 87.3% identity (96.0% similar) in 495 aa overlap (9-503:20-509)
10 20 30 40
pF1KE6 MAMEIDSRPGGLPGSSCNLGAAREHMQAVTRNYITHPRVTYRTVCSVNG
: : :. .:: ::. ::.:::...::.::.:: .:::
CCDS60 MALRAMRGIVNGAAPELPVPTGGPA----VGA-REQALAVSRNYLSQPRLTYKTVSGVNG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 PLVVLDRVKFAQYAEIVHFTLPDGTQRSGQVLEVAGTKAIVQVFEGTSGIDARKTTCEFT
:::.::.::: .::::::.::::::.::::::::.:.::.::::::::::::.::.::::
CCDS60 PLVILDHVKFPRYAEIVHLTLPDGTKRSGQVLEVSGSKAVVQVFEGTSGIDAKKTSCEFT
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 GDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPIDKGPVVMAEDFLDINGQPINPHSRIYPEEMIQTGIS
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CCDS60 GDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPIDRGPVVLAEDFLDIMGQPINPQCRIYPEEMIQTGIS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 PIDVMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKAVLDYHDDNFAIVFAAMG
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.:: ..::::::::::
CCDS60 AIDGMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYSEENFAIVFAAMG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 VNMETARFFKSDFEQNGTMGNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLV
::::::::::::::.::.: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VNMETARFFKSDFEENGSMDNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 ILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGRGGSITQIPILT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS60 ILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGRNGSITQIPILT
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 MPNDDITHPIPDLTGFITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDH
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDH
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 GDVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSEDLLYLEFLQKFEKNFINQGPYENRSVFE
.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::: :::::::.:::
CCDS60 ADVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSDDLLYLEFLQKFERNFIAQGPYENRTVFE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KE6 SLDLGWKLLRIFPKEMLKRIPQAVIDEFYSREGALQDLAPDTAL
.::.::.:::::::::::::::....::: :..:
CCDS60 TLDIGWQLLRIFPKEMLKRIPQSTLSEFYPRDSAKH
480 490 500 510
>>CCDS58620.1 ATP5A1 gene_id:498|Hs108|chr18 (503 aa)
initn: 261 init1: 141 opt: 393 Z-score: 505.2 bits: 103.0 E(32554): 8e-22
Smith-Waterman score: 393; 25.4% identity (58.1% similar) in 472 aa overlap (44-504:24-472)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 GSSCNLGAAREHMQAVTRNYITHPRVTYRTVCSVNGPLVVLDRVKFAQYAEIVHFTLPDG
: :.. .. . .. .: :.:.:. .:
CCDS58 MSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFS--SG
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 TQRSGQVLEVAGTKAIVQVFEGTSGIDARKTTCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPI
. :. :.. .. : :: :.. . . . :: :. .::.:..:::: .. :. :
CCDS58 LK--GMSLNLEPDNVGVVVF-GNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAI
60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 D-KGPV-VMAEDFLDINGQPINPHSRIYPEEMIQTGISPIDVMNSIARGQKIPIFSAAGL
: :::. .. . ... : : :: .: .::::. .: . :.:::. :..
CCDS58 DGKGPIGSKTRRRVGLKAPGIIP--RISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQT
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240
pF1KE6 PHNEIAAQICRQAGLVKKSKAVLDYHDDNFAI--VFAAMGVNMETARFFKSDFEQNGTMG
.. :: . . ..: : :.. . ...:.: . :. . . . . .:
CCDS58 GKTSIAIDT------IINQKRFNDGSDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMK
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAARE
. . :.: . . ..: . . .:.. . ::.:.: :.:. : : :..: .
CCDS58 YTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYF-RDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLR
230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 EVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGR--GGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGFIT
. :::...:: .. . . :::.... :::.: .:.. :.. :: . ::
CCDS58 RPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISIT
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 EGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVSNQLYACYAIGKDVQ
.:::... .: . : : ::: :.::. ..: ..: .. : .. .: : : ..:
CCDS58 DGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAM-KQVAGTMKLEL-AQY---REVA
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 AMKAVVGEEALTSEDLLYLEFLQKFEKNFINQGPYENRSVFESLDLGWKLLRIF-----P
:. : : . .. . : . .. : ...:: : .. :.. . . .: . :
CCDS58 AF-AQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTE--LLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEP
400 410 420 430 440 450
490 500 510
pF1KE6 KEMLKRIPQAVIDEFYSREGALQDLAPDTAL
... : . .: ... :.. ::
CCDS58 SKITK-FENAFLSHVVSQHQALLGTIRADGKISEQSDAKLKEIVTNFLAGFEA
460 470 480 490 500
>>CCDS11927.1 ATP5A1 gene_id:498|Hs108|chr18 (553 aa)
initn: 261 init1: 141 opt: 393 Z-score: 504.6 bits: 103.1 E(32554): 8.8e-22
Smith-Waterman score: 393; 25.4% identity (58.1% similar) in 472 aa overlap (44-504:74-522)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 GSSCNLGAAREHMQAVTRNYITHPRVTYRTVCSVNGPLVVLDRVKFAQYAEIVHFTLPDG
: :.. .. . .. .: :.:.:. .:
CCDS11 QKTGTAEMSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFS--SG
50 60 70 80 90 100
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 TQRSGQVLEVAGTKAIVQVFEGTSGIDARKTTCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPI
. :. :.. .. : :: :.. . . . :: :. .::.:..:::: .. :. :
CCDS11 LK--GMSLNLEPDNVGVVVF-GNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAI
110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 D-KGPV-VMAEDFLDINGQPINPHSRIYPEEMIQTGISPIDVMNSIARGQKIPIFSAAGL
: :::. .. . ... : : :: .: .::::. .: . :.:::. :..
CCDS11 DGKGPIGSKTRRRVGLKAPGIIP--RISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQT
160 170 180 190 200 210
200 210 220 230 240
pF1KE6 PHNEIAAQICRQAGLVKKSKAVLDYHDDNFAI--VFAAMGVNMETARFFKSDFEQNGTMG
.. :: . . ..: : :.. . ...:.: . :. . . . . .:
CCDS11 GKTSIAIDT------IINQKRFNDGSDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMK
220 230 240 250 260 270
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 NVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAARE
. . :.: . . ..: . . .:.. . ::.:.: :.:. : : :..: .
CCDS11 YTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYF-RDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLR
280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 EVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGR--GGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGFIT
. :::...:: .. . . :::.... :::.: .:.. :.. :: . ::
CCDS11 RPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISIT
330 340 350 360 370 380
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 EGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVSNQLYACYAIGKDVQ
.:::... .: . : : ::: :.::. ..: ..: .. : .. .: : : ..:
CCDS11 DGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAM-KQVAGTMKLEL-AQY---REVA
390 400 410 420 430 440
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 AMKAVVGEEALTSEDLLYLEFLQKFEKNFINQGPYENRSVFESLDLGWKLLRIF-----P
:. : : . .. . : . .. : ...:: : .. :.. . . .: . :
CCDS11 AF-AQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTE--LLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEP
450 460 470 480 490 500
490 500 510
pF1KE6 KEMLKRIPQAVIDEFYSREGALQDLAPDTAL
... : . .: ... :.. ::
CCDS11 SKITK-FENAFLSHVVSQHQALLGTIRADGKISEQSDAKLKEIVTNFLAGFEA
510 520 530 540 550
>>CCDS8924.1 ATP5B gene_id:506|Hs108|chr12 (529 aa)
initn: 373 init1: 147 opt: 361 Z-score: 463.5 bits: 95.4 E(32554): 1.7e-19
Smith-Waterman score: 442; 26.2% identity (55.5% similar) in 503 aa overlap (12-497:26-499)
10 20 30 40
pF1KE6 MAMEIDSRPGGLPGSSCNLGAAREHMQAVTRNYITH----PRVTYR
:: .. : :: .. : :.: .. :..
CCDS89 MLGFVGRVAAAPASGALRRLTPSASLPPAQLLLRAAPTAVHPV-RDYAAQTSPSPKAGAA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KE6 T--VCSVNGPLVVLDRVKFAQYAEIVHFTLPDGTQRSGQVLEVA---GTKAIVQV-FEGT
: . .: : .:.: :.: . . .: ... ::::: : ... . ..::
CCDS89 TGRIVAVIG--AVVD-VQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGT
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 SGIDARKTTCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPID-KGPVVMAEDFLDINGQPINPH
:. .: .: .. ::. . :::..: :.::: .::. ...: :... .
CCDS89 EGL-VRGQKVLDSGAPIKIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPI-KTKQFAPIHAEAPEFM
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 SRIYPEEMIQTGISPIDVMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKAVLD
.:.. :::. .:.. :.: :: .:..::. .. . .. .. .::
CCDS89 EMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNV-----AKAHGG
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260
pF1KE6 YHDDNFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEQNGTMG------NVCLFLNLANDPTIERIITP
: :::..: . . . .. ..:... .: : . :.: : .
CCDS89 YS------VFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVA
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 RLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIY
.::.::.. : . ::... .. ...: :::: ..:. :. . ::..:.
CCDS89 LTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQ
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 ERAGRVEGRGGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGFITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVL
:: . . ::::.. . .: ::.: : : : .. ..: . . ::: .. :
CCDS89 ERI--TTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPL
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 PSLSRLMKSAIGEGMTRKDHGDVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSEDLLYLEFL
: ::.: : . ..: ::. . :..: . :..: . :. :: : .
CCDS89 DSTSRIMDPNI----VGSEHYDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRA
410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 QKFEKNFINQGPYENRSVFESLDLGWKLLRIFPKEMLKRIPQAVIDEFYSREGALQDLAP
.:... :..: :.. :: . .: ::. . :: .: . : . :.
CCDS89 RKIQR-FLSQ-PFQVAEVFTG-HMG-KLVPL--KETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVG
460 470 480 490 500 510
510
pF1KE6 DTAL
CCDS89 PIEEAVAKADKLAEEHSS
520
>>CCDS59315.1 ATP5A1 gene_id:498|Hs108|chr18 (531 aa)
initn: 202 init1: 141 opt: 311 Z-score: 398.7 bits: 83.4 E(32554): 6.9e-16
Smith-Waterman score: 326; 24.2% identity (55.9% similar) in 454 aa overlap (75-504:69-500)
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 CSVNGPLVVLDRVKFAQYAEIVHFTLPDGTQRSGQVLEVAGTKAIVQVFEGTSGIDARKT
...:.:: .. : :. : ...:..
CCDS59 SNTHLQKTGTAEMSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVH---GLRNVQAEEM
40 50 60 70 80 90
110 120 130 140 150
pF1KE6 TCEFTGDI--LRTPVSEDMLGRVFNGSGKPIDKGPVVMAEDFLDINGQPINPHSR-----
. ::.. . . . : .: : :. : : .: .: . ..: ::. ..:
CCDS59 V-EFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAI-VDG-PIGSKTRRRVGL
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200
pF1KE6 ----IYPE----EMIQTGISPIDVMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKK
: :. : .::::. .: . :.:::. :.. .. :: . . .
CCDS59 KAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDT------IIN
160 170 180 190 200
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