Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6463
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6463, 500 aa
1>>>pF1KE6463 500 - 500 aa - 500 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1400+/-0.00096; mu= 18.9169+/- 0.057
mean_var=62.0282+/-12.526, 0's: 0 Z-trim(104.1): 37 B-trim: 0 in 0/46
Lambda= 0.162847
statistics sampled from 7677 (7712) to 7677 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 2.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10128.1 SLC24A5 gene_id:283652|Hs108|chr15 ( 500) 3315 787.7 0
CCDS13140.1 SLC24A3 gene_id:57419|Hs108|chr20 ( 644) 631 157.2 5e-38
CCDS45156.1 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 ( 558) 616 153.6 5.1e-37
CCDS9903.2 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 ( 622) 616 153.7 5.6e-37
CCDS45155.2 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 ( 603) 609 152.0 1.7e-36
CCDS55297.1 SLC24A2 gene_id:25769|Hs108|chr9 ( 644) 593 148.3 2.4e-35
CCDS6493.1 SLC24A2 gene_id:25769|Hs108|chr9 ( 661) 593 148.3 2.5e-35
CCDS73744.1 SLC24A1 gene_id:9187|Hs108|chr15 (1012) 565 141.8 3.4e-33
CCDS73743.1 SLC24A1 gene_id:9187|Hs108|chr15 (1081) 565 141.8 3.6e-33
CCDS73742.1 SLC24A1 gene_id:9187|Hs108|chr15 (1069) 564 141.6 4.2e-33
CCDS45284.1 SLC24A1 gene_id:9187|Hs108|chr15 (1099) 564 141.6 4.3e-33
CCDS81744.1 SLC8B1 gene_id:80024|Hs108|chr12 ( 528) 309 81.5 2.5e-15
CCDS31909.1 SLC8B1 gene_id:80024|Hs108|chr12 ( 584) 251 67.9 3.5e-11
>>CCDS10128.1 SLC24A5 gene_id:283652|Hs108|chr15 (500 aa)
initn: 3315 init1: 3315 opt: 3315 Z-score: 4205.7 bits: 787.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3315; 100.0% identity (100.0% similar) in 500 aa overlap (1-500:1-500)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MQTKGGQTWARRALLLGILWATAHLPLSGTSLPQRLPRATGNSTQCVISPSSEFPEGFFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MQTKGGQTWARRALLLGILWATAHLPLSGTSLPQRLPRATGNSTQCVISPSSEFPEGFFT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 RQERRDGGIIIYFLIIVYMFMAISIVCDEYFLPSLEIISESLGLSQDVAGTTFMAAGSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RQERRDGGIIIYFLIIVYMFMAISIVCDEYFLPSLEIISESLGLSQDVAGTTFMAAGSSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 PELVTAFLGVFITKGDIGISTILGSAIYNLLGICAACGLLSNTVSTLSCWPLFRDCAAYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PELVTAFLGVFITKGDIGISTILGSAIYNLLGICAACGLLSNTVSTLSCWPLFRDCAAYT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 ISAAAVLGIIYDNQVYWYEGALLLLIYGLYVLVLCFDIKINQYIIKKCSPCCACLAKAME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ISAAAVLGIIYDNQVYWYEGALLLLIYGLYVLVLCFDIKINQYIIKKCSPCCACLAKAME
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 RSEQQPLMGWEDEGQPFIRRQSRTDSGIFYEDSGYSQLSISLHGLSQVSEDPPSVFNMPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RSEQQPLMGWEDEGQPFIRRQSRTDSGIFYEDSGYSQLSISLHGLSQVSEDPPSVFNMPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 ADLKRIFWVLSLPIITLLFLTTPDCRKKFWKNYFVITFFMSAIWISAFTYILVWMVTITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ADLKRIFWVLSLPIITLLFLTTPDCRKKFWKNYFVITFFMSAIWISAFTYILVWMVTITG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 ETLEIPDTVMGLTLLAAGTSIPDTIASVLVARKGKGDMAMSNIVGSNVFDMLCLGIPWFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ETLEIPDTVMGLTLLAAGTSIPDTIASVLVARKGKGDMAMSNIVGSNVFDMLCLGIPWFI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 KTAFINGSAPAEVNSRGLTYITISLNISIIFLFLAVHFNGWKLDRKLGIVCLLSYLGLAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KTAFINGSAPAEVNSRGLTYITISLNISIIFLFLAVHFNGWKLDRKLGIVCLLSYLGLAT
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE6 LSVLYELGIIGNNKIRGCGG
::::::::::::::::::::
CCDS10 LSVLYELGIIGNNKIRGCGG
490 500
>>CCDS13140.1 SLC24A3 gene_id:57419|Hs108|chr20 (644 aa)
initn: 1150 init1: 631 opt: 631 Z-score: 796.2 bits: 157.2 E(32554): 5e-38
Smith-Waterman score: 958; 36.7% identity (60.8% similar) in 490 aa overlap (42-428:83-572)
20 30 40 50 60 70
pF1KE6 RALLLGILWATAHLPLSGTSLPQRLPRATGNSTQCVISPSSEFPEGFFTRQERRDGGIII
:: .:. :::. .:: ..::.:....
CCDS13 DLVGEDRKWMMARKLMQVNDTLTSEDAGLRNSKNCTEPALHEFPNDIFTNEDRRQGAVVL
60 70 80 90 100 110
80 90 100 110 120 130
pF1KE6 YFLIIVYMFMAISIVCDEYFLPSLEIISESLGLSQDVAGTTFMAAGSSAPELVTAFLGVF
. : .:::.:..::::..:.:::: : : : ::.::::.:::::::::::: :. .:::
CCDS13 HVLCAIYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSAPELFTSVIGVF
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KE6 ITKGDIGISTILGSAIYNLLGICAACGLLSNTVSTLSCWPLFRDCAAYTISAAAVLGIIY
:::::.:..::.:::..:.: : ..:::... : .:: : :.:: ::.:. :.. .::
CCDS13 ITKGDVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVALSSWCLLRDSIYYTLSVIALIVFIY
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230
pF1KE6 DNQVYWYEGALLLLIYGLYVLVL--------CFDIKI-----------NQYIIKKCSPCC
:..: :.:. .:.:.: .:.... ::. . :. : : :
CCDS13 DEKVSWWESLVLVLMYLIYIVIMKYNACIHQCFERRTKGAGNMVNGLANNAEIDDSSNCD
240 250 260 270 280 290
240 250 260
pF1KE6 AC---LAKAMERSEQQPLM------------GWEDEGQ--------PFIRRQSRTDSGIF
: : :: . . . .: .. . : : : : .. ..
CCDS13 ATVVLLKKANFHRKASVIMVDELLSAYPHQLSFSEAGLRIMITSHFPPKTRLSMASRMLI
300 310 320 330 340 350
270 280
pF1KE6 YE----------DSGYSQLSISL-------HGLSQVS-----------------------
: .: :...:.. .: . :
CCDS13 NERQRLINSRAYTNGESEVAIKIPIKHTVENGTGPSSAPDRGVNGTRRDDVVAEAGNETE
360 370 380 390 400 410
290 300 310 320 330
pF1KE6 -------------------EDPPSVFNMPEADLKRIFWVLSLPIITLLFLTTPDCRKKFW
: : . :. : . :. . :... :. .:..:.:.: : :
CCDS13 NENEDNENDEEEEEDEDDDEGPYTPFDTPSGKLETVKWAFTWPLSFVLYFTVPNCNKPRW
420 430 440 450 460 470
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 KNYFVITFFMSAIWISAFTYILVWMVTITGETLEIPDTVMGLTLLAAGTSIPDTIASVLV
...:..:: :..::.::.:..:::::: : :: :::..::.:.::::::.:: .::..:
CCDS13 EKWFMVTFASSTLWIAAFSYMMVWMVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIV
480 490 500 510 520 530
400 410 420 430 440
pF1KE6 ARKGKGDMAMSNIVGSNVFDMLC-LGIPWFIKTAFIN-GSAPAEVNSRGLTYITISLNIS
::.: ::::.:: .::::::.: ::.:: ..: .. ::
CCDS13 ARQGMGDMAVSNSIGSNVFDILIGLGLPWALQTLAVDYGSYIRLNSRGLIYSVGLLLASV
540 550 560 570 580 590
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 IIFLFLAVHFNGWKLDRKLGIVCLLSYLGLATLSVLYELGIIGNNKIRGCGG
CCDS13 FVTVFGVHLNKWQLDKKLGCGCLLLYGVFLCFSIMTEFNVFTFVNLPMCGDH
600 610 620 630 640
>>CCDS45156.1 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 (558 aa)
initn: 1237 init1: 598 opt: 616 Z-score: 778.1 bits: 153.6 E(32554): 5.1e-37
Smith-Waterman score: 1025; 36.5% identity (64.1% similar) in 493 aa overlap (40-443:7-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 ARRALLLGILWATAHLPLSGTSLPQRLPRATGNSTQCVISPSSEFPEGFFTRQERRDGGI
: .. .:. ::: .:. .::. :..
CCDS45 MAPVNGTQTAKNCTDPAIHEFPTDLFSNKERQHGAV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IIYFLIIVYMFMAISIVCDEYFLPSLEIISESLGLSQDVAGTTFMAAGSSAPELVTAFLG
....: .:::.:..::::..:.:::: : : : ::.::::.::::::::.::: .. .:
CCDS45 LLHILGALYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSTPELFASVIG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VFITKGDIGISTILGSAIYNLLGICAACGLLSNTVSTLSCWPLFRDCAAYTISAAAVLGI
::::.::.:..::.:::..:.: : ..:::... : :. : . :: . ::::. ... .
CCDS45 VFITHGDVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVRLTWWAVCRDSVYYTISVIVLIVF
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IYDNQVYWYEGALLLLIYGLYVLVLCFDIKINQYI-IKKCS-----PCCACLAKAMERSE
:::.:. :.:: .:...: .:.:.. ...:.. .. .:. : : . : . . .
CCDS45 IYDEQIVWWEGLVLIILYVFYILIMKYNVKMQAFFTVKQKSIANGNPVNSELEAGNDFYD
160 170 180 190 200 210
250 260 270
pF1KE6 QQ------PLMGWEDE----GQ-PFI---RRQSRTDSGIFYEDSGY--------------
. ::.: : :. : . . .: . . . ..:
CCDS45 GSYDDPSVPLLGQVKEKPQYGKNPVVMVDEIMSSSPPKFTFPEAGLRIMITNKFGPRTRL
220 230 240 250 260 270
280 290
pF1KE6 ---SQLSI--------SLHGLS----------------------------QVSEDPP---
:.. : : .:.: : .. ::
CCDS45 RMASRIIINERQRLINSANGVSSKPLQNGRHENIENGNVPVENPEDPQQNQEQQPPPQPP
280 290 300 310 320 330
300 310 320 330 340
pF1KE6 ------------SVFNMPEADLKRIFWVLSLPIITLLFLTTPDCRKKFWKNYFVITFFMS
: :..::: .. ::.. :.: :: .: :.: : :...:..::. .
CCDS45 PPEPEPVEADFLSPFSVPEARGDKVKWVFTWPLIFLLCVTIPNCSKPRWEKFFMVTFITA
340 350 360 370 380 390
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 AIWISAFTYILVWMVTITGETLEIPDTVMGLTLLAAGTSIPDTIASVLVARKGKGDMAMS
..::..:.::.::.::: : :: :::..::.:.::::::.:: .::..:::.: ::::.:
CCDS45 TLWIAVFSYIMVWLVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGLGDMAVS
400 410 420 430 440 450
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 NIVGSNVFDMLC-LGIPWFIKTAFINGSAPAEVNSRGLTYITISLNISIIFLFLAVHFNG
: .::::::.: ::.:: ..: .: .. ...:::::.: ..
CCDS45 NTIGSNVFDILVGLGVPWGLQTMVVNYGSTVKINSRGLVYSVVLLLGSVALTVLGIHLNK
460 470 480 490 500 510
470 480 490 500
pF1KE6 WKLDRKLGIVCLLSYLGLATLSVLYELGIIGNNKIRGCGG
CCDS45 WRLDRKLGVYVLVLYAIFLCFSIMIEFNVFTFVNLPMCREDD
520 530 540 550
>>CCDS9903.2 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 (622 aa)
initn: 1237 init1: 598 opt: 616 Z-score: 777.4 bits: 153.7 E(32554): 5.6e-37
Smith-Waterman score: 1025; 36.5% identity (64.1% similar) in 493 aa overlap (40-443:71-563)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 ARRALLLGILWATAHLPLSGTSLPQRLPRATGNSTQCVISPSSEFPEGFFTRQERRDGGI
: .. .:. ::: .:. .::. :..
CCDS99 GSLGHKTASASKRVLPDTWRNRKLMAPVNGTQTAKNCTDPAIHEFPTDLFSNKERQHGAV
50 60 70 80 90 100
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IIYFLIIVYMFMAISIVCDEYFLPSLEIISESLGLSQDVAGTTFMAAGSSAPELVTAFLG
....: .:::.:..::::..:.:::: : : : ::.::::.::::::::.::: .. .:
CCDS99 LLHILGALYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSTPELFASVIG
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VFITKGDIGISTILGSAIYNLLGICAACGLLSNTVSTLSCWPLFRDCAAYTISAAAVLGI
::::.::.:..::.:::..:.: : ..:::... : :. : . :: . ::::. ... .
CCDS99 VFITHGDVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVRLTWWAVCRDSVYYTISVIVLIVF
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IYDNQVYWYEGALLLLIYGLYVLVLCFDIKINQYI-IKKCS-----PCCACLAKAMERSE
:::.:. :.:: .:...: .:.:.. ...:.. .. .:. : : . : . . .
CCDS99 IYDEQIVWWEGLVLIILYVFYILIMKYNVKMQAFFTVKQKSIANGNPVNSELEAGNDFYD
230 240 250 260 270 280
250 260 270
pF1KE6 QQ------PLMGWEDE----GQ-PFI---RRQSRTDSGIFYEDSGY--------------
. ::.: : :. : . . .: . . . ..:
CCDS99 GSYDDPSVPLLGQVKEKPQYGKNPVVMVDEIMSSSPPKFTFPEAGLRIMITNKFGPRTRL
290 300 310 320 330 340
280 290
pF1KE6 ---SQLSI--------SLHGLS----------------------------QVSEDPP---
:.. : : .:.: : .. ::
CCDS99 RMASRIIINERQRLINSANGVSSKPLQNGRHENIENGNVPVENPEDPQQNQEQQPPPQPP
350 360 370 380 390 400
300 310 320 330 340
pF1KE6 ------------SVFNMPEADLKRIFWVLSLPIITLLFLTTPDCRKKFWKNYFVITFFMS
: :..::: .. ::.. :.: :: .: :.: : :...:..::. .
CCDS99 PPEPEPVEADFLSPFSVPEARGDKVKWVFTWPLIFLLCVTIPNCSKPRWEKFFMVTFITA
410 420 430 440 450 460
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 AIWISAFTYILVWMVTITGETLEIPDTVMGLTLLAAGTSIPDTIASVLVARKGKGDMAMS
..::..:.::.::.::: : :: :::..::.:.::::::.:: .::..:::.: ::::.:
CCDS99 TLWIAVFSYIMVWLVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGLGDMAVS
470 480 490 500 510 520
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 NIVGSNVFDMLC-LGIPWFIKTAFINGSAPAEVNSRGLTYITISLNISIIFLFLAVHFNG
: .::::::.: ::.:: ..: .: .. ...:::::.: ..
CCDS99 NTIGSNVFDILVGLGVPWGLQTMVVNYGSTVKINSRGLVYSVVLLLGSVALTVLGIHLNK
530 540 550 560 570 580
470 480 490 500
pF1KE6 WKLDRKLGIVCLLSYLGLATLSVLYELGIIGNNKIRGCGG
CCDS99 WRLDRKLGVYVLVLYAIFLCFSIMIEFNVFTFVNLPMCREDD
590 600 610 620
>>CCDS45155.2 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 (603 aa)
initn: 1237 init1: 598 opt: 609 Z-score: 768.7 bits: 152.0 E(32554): 1.7e-36
Smith-Waterman score: 1101; 37.4% identity (65.7% similar) in 495 aa overlap (40-462:71-563)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 ARRALLLGILWATAHLPLSGTSLPQRLPRATGNSTQCVISPSSEFPEGFFTRQERRDGGI
: .. .:. ::: .:. .::. :..
CCDS45 GSLGHKTASASKRVLPDTWRNRKLMAPVNGTQTAKNCTDPAIHEFPTDLFSNKERQHGAV
50 60 70 80 90 100
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 IIYFLIIVYMFMAISIVCDEYFLPSLEIISESLGLSQDVAGTTFMAAGSSAPELVTAFLG
....: .:::.:..::::..:.:::: : : : ::.::::.::::::::.::: .. .:
CCDS45 LLHILGALYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSTPELFASVIG
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VFITKGDIGISTILGSAIYNLLGICAACGLLSNTVSTLSCWPLFRDCAAYTISAAAVLGI
::::.::.:..::.:::..:.: : ..:::... : :. : . :: . ::::. ... .
CCDS45 VFITHGDVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVRLTWWAVCRDSVYYTISVIVLIVF
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 IYDNQVYWYEGALLLLIYGLYVLVLCFDIKINQYI-IKKCS-----PCCACLAKAMER--
:::.:. :.:: .:...: .:.:.. ...:.. .. .:. : : . : . :.
CCDS45 IYDEQIVWWEGLVLIILYVFYILIMKYNVKMQAFFTVKQKSIANGNPVNSELEAVKEKPQ
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280
pF1KE6 -------------SEQQPLMGWEDEGQPFI-------RRQSRTDSGIFYEDSGYSQLSIS
: . : . . . : .. : . : : :. .. ..: :
CCDS45 YGKNPVVMVDEIMSSSPPKFTFPEAGLRIMITNKFGPRTRLRMASRIIINE--RQRLINS
290 300 310 320 330
290
pF1KE6 LHGLS----------------------------QVSEDPP---------------SVFNM
.:.: : .. :: : :..
CCDS45 ANGVSSKPLQNGRHENIENGNVPVENPEDPQQNQEQQPPPQPPPPEPEPVEADFLSPFSV
340 350 360 370 380 390
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 PEADLKRIFWVLSLPIITLLFLTTPDCRKKFWKNYFVITFFMSAIWISAFTYILVWMVTI
::: .. ::.. :.: :: .: :.: : :...:..::. ...::..:.::.::.:::
CCDS45 PEARGDKVKWVFTWPLIFLLCVTIPNCSKPRWEKFFMVTFITATLWIAVFSYIMVWLVTI
400 410 420 430 440 450
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 TGETLEIPDTVMGLTLLAAGTSIPDTIASVLVARKGKGDMAMSNIVGSNVFDMLC-LGIP
: :: :::..::.:.::::::.:: .::..:::.: ::::.:: .::::::.: ::.:
CCDS45 IGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGLGDMAVSNTIGSNVFDILVGLGVP
460 470 480 490 500 510
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 WFIKTAFINGSAPAEVNSRGLTYITISLNISIIFLFLAVHFNGWKLDRKLGIVCLLSYLG
: ..: .: .. ...:::::.: .. : :. . :..:.: :.
CCDS45 WGLQTMVVNYGSTVKINSRGLVYSVVLLLGSVALTVLGIHLNKWRLDRKLGVYVLVLYAI
520 530 540 550 560 570
480 490 500
pF1KE6 LATLSVLYELGIIGNNKIRGCGG
CCDS45 FLCFSIMIEFNVFTFVNLPMCREDD
580 590 600
>>CCDS55297.1 SLC24A2 gene_id:25769|Hs108|chr9 (644 aa)
initn: 1060 init1: 585 opt: 593 Z-score: 747.9 bits: 148.3 E(32554): 2.4e-35
Smith-Waterman score: 885; 33.9% identity (60.7% similar) in 501 aa overlap (33-450:99-598)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 TKGGQTWARRALLLGILWATAHLPLSGTSLPQRLPRATGNSTQCVISPSSEFPEGFFTRQ
:: :.: . . ....:. .:. .
CCDS55 EASVVSGPRVAQGYHQRTLLDLNDKILDYTPQPPLSKEGESENSTDHAQGDYPKDIFSLE
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 ERRDGGIIIYFLIIVYMFMAISIVCDEYFLPSLEIISESLGLSQDVAGTTFMAAGSSAPE
::: :.::.. . ..:::.:..:::::.:.::: .:.:.::.:.::::.::::::.::::
CCDS55 ERRKGAIILHVIGMIYMFIALAIVCDEFFVPSLTVITEKLGISDDVAGATFMAAGGSAPE
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LVTAFLGVFITKGDIGISTILGSAIYNLLGICAACGLLSNTVSTLSCWPLFRDCAAYTIS
: :...::::.....::.::.:::..:.: . . :.:.: . .:. :::::: . : ..
CCDS55 LFTSLIGVFIAHSNVGIGTIVGSAVFNILFVIGMCALFSREILNLTWWPLFRDVSFYIVD
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230
pF1KE6 AAAVLGIIYDNQVYWYEGALLLLIYGLYVLVLCFDIKINQYIIK-----KCSPCCACLAK
.. .. :: ..:.:. ::: : ::. . :........ . : : :.
CCDS55 LIMLIIFFLDNVIMWWESLLLLTAYFCYVVFMKFNVQVEKWVKQMINRNKVVKVTAPEAQ
250 260 270 280 290 300
240 250 260
pF1KE6 A---MERSEQQPLMGWEDEGQ--------------------------PFIRRQSRTDSGI
: :....: . . . : :. . . : ..:
CCDS55 AKPSAARDKDEPTLPAKPRLQRGGSSASLHNSLMRNSIFQLMIHTLDPLAEGRFREKASI
310 320 330 340 350 360
270 280
pF1KE6 FYE--------DSGYSQ------------------------------------LSISLHG
... : . : :: ...:
CCDS55 LHKIAKKKCHVDENERQNGAANHVEKIELPNSTSTDVEMTPSSDASEPVQNGNLSHNIEG
370 380 390 400 410 420
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 L-SQVS---EDPPSVFNMPEADLKRIFWVLSLPIITLLFLTTPDCRKKFWKNYFVITFFM
.:.. :: : . : :.. ... .::. :..: :: :: ...: ::::
CCDS55 AEAQTADEEEDQPLSLAWPSETRKQVTFLIVFPIVFPLWITLPDVRKPSSRKFFPITFFG
430 440 450 460 470 480
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 SAIWISAFTYILVWMVTITGETLEIPDTVMGLTLLAAGTSIPDTIASVLVARKGKGDMAM
: ::..:.:..:: . .:::. : . .::::.::::::::: :.::.::::: ::::.
CCDS55 SITWIAVFSYLMVWWAHQVGETIGISEEIMGLTILAAGTSIPDLITSVIVARKGLGDMAV
490 500 510 520 530 540
410 420 430 440 450
pF1KE6 SNIVGSNVFDMLC-LGIPWFIKTAFINGSAPAEVNSRGLTYITISLNISIIFLFLAVHFN
:. ::::.::. : .::.. :. :. :. :.: :: . : : ..
CCDS55 SSSVGSNIFDITVGLPLPWLLYTV-IHRFQPVAVSSNGLFCAIVLLFIMLLFVILSIALC
550 560 570 580 590 600
460 470 480 490 500
pF1KE6 GWKLDRKLGIVCLLSYLGLATLSVLYELGIIGNNKIRGCGG
CCDS55 KWRMNKILGFIMFGLYFVFLVVSVLLEDRILTCPVSI
610 620 630 640
>>CCDS6493.1 SLC24A2 gene_id:25769|Hs108|chr9 (661 aa)
initn: 1060 init1: 585 opt: 593 Z-score: 747.8 bits: 148.3 E(32554): 2.5e-35
Smith-Waterman score: 834; 33.3% identity (58.9% similar) in 501 aa overlap (33-433:99-598)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 TKGGQTWARRALLLGILWATAHLPLSGTSLPQRLPRATGNSTQCVISPSSEFPEGFFTRQ
:: :.: . . ....:. .:. .
CCDS64 EASVVSGPRVAQGYHQRTLLDLNDKILDYTPQPPLSKEGESENSTDHAQGDYPKDIFSLE
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 ERRDGGIIIYFLIIVYMFMAISIVCDEYFLPSLEIISESLGLSQDVAGTTFMAAGSSAPE
::: :.::.. . ..:::.:..:::::.:.::: .:.:.::.:.::::.::::::.::::
CCDS64 ERRKGAIILHVIGMIYMFIALAIVCDEFFVPSLTVITEKLGISDDVAGATFMAAGGSAPE
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LVTAFLGVFITKGDIGISTILGSAIYNLLGICAACGLLSNTVSTLSCWPLFRDCAAYTIS
: :...::::.....::.::.:::..:.: . . :.:.: . .:. :::::: . : ..
CCDS64 LFTSLIGVFIAHSNVGIGTIVGSAVFNILFVIGMCALFSREILNLTWWPLFRDVSFYIVD
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230
pF1KE6 AAAVLGIIYDNQVYWYEGALLLLIYGLYVLVLCFDIKINQYIIK-----KCSPCCACLAK
.. .. :: ..:.:. ::: : ::. . :........ . : : :.
CCDS64 LIMLIIFFLDNVIMWWESLLLLTAYFCYVVFMKFNVQVEKWVKQMINRNKVVKVTAPEAQ
250 260 270 280 290 300
240 250 260
pF1KE6 A---MERSEQQPLMGWEDEGQ--------------------------PFIRR--------
: :....: . . . : :. ..
CCDS64 AKPSAARDKDEPTLPAKPRLQRGGSSASLHNSLMRNSIFQLMIHTLDPLAEELGSYGKLK
310 320 330 340 350 360
270
pF1KE6 --QSRTDSGIFYE---------------DSGYSQ--------------------------
.. :. : : : : . :
CCDS64 YYDTMTEEGRFREKASILHKIAKKKCHVDENERQNGAANHVEKIELPNSTSTDVEMTPSS
370 380 390 400 410 420
280 290 300 310 320
pF1KE6 ----------LSISLHGL-SQVS---EDPPSVFNMPEADLKRIFWVLSLPIITLLFLTTP
:: ...: .:.. :: : . : :.. ... .::. :..: :
CCDS64 DASEPVQNGNLSHNIEGAEAQTADEEEDQPLSLAWPSETRKQVTFLIVFPIVFPLWITLP
430 440 450 460 470 480
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 DCRKKFWKNYFVITFFMSAIWISAFTYILVWMVTITGETLEIPDTVMGLTLLAAGTSIPD
: :: ...: :::: : ::..:.:..:: . .:::. : . .::::.:::::::::
CCDS64 DVRKPSSRKFFPITFFGSITWIAVFSYLMVWWAHQVGETIGISEEIMGLTILAAGTSIPD
490 500 510 520 530 540
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 TIASVLVARKGKGDMAMSNIVGSNVFDMLC-LGIPWFIKTAFINGSAPAEVNSRGLTYIT
:.::.::::: ::::.:. ::::.::. : .::.. :. :. :. :
CCDS64 LITSVIVARKGLGDMAVSSSVGSNIFDITVGLPLPWLLYTV-IHRFQPVAVSSNGLFCAI
550 560 570 580 590 600
450 460 470 480 490 500
pF1KE6 ISLNISIIFLFLAVHFNGWKLDRKLGIVCLLSYLGLATLSVLYELGIIGNNKIRGCGG
CCDS64 VLLFIMLLFVILSIALCKWRMNKILGFIMFGLYFVFLVVSVLLEDRILTCPVSI
610 620 630 640 650 660
>>CCDS73744.1 SLC24A1 gene_id:9187|Hs108|chr15 (1012 aa)
initn: 942 init1: 554 opt: 565 Z-score: 709.4 bits: 141.8 E(32554): 3.4e-33
Smith-Waterman score: 565; 37.8% identity (74.2% similar) in 225 aa overlap (22-246:413-632)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MQTKGGQTWARRALLLGILWATAHLPLSGTSLPQRLPRATGNSTQCVISPS
:: :: . :. :: . . . :.
CCDS73 VRAKLTMQVHHCVVVKPTPAMLTTPSPSLTTALLPEELSPSPSVLPPSLPD-----LHPK
390 400 410 420 430
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 SEFPEGFFTRQERRDGGIIIYFLIIVYMFMAISIVCDEYFLPSLEIISESLGLSQDVAGT
.:.: .:. .:::.: .... . ..:.:.:..:::::::.:.: .:...: .:.::::.
CCDS73 GEYPPDLFSVEERRQGWVVLHVFGMMYVFVALAIVCDEYFVPALGVITDKLQISEDVAGA
440 450 460 470 480 490
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 TFMAAGSSAPELVTAFLGVFITKGDIGISTILGSAIYNLLGICAACGLLSNTVSTLSCWP
::::::.::::: :...::::.....::.::.:::..:.: . ..:.:.: . .:. ::
CCDS73 TFMAAGGSAPELFTSLIGVFISHSNVGIGTIVGSAVFNILFVIGTCSLFSREILNLTWWP
500 510 520 530 540 550
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LFRDCAAYTISAAAVLGIIYDNQVYWYEGALLLLIYGLYVLVLCFDIKINQYIIKKCSPC
:::: . : .. .. .. :. . :.:. :::: :..::... .. .:. .. .. :
CCDS73 LFRDVSFYILDLIMLILFFLDSLIAWWESLLLLLAYAFYVFTMKWNKHIEVWVKEQLSRR
560 570 580 590 600 610
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CACLAKAMERSEQQPLMGWEDEGQPFIRRQSRTDSGIFYEDSGYSQLSISLHGLSQVSED
. . :.: . :
CCDS73 PVAKVMALEDLSKLPSLLTRGSSSTSLHNSTIRSTIYQLMLHSLDPLREVRLAKEKEEES
620 630 640 650 660 670
>--
initn: 499 init1: 402 opt: 412 Z-score: 515.2 bits: 105.9 E(32554): 2.2e-22
Smith-Waterman score: 412; 50.4% identity (80.5% similar) in 123 aa overlap (289-411:875-996)
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 RRQSRTDSGIFYEDSGYSQLSISLHGLSQVSEDPPSVFNMPEADLKRIFWVLSLPIITLL
.:.: :. . ::. :. .... :::. :
CCDS73 EEEEEEQEEEEEEEEQEEEEEEEEEEEEKGNEEPLSL-DWPETRQKQAIYLFLLPIVFPL
850 860 870 880 890 900
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 FLTTPDCRKKFWKNYFVITFFMSAIWISAFTYILVWMVTITGETLEIPDTVMGLTLLAAG
.::.:: :.. ...::.::. : .::. :.:..:: . .:::. : . .::::.::::
CCDS73 WLTVPDVRRQESRKFFVFTFLGSIMWIAMFSYLMVWWAHQVGETIGISEEIMGLTILAAG
910 920 930 940 950 960
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 TSIPDTIASVLVARKGKGDMAMSNIVGSNVFDMLCLGIPWFIKTAFINGSAPAEVNSRGL
::::: :.::.::::: ::::.:. ::::.::.
CCDS73 TSIPDLITSVIVARKGLGDMAVSSSVGSNIFDITVGVGSCEMFQHGAIH
970 980 990 1000 1010
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 TYITISLNISIIFLFLAVHFNGWKLDRKLGIVCLLSYLGLATLSVLYELGIIGNNKIRGC
>>CCDS73743.1 SLC24A1 gene_id:9187|Hs108|chr15 (1081 aa)
initn: 1036 init1: 554 opt: 565 Z-score: 709.0 bits: 141.8 E(32554): 3.6e-33
Smith-Waterman score: 565; 37.8% identity (74.2% similar) in 225 aa overlap (22-246:413-632)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MQTKGGQTWARRALLLGILWATAHLPLSGTSLPQRLPRATGNSTQCVISPS
:: :: . :. :: . . . :.
CCDS73 VRAKLTMQVHHCVVVKPTPAMLTTPSPSLTTALLPEELSPSPSVLPPSLPD-----LHPK
390 400 410 420 430
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 SEFPEGFFTRQERRDGGIIIYFLIIVYMFMAISIVCDEYFLPSLEIISESLGLSQDVAGT
.:.: .:. .:::.: .... . ..:.:.:..:::::::.:.: .:...: .:.::::.
CCDS73 GEYPPDLFSVEERRQGWVVLHVFGMMYVFVALAIVCDEYFVPALGVITDKLQISEDVAGA
440 450 460 470 480 490
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 TFMAAGSSAPELVTAFLGVFITKGDIGISTILGSAIYNLLGICAACGLLSNTVSTLSCWP
::::::.::::: :...::::.....::.::.:::..:.: . ..:.:.: . .:. ::
CCDS73 TFMAAGGSAPELFTSLIGVFISHSNVGIGTIVGSAVFNILFVIGTCSLFSREILNLTWWP
500 510 520 530 540 550
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LFRDCAAYTISAAAVLGIIYDNQVYWYEGALLLLIYGLYVLVLCFDIKINQYIIKKCSPC
:::: . : .. .. .. :. . :.:. :::: :..::... .. .:. .. .. :
CCDS73 LFRDVSFYILDLIMLILFFLDSLIAWWESLLLLLAYAFYVFTMKWNKHIEVWVKEQLSRR
560 570 580 590 600 610
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CACLAKAMERSEQQPLMGWEDEGQPFIRRQSRTDSGIFYEDSGYSQLSISLHGLSQVSED
. . :.: . :
CCDS73 PVAKVMALEDLSKLPSLLTRGSSSTSLHNSTIRSTIYQLMLHSLDPLREVRLAKEKEEES
620 630 640 650 660 670
>--
initn: 496 init1: 496 opt: 533 Z-score: 668.4 bits: 134.3 E(32554): 6.6e-31
Smith-Waterman score: 533; 41.9% identity (72.9% similar) in 203 aa overlap (289-490:875-1075)
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 RRQSRTDSGIFYEDSGYSQLSISLHGLSQVSEDPPSVFNMPEADLKRIFWVLSLPIITLL
.:.: :. . ::. :. .... :::. :
CCDS73 EEEEEEQEEEEEEEEQEEEEEEEEEEEEKGNEEPLSL-DWPETRQKQAIYLFLLPIVFPL
850 860 870 880 890 900
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 FLTTPDCRKKFWKNYFVITFFMSAIWISAFTYILVWMVTITGETLEIPDTVMGLTLLAAG
.::.:: :.. ...::.::. : .::. :.:..:: . .:::. : . .::::.::::
CCDS73 WLTVPDVRRQESRKFFVFTFLGSIMWIAMFSYLMVWWAHQVGETIGISEEIMGLTILAAG
910 920 930 940 950 960
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 TSIPDTIASVLVARKGKGDMAMSNIVGSNVFDMLC-LGIPWFIKTAFINGSAPAEVNSRG
::::: :.::.::::: ::::.:. ::::.::. : .::.. ..::: :. :.: :
CCDS73 TSIPDLITSVIVARKGLGDMAVSSSVGSNIFDITVGLPVPWLL-FSLINGLQPVPVSSNG
970 980 990 1000 1010 1020
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 LTYITISLNISIIFLFLAVHFNGWKLDRKLGIVCLLSYLGLATLSVLYELGIIGNNKIRG
: . : . ..:.. .. :.... ::.. .: :. . .::. : ::
CCDS73 LFCAIVLLFLMLLFVISSIASCKWRMNKILGFTMFLLYFVFLIISVMLEDRIISCPVSV
1030 1040 1050 1060 1070 1080
500
pF1KE6 CGG
>>CCDS73742.1 SLC24A1 gene_id:9187|Hs108|chr15 (1069 aa)
initn: 893 init1: 514 opt: 564 Z-score: 707.8 bits: 141.6 E(32554): 4.2e-33
Smith-Waterman score: 564; 39.4% identity (76.9% similar) in 208 aa overlap (22-229:413-615)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MQTKGGQTWARRALLLGILWATAHLPLSGTSLPQRLPRATGNSTQCVISPS
:: :: . :. :: . . . :.
CCDS73 VRAKLTMQVHHCVVVKPTPAMLTTPSPSLTTALLPEELSPSPSVLPPSLPD-----LHPK
390 400 410 420 430
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 SEFPEGFFTRQERRDGGIIIYFLIIVYMFMAISIVCDEYFLPSLEIISESLGLSQDVAGT
.:.: .:. .:::.: .... . ..:.:.:..:::::::.:.: .:...: .:.::::.
CCDS73 GEYPPDLFSVEERRQGWVVLHVFGMMYVFVALAIVCDEYFVPALGVITDKLQISEDVAGA
440 450 460 470 480 490
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 TFMAAGSSAPELVTAFLGVFITKGDIGISTILGSAIYNLLGICAACGLLSNTVSTLSCWP
::::::.::::: :...::::.....::.::.:::..:.: . ..:.:.: . .:. ::
CCDS73 TFMAAGGSAPELFTSLIGVFISHSNVGIGTIVGSAVFNILFVIGTCSLFSREILNLTWWP
500 510 520 530 540 550
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LFRDCAAYTISAAAVLGIIYDNQVYWYEGALLLLIYGLYVLVLCFDIKINQYIIKKCSPC
:::: . : .. .. .. :. . :.:. :::: :..::... .. .:. .. .. :
CCDS73 LFRDVSFYILDLIMLILFFLDSLIAWWESLLLLLAYAFYVFTMKWNKHIEVWVKEQLSRR
560 570 580 590 600 610
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 CACLAKAMERSEQQPLMGWEDEGQPFIRRQSRTDSGIFYEDSGYSQLSISLHGLSQVSED
CCDS73 PVAKVMALEDLSKPGDGAIAVDELQDNKKLKLPSLLTRGSSSTSLHNSTIRSTIYQLMLH
620 630 640 650 660 670
>--
initn: 414 init1: 325 opt: 358 Z-score: 446.2 bits: 93.2 E(32554): 1.6e-18
Smith-Waterman score: 376; 36.5% identity (62.1% similar) in 203 aa overlap (289-490:893-1063)
260 270 280 290 300 310
pF1KE6 RRQSRTDSGIFYEDSGYSQLSISLHGLSQVSEDPPSVFNMPEADLKRIFWVLSLPIITLL
.:.: :. . ::. :. .... :::. :
CCDS73 EEEEEEQEEEEEEEEQEEEEEEEEEEEEKGNEEPLSL-DWPETRQKQAIYLFLLPIVFPL
870 880 890 900 910 920
320 330 340 350 360 370
pF1KE6 FLTTPDCRKKFWKNYFVITFFMSAIWISAFTYILVWMVTITGETLEIPDTVMGLTLLAAG
.::.:: :.. .:::. : . .::::.::::
CCDS73 WLTVPDVRRQ------------------------------VGETIGISEEIMGLTILAAG
930 940 950
380 390 400 410 420 430
pF1KE6 TSIPDTIASVLVARKGKGDMAMSNIVGSNVFDMLC-LGIPWFIKTAFINGSAPAEVNSRG
::::: :.::.::::: ::::.:. ::::.::. : .::.. ..::: :. :.: :
CCDS73 TSIPDLITSVIVARKGLGDMAVSSSVGSNIFDITVGLPVPWLL-FSLINGLQPVPVSSNG
960 970 980 990 1000 1010
440 450 460 470 480 490
pF1KE6 LTYITISLNISIIFLFLAVHFNGWKLDRKLGIVCLLSYLGLATLSVLYELGIIGNNKIRG
: . : . ..:.. .. :.... ::.. .: :. . .::. : ::
CCDS73 LFCAIVLLFLMLLFVISSIASCKWRMNKILGFTMFLLYFVFLIISVMLEDRIISCPVSV
1020 1030 1040 1050 1060
500
pF1KE6 CGG
500 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 13:32:27 2016 done: Tue Nov 8 13:32:27 2016
Total Scan time: 2.080 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]