FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2561, 2551 aa 1>>>pF1KE2561 2551 - 2551 aa - 2551 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9825+/-0.0007; mu= 19.2436+/- 0.043 mean_var=260.9726+/-53.836, 0's: 0 Z-trim(111.5): 567 B-trim: 49 in 1/52 Lambda= 0.079392 statistics sampled from 19364 (20064) to 19364 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16 Scan time: 15.470 The best scores are: opt bits E(85289) NP_060034 (OMIM: 608561) stabilin-2 precursor [Hom (2551) 18199 2101.6 0 XP_016875074 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (2246) 16112 1862.4 0 XP_011536839 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (2283) 16111 1862.3 0 XP_011536840 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (2242) 16107 1861.9 0 XP_011536841 (OMIM: 608561) PREDICTED: stabilin-2 (1994) 14000 1620.5 0 XP_011536843 (OMIM: 608561) PREDICTED: 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(2789) 608 86.8 4.6e-15 XP_016882863 (OMIM: 608529) PREDICTED: fibrillin-3 (2777) 605 86.4 5.8e-15 NP_001308360 (OMIM: 608529) fibrillin-3 precursor (2809) 605 86.4 5.8e-15 NP_115823 (OMIM: 608529) fibrillin-3 precursor [Ho (2809) 605 86.4 5.8e-15 XP_016882861 (OMIM: 608529) PREDICTED: fibrillin-3 (2809) 605 86.4 5.8e-15 XP_016882868 (OMIM: 608529) PREDICTED: fibrillin-3 (2851) 605 86.4 5.9e-15 XP_016882865 (OMIM: 608529) PREDICTED: fibrillin-3 (2766) 577 83.2 5.4e-14 XP_016882866 (OMIM: 608529) PREDICTED: fibrillin-3 (1948) 539 78.6 9e-13 XP_016882864 (OMIM: 608529) PREDICTED: fibrillin-3 (2768) 516 76.2 6.8e-12 XP_016882867 (OMIM: 608529) PREDICTED: fibrillin-3 (1595) 483 72.1 6.9e-11 NP_001295048 (OMIM: 612453,614399) multiple epider ( 567) 471 70.1 1e-10 NP_001295050 (OMIM: 612453,614399) multiple epider ( 567) 471 70.1 1e-10 NP_115822 (OMIM: 612453,614399) multiple epidermal (1140) 472 70.6 1.4e-10 NP_001243474 (OMIM: 612453,614399) multiple epider (1140) 472 70.6 1.4e-10 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 LGKVLEIQKNRCDNNDTTIIRGRCRTCSSELTCPFGTKSLGNEKRRCIYTSYFMGRRTLF 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE2 IGCQPKCVRTVITRECCAGFFGPQCQPCPGNAQNVCFGNGICLDGVNGTGVCECGEGFSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 IGCQPKCVRTVITRECCAGFFGPQCQPCPGNAQNVCFGNGICLDGVNGTGVCECGEGFSG 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KE2 TACETCTEGKYGIHCDQACSCVHGRCNQGPLGDGSCDCDVGWRGVHCDNATTEDNCNGTC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 TACETCTEGKYGIHCDQACSCVHGRCNQGPLGDGSCDCDVGWRGVHCDNATTEDNCNGTC 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KE2 HTSANCLTNSDGTASCKCAAGFQGNGTICTAINACEISNGGCSAKADCKRTTPGRRVCTC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 HTSANCLTNSDGTASCKCAAGFQGNGTICTAINACEISNGGCSAKADCKRTTPGRRVCTC 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KE2 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