FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2134, 858 aa 1>>>pF1KE2134 858 - 858 aa - 858 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5266+/-0.00132; mu= 13.7744+/- 0.078 mean_var=110.3684+/-22.643, 0's: 0 Z-trim(101.8): 167 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.122082 statistics sampled from 6490 (6679) to 6490 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16 Scan time: 3.390 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs108|chr1 ( 858) 5692 1014.9 0 CCDS14152.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1041) 653 127.5 1.2e-28 CCDS14153.1 TLR8 gene_id:51311|Hs108|chrX (1059) 653 127.5 1.2e-28 CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs108|chrX (1049) 626 122.7 3.3e-27 CCDS2848.1 TLR9 gene_id:54106|Hs108|chr3 (1032) 521 104.2 1.2e-21 CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs108|chr4 ( 786) 449 91.5 6.4e-18 CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs108|chr4 ( 796) 401 83.0 2.3e-15 CCDS6818.1 TLR4 gene_id:7099|Hs108|chr9 ( 839) 388 80.7 1.2e-14 CCDS3307.1 GP5 gene_id:2814|Hs108|chr3 ( 560) 356 75.0 4.2e-13 CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4 ( 784) 357 75.3 4.8e-13 CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 605) 328 70.1 1.4e-11 CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 643) 328 70.1 1.4e-11 CCDS30855.1 LINGO4 gene_id:339398|Hs108|chr1 ( 593) 323 69.2 2.4e-11 >>CCDS31033.1 TLR5 gene_id:7100|Hs108|chr1 (858 aa) initn: 5692 init1: 5692 opt: 5692 Z-score: 5425.3 bits: 1014.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5692; 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CCDS14 SN-FYHFTRPLIKPQCAAYG----------------KALDLSLNSIFFIGPNQFENLPDI 490 500 510 520 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 QVLNLSYNLLGELYS-SNFYGLPKVAYIDLQKNHIAIIQDQTFKFLEKLQTLDLRDN--- :::: : ... : ..: ..:.: :.:: .:.. . . ... : :..::: : CCDS14 ACLNLSANSNAQVLSGTEFSAIPHVKYLDLTNNRLDFDNASALTELSDLEVLDLSYNSHY 530 540 550 560 570 580 400 410 420 430 pF1KE2 ---ALTTIH--FIPSIPDIF---LSGNKLVTLP-KINL-TANLIHL--SENRLENL---- : .: : :: .. .. :: :.. :: : :: . .:..: : :::. : CCDS14 FRIAGVTHHLEFIQNFTNLKVLNLSHNNIYTLTDKYNLESKSLVELVFSGNRLDILWNDD 590 600 610 620 630 640 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 DILYFLLR--VPHLQILILNQNRFSSCSGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQLAWETELCWD : :. . . .: : :. ::.. .. . :: .: ...:::.. . : CCDS14 DNRYISIFKGLKNLTRLDLSLNRLKHIPNEAFLNLPASLTELHINDNMLKF-----FNWT 650 660 670 680 690 700 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 VFEGLSHLQVLYLNHNYLNSLPPGVFSHLTALRGLSLNSNRLTVLSHNDLP--ANLEILD ... . .:..: : : : : .. . ..:: : :. ::.. : . : ..:. :: CCDS14 LLQQFPRLELLDLRGNKLLFLTDSLSDFTSSLRTLLLSHNRISHLPSGFLSEVSSLKHLD 710 720 730 740 750 760 560 570 580 590 600 pF1KE2 ISRNQLLAPNPDVF-----VSLSVLDITHNKFICECELSTFISWLN-HTNVTIAGPP-AD .: : : . : ... ..::.:.. : : : :... : :.. : :: : : .: CCDS14 LSSNLLKTINKSALETKTTTKLSMLELHGNPFECTCDIGDFRRWMDEHLNVKI--PRLVD 770 780 790 800 810 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 IYCVYPDSLSGVSLFSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFRGFC . :. : . : :. :: : . . : : :.. :. ... :. : CCDS14 VICASPGDQRGKSIVSLELTTCVSDVTAVILFFFTFFI----TTMVMLAALAHHLFYWDV 820 830 840 850 860 870 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 FICYKTAQRLVFKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKDFT---WVQNALLKHLDTQYSDQNR .. :.. : : . . . . . ::::. ...:: . :: : : ::. . :.: CCDS14 WFIYNVCLAKV-KGYRSLSTSQTF-YDAYISYDTKDASVTDWVINELRYHLE-ESRDKNV 880 890 900 910 920 930 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 FNLCFEERDFVPGENRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLE-AFSYAQGRCLSDL . ::.::::. :: : :....: .:.: : ...... .. : .. :: : : ... CCDS14 L-LCLEERDWDPGLAIIDNLMQSINQSKKTVFVLTKKYAKS-WNFKTAFYLALQRLMDEN 940 950 960 970 980 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 NSALIMVVVGSLSQYQLMKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEK ...:.... . :.. .. .: . :.. :.::.. . : : . : . .: :... CCDS14 MDVIIFILLEPVLQHS--QYLRLRQRICKSSILQWPDNPKAEGLFWQTLRNVVLT-ENDS 990 1000 1010 1020 1030 1040 850 pF1KE2 KKDNNIPLQTVATIS . .: CCDS14 RYNNMYVDSIKQY 1050 >>CCDS14151.1 TLR7 gene_id:51284|Hs108|chrX (1049 aa) initn: 412 init1: 178 opt: 626 Z-score: 601.9 bits: 122.7 E(32554): 3.3e-27 Smith-Waterman score: 750; 26.9% identity (57.1% similar) in 856 aa overlap (37-836:215-1033) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 LLLGVVLMAGPVFGIPSCSFDGRIAFYRFCNLTQVPQVLNTT-ERLLLSFNYIRTVTASS :.: :: :: .: .: : :.: . .. CCDS14 YRNPCYVSYSIEKDAFLNLTKLKVLSLKDNNVTAVPTVLPSTLTELYLYNNMIAKIQEDD 190 200 210 220 230 240 70 80 90 100 pF1KE2 FPFLEQLQLLELGSQ----Y------------TPLTIDKEAFRNLPNLRILDLGSSKIYF : :.:::.:.:... : .:: : .:: : .:..: : :... CCDS14 FNNLNQLQILDLSGNCPRCYNAPFPCAPCKNNSPLQIPVNAFDALTELKVLRLHSNSLQH 250 260 270 280 290 300 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 LHPDAFQGLFHLFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKN---QIR--SLYLHP . : :... .: :: : :. . ... : .: .:::: : :. :. : CCDS14 VPPRWFKNINKLQELDLSQNFLAKEIGDAKFLHFLPSLIQLDLSFNFELQVYRASMNLSQ 310 320 330 340 350 360 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 SFGKLNSLKSIDFSSNQIFLVCEHELEPLQG-KTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMNPF .:..:.::: . . . . . .: ::.. ..: ..:..: . . .... : .. . CCDS14 AFSSLKSLKILRIRGYVFKELKSFNLSPLHNLQNLEVLDLGTN-FIKIANLSMFKQFKRL 370 380 390 400 410 420 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 RNMVLEILDVSGNGWTVDITGNFSNAISKSQAFS---LILAHHIMGAGFGFHNIKDPDQN . . : . .: .: . .. : ::: .. ... : :.. .. . CCDS14 KVIDLSVNKISPSGDSSEV-GFCSNARTSVESYEPQVLEQLHYFRYDKYARSCRFKNKEA 430 440 450 460 470 480 290 300 310 320 330 pF1KE2 TFAGLARSSVRH---LDLSHGFVFSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINK-IADEAFYGLD .: .. .: .. ::::.. .: ..: :. :. :: :::. : :.. . : : CCDS14 SFMSVNESCYKYGQTLDLSKNSIFFVKSSDFQHLSFLKCLNLSGNLISQTLNGSEFQPLA 490 500 510 520 530 540 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 NLQVLNLSYNLLGELYSSNFYGLPKVAYIDLQKN-HI----AIIQDQTF-KFLEKLQTLD .:. :..: : : :.:. : : :. .:...: : .: . .: : :. :: : CCDS14 ELRYLDFSNNRLDLLHSTAFEELHKLEVLDISSNSHYFQSEGITHMLNFTKNLKVLQKLM 550 560 570 580 590 600 400 410 420 430 440 pF1KE2 LRDNALTTIHFIPSIPDIFLSGNKLVTLP-KINLTANLIHLSENRLENLDILYFLLRVPH . :: .. : . . ...: :: . : : . ..:: :... ::.. . CCDS14 MNDNDIS------SSTSRTMESESLRTLEFRGNHLDVLWREGDNRY--LQLFKNLLKLEE 610 620 630 640 650 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 LQILILNQNRFSSCSGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQ-LAWETELCWDVFEGLSHLQVLY :.: ..: .: . . :.:..: :..: :. ..:. : :..:..: CCDS14 LDI---SKNSLSFLPSGVFDGMPPNLKNLSLAKNGLKSFSWKKLQC------LKNLETLD 660 670 680 690 700 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 LNHNYLNSLPPGVFSHLTALRGLSLNSNRLTVLSHNDLPANLEI--LDISRN--QLLAPN :.:: :...: . . .:..: :..:.. :.. : ... ::.: : :.. . CCDS14 LSHNQLTTVPERLSNCSRSLKNLILKNNQIRSLTKYFLQDAFQLRYLDLSSNKIQMIQKT 710 720 730 740 750 760 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 --PD-VFVSLSVLDITHNKFICECELSTFISWLNHTNVTIAGPPADIYCVYPDSLSGVSL :. :. .:..: . ::.:.: :. :. :.:::.::: .:. :: : . .: :. CCDS14 SFPENVLNNLKMLLLHHNRFLCTCDAVWFVWWVNHTEVTIPYLATDVTCVGPGAHKGQSV 770 780 790 800 810 820 630 640 650 660 670 pF1KE2 FSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFR--------GFCFICYKT .::. : : .. . . ::: .....::::...:.... :: : CCDS14 ISLDLYTC-ELDLTNLILFSL----SISVSLFLMVMMTASHLYFWDVWYIYHFCKAKIKG 830 840 850 860 870 880 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 AQRLVFKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKD---FTWVQNALLKHLDTQYSDQNRFNLCFE :::. :: :::.. ...:: :: :. .:. ...::::.: CCDS14 YQRLI--------SPDCC-YDAFIVYDTKDPAVTEWVLAELVAKLEDPR--EKHFNLCLE 890 900 910 920 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 ERDFVPGENRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCLSDLNSALIMV :::..::. . :....: :.: : ... .. . :: .. : ... ...:.. CCDS14 ERDWLPGQPVLENLSQSIQLSKKTVFVMTDKYAKTENFKIAFYLSHQRLMDEKVDVIILI 930 940 950 960 970 980 800 810 820 830 840 850 pF1KE2 VVGSLSQYQLMKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIP . . .: : ..: . .. :.:: . : .: . :.. . CCDS14 FLE--KPFQKSKFLQLRKRLCGSSVLEWPTNPQAHPYFWQCLKNALATDNHVAYSQVFKE 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 LQTVATIS CCDS14 TV >>CCDS2848.1 TLR9 gene_id:54106|Hs108|chr3 (1032 aa) initn: 362 init1: 129 opt: 521 Z-score: 502.1 bits: 104.2 E(32554): 1.2e-21 Smith-Waterman score: 626; 26.0% identity (56.2% similar) in 827 aa overlap (34-819:207-996) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 HLDLLLGVVLMAGPVFGIPSCSFDGRIAFYRFCNLTQVPQVLNTT-ERLLLSFNYIRTVT .. ::: ::. : .. : ::::.: : .. CCDS28 NCYYKNPCRQALEVAPGALLGLGNLTHLSLKYNNLTVVPRNLPSSLEYLLLSYNRIVKLA 180 190 200 210 220 230 70 80 90 100 pF1KE2 ASSFPFLEQLQLLELGSQ-----YTPLT----------IDKEAFRNLPNLRILDLGSSKI .. : :..:..:.. ..: . ..: .: :. : : .:.. CCDS28 PEDLANLTALRVLDVGGNCRRCDHAPNPCMECPRHFPQLHPDTFSHLSRLEGLVLKDSSL 240 250 260 270 280 290 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 YFLHPDAFQGLFHLFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKN-QIRSLYLH--- .:. . :.:: .: : : : . : :..: : .:.:: : : : . : CCDS28 SWLNASWFRGLGNLRVLDLSENFLYKCITKTKAFQGLTQLRKLNLSFNYQKRVSFAHLSL 300 310 320 330 340 350 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 -PSFGKLNSLKSIDFSSNQIFLVCEHELEPL-QGKTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMN ::::.: .:: .:. . . . : :.:: . :. . : : . ..... . . CCDS28 APSFGSLVALKELDMHGIFFRSLDETTLRPLARLPMLQTLRLQMN-FINQAQLGIFRAFP 360 370 380 390 400 410 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 PFRNMVLEILDVSGNGWTVDITGNFSNAISKSQAFSLILAHHIMGAGFGFHNIKDPDQNT .: . : .:: . ..:.....: . ... .. . .. . :... CCDS28 GLRYVDLSDNRISGAS---ELTATMGEADGGEKVW-------LQPGDLAPAPVDTPSSED 420 430 440 450 460 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 FAGLARSSVRHLDLSHGFVFSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINK-IADEAFYGLDNLQV : . ::::.. . ... ..: :. :. : :..: :.. . : : .::: CCDS28 FRPNCSTLNFTLDLSRNNLVTVQPEMFAQLSHLQCLRLSHNCISQAVNGSQFLPLTGLQV 470 480 490 500 510 520 350 360 370 380 390 pF1KE2 LNLSYNLLGELYSSNFYGLPKVAYIDLQKNHIAI-IQD--QTFKFLEKLQTLDLRDNALT :.::.: : . .: ::.. .::. : . .: ..:.:. .:.:: . : . CCDS28 LDLSHNKLDLYHEHSFTELPRLEALDLSYNSQPFGMQGVGHNFSFVAHLRTLRHLSLAHN 530 540 550 560 570 580 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 TIHFIPSIPDIFLSGNKLVTLPKINLTAN-LIHL-SENRLENLDILYFLLRVPHLQILIL .:: .. . . : ..: .....: : :. .:. : :.:. . : : : CCDS28 NIH--SQVSQQLCS----TSLRALDFSGNALGHMWAEGDL----YLHFFQGLSGLIWLDL 590 600 610 620 630 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 NQNRFSSCSGDQTPSENP-SLEQLFLGENMLQLAWETELCWDVFEGLSHLQVLYLNHNYL .:::. . :: . : ::. : : .:.: . . : .. : .:.:: : : : CCDS28 SQNRLHTLL-PQTLRNLPKSLQVLRLRDNYLAF-----FKWWSLHFLPKLEVLDLAGNQL 640 650 660 670 680 520 530 540 550 560 pF1KE2 NSLPPGVFSHLTALRGLSLNSNRLTVLSHNDLPANLEI--LDISRNQLLAPNPDVF---- ..: : . : :: :... : .. .. . . :. :..: : : . . . : CCDS28 KALTNGSLPAGTRLRRLDVSCNSISFVAPGFFSKAKELRELNLSANALKTVDHSWFGPLA 690 700 710 720 730 740 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 VSLSVLDITHNKFICECELSTFISWLNHTNVTIAGPPADIYCVYPDSLSGVSLFSLSTEG .:..::.. : . : : ..:...: ...... : :. . : : .:.:.:.:. . . CCDS28 SALQILDVSANPLHCACG-AAFMDFLLEVQAAVPGLPSRVKCGSPGQLQGLSIFAQDLRL 750 760 770 780 790 800 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 C-DEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFRGFCF-ICYKTAQRLVFKDHPQGT : :: . .::. : .. : . .. : . .:: .: : .. . .: CCDS28 CLDEALSWDCFALSLLAV-ALGLGVPMLHHLCGWDLW-YCFHLCL---AWLPWRGRQSGR 810 820 830 840 850 860 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 EPDMYKYDAYLCFSSKDFT---WVQNALLKHLDTQYSDQNRFNLCFEERDFVPGENRIAN . : :::.. :.. . . :: : : .:. . . . ::.::::..::.. . : CCDS28 DEDALPYDAFVVFDKTQSAVADWVYNELRGQLE-ECRGRWALRLCLEERDWLPGKTLFEN 870 880 890 900 910 920 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 IQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEA-FSYAQGRCLSDLNSALIMVVVGSLSQYQLMK . ....::: . .: : : . :.: : :: : : : ......:... .. . . CCDS28 LWASVYGSRKTL-FVLAHTDRVSGLLRASFLLAQQRLLEDRKDVVVLVILSPDGRRS--R 930 940 950 960 970 810 820 830 840 850 pF1KE2 HQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIPLQTVATIS . .: . .:. : :: CCDS28 YVRLRQRLCRQSVLLWPHQPSGQRSFWAQLGMALTRDNHHFYNRNFCQGPTAE 980 990 1000 1010 1020 1030 >>CCDS33973.1 TLR1 gene_id:7096|Hs108|chr4 (786 aa) initn: 311 init1: 137 opt: 449 Z-score: 435.2 bits: 91.5 E(32554): 6.4e-18 Smith-Waterman score: 507; 23.6% identity (55.8% similar) in 738 aa overlap (141-845:89-785) 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 HPDAFQGLFHLFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKNQIRSLYLHPSFGKLN :. . : ::::.:.. .. ::. CCDS33 ELWTSDILSLSKLRILIISHNRIQYLDISVFKFNQELEYLDLSHNKLVKISCHPTV---- 60 70 80 90 100 110 180 190 200 210 220 pF1KE2 SLKSIDFSSNQI--FLVCEHELEPLQGKTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMNPFRNMVL .:: .:.: : . . .:. :. . . :.:..:... : . :: .: . CCDS33 NLKHLDLSFNAFDALPICK-EFGNM--SQLKFLGLSTTHL-EKSSVLPIAHLN-----IS 120 130 140 150 160 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 EILDVSGN--GWTVDITGNFSNAISKSQAFSLILAHHIMGAGFGFHNIKDPDQNTFAGLA ..: : :. : : : : :. : .. .. :: : : . .: :.: CCDS33 KVLLVLGETYGEKEDPEG--------LQDFNTESLHIVFPTNKEFHFILDVSVKTVANLE 170 180 190 200 210 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 RSSVRHL--DLSHGFVFSLNSRVFET--LKDLKVLNL--AYNKINKIADEAFYGLDNLQV :... . : . .. .:. ... . :..: . :. ..:.. .: . ... .. CCDS33 LSNIKCVLEDNKCSYFLSILAKLQTNPKLSNLTLNNIETTWNSFIRILQLVWH--TTVWY 220 230 240 250 260 270 350 360 370 380 390 pF1KE2 LNLS-YNLLGELYSSNF-YGLPKVAYIDLQK---NHIAIIQDQTFKFLEKLQTLDLRDNA ...: .: :.: .: :. .. ..... . ... :. .... ... .. .. CCDS33 FSISNVKLQGQLDFRDFDYSGTSLKALSIHQVVSDVFGFPQSYIYEIFSNMNIKNFTVSG 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 pF1KE2 LTTIHFI-PSIPDIFLSGNKLVTLPKINLTANLIHLSE--------NRLENLD-ILYFLL .:.. :: . :: . .: .. : ::.: :.:..:. : . CCDS33 TRMVHMLCPSKISPFLHLDFSNNLLTDTVFENCGHLTELETLILQMNQLKELSKIAEMTT 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 RVPHLQILILNQNRFSSCSGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQLAWETELCWDVFEGLS-HL .. :: : ..:: : : . :: .: .. :.: :. .:. : .. CCDS33 QMKSLQQLDISQNSVSYDEKKGDCSWTKSLLSLNMSSNIL-----TDT---IFRCLPPRI 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 QVLYLNHNYLNSLPPGVFSHLTALRGLSLNSNRLTVLSHNDLPANLEILDISRNQLLAPN .:: :. : ..:.: : . : ::. :.. : :: : ..: .: :..:.. :. CCDS33 KVLDLHSNKIKSIPKQVVK-LEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPS 450 460 470 480 490 500 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 PDVFVS---LSVLDITHNKFICECELSTFISWLNHTNVTI-AGPPADIYCVYPDSLSGVS : : : . . : : : :::. :.. ..... . : : . : ::.: :. CCDS33 ADFFQSCQKMRSIKAGDNPFQCTCELGEFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGTL 510 520 530 540 550 560 630 640 650 660 670 pF1KE2 L--FSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFRGFCFICYKTAQRLV : : .: .:. .. .. ..... .::.: : . : . . . ..: : : CCDS33 LKDFHMSELSCNITLLIVTIVATMLVL-AVTVTS-LCSYLDLPWY--LRMVCQWTQTRRR 570 580 590 600 610 620 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 FKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKDFTWVQNALLKHLDTQYSDQNRFNLCFEERDFVPGE .. : .. :.. .:..: ::.: :: .:. .. ...:..::.::::. CCDS33 ARNIPLEELQRNLQFHAFISYSGHDSFWVKNELLPNLE-----KEGMQICLHERNFVPGK 630 640 650 660 670 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 NRIANIQDAIWNSRKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCLSDLNSALIMVVVGSLSQY . . :: : .: : . ..: .:... :: . .:. . . ...::.... . :: CCDS33 SIVENIITCIEKSYKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNSLILILLEPIPQY 680 690 700 710 720 730 800 810 820 830 840 850 pF1KE2 QL-MKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIPLQTVATI .. ......... .. ::.::.. . : : .: : : :. : CCDS33 SIPSSYHKLKSLMARRTYLEWPKEKSKRGLFWANLRAAINIKLTEQAKK 740 750 760 770 780 pF1KE2 S >>CCDS3446.1 TLR6 gene_id:10333|Hs108|chr4 (796 aa) initn: 318 init1: 151 opt: 401 Z-score: 389.4 bits: 83.0 E(32554): 2.3e-15 Smith-Waterman score: 529; 23.7% identity (56.6% similar) in 768 aa overlap (92-828:48-773) 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 TASSFPFLEQLQLLELGSQYTPLTIDKEAFRNLP-NLRILDLGSSKIYFLHPDAFQGLFH ..:: . ..::.... : :. . .. : . CCDS34 MIIIVGTRIQFSDGNEFAVDKSKRGLIHVPKDLPLKTKVLDMSQNYIAELQVSDMSFLSE 20 30 40 50 60 70 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKNQIRSLYLHPSFGKLNSLKSIDFSSN : ::: .. .: . :. . : ::::.::.... :: . :.. .:.: : CCDS34 LTVLRLSHNRIQ--LLDLSVFKFNQDLEYLDLSHNQLQKISCHP----IVSFRHLDLSFN 80 90 100 110 120 130 190 200 210 220 230 pF1KE2 --QIFLVCEH--ELEPLQGKTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMNPFRNMVLEILDVSGN . . .:.. .: :. :: ..: .: . . . . .::. .. . . CCDS34 DFKALPICKEFGNLSQLNFLGLSAMKLQKLDLLPIAHLHLSYILLDLRNYYIK--ENETE 140 150 160 170 180 240 250 260 270 280 pF1KE2 GWTVDITGNFSNAISKSQAFSLILAHHIMGAG-FGFHNIKDPDQNT------FAGLAR-S . . . .. .. .. :.. . . : . . ::: :.: .. :.: : CCDS34 SLQILNAKTLHLVFHPTSLFAIQVNISVNTLGCLQLTNIKLNDDNCQVFIKFLSELTRGS 190 200 210 220 230 240 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 SVRHLDLSH-GFVFSLNSRVFETL--KDLKVLNLAYNK--INKIADEAF-YGLDNLQVLN .. .. :.: ... :::. : : .. ::. :: :..: .: : :. .:..:. CCDS34 TLLNFTLNHIETTWKCLVRVFQFLWPKPVEYLNI-YNLTIIESIREEDFTYSKTTLKALT 250 260 270 280 290 300 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 LSYNLLGELYSSNFYGLPKVA-YIDLQKNHIAIIQDQTFKFLEKLQTLDLRDNALTTIHF . : ... . . ..: : ... .: .. . :.. : .: .:..: CCDS34 I------EHITNQVFLFSQTALYTVFSEMNIMMLTISDTPFIHMLCP-----HAPSTFKF 310 320 330 340 350 410 420 430 440 450 pF1KE2 IPSIPDIFLSG--NKLVTLPKINLTANLIHLSENRLENLDILYFLLR-VPHLQILILNQN . ..: .. .: :: :.. .:: :..: :..: . .. . .: :.:: .. : CCDS34 LNFTQNVFTDSIFEKCSTLVKLE---TLI-LQKNGLKDLFKVGLMTKDMPSLEILDVSWN 360 370 380 390 400 410 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 RFSSCSGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQLAWETELCWDVFEGLS-HLQVLYLNHNYLNSL . : .. . :. : :. ::: :. .::. : ...:: :. : ..:. CCDS34 SLESGRHKENCTWVESIVVLNLSSNML-----TD---SVFRCLPPRIKVLDLHSNKIKSV 420 430 440 450 460 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 PPGVFSHLTALRGLSLNSNRLTVLSHNDLPANLEILDISRNQLLAPNPDVFVS---LSVL : : . : ::. :.. : :: : ..: .: :..:.. :. : : : . . CCDS34 PKQVVK-LEALQELNVAFNSLTDLPGCGSFSSLSVLIIDHNSVSHPSADFFQSCQKMRSI 470 480 490 500 510 520 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 DITHNKFICECELSTFISWLNHTNVTI-AGPPADIYCVYPDSLSGVSL--FSLSTEGCDE : : : ::: :.. ..... . : : . : ::.: : : : .: .:. CCDS34 KAGDNPFQCTCELREFVKNIDQVSSEVLEGWPDSYKCDYPESYRGSPLKDFHMSELSCNI 530 540 550 560 570 580 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 EEVLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFRGFCFICYKTAQRLVFKDHPQGTEPDMY .. .. ..... .::.: . . . .: ..: : : .. : CCDS34 TLLIVTIGATMLVL-AVTVTSLCIYLDLPWYLR---MVCQWTQTRRRARNIPLEELQRNL 590 600 610 620 630 640 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 KYDAYLCFSSKDFTWVQNALLKHLDTQYSDQNRFNLCFEERDFVPGENRIANIQDAIWNS .. :.. .: .: .::.. :. .:. .. ...:..::.::::.. . :: . : .: CCDS34 QFHAFISYSEHDSAWVKSELVPYLE-----KEDIQICLHERNFVPGKSIVENIINCIEKS 650 660 670 680 690 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 RKIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCLSDLNSALIMVVVGSLSQYQL-MKHQSIRGFV : . ..: .:... :: . .:. . . .. ::.... . : .. :........ CCDS34 YKSIFVLSPNFVQSEWCHYELYFAHHNLFHEGSNNLILILLEPIPQNSIPNKYHKLKALM 700 710 720 730 740 750 820 830 840 850 pF1KE2 QKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIPLQTVATIS .. ::.::.. . : : CCDS34 TQRTYLQWPKEKSKRGLFWANIRAAFNMKLTLVTENNDVKS 760 770 780 790 >>CCDS6818.1 TLR4 gene_id:7099|Hs108|chr9 (839 aa) initn: 445 init1: 129 opt: 388 Z-score: 376.7 bits: 80.7 E(32554): 1.2e-14 Smith-Waterman score: 658; 24.3% identity (58.3% similar) in 835 aa overlap (37-837:44-816) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 LLLGVVLMAGPVFGIPSCSFDGRIAFYRFCNLTQVPQVLN-TTERLLLSFNYIRTVTASS :. ..:. : .:. : :::: .: . . : CCDS68 AMAFLSCVRPESWEPCVEVVPNITYQCMELNFYKIPDNLPFSTKNLDLSFNPLRHLGSYS 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 FPFLEQLQLLELGSQYTPLTIDKEAFRNLPNLRILDLGSSKIYFLHPDAFQGLFHLFELR : . .::.:.: :. ::. :...: .: : : .. : : ::.:: : .: CCDS68 FFSFPELQVLDL-SRCEIQTIEDGAYQSLSHLSTLILTGNPIQSLALGAFSGLSSLQKLV 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLDLSKNQIRSLYLHPSFGKLNSLKSIDFSSNQIFLV .: : :.. . .::.: .:....: :.:. : :..:..:. .:.:::.: . CCDS68 AVETNL--ASLENFPIGHLKTLKELNVAHNLIQSFKLPEYFSNLTNLEHLDLSSNKIQSI 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 CEHELEPLQGKTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMNP--FRNMVLEILDVSGNGWTVDIT .:. :. : .:: .:.. . ..: :... :. : . .: .... CCDS68 YCTDLRVLHQMPLLNLSLD-------LSLNPMNFIQPGAFKEIRLHKLTLRNNFDSLNVM 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 GNFSNAISKSQAFSLILAHHIMGAGFGFHNIKDPDQNTFAGLARSSVRHLDLSHGFVFSL . .... .. :.:.. . . : :.. :.... :: ..... :.. . . : CCDS68 KTCIQGLAGLEVHRLVLGE-FRNEG----NLEKFDKSALEGLCNLTIEEFRLAY-LDYYL 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 pF1KE2 NSRV--FETLKDLKVLNLAYNKINKIADEAF-YGLDNLQVLNLSYNLLGEL--------- .. . :. : ... ..:. :... : .. .: ..:...: ... . : CCDS68 DDIIDLFNCLTNVSSFSLVSVTIERVKDFSYNFGWQHLELVNCKFGQFPTLKLKSLKRLT 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 YSSNFYG-------LPKVAYIDLQKNHIAIIQ--DQTFKFLEKLQTLDLRDNALTTIHFI ..:: : ::.. ..::..: ... .:. .:. ::: :.. : CCDS68 FTSNKGGNAFSEVDLPSLEFLDLSRNGLSFKGCCSQSDFGTTSLKYLDLSFNGVIT---- 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 PSIPDIFLSGNKLVTLPKINLTANLIHLSE-NRLENLDILYFLLRVPHLQILILNQNRFS . . ::. ..: : . .:: ..:: . . .: : .: . : . . .. :. CCDS68 --MSSNFLGLEQLEHLDFQH--SNLKQMSEFSVFLSLRNLIYL-DISHTHTRVAFNGIFN 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 SCSGDQTPSENPSLEQLFLGENMLQLAWETELCWDVFEGLSHLQVLYLNHNYLNSLPPGV . : ::: : .. : .: .. :.: : .: : :.. :..: : . CCDS68 GLS---------SLEVLKMAGNSFQ----ENFLPDIFTELRNLTFLDLSQCQLEQLSPTA 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 pF1KE2 FSHLTALRGLSLNSNRLTVLSHNDLP----ANLEILDISRNQLLAPNPDVF----VSLSV :. :..:. :... : . .: . .: .:..:: : :.... . . . ::. CCDS68 FNSLSSLQVLNMSHNNF--FSLDTFPYKCLNSLQVLDYSLNHIMTSKKQELQHFPSSLAF 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 LDITHNKFICECELSTFISWLNHTNVTIAGPPADIYCVYPDSLSGVSLFSLSTEGCDEEE :..:.: : : :: ..:..:.. .. . :. :.. .:. ..::. :. .. CCDS68 LNLTQNDFACTCEHQSFLQWIKDQRQLLV-EVERMECATPSDKQGMPVLSLNIT-CQMNK 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 VLKSLKFSLFIVCTVTLTLFLMTILTVTKFRGFCFICYKTAQRLVFKDHPQGTEPDMYKY . :. . .:.........: .. : : . : . . : ..: CCDS68 T---------IIGVSVLSVLVVSVVAVLVYK-FYFHLMLLAGCIKY-----GRGENIY-- 640 650 660 670 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 DAYLCFSSKDFTWVQNALLKHLDTQYSDQNRFNLCFEERDFVPGENRIANI-QDAIWNSR ::.. .::.: ::.: :.:.:. :.::.. :::.:: ::: .... .:: CCDS68 DAFVIYSSQDEDWVRNELVKNLEEGVPP---FQLCLHYRDFIPGVAIAANIIHEGFHKSR 680 690 700 710 720 730 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 KIVCLVSRHFLRDGWCLEAFSYAQGRCLSDLNSALIMVVVGSLSQYQLMKHQSIRGFVQK :.. .::.::... ::. . :: . . ...:..:. .. . : .. . .... CCDS68 KVIVVVSQHFIQSRWCIFEYEIAQTWQFLSSRAGIIFIVLQKVEKTLLRQQVELYRLLSR 740 750 760 770 780 790 820 830 840 850 pF1KE2 QQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQILKKEKEKKKDNNIPLQTVATIS . ::.: ... : ..: . .: CCDS68 NTYLEWEDSVLGRHIFWRRLRKALLDGKSWNPEGTVGTGCNWQEATSI 800 810 820 830 >>CCDS3307.1 GP5 gene_id:2814|Hs108|chr3 (560 aa) initn: 344 init1: 113 opt: 356 Z-score: 348.8 bits: 75.0 E(32554): 4.2e-13 Smith-Waterman score: 365; 29.9% identity (56.2% similar) in 432 aa overlap (223-632:70-471) 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 LQGKTLSFFSLAANSLYSRVSVDWGKCMNPFRNM-VLEILDVSGNGWTVDITGNFSNAIS : .: ::. : .: . .. :.::. :. CCDS33 VARISALGLPTNLTHILLFGMGRGVLQSQSFSGMTVLQRLMISDSHISAVAPGTFSDLIK 40 50 60 70 80 90 260 270 280 290 pF1KE2 -KSQAFSLILAHHIMGAG----------FGFHN-IKDPDQNTFAGLARSSVRHLDLSHGF :. .: :. :: : :: .. ::: : :. ....: :... CCDS33 LKTLRLSRNKITHLPGALLDKMVLLEQLFLDHNALRGIDQNMFQKLV--NLQELALNQNQ 100 110 120 130 140 150 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 VFSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINKIADEAFYGLDNLQVLNLSYNLLGELYSSNFYGL . : . .: .:..::.:.:. :..... . . .:. : : : : : :. . .: CCDS33 LDFLPASLFTNLENLKLLDLSGNNLTHLPKGLLGAQAKLERLLLHSNRLVSLDSGLLNSL 160 170 180 190 200 210 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 PKVAYIDLQKNHIAIIQDQTFKFLEKLQTLDLRDNALTTIHFIPSIPDIFLSGNKLVTLP .. .....::: : .: : .:..: : : :. :.:: .:: .. CCDS33 GALTELQFHRNHIRSIAPGAFDRLPNLSSLTLSRNHLA---FLPSA--LFLHSH------ 220 230 240 250 260 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 KINLTANLIHLSENRLENLDILYFLLRVPHLQILILNQNRFSSCSGDQTPSEN-PSLEQL ::: :. : :: : .: . : .. :: : ::.... . :. .: .: CCDS33 --NLT--LLTLFENPLAELPGVLFG-EMGGLQELWLNRTQLRT-----LPAAAFRNLSRL 270 280 290 300 310 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 -FLGENMLQLAWETELCWDVFEGLSHLQVLYLNHNYLNSLPPGVFSHLTALRGLSLNSNR .:: .. . : .:.::..:::: :. : :..:: :.. : :: .:: :: CCDS33 RYLGVTLSPRL--SALPQGAFQGLGELQVLALHSNGLTALPDGLLRGLGKLRQVSLRRNR 320 330 340 350 360 370 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 LTVLSHNDLP--ANLEILDISRNQLLAPNPDVFVSLSVLD---ITHNKFICECELSTFIS : .: . . ..:: .....::: . ::: .: : . ::.. :.: :. :.. CCDS33 LRALPRALFRNLSSLESVQLDHNQLETLPGDVFGALPRLTEVLLGHNSWRCDCGLGPFLG 380 390 400 410 420 430 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 WLNHTNVTIAG--PPADIYCVYPDSLSGVSLFSLSTEGCDEEEVLKSLKFSLFIVCTVTL :: . ..: :: :. : . .:. :..: : : : CCDS33 WLRQHLGLVGGEEPP---RCAGPGAHAGLPLWALP--GGDAECPGPRGPPPRPAADSSSE 440 450 460 470 480 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 TLFLMTILTVTKFRGFCFICYKTAQRLVFKDHPQGTEPDMYKYDAYLCFSSKDFTWVQNA CCDS33 APVHPALAPNSSEPWVWAQPVTTGKGQDHSPFWGFYFLLLAVQAMITVIIVFAMIKIGQL 490 500 510 520 530 540 >>CCDS3784.1 TLR2 gene_id:7097|Hs108|chr4 (784 aa) initn: 477 init1: 147 opt: 357 Z-score: 347.7 bits: 75.3 E(32554): 4.8e-13 Smith-Waterman score: 532; 24.3% identity (55.5% similar) in 795 aa overlap (64-821:44-767) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 RFCNLTQVPQVLNTTERLLLSFNYIRTVTASSFP--FLEQLQLLELGSQYTPLTIDKEAF .:.: . : .. :.:... ... CCDS37 IISLSKEESSNQASLSCDRNGICKGSSGSLNSIPSGLTEAVKSLDLSNNRITYISNSDLQ 20 30 40 50 60 70 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 RNLPNLRILDLGSSKIYFLHPDAFQGLFHLFELRLYFCGLSDAVLKDGYFRNLKALTRLD : . ::. : : :. : .. :.:..: : .: : . ::. :....:. :..:: :. CCDS37 RCV-NLQALVLTSNGINTIEEDSFSSLGSLEHLDLSYNYLSN--LSSSWFKPLSSLTFLN 80 90 100 110 120 130 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 LSKNQIRSLYLHPSFGKLNSLKSIDFSSNQIFLVCEHELEPLQGKT-LSFFSLAANSLYS : : ..: :..:..:. . .. . : ... . : : : . . :..: : CCDS37 LLGNPYKTLGETSLFSHLTKLQILRVGNMDTFTKIQRK--DFAGLTFLEELEIDASDLQS 140 150 160 170 180 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 RVSVDWGKCMNPFRNMVLEILDVSGNGWTVDITGNFSNAISKSQAFSLILAHHIMGAGFG : .. ..:. :: .. . ..: : .. :. . . : CCDS37 YEP----KSLKSIQNVSHLILHMKQHILLLEI---FVDVTSSVECLEL------------ 190 200 210 220 280 290 300 310 320 pF1KE2 FHNIKDPDQNTFAGLARSSVRHL-DLSHGFVFSLNSRVFETLKDLKVLNLAYNKINKIAD .: : .:: :. .:: : . :: .. :....:. . . .. :. . CCDS37 ----RDTDLDTF---------HFSELSTGETNSLIKKF--TFRNVKITDESLFQVMKLLN 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 EAFYGLDNLQVLNLSYNLLGELYSSNFYGL--P-KVAYIDLQKNHIA---IIQDQT--FK . . :: .:. . . : .:.. .:. . : :: . ... :: .. : . .. 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CCDS37 -FNPP--FKLCLHKRDFIPGKWIIDNIIDSIEKSHKTVFVLSENFVKSEWCKYELDFSHF 670 680 690 700 710 720 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 RCLSDLNSALIMVVVGSLSQYQL-MKHQSIRGFVQKQQYLRWPEDLQDVGWFLHKLSQQI : ... :.: :.... . . . .. ..: ... . ::.:: : CCDS37 RLFDENNDAAILILLEPIEKKAIPQRFCKLRKIMNTKTYLEWPMDEAQREGFWVNLRAAI 730 740 750 760 770 780 840 850 pF1KE2 LKKEKEKKKDNNIPLQTVATIS CCDS37 KS 858 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 10:47:34 2016 done: Tue Nov 8 10:47:34 2016 Total Scan time: 3.390 Total Display time: 0.260 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]