FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9392, 1278 aa 1>>>pF1KE9392 1278 - 1278 aa - 1278 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4887+/-0.000993; mu= -0.7818+/- 0.060 mean_var=229.2414+/-46.742, 0's: 0 Z-trim(112.7): 34 B-trim: 70 in 1/52 Lambda= 0.084709 statistics sampled from 13385 (13413) to 13385 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.412), width: 16 Scan time: 3.990 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS78510.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276) 8448 1046.1 0 CCDS76040.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276) 8400 1040.2 0 CCDS55521.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX ( 952) 6150 765.2 0 CCDS14684.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1311) 6048 752.8 1.3e-216 CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163) 999 135.7 6.6e-31 CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226) 771 107.9 1.7e-22 CCDS33258.1 AFF3 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70 80 90 100 110 pF1KE9 TNKGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 TNKGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKN 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 RIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 RIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNK 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 MQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 MQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPE 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 ESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 ESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPD 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 ISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 ISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDPSCVEEI 310 320 330 340 350 360 360 370 380 pF1KE9 LRE-----------------------------SQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFK ::: :::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 LREMTHSWPTPLTSMHTAGHSEQSTFSIPGQESQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFK 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KE9 SMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 SMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQA 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KE9 SGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 SGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQ 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 560 pF1KE9 NKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRP 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 IPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTA 790 800 810 820 830 840 810 820 830 840 850 860 pF1KE9 VTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 VTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNS 850 860 870 880 890 900 870 880 890 900 910 920 pF1KE9 SRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 SRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGK 910 920 930 940 950 960 930 940 950 960 970 980 pF1KE9 FCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 FCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTT 970 980 990 1000 1010 1020 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE9 TTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 TTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAK 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE9 KLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 KLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRL 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE9 KNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 KNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIP 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE9 SPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGPVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 SPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGPVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHW 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE9 DMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 DMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL 1270 1280 1290 1300 1310 >>CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163 aa) initn: 1642 init1: 586 opt: 999 Z-score: 668.3 bits: 135.7 E(32554): 6.6e-31 Smith-Waterman score: 2051; 36.0% identity (60.6% similar) in 1316 aa overlap (20-1278:4-1162) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYK-TNK .::..:. .: ::::::.:: .: : . ::.:::: :.: CCDS41 MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVTSK 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 GDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRII : :..:.:. ::::::::... ..: . ::.::: .:: . ..:..:.:: ::.. CCDS41 EDKLSSRIQSMLGNYDEMKDFIGDRSIPK-LVAIPKPTVPPSADEKSNPNFF-EQRHG-- 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 PPHQDNT-HPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQ ::.. : .: : : :. ..:...:. : : . :. ....::: . . CCDS41 GSHQSSKWTPVGPAPSTSQSQKRSSGLQSGHSSQ----RTSAGSSS--GTNSSGQRHDRE 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 TLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNP---SAKEDSNPNSSGEDAF-KEIFQSNS . ... :... . . .:. . ..: :. ..:. : :.: :: .:.: CCDS41 SYNNSGSSSRKKG--QHGSEHSKSRSSSPGKPQAVSSLNSSHSRSHGNDHHSKEHQRSKS 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 PEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGL-SVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQ :.. . ..: : . ::: :.:.:::.:. :.. :::::::::::::.. CCDS41 PRDPDANWDSP-------SRVPFSSGQHSTQSFPPSLMSKSNSMLQKPTAYVRPMDGQES 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 APDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTI-LQTSEVSLPSDPSC . : :. .: :: .. . ::: ::..: :. : : ..: .: :: CCDS41 ---MEPKLSSEHYSSQSHGN----SMTELKPS---SKAHLTKLKIPSQPLDASASGDVSC 270 280 290 300 310 360 370 380 pF1KE9 VEEILRESQHLTP-----------------------------GFTLQKWNDPTTRASTKS :.:::.: : : : :: .:. ..:. CCDS41 VDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTGEQKRYNPS-KTSNGH 320 330 340 350 360 370 390 400 410 420 430 440 pF1KE9 VSFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNP-VNPPLATPQPP : ::::.:::::::.:: .. : .:. ::..: : . . CCDS41 QS-KSMLKDDLKLSSSED--------------SDGEQDCDKTMPRSTPGSNSEPSHHNSE 380 390 400 410 450 460 470 480 490 500 pF1KE9 PAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLN : .. :.: : ::::: :::..:::..:::.:: . :.:::::: :::::::.::: CCDS41 GADNSRDDSSSHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDNWLN 420 430 440 450 460 470 510 520 530 540 550 560 pF1KE9 KVTSQNKSFICGQNETPMETISLPPPIIQPMEVQMKVK-TNASQVPAE-PKERPLLSLIR ::. .. : : ... : : .. . . . :. : . . ::: . : CCDS41 KVNPHKVS--------PASSVDSNIPSSQGYKKEGREQGTGNSYTDTSGPKETSSATPGR 480 490 500 510 520 530 570 580 590 600 610 pF1KE9 EKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVSQR-TIGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPN--I .. . :: :. ..: . :....:: :.:::::::.:: .. . :. . : CCDS41 DS---KTIQKGSESGRGRQKSPAQSDSTTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEE----PRGGLKI 540 550 560 570 580 620 630 640 650 660 670 pF1KE9 TSSTPKEKESVELHDPPRGRNKAT---AHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKS : :: . : . : .:.::. ..:: .:: . . . :::::.. .: :: CCDS41 ESETPVDLAS----SMPSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKS 590 600 610 620 630 640 680 690 700 710 720 730 pF1KE9 REFIETDSSTSDSNTDQEETLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEICGASLTLSTLMSSSGSNN ::.::::.:.::: :. :.: :: ...: : : . : .. :. .. CCDS41 REIIETDTSSSDS--DESESL-----PP----SSQTPKYPE------SNRTPVKPSSVEE 650 660 670 680 740 750 760 770 780 790 pF1KE9 NLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAPAKPD . :. .. :::. . :.:::: . .. : :::::.::.:.::. .. : : . CCDS41 EDSFFRQR-MFSPME--EKELLSPLSEPDDRYPLIVKIDLNLLTRIPGKPYKETEPPKGE 690 700 710 720 730 740 800 810 820 830 840 850 pF1KE9 HKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPA .:.. : :.. : :: . ::::::: . . :: . :. .. CCDS41 KKNVPEKHTREAQKQASEKVSNKGKRKHKNEDDNRASESKKPKTEDKNSA---------- 750 760 770 780 790 860 870 880 890 900 910 pF1KE9 PPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRNVSGNNGPFGQDKNIAMTG ::: ..::.... : ::. :.: : .:.: :. .. : . ..:.... CCDS41 -GHKPSSNRESSKQSAA---KEKDLLPSPAGPVPSKDPKTEHGS-------RKRTISQSS 800 810 820 830 920 930 940 950 960 970 pF1KE9 QITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVT .. :.. . : .: : : ..: :. .. : ... : CCDS41 SLKSSSNSNKET------SGSSKNSSSTSKQKKTEGKTSSSSK--------------EVK 840 850 860 870 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE9 ATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDD : ..... .. : :.::. :: ::.::: CCDS41 EKAPSSSSNCPPSA---------------------------PTLDSSKP--RRTKLVFDD 880 890 900 910 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE9 SVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMY ..::.:.::::::::.:::: ..: ::: : ::..:: :::::.:.. :.:::. :: CCDS41 RNYSADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDAVVSFIECGNALEKNAQESKSPFPMY 920 930 940 950 960 970 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE9 SETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLME ::::.:..:.:.:::. .: :. .::.:.::: :: ::::::.:::::..:.:::..: : CCDS41 SETVDLIKYTMKLKNYLAPDATAADKRLTVLCLRCESLLYLRLFKLKKENALKYSKTLTE 980 990 1000 1010 1020 1030 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE9 YFKQNASKVAQIPSPWV-SNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCNNGP---------VTIPQ ..: :. . .: ::: . :.. . ::::: ..:: :. :: ..: ::::: CCDS41 HLK-NSYNNSQAPSPGLGSKAVGMPSPVS-PKLSPGNS-GNYSSGASSASASGSSVTIPQ 1040 1050 1060 1070 1080 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE9 RIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSS-MTNLVRY .::.::::.:..::: : . : ::.:..:..:.::::..:: .:::: ..: ::.:::: CCDS41 KIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEFFAELDKVMGPLIFNASIMTDLVRY 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1270 pF1KE9 VRQGLCWLRIDAHLL .:::: ::: ::.:. CCDS41 TRQGLHWLRQDAKLIS 1150 1160 >>CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226 aa) initn: 2311 init1: 660 opt: 771 Z-score: 517.4 bits: 107.9 E(32554): 1.7e-22 Smith-Waterman score: 2490; 37.8% identity (60.6% similar) in 1357 aa overlap (1-1277:1-1225) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MDLFDF--FRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKTN :: ::. ...::::. : :: ::.::...: ::::::.::.: :.:...::.:::::: CCDS42 MDSFDLALLQEWDLESLCVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 KGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRI ::: :.::.:::::::::::..::..:::.::::.:: .:::.: :: . : ... . CCDS42 KGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQN 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 IPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQ : .: :.: : ....... :.. .: :: ..: . : .... CCDS42 QPSSICSTTTSTPAAVP---------VQQSKRGTMGWQKAGHPPSD--GQQRATQQGSLR 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 TLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPEES :: : .:. ..: ::. : CCDS42 TLLGDG-----------------VGR---QQPRAKQVCN--------------------V 170 180 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 EFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPDIS : ..:. : : . ::: ::::::.: : :. ::::::::::::::::::: : CCDS42 EVGLQTQERP-PAMAAKHSSSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDES 190 200 210 220 230 240 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 PTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDP-SCVEEIL : :: : : .: :. . .:: : .:.:: ::.: . .: : .. ::::::. CCDS42 PKLKSSSE--TSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNSCVEEII 250 260 270 280 290 300 360 370 380 390 pF1KE9 RE---------------------------SQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSML :: :: .. : . : .: .. ...: ::: CCDS42 REMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSML 310 320 330 340 350 360 400 410 420 430 440 450 pF1KE9 EDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGG ::::::::::.. : . : : .:.. . :.. . . . . ..::. CCDS42 EDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTS-----VPSSKGSSSSSSSGS 370 380 390 400 410 420 460 470 480 490 500 510 pF1KE9 SGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKS :.:::.::::: :::.::::...::... :. ..:: :: :.:::::::::::: . .: CCDS42 SSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKV-NPHKP 430 440 450 460 470 480 520 530 540 550 560 pF1KE9 FICGQNETP-METISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQ : :::. :. . :. . .. :: .. : :. .:. . : .:. ::: .. CCDS42 PILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGKVP-DVCQ-PSL-REKEIKSTCKEEQRPRTAN 490 500 510 520 530 570 580 590 600 pF1KE9 KIPETKALKHKLSTTSETVS----------------------QRTIGKKQPKKVEKNTST : : .:..:.: .. .:. .:. ::: ...:.... CCDS42 KAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSAG 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 pF1KE9 DEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGP : . .:. ... :: . : .. . ::: : .. ::.. :: CCDS42 DGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELRSSVTC--EKRRTRGL 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 pF1KE9 GKIVPKSREFIETDSSTSDSNTD------QEE-TLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEIC--G ..:::::.:::::.::.:.:..: ::: :. :.:: . :: : CCDS42 SRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANG 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE9 ASLTLSTLMS-SSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLL .: . . : .. ...... :: .. .: ..:.::::.: .....::::::: :: CCDS42 GSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLL 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KE9 SRVPGHSSLHAAP---AKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEK ::.: : : : . : :.. . : .:. : .:: ::.:::.: . . : CCDS42 SRIPEH--LPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALPKSKRKRK-CDNEDDYREI 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KE9 KQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRR :. : . : : . . : :. . : :.::.. :.::: . .. CCDS42 KKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPIN--KNEKMLRSPISPLSDASKHK 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KE9 ---RNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATI ....... : : : .:. .: ::: . .. . :: : : . . CCDS42 YTSEDLTSSSRPNG---NSLFTSASSSKKPKAD--------SQLQPHGGDLTKAAHNNSE 900 910 920 930 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE9 TVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTS .. . .:. . CCDS42 NIP-----------------------------------------------LHKSRPQTKP 940 950 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE9 WAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAAL :. : :.. . .: ::.::: ..:::.:::::..::::::. ::::::.:::.::: CCDS42 WS--PG-SNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAAL 960 970 980 990 1000 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE9 SFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLS :: :::::::. :.:.:::::::::::::.:::::::. ..: :. ::.::.::::::. CCDS42 SFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLA 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE9 LLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNT--PSPVSLNN--VS ::: :::.::.:::.:::..:..::: :.::.:: :::: ..::.: :::.: : .: CCDS42 LLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFK-NSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPAS 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE9 PINAMGNCNNG----P---VTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEF ....:. .:. : :.::::::.:::.::.::...:..:..:.:::.:..::.:: CCDS42 SVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREF 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1250 1260 1270 pF1KE9 FGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL :.::: ::::.: :::: .::.: .::: ::: .::: CCDS42 FNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS 1190 1200 1210 1220 >>CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1251 aa) initn: 2265 init1: 660 opt: 771 Z-score: 517.2 bits: 107.9 E(32554): 1.7e-22 Smith-Waterman score: 2430; 37.7% identity (60.5% similar) in 1338 aa overlap (18-1277:45-1250) 10 20 30 40 pF1KE9 MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSG :: ::.::...: ::::::.::.: :.:. CCDS33 ESLWGEDILNQRNDSLVVEFQSSASRCRSVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSS 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 FDLFGEPYKTNKGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNE ..::.::::::::: :.::.:::::::::::..::..:::.::::.:: .:::.: :: . CCDS33 YSLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGVPQTPVNKID 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 PSFFPEQKNRIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLA : ... . : .: :.: : ....... :.. .: :: . CCDS33 EHFVADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVP---------VQQSKRGTMGWQKAGHPPSD--G 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 SQASGQPNKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFK .: . : ....:: : .:. ..: ::. : CCDS33 QQRATQQGSLRTLLGDG-----------------VGR---QQPRAKQVCN---------- 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 EIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRP : ..:. : : . ::: ::::::.: : :. :::::::::: CCDS33 ----------VEVGLQTQERP-PAMAAKHSSSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRP 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 MDGQDQAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLP ::::::::: :: :: : :.: :. . .:: : .:.:: ::.: . .: : CCDS33 MDGQDQAPDESPKLKSSS--ETSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQGEESRS 270 280 290 300 310 320 350 360 370 pF1KE9 SDP-SCVEEILRE---------------------------SQHLTPGFTLQKWNDPTTRA .. ::::::.:: :: .. : . : .: .. 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CCDS33 PTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELRSSVT 620 630 640 650 660 670 660 670 680 690 700 pF1KE9 LAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTD------QEE-TLQIKVLPPCIISGGN ::.. :: ..:::::.:::::.::.:.:..: ::: :. :.:: CCDS33 C--EKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASASSGN 680 690 700 710 720 710 720 730 740 750 760 pF1KE9 TAKSKEIC--GASLTLSTLMS-SSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLK . :: :.: . . : .. ...... :: .. .: ..:.::::.: .... CCDS33 DQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLSPLKDSDEIR 730 740 750 760 770 780 770 780 790 800 810 820 pF1KE9 NLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAP---AKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHK .::::::: ::::.: : : : . : :.. . : .:. : .:: ::.:::.: CCDS33 SLWVKIDLTLLSRIPEH--LPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALPKSKRKRK 790 800 810 820 830 840 830 840 850 860 870 880 pF1KE9 PIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPP . . : :. : . : : . . : :. . : :.::.. : CCDS33 -CDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPIN--KNEKMLRSP 850 860 870 880 890 900 890 900 910 920 930 940 pF1KE9 LSPLPEDPPRR---RNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEG .::: . .. ....... : : : .:. .: ::: . .. . : CCDS33 ISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPNG---NSLFTSASSSKKPKAD--------SQLQPHGG 910 920 930 940 950 950 960 970 980 990 1000 pF1KE9 DTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTG : : : . . .. 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CCDS54 DELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSH-THRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHT 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 IPPHQDNTHP-SAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNP--STVLASQASGQP- ::. : :.:. .. : . . . : : .: : :... :: CCDS54 SVHHQSIHTPASGPLSVGNIS-HNPKMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 ---------------NKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEV---EESNPSAKEDS .. ..:.. . .: .. :. : .. . ... : .. .: CCDS54 FGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSS 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 NPNSSGEDAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPP-GLYCKTS . ..:.... : ..::.. :. .: .::.::.. : :.::: .: :. 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CCDS54 SSEKKKHKSS---LPAPSKALSGPEPAKDNVEDR--TPEHFALVPLTESQGPPHSGS--- 680 690 700 710 720 720 730 740 750 760 770 pF1KE9 GASLTLSTLMSSSGSNNNLSISNE-EPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDL :. .:: . . .... . :.:. .:..:::::: ..: ::: ::: CCDS54 GSR--------TSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDL 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KE9 LSRVPGHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQ :::.: . . : . :. . :... . .. . .:... :. . .:: CCDS54 LSRIPQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKG--EAERDCDNKKI 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KE9 RLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRN :::. . : . :: ... . : .. :.: : :::.: . : . CCDS54 RLEKE----IKSQSSSSSSSHKE-SSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAK--- 840 850 860 870 880 900 910 920 930 940 950 pF1KE9 VSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNT : . : .: :. :. : ::.::: :.. CCDS54 ------P--------------ALKRSRREADTCGQ---------DPPKSASS-----TKS 890 900 910 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE9 AIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALP ... : . ... .. :.. . : CCDS54 NHKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPV----------------------P 920 930 940 950 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE9 LLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTEC : ..... .:.. :: ..:: .:.::::.:.::. . .. ::: .: .:.::: :: CCDS54 SLPNGNSKPGKPQVKFDK--QQADLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIEC 960 970 980 990 1000 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE9 GNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLR : : : . .:: :..:::::.:... : ::.:.. : .: .::::.:: :.: . CCDS54 GIATESESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMA 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE9 MFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNTPSPVSLNNVSPINAMGNCN ::. ::: :.::::.: ..: ...::::: ::: .. . .::::.: :: ...:. . CCDS54 MFRCKKDIAIKYSRTLNKHF-ESSSKVAQAPSPCIARSTGTPSPLS-PMPSPASSVGSQS 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE9 NG----------PVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDT .. .. : :..:..:.:.:::.:: ... :..:. :::.:::::. :.: CCDS54 SAGSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLST 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1250 1260 1270 pF1KE9 LMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL . :. .::...::.:.:::. :. 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CCDS36 DELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSH-THRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFHT 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 IPPHQDNTHP-SAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNP--STVLASQASGQP- ::. : :.:. .. : . . . : : .: : :... :: CCDS36 SVHHQSIHTPASGPLSVGNIS-HNPKMAQPRTEPMPSLHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQEG 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 pF1KE9 ---------------NKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEV---EESNPSAKEDS .. ..:.. . .: .. :. : .. . ... : .. .: CCDS36 FGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSPVPPLSPIHSNQQTLPRTQGSS 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 NPNSSGEDAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPP-GLYCKTS . ..:.... : ..::.. :. .: .::.::.. : :.::: .: :. 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CCDS36 SSEKKKHKSS---LPAPSKALSGPEPAKDNVEDR--TPEHFALVPLTESQGPPHSGS--- 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE9 GASLTLSTLMSSSGSNNNLSISNE-EPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDL :. .:: . . .... . :.:. .:..:::::: ..: ::: ::: CCDS36 GSR--------TSGCRQAVVVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDL 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 830 pF1KE9 LSRVPGHSSLHAAPAKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQ :::.: . . : . :. . :... . .. . .:... :. . .:: CCDS36 LSRIPQPPGKGSRQRKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKG--EAERDCDNKKI 770 780 790 800 810 820 840 850 860 870 880 890 pF1KE9 RLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRRRN :::. . : . :: ... . : .. :.: : :::.: . : . CCDS36 RLEKE----IKSQSSSSSSSHKE-SSKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQKPAK--- 830 840 850 860 870 900 910 920 930 940 950 pF1KE9 VSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNT : . : .: :. :. : ::.::: :.. 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CCDS36 MFRCKKDIAIKYSRTLNKHF-ESSSKVAQAPSPCIAS-TGTPSPLS-PMPSPASSVGSQS 1070 1080 1090 1100 1110 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE9 NG----------PVTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDT .. .. : :..:..:.:.:::.:: ... :..:. :::.:::::. :.: CCDS36 SAGSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLST 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1250 1260 1270 pF1KE9 LMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL . :. .::...::.:.:::. :. CCDS36 NVCTLALNSSLVDLVHYTRQGFQQLQELTKTP 1180 1190 1200 1210 1278 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 10:23:47 2016 done: Tue Nov 8 10:23:48 2016 Total Scan time: 3.990 Total Display time: 0.410 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]