FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6065, 320 aa 1>>>pF1KE6065 320 - 320 aa - 320 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2201+/-0.000516; mu= 22.3621+/- 0.032 mean_var=109.1109+/-29.242, 0's: 0 Z-trim(107.5): 352 B-trim: 1804 in 2/48 Lambda= 0.122784 statistics sampled from 15091 (15605) to 15091 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.516), E-opt: 0.2 (0.183), width: 16 Scan time: 4.460 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 1259 234.7 2e-61 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 1193 223.0 6.5e-58 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 1152 215.7 1e-55 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 1140 213.5 4.3e-55 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 937 177.6 2.9e-44 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 900 171.1 2.7e-42 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 898 170.7 3.5e-42 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 893 169.8 6.5e-42 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 893 169.8 6.5e-42 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 893 169.8 6.5e-42 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 885 168.4 1.7e-41 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 874 166.4 6.6e-41 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 871 165.9 9.6e-41 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 868 165.4 1.4e-40 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 868 165.4 1.4e-40 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 868 165.4 1.4e-40 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 862 164.3 2.9e-40 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 857 163.4 5.4e-40 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 822 157.3 4e-38 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 768 147.7 3e-35 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 507 101.5 2.5e-21 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 463 93.7 5.5e-19 NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 231 52.7 1.4e-06 NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 231 52.7 1.5e-06 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 223 51.2 3.6e-06 NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 217 50.3 8.5e-06 NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 213 49.5 1.3e-05 XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 213 49.5 1.3e-05 NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 213 49.5 1.3e-05 XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 213 49.6 1.4e-05 XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 213 49.6 1.4e-05 XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 213 49.6 1.4e-05 XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 213 49.6 1.4e-05 XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 213 49.6 1.4e-05 XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 206 48.3 3.1e-05 NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 206 48.3 3.1e-05 NP_001295394 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 202 47.5 4.8e-05 NP_001295405 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 202 47.5 4.8e-05 NP_001295397 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 202 47.5 4.8e-05 NP_065110 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene rec ( 346) 202 47.5 4.8e-05 NP_001295400 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 202 47.5 4.8e-05 NP_001295399 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 202 47.5 4.8e-05 NP_001295396 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 202 47.5 4.8e-05 NP_001295398 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 202 47.5 4.8e-05 NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 193 46.0 0.00016 NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 192 45.7 0.00016 NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 193 46.1 0.00017 NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 191 45.6 0.0002 NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 190 45.3 0.0002 NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432) 190 45.5 0.00023 >>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa) initn: 1259 init1: 1259 opt: 1259 Z-score: 1223.9 bits: 234.7 E(85289): 2e-61 Smith-Waterman score: 1259; 60.3% identity (85.9% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY :: .: :. :::::::..:..: :: :. : ::.::::::.:::.: :: .:::::: NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY ::: .:::::: :::: :::.: :: : ::::::.:: :::.... ::.:::::::::.: NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE :: .::::::::.:.:::.:: .. . :. ..:::... .:: :: ::.. .:::: : NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT .:::...:::.:...: .::.:.. .::.::..::.::.::..:::. .: ....::..: NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA :::::::::.:::.:::::.::: .:.::: :: :::...:: ::::::::::...: : NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS : .:. NP_001 LGRLLLGKRELGKE 310 >>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa) initn: 1193 init1: 1193 opt: 1193 Z-score: 1160.8 bits: 223.0 E(85289): 6.5e-58 Smith-Waterman score: 1193; 56.8% identity (82.7% similar) in 301 aa overlap (5-305:8-308) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHT : :: :::.:::: :..:... :: ::::.::.:: ::. : :::.::: NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 PMYFFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAV :::::: ::::::::.::: :::.:::::::.:::::.::.:::: . ::..::.::.: NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 MSYDRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHF :::::..:.:.:::: :.:.:..: . . : ...::.. ..:. .: ::. .::: NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 LCELPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKA .::.:::....:::: . :.... . :.:: :::::: ::: :..:.:: .: .. .:. NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 MNTCGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNM ..:::.:: .::.:. . ::::: . :.:::::..:::::.:::::::::::::: . NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE6 KDALKKLMRFHHKSTKIKRNCKS . :.:.:: NP_001 RGAVKRLMGWE 310 >>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa) initn: 1146 init1: 1146 opt: 1152 Z-score: 1121.5 bits: 215.7 E(85289): 1e-55 Smith-Waterman score: 1152; 54.8% identity (81.7% similar) in 301 aa overlap (5-305:3-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY : :: ::.:::::.:: .: : :: ::.:::::: ::: : :: .::.::: NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY ::: :::::::::::: .:::::::::: ::::.. : .:..... ::..::.::.::.. NP_009 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE ::..:.:.:::: ....:.:: .. . : :.:..::: ::.:: : . .: :.:: NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT .:::....: ::. :..: . ...:...:: :::.::: :. :::: .: ..:::..: NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA :.::::::..::...: .:::: : ....:::. :::.: ::::::::::::::.. : NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRA 240 250 260 270 280 290 310 320 pF1KE6 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS ...:. NP_009 FRRLLGKEMGLTQS 300 310 >>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa) initn: 1134 init1: 1134 opt: 1140 Z-score: 1110.2 bits: 213.5 E(85289): 4.3e-55 Smith-Waterman score: 1140; 55.8% identity (82.0% similar) in 294 aa overlap (5-298:3-296) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY : :: ::.:::::.:: .: : :: ::.:::::: ::: : :: .::.::: XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY ::: :::::::::::: .:::::::::: ::::.. : .:..... ::..::.::.::.. XP_011 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE ::..:.:.:::: ....:.:: .. . : :.:..::: ::.:: : . .: :.:: XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT .:::....: ::. :..: . ...:...:: :::.::: :. :::: .: ..:::..: XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA :.::::::..::...: .:::: : ....:::. :::.: ::::::::::::::..: XP_011 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQKRR 240 250 260 270 280 290 310 320 pF1KE6 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS XP_011 GS 300 >>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa) initn: 951 init1: 774 opt: 937 Z-score: 915.7 bits: 177.6 E(85289): 2.9e-44 Smith-Waterman score: 937; 46.7% identity (75.3% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY : : : ... :.:::.:. :. :..: :. ::.:..:: .: .::::::::: NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY ::: :::. ::::.:.:.:: ::.: . :.:... : .: .. .: ..: ::::::: NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE ::..:::.::.: .:. ..:... :. .. ::: :. : :: :.: . ::.:: NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT :::. .: .:: . ::..: .:..:.: :..:::.::: : .:.. :: ... ::..: NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA ::::: :: .:::. : :. : ..::.: : ...::...:: ::::::.::::..: : NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTP--KSSKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA 250 260 270 280 290 310 320 pF1KE6 LKKLMRFHHKSTKIKRNCKS :.:. NP_003 LRKVATRNFP 300 >>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa) initn: 948 init1: 896 opt: 900 Z-score: 880.3 bits: 171.1 E(85289): 2.7e-42 Smith-Waterman score: 900; 42.1% identity (74.8% similar) in 302 aa overlap (5-306:6-307) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPM : . . :::::::. :.. .: . ..:. .:. : ..:. .::.::::: NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YFFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMS :::: ::::.:.:. .: .:.:: :: ..::..:::::: ... .: : :...:. NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 YDRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLC :::..:::.:: : .:.: ::. :.. . .:. :. :.: ::.:.. ::.: NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 ELPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMN ..: :. ..:.:: :.. . : ... .. ..:.::::::. .... : .. ::.: NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 TCGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKD ::.::::.::.:: . :..::. .. .:.. .: ..::::. : ::::::.::::..:: NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE6 ALKKLMRFHHKSTKIKRNCKS :::.:.. NP_001 ALKRLQKRKCC 310 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 873 init1: 845 opt: 898 Z-score: 878.3 bits: 170.7 E(85289): 3.5e-42 Smith-Waterman score: 898; 43.3% identity (72.7% similar) in 319 aa overlap (1-318:1-315) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHP-KMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPM : .:.. . :::..::. : ... .: . .::.:: ::. :::..: : .::.:: NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YFFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMS ::::::::::.. :. :.:.:: .: . : :::..:: :.: ....: .::.:::.:. NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 YDRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLC :::..:::.:::: :.:: . :. : .. ..: : ...: ::.: ..::.: NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 ELPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMN . : ..:..:.::. :. ... :..:. : .::: :: :: :.:. : ...::.. NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 TCGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKD ::.::: :::.:: . :. : . : .. :.:.: :::.:: :::.::.:::...:. NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE6 ALKKLMRFHHKSTKIKRNCKS ::. : :: . ::: NP_835 ALS---RTFHKVLAL-RNCIP 310 >>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa) initn: 905 init1: 882 opt: 893 Z-score: 873.5 bits: 169.8 E(85289): 6.5e-42 Smith-Waterman score: 893; 41.0% identity (75.9% similar) in 315 aa overlap (1-314:1-315) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY : .: . . :::::.:. .. : . ..:..:..:: :.: :::.:::::: NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY ::: :::..:. ..::..::.:... . :.: . .: ::. . ::..: .:::::.: NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE ::..:.: :.: ..:. :: .. : : .. .: : ..:..:: : :...::. :: NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT : :.:..:::::.. :..... .:....::. :.:.:: : ...:. .:. ...::..: NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA :.::::::.. ::. :. :.:: . : : :....::...:: :::.::.::::..: : NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 LKKLM-RFHHKSTKIKRNCKS .::. .: ..:. NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT 310 >>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 905 init1: 882 opt: 893 Z-score: 873.5 bits: 169.8 E(85289): 6.5e-42 Smith-Waterman score: 893; 41.0% identity (75.9% similar) in 315 aa overlap (1-314:1-315) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY : .: . . :::::.:. .. : . ..:..:..:: :.: :::.:::::: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY ::: :::..:. ..::..::.:... . :.: . .: ::. . ::..: .:::::.: XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE ::..:.: :.: ..:. :: .. : : .. .: : ..:..:: : :...::. :: XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT : :.:..:::::.. :..... .:....::. :.:.:: : ...:. .:. ...::..: XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA :.::::::.. ::. :. :.:: . : : :....::...:: :::.::.::::..: : XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 LKKLM-RFHHKSTKIKRNCKS .::. .: ..:. XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT 310 >>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 905 init1: 882 opt: 893 Z-score: 873.5 bits: 169.8 E(85289): 6.5e-42 Smith-Waterman score: 893; 41.0% identity (75.9% similar) in 315 aa overlap (1-314:1-315) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDQSNYSSLHGFILLGFSNHPKMEMILSGVVAIFYLITLVGNTAIILASLLDSQLHTPMY : .: . . :::::.:. .. : . ..:..:..:: :.: :::.:::::: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FFLRNLSFLDLCFTTSIIPQMLVNLWGPDKTISYVGCIIQLYVYMWLGSVECLLLAVMSY ::: :::..:. ..::..::.:... . :.: . .: ::. . ::..: .:::::.: XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRFTAICKPLHYFVVMNPHLCLKMIIMIWSISLANSVVLCTLTLNLPTCGNNILDHFLCE ::..:.: :.: ..:. :: .. : : .. .: : ..:..:: : :...::. :: XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 LPALVKIACVDTTTVEMSVFALGIIIVLTPLILILISYGYIAKAVLRTKSKASQRKAMNT : :.:..:::::.. :..... .:....::. :.:.:: : ...:. .:. ...::..: XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CGSHLTVVSMFYGTIIYMYLQPGNRASKDQGKFLTLFYTVITPSLNPLIYTLRNKNMKDA :.::::::.. ::. :. :.:: . : : :....::...:: :::.::.::::..: : XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 LKKLM-RFHHKSTKIKRNCKS .::. .: ..:. XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT 310 320 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 09:11:14 2016 done: Tue Nov 8 09:11:15 2016 Total Scan time: 4.460 Total Display time: 0.000 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]