Result of FASTA (omim) for
pFN21AE6024
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6024, 315 aa
1>>>pF1KE6024 315 - 315 aa - 315 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7003+/-0.000468; mu= 19.3670+/- 0.029
mean_var=97.6141+/-25.697, 0's: 0 Z-trim(108.4): 282 B-trim: 944 in 1/49
Lambda= 0.129813
statistics sampled from 16092 (16531) to 16092 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16
Scan time: 5.950
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 1540 299.5 5.8e-81
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 950 189.0 1.1e-47
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 949 188.8 1.2e-47
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 949 188.8 1.2e-47
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 949 188.8 1.2e-47
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 924 184.1 3.1e-46
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 918 183.0 6.8e-46
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 918 183.0 6.8e-46
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 918 183.0 6.8e-46
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 913 182.1 1.3e-45
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 912 181.9 1.5e-45
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 880 175.9 9.3e-44
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 877 175.3 1.4e-43
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 870 174.0 3.4e-43
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 847 169.7 6.8e-42
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 844 169.1 9.7e-42
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 834 167.3 3.7e-41
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 829 166.4 7e-41
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 811 163.0 7.2e-40
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 777 156.6 6e-38
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 511 106.8 6e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 485 101.9 1.8e-21
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 199 48.4 2.4e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 198 48.4 3.2e-05
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 187 46.3 0.00013
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 187 46.3 0.00013
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 187 46.3 0.00013
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 187 46.3 0.00013
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 187 46.3 0.00013
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 182 45.2 0.00021
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 180 45.0 0.00032
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 178 44.5 0.00036
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 176 44.1 0.00047
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 176 44.2 0.00053
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 173 43.7 0.00087
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 170 43.1 0.0011
XP_011509323 (OMIM: 602886) PREDICTED: G-protein c ( 293) 165 42.0 0.0018
XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 160 40.5 0.002
NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 164 41.9 0.0024
NP_001499 (OMIM: 602886) G-protein coupled recepto ( 453) 165 42.2 0.0024
NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 164 41.9 0.0024
NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 164 41.9 0.0025
NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 164 41.9 0.0025
NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 164 41.9 0.0025
NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 164 42.0 0.0026
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 163 41.7 0.0026
NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 164 42.0 0.0026
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 162 41.5 0.003
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 162 41.5 0.0031
XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 162 41.5 0.0031
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 1582 init1: 1540 opt: 1540 Z-score: 1574.5 bits: 299.5 E(85289): 5.8e-81
Smith-Waterman score: 1540; 75.5% identity (90.5% similar) in 306 aa overlap (5-310:5-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::.::: ::::::
NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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pF1KE6 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
:::.::::::::: .. :::: :.:. : ::::::::: ::::::::::::: ::.:::
NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 ALKRLIHRTLGSQKL
::.: .:..:
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa)
initn: 907 init1: 725 opt: 950 Z-score: 977.2 bits: 189.0 E(85289): 1.1e-47
Smith-Waterman score: 950; 47.4% identity (75.3% similar) in 312 aa overlap (1-307:1-311)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MMWENWTI-VSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSP
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NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPA-PAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKP
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pF1KE6 MYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLI--IQD--TTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCL
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NP_003 MYFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVL
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pF1KE6 LATMAYDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRV
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NP_003 LAVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNII
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pF1KE6 NHFFCDSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGK
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NP_003 NHFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTDFILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGR
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240 250 260 270 280 290
pF1KE6 HQAFSTCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRN
..:::::..:: :: .::...:. : ::.. .. ...::.:. .:..:.:::::: ::
NP_003 YKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRN
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE6 KEVKAALKRLIHRTLGSQKL
.::: :: .:
NP_003 QEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV
300 310 320
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 938 init1: 916 opt: 949 Z-score: 976.4 bits: 188.8 E(85289): 1.2e-47
Smith-Waterman score: 949; 47.8% identity (74.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
: : . ::::.:...: . . : :::..::..::.:..::.:::: . :: :..::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSR-QPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPM
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pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
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NP_036 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
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pF1KE6 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
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NP_036 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
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pF1KE6 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
::..:: :: ::::: : .:: : :: :.:. . .. :::::::::.::: ::. .:.
NP_036 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 ALKRLIHRTLGSQKL
:::... :.. :
NP_036 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 938 init1: 916 opt: 949 Z-score: 976.4 bits: 188.8 E(85289): 1.2e-47
Smith-Waterman score: 949; 47.8% identity (74.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
: : . ::::.:...: . . : :::..::..::.:..::.:::: . :: :..::
XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSR-QPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPM
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pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
:::: ::::..: :... :::::.. :.. :::: :: ::::: :.: . :::.::
XP_011 YFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMA
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pF1KE6 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
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XP_011 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
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pF1KE6 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
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XP_011 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
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pF1KE6 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
::..:: :: ::::: : .:: : :: :.:. . .. :::::::::.::: ::. .:.
XP_011 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 ALKRLIHRTLGSQKL
:::... :.. :
XP_011 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
initn: 938 init1: 916 opt: 949 Z-score: 976.2 bits: 188.8 E(85289): 1.2e-47
Smith-Waterman score: 949; 47.8% identity (74.0% similar) in 312 aa overlap (1-312:11-321)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVT
: : . ::::.:...: . . : :::..::..::.:..::.:::: .
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSR-QPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSV
10 20 30 40 50
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pF1KE6 IADSALQSPMYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGA
:: :..:::::: ::::..: :... :::::.. :.. :::: :: ::::: :.:
XP_011 SIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVD
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pF1KE6 AECCLLATMAYDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFC
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XP_011 MDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFC
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pF1KE6 GPNRVNHFFCDSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMP
. : ..::::: :.. : :.:: . :. :. .: .. ::: ::.::..: :....:
XP_011 ADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVP
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pF1KE6 SAEGKHQAFSTCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPII
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XP_011 STKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFI
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300 310
pF1KE6 YSSRNKEVKAALKRLIHRTLGSQKL
:: ::. .:.:::... :.. :
XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
300 310 320
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 910 init1: 776 opt: 924 Z-score: 951.2 bits: 184.1 E(85289): 3.1e-46
Smith-Waterman score: 924; 47.1% identity (77.8% similar) in 306 aa overlap (5-310:5-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
: : :.::.:...: . . . :::...: .::::..::.:.: .. .:: :..::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSD-GPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPM
10 20 30 40 50
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pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
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NP_003 YFFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMS
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
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NP_003 YDRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFC
120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
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NP_003 EAPALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFS
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NP_003 TCGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQE--KSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKA
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310
pF1KE6 ALKRLIHRTLGSQKL
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NP_003 ALRKVATRNFP
300
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KE6 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
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XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
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pF1KE6 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
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XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
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XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
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pF1KE6 ALKRLIHRTLG-SQKL
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XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 927 init1: 878 opt: 918 Z-score: 944.9 bits: 183.0 E(85289): 6.8e-46
Smith-Waterman score: 918; 44.3% identity (77.2% similar) in 316 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSS-DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
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pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
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XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
60 70 80 90 100 110
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pF1KE6 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
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XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
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XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
180 190 200 210 220 230
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pF1KE6 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
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XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE6 ALKRLIHRTLG-SQKL
: ..:. . : ..::
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 927 init1: 878 opt: 918 Z-score: 944.9 bits: 183.0 E(85289): 6.8e-46
Smith-Waterman score: 918; 44.3% identity (77.2% similar) in 316 aa overlap (1-315:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
: .: : ::::.:...:. . . .. ::.:::..:.::..:: ::.:. :: :..::
NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSS-DWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPM
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pF1KE6 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
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NP_036 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
::::::.:: :.: .:: ::.:: .:: ::: . :::. :..:.: . ..:. :
NP_036 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
. :. :.:.::: :. ......... :: :.: ::..:.:::... : ::...::
NP_036 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
::..:: ::.: :..::.::..:.:: : ..::.:. ...::::::.::: ::::::.
NP_036 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
240 250 260 270 280 290
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pF1KE6 ALKRLIHRTLG-SQKL
: ..:. . : ..::
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 899 init1: 871 opt: 913 Z-score: 940.0 bits: 182.1 E(85289): 1.3e-45
Smith-Waterman score: 913; 45.4% identity (76.6% similar) in 295 aa overlap (12-306:15-308)
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NP_001 VRGAVKRLMGWE
300 310
315 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 08:49:49 2016 done: Tue Nov 8 08:49:50 2016
Total Scan time: 5.950 Total Display time: 0.000
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]