FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5979, 313 aa 1>>>pF1KE5979 313 - 313 aa - 313 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8598+/-0.000549; mu= 18.6166+/- 0.035 mean_var=109.6467+/-33.277, 0's: 0 Z-trim(106.7): 383 B-trim: 948 in 1/47 Lambda= 0.122483 statistics sampled from 14195 (14750) to 14195 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.482), E-opt: 0.2 (0.173), width: 16 Scan time: 7.010 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 911 172.7 8.8e-43 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 897 170.2 4.8e-42 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 878 166.9 4.9e-41 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 878 166.9 4.9e-41 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 878 166.9 5e-41 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 868 165.1 1.7e-40 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 868 165.1 1.7e-40 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 868 165.1 1.7e-40 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 868 165.1 1.7e-40 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 861 163.9 3.9e-40 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 842 160.5 4e-39 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 841 160.3 4.6e-39 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 804 153.8 4.2e-37 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 797 152.6 9.9e-37 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 769 147.6 3e-35 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 767 147.3 3.9e-35 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 767 147.3 3.9e-35 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 759 145.8 1e-34 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 740 142.5 1e-33 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 732 141.1 2.8e-33 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 518 103.3 7e-22 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 460 93.0 8.5e-19 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 207 48.3 2.5e-05 XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 204 47.9 4e-05 NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 204 47.9 4.2e-05 XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 204 47.9 4.2e-05 XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 204 47.9 4.2e-05 NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 201 47.5 6.4e-05 NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 198 46.9 9e-05 XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 198 46.9 9.2e-05 NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 195 46.2 0.00011 NP_000862 (OMIM: 601109) 5-hydroxytryptamine recep ( 440) 196 46.6 0.00011 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 191 45.5 0.00018 NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 188 45.0 0.00027 NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 188 45.1 0.00028 NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 188 45.1 0.00028 NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 188 45.1 0.00028 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 187 44.8 0.00028 NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 188 45.1 0.00029 NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 188 45.1 0.0003 NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 187 44.8 0.0003 XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 187 44.8 0.0003 NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 187 44.9 0.00032 XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 187 44.9 0.00033 XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 187 44.9 0.00033 XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 187 44.9 0.00033 XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 187 44.9 0.00033 XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 187 44.9 0.00033 NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 184 44.3 0.00041 NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 184 44.3 0.00041 >>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa) initn: 925 init1: 436 opt: 911 Z-score: 889.0 bits: 172.7 E(85289): 8.8e-43 Smith-Waterman score: 911; 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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCRKE-INHFFCD ::: ::: :: :..::. . : .. : .....:. . : :. : .: .. :.::::: NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 IAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFST ::....: .: : :.:. .:... :...: .:: :.. .:. . : .::..:::: NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLIKVVTPLLNPFIYSLRNEKVQEV ::::.:.. . ... :..:.::... ::. ::::.:. :: :.:::.:::::...:... 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NP_036 LKKVVGRVVFSV 310 >>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa) initn: 889 init1: 448 opt: 878 Z-score: 857.7 bits: 166.9 E(85289): 4.9e-41 Smith-Waterman score: 878; 45.2% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (3-306:5-309) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMY : :.:.:. :... . . ::: .. : :. ::. :: . :: :.:::: XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSF ::::::::.:: .. . .::.:: . : .:::: ::. : :: :.. .. .:::::.. XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCRKE-INHFFCD :...:.: :::::. :. . : ::: : :: : :.::. :.... : .: . :.::::: XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 IAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFST ..:::...: .::: : : . .:::... . .::..: :.:..:::.:: ::::: XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 CASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLIKVVTPLLNPFIYSLRNEKVQEV :.::..:: . ... : :: : .. : . : .:.:: ::::.::::::::::. .. . XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 LRETVNRIMTLIQRKT :...:.:.. XP_011 LKKVVGRVVFSV 310 >>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa) initn: 889 init1: 448 opt: 878 Z-score: 857.6 bits: 166.9 E(85289): 5e-41 Smith-Waterman score: 878; 45.2% identity (74.1% similar) in 305 aa overlap (3-306:15-319) 10 20 30 40 pF1KE5 MGNWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIW : :.:.:. :... . . ::: .. : :. ::. :: . XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 IDHRLQTPMYFFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTV :: :.::::::::::::.:: .. . .::.:: . : .:::: ::. : :: :.. . XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 EFILLAVMSFDRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCR . .:::::..:...:.: :::::. :. . : ::: : :: : :.::. :.... : .: XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 KE-INHFFCDIAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVILSSLAFTTGSYVYIISTILRIPS . :.:::::..:::...: .::: : : . .:::... . .::..: :.:..:: XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 TQGRQKAFSTCASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLIKVVTPLLNPFIY :.:: ::::::.::..:: . ... : :: : .. : . : .:.:: ::::.:::::: XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY 250 260 270 280 290 300 290 300 310 pF1KE5 SLRNEKVQEVLRETVNRIMTLIQRKT ::::. .. .:...:.:.. XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV 310 320 >>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 817 init1: 487 opt: 868 Z-score: 848.1 bits: 165.1 E(85289): 1.7e-40 Smith-Waterman score: 868; 43.8% identity (77.6% similar) in 299 aa overlap (1-295:1-298) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MG--NWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMY :: : . :.:. :... . . :.::::...: :..:. :: :. :: .: ::.:::: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSF :::.:::..:. :.: ..:.::: .:.:.:.: : .: : .: . :: .::.:::::.. XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DRYMAICDPLHYTVIMNSRACLLLVLGCWVGAFLSVLFPTIVVTRLPYCR-KEINHFFCD :::.:.:: :.:..::.. : :.. ::..:.: : .. .::.:: : :.:. :. XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 IAPLLQVACINTHLIEKINFLLSALVIL-SSLAFTTGSYVYIISTILRIPSTQGRQKAFS . ....::..: : .....:..:.: . . .. ::. ::::::.: : .::.::: XP_011 LLAVVRLACVDTSSNE-VTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCASHITVVSIAHGSNIFVYVRPNQNSSLDYDKVAAVLIKVVTPLLNPFIYSLRNEKVQE :::::.:::.. .: ::.:..:... :. .:. .:. ..::.:::.::::::..:. XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 VLRETVNRIMTLIQRKT XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT 300 310 >>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 817 init1: 487 opt: 868 Z-score: 848.1 bits: 165.1 E(85289): 1.7e-40 Smith-Waterman score: 868; 43.8% identity (77.6% similar) in 299 aa overlap (1-295:1-298) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MG--NWSTVTEITLIAFPALLEIRISLFVVLVVTYTLTATGNITIISLIWIDHRLQTPMY :: : . :.:. :... . . :.::::...: :..:. :: :. :: .: ::.:::: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLSNLSFLDILYTTVITPKLLACLLGEEKTISFAGCMIQTYFYFFLGTVEFILLAVMSF :::.:::..:. :.: ..:.::: .:.:.:.: : .: : .: . :: .::.:::::.. 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