FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5919, 310 aa 1>>>pF1KE5919 310 - 310 aa - 310 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0496+/-0.00117; mu= 11.4105+/- 0.068 mean_var=152.5765+/-50.140, 0's: 0 Z-trim(103.6): 378 B-trim: 445 in 1/48 Lambda= 0.103832 statistics sampled from 6998 (7474) to 6998 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16 Scan time: 2.420 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 ( 310) 2059 321.0 7.2e-88 CCDS5149.1 OR2A4 gene_id:79541|Hs108|chr6 ( 310) 2027 316.2 2e-86 CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 1625 256.0 2.7e-68 CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 1444 228.9 3.9e-60 CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 1444 228.9 3.9e-60 CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 1329 211.7 5.9e-55 CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 1279 204.2 1.1e-52 CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 1267 202.4 3.8e-52 CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 1247 199.4 3e-51 CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 905 148.2 7.8e-36 CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 881 144.6 9.4e-35 CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 881 144.6 9.5e-35 CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 877 144.0 1.5e-34 CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 877 144.0 1.6e-34 CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 872 143.2 2.5e-34 CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 869 142.8 3.4e-34 CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 868 142.6 3.7e-34 CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 867 142.5 4e-34 CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 861 141.6 7.6e-34 CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 861 141.6 7.8e-34 CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 860 141.4 8.5e-34 CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 859 141.3 9.5e-34 CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 856 140.8 1.3e-33 CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 854 140.5 1.6e-33 CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 854 140.5 1.6e-33 CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 854 140.5 1.6e-33 CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 853 140.4 1.7e-33 CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 853 140.4 1.7e-33 CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 847 139.5 3.3e-33 CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 845 139.2 4e-33 CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 845 139.2 4e-33 CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 845 139.2 4e-33 CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 845 139.2 4e-33 CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 844 139.1 4.5e-33 CCDS35011.1 OR13J1 gene_id:392309|Hs108|chr9 ( 312) 841 138.6 6e-33 CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 841 138.6 6e-33 CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 839 138.3 7.5e-33 CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 837 138.0 9.1e-33 CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 837 138.0 9.2e-33 CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 837 138.0 9.5e-33 CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 836 137.8 1e-32 CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 836 137.9 1e-32 CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 836 137.9 1.1e-32 CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 835 137.7 1.1e-32 CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 835 137.7 1.1e-32 CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 835 137.7 1.1e-32 CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 835 137.7 1.1e-32 CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 835 137.8 1.2e-32 CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 834 137.5 1.3e-32 CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 833 137.4 1.4e-32 >>CCDS55177.1 OR2A7 gene_id:401427|Hs108|chr7 (310 aa) initn: 2059 init1: 2059 opt: 2059 Z-score: 1691.1 bits: 321.0 E(32554): 7.2e-88 Smith-Waterman score: 2059; 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71.3% identity (87.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MGDNITSITEFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF ::.: : .:::::::: .::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::.:::: CCDS56 MGENQTMVTEFLLLGFLLGPRIQMLLFGLFSLFYIFTLLGNGAILGLISLDSRLHTPMYF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD ::::::::::::. ::::.::.::::::::::::: : :::: .:. .::::::.:::: CCDS56 FLSHLAVVDIAYTRNTVPQMLANLLHPAKPISFAGCMTQTFLCLSFGHSECLLLVLMSYD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI :::::::::: .:::::::::::::::: : ::.: :.::.: ::: :..: :::::: CCDS56 RYVAICHPLRYSVIMTWRVCITLAVTSWTCGSLLALAHVVLILRLPFSGPHEINHFFCEI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFCTC :.::.:::::: .:. ...:. . :::: : ..::: :: :::.::: : .:::: :: CCDS56 LSVLRLACADTWLNQVVIFAACVFFLVGPPSLVLVSYSHILAAILRIQSGEGRRKAFSTC 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FSHLCVIGLFYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL :::::.:::.:.:::::..:. .:.::.: ..::.:.::: ::::: ::::.:::..: CCDS56 SSHLCVVGLFFGSAIIMYMAPKSRHPEEQQKVFFLFYSFFNPTLNPLIYSLRNGEVKGAL 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 KRVLGVERAL .:.:: : CCDS56 RRALGKESHS 310 >>CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 (311 aa) initn: 1323 init1: 928 opt: 1329 Z-score: 1100.0 bits: 211.7 E(32554): 5.9e-55 Smith-Waterman score: 1329; 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CCDS43 CSSHLCMVGLFFGSAIVMYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 LKRVLGVERAL ::::: .:. 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CCDS43 KRVLWKQRSM 310 >>CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 (318 aa) initn: 1308 init1: 1252 opt: 1267 Z-score: 1049.7 bits: 202.4 E(32554): 3.8e-52 Smith-Waterman score: 1267; 60.0% identity (83.5% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MGDNITSITEFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF : : : ::.. :::: ::: . .:: ::::.::..::::::.:.:.: :::.::.:::: CCDS43 MEGNQTWITDITLLGFQVGPALAILLCGLFSVFYTLTLLGNGVIFGIICLDSKLHTPMYF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD ::::::..:..:: :.::.::.::.. . :::. .:::::. .:::::::.::::::: CCDS43 FLSHLAIIDMSYASNNVPKMLANLMNQKRTISFVPCIMQTFLYLAFAVTECLILVVMSYD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI :::::::..: .::.:::: :..:::. : :::.: .::: :::: :. . :.:::: CCDS43 RYVAICHPFQYTVIMSWRVCTILVLTSWSCGFALSLVHEILLLRLPFCGPRDVNHLFCEI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFCTC :.::::::::: .:. ...: . :::::: :.:::: :: :::.::..: . ::: :: CCDS43 LSVLKLACADTWVNQVVIFATCVFVLVGPLSLILVSYMHILGAILKIQTKEGRIKAFSTC 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FSHLCVIGLFYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL :::::.:::.: :...:. : .. .::.:.: ::::.::::::::: ::::...:..: CCDS43 SSHLCVVGLFFGIAMVVYMVPDSNQREEQEKMLSLFHSVFNPMLNPLIYSLRNAQLKGAL 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 KRVLGVERAL .:.: .:.. CCDS43 HRALQRKRSMRTVYGLCL 310 >>CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 (310 aa) initn: 1247 init1: 1247 opt: 1247 Z-score: 1033.7 bits: 199.4 E(32554): 3e-51 Smith-Waterman score: 1247; 61.0% identity (82.5% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MGDNITSITEFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMYF : : : ::.. : : ::: ...:: :::: ::..::::::.:.:.: :: .::.:::: CCDS43 MEGNKTWITDITLPRFQVGPALEILLCGLFSAFYTLTLLGNGVIFGIICLDCKLHTPMYF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSYD ::::::.:::.:: : ::.::.::.. . ::: .:::::. .:: .:::.::::::: CCDS43 FLSHLAIVDISYASNYVPKMLTNLMNQESTISFFPCIMQTFLYLAFAHVECLILVVMSYD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCEI :. ::::::: ..:.:::: .:::.::. . ::.:. :::.: :::: :..: :::::: CCDS43 RYADICHPLRYNSLMSWRVCTVLAVASWVFSFLLALVPLVLILSLPFCGPHEINHFFCEI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVGPLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFCTC :.::::::::: .:. ...:. . ::::: ..:::. :: :::.::: : .:::: :: CCDS43 LSVLKLACADTWLNQVVIFAACVFILVGPLCLVLVSYLRILAAILRIQSGEGRRKAFSTC 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FSHLCVIGLFYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKNTL :::::.:::.:.::. :..:. .:.::.: : ::.::::::::::: ::::.:::..: CCDS43 SSHLCVVGLFFGSAIVTYMAPKSRHPEEQQKVLSLFYSLFNPMLNPLIYSLRNAEVKGAL 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 KRVLGVERAL .:.: :: CCDS43 RRALRKERLT 310 >>CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 (312 aa) initn: 842 init1: 842 opt: 905 Z-score: 756.8 bits: 148.2 E(32554): 7.8e-36 Smith-Waterman score: 905; 46.8% identity (76.0% similar) in 308 aa overlap (2-308:3-309) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MGDNITSITEFLLLGFPVGPRIQMLLFGLFSLFYVFTLLGNGTILGLISLDSRLHAPMY : : .:. :.:.:. :...:..: . . :..:::::.::. : :..:::.::: CCDS10 MDGVNDSSLQGFVLMGISDHPQLEMIFFIAILFSYLLTLLGNSTIILLSRLEARLHTPMY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 FFLSHLAVVDIAYACNTVPRMLVNLLHPAKPISFAGRMMQTFLFSTFAVTECLLLVVMSY ::::.:. .:.:.: ..::.::.:: :.: ::..: . : ..: ...:::.:::::.. CCDS10 FFLSNLSSLDLAFATSSVPQMLINLWGPGKTISYGGCITQLYVFLWLGATECILLVVMAF 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 DLYVAICHPLRYLAIMTWRVCITLAVTSWTTGVLLSLIHLVLLLPLPFCRPQKIYHFFCE : :::.:.:::: :::. ..: ::: . :. :.:. .. : ::.: ... :.:: CCDS10 DRYVAVCRPLRYTAIMNPQLCWLLAVIACLGGLGNSVIQSTFTLQLPLCGHRRVEGFLCE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 ILAVLKLACADTHINENMVLAGAISGLVG-PLSTIVVSYMCILCAILQIQSREVQRKAFC . :..::::.:: .:. :: :. . ... ::: ::.:: : :.:.:.: : .:::: CCDS10 VPAMIKLACGDTSLNQA-VLNGVCTFFTAVPLSIIVISYCLIAQAVLKIRSAEGRRKAFN 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCFSHLCVIGLFYGTAIIMYVGPRYGNPKEQKKYLLLFHSLFNPMLNPLICSLRNSEVKN ::.::: :. ::::.: :. : .. ..: :.. ::.:: .::.:::: .::: :::. CCDS10 TCLSHLLVVFLFYGSASYGYLLPAKNSKQDQGKFISLFYSLVTPMVNPLIYTLRNMEVKG 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 TLKRVLGVERAL .:.:.:: : CCDS10 ALRRLLGKGREVG 300 310 310 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 07:56:10 2016 done: Tue Nov 8 07:56:10 2016 Total Scan time: 2.420 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]