FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5830, 1059 aa 1>>>pF1KE5830 1059 - 1059 aa - 1059 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8855+/-0.000441; mu= -10.3774+/- 0.028 mean_var=555.8296+/-115.875, 0's: 0 Z-trim(124.9): 1856 B-trim: 546 in 1/60 Lambda= 0.054401 statistics sampled from 45331 (47408) to 45331 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.783), E-opt: 0.2 (0.556), width: 16 Scan time: 14.720 The best scores are: opt bits E(85289) NP_149104 (OMIM: 610671) zinc finger protein 628 [ (1059) 7465 601.4 8.6e-171 XP_005259428 (OMIM: 610671) PREDICTED: zinc finger (1055) 7440 599.5 3.3e-170 XP_016865210 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 753) 1313 118.4 1.5e-25 XP_016865209 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 786) 1313 118.5 1.5e-25 XP_016865208 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1313 118.5 1.6e-25 XP_016865207 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 806) 1313 118.5 1.6e-25 XP_016865205 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 821) 1313 118.5 1.6e-25 XP_016865204 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1313 118.5 1.7e-25 XP_016865203 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1313 118.5 1.7e-25 XP_016865202 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1313 118.5 1.7e-25 NP_689496 (OMIM: 610281) zinc finger protein 62 ho ( 867) 1313 118.5 1.7e-25 XP_016865200 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1313 118.5 1.7e-25 XP_016865199 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1313 118.5 1.7e-25 XP_016865201 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1313 118.5 1.7e-25 NP_001166109 (OMIM: 610281) zinc finger protein 62 ( 900) 1313 118.5 1.7e-25 XP_016865206 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 900) 1313 118.5 1.7e-25 XP_016881640 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 669) 1034 96.5 5.4e-19 XP_016881639 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 688) 1034 96.5 5.5e-19 XP_006723037 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 700) 1034 96.5 5.6e-19 NP_001138296 (OMIM: 604750) zinc finger protein 23 ( 700) 1034 96.5 5.6e-19 XP_016881638 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 700) 1034 96.5 5.6e-19 NP_006621 (OMIM: 604750) zinc finger protein 234 [ ( 700) 1034 96.5 5.6e-19 NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 1033 96.6 7.8e-19 XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1033 96.6 7.8e-19 NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 1033 96.6 7.8e-19 XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1033 96.6 7.8e-19 XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1033 96.6 7.8e-19 XP_016882695 (OMIM: 194550) PREDICTED: myeloid zin ( 450) 933 88.4 9.9e-17 NP_003413 (OMIM: 194550) myeloid zinc finger 1 iso ( 734) 933 88.6 1.4e-16 NP_932172 (OMIM: 194550) myeloid zinc finger 1 iso ( 734) 933 88.6 1.4e-16 XP_011525566 (OMIM: 194550) PREDICTED: myeloid zin ( 764) 933 88.6 1.4e-16 XP_005259261 (OMIM: 194550) PREDICTED: myeloid zin ( 775) 933 88.6 1.5e-16 XP_016881642 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 502) 902 86.0 5.8e-16 XP_016881641 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 502) 902 86.0 5.8e-16 XP_016882718 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 898 85.8 8.6e-16 XP_016882719 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 898 85.8 8.6e-16 XP_016882717 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 898 85.8 8.6e-16 XP_016882715 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16 XP_016882713 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16 XP_011525575 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16 XP_016882714 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16 XP_016882716 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16 XP_011525571 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16 XP_011525573 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16 XP_016882709 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16 XP_016882708 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16 XP_016882710 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16 XP_016882707 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16 XP_011525569 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16 XP_016882706 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 898 85.8 8.9e-16 >>NP_149104 (OMIM: 610671) zinc finger protein 628 [Homo (1059 aa) initn: 7465 init1: 7465 opt: 7465 Z-score: 3187.3 bits: 601.4 E(85289): 8.6e-171 Smith-Waterman score: 7465; 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