Result of FASTA (omim) for pFN21AE5692
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5692, 501 aa
  1>>>pF1KE5692 501 - 501 aa - 501 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6604+/-0.00038; mu= 21.8926+/- 0.024
 mean_var=68.6628+/-13.891, 0's: 0 Z-trim(112.6): 110  B-trim: 0 in 0/57
 Lambda= 0.154779
 statistics sampled from 21459 (21590) to 21459 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.253), width:  16
 Scan time:  9.420

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_004382 (OMIM: 602172) 7-alpha-hydroxycholest-4- ( 501) 3447 779.1       0
NP_000952 (OMIM: 145500,601699) prostacyclin synth ( 500) 1301 299.9 1.1e-80
NP_000771 (OMIM: 118455) cholesterol 7-alpha-monoo ( 504) 1087 252.1 2.7e-66
NP_004811 (OMIM: 270800,603711,613812) 25-hydroxyc ( 506) 1006 234.0 7.6e-61
XP_016869491 (OMIM: 270800,603711,613812) PREDICTE ( 528)  987 229.8 1.5e-59
NP_001311041 (OMIM: 270800,603711,613812) 25-hydro ( 460)  691 163.7 1.1e-39
XP_011512960 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 371)  340 85.2 3.6e-16
XP_005249228 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 420)  340 85.2 3.9e-16
NP_057677 (OMIM: 605994) 24-hydroxycholesterol 7-a ( 469)  340 85.3 4.2e-16
XP_016866410 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 471)  340 85.3 4.3e-16
NP_000777 (OMIM: 601637) lanosterol 14-alpha demet ( 509)  221 58.7 4.5e-08
NP_000758 (OMIM: 123930,614546) cytochrome P450 2B ( 491)  219 58.3   6e-08
NP_001265668 (OMIM: 605994) 24-hydroxycholesterol  ( 297)  200 53.8 7.9e-07
XP_016866414 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 335)  200 53.9 8.6e-07
XP_016866413 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 433)  200 54.0   1e-06
XP_016866412 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 435)  200 54.0   1e-06
NP_001265667 (OMIM: 605994) 24-hydroxycholesterol  ( 449)  193 52.4 3.1e-06
XP_016866411 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 451)  193 52.4 3.1e-06
NP_001122062 (OMIM: 201910,613815) steroid 21-hydr ( 465)  181 49.8 2.1e-05
NP_000491 (OMIM: 201910,613815) steroid 21-hydroxy ( 495)  181 49.8 2.1e-05
NP_828847 (OMIM: 614999) cytochrome P450 4X1 isofo ( 509)  180 49.6 2.6e-05
NP_899230 (OMIM: 608428,614974) cytochrome P450 26 ( 522)  179 49.4   3e-05
NP_063938 (OMIM: 605207,614416) cytochrome P450 26 ( 512)  172 47.8 8.9e-05
NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Hom ( 494)  163 45.8 0.00035
NP_000093 (OMIM: 202110,609300) steroid 17-alpha-h ( 508)  160 45.1 0.00056
NP_000753 (OMIM: 122700,122720,188890,211980) cyto ( 494)  157 44.4 0.00088
NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precu ( 493)  156 44.2   0.001
XP_005264490 (OMIM: 605207,614416) PREDICTED: cyto ( 454)  154 43.7  0.0013
NP_000774 (OMIM: 602239) cytochrome P450 26A1 isof ( 497)  144 41.5  0.0066
XP_016856462 (OMIM: 614999) PREDICTED: cytochrome  ( 470)  143 41.3  0.0074


>>NP_004382 (OMIM: 602172) 7-alpha-hydroxycholest-4-en-3  (501 aa)
 initn: 3447 init1: 3447 opt: 3447  Z-score: 4159.2  bits: 779.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3447; 99.8% identity (99.8% similar) in 501 aa overlap (1-501:1-501)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMFEFLKRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMFEFLKRM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 RTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGYRSVQGDH
       ::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGSILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGYRSVQGDH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 EMIHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDASCWHEDSLFRFCYYILFTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EMIHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDASCWHEDSLFRFCYYILFTA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 GYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPREWLEVGRLQRLFHKML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPREWLEVGRLQRLFHKML
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 SVSHSQEKEGISNWLGNMLQFLREQGVPSAMQDKFNFMMLWASQGNTGPTSFWALLYLLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SVSHSQEKEGISNWLGNMLQFLREQGVPSAMQDKFNFMMLWASQGNTGPTSFWALLYLLK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 HPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHTPVLDSVVEETLRLRAAPTLLRLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHTPVLDSVVEETLRLRAAPTLLRLV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 HEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPEPTVFKYDRFLNPNGSRKVDFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPEPTVFKYDRFLNPNGSRKVDFF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 KTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVTHFDLELVDPDTPLPHVDPQRW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVTHFDLELVDPDTPLPHVDPQRW
              430       440       450       460       470       480

              490       500 
pF1KE5 GFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
       :::::::::::::::::::::
NP_004 GFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
              490       500 

>>NP_000952 (OMIM: 145500,601699) prostacyclin synthase   (500 aa)
 initn: 1290 init1: 907 opt: 1301  Z-score: 1569.4  bits: 299.9 E(85289): 1.1e-80
Smith-Waterman score: 1301; 40.9% identity (69.2% similar) in 506 aa overlap (4-499:3-500)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMFEFLKRM
          :. .:: : ...   : : .  : ::: ::::: :..::::.:. : :.   :: ::
NP_000  MAWAALLGLLAALL--LLLLLSRRRTRRPGEPPLDLGSIPWLGYALDFGKDAASFLTRM
                10          20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 RTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGYRSVQGDH
       . ::::.::. .::.: : ..:: :.  .. . . .:::  ::  :. ..:   .::  :
NP_000 KEKHGDIFTILVGGRYVTVLLDPHSYDAVVWEPRTRLDFHAYAIFLMERIF---DVQLPH
        60        70        80        90       100          110    

              130          140       150       160        170      
pF1KE5 EMIHSASTKH---LRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDA-SCWHEDSLFRFCYYI
           . ...    :    :. :.:.:  .:  :.:   : . .: : ::: .:. : : .
NP_000 YSPSDEKARMKLTLLHRELQALTEAMYTNLHAVLL---GDATEAGSGWHEMGLLDFSYSF
          120       130       140          150       160       170 

        180             190       200       210       220       230
pF1KE5 LFTAGYLSLFGYT------KDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPREWLEVG
       :. ::::.:.:        ... :: ......:  ::..: :.:... . :   .  .. 
NP_000 LLRAGYLTLYGIEALPRTHESQAQDRVHSADVFHTFRQLDRLLPKLARGSLSVGDKDHMC
             180       190       200       210       220       230 

              240       250       260       270       280       290
pF1KE5 RLQRLFHKMLSVSHSQEKEGISNWLGNMLQFLREQGVPSAMQDKFNFMMLWASQGNTGPT
        ..  . :.:: ..  ..   :.:: ..:  :.:.::   :: .   ..:::.::: ::.
NP_000 SVKSRLWKLLSPARLARRAHRSKWLESYLLHLEEMGVSEEMQARALVLQLWATQGNMGPA
             240       250       260       270       280       290 

              300       310       320       330       340       350
pF1KE5 SFWALLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHTPVLDSVVEETLRL
       .:: ::.:::.:::. ::: :  ..: .:.  ..:. ..   .:. :::::::. :.:::
NP_000 AFWLLLFLLKNPEALAAVRGELESILWQAEQPVSQTTTLPQKVLDSTPVLDSVLSESLRL
             300       310       320       330       340       350 

              360       370       380       390       400       410
pF1KE5 RAAPTLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPEPTVFKYDRFLN
        ::: . : :  : .. :..:.:. .:.:: : :::.:: . ::.:. .: ::::.::::
NP_000 TAAPFITREVVVDLAMPMADGREFNLRRGDRLLLFPFLSPQRDPEIYTDPEVFKYNRFLN
             360       370       380       390       400       410 

              420       430       440       450       460       470
pF1KE5 PNGSRKVDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVTHFDLELVDPDT
       :.::.: ::.: ::....:.::::.: . : :: .:.. .: :..:...:.::::.. :.
NP_000 PDGSEKKDFYKDGKRLKNYNMPWGAGHNHCLGRSYAVNSIKQFVFLVLVHLDLELINADV
             420       430       440       450       460       470 

              480       490       500 
pF1KE5 PLPHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
        .:. : .:.::: ::: :::  :::..:  
NP_000 EIPEFDLSRYGFGLMQPEHDVPVRYRIRP  
             480       490       500  

>>NP_000771 (OMIM: 118455) cholesterol 7-alpha-monooxyge  (504 aa)
 initn: 838 init1: 318 opt: 1087  Z-score: 1311.1  bits: 252.1 E(85289): 2.7e-66
Smith-Waterman score: 1087; 35.5% identity (69.7% similar) in 512 aa overlap (2-497:6-501)

                   10        20          30        40        50    
pF1KE5     MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGML--RQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMF
            ..::       ..::.  ::  .:  :.:.  ::::..: .:.:: :. :  : .
NP_000 MMTTSLIWG-------IAIAACCCLWLILGIRRRQTGEPPLENGLIPYLGCALQFGANPL
                      10        20        30        40        50   

           60        70        80        90       100       110    
pF1KE5 EFLKRMRTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGYR
       :::.  . ::: ::: .: :.:  :. .:::.  .:    . .:. ..      :.::.:
NP_000 EFLRANQRKHGHVFTCKLMGKYVHFITNPLSYHKVLCHG-KYFDWKKFHFATSAKAFGHR
            60        70        80        90        100       110  

             120        130       140       150       160       170
pF1KE5 SVQ---GDH-EMIHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDASCWHEDSLF
       :..   :.  : :...  : :.: .:..:.:.:...:. .:    . .  .. :  ....
NP_000 SIDPMDGNTTENINDTFIKTLQGHALNSLTESMMENLQRIMRPPVSSNSKTAAWVTEGMY
            120       130       140       150       160       170  

              180       190       200         210       220        
pF1KE5 RFCYYILFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGEL--FMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPREWLE
        ::: ..: ::::..::    . .:  .:  :  . .:..:: .:: .: .:  : . ..
NP_000 SFCYRVMFEAGYLTIFGRDLTR-RDTQKAHILNNLDNFKQFDKVFPALVAGL--PIHMFR
            180       190        200       210       220           

      230       240          250       260         270       280   
pF1KE5 VGRLQRLFHKML-SVSHS--QEKEGISNWLGNMLQFLRE--QGVPSAMQDKFNFMMLWAS
       ...  :  .:.  :. :   :..:.::. : .. .:: .  .   .  . : ....::::
NP_000 TAHNAR--EKLAESLRHENLQKRESISE-LISLRMFLNDTLSTFDDLEKAKTHLVVLWAS
     230         240       250        260       270       280      

           290       300       310       320          330       340
pF1KE5 QGNTGPTSFWALLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETK---QSFAFKLGALQHTPVL
       :.:: :..::.:. ....:::..:. ::. ..: .:  ...   . . .. . :.  :::
NP_000 QANTIPATFWSLFQMIRNPEAMKAATEEVKRTLENAGQKVSLEGNPICLSQAELNDLPVL
        290       300       310       320       330       340      

              350       360       370       380       390       400
pF1KE5 DSVVEETLRLRAAPTLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPEP
       ::...:.::: .:   .: ..::.::.. .:. : .:. ::.::.: : .:.::.:.:.:
NP_000 DSIIKESLRLSSASLNIRTAKEDFTLHLEDGS-YNIRKDDIIALYPQL-MHLDPEIYPDP
        350       360       370        380       390        400    

              410       420       430       440       450       460
pF1KE5 TVFKYDRFLNPNGSRKVDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVTH
        .:::::.:. ::. :. :. .: :...: ::.:::..:::::.::. :.: :..::...
NP_000 LTFKYDRYLDENGKTKTTFYCNGLKLKYYYMPFGSGATICPGRLFAIHEIKQFLILMLSY
          410       420       430       440       450       460    

              470       480       490       500 
pF1KE5 FDLELVDPDTPLPHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
       :.:::.. ..  : .: .: :.: . : .:..:.:..    
NP_000 FELELIEGQAKCPPLDQSRAGLGILPPLNDIEFKYKFKHL 
          470       480       490       500     

>>NP_004811 (OMIM: 270800,603711,613812) 25-hydroxychole  (506 aa)
 initn: 750 init1: 249 opt: 1006  Z-score: 1213.3  bits: 234.0 E(85289): 7.6e-61
Smith-Waterman score: 1006; 36.1% identity (66.9% similar) in 504 aa overlap (3-497:19-504)

                               10        20        30        40    
pF1KE5                 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLG
                         : : .:.: :...:  :::  . : ::: :::: :: .:.::
NP_004 MAGEVSAATGRFSLERLGLPGLALAAALLLLA--LCLL-VRRTRRPGEPPLIKGWLPYLG
               10        20        30           40        50       

           50        60        70        80        90       100    
pF1KE5 HAMAFRKNMFEFLKRMRTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAK
        .. .::. ..:.: .. .:::.::: :::.:.::..::...  ..:. ...:.:  ...
NP_004 VVLNLRKDPLRFMKTLQKQHGDTFTVLLGGKYITFILDPFQYQLVIKN-HKQLSFRVFSN
        60        70        80        90       100        110      

          110       120          130       140       150       160 
pF1KE5 KLVLKVFGYRSVQGDHEM---IHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDA
       ::. :.:.  ..: .:.:   .:    . :.: .:  : :.:...:. :.   .   : .
NP_004 KLLEKAFSISQLQKNHDMNDELH-LCYQFLQGKSLDILLESMMQNLKQVF---EPQLLKT
        120       130        140       150       160          170  

             170       180       190       200       210       220 
pF1KE5 SCWHEDSLFRFCYYILFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLL
       . :    :. ::  :.:   . ...: .   ... .  .::  .: :::  :  .: .. 
NP_004 TSWDTAELYPFCSSIIFEITFTTIYGKVIVCDNNKF-ISELRDDFLKFDDKFAYLVSNI-
            180       190       200        210       220       230 

             230       240       250          260       270        
pF1KE5 WPREWLEVGRLQRLFHKMLSVSHSQEKEGISNW---LGNMLQFLREQGVPSAMQ-DKFNF
        : : :  : .. . .:...   :..   ...:   . .  . :..  :   ..    ..
NP_004 -PIELL--GNVKSIREKIIKCFSSEKLAKMQGWSEVFQSRQDVLEKYYVHEDLEIGAHHL
                 240       250       260       270       280       

       280       290       300       310       320       330       
pF1KE5 MMLWASQGNTGPTSFWALLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHT
        .:::: .:: :: :::. :::.::::. :::.:  ..:  .  .  ..: ..:   :  
NP_004 GFLWASVANTIPTMFWAMYYLLRHPEAMAAVRDEIDRLLQSTGQKKGSGFPIHLTREQLD
       290       300       310       320       330       340       

         340       350       360       370       380       390     
pF1KE5 PV--LDSVVEETLRLRAAPTLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPD
        .  :.: . :.::: .  : .:.:.:: ::.  .: .:  :.::..:.:: . .: ::.
NP_004 SLICLESSIFEALRLSSYSTTIRFVEEDLTLSSETG-DYCVRKGDLVAIFPPV-LHGDPE
       350       360       370       380        390        400     

         400       410       420       430       440       450     
pF1KE5 IHPEPTVFKYDRFLNPNGSRKVDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFIL
       :   :  :.::::.. .:..:. ::: :::.. : ::.:.:.: :::::::: :.: ...
NP_004 IFEAPEEFRYDRFIE-DGKKKTTFFKRGKKLKCYLMPFGTGTSKCPGRFFALMEIKQLLV
         410       420        430       440       450       460    

         460       470       480       490       500 
pF1KE5 LMVTHFDLELVDPDTPLPHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
       ...:.::::..: : :.  .. .:  :: . :. :: :::..    
NP_004 ILLTYFDLEIID-DKPIG-LNYSRLLFGIQYPDSDVLFRYKVKS  
          470        480        490       500        

>>XP_016869491 (OMIM: 270800,603711,613812) PREDICTED: 2  (528 aa)
 initn: 749 init1: 248 opt: 987  Z-score: 1190.2  bits: 229.8 E(85289): 1.5e-59
Smith-Waterman score: 987; 35.9% identity (66.4% similar) in 488 aa overlap (19-497:54-526)

                           10        20        30        40        
pF1KE5             MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMA
                                     : ::     ::: :::: :: .:.:: .. 
XP_016 TVDSIVALWEDIQLMLTDCNPLRQDLDIYTLQLPEKTCLRRPGEPPLIKGWLPYLGVVLN
            30        40        50        60        70        80   

       50        60        70        80        90       100        
pF1KE5 FRKNMFEFLKRMRTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVL
       .::. ..:.: .. .:::.::: :::.:.::..::...  ..:. ...:.:  ...::. 
XP_016 LRKDPLRFMKTLQKQHGDTFTVLLGGKYITFILDPFQYQLVIKN-HKQLSFRVFSNKLLE
            90       100       110       120        130       140  

      110       120          130       140       150       160     
pF1KE5 KVFGYRSVQGDHEM---IHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDASCWH
       :.:.  ..: .:.:   .:    . :.: .:  : :.:...:. :.   .   : .. : 
XP_016 KAFSISQLQKNHDMNDELH-LCYQFLQGKSLDILLESMMQNLKQVF---EPQLLKTTSWD
            150       160        170       180          190        

         170       180       190       200       210       220     
pF1KE5 EDSLFRFCYYILFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPRE
          :. ::  :.:   . ...: .   ... .  .::  .: :::  :  .: ..  : :
XP_016 TAELYPFCSSIIFEITFTTIYGKVIVCDNNKF-ISELRDDFLKFDDKFAYLVSNI--PIE
      200       210       220       230        240       250       

         230       240       250          260       270        280 
pF1KE5 WLEVGRLQRLFHKMLSVSHSQEKEGISNW---LGNMLQFLREQGVPSAMQ-DKFNFMMLW
        :  : .. . .:...   :..   ...:   . .  . :..  :   ..    .. .::
XP_016 LL--GNVKSIREKIIKCFSSEKLAKMQGWSEVFQSRQDVLEKYYVHEDLEIGAHHLGFLW
           260       270       280       290       300       310   

             290       300       310       320       330           
pF1KE5 ASQGNTGPTSFWALLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHTPV--
       :: .:: :: :::. :::.::::. :::.:  ..:  .  .  ..: ..:   :   .  
XP_016 ASVANTIPTMFWAMYYLLRHPEAMAAVRDEIDRLLQSTGQKKGSGFPIHLTREQLDSLIC
           320       330       340       350       360       370   

     340       350       360       370       380       390         
pF1KE5 LDSVVEETLRLRAAPTLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPE
       :.: . :.::: .  : .:.:.:: ::.  .: .:  :.::..:.:: . .: ::.:   
XP_016 LESSIFEALRLSSYSTTIRFVEEDLTLSSETG-DYCVRKGDLVAIFPPV-LHGDPEIFEA
           380       390       400        410       420        430 

     400       410       420       430       440       450         
pF1KE5 PTVFKYDRFLNPNGSRKVDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVT
       :  :.::::.. .:..:. ::: :::.. : ::.:.:.: :::::::: :.: ......:
XP_016 PEEFRYDRFIE-DGKKKTTFFKRGKKLKCYLMPFGTGTSKCPGRFFALMEIKQLLVILLT
             440        450       460       470       480       490

     460       470       480       490       500 
pF1KE5 HFDLELVDPDTPLPHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
       .::::..: : :.  .. .:  :: . :. :: :::..    
XP_016 YFDLEIID-DKPIG-LNYSRLLFGIQYPDSDVLFRYKVKS  
               500        510       520          

>>NP_001311041 (OMIM: 270800,603711,613812) 25-hydroxych  (460 aa)
 initn: 496 init1: 249 opt: 691  Z-score: 833.7  bits: 163.7 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 691; 33.7% identity (64.3% similar) in 412 aa overlap (3-403:19-415)

                               10        20        30        40    
pF1KE5                 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLG
                         : : .:.: :...:  :::  . : ::: :::: :: .:.::
NP_001 MAGEVSAATGRFSLERLGLPGLALAAALLLLA--LCLL-VRRTRRPGEPPLIKGWLPYLG
               10        20        30           40        50       

           50        60        70        80        90       100    
pF1KE5 HAMAFRKNMFEFLKRMRTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAK
        .. .::. ..:.: .. .:::.::: :::.:.::..::...  ..:. ...:.:  ...
NP_001 VVLNLRKDPLRFMKTLQKQHGDTFTVLLGGKYITFILDPFQYQLVIKN-HKQLSFRVFSN
        60        70        80        90       100        110      

          110       120          130       140       150       160 
pF1KE5 KLVLKVFGYRSVQGDHEM---IHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDA
       ::. :.:.  ..: .:.:   .:    . :.: .:  : :.:...:. :.   .   : .
NP_001 KLLEKAFSISQLQKNHDMNDELH-LCYQFLQGKSLDILLESMMQNLKQVF---EPQLLKT
        120       130        140       150       160          170  

             170       180       190       200       210       220 
pF1KE5 SCWHEDSLFRFCYYILFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLL
       . :    :. ::  :.:   . ...: .   ... .  .::  .: :::  :  .: .. 
NP_001 TSWDTAELYPFCSSIIFEITFTTIYGKVIVCDNNKF-ISELRDDFLKFDDKFAYLVSNI-
            180       190       200        210       220       230 

             230       240       250          260       270        
pF1KE5 WPREWLEVGRLQRLFHKMLSVSHSQEKEGISNW---LGNMLQFLREQGVPSAMQ-DKFNF
        : : :  : .. . .:...   :..   ...:   . .  . :..  :   ..    ..
NP_001 -PIELL--GNVKSIREKIIKCFSSEKLAKMQGWSEVFQSRQDVLEKYYVHEDLEIGAHHL
                 240       250       260       270       280       

       280       290       300       310       320       330       
pF1KE5 MMLWASQGNTGPTSFWALLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHT
        .:::: .:: :: :::. :::.::::. :::.:  ..:  .  .  ..: ..:   :  
NP_001 GFLWASVANTIPTMFWAMYYLLRHPEAMAAVRDEIDRLLQSTGQKKGSGFPIHLTREQLD
       290       300       310       320       330       340       

         340       350       360       370       380       390     
pF1KE5 PV--LDSVVEETLRLRAAPTLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPD
        .  :.: . :.::: .  : .:.:.:: ::.  .: .:  :.::..:.:: . .: ::.
NP_001 SLICLESSIFEALRLSSYSTTIRFVEEDLTLSSETG-DYCVRKGDLVAIFPPV-LHGDPE
       350       360       370       380        390        400     

           400       410       420       430       440       450   
pF1KE5 IH--PEPTVFKYDRFLNPNGSRKVDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLF
       :   :: ::.                                                  
NP_001 IFEAPEQTVLTGETRGMEITELSNLYFCTAYSREKWRRERRKIHTHILVYLIILQ     
         410       420       430       440       450       460     

>>XP_011512960 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxychole  (371 aa)
 initn: 272 init1: 151 opt: 340  Z-score: 411.3  bits: 85.2 E(85289): 3.6e-16
Smith-Waterman score: 340; 24.7% identity (58.9% similar) in 360 aa overlap (7-360:3-348)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMFEFLKRM
             ...  ...: : : :  .:...   .::  :: .::.: .. : :  .::... 
XP_011     MELISPTVIIILGCLALFLLLQRKNLRRPPCIKGWIPWIGVGFEFGKAPLEFIEKA
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100       110          
pF1KE5 RTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGY-RSV-QG
       : :.: .:::   :. .::: .  ... .::.  .:.::   ....: .. .  ..:  .
XP_011 RIKYGPIFTVFAMGNRMTFVTEEEGINVFLKS--KKVDFELAVQNIVYRTASIPKNVFLA
         60        70        80          90       100       110    

      120       130       140       150         160       170      
pF1KE5 DHEMIHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVM--LTSKGWSLDASCWHEDSLFRFCYYI
        :: ..     ..   .:....  . . :   .  : ..: ..: .   .  :.     .
XP_011 LHEKLYIMLKGKMGTVNLHQFTGQLTEELHEQLENLGTHG-TMDLNNLVRHLLYPVTVNM
          120       130       140       150        160       170   

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE5 LFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPREWLEVGR-LQRL
       ::.    :::. .: : ... :  ... :  ..   .:.    ::  :.: .  . . .:
XP_011 LFNK---SLFSTNKKKIKEFHQYFQVYDEDFEYGSQLPE---CLL--RNWSKSKKWFLEL
              180       190       200          210         220     

         240        250       260       270       280       290    
pF1KE5 FHKML-SVSHSQEKEGISNWLGNMLQFLREQGVPSAMQDKFNFMMLWASQGNTGPTSFWA
       :.: . ...  .  .  :  : .    . :  . .  . ......:::: .:. :..::.
XP_011 FEKNIPDIKACKSAKDNSMTLLQATLDIVETETSKENSPNYGLLLLWASLSNAVPVAFWT
         230       240       250       260       270       280     

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE5 LLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHTPVLDSVVEETLRLRAAP
       : :.:.::.  .:. :  ..:.:.:    :...  .   :..  ..   : ::.::.:  
XP_011 LAYVLSHPDIHKAIMEGISSVFGKA---GKDKIKVSEDDLENLLLIKWCVLETIRLKAPG
         290       300       310          320       330       340  

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE5 TLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPEPTVFKYDRFLNPNGS
       .. : :                                                      
XP_011 VITRKVVKPVEILVVCSVRGSDVYYFNTL                               
            350       360       370                                

>>XP_005249228 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxychole  (420 aa)
 initn: 345 init1: 151 opt: 340  Z-score: 410.6  bits: 85.2 E(85289): 3.9e-16
Smith-Waterman score: 431; 25.6% identity (57.1% similar) in 445 aa overlap (7-443:3-417)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMFEFLKRM
             ...  ...: : : :  .:...   .::  :: .::.: .. : :  .::... 
XP_005     MELISPTVIIILGCLALFLLLQRKNLRRPPCIKGWIPWIGVGFEFGKAPLEFIEKA
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100       110          
pF1KE5 RTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGY-RSV-QG
       : :.: .:::   :. .::: .  ... .::.  .:.::   ....: .. .  ..:  .
XP_005 RIKYGPIFTVFAMGNRMTFVTEEEGINVFLKS--KKVDFELAVQNIVYRTASIPKNVFLA
         60        70        80          90       100       110    

      120       130       140       150         160       170      
pF1KE5 DHEMIHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVM--LTSKGWSLDASCWHEDSLFRFCYYI
        :: ..     ..   .:....  . . :   .  : ..: ..: .   .  :.     .
XP_005 LHEKLYIMLKGKMGTVNLHQFTGQLTEELHEQLENLGTHG-TMDLNNLVRHLLYPVTVNM
          120       130       140       150        160       170   

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE5 LFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPREWLEVGR-LQRL
       ::.    :::. .: : ... :  ... :  ..   .:.    ::  :.: .  . . .:
XP_005 LFNK---SLFSTNKKKIKEFHQYFQVYDEDFEYGSQLPE---CLL--RNWSKSKKWFLEL
              180       190       200          210         220     

         240        250       260       270       280       290    
pF1KE5 FHKML-SVSHSQEKEGISNWLGNMLQFLREQGVPSAMQDKFNFMMLWASQGNTGPTSFWA
       :.: . ...  .  .  :  : .    . :  . .  . ......:::: .:. :..::.
XP_005 FEKNIPDIKACKSAKDNSMTLLQATLDIVETETSKENSPNYGLLLLWASLSNAVPVAFWT
         230       240       250       260       270       280     

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE5 LLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHTPVLDSVVEETLRLRAAP
       : :.:.::.  .:. :  ..:.:.:    :...  .   :..  ..   : ::.::.:  
XP_005 LAYVLSHPDIHKAIMEGISSVFGKA---GKDKIKVSEDDLENLLLIKWCVLETIRLKAPG
         290       300       310          320       330       340  

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE5 TLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPEPTVFKYDRFLNPNGS
       .. : :     .:     .:..  ::.: : :.  .: .:   ::: .:: .:. . :  
XP_005 VITRKV-----VKPVEILNYIIPSGDLLMLSPFW-LHRNPKYFPEPELFKPERWKKANLE
                 350       360       370        380       390      

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE5 RK--VDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVTHFDLELVDPDTPL
       ..  .: :          : .:::   ::.:                             
XP_005 KHSFLDCF----------MAFGSGKFQCPARKGF                          
        400                 410       420                          

            480       490       500 
pF1KE5 PHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE

>>NP_057677 (OMIM: 605994) 24-hydroxycholesterol 7-alpha  (469 aa)
 initn: 428 init1: 151 opt: 340  Z-score: 410.0  bits: 85.3 E(85289): 4.2e-16
Smith-Waterman score: 519; 26.5% identity (58.0% similar) in 498 aa overlap (7-496:3-466)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMFEFLKRM
             ...  ...: : : :  .:...   .::  :: .::.: .. : :  .::... 
NP_057     MELISPTVIIILGCLALFLLLQRKNLRRPPCIKGWIPWIGVGFEFGKAPLEFIEKA
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100       110          
pF1KE5 RTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGY-RSV-QG
       : :.: .:::   :. .::: .  ... .::  ..:.::   ....: .. .  ..:  .
NP_057 RIKYGPIFTVFAMGNRMTFVTEEEGINVFLK--SKKVDFELAVQNIVYRTASIPKNVFLA
         60        70        80          90       100       110    

      120       130       140       150         160       170      
pF1KE5 DHEMIHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVM--LTSKGWSLDASCWHEDSLFRFCYYI
        :: ..     ..   .:....  . . :   .  : ..: ..: .   .  :.     .
NP_057 LHEKLYIMLKGKMGTVNLHQFTGQLTEELHEQLENLGTHG-TMDLNNLVRHLLYPVTVNM
          120       130       140       150        160       170   

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE5 LFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPREWLEVGR-LQRL
       ::.    :::. .: : ... :  ... :  ..   .:.    ::  :.: .  . . .:
NP_057 LFNK---SLFSTNKKKIKEFHQYFQVYDEDFEYGSQLPE---CLL--RNWSKSKKWFLEL
              180       190       200          210         220     

         240        250       260       270       280       290    
pF1KE5 FHKML-SVSHSQEKEGISNWLGNMLQFLREQGVPSAMQDKFNFMMLWASQGNTGPTSFWA
       :.: . ...  .  .  :  : .    . :  . .  . ......:::: .:. :..::.
NP_057 FEKNIPDIKACKSAKDNSMTLLQATLDIVETETSKENSPNYGLLLLWASLSNAVPVAFWT
         230       240       250       260       270       280     

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE5 LLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHTPVLDSVVEETLRLRAAP
       : :.:.::.  .:. :  ..:.:.:    :...  .   :..  ..   : ::.::.:  
NP_057 LAYVLSHPDIHKAIMEGISSVFGKA---GKDKIKVSEDDLENLLLIKWCVLETIRLKAPG
         290       300       310          320       330       340  

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE5 TLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPEPTVFKYDRFLNPNGS
       .. : :     .:     .:..  ::.: : :.  .: .:   ::: .:: .:. . :  
NP_057 VITRKV-----VKPVEILNYIIPSGDLLMLSPFW-LHRNPKYFPEPELFKPERWKKANLE
                 350       360       370        380       390      

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE5 RK--VDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVTHFDLELVDPDTPL
       ..  .: :          : .:::   ::.:.::: ::.. :.:.. ..:  :.::   :
NP_057 KHSFLDCF----------MAFGSGKFQCPARWFALLEVQMCIILILYKYDCSLLDP---L
        400                 410       420       430       440      

            480       490       500 
pF1KE5 PHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
       :. .  .   :. ::  . :..:.     
NP_057 PKQSYLHL-VGVPQPEGQCRIEYKQRI  
           450        460           

>>XP_016866410 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxychole  (471 aa)
 initn: 345 init1: 151 opt: 340  Z-score: 410.0  bits: 85.3 E(85289): 4.3e-16
Smith-Waterman score: 431; 25.6% identity (57.1% similar) in 445 aa overlap (7-443:3-417)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMFEFLKRM
             ...  ...: : : :  .:...   .::  :: .::.: .. : :  .::... 
XP_016     MELISPTVIIILGCLALFLLLQRKNLRRPPCIKGWIPWIGVGFEFGKAPLEFIEKA
                   10        20        30        40        50      

               70        80        90       100       110          
pF1KE5 RTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGY-RSV-QG
       : :.: .:::   :. .::: .  ... .::.  .:.::   ....: .. .  ..:  .
XP_016 RIKYGPIFTVFAMGNRMTFVTEEEGINVFLKS--KKVDFELAVQNIVYRTASIPKNVFLA
         60        70        80          90       100       110    

      120       130       140       150         160       170      
pF1KE5 DHEMIHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVM--LTSKGWSLDASCWHEDSLFRFCYYI
        :: ..     ..   .:....  . . :   .  : ..: ..: .   .  :.     .
XP_016 LHEKLYIMLKGKMGTVNLHQFTGQLTEELHEQLENLGTHG-TMDLNNLVRHLLYPVTVNM
          120       130       140       150        160       170   

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE5 LFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPREWLEVGR-LQRL
       ::.    :::. .: : ... :  ... :  ..   .:.    ::  :.: .  . . .:
XP_016 LFNK---SLFSTNKKKIKEFHQYFQVYDEDFEYGSQLPE---CLL--RNWSKSKKWFLEL
              180       190       200          210         220     

         240        250       260       270       280       290    
pF1KE5 FHKML-SVSHSQEKEGISNWLGNMLQFLREQGVPSAMQDKFNFMMLWASQGNTGPTSFWA
       :.: . ...  .  .  :  : .    . :  . .  . ......:::: .:. :..::.
XP_016 FEKNIPDIKACKSAKDNSMTLLQATLDIVETETSKENSPNYGLLLLWASLSNAVPVAFWT
         230       240       250       260       270       280     

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE5 LLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHTPVLDSVVEETLRLRAAP
       : :.:.::.  .:. :  ..:.:.:    :...  .   :..  ..   : ::.::.:  
XP_016 LAYVLSHPDIHKAIMEGISSVFGKA---GKDKIKVSEDDLENLLLIKWCVLETIRLKAPG
         290       300       310          320       330       340  

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE5 TLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPEPTVFKYDRFLNPNGS
       .. : :     .:     .:..  ::.: : :.  .: .:   ::: .:: .:. . :  
XP_016 VITRKV-----VKPVEILNYIIPSGDLLMLSPFW-LHRNPKYFPEPELFKPERWKKANLE
                 350       360       370        380       390      

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE5 RK--VDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVTHFDLELVDPDTPL
       ..  .: :          : .:::   ::.:                             
XP_016 KHSFLDCF----------MAFGSGKFQCPARKTNRKEQHEPPDFFRNCSLQSEESHYSRQ
        400                 410       420       430       440      

            480       490       500 
pF1KE5 PHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE
                                    
XP_016 SHIKLYDLNGGIRRRVFSVEENFFE    
        450       460       470     




501 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 05:53:09 2016 done: Tue Nov  8 05:53:11 2016
 Total Scan time:  9.420 Total Display time:  0.060

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com