FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5692, 501 aa 1>>>pF1KE5692 501 - 501 aa - 501 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6604+/-0.00038; mu= 21.8926+/- 0.024 mean_var=68.6628+/-13.891, 0's: 0 Z-trim(112.6): 110 B-trim: 0 in 0/57 Lambda= 0.154779 statistics sampled from 21459 (21590) to 21459 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16 Scan time: 9.420 The best scores are: opt bits E(85289) NP_004382 (OMIM: 602172) 7-alpha-hydroxycholest-4- ( 501) 3447 779.1 0 NP_000952 (OMIM: 145500,601699) prostacyclin synth ( 500) 1301 299.9 1.1e-80 NP_000771 (OMIM: 118455) cholesterol 7-alpha-monoo ( 504) 1087 252.1 2.7e-66 NP_004811 (OMIM: 270800,603711,613812) 25-hydroxyc ( 506) 1006 234.0 7.6e-61 XP_016869491 (OMIM: 270800,603711,613812) PREDICTE ( 528) 987 229.8 1.5e-59 NP_001311041 (OMIM: 270800,603711,613812) 25-hydro ( 460) 691 163.7 1.1e-39 XP_011512960 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 371) 340 85.2 3.6e-16 XP_005249228 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 420) 340 85.2 3.9e-16 NP_057677 (OMIM: 605994) 24-hydroxycholesterol 7-a ( 469) 340 85.3 4.2e-16 XP_016866410 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 471) 340 85.3 4.3e-16 NP_000777 (OMIM: 601637) lanosterol 14-alpha demet ( 509) 221 58.7 4.5e-08 NP_000758 (OMIM: 123930,614546) cytochrome P450 2B ( 491) 219 58.3 6e-08 NP_001265668 (OMIM: 605994) 24-hydroxycholesterol ( 297) 200 53.8 7.9e-07 XP_016866414 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 335) 200 53.9 8.6e-07 XP_016866413 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 433) 200 54.0 1e-06 XP_016866412 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 435) 200 54.0 1e-06 NP_001265667 (OMIM: 605994) 24-hydroxycholesterol ( 449) 193 52.4 3.1e-06 XP_016866411 (OMIM: 605994) PREDICTED: 24-hydroxyc ( 451) 193 52.4 3.1e-06 NP_001122062 (OMIM: 201910,613815) steroid 21-hydr ( 465) 181 49.8 2.1e-05 NP_000491 (OMIM: 201910,613815) steroid 21-hydroxy ( 495) 181 49.8 2.1e-05 NP_828847 (OMIM: 614999) cytochrome P450 4X1 isofo ( 509) 180 49.6 2.6e-05 NP_899230 (OMIM: 608428,614974) cytochrome P450 26 ( 522) 179 49.4 3e-05 NP_063938 (OMIM: 605207,614416) cytochrome P450 26 ( 512) 172 47.8 8.9e-05 NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Hom ( 494) 163 45.8 0.00035 NP_000093 (OMIM: 202110,609300) steroid 17-alpha-h ( 508) 160 45.1 0.00056 NP_000753 (OMIM: 122700,122720,188890,211980) cyto ( 494) 157 44.4 0.00088 NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precu ( 493) 156 44.2 0.001 XP_005264490 (OMIM: 605207,614416) PREDICTED: cyto ( 454) 154 43.7 0.0013 NP_000774 (OMIM: 602239) cytochrome P450 26A1 isof ( 497) 144 41.5 0.0066 XP_016856462 (OMIM: 614999) PREDICTED: cytochrome ( 470) 143 41.3 0.0074 >>NP_004382 (OMIM: 602172) 7-alpha-hydroxycholest-4-en-3 (501 aa) initn: 3447 init1: 3447 opt: 3447 Z-score: 4159.2 bits: 779.1 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 3447; 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NP_000 PDGSEKKDFYKDGKRLKNYNMPWGAGHNHCLGRSYAVNSIKQFVFLVLVHLDLELINADV 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KE5 PLPHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE .:. : .:.::: ::: ::: :::..: NP_000 EIPEFDLSRYGFGLMQPEHDVPVRYRIRP 480 490 500 >>NP_000771 (OMIM: 118455) cholesterol 7-alpha-monooxyge (504 aa) initn: 838 init1: 318 opt: 1087 Z-score: 1311.1 bits: 252.1 E(85289): 2.7e-66 Smith-Waterman score: 1087; 35.5% identity (69.7% similar) in 512 aa overlap (2-497:6-501) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGML--RQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMAFRKNMF ..:: ..::. :: .: :.:. ::::..: .:.:: :. : : . NP_000 MMTTSLIWG-------IAIAACCCLWLILGIRRRQTGEPPLENGLIPYLGCALQFGANPL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 EFLKRMRTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVLKVFGYR :::. . ::: ::: .: :.: :. .:::. .: . .:. .. :.::.: NP_000 EFLRANQRKHGHVFTCKLMGKYVHFITNPLSYHKVLCHG-KYFDWKKFHFATSAKAFGHR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 SVQ---GDH-EMIHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDASCWHEDSLF :.. :. : :... : :.: .:..:.:.:...:. .: . . .. : .... NP_000 SIDPMDGNTTENINDTFIKTLQGHALNSLTESMMENLQRIMRPPVSSNSKTAAWVTEGMY 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 RFCYYILFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGEL--FMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPREWLE ::: ..: ::::..:: . .: .: : . .:..:: .:: .: .: : . .. NP_000 SFCYRVMFEAGYLTIFGRDLTR-RDTQKAHILNNLDNFKQFDKVFPALVAGL--PIHMFR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 VGRLQRLFHKML-SVSHS--QEKEGISNWLGNMLQFLRE--QGVPSAMQDKFNFMMLWAS ... : .:. :. : :..:.::. : .. .:: . . . . : ....:::: NP_000 TAHNAR--EKLAESLRHENLQKRESISE-LISLRMFLNDTLSTFDDLEKAKTHLVVLWAS 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 QGNTGPTSFWALLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETK---QSFAFKLGALQHTPVL :.:: :..::.:. ....:::..:. ::. ..: .: ... . . .. . :. ::: NP_000 QANTIPATFWSLFQMIRNPEAMKAATEEVKRTLENAGQKVSLEGNPICLSQAELNDLPVL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 DSVVEETLRLRAAPTLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPDIHPEP ::...:.::: .: .: ..::.::.. .:. : .:. ::.::.: : .:.::.:.:.: NP_000 DSIIKESLRLSSASLNIRTAKEDFTLHLEDGS-YNIRKDDIIALYPQL-MHLDPEIYPDP 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 TVFKYDRFLNPNGSRKVDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFILLMVTH .:::::.:. ::. :. :. .: :...: ::.:::..:::::.::. :.: :..::... NP_000 LTFKYDRYLDENGKTKTTFYCNGLKLKYYYMPFGSGATICPGRLFAIHEIKQFLILMLSY 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KE5 FDLELVDPDTPLPHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE :.:::.. .. : .: .: :.: . : .:..:.:.. NP_000 FELELIEGQAKCPPLDQSRAGLGILPPLNDIEFKYKFKHL 470 480 490 500 >>NP_004811 (OMIM: 270800,603711,613812) 25-hydroxychole (506 aa) initn: 750 init1: 249 opt: 1006 Z-score: 1213.3 bits: 234.0 E(85289): 7.6e-61 Smith-Waterman score: 1006; 36.1% identity (66.9% similar) in 504 aa overlap (3-497:19-504) 10 20 30 40 pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLG : : .:.: :...: ::: . : ::: :::: :: .:.:: NP_004 MAGEVSAATGRFSLERLGLPGLALAAALLLLA--LCLL-VRRTRRPGEPPLIKGWLPYLG 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 HAMAFRKNMFEFLKRMRTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAK .. .::. ..:.: .. .:::.::: :::.:.::..::... ..:. ...:.: ... NP_004 VVLNLRKDPLRFMKTLQKQHGDTFTVLLGGKYITFILDPFQYQLVIKN-HKQLSFRVFSN 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 KLVLKVFGYRSVQGDHEM---IHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDA ::. :.:. ..: .:.: .: . :.: .: : :.:...:. :. . : . NP_004 KLLEKAFSISQLQKNHDMNDELH-LCYQFLQGKSLDILLESMMQNLKQVF---EPQLLKT 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 SCWHEDSLFRFCYYILFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLL . : :. :: :.: . ...: . ... . .:: .: ::: : .: .. NP_004 TSWDTAELYPFCSSIIFEITFTTIYGKVIVCDNNKF-ISELRDDFLKFDDKFAYLVSNI- 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE5 WPREWLEVGRLQRLFHKMLSVSHSQEKEGISNW---LGNMLQFLREQGVPSAMQ-DKFNF : : : : .. . .:... :.. ...: . . . :.. : .. .. NP_004 -PIELL--GNVKSIREKIIKCFSSEKLAKMQGWSEVFQSRQDVLEKYYVHEDLEIGAHHL 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 MMLWASQGNTGPTSFWALLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHT .:::: .:: :: :::. :::.::::. :::.: ..: . . ..: ..: : NP_004 GFLWASVANTIPTMFWAMYYLLRHPEAMAAVRDEIDRLLQSTGQKKGSGFPIHLTREQLD 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE5 PV--LDSVVEETLRLRAAPTLLRLVHEDYTLKMSSGQEYLFRHGDILALFPYLSVHMDPD . :.: . :.::: . : .:.:.:: ::. .: .: :.::..:.:: . .: ::. NP_004 SLICLESSIFEALRLSSYSTTIRFVEEDLTLSSETG-DYCVRKGDLVAIFPPV-LHGDPE 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 IHPEPTVFKYDRFLNPNGSRKVDFFKTGKKIHHYTMPWGSGVSICPGRFFALSEVKLFIL : : :.::::.. .:..:. ::: :::.. : ::.:.:.: :::::::: :.: ... NP_004 IFEAPEEFRYDRFIE-DGKKKTTFFKRGKKLKCYLMPFGTGTSKCPGRFFALMEIKQLLV 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 pF1KE5 LMVTHFDLELVDPDTPLPHVDPQRWGFGTMQPSHDVRFRYRLHPTE ...:.::::..: : :. .. .: :: . :. :: :::.. NP_004 ILLTYFDLEIID-DKPIG-LNYSRLLFGIQYPDSDVLFRYKVKS 470 480 490 500 >>XP_016869491 (OMIM: 270800,603711,613812) PREDICTED: 2 (528 aa) initn: 749 init1: 248 opt: 987 Z-score: 1190.2 bits: 229.8 E(85289): 1.5e-59 Smith-Waterman score: 987; 35.9% identity (66.4% similar) in 488 aa overlap (19-497:54-526) 10 20 30 40 pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLGHAMA : :: ::: :::: :: .:.:: .. XP_016 TVDSIVALWEDIQLMLTDCNPLRQDLDIYTLQLPEKTCLRRPGEPPLIKGWLPYLGVVLN 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 FRKNMFEFLKRMRTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAKKLVL .::. ..:.: .. .:::.::: :::.:.::..::... ..:. ...:.: ...::. XP_016 LRKDPLRFMKTLQKQHGDTFTVLLGGKYITFILDPFQYQLVIKN-HKQLSFRVFSNKLLE 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 KVFGYRSVQGDHEM---IHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDASCWH :.:. ..: .:.: .: . :.: .: : :.:...:. :. . : .. : XP_016 KAFSISQLQKNHDMNDELH-LCYQFLQGKSLDILLESMMQNLKQVF---EPQLLKTTSWD 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 EDSLFRFCYYILFTAGYLSLFGYTKDKEQDLLQAGELFMEFRKFDLLFPRFVYSLLWPRE :. :: :.: . ...: . ... . .:: .: ::: : .: .. : : XP_016 TAELYPFCSSIIFEITFTTIYGKVIVCDNNKF-ISELRDDFLKFDDKFAYLVSNI--PIE 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 WLEVGRLQRLFHKMLSVSHSQEKEGISNW---LGNMLQFLREQGVPSAMQ-DKFNFMMLW : : .. . .:... :.. ...: . . . :.. : .. .. .:: XP_016 LL--GNVKSIREKIIKCFSSEKLAKMQGWSEVFQSRQDVLEKYYVHEDLEIGAHHLGFLW 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 pF1KE5 ASQGNTGPTSFWALLYLLKHPEAIRAVREEATQVLGEARLETKQSFAFKLGALQHTPV-- :: .:: :: :::. :::.::::. :::.: ..: . . ..: ..: : . 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XP_016 YFDLEIID-DKPIG-LNYSRLLFGIQYPDSDVLFRYKVKS 500 510 520 >>NP_001311041 (OMIM: 270800,603711,613812) 25-hydroxych (460 aa) initn: 496 init1: 249 opt: 691 Z-score: 833.7 bits: 163.7 E(85289): 1.1e-39 Smith-Waterman score: 691; 33.7% identity (64.3% similar) in 412 aa overlap (3-403:19-415) 10 20 30 40 pF1KE5 MVLWGPVLGALLVVIAGYLCLPGMLRQRRPWEPPLDKGTVPWLG : : .:.: :...: ::: . : ::: :::: :: .:.:: NP_001 MAGEVSAATGRFSLERLGLPGLALAAALLLLA--LCLL-VRRTRRPGEPPLIKGWLPYLG 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 HAMAFRKNMFEFLKRMRTKHGDVFTVQLGGQYFTFVMDPLSFGPILKDTQRKLDFGQYAK .. .::. ..:.: .. .:::.::: :::.:.::..::... ..:. ...:.: ... NP_001 VVLNLRKDPLRFMKTLQKQHGDTFTVLLGGKYITFILDPFQYQLVIKN-HKQLSFRVFSN 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 KLVLKVFGYRSVQGDHEM---IHSASTKHLRGDGLKDLNETMLDSLSFVMLTSKGWSLDA ::. :.:. ..: .:.: .: . :.: .: : :.:...:. :. . : . 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