FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5770, 600 aa 1>>>pF1KE5770 600 - 600 aa - 600 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9948+/-0.00122; mu= 6.9705+/- 0.073 mean_var=168.0660+/-32.750, 0's: 0 Z-trim(107.0): 60 B-trim: 0 in 0/48 Lambda= 0.098931 statistics sampled from 9262 (9319) to 9262 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16 Scan time: 3.260 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 3939 575.0 9.4e-164 CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 774 123.4 1.2e-27 CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 710 114.2 5.6e-25 CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 535 89.1 1.4e-17 CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 520 87.0 7.9e-17 CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 515 86.4 1.4e-16 CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 504 84.8 4.2e-16 CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 504 84.8 4.5e-16 CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 500 84.2 6.8e-16 CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 462 78.8 2.4e-14 CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 453 77.6 7.7e-14 CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 453 77.6 7.7e-14 CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 439 75.6 3.5e-13 CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 439 75.6 3.5e-13 CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 423 73.1 9.3e-13 CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 424 73.3 9.6e-13 CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 424 73.4 1.1e-12 CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 424 73.4 1.1e-12 CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 424 73.4 1.2e-12 CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 415 72.1 2.8e-12 CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 415 72.1 2.8e-12 CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 403 70.3 8.1e-12 CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 403 70.3 8.1e-12 CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 401 70.0 9.5e-12 CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 388 68.2 3.5e-11 >>CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 (600 aa) initn: 3939 init1: 3939 opt: 3939 Z-score: 3053.3 bits: 575.0 E(32554): 9.4e-164 Smith-Waterman score: 3939; 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CCDS83 EWQVERESISRLMQNYEKINVNEITRFSDFPLSKKTLKGLQEAQYRLVTEIQKQTIGLAL 50 60 70 80 90 100 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 RNKDVAAEAVTGSGKTLAFVIPILEILLRREEKLKKSQVGAIIITPTRELAIQIDEVLSH ..::: . : :::::::::..:.:: : : . . . .:..::.:::::: : ::: . CCDS83 QGKDVLGAAKTGSGKTLAFLVPVLEALYRLQWT-STDGLGVLIISPTRELAYQTFEVLRK 110 120 130 140 150 160 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 FTKHFPEFSQILWIGGRNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVRS :. .:: : :::.. ...::... ::.: ::::: ... : ... . . CCDS83 VGKNH-DFSAGLIIGGKDLKHEAERINNI--NILVCTPGRL---LQHMDETVSFHA--TD 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 LDVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRVS :..::::::::.::::: ..:...: :::.:.: :::::::. :..:.: .:.:: : CCDS83 LQMLVLDEADRILDMGFADTMNAVIENLPKKRQTLLFSATQTKSVKDLARLSLKNPEYVW 220 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 VKEKGVAASSAQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFSTCACVEYYG :.:: . .::. ::. :.::. ..:.. : :::.: ..: .::::.: :.: CCDS83 VHEK-----AKYSTPATLEQNYIVCELQQKISVLYSFLRSHLKKKSIVFFSSCKEVQYLY 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 KALEVLVKGVKIMCIHGKMK-YKRNKIFMEFRKLQSGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQY ... : ::.:. .::... ..: ... :: . ....: ::. :::.:.: ::::::. CCDS83 RVFCRLRPGVSILALHGRQQQMRRMEVYNEFVRKRAAVLFATDIAARGLDFPAVNWVLQF 340 350 360 370 380 390 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 DPPSNASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYINFLAINQKCPLQEMK--PQRNTA : : .:....:: ::::: . : ::..::: :..... : ...: :..:.: :.. CCDS83 DCPEDANTYIHRAGRTARYKEDGEALLILLPSEKAMVQQL-LQKKVPVKEIKINPEK-LI 400 410 420 430 440 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 DLLPKLKSMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYAKHECNLIFRLKDLDFASLARGFALLRMP :. ::.:. :. . :.... :::::.. . . .: .. : . : ...: : CCDS83 DVQKKLESILAQDQDLKERAQRCFVSYVRSVYLMKDKEVFDVSKLPIPEYALSLGLAVAP 450 460 470 480 490 500 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 KMPELRGKQFPDFVPVDVNTDTIPFKDKIREKQRQKLLEQQRREKTENEGRRKFIKNKAW .. :. : : :. .: .: .:..: : . :. ..: .:. CCDS83 RVRFLQKMQ------------KQPTKELVR-SQADKVIEP-RAPSLTNDEVEEF---RAY 510 520 530 540 550 530 540 550 560 570 pF1KE5 SKQKAKKEKK--KKMNEKRKREEGSDIEDEDMEELLNDTRLLKKLKKGKITEEEFEKGLL ..: . .: :... ..:.... ..:. :: .. .. .:: :.: CCDS83 FNEKMSILQKGGKRLEGTEHRQDNDTGNEEQEEEEDDEEEMEEKLAKAKGSQAPSLPNTS 560 570 580 590 600 610 580 590 600 pF1KE5 TTGKRTIKTVDLGISDLEDDC CCDS83 EAQKIKEVPTQFLDRDEEEEDADFLKVKRHNVFGLDLKDEKTLQKKEPSKSSIKKKMTKV 620 630 640 650 660 670 >>CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 (670 aa) initn: 836 init1: 264 opt: 710 Z-score: 561.9 bits: 114.2 E(32554): 5.6e-25 Smith-Waterman score: 991; 35.9% identity (68.5% similar) in 518 aa overlap (8-520:178-662) 10 20 30 pF1KE5 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPVQS :. :: .. ..: :..:.:: :: .: CCDS21 ENNVEKPDNDEDESEVPSLPLGLTGAFEDTSFASLCNLVNENTLKAIKEMGFTNMTEIQH 150 160 170 180 190 200 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 ATIPLFMRNKDVAAEAVTGSGKTLAFVIPILEILLRREEKLKKSQVGAIIITPTRELAIQ .: .....:. : : :::::::::.:: .:.... . . .. .:..:..::::::.: CCDS21 KSIRPLLEGRDLLAAAKTGSGKTLAFLIPAVELIVKLRF-MPRNGTGVLILSPTRELAMQ 210 220 230 240 250 260 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 IDEVLSHF-TKHFPEFSQILWIGGRNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGL ::... :.: .. :. :: : . ..... . : :::::::::: : .. .. :. CCDS21 TFGVLKELMTHHVHTYGLIM--GGSNRSAEAQKLGN-GINIIVATPGRLLDHMQ-NTPGF 270 280 290 300 310 320 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 DLASCVRSLDVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAG ..:. ::.:::::.::.::: .. :...:: .:.: :::::::..::.:.: . CCDS21 ----MYKNLQCLVIDEADRILDVGFEEELKQIIKLLPTRRQTMLFSATQTRKVEDLARIS 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 LRN-PVRVSVKEKGVAASSAQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFS :.. :. : :: ..:. : . ::. :.:: ....: : ::......: .:::: CCDS21 LKKEPLYV-----GVDDDKANATVDGLEQGYVVCPSEKRFLLLFTFLKKNRKKKLMVFFS 380 390 400 410 420 430 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 TCACVEYYGKALEVLVKGVKIMCIHGKMKY-KRNKIFMEFRKLQSGILVCTDVMARGIDI .: :.:. . :. . . .. ::::.: ::. :..: . .:: :.:::: :::.:: CCDS21 SCMSVKYHYELLNYI--DLPVLAIHGKQKQNKRTTTFFQFCNADSGTLLCTDVAARGLDI 440 450 460 470 480 490 340 350 360 370 380 390 pF1KE5 PEVNWVLQYDPPSNASAFVHRCGRTARIGHG-GSALVFLLPMEESYINFLAINQKCPLQE :::.:..:::::.. . ..:: ::::: .: : ::..: : : ... .: ..: ::.: CCDS21 PEVDWIVQYDPPDDPKEYIHRVGRTARGLNGRGHALLILRPEELGFLRYLK-QSKVPLSE 500 510 520 530 540 550 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 MK-PQRNTADLLPKLKSMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYAKHECNLIFRLKDLDFASLA . . .:. .:... . . .....:. ::..:: .: . :: ...:.. ..: CCDS21 FDFSWSKISDIQSQLEKLIEKNYFLHKSAQEAYKSYIRAYDSHSLKQIFNVNNLNLPQVA 560 570 580 590 600 610 460 470 480 490 500 510 pF1KE5 RGFALLRMPKMPELRGKQFPDFVPVDVNTDTIPFKDKIREKQRQKLLEQQRREKTENEGR .: : . : :: ..::.. . : ... . :. .:.:. CCDS21 LSF------------GFKVPPFVDLNVNSN----EGKQKKRGGGGGFGYQKTKKVEKSKI 620 630 640 650 520 530 540 550 560 570 pF1KE5 RKFIKNKAWSKQKAKKEKKKKMNEKRKREEGSDIEDEDMEELLNDTRLLKKLKKGKITEE : :..:. CCDS21 FKHISKKSSDSRQFSH 660 670 >>CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 (455 aa) initn: 612 init1: 216 opt: 535 Z-score: 429.3 bits: 89.1 E(32554): 1.4e-17 Smith-Waterman score: 689; 37.0% identity (68.1% similar) in 351 aa overlap (23-372:38-367) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPVQSATIPLFMRNKDVAAE : .::. : .: .::: ....:. . CCDS86 DSPTEASQPIVEEEETKTFKDLGVTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQGRDIIGL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 AVTGSGKTLAFVIPILEILLRREEKLKKSQVGAIIITPTRELAIQIDEVLSHFTKHFPEF : :::::: ::..:::. ::. ..: :...:::::::.::.: . . . . CCDS86 AETGSGKTGAFALPILNALLETPQRLF-----ALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIGVQ 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 SQILWIGGRNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVRSLDVLVLDE : .. .:: . . . .. .::.:::::: : .. ...:..: :.: ::.:: CCDS86 SAVI-VGGIDSMSQSLALAKKP-HIIIATPGRLIDHLE-NTKGFNL----RALKYLVMDE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 ADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRVSVKEKGVAA :::.:.: ::. .. ::. .:..:.: :::::.:..:..: ::.:.:::. .: CCDS86 ADRILNMDFETEVDKILKVIPRDRKTFLFSATMTKKVQKLQRAALKNPVKCAV------- 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 SSAQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFSTCACVEYYGKALEVLVK :: .: .:..::. . : . ::..: . .. ..: ::: .. . :. : CCDS86 SSKYQTVEKLQQYYIFIPSKFKDTYLVYILNELAGNSFMIFCSTCNNTQRTALLLRNL-- 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 GVKIMCIHGKM-KYKRNKIFMEFRKLQSGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQYDPPSNASA : . .::.: . :: . .:. .::. ::: .::.:::.:. :...: :.... CCDS86 GFTAIPLHGQMSQSKRLGSLNKFKAKARSILLATDVASRGLDIPHVDVVVNFDIPTHSKD 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 FVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYINFLAINQKCPLQEMKPQRNTADLLPKLKSMA ..:: ::::: :..:.:..:. CCDS86 YIHRVGRTARAGRSGKAITFVTQYDVELFQRIEHLIGKKLPGFPTQDDEVMMLTERVAEA 350 360 370 380 390 400 >>CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 (648 aa) initn: 506 init1: 155 opt: 520 Z-score: 415.6 bits: 87.0 E(32554): 7.9e-17 Smith-Waterman score: 603; 31.8% identity (66.6% similar) in 359 aa overlap (17-372:250-591) 10 20 30 40 pF1KE5 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPVQSATIPLFMRN .:.:. ... :: ::.:: . :. ... CCDS49 NFNITWDDLKDGEKRPIPNPTCTFDDAFQCYPEVMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQG 220 230 240 250 260 270 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 KDVAAEAVTGSGKTLAFVIP-ILEILLRREEKLKKSQVGAIIITPTRELAIQIDEVLSHF :. . : ::.:::: ...: .....:. : .... : ...:::::::.:.. .. CCDS49 IDLIGVAQTGTGKTLCYLMPGFIHLVLQPSLKGQRNRPGMLVLTPTRELALQVEGECCKY 280 290 300 310 320 330 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 TKHFPEFSQILWIGGRNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVRSL . . . .. :: : :..:..:. : .::.::::::.:. . .. ..: ... CCDS49 S--YKGLRSVCVYGGGNRDEQIEELKK-GVDIIIATPGRLNDL--QMSNFVNL----KNI 340 350 360 370 380 390 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 DVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRVSV :::::::..:::::: .: :: . .:.: . ::: . :. :... :..:. : : CCDS49 TYLVLDEADKMLDMGFEPQIMKILLDVRPDRQTVMTSATWPHSVHRLAQSYLKEPMIVYV 400 410 420 430 440 450 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 KEKGVAASSAQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQ-EKHLVFFSTCACVEYYG ..: :. : .: .: .::.... ::.. .. .: .:: : : ... . CCDS49 GTLDLVAVSSVK-----QNI-IVTTEEEKWSHMQTFLQSMSSTDKVIVFVSRKAVADHLS 460 470 480 490 500 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 KALEVLVKGVKIMCIHG-KMKYKRNKIFMEFRKLQSGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQY . .... .... .:: . . :.: . .:. . ::. ::. .::.:. .:. : .. CCDS49 S--DLILGNISVESLHGDREQRDREKALENFKTGKVRILIATDLASRGLDVHDVTHVYNF 510 520 530 540 550 560 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 DPPSNASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYINFLAINQKCPLQEMKPQRNTADL : : : .::: :::.: :. : ... : CCDS49 DFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTRNDWRVASELINILERANQSIPEELVSMAE 570 580 590 600 610 620 >>CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 (737 aa) initn: 438 init1: 206 opt: 515 Z-score: 410.9 bits: 86.4 E(32554): 1.4e-16 Smith-Waterman score: 561; 29.4% identity (62.9% similar) in 415 aa overlap (6-410:136-528) 10 20 30 pF1KE5 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPV ::.. ..:. ... :. : :. :. CCDS72 KKSKRVSSLDTSTHKSSDNKLEETLTREQKEGAFSNFPIS--EETIKLLKGRGVTYLFPI 110 120 130 140 150 160 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 QSATIPLFMRNKDVAAEAVTGSGKTLAFVIPILEILLRREEKLKKSQVGAIII-TPTREL : :. ...::. :.: ::.:::..:.::..: : : .: .:::. ... .::::: CCDS72 QVKTFGPVYEGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIERLQRNQETIKKSRSPKVLVLAPTREL 170 180 190 200 210 220 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 AIQIDEVLSHFTKHFPEFSQILWIGGRNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAE : :. . .. .:. ..: . :: . ....... : .:.:.::::..: . .. CCDS72 ANQVAKDFKDITR---KLSVACFYGGTSYQSQINHIRN-GIDILVGTPGRIKDHL--QSG 230 240 250 260 270 160 170 180 190 200 pF1KE5 GLDLASCVRSLDVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQR-----RTGLFSATQTQEV :::.. : .::::.:..::.:: ... :.. : .: ::::: : : CCDS72 RLDLSK----LRHVVLDEVDQMLDLGFAEQVEDIIHESYKTDSEDNPQTLLFSATCPQWV 280 290 300 310 320 330 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 ENLVRAGLRNPVRVSVKEKGVAASSAQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHK--Q .... ... .. .... .::. . .:. . :. ... . :. .. . CCDS72 YKVAKKYMKS----RYEQVDLVGKMTQKAATTVEHLAIQCHWSQRPAVIGDVLQVYSGSE 340 350 360 370 380 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 EKHLVFFSTCACVEYYGKALEVLVKGVKIMCIHGKMKYKRNKIFME-FRKLQSGILVCTD . ..: : : . :.. .: . .:.:: . .. .: .. ::. . .:: :. CCDS72 GRAIIFCETKKNVTEM--AMNPHIKQ-NAQCLHGDIAQSQREITLKGFREGSFKVLVATN 390 400 410 420 430 440 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 VMARGIDIPEVNWVLQYDPPSNASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYINFLAIN : :::.:::::. :.: .::... ...:: :::.: :. : . : : :.. . . .. CCDS72 VAARGLDIPEVDLVIQSSPPQDVESYIHRSGRTGRAGRTGICICFYQPRERGQLRY--VE 450 460 470 480 490 500 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 QKCPLQEMKPQR-NTADLLPKLKSMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYAKHECNLIFRLKD :: . . .: ::. : ::: CCDS72 QKAGITFKRVGVPSTMDLV-KSKSMDAIRSLASVSYAAVDFFRPSAQRLIEEKGAVDALA 510 520 530 540 550 560 >>CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 (715 aa) initn: 400 init1: 205 opt: 504 Z-score: 402.6 bits: 84.8 E(32554): 4.2e-16 Smith-Waterman score: 558; 30.1% identity (62.9% similar) in 399 aa overlap (6-392:117-491) 10 20 30 pF1KE5 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPV ::.. ..:. ... :. : .. :. CCDS73 PHPEPDCNPSEAASEESNSEIEQEIPVEQKEGAFSNFPIS--EETIKLLKGRGVTFLFPI 90 100 110 120 130 140 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 QSATIPLFMRNKDVAAEAVTGSGKTLAFVIPILEIL---LRREEKLKKSQVGAIIITPTR :. :. . .::. :.: ::.:::..:.::..: : :. ... . :: ....::: CCDS73 QAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKLHGELQDRKRGRAPQV--LVLAPTR 150 160 170 180 190 200 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 ELAIQIDEVLSHFTKHFPEFSQILWIGGRNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRK ::: :... .: .:: ..: . :: : . ::... : .:.:.::::..: .. CCDS73 ELANQVSKDFSDITK---KLSVACFYGGTPYGGQFERMRN-GIDILVGTPGRIKDHIQNG 210 220 230 240 250 160 170 180 190 200 pF1KE5 AEGLDLASCVRSLDVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQR-----RTGLFSATQTQ :::.. : .::::.:..::::: ... :: :. .: ::::: . CCDS73 K--LDLTK----LKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATCPH 260 270 280 290 300 310 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 EVENLVRAGLRNPVRVSVKEKGVAASSAQKTPSRLENYYMVCKADEK---FNQLVHFLRN : :... ... . .. . ....::: .:. . :. .. ...... . CCDS73 WVFNVAKKYMKS----TYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGDVIRVYSG 320 330 340 350 360 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 HKQEKHLVFFSTCACVEYYGKALEVLVKGVKIMCIHGKMKYKRNKIFME-FRKLQSGILV : : . ..: : .. .. . .: . .:: . :. .: .. ::. . :.:: CCDS73 H-QGRTIIFCETKKEAQELSQ--NSAIKQ-DAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVLV 370 380 390 400 410 420 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 CTDVMARGIDIPEVNWVLQYDPPSNASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYINFL :.: :::.:::::. :.: .::... ...:: :::.: :. : . : :: ... CCDS73 ATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQHKEE--YQLV 430 440 450 460 470 480 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 AINQKCPLQEMKPQRNTADLLPKLKSMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYAKHECNLIFRL ..:: .. CCDS73 QVEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEA 490 500 510 520 530 540 >>CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 (783 aa) initn: 400 init1: 205 opt: 504 Z-score: 402.1 bits: 84.8 E(32554): 4.5e-16 Smith-Waterman score: 558; 30.1% identity (62.9% similar) in 399 aa overlap (6-392:185-559) 10 20 30 pF1KE5 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPV ::.. ..:. ... :. : .. :. CCDS31 PHPEPDCNPSEAASEESNSEIEQEIPVEQKEGAFSNFPIS--EETIKLLKGRGVTFLFPI 160 170 180 190 200 210 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 QSATIPLFMRNKDVAAEAVTGSGKTLAFVIPILEIL---LRREEKLKKSQVGAIIITPTR :. :. . .::. :.: ::.:::..:.::..: : :. ... . :: ....::: CCDS31 QAKTFHHVYSGKDLIAQARTGTGKTFSFAIPLIEKLHGELQDRKRGRAPQV--LVLAPTR 220 230 240 250 260 270 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 ELAIQIDEVLSHFTKHFPEFSQILWIGGRNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRK ::: :... .: .:: ..: . :: : . ::... : .:.:.::::..: .. CCDS31 ELANQVSKDFSDITK---KLSVACFYGGTPYGGQFERMRN-GIDILVGTPGRIKDHIQNG 280 290 300 310 320 160 170 180 190 200 pF1KE5 AEGLDLASCVRSLDVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQR-----RTGLFSATQTQ :::.. : .::::.:..::::: ... :: :. .: ::::: . CCDS31 K--LDLTK----LKHVVLDEVDQMLDMGFADQVEEILSVAYKKDSEDNPQTLLFSATCPH 330 340 350 360 370 380 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 EVENLVRAGLRNPVRVSVKEKGVAASSAQKTPSRLENYYMVCKADEK---FNQLVHFLRN : :... ... . .. . ....::: .:. . :. .. ...... . CCDS31 WVFNVAKKYMKS----TYEQVDLIGKKTQKTAITVEHLAIKCHWTQRAAVIGDVIRVYSG 390 400 410 420 430 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 HKQEKHLVFFSTCACVEYYGKALEVLVKGVKIMCIHGKMKYKRNKIFME-FRKLQSGILV : : . ..: : .. .. . .: . .:: . :. .: .. ::. . :.:: CCDS31 H-QGRTIIFCETKKEAQELSQ--NSAIKQ-DAQSLHGDIPQKQREITLKGFRNGSFGVLV 440 450 460 470 480 490 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 CTDVMARGIDIPEVNWVLQYDPPSNASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYINFL :.: :::.:::::. :.: .::... ...:: :::.: :. : . : :: ... CCDS31 ATNVAARGLDIPEVDLVIQSSPPKDVESYIHRSGRTGRAGRTGVCICFYQHKEE--YQLV 500 510 520 530 540 550 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 AINQKCPLQEMKPQRNTADLLPKLKSMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYAKHECNLIFRL ..:: .. CCDS31 QVEQKAGIKFKRIGVPSATEIIKASSKDAIRLLDSVPPTAISHFKQSAEKLIEEKGAVEA 560 570 580 590 600 610 >>CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 (796 aa) initn: 587 init1: 196 opt: 500 Z-score: 398.9 bits: 84.2 E(32554): 6.8e-16 Smith-Waterman score: 654; 28.7% identity (60.8% similar) in 579 aa overlap (20-578:229-777) 10 20 30 40 pF1KE5 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPVQSATIPLFMRNKDV .: :. .:: ::.:.: ::. . .::. CCDS13 KKGQEAGGFFEDASQYDENLSFQDMNLSRPLLKAITAMGFKQPTPIQKACIPVGLLGKDI 200 210 220 230 240 250 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 AAEAVTGSGKTLAFVIPILEILLRREEKLKKSQVGAIIITPTRELAIQIDEVLSHFTKHF : :.::.::: ::..:.:: :. . .. ..: ....:::::.::. : .... : CCDS13 CACAATGTGKTAAFALPVLERLIYKPRQAPVTRV--LVLVPTRELGIQVHSVTRQLAQ-F 260 270 280 290 300 310 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 PEFSQILWIGGRNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMFRRKAEGLDLASCVRSLDVLV ... : .:: . .. : . . .:..:::::: : .. . .. :.: ..::. CCDS13 CNITTCLAVGGLDV-KSQEAALRAAPDILIATPGRLIDHLH-NCPSFHLSS----IEVLI 320 330 340 350 360 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 LDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEVENLVRAGLRNPVRVSVKEKG ::::::.:: :: ... :... ..:.: :::::.:.::..:. ..:.::::. :. . CCDS13 LDEADRMLDEYFEEQMKEIIRMCSHHRQTMLFSATMTDEVKDLASVSLKNPVRIFVNSNT 370 380 390 400 410 420 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 VAASSAQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEKHLVFFSTCACVEYYGKALEV .: .. :.. ..:.. .: : .. :...:. . . : CCDS13 DVAPFLRQEFIRIRPNR---EGDRE--AIVAALLTRTFTDHVMLFTQTKKQAHRMHILLG 430 440 450 460 470 480 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 LVKGVKIMCIHGKM-KYKRNKIFMEFRKLQSGILVCTDVMARGIDIPEVNWVLQYDPPSN :. :... .::.. . .: . . .:. : ::: ::: :::.:: :. :... :.. CCDS13 LM-GLQVGELHGNLSQTQRLEALRRFKDEQIDILVATDVAARGLDIEGVKTVINFTMPNT 490 500 510 520 530 540 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 ASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPMEESYINFLAINQKCPLQ-EMKPQRNTADLLPKL . .::: ::::: :..: .. .. :..... .. : :.. .. :: . :. CCDS13 IKHYVHRVGRTARAGRAGRSVSLVGEDERKMLKEIVKAAKAPVKARILPQDVILKFRDKI 550 560 570 580 590 600 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 KSMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYAKHECNLIFRLKDLDFASLARG-FALLRMPKMPEL ..: ::.. ..: . .: .. . : :: : .: :... :. . CCDS13 EKMEKDVYAVLQ--LEAEEKEMQQ-SEAQINTAKRL-------LEKGKEAVVQEPERSWF 610 620 630 640 650 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 RGKQFPDFVPVDVNTDTIPFKDKIREKQRQKLLEQQRREKTE--NEGRRKF--IKNKAWS . :. . . : .: :...: . .. ..: : : : .: .: . .. CCDS13 QTKE--ERKKEKIAKALQEFDLALRGKKKRKKFMKDAKKKGEMTAEERSQFEILKAQMFA 660 670 680 690 700 710 530 540 550 560 pF1KE5 KQKAKKEKKKK----MNEK-------RKREEGS-DIEDEDMEELLNDTR-LLKKLKKGKI .. ::.... : : :. .:...:. .. : ::: : .. ::. . : CCDS13 ERLAKRNRRAKRARAMPEEEPVRGPAKKQKQGKKSVFD---EELTNTSKKALKQYRAGPS 720 730 740 750 760 570 580 590 600 pF1KE5 TEEEFEKGLLTTGKRTIKTVDLGISDLEDDC ::. . :: CCDS13 FEERKQLGLPHQRRGGNFKSKSRYKRRK 770 780 790 >>CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 (622 aa) initn: 559 init1: 198 opt: 462 Z-score: 371.1 bits: 78.8 E(32554): 2.4e-14 Smith-Waterman score: 659; 33.3% identity (63.4% similar) in 424 aa overlap (8-421:182-577) 10 20 30 pF1KE5 MEHVTEGSWESLPVPLHPQVLGALRELGFPYMTPVQS :.. . : .: .:.. :. . ::.: CCDS44 VLSMSEERHERVRKKYHILVEGDGIPPPIKSFKEMKFP--AAILRGLKKKGIHHPTPIQI 160 170 180 190 200 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 ATIPLFMRNKDVAAEAVTGSGKTLAFVIPILEILLRREEKL---KKSQVGAIIITPTREL :: .. ..:. . : :::::::.:..:.. . :..:..: :. ..:: :.::: CCDS44 QGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKREGPYGLIICPSREL 210 220 230 240 250 260 100 110 120 130 140 pF1KE5 AIQIDEVLSHFTKHFPEFSQILW-----IGGRNPGEDVERFKQQGGNIIVATPGRLEDMF : : .: .. . . : :. : ::: . :..: ... : ...::::::: :.. CCDS44 ARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGGMSVKEQMETIRH-GVHMMVATPGRLMDLL 270 280 290 300 310 320 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 RRKAEGLDLASCVRSLDVLVLDEADRLLDMGFEASINTILEFLPKQRRTGLFSATQTQEV ..: .::. : :.::::::..:::::..: ::. .. ::.: :::::. ... CCDS44 QKKMVSLDI--C----RYLALDEADRMIDMGFEGDIRTIFSYFKGQRQTLLFSATMPKKI 330 340 350 360 370 380 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 ENLVRAGLRNPVRVSVKEKGVAASSAQKTPSRLENYYMVCKADEKFNQLVHFLRNHKQEK .:.....: .:: ..: . :.:. .. . : :. : . :. :.. :.. CCDS44 QNFAKSALVKPVTINVGRAGAASLDVIQ-----EVEYV--KEEAKMVYLLECLQK-TPPP 390 400 410 420 430 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 HLVFFSTCACVEYYGKALEVLVKGVKIMCIHG-KMKYKRNKIFMEFRKLQSGILVCTDVM :.: : :. . : :.:::. . ::: : . .:.: . ::. .. .:: ::: CCDS44 VLIFAEKKADVDAIHEYL--LLKGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFREGKKDVLVATDVA 440 450 460 470 480 490 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 ARGIDIPEVNWVLQYDPPSNASAFVHRCGRTARIGHGGSALVFLLPM-EESYINFLAINQ ..:.:.: .. :..:: : . .::: :::.: :. : : .:. .:: . .. CCDS44 SKGLDFPAIQHVINYDMPEEIENYVHRIGRTGRSGNTGIATTFINKACDESVL----MDL 500 510 520 530 540 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 KCPLQEMKPQRNTADLLPKLKSMALADRAVFEKGMKAFVSYVQAYAKHECNLIFRLKDLD : : : : . . : :. . .:..... : CCDS44 KALLLEAKQK-----VPPVLQVLHCGDESMLDIGGERGCAFCGGLGHRITDCPKLEAMQT 550 560 570 580 590 600 450 460 470 480 490 500 pF1KE5 FASLARGFALLRMPKMPELRGKQFPDFVPVDVNTDTIPFKDKIREKQRQKLLEQQRREKT CCDS44 KQVSNIGRKDYLAHSSMDF 610 620 600 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 04:56:47 2016 done: Tue Nov 8 04:56:47 2016 Total Scan time: 3.260 Total Display time: 0.110 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]