FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5064, 554 aa 1>>>pF1KE5064 554 - 554 aa - 554 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5904+/-0.000928; mu= 8.2598+/- 0.056 mean_var=120.5081+/-24.163, 0's: 0 Z-trim(109.7): 68 B-trim: 51 in 2/48 Lambda= 0.116833 statistics sampled from 11029 (11097) to 11029 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.341), width: 16 Scan time: 3.090 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3473.1 GABRA4 gene_id:2557|Hs108|chr4 ( 554) 3621 621.5 8.3e-178 CCDS4356.1 GABRA6 gene_id:2559|Hs108|chr5 ( 453) 1901 331.5 1.3e-90 CCDS14706.1 GABRA3 gene_id:2556|Hs108|chrX ( 492) 1653 289.7 5.3e-78 CCDS4357.1 GABRA1 gene_id:2554|Hs108|chr5 ( 456) 1611 282.6 6.8e-76 CCDS45194.1 GABRA5 gene_id:2558|Hs108|chr15 ( 462) 1570 275.7 8.2e-74 CCDS3471.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 451) 1561 274.2 2.3e-73 CCDS82921.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 511) 1561 274.2 2.6e-73 CCDS4358.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 467) 1237 219.6 6.5e-57 CCDS4359.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 475) 1234 219.1 9.4e-57 CCDS3470.1 GABRG1 gene_id:2565|Hs108|chr4 ( 465) 1225 217.6 2.6e-56 CCDS45195.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 467) 1176 209.3 8.1e-54 CCDS14703.1 GABRE gene_id:2564|Hs108|chrX ( 506) 1027 184.2 3.2e-46 CCDS14160.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 907 164.0 3.5e-40 CCDS43283.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 449) 906 163.8 3.9e-40 CCDS48085.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 905 163.6 4.5e-40 CCDS3822.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 464) 899 162.6 9.2e-40 CCDS54942.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 457) 885 160.3 4.7e-39 CCDS4320.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 449) 876 158.8 1.3e-38 CCDS36.1 GABRD gene_id:2563|Hs108|chr1 ( 452) 861 156.2 7.6e-38 CCDS43980.2 GLRA4 gene_id:441509|Hs108|chrX ( 417) 858 155.7 1e-37 CCDS3474.1 GABRB1 gene_id:2560|Hs108|chr4 ( 474) 854 155.1 1.8e-37 CCDS10019.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 852 154.7 2.3e-37 CCDS10018.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 852 154.7 2.3e-37 CCDS4354.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 474) 849 154.2 3.2e-37 CCDS4355.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 512) 830 151.0 3.2e-36 CCDS5020.3 GABRR2 gene_id:2570|Hs108|chr6 ( 465) 815 148.5 1.7e-35 CCDS59029.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 462) 811 147.8 2.7e-35 CCDS5019.2 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 479) 811 147.8 2.8e-35 CCDS59028.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 392) 797 145.4 1.2e-34 CCDS4375.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 440) 797 145.4 1.3e-34 CCDS55371.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 363) 776 141.9 1.3e-33 CCDS54617.1 GABRR3 gene_id:200959|Hs108|chr3 ( 467) 773 141.4 2.3e-33 CCDS14707.1 GABRQ gene_id:55879|Hs108|chrX ( 632) 771 141.1 3.8e-33 CCDS53921.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 402) 734 134.8 1.9e-31 CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 497) 716 131.8 1.9e-30 CCDS53920.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 388) 713 131.3 2.1e-30 CCDS59251.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 253) 663 122.8 5.1e-28 CCDS47333.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 515) 611 114.1 4.1e-25 CCDS75368.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 289) 599 112.0 1e-24 CCDS54813.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 303) 581 109.0 8.6e-24 >>CCDS3473.1 GABRA4 gene_id:2557|Hs108|chr4 (554 aa) initn: 3621 init1: 3621 opt: 3621 Z-score: 3305.7 bits: 621.5 E(32554): 8.3e-178 Smith-Waterman score: 3621; 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CCDS43 TLSISARHSLPKVSYATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKA----- 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 EVPAAPVQREKHPEAPLQNTNANLNMRKRTNALVHSESDVGNRTEVGNHSSKSSTVVQES . : :. .. ::. .. ..: .: : .: : CCDS43 QFAAPPTVTISKATEPLE-----------AEIVLHPDSKY--------HLKKRIT----- 340 350 360 370 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 SKGTPRSYLASSPNPFSRANAAETISAARALPSASPTSIRTGYMPRKASVGSASTRHVFG : . : ..:: :.:: . : :: : . : . CCDS43 SLSLP---IVSS----SEANKVLT----RA-PILQSTPV--------------------- 380 390 400 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 SRLQRIKTTVNTIGATGKLSATPPPSAPPPSGSGTSKIDKYARILFPVTFGAFNMVYWVV :::: . :. .::::::.:.::::::.:..::.::::: CCDS43 ---------------------TPPPLS--PAFGGTSKIDQYSRILFPVAFAGFNLVYWVV 410 420 430 550 pF1KE5 YLSKDTMEKSESLM :::::::: : :. CCDS43 YLSKDTMEVSSSVE 440 450 >>CCDS14706.1 GABRA3 gene_id:2556|Hs108|chrX (492 aa) initn: 1778 init1: 1599 opt: 1653 Z-score: 1513.8 bits: 289.7 E(32554): 5.3e-78 Smith-Waterman score: 1663; 62.9% identity (84.7% similar) in 399 aa overlap (48-445:67-455) 20 30 40 50 60 70 pF1KE5 FALLRFLCLAVCLNESPGQNQKEEKLCTENFTRILDSLLDGYDNRLRPGFGGPVTEVKTD :::::: ::::::::::::.: ::::::: CCDS14 PGDFVKQDIGGLSPKHAPDIPDDSTDNITIFTRILDRLLDGYDNRLRPGLGDAVTEVKTD 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 IYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWIDKRLKYDGPIEILRLNNMMVTKVWTPDTFFRNG :::::::::::..::::.:::::::: :.:::.:::..:: :::....:.:::::::.:: CCDS14 IYVTSFGPVSDTDMEYTIDVFFRQTWHDERLKFDGPMKILPLNNLLASKIWTPDTFFHNG 100 110 120 130 140 150 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 KKSVSHNMTAPNKLFRIMRNGTILYTMRLTISAECPMRLVDFPMDGHACPLKFGSYAYPK ::::.::::.::::.:.. :::.:::::::: :::::.: ::::: :::::::::::: CCDS14 KKSVAHNMTTPNKLLRLVDNGTLLYTMRLTIHAECPMHLEDFPMDVHACPLKFGSYAYTT 160 170 180 190 200 210 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 SEMIYTWTKGPEKSVEVPKESSSLVQYDLIGQTVSSETIKSITGEYIVMTVYFHLRRKMG .:..:.:: : .::::: ...: : ::::.:..:..: :.: ::::.:::..:::.::.: CCDS14 AEVVYSWTLGKNKSVEVAQDGSRLNQYDLLGHVVGTEIIRSSTGEYVVMTTHFHLKRKIG 220 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 YFMIQTYIPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYAT ::.::::.::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::::.:::::.::: CCDS14 YFVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYAT 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 AMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNIQMEKAKRKTSKPPQEVPAAPVQREKHPEAPL :::::::::.:::::::::::.::::: ::. . ..:: : ...: : :: CCDS14 AMDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFT-------KRSWAWEGKKVPEALEMKKKTPAAPA 340 350 360 370 380 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 QNTNANLNMRKRTNAL-VHSESDVGNRTEVGNHSSKSSTVVQESSKGTPRSYLASSPNPF ..:....:. : . . .... .. .. . :..:. .. : :.: :. .::. CCDS14 KKTSTTFNIVGTTYPINLAKDTEFSTISKGAAPSASSTPTIIASPKAT---YVQDSPTET 390 400 410 420 430 440 440 450 460 470 480 490 pF1KE5 SRANAAETISAARALPSASPTSIRTGYMPRKASVGSASTRHVFGSRLQRIKTTVNTIGAT . :.. . CCDS14 KTYNSVSKVDKISRIIFPVLFAIFNLVYWATYVNRESAIKGMIRKQ 450 460 470 480 490 >>CCDS4357.1 GABRA1 gene_id:2554|Hs108|chr5 (456 aa) initn: 1709 init1: 1584 opt: 1611 Z-score: 1476.1 bits: 282.6 E(32554): 6.8e-76 Smith-Waterman score: 1611; 66.6% identity (84.8% similar) in 368 aa overlap (13-376:4-370) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MVSAKKVPAIALSAGVSFALLRF-LCLAVCLNESPGQN--QKEEKLCTENFTRILDSLLD : :.: : . : :.. ..: :: : : : : :::::: ::: CCDS43 MRKSPGLSDCLWAWILLLSTLTGRSYGQPSLQDELKDNTTVFTRILDRLLD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 GYDNRLRPGFGGPVTEVKTDIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWIDKRLKYDGPIEIL :::::::::.: ::::::::.::::::::: .::::.::::::.: :.:::. ::. .: CCDS43 GYDNRLRPGLGERVTEVKTDIFVTSFGPVSDHDMEYTIDVFFRQSWKDERLKFKGPMTVL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 RLNNMMVTKVWTPDTFFRNGKKSVSHNMTAPNKLFRIMRNGTILYTMRLTISAECPMRLV ::::.:..:.:::::::.::::::.:::: ::::.:: ..::.:::::::. :::::.: CCDS43 RLNNLMASKIWTPDTFFHNGKKSVAHNMTMPNKLLRITEDGTLLYTMRLTVRAECPMHLE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DFPMDGHACPLKFGSYAYPKSEMIYTWTKGPEKSVEVPKESSSLVQYDLIGQTVSSETIK :::::.:::::::::::: ..:..: ::. : .:: : ...: : ::::.::::.: .. CCDS43 DFPMDAHACPLKFGSYAYTRAEVVYEWTREPARSVVVAEDGSRLNQYDLLGQTVDSGIVQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 SITGEYIVMTVYFHLRRKMGYFMIQTYIPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVL : ::::.:::..:::.::.:::.::::.::::::::::::::.:.::::::::::.:::: CCDS43 SSTGEYVVMTTHFHLKRKIGYFVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 TMTTLSISARHSLPKVSYATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNIQME-KAKRKTS ::::::::::.:::::.::::::::::::.:::::::::::.:::::. . .: . CCDS43 TMTTLSISARNSLPKVAYATAMDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTKRGYAWDGKSVVP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 KPPQEVPAAPVQREKHPEAPLQNTNANLNMRKRTNALVHSESDVGNRTEVGNHSSKSSTV . :..: :. .... :: CCDS43 EKPKKVKD-PLIKKNNTYAPTATSYTPNLARGDPGLATIAKSATIEPKEVKPETKPPEPK 360 370 380 390 400 410 >>CCDS45194.1 GABRA5 gene_id:2558|Hs108|chr15 (462 aa) initn: 1704 init1: 1569 opt: 1570 Z-score: 1438.6 bits: 275.7 E(32554): 8.2e-74 Smith-Waterman score: 1575; 59.7% identity (81.5% similar) in 417 aa overlap (21-427:15-415) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MVSAKKVPAIALSAGVSFALLRFLCLAVCLNESPGQNQ------KEEKLCTEN---FTRI : ..:... :. : .: :.: ..: :::: CCDS45 MDNGMFSGFIMIKNLLLFCISMNLSSHFGFSQMPTSSVKDE--TNDNITIFTRI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 LDSLLDGYDNRLRPGFGGPVTEVKTDIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWIDKRLKYD ::.::::::::::::.: .:.:.:::::::::::::.:::::.::::::.: :.::.. CCDS45 LDGLLDGYDNRLRPGLGERITQVRTDIYVTSFGPVSDTEMEYTIDVFFRQSWKDERLRFK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 GPIEILRLNNMMVTKVWTPDTFFRNGKKSVSHNMTAPNKLFRIMRNGTILYTMRLTISAE ::.. : :::....:.:::::::.:::::..::::.::::.:. .::.::::::::::: CCDS45 GPMQRLPLNNLLASKIWTPDTFFHNGKKSIAHNMTTPNKLLRLEDDGTLLYTMRLTISAE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 CPMRLVDFPMDGHACPLKFGSYAYPKSEMIYTWTKGPEKSVEVPKESSSLVQYDLIGQTV :::.: :::::.:::::::::::::.::..:.::.: ::: : ...: : :: :.:::: CCDS45 CPMQLEDFPMDAHACPLKFGSYAYPNSEVVYVWTNGSTKSVVVAEDGSRLNQYHLMGQTV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 SSETIKSITGEYIVMTVYFHLRRKMGYFMIQTYIPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVF ..:.:.. :::: .::..:::.::.:::.::::.::::::::::::::.:.::::::::: CCDS45 GTENISTSTGEYTIMTAHFHLKRKIGYFVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 GITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNIQMEKA :.::::::::::::::.:::::.::::::::::::.:::::::::::.:::::. CCDS45 GVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYATAMDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTKRGWAWD 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 KRKTSKPPQEVPAAPVQREKHPEAPL-QNTNANLNMRKRTNALVHSESDVGNRTEVGNHS .:. . :: ..... :. : ..::: :. . : . ..: .:. : CCDS45 GKKA------LEAAKIKKKR--EVILNKSTNAF-----TTGKMSHPPNIPKEQTPAGT-S 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 SKSSTVVQESSKGTPRSYLASSPNPFSRANAAETISAARALPSASPTSIRTGYMPRKASV . .:. :. : . : .: CCDS45 NTTSVSVKPSEEKTSESKKTYNSISKIDKMSRIVFPVLFGTFNLVYWATYLNREPVIKGA 400 410 420 430 440 450 >>CCDS3471.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 (451 aa) initn: 1691 init1: 1561 opt: 1561 Z-score: 1430.6 bits: 274.2 E(32554): 2.3e-73 Smith-Waterman score: 1561; 73.9% identity (89.9% similar) in 307 aa overlap (38-344:32-338) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 PAIALSAGVSFALLRFLCLAVCLNESPGQNQKEEKLCTENFTRILDSLLDGYDNRLRPGF . : : :::::: ::::::::::::. CCDS34 KTKLNIYNMQFLLFVFLVWDPARLVLANIQEDEAKNNITIFTRILDRLLDGYDNRLRPGL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 GGPVTEVKTDIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWIDKRLKYDGPIEILRLNNMMVTKV : .::: :.:::::::::::..::::.:::::: : :.:::. ::..::::::.:..:. CCDS34 GDSITEVFTNIYVTSFGPVSDTDMEYTIDVFFRQKWKDERLKFKGPMNILRLNNLMASKI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 WTPDTFFRNGKKSVSHNMTAPNKLFRIMRNGTILYTMRLTISAECPMRLVDFPMDGHACP :::::::.::::::.:::: ::::.::. .::.:::::::..:::::.: :::::.:.:: CCDS34 WTPDTFFHNGKKSVAHNMTMPNKLLRIQDDGTLLYTMRLTVQAECPMHLEDFPMDAHSCP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LKFGSYAYPKSEMIYTWTKGPEKSVEVPKESSSLVQYDLIGQTVSSETIKSITGEYIVMT :::::::: ::. : :: . ::.: ..: : ::::.::....::::: :::: ::: CCDS34 LKFGSYAYTTSEVTYIWTYNASDSVQVAPDGSRLNQYDLLGQSIGKETIKSSTGEYTVMT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 VYFHLRRKMGYFMIQTYIPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISAR ..:::.::.:::.::::.::::::::::::::.:.::::::::::.:::::::::::::: CCDS34 AHFHLKRKIGYFVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISAR 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 HSLPKVSYATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNIQMEKAKRKTSKPPQEVPAAPV .:::::.::::::::::::.:::::::::::.::::: CCDS34 NSLPKVAYATAMDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTKRGWAWDGKSVVNDKKKEKASVM 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 QREKHPEAPLQNTNANLNMRKRTNALVHSESDVGNRTEVGNHSSKSSTVVQESSKGTPRS CCDS34 IQNNAYAVAVANYAPNLSKDPVLSTISKSATTPEPNKKPENKPAEAKKTFNSVSKIDRMS 370 380 390 400 410 420 >>CCDS82921.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 (511 aa) initn: 1691 init1: 1561 opt: 1561 Z-score: 1429.7 bits: 274.2 E(32554): 2.6e-73 Smith-Waterman score: 1621; 52.4% identity (73.9% similar) in 510 aa overlap (38-545:32-504) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 PAIALSAGVSFALLRFLCLAVCLNESPGQNQKEEKLCTENFTRILDSLLDGYDNRLRPGF . : : :::::: ::::::::::::. CCDS82 KTKLNIYNMQFLLFVFLVWDPARLVLANIQEDEAKNNITIFTRILDRLLDGYDNRLRPGL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 GGPVTEVKTDIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWIDKRLKYDGPIEILRLNNMMVTKV : .::: :.:::::::::::..::::.:::::: : :.:::. ::..::::::.:..:. CCDS82 GDSITEVFTNIYVTSFGPVSDTDMEYTIDVFFRQKWKDERLKFKGPMNILRLNNLMASKI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 WTPDTFFRNGKKSVSHNMTAPNKLFRIMRNGTILYTMRLTISAECPMRLVDFPMDGHACP :::::::.::::::.:::: ::::.::. .::.:::::::..:::::.: :::::.:.:: CCDS82 WTPDTFFHNGKKSVAHNMTMPNKLLRIQDDGTLLYTMRLTVQAECPMHLEDFPMDAHSCP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LKFGSYAYPKSEMIYTWTKGPEKSVEVPKESSSLVQYDLIGQTVSSETIKSITGEYIVMT :::::::: ::. : :: . ::.: ..: : ::::.::....::::: :::: ::: CCDS82 LKFGSYAYTTSEVTYIWTYNASDSVQVAPDGSRLNQYDLLGQSIGKETIKSSTGEYTVMT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 VYFHLRRKMGYFMIQTYIPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISAR ..:::.::.:::.::::.::::::::::::::.:.::::::::::.:::::::::::::: CCDS82 AHFHLKRKIGYFVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISAR 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 HSLPKVSYATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNIQMEKAKRKTSKPPQEVPAAPV .:::::.::::::::::::.:::::::::::.::::: :: . . : CCDS82 NSLPKVAYATAMDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFT-------KRGWAWDGKSVVN--- 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 QREKHPEAPLQNTNANLNMRKRTNALVHSESDVGNRTEVGNHSSKSSTVVQESSKGTPRS .: : .. . . : : :.... . . .. . . : . ::.. CCDS82 --DKSPSIKAEGITLTYNSVK---AILQGAKLIWSKYIAFSWPS----LFQEKT----LE 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 YLASSPNPFSRANAAETISAARALPSASPTSIRTGYMPRKASVGSASTRHVFGSRLQRIK :: . . .. .... .:. . . . . ..: : . : :. CCDS82 YLEKWMDCLTFKQSSKKEKASVMIQNNAYAVAVANYAP------NLSKDPVL-------- 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 TTVNTIGATGKLSATPP--PSAPPPSGSGTSKIDKYARILFPVTFGAFNMVYWVVYLSKD .:.. ..: . . : :. . ...::::...::.::: ::.::.:::..::... CCDS82 STISKSATTPEPNKKPENKPAEAKKTFNSVSKIDRMSRIVFPVLFGTFNLVYWATYLNRE 450 460 470 480 490 500 550 pF1KE5 TMEKSESLM CCDS82 PVLGVSP 510 >>CCDS4358.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 (467 aa) initn: 1294 init1: 669 opt: 1237 Z-score: 1135.2 bits: 219.6 E(32554): 6.5e-57 Smith-Waterman score: 1237; 53.3% identity (79.1% similar) in 345 aa overlap (47-389:65-400) 20 30 40 50 60 70 pF1KE5 SFALLRFLCLAVCLNESPGQNQKEEKLCTENFTRILDSLLDGYDNRLRPGFGGPVTEVKT . : ::..::.::::.::: .: : ..: CCDS43 PGFTSQKSDDDYEDYASNKTWVLTPKVPEGDVTVILNNLLEGYDNKLRPDIGVKPTLIHT 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 DIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWIDKRLKYDGPIEILRLNNMMVTKVWTPDTFFRN :.::.:.:::. ..::::.:.:: ::: :.:::... :..::::. :: :.: ::::::: CCDS43 DMYVNSIGPVNAINMEYTIDIFFAQTWYDRRLKFNSTIKVLRLNSNMVGKIWIPDTFFRN 100 110 120 130 140 150 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 GKKSVSHNMTAPNKLFRIMRNGTILYTMRLTISAECPMRLVDFPMDGHACPLKFGSYAYP .::. .: .:.::...:: .: .:::.::::.::: ..: .:::: :.:::.:.::.:: CCDS43 SKKADAHWITTPNRMLRIWNDGRVLYTLRLTIDAECQLQLHNFPMDEHSCPLEFSSYGYP 160 170 180 190 200 210 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 KSEMIYTWTKGPEKSVEVPKESS-SLVQYDLIGQTVSSETIKSITGEYIVMTVYFHLRRK . :..: : .. :::: : : :....: ..:..:. .:.:.::.::: : :. CCDS43 REEIVYQWKRS---SVEVGDTRSWRLYQFSFVGLRNTTEVVKTTSGDYVVMSVYFDLSRR 220 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 MGYFMIQTYIPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSY :::: ::::::: . :.:: :::::::..::::: .:::::::::::: ::.::::::: CCDS43 MGYFTIQTYIPCTLIVVLSWVSFWINKDAVPARTSLGITTVLTMTTLSTIARKSLPKVSY 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 ATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYF-TNIQMEKAKRKTSKPPQEVPAAPVQREKHPE .:::: :..::: ::::::.:.....:: .: . : : : .: : ::. . CCDS43 VTAMDLFVSVCFIFVFSALVEYGTLHYFVSNRKPSKDKDKKKKNP-----APTIDIRPRS 340 350 360 370 380 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 APLQNTNANLNMRKRTNALVHSESDVGNRTEVGNHSSKSSTVVQESSKGTPRSYLASSPN : .: .::. ....: CCDS43 ATIQMNNAT-HLQERDEEYGYECLDGKDCASFFCCFEDCRTGAWRHGRIHIRIAKMDSYA 390 400 410 420 430 440 >>CCDS4359.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 (475 aa) initn: 1249 init1: 669 opt: 1234 Z-score: 1132.4 bits: 219.1 E(32554): 9.4e-57 Smith-Waterman score: 1234; 52.1% identity (78.2% similar) in 349 aa overlap (47-391:65-404) 20 30 40 50 60 70 pF1KE5 SFALLRFLCLAVCLNESPGQNQKEEKLCTENFTRILDSLLDGYDNRLRPGFGGPVTEVKT . : ::..::.::::.::: .: : ..: CCDS43 PGFTSQKSDDDYEDYASNKTWVLTPKVPEGDVTVILNNLLEGYDNKLRPDIGVKPTLIHT 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 DIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWIDKRLKYDGPIEILRLNNMMVTKVWTPDTFFRN :.::.:.:::. ..::::.:.:: ::: :.:::... :..::::. :: :.: ::::::: CCDS43 DMYVNSIGPVNAINMEYTIDIFFAQTWYDRRLKFNSTIKVLRLNSNMVGKIWIPDTFFRN 100 110 120 130 140 150 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 GKKSVSHNMTAPNKLFRIMRNGTILYTMRLTISAECPMRLVDFPMDGHACPLKFGSYAYP .::. .: .:.::...:: .: .:::.::::.::: ..: .:::: :.:::.:.::.:: CCDS43 SKKADAHWITTPNRMLRIWNDGRVLYTLRLTIDAECQLQLHNFPMDEHSCPLEFSSYGYP 160 170 180 190 200 210 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 KSEMIYTWTKGPEKSVEVPKESS-SLVQYDLIGQTVSSETIKSITGEYIVMTVYFHLRRK . :..: : .. :::: : : :....: ..:..:. .:.:.::.::: : :. CCDS43 REEIVYQWKRS---SVEVGDTRSWRLYQFSFVGLRNTTEVVKTTSGDYVVMSVYFDLSRR 220 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 MGYFMIQTYIPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSY :::: ::::::: . :.:: :::::::..::::: .:::::::::::: ::.::::::: CCDS43 MGYFTIQTYIPCTLIVVLSWVSFWINKDAVPARTSLGITTVLTMTTLSTIARKSLPKVSY 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 ATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNIQMEKAKRKTSKPPQEVPAAPVQRE---KH .:::: :..::: ::::::.:.....::.. .:: :: .. :. : : CCDS43 VTAMDLFVSVCFIFVFSALVEYGTLHYFVS------NRKPSKDKDKKKKNPLLRMFSFKA 340 350 360 370 380 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 PEAPLQNTNANLNMRKRTNALVHSESDVGNRTEVGNHSSKSSTVVQESSKGTPRSYLASS : .. .:...: . :. CCDS43 PTIDIRPRSATIQMNNATHLQERDEEYGYECLDGKDCASFFCCFEDCRTGAWRHGRIHIR 390 400 410 420 430 440 >>CCDS3470.1 GABRG1 gene_id:2565|Hs108|chr4 (465 aa) initn: 1304 init1: 652 opt: 1225 Z-score: 1124.3 bits: 217.6 E(32554): 2.6e-56 Smith-Waterman score: 1230; 49.7% identity (75.9% similar) in 378 aa overlap (13-379:18-393) 10 20 30 40 pF1KE5 MVSAKKVPAIALSAGVSFA-LLRFLCLAVCLNESPGQNQKE----------EKLC : :: .. :: : :. :.... ..... :. CCDS34 MGPLKAFLFSPFLLRSQSRGVRLVFLLLTLHLGNCVDKADDEDDEDLTVNKTWVLAPKIH 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 TENFTRILDSLLDGYDNRLRPGFGGPVTEVKTDIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWI ..:.::.:::.::::.::: .: : ..::.::.:.:::. ..::::.:..: :::. CCDS34 EGDITQILNSLLQGYDNKLRPDIGVRPTVIETDVYVNSIGPVDPINMEYTIDIIFAQTWF 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 DKRLKYDGPIEILRLNNMMVTKVWTPDTFFRNGKKSVSHNMTAPNKLFRIMRNGTILYTM :.:::... ...: ::. :: :.: :::::::..:: .: .:.::.:.:: .: .:::. CCDS34 DSRLKFNSTMKVLMLNSNMVGKIWIPDTFFRNSRKSDAHWITTPNRLLRIWNDGRVLYTL 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 RLTISAECPMRLVDFPMDGHACPLKFGSYAYPKSEMIYTWTKGPEKSVEVPKESSSLVQY ::::.::: ..: .:::: :.:::.:.::.:::.:. : : : : : :: : :. CCDS34 RLTINAECYLQLHNFPMDEHSCPLEFSSYGYPKNEIEYKWKK-PSVEVADPKYWR-LYQF 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 DLIGQTVSSETIKSITGEYIVMTVYFHLRRKMGYFMIQTYIPCIMTVILSQVSFWINKES ..: :.: ..:.:.:..::..: : :.:::: ::::::::.::.:: :::::::.. CCDS34 AFVGLRNSTEITHTISGDYVIMTIFFDLSRRMGYFTIQTYIPCILTVVLSWVSFWINKDA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 VPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYATAMDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFT ::::: .:::::::::::: ::.:::::::.:::: :..::: :::.::.:.....::: CCDS34 VPARTSLGITTVLTMTTLSTIARKSLPKVSYVTAMDLFVSVCFIFVFAALMEYGTLHYFT 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 NIQMEKAKRKTSKPPQEVPAAPVQREKHPEAPLQNTNANLNMRKRTNALVHSESDVGNRT . : :. : : ... .: . :..: CCDS34 SNQKGKTATKDRKLKNKASMTPGLHPGSTLIPMNNISVPQEDDYGYQCLEGKDCASFFCC 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 EVGNHSSKSSTVVQESSKGTPRSYLASSPNPFSRANAAETISAARALPSASPTSIRTGYM CCDS34 FEDCRTGSWREGRIHIRIAKIDSYSRIFFPTAFALFNLVYWVGYLYL 420 430 440 450 460 554 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 04:41:08 2016 done: Tue Nov 8 04:41:09 2016 Total Scan time: 3.090 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]