FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5694, 540 aa 1>>>pF1KE5694 540 - 540 aa - 540 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1883+/-0.000888; mu= 14.7214+/- 0.053 mean_var=93.8006+/-18.558, 0's: 0 Z-trim(108.3): 68 B-trim: 52 in 1/51 Lambda= 0.132425 statistics sampled from 10045 (10113) to 10045 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.311), width: 16 Scan time: 3.650 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10858.1 DDX28 gene_id:55794|Hs108|chr16 ( 540) 3518 682.5 3.3e-196 CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 580 121.3 4.3e-27 CCDS9918.1 DDX24 gene_id:57062|Hs108|chr14 ( 859) 365 80.3 1e-14 CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 354 78.2 4.8e-14 CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 347 76.9 1.3e-13 CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 347 76.9 1.3e-13 CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 332 73.8 4.8e-13 CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 327 72.9 1.2e-12 CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 328 73.2 1.4e-12 CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 328 73.2 1.4e-12 CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 507) 310 69.6 9.7e-12 CCDS5492.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 547) 310 69.7 1e-11 CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 304 68.4 1.8e-11 >>CCDS10858.1 DDX28 gene_id:55794|Hs108|chr16 (540 aa) initn: 3518 init1: 3518 opt: 3518 Z-score: 3636.1 bits: 682.5 E(32554): 3.3e-196 Smith-Waterman score: 3518; 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CCDS87 KAGAKDILVATDVAGRGIDIQDVSMVVNYDMAKNIEDYIHRIGRTGRAGK--SGVAITFL 720 730 740 750 760 510 520 530 540 pF1KE5 THPWDVSLVQKIELAARRRRSLPGLASSVKEPLPQAT : CCDS87 TKEDSAVFYELKQAILESPVSSCPPELANHPDAQHKPGTILTKKRREETIFA 770 780 790 800 810 820 >>CCDS9918.1 DDX24 gene_id:57062|Hs108|chr14 (859 aa) initn: 450 init1: 190 opt: 365 Z-score: 377.6 bits: 80.3 E(32554): 1e-14 Smith-Waterman score: 395; 29.3% identity (57.1% similar) in 338 aa overlap (206-526:390-713) 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 SGKTLSYLLPLLQRLLGQPSLDSLPIPAPRGLVLVPSRELAQQVRAVAQPLGRSLGLLVR ::::.:.:::: ::. . ..: :. . CCDS99 NLDKEQTGNLKQELDDKSATCKAYPKRPLLGLVLTPTRELAVQVKQHIDAVARFTGIKTA 360 370 380 390 400 410 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 DLEGGHGMRRIRLQLSRQPSADVLVATPGALWKALKSR---LISLEQLSFLVLDEADTLL : :: . .. . .:.:.: ...::::: ::. .: . : .:.:: ::.:::: .. CCDS99 ILVGGMSTQKQQRMLNRRP--EIVVATPGRLWELIKEKHYHLRNLRQLRCLVVDEADRMV 420 430 440 450 460 470 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 DESFLELVDYILEKSHIAEGPADLEDPFNPKAQLVLVGATFPEGVGQLLNKVASPDAVTT ... . .. .:: . .. .::: : .. .::. : : .. . CCDS99 EKGHFAELSQLLEMLN--------DSQYNPKRQTLVFSATLTL-VHQAPARILHKKHTKK 480 490 500 510 520 360 370 380 390 pF1KE5 IT-SSKLHCIMPHV----KQTFLRLKGADKVAELVHILK-HRDRAERT--------GPSG . ..:: .: .. : . : . ..: . : : . :. : CCDS99 MDKTAKLDLLMQKIGMRGKPKVIDLTRNEATVETLTETKIHCETDEKDFYLYYFLMQYPG 530 540 550 560 570 580 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 TVLVFCNSSSTVNWLGYILDDHKIQHLRLQGQMPALMRVGIFQSFQKSSRDILLCTDIAS ::: :: : .. :. .: :. : :.. : .:. ...: . .:: ::.:. CCDS99 RSLVFANSISCIKRLSGLLKVLDIMPLTLHACMHQKQRLRNLEQFARLEDCVLLATDVAA 590 600 610 620 630 640 460 470 480 490 500 510 pF1KE5 RGLDSTGVELVVNYDFPPTLQDYIHRAGRVGRVGSEVPGTVISFVTHPWDVSLVQKIELA :::: :. :..:. : : . :.::.::..:. .: : . .. : :: .:: . CCDS99 RGLDIPKVQHVIHYQVPRTSEIYVHRSGRTARATNE--GLSLMLIG-PEDVINFKKIYKT 650 660 670 680 690 700 520 530 540 pF1KE5 ARRRRSLPGLASSVKEPLPQAT .. ...: CCDS99 LKKDEDIPLFPVQTKYMDVVKERIRLARQIEKSEYRNFQACLHNSWIEQAAAALEIELEE 710 720 730 740 750 760 >>CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 (938 aa) initn: 416 init1: 140 opt: 354 Z-score: 365.7 bits: 78.2 E(32554): 4.8e-14 Smith-Waterman score: 519; 30.0% identity (60.2% similar) in 397 aa overlap (127-518:254-620) 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 WKSRRARRDHFSIERAQQEAPAVRKLSSKGSFADLGLEPRVLHALQEAAPEVVQPTTVQS ::: .:.. ...: .... : .::: .: CCDS32 ITNLTPQQLIDLRHKLNLRVSGAAPPRPGSSFAHFGFDEQLMHQIRKS--EYTQPTPIQC 230 240 250 260 270 280 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 STIPSLLRGRHVVCAAETGSGKTLSYLLPLLQRLLGQPSLDSLPIPAPRGLVLVPSRELA . .: : :: .. :.:::::: ... :.: ... : :. : .: .... :.::: CCDS32 QGVPVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQKELE--PGDGPIAVIVCPTRELC 290 300 310 320 330 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 QQVRAVAQPLGRSLGLLVRDLEGGHGMRRIRLQLSRQPSADVLVATPGALWKALKSRLIS ::..: . .:.. .: . :: .: . : : .:...: ::: : .:.. . CCDS32 QQIHAECKRFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKAL--QEGAEIVVCTPGRLIDHVKKKATN 340 350 360 370 380 390 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 LEQLSFLVLDEADTLLDESFLELVDYILEKSHIAEGPADLEDPFNPKAQLVLVGATFPEG :...:.::.:::: ..: .: : : ::. : : .: .::: . CCDS32 LQRVSYLVFDEADRMFDMGFEYQVRSI--ASHV-----------RPDRQTLLFSATFRKK 400 410 420 430 440 340 350 360 370 380 390 pF1KE5 VGQLLNKVASPDAVTTITSSKLHCIMPHVKQTFLRLK-GADKVAELVHILKHRDRAERTG . .: . : . .... . : : :. : .: :. : .: :. CCDS32 IEKLARDILI-DPIR-VVQGDIGEANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLT-----RRLVEFTS 450 460 470 480 490 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 PSGTVLVFCNSSSTVNWLGYILDDHKIQHLRLQGQMPALMRVGIFQSFQKSSRDILLCTD ::.::.: ....... :. : .. . :.:.: : ....:.:.. .:. :: CCDS32 -SGSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATD 500 510 520 530 540 550 460 470 480 490 500 510 pF1KE5 IASRGLDSTGVELVVNYDFPPTLQDYIHRAGRVGRVGSEVPGTVISFVTHPWDVS----L .:.:::: ... :.::: .. . :: ::.::.: . :.. ...: : : . : CCDS32 VAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRIGRTGRAGEK--GVAYTLLT-PKDSNFAGDL 560 570 580 590 600 610 520 530 540 pF1KE5 VQKIELAARRRRSLPGLASSVKEPLPQAT :...: : CCDS32 VRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKGGKGKKLNIGGGGLGYRERPGLGSENMDR 620 630 640 650 660 670 >>CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031 aa) initn: 375 init1: 157 opt: 347 Z-score: 357.9 bits: 76.9 E(32554): 1.3e-13 Smith-Waterman score: 580; 28.6% identity (62.6% similar) in 412 aa overlap (101-504:344-724) 80 90 100 110 120 pF1KE5 ARRPELNQPARLTLGRWERAPLASQGWKSRRARRDHFSIERAQQEAPAVR-KLSSKG--S . ... .. : ..:. .:. : : : CCDS34 QRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKS 320 330 340 350 360 370 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 FADLGLEPRVLHALQEAAPEVVQPTTVQSSTIPSLLRGRHVVCAAETGSGKTLSYLLPLL ... :. ..:..:.. . : .:: .:...::... :: .. :.::::::...:::.. CCDS34 WVQCGISMKILNSLKKHGYE--KPTPIQTQAIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIAFLLPMF 380 390 400 410 420 430 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 QRLLGQPSLDSLPIPAPRGLVLVPSRELAQQVRAVAQPLGRSLGLLVRDLEGGHGMRRIR .... : ::. .: .....:.:::: :. . ....::: : . :: :. . CCDS34 RHIMDQRSLEEG--EGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFSKTLGLRVVCVYGGTGISEQI 440 450 460 470 480 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 LQLSRQPSADVLVATPGALWKALKS---RLISLEQLSFLVLDEADTLLDESFLELVDYIL .:.: .:...: ::: . : . :. .:......:::::: ..: .: : :. CCDS34 AELKR--GAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEADRMFDMGFEPQVMRIV 490 500 510 520 530 540 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 EKSHIAEGPADLEDPFNPKAQLVLVGATFPEGVGQLLNKVASPDAVTTITSSKLHCIMPH : : : :. .::::... : .. : . . . .. : CCDS34 -------------DNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVVC--SD 550 560 570 580 590 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 VKQTFLRLKGADKVAELVHILKHRDRAERTGPSGTVLVFCNSSSTVNWLGYILDDHKIQH :.: . .. : .:...: : .. ::.:..: ... .. : . : . .. CCDS34 VEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQE------SGSVIIFVDKQEHAD--GLLKDLMRASY 600 610 620 630 640 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 --LRLQGQMPALMRVGIFQSFQKSSRDILLCTDIASRGLDSTGVELVVNYDFPPTLQDYI . :.: . : .:...:.... .:. :..:.:::: . :::::. : .::. CCDS34 PCMSLHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYV 650 660 670 680 690 700 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 HRAGRVGRVGSEVPGTVISFVTHPWDVSLVQKIELAARRRRSLPGLASSVKEPLPQAT :::::.::.:.. : . .:.: CCDS34 HRAGRTGRAGNK--GYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDFKDQQKA 710 720 730 740 750 760 >>CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032 aa) initn: 375 init1: 157 opt: 347 Z-score: 357.9 bits: 76.9 E(32554): 1.3e-13 Smith-Waterman score: 580; 28.6% identity (62.6% similar) in 412 aa overlap (101-504:344-724) 80 90 100 110 120 pF1KE5 ARRPELNQPARLTLGRWERAPLASQGWKSRRARRDHFSIERAQQEAPAVR-KLSSKG--S . ... .. : ..:. .:. : : : CCDS75 QRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKS 320 330 340 350 360 370 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 FADLGLEPRVLHALQEAAPEVVQPTTVQSSTIPSLLRGRHVVCAAETGSGKTLSYLLPLL ... :. ..:..:.. . : .:: .:...::... :: .. :.::::::...:::.. CCDS75 WVQCGISMKILNSLKKHGYE--KPTPIQTQAIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIAFLLPMF 380 390 400 410 420 430 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 QRLLGQPSLDSLPIPAPRGLVLVPSRELAQQVRAVAQPLGRSLGLLVRDLEGGHGMRRIR .... : ::. .: .....:.:::: :. . ....::: : . :: :. . CCDS75 RHIMDQRSLEEG--EGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFSKTLGLRVVCVYGGTGISEQI 440 450 460 470 480 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 LQLSRQPSADVLVATPGALWKALKS---RLISLEQLSFLVLDEADTLLDESFLELVDYIL .:.: .:...: ::: . : . :. .:......:::::: ..: .: : :. CCDS75 AELKR--GAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEADRMFDMGFEPQVMRIV 490 500 510 520 530 540 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 EKSHIAEGPADLEDPFNPKAQLVLVGATFPEGVGQLLNKVASPDAVTTITSSKLHCIMPH : : : :. .::::... : .. : . . . .. : CCDS75 -------------DNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVVC--SD 550 560 570 580 590 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 VKQTFLRLKGADKVAELVHILKHRDRAERTGPSGTVLVFCNSSSTVNWLGYILDDHKIQH :.: . .. : .:...: : .. ::.:..: ... .. : . : . .. CCDS75 VEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQE------SGSVIIFVDKQEHAD--GLLKDLMRASY 600 610 620 630 640 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 --LRLQGQMPALMRVGIFQSFQKSSRDILLCTDIASRGLDSTGVELVVNYDFPPTLQDYI . :.: . : .:...:.... .:. :..:.:::: . :::::. : .::. CCDS75 PCMSLHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYV 650 660 670 680 690 700 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 HRAGRVGRVGSEVPGTVISFVTHPWDVSLVQKIELAARRRRSLPGLASSVKEPLPQAT :::::.::.:.. : . .:.: CCDS75 HRAGRTGRAGNK--GYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDFKDQQKA 710 720 730 740 750 760 >>CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 (455 aa) initn: 490 init1: 243 opt: 332 Z-score: 347.6 bits: 73.8 E(32554): 4.8e-13 Smith-Waterman score: 627; 34.6% identity (60.8% similar) in 436 aa overlap (102-534:3-395) 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 RRPELNQPARLTLGRWERAPLASQGWKSRRARRDHFSIERAQQEAPAVRKLSSKGSFADL : ..: : .:.: : :.. .: .: :: CCDS86 MAAPEEHDSPTEASQ--PIVEEEETK-TFKDL 10 20 140 150 160 170 180 pF1KE5 GLEPRVLHALQEAAPEV--VQPTTVQSSTIPSLLRGRHVVCAAETGSGKTLSYLLPLLQR : : .: :: .. ..:: .: .:: :.:: .. :::::::: .. ::.:. CCDS86 G----VTDVLCEACDQLGWTKPTKIQIEAIPLALQGRDIIGLAETGSGKTGAFALPILNA 30 40 50 60 70 80 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LLGQPSLDSLPIPAPRGLVLVPSRELAQQVRAVAQPLGRSLGLLVRDLEGGHGMRRIRLQ :: :. : .:::.:.:::: :. . :: :.:. . :: : CCDS86 LLETPQ--RL-----FALVLTPTRELAFQISEQFEALGSSIGVQSAVIVGGIDSMSQSLA 90 100 110 120 130 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 LSRQPSADVLVATPGALWKALK-SRLISLEQLSFLVLDEADTLLDESFLELVDYILEKSH :...: ...:::: : :. .. ..:. :..::.:::: .:. .: :: ::. CCDS86 LAKKPH--IIIATPGRLIDHLENTKGFNLRALKYLVMDEADRILNMDFETEVDKILKVI- 140 150 160 170 180 190 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 IAEGPADLEDPFNPKAQLVLVGATFPEGVGQLLNKVASPDAVTTITSSKLHCIMPHVKQT : : . : .::. . : : :...: . : .::: . . ...: CCDS86 ----PRD--------RKTFLFSATMTKKV-QKLQRAALKNPVKCAVSSKYQTV-EKLQQY 200 210 220 230 240 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 FLRLKGADKVAELVHILKHRDRAERTGPSGTVLVFCNSSSTVNWLGYILDDHKIQHLRLQ .. . . : . ::.::. : .: : ..::.. .... . .: . . . :. 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CCDS69 APGSLLHHASPTQTMAAADGSLFDNPRTFSRRP--PAQASRQAKATKRKYQASSEAPPAK 100 110 120 130 140 60 70 80 90 100 pF1KE5 RRN----LP-RPVLVRPGPLLVSARRPELNQPARLTLGRWERAPLASQGWKSRRARRDHF ::: :: . . :. .. .. .: . ... .: : :. ... CCDS69 RRNETSFLPAKKTSVKETQRTFKGNAQKMFSPKKHSVSTSDRNQEERQCIKTSSLFKNNP 150 160 170 180 190 200 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 SIERAQQEAPAVRKLSSK----GSFADLGLEPRVLHALQEAAPEVVQPTTVQSSTIPSLL .: . .. :.:.... : ..: .:::.:... ... . .. . :.::...:: :: CCDS69 DIPELHR--PVVKQVQEKVFTSAAFHELGLHPHLISTINTVL-KMSSMTSVQKQSIPVLL 210 220 230 240 250 260 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 RGRHVVCAAETGSGKTLSYLLPLLQRLLGQPSLDSLPIPAPRGLVLVPSRELAQQVRAVA .:: .. ..:::::::.: .:..: : .. : . .: .:::::.:::: : .. CCDS69 EGRDALVRSQTGSGKTLAYCIPVVQSLQAMESKIQRS-DGPYALVLVPTRELALQSFDTV 270 280 290 300 310 320 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 QPLGRSLGLLVRDLEGGHGMRRIRLQLSRQPSADVLVATPGALWKALKS-RLISLEQLSF : : . . .: . : : .: . . . ..:..::: : .:: . : . .: . CCDS69 QKLLKPFTWIVPGVLMG-GEKRKSEKARLRKGINILISTPGRLVDHIKSTKNIHFSRLRW 330 340 350 360 370 380 290 300 310 pF1KE5 LVLDEADTLLDESFLELVDYILE--------------KSHIAEGP---AD--LEDP---- ::.:::: .:: .: . . ::. .. ..:: :: :.:: CCDS69 LVFDEADRILDLGFEKDITVILNAVNAECQKRQNVLLSATLTEGVTRLADISLHDPVSIS 390 400 410 420 430 440 320 330 340 350 360 pF1KE5 --------FNPKAQLVLVGATFPEGVGQLLNKVASPDAV---TTITSSKLH--CIMPHVK .::: . : . : .:. :.. : :... .:.. :::. :. . CCDS69 VLDKSHDQLNPKDKAV--QEVCPPPAGDKLDSFAIPESLKQHVTVVPSKLRLVCLAAFIL 450 460 470 480 490 500 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 QTFLRLKGADKVAELVHILKHRDRAERTGPSGTVLVFCNSSSTVNWLGYILD-DHKIQHL : . : .. ..: ... . .: . : ::: . : . . . ... : CCDS69 Q---KCK-FEEDQKMVVFFSSCELVEFH--YSLFLQTLLSSSGAPASGQLPSASMRLKFL 510 520 530 540 550 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 RLQGQMPALMRVGIFQSFQKSSRDILLCTDIASRGLDSTGVELVVNYDFPPTLQDYIHRA ::.: : :...:: :..: : .:::: CCDS69 RLHGGMEQEERTAVFQEFSHSRRGVLLCT 560 570 580 >>CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 (881 aa) initn: 381 init1: 146 opt: 328 Z-score: 339.3 bits: 73.2 E(32554): 1.4e-12 Smith-Waterman score: 518; 28.3% identity (57.0% similar) in 505 aa overlap (34-535:11-470) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 TRPVRLFSLVTRLLLAPRRGLTVRSPDEPLPVVRIPVALQRQLEQRQSRR--RNLPRPVL : : .: :. . ..:: . : CCDS31 MAADKGPAAGPRSRAAMAQWRKKKGLRKRRGAASQARGSD 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VRPGPLLVSARRPELNQPARLTLGRWERAPLASQGWKSRRARRDHFSIERAQQEAPAVRK . : . ..: : . :: :: . : . . .. : . :::. .: CCDS31 SEDGEFEIQA---EDDARAR-KLGPGRPLPTFPTSECTSDVEPDTREMVRAQN-----KK 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LSSKGSFADLGLEPRVLHALQEAAPEVVQPTTVQSSTIPSLLRGRHVVCAAETGSGKTLS ...:.: ..:: :...... . .: :: .: .::: .: :. :: :.:::::: CCDS31 KKKSGGFQSMGLSYPVFKGIMKKGYKV--PTPIQRKTIPVILDGKDVVAMARTGSGKTAC 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 YLLPLLQRLLGQPSLDSLPIPAPRGLVLVPSRELAQQVRAVAQPLGRSLGLLVRDLEGGH .:::...:: . . . :.:.: :.:::: :. .. ::. :: . . :: CCDS31 FLLPMFERLKTHSAQTG-----ARALILSPTRELALQTLKFTKELGKFTGLKTALILGGD 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 GMRRIRLQLSRQPSADVLVATPGALWKALKSRLISLEQLSFLVLDEADTLLDESFLELVD :. : ..: :...:::: : .. ..:... ..:.:::: :.. .: : .. CCDS31 RMEDQFAALHENP--DIIIATPGRLVHVAVEMSLKLQSVEYVVFDEADRLFEMGFAEQLQ 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 YILEKSHIAEGPADLEDPFNPKAQLVLVGATFPEGVGQLLNK-VASPDAVTTITSSKLHC : ::. :. : :: .::.:. . .. .. : . ...::. CCDS31 EI-----IARLPGG--------HQTVLFSATLPKLLVEFARAGLTEPVLIRLDVDTKLN- 270 280 290 300 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 IMPHVKQTFLRLKGADKVAELVHILKHRDRAERTGPSGTVLVFCNSSSTVNWLGYILDDH ..: .:. .. :.: :.:.:.. : :. ..:: .. ...: .: . CCDS31 --EQLKTSFFLVREDTKAAVLLHLLHNVVR-----PQDQTVVFVATKHHAEYLTELLTTQ 310 320 330 340 350 360 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 KIQHLRLQGQMPALMRVGIFQSFQKSSRDILLCTDIASRGLDSTGVELVVNYDFPPTLQD ... .. . . : . .: .. . :. ::.:.:::: .. :.::.:: . CCDS31 RVSCAHIYSALDPTARKINLAKFTLGKCSTLIVTDLAARGLDIPLLDNVINYSFPAKGKL 370 380 390 400 410 420 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 YIHRAGRVGRVGSEVPGTVISFVTHPWDVSLVQKIELAARRRRSLPGLASSVKEPLPQAT ..::.:::.:.: ::. :.:. : .. . ..: : :: :: .::: CCDS31 FLHRVGRVARAGR--SGTAYSLVA-PDEIPYLLDLHLFLGR--SLT-LARPLKEPSGVAG 430 440 450 460 470 CCDS31 VDGMLGRVPQSVVDEEDSGLQSTLEASLELRGLARVADNAQQQYVRSRPAPSPESIKRAK 480 490 500 510 520 530 >>CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 (882 aa) initn: 381 init1: 146 opt: 328 Z-score: 339.2 bits: 73.2 E(32554): 1.4e-12 Smith-Waterman score: 518; 28.3% identity (57.0% similar) in 505 aa overlap (34-535:11-470) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 TRPVRLFSLVTRLLLAPRRGLTVRSPDEPLPVVRIPVALQRQLEQRQSRR--RNLPRPVL : : .: :. . ..:: . : CCDS44 MAADKGPAAGPRSRAAMAQWRKKKGLRKRRGAASQARGSD 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VRPGPLLVSARRPELNQPARLTLGRWERAPLASQGWKSRRARRDHFSIERAQQEAPAVRK . : . ..: : . :: :: . : . . .. : . :::. .: CCDS44 SEDGEFEIQA---EDDARAR-KLGPGRPLPTFPTSECTSDVEPDTREMVRAQN-----KK 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LSSKGSFADLGLEPRVLHALQEAAPEVVQPTTVQSSTIPSLLRGRHVVCAAETGSGKTLS ...:.: ..:: :...... . .: :: .: .::: .: :. :: :.:::::: CCDS44 KKKSGGFQSMGLSYPVFKGIMKKGYKV--PTPIQRKTIPVILDGKDVVAMARTGSGKTAC 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 YLLPLLQRLLGQPSLDSLPIPAPRGLVLVPSRELAQQVRAVAQPLGRSLGLLVRDLEGGH .:::...:: . . . :.:.: :.:::: :. .. ::. :: . . :: CCDS44 FLLPMFERLKTHSAQTG-----ARALILSPTRELALQTLKFTKELGKFTGLKTALILGGD 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 GMRRIRLQLSRQPSADVLVATPGALWKALKSRLISLEQLSFLVLDEADTLLDESFLELVD :. : ..: :...:::: : .. ..:... ..:.:::: :.. .: : .. 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CCDS44 RVSCAHIYSALDPTARKINLAKFTLGKCSTLIVTDLAARGLDIPLLDNVINYSFPAKGKL 370 380 390 400 410 420 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 YIHRAGRVGRVGSEVPGTVISFVTHPWDVSLVQKIELAARRRRSLPGLASSVKEPLPQAT ..::.:::.:.: ::. :.:. : .. . ..: : :: :: .::: CCDS44 FLHRVGRVARAGR--SGTAYSLVA-PDEIPYLLDLHLFLGR--SLT-LARPLKEPSGVAG 430 440 450 460 470 CCDS44 VDGMLGRVPQSVVDEEDSGLQSTLEASLELRGLARVADNAQQQYVRSRPAPSPESIKRAK 480 490 500 510 520 530 540 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 04:17:01 2016 done: Tue Nov 8 04:17:02 2016 Total Scan time: 3.650 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]