FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5023, 467 aa 1>>>pF1KE5023 467 - 467 aa - 467 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2500+/-0.000705; mu= 19.2894+/- 0.043 mean_var=80.7876+/-16.337, 0's: 0 Z-trim(111.2): 92 B-trim: 60 in 1/49 Lambda= 0.142693 statistics sampled from 12127 (12223) to 12127 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.375), width: 16 Scan time: 2.710 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 3116 650.8 8.5e-187 CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 1681 355.5 7.8e-98 CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 1286 274.1 2.3e-73 CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 1149 245.9 6.3e-65 CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 1113 238.7 1.9e-62 CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 1084 232.7 1.1e-60 CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 872 188.9 1e-47 CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 855 185.4 1.2e-46 CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 837 181.7 1.5e-45 CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 733 160.2 3.8e-39 CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 726 158.9 1.2e-38 CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 625 138.0 2e-32 CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 626 138.4 2.2e-32 CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 609 134.8 2.1e-31 CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 582 129.2 9.6e-30 CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 581 129.0 1e-29 CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 578 128.4 1.7e-29 CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 565 125.8 1.2e-28 CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 543 121.2 2.6e-27 CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 542 121.0 3.4e-27 CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 536 119.8 7.2e-27 CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 523 117.1 4.5e-26 CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 515 115.5 1.5e-25 CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 512 114.9 2.9e-25 CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 510 114.4 3.1e-25 CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 510 114.4 3.2e-25 CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 510 114.5 3.3e-25 CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 510 114.5 3.3e-25 CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 510 114.5 3.3e-25 CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 510 114.5 3.4e-25 CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 505 113.4 6.8e-25 CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 505 113.4 6.9e-25 CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 472 106.7 7.7e-23 CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 428 97.6 4e-20 CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 428 97.6 4.1e-20 CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 428 97.6 4.2e-20 CCDS456.1 KCNQ4 gene_id:9132|Hs108|chr1 ( 695) 313 73.9 5.8e-13 CCDS13521.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 393) 297 70.4 3.7e-12 CCDS46629.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 841) 297 70.7 6.6e-12 CCDS13518.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 844) 297 70.7 6.6e-12 CCDS13519.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 854) 297 70.7 6.6e-12 CCDS13520.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 872) 297 70.7 6.8e-12 >>CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 (466 aa) initn: 3052 init1: 3052 opt: 3116 Z-score: 3467.1 bits: 650.8 E(32554): 8.5e-187 Smith-Waterman score: 3116; 99.8% identity (99.8% similar) in 467 aa overlap (1-467:1-466) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEPWPCSPGGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERLRACRGHDDLLRVC ::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 MEPWPCSPGGGGG-TRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERLRACRGHDDLLRVC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 DDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 DDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCC 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LRRLRRREEEAAEARAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNPHSGLAGKLF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 LRRLRRREEEAAEARAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNPHSGLAGKLF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 ACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFSFEFLLRSLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 ACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFSFEFLLRSLQ 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 AESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAGLVLRLLRALRVLYVM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 AESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAGLVLRLLRALRVLYVM 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 RLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAERELGARRDFSSVPAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 RLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAERELGARRDFSSVPAS 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 YWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYSELKEQQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 YWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYSELKEQQ 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 pF1KE5 QRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRAGR ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 QRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRAGR 420 430 440 450 460 >>CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 (519 aa) initn: 1710 init1: 754 opt: 1681 Z-score: 1869.9 bits: 355.5 E(32554): 7.8e-98 Smith-Waterman score: 1681; 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CCDS10 EMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEEDQGECSRKCYYIFIVETI 210 220 230 240 250 260 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 CVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAG-----PGGTKL ::::::.:: :: .::..:: :...:::::::::. :.:::: .. :.:.. CCDS10 CVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEPPEDGERPSGSSY 270 280 290 300 310 320 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 LERAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPL ::..:::::.:::::.:::::::::::::..::::.:::.:::::::::: ::..::.:: CCDS10 LEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITLFSPL 330 340 350 360 370 380 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 VHLAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAF :..::.: : .:.:.:::::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::.::: CCDS10 VYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPRSVPGQMVALSSILSGILIMAF 390 400 410 420 430 440 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 PVTSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADA :.::::::::.:: :::..:.. . ::. . : : . . : .: : CCDS10 PATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECELLDPHVASEHE-LMNDVNDL 450 460 470 480 490 500 pF1KE5 LWVRAGR CCDS10 ILEGPALPIMHM 510 >>CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 (513 aa) initn: 1714 init1: 763 opt: 1286 Z-score: 1430.5 bits: 274.1 E(32554): 2.3e-73 Smith-Waterman score: 1728; 59.6% identity (80.6% similar) in 453 aa overlap (16-459:61-511) 10 20 30 40 pF1KE5 MEPWPCSPGGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLE : :..:::::: . : :..: . ::.:: CCDS13 QRQAIKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLG 40 50 60 70 80 90 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 RLRACRGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDE .:.:: . ::.: :::::::. .::::::.: :: .:...:::::::::: :::.:..: CCDS13 QLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEE 100 110 120 130 140 150 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 LAYWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEARAGPTERGAQGSPAR-ALGP---RGRLQRGR : :::: : .:. :: :: .. :: :: : : : .: . :: .::: : CCDS13 LLYWGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDSEGPAEGEGRLGRCM 160 170 180 190 200 210 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 RRLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFV :::::.:. ::::: ::.:::.:: ::.::::.: .::.:..: :::.:.:: :...:. CCDS13 RRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGHCSQMCHNVFI 220 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 pF1KE5 LETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLL-GLAAG---PG- .:.:::.:::.::::: .:: :: ::::.::..::..:.::.:..::. : ::: :: CCDS13 VESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAAGRRKPGA 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 GTKLLERAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMAL :.. :...:::::.:::::.:::::::::::::..:::: :::.:::::::::::::.:: CCDS13 GNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLFLCVAIAL 340 350 360 370 380 390 340 350 360 370 380 390 pF1KE5 FAPLVHLAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGIL ::::... : :.. .:.:.:: ::::::.::::::::::::: ::::::::::::::: CCDS13 FAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALSSILSGIL 400 410 420 430 440 450 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 LMAFPVTSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADD ::::::::::::::::: :::..:.:. . . . . ....::. :: ..: CCDS13 LMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFGSA--SSD 460 470 480 490 500 460 pF1KE5 SADALWVRAGR . : CCDS13 TRDNN 510 >>CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (425 aa) initn: 838 init1: 306 opt: 1149 Z-score: 1279.2 bits: 245.9 E(32554): 6.3e-65 Smith-Waterman score: 1149; 43.2% identity (71.7% similar) in 417 aa overlap (13-422:4-414) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEPWPCSPGGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERLRACRGHDDLLRVC : . : :..:::: : :. : :: :. ::..::.. :.:.:: CCDS42 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHGCRSERDVLEVC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE5 DDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRA-GKLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERC :::: :.:.:::: :: :. .:. ::::. : :.: .:. :::.. :.:: : CCDS42 DDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIYWGLEGAHLEYC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 CLRRLRRREEEAAEARAGPTERGAQG-SPARALGPRGR-LQRGRRRLRDVVDNPHSGLAG : ::: : .. .. : :. : . :: : .. .: .:.: . ..: :.::. CCDS42 CQRRLDDRMSDTYTFYSAD-EPGVLGRDEARPGGAEAAPSRRWLERMRRTFEEPTSSLAA 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 KLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIR-AEEERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFSFEFLL ...: ::: :: :. : :: ::.:: : : . . . : ..:..:..::. : .. CCDS42 QILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSR---IIEAICIGWFTAECIV 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 RSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAGLVLRLLRALRV : . ...:: :.. ::::::.::. :.:.:.:. . .: .. :.:::..::.:: .:. CCDS42 RFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENSQ--LQRAGVTLRVLRMMRI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 LYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAERELG---ARRD ..:..:::: .::..::::..:: ::. .::.:.:::::.:. : .: :. : . .: CCDS42 FWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKD 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 FSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSY :.:.::. ::..::::::::::: : ..::.... ..:::.:.:.:.: :.:.: . : CCDS42 FTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCY 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KE5 SELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRAGR ::: .. : CCDS42 HELKFRSARYSRSLSTEFLN 410 420 >>CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 (911 aa) initn: 941 init1: 398 opt: 1113 Z-score: 1234.7 bits: 238.7 E(32554): 1.9e-62 Smith-Waterman score: 1113; 40.6% identity (74.2% similar) in 419 aa overlap (15-431:32-441) 10 20 30 40 pF1KE5 MEPWPCSPGGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARL : .:.: ::::: .. : .: : : .:: CCDS62 AEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 ERLRACRGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRD .:: : :..::.:::::.....:.:::: : :: .:. . :.:::.... :::.: . CCDS62 GKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFGQ 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 ELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEA--RAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRR :: :::::: :: :: : ....:. : : . : : .: . :. CCDS62 ELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDK----RK 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 RLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVL .: :....:.:..:.:..: ::. :.......: :.:.:... .: :. . . :.: . CCDS62 KLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDN-RQLAHV 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 ETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLE :.::.:::..:.::: :.. .: :...:::.::.::.::.::... :. . .. .. CCDS62 EAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIF--LTESNKSVLQFQ 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 RAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVH . :....: .:.: ...::::: ::.:::.:.:: :.:::.::: ... .:. :: CCDS62 NVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVF 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 LAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPV .::.. : . :.:.:::.:::.:.::::::::. :..: :..:. ..:.:..:.:. CCDS62 FAEKDEDATK-FTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPI 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 TSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALW : ..::. :.: : .:..: . . ::. CCDS62 PIIVNNFSEFYKEQK-RQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKA 420 430 440 450 460 470 >>CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 (858 aa) initn: 926 init1: 392 opt: 1084 Z-score: 1202.7 bits: 232.7 E(32554): 1.1e-60 Smith-Waterman score: 1084; 39.8% identity (73.4% similar) in 417 aa overlap (17-431:30-437) 10 20 30 40 pF1KE5 MEPWPCSPGGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERL .:.: .:::: .. : .: : : .:: .: CCDS13 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 RACRGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELA : : ::.::.:::::... .:.:::: : :: .:. . :.:.:.... :::.: .:: CCDS13 RDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELD 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 YWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEA--RAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLR :::::: :: :: : ....:. : : . : : .: . :..: CCDS13 YWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTC----CAEKRKKLW 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 DVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETV :....:.:..:.:..: .:. :.......: :.:.:.... .: :. : .: .:.: CCDS13 DLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQ-STDNPQLAHVEAV 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 CVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAG :.:::..:.::: :.. .: :...::: ::.::.::.::...: . . .. .. . CCDS13 CIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFL--TESNKSVLQFQNVR 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 LVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAE :....: .:.: ...::::: ::.:::.:.:: :.:::.::: ... .:. :: .:: CCDS13 RVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAE 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 RELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSI .. . :.:.:::.:::.:.::::::::. :..: :..:. ..:.:..:.:. : CCDS13 KDEDDTK-FKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPII 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 FHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRA ..::. :.: : .:..: . . ::. CCDS13 VNNFSEFYKEQK-RQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGEN 420 430 440 450 460 470 >>CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 (494 aa) initn: 709 init1: 250 opt: 872 Z-score: 970.1 bits: 188.9 E(32554): 1e-47 Smith-Waterman score: 873; 33.0% identity (66.3% similar) in 436 aa overlap (20-450:25-447) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MEPWPCSPGGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERLRACR--GH ...:::: : : :.. : .:: .: : :. CCDS16 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETRLAELINCLAGGY 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 DDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDE : .. .::::: .. ::.:::.: ::. .. . :.... .: : . :..:. .: .: CCDS16 DTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPICFKNEMDFWKVDL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 ARLERCCLRRLRRREEEAAE-ARAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNPH :. :: .: ...:: : :: : : .:: .: .. . ...:. CCDS16 KFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDA----AEGRWRRCQKCVWKFLEKPE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 SGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFSF :. ... : .: .. :..: .:..:.:.... . .:. . .: .::.:..::.. CCDS16 SSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGN-RVEHPTLENVETACIGWFTL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 EFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAGL--VLRL :.::: ... .: : . .::.:.::.::::::: : :....: ... ... CCDS16 EYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHL----GARMMELTNVQQAVQA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 LRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAERELGA :: .:. ...::::: ::..: ...: .:.::::..: :.. .:. : . :. CCDS16 LRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQS-HP 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 RRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFS . :.:.: :.:::.:.::::::::. :.. :.. : :.: :.. .:.:. :...: CCDS16 ETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIINNFV 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 RSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRAGR : :.. .. . ::. : :.: .:... : .. : : CCDS16 RYYNK-QRVLETAAKHELELME--LNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPPEPAGKEAPSCSSR 420 430 440 450 460 CCDS16 LKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK 470 480 490 >>CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 (500 aa) initn: 922 init1: 416 opt: 855 Z-score: 951.1 bits: 185.4 E(32554): 1.2e-46 Smith-Waterman score: 949; 37.7% identity (64.8% similar) in 446 aa overlap (6-439:27-460) 10 20 30 pF1KE5 MEPWPCSPGGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARC :: : : . . .:::: : :. ::. CCDS63 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLDSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCF 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 pF1KE5 PLARLERLRAC----RGHDDL------LRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAG : .:: .: . : : :..::: . .:.::::: ::: .. :.: CCDS63 PHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTG 70 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 KLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREE--EAAEARAGPTERGAQGSP .:.... :::.: .:. :::::: .. :: : ::.: :. . . .. .: CCDS63 RLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSETLDFKKDTEDQESQHES 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 ARALGPRGRLQRGRRRLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEE . .. .: :..: .....: :. :...:. .:. ::.:. ... : . :: CCDS63 EQDFS-QGPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMAL-----MSAEL 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 ERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSL . . : .:: ::..::. ::.:: : ....: ::: ::::.::.::::..: CCDS63 SWLD----LQLLEILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 LLGLAAGPGGTKLLERAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLL :. .: :. :: .: ....:: ::.: ...:.::: ::::::.:. .: .: :::: CCDS63 LVESLSGSQTTQELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLL 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 LFLCVAMALFAPLVHLAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVA ::: :....:. . ..::. . :.::: ..:::. :::::::::. : . :..:: CCDS63 LFLSVGISIFSTVEYFAEQSI-PDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVA 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 LSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQG . ::::::..:.:.. : :: : :: .. :. . ::.. . . :: CCDS63 FMCILSGILVLALPIAIINDRFSACYFTLK-LKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNL 410 420 430 440 450 460 450 460 pF1KE5 PDSAGLADDSADALWVRAGR CCDS63 RDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSGGDDFWF 470 480 490 500 >>CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 (491 aa) initn: 827 init1: 315 opt: 837 Z-score: 931.2 bits: 181.7 E(32554): 1.5e-45 Smith-Waterman score: 899; 35.4% identity (66.3% similar) in 427 aa overlap (14-427:11-430) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEPWPCSPGGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERLRACRGHDDLLRVC : . : .:::: . . ..: : : .:: .: .:.... .:..: CCDS16 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLTCHSEEAILELC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 DDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCC :::.:. :..:::.: :: .. . .:::.... :...: .:. ::::.: .. :: CCDS16 DDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYWGINELFIDSCC 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE5 LRRLRRREEEAAE------ARAGPTERGAQGSP--ARALGPRGRLQRG--RRRLRDVVDN : ..:.:: : .. :. . . : . : :. : :... ..: CCDS16 SNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQLRKKIWIRMEN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 PHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETVCVAWF : :..::.: :.: : .. :..:. .: ... :. :: . : .: .:.::: CCDS16 PAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNED--GEVDDPV--LEGVEIACIAWF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 SFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAGLVLRL . :. .: : . : . ::::::.....:::..: . .. .: : :... CCDS16 TGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEE--SEDIENMGKVVQI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 LRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAERELGA :: .:.. ...:::::.:::::: :.:. .: ::::::: :....:. :.. .:.. CCDS16 LRLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVLIYSVEKD-DH 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 RRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFS ...:.: .:::.:::::::::: : .: :...: . :. :::..:.:.: ::. :: CCDS16 TSSLTSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILVVALPITIIFNKFS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 RSYSELKE---QQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRAGR . :.. :. .: .:: CCDS16 KYYQKQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDA 420 430 440 450 460 470 >>CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (436 aa) initn: 1177 init1: 279 opt: 733 Z-score: 816.2 bits: 160.2 E(32554): 3.8e-39 Smith-Waterman score: 1141; 42.4% identity (70.6% similar) in 425 aa overlap (13-422:4-425) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MEPWPCSPGGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERLRACRGHDDLLRVC : . : :..:::: : :. : :: :. ::..::.. :.:.:: CCDS18 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHGCRSERDVLEVC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE5 DDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRA-GKLRLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERC :::: :.:.:::: :: :. .:. ::::. : :.: .:. :::.. :.:: : CCDS18 DDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIYWGLEGAHLEYC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 CLRRLRRREEEAAEARAGPTERGAQG-SPARALGPRGR-LQRGRRRLRDVVDNPHSGLAG : ::: : .. .. : :. : . :: : .. .: .:.: . ..: :.::. CCDS18 CQRRLDDRMSDTYTFYSAD-EPGVLGRDEARPGGAEAAPSRRWLERMRRTFEEPTSSLAA 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 KLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRA---------EEERGECSPKCRSLFVLETVCVA ...: ::: :: :. : :: ::.:: : .. : .: . ..:..:.. CCDS18 QILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAGPGREPSGIIEAICIG 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 WFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLERAGLVL ::. : ..: . ...:: :.. ::::::.::. :.:.:.:. . .: .. :.:::..: CCDS18 WFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENSQ--LQRAGVTL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 RLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAEREL :.:: .:...:..:::: .::..::::..:: ::. .::.:.:::::.:. : .: :. : CCDS18 RVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 G---ARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSI . .::.:.::. ::..::::::::::: : ..::.... ..:::.:.:.:.: : CCDS18 DLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFI 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 FHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALWVRA .:.: . : ::: .. : CCDS18 YHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN 410 420 430 467 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 04:15:39 2016 done: Tue Nov 8 04:15:40 2016 Total Scan time: 2.710 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]