FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5005, 467 aa 1>>>pF1KE5005 467 - 467 aa - 467 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9725+/-0.00108; mu= -10.3480+/- 0.064 mean_var=324.6885+/-72.388, 0's: 0 Z-trim(110.8): 114 B-trim: 699 in 1/52 Lambda= 0.071177 statistics sampled from 11765 (11873) to 11765 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16 Scan time: 3.270 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10265.1 CLK3 gene_id:1198|Hs108|chr15 ( 490) 2207 240.8 2.4e-63 CCDS45304.1 CLK3 gene_id:1198|Hs108|chr15 ( 638) 2207 240.9 3e-63 CCDS72939.1 CLK2 gene_id:1196|Hs108|chr1 ( 499) 1625 181.0 2.4e-45 CCDS1107.1 CLK2 gene_id:1196|Hs108|chr1 ( 498) 1614 179.9 5.2e-45 CCDS4437.1 CLK4 gene_id:57396|Hs108|chr5 ( 481) 1376 155.5 1.2e-37 CCDS2331.1 CLK1 gene_id:1195|Hs108|chr2 ( 484) 1330 150.7 3.1e-36 CCDS54427.1 CLK1 gene_id:1195|Hs108|chr2 ( 526) 1330 150.8 3.3e-36 >>CCDS10265.1 CLK3 gene_id:1198|Hs108|chr15 (490 aa) initn: 2138 init1: 2138 opt: 2207 Z-score: 1250.7 bits: 240.8 E(32554): 2.4e-63 Smith-Waterman score: 3217; 95.3% identity (95.3% similar) in 490 aa overlap (1-467:1-490) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MHHCKRYRSPEPDPYLSYRWKRRRSYSREHEGRLRYPSRREPPPRRSRSRSHDRLPYQRR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 MHHCKRYRSPEPDPYLSYRWKRRRSYSREHEGRLRYPSRREPPPRRSRSRSHDRLPYQRR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YRERRDSDTYRCEERSPSFGEDYYGPSRSRHRRRSRERGPYRTRKHAHHCHKRRTRSCSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 YRERRDSDTYRCEERSPSFGEDYYGPSRSRHRRRSRERGPYRTRKHAHHCHKRRTRSCSS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 ASSRSQQSSKRSSRSVEDDKEGHLVCRIGDWLQERYE----------------------- ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 ASSRSQQSSKRSSRSVEDDKEGHLVCRIGDWLQERYEIVGNLGEGTFGKVVECLDHARGK 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 SQVALKIIRNVGKYREAARLEINVLKKIKEKDKENKFLCVLMSDWFNFHGHMCIAFELLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 SQVALKIIRNVGKYREAARLEINVLKKIKEKDKENKFLCVLMSDWFNFHGHMCIAFELLG 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 KNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPENILFVNSEFETLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 KNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPENILFVNSEFETLY 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 NEHKSCEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILELGWAQPCDVWSI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 NEHKSCEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILELGWAQPCDVWSI 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KE5 GCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 GCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSD 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 GRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 GRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEER 430 440 450 460 470 480 460 pF1KE5 SFHTSRNPSR :::::::::: CCDS10 SFHTSRNPSR 490 >>CCDS45304.1 CLK3 gene_id:1198|Hs108|chr15 (638 aa) initn: 2214 init1: 2138 opt: 2207 Z-score: 1249.1 bits: 240.9 E(32554): 3e-63 Smith-Waterman score: 3217; 95.3% identity (95.3% similar) in 490 aa overlap (1-467:149-638) 10 20 30 pF1KE5 MHHCKRYRSPEPDPYLSYRWKRRRSYSREH :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 GLPRAEVAAGSGRGARSGEWGLAAAGAWETMHHCKRYRSPEPDPYLSYRWKRRRSYSREH 120 130 140 150 160 170 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 EGRLRYPSRREPPPRRSRSRSHDRLPYQRRYRERRDSDTYRCEERSPSFGEDYYGPSRSR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 EGRLRYPSRREPPPRRSRSRSHDRLPYQRRYRERRDSDTYRCEERSPSFGEDYYGPSRSR 180 190 200 210 220 230 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 HRRRSRERGPYRTRKHAHHCHKRRTRSCSSASSRSQQSSKRSSRSVEDDKEGHLVCRIGD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 HRRRSRERGPYRTRKHAHHCHKRRTRSCSSASSRSQQSSKRSSRSVEDDKEGHLVCRIGD 240 250 260 270 280 290 160 170 180 pF1KE5 WLQERYE-----------------------SQVALKIIRNVGKYREAARLEINVLKKIKE ::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 WLQERYEIVGNLGEGTFGKVVECLDHARGKSQVALKIIRNVGKYREAARLEINVLKKIKE 300 310 320 330 340 350 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 KDKENKFLCVLMSDWFNFHGHMCIAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 KDKENKFLCVLMSDWFNFHGHMCIAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHA 360 370 380 390 400 410 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 LRFLHENQLTHTDLKPENILFVNSEFETLYNEHKSCEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 LRFLHENQLTHTDLKPENILFVNSEFETLYNEHKSCEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEH 420 430 440 450 460 470 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 HTTIVATRHYRPPEVILELGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 HTTIVATRHYRPPEVILELGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKIL 480 490 500 510 520 530 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 GPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 GPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMR 540 550 560 570 580 590 430 440 450 460 pF1KE5 RMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEERSFHTSRNPSR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 RMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEERSFHTSRNPSR 600 610 620 630 >>CCDS72939.1 CLK2 gene_id:1196|Hs108|chr1 (499 aa) initn: 1851 init1: 1547 opt: 1625 Z-score: 927.6 bits: 181.0 E(32554): 2.4e-45 Smith-Waterman score: 1848; 56.8% identity (75.4% similar) in 500 aa overlap (1-467:1-499) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MHHCKRYRSPEPDPYLSYRW-------KRRRSYS-REHEGRLRYPSRREPPPRRSRSRSH : : .::.: : ::: ::::: : : : :.. :::: CCDS72 MPHPRRYHSSERGSRGSYREHYRSRKHKRRRSRSWSSSSDRTRRRRREDSYHVRSRSSYD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 DRLPYQRRYRERRDSDTYRCEERSPSFGEDYYGPSRSRHRRRSRERGPYRTRKHAHHCHK :: .:: .:: .:: .. : . :. :: . . . .:: . ::... ... :. CCDS72 DR-SSDRRVYDRRYCGSYRRNDYSRDRGDAYYDTDYRHSYEYQRENSSYRSQRSSRRKHR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 RRTRSCSSASSRSQQSSKRSSRSVEDDKEGHLVCRIGDWLQERYE--------------- :: : . : :.: :.: ..::::: ::::. ..::::::::: CCDS72 RRRRRSRTFSRSSSQHSSRRAKSVEDDAEGHLIYHVGDWLQERYEIVSTLGEGTFGRVVQ 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 pF1KE5 --------SQVALKIIRNVGKYREAARLEINVLKKIKEKDKENKFLCVLMSDWFNFHGHM ..::::::.:: ::.::::::::::.::.::: .:: ::: : :::..:::: CCDS72 CVDHRRGGARVALKIIKNVEKYKEAARLEINVLEKINEKDPDNKNLCVQMFDWFDYHGHM 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 CIAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPENILFV ::.::::: .::.:::.::. :::. .:::::.:::.:..:::.:.:::::::::::::: CCDS72 CISFELLGLSTFDFLKDNNYLPYPIHQVRHMAFQLCQAVKFLHDNKLTHTDLKPENILFV 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 NSEFETLYNEHKSCEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILELGWA ::..: :: .:. .:.:::.:..::.::::::::::::.:::.::::: :::::::::. CCDS72 NSDYELTYNLEKKRDERSVKSTAVRVVDFGSATFDHEHHSTIVSTRHYRAPEVILELGWS 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 QPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGL :::::::::::.:::: ::::::::.:::::.:::.:::::::.::..::::::::.: : CCDS72 QPCDVWSIGCIIFEYYVGFTLFQTHDNREHLAMMERILGPIPSRMIRKTRKQKYFYRGRL 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 VWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFF ::::.: ::::.::::::. :. ... :: :::::.. :::..::.:.::.::: :::: CCDS72 DWDENTSAGRYVRENCKPLRRYLTSEAEEHHQLFDLIESMLEYEPAKRLTLGEALQHPFF 420 430 440 450 460 470 450 460 pF1KE5 AGLT--PEERSFHTSRNPSR : : : .. . .::. :: CCDS72 ARLRAEPPNKLWDSSRDISR 480 490 >>CCDS1107.1 CLK2 gene_id:1196|Hs108|chr1 (498 aa) initn: 1729 init1: 1547 opt: 1614 Z-score: 921.5 bits: 179.9 E(32554): 5.2e-45 Smith-Waterman score: 1842; 57.0% identity (75.8% similar) in 500 aa overlap (1-467:1-498) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MHHCKRYRSPEPDPYLSYRW-------KRRRSYS-REHEGRLRYPSRREPPPRRSRSRSH : : .::.: : ::: ::::: : : : :.. :::: CCDS11 MPHPRRYHSSERGSRGSYREHYRSRKHKRRRSRSWSSSSDRTRRRRREDSYHVRSRSSYD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 DRLPYQRRYRERRDSDTYRCEERSPSFGEDYYGPSRSRHRRRSRERGPYRTRKHAHHCHK :: .:: .:: .:: .. : . :. :: . . . .:: . ::... ... :. CCDS11 DR-SSDRRVYDRRYCGSYRRNDYSRDRGDAYYDTDYRHSYEYQRENSSYRSQRSSRRKHR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 RRTRSCSSASSRSQQSSKRSSRSVEDDKEGHLVCRIGDWLQERYE--------------- :: : : . :::.. :.: ..::::: ::::. ..::::::::: CCDS11 RRRRR-SRTFSRSSSHSSRRAKSVEDDAEGHLIYHVGDWLQERYEIVSTLGEGTFGRVVQ 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 pF1KE5 --------SQVALKIIRNVGKYREAARLEINVLKKIKEKDKENKFLCVLMSDWFNFHGHM ..::::::.:: ::.::::::::::.::.::: .:: ::: : :::..:::: CCDS11 CVDHRRGGARVALKIIKNVEKYKEAARLEINVLEKINEKDPDNKNLCVQMFDWFDYHGHM 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 CIAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPENILFV ::.::::: .::.:::.::. :::. .:::::.:::.:..:::.:.:::::::::::::: CCDS11 CISFELLGLSTFDFLKDNNYLPYPIHQVRHMAFQLCQAVKFLHDNKLTHTDLKPENILFV 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 NSEFETLYNEHKSCEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILELGWA ::..: :: .:. .:.:::.:..::.::::::::::::.:::.::::: :::::::::. CCDS11 NSDYELTYNLEKKRDERSVKSTAVRVVDFGSATFDHEHHSTIVSTRHYRAPEVILELGWS 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 QPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGL :::::::::::.:::: ::::::::.:::::.:::.:::::::.::..::::::::.: : CCDS11 QPCDVWSIGCIIFEYYVGFTLFQTHDNREHLAMMERILGPIPSRMIRKTRKQKYFYRGRL 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 VWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFF ::::.: ::::.::::::. :. ... :: :::::.. :::..::.:.::.::: :::: CCDS11 DWDENTSAGRYVRENCKPLRRYLTSEAEEHHQLFDLIESMLEYEPAKRLTLGEALQHPFF 420 430 440 450 460 470 450 460 pF1KE5 AGLT--PEERSFHTSRNPSR : : : .. . .::. :: CCDS11 ARLRAEPPNKLWDSSRDISR 480 490 >>CCDS4437.1 CLK4 gene_id:57396|Hs108|chr5 (481 aa) initn: 1600 init1: 1357 opt: 1376 Z-score: 789.6 bits: 155.5 E(32554): 1.2e-37 Smith-Waterman score: 1578; 50.7% identity (72.6% similar) in 489 aa overlap (1-449:1-475) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MHHCKRYRSPEPDP-----YLSYRW---KRRRSYSREHEGRLRYPSR--REPPPRRSRSR :.: :: . :. : . ::: ..:::.: .:.: : . .: . ..: CCDS44 MRHSKRTHCPDWDSRESWGHESYRGSHKRKRRSHSSTQENRHCKPHHQFKESDCHYLEAR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE5 SHDRLPYQRRYRERRDSDTYR---CEERSPS-FGEDYYGPSR---SRHRRRSRERGPYRT : . .: ::.:: : :: :: : . .: . : :. :::. .: : CCDS44 SLN----ERDYRDRRYVDEYRNDYCEGYVPRHYHRDIESGYRIHCSKSSVRSRRSSPKR- 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 pF1KE5 RKHAHHCHKRRTRSCSSASSRSQQSSKRSSRSVEDDKEGHLVCRIGDWLQERYE------ .:.: ::: .:::.. .. :::.:::.::::.:. :: :. ::: CCDS44 ---------KRNRHCSSHQSRSKSHRRKRSRSIEDDEEGHLICQSGDVLRARYEIVDTLG 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 pF1KE5 -----------------SQVALKIIRNVGKYREAARLEINVLKKIKEKDKENKFLCVLMS .::.::..:::.:::::: ::.::.... : .. : :: : CCDS44 EGAFGKVVECIDHGMDGMHVAVKIVKNVGRYREAARSEIQVLEHLNSTDPNSVFRCVQML 170 180 190 200 210 220 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 DWFNFHGHMCIAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTD .::. :::.::.::::: .:..:.:::.: :. . :.:.::::.:... :::.:.::::: CCDS44 EWFDHHGHVCIVFELLGLSTYDFIKENSFLPFQIDHIRQMAYQICQSINFLHHNKLTHTD 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 LKPENILFVNSEFETLYNEHKSCEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPP :::::::::.:.. . :: . . .:...:::.:.:.::::::.: :::.:.:.::::: : CCDS44 LKPENILFVKSDYVVKYNSKMKRDERTLKNTDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAP 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 EVILELGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRK :::: :::.::::::::::::.::: :::.::::...:::.:::.::::::.:::..::: CCDS44 EVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFQTHDSKEHLAMMERILGPIPQHMIQKTRK 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 QKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITL .:::... : :::.:: ::::.. ::::: .:: . :: .::::.:::::.::.::::: CCDS44 RKYFHHNQLDWDEHSSAGRYVRRRCKPLKEFMLCHDEEHEKLFDLVRRMLEYDPTQRITL 410 420 430 440 450 460 450 460 pF1KE5 AEALLHPFFAGLTPEERSFHTSRNPSR ::: :::: CCDS44 DEALQHPFFDLLKKK 470 480 >>CCDS2331.1 CLK1 gene_id:1195|Hs108|chr2 (484 aa) initn: 1426 init1: 1301 opt: 1330 Z-score: 764.1 bits: 150.7 E(32554): 3.1e-36 Smith-Waterman score: 1476; 47.9% identity (71.1% similar) in 484 aa overlap (1-449:1-477) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MHHCKRYRSPE-PDPYLSY-RWK-------RRRSYSREHEG-RLRYPSRREPPPRRSRSR :.: :: :. : .: .:. :.::.: .:. : .: . . .:: CCDS23 MRHSKRTYCPDWDDKDWDYGKWRSSSSHKRRKRSHSSAQENKRCKYNHSKMCDSHYLESR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE5 SHDRLPYQ-RRY-RERRDSDTYRCEERSPSFGEDYYGPSRSRHRRRSRERGPYRTRKHAH : .. :. ::: : :.. : :: :. . . . : .: :. . : : CCDS23 SINEKDYHSRRYIDEYRNDYTQGCE---PGHRQRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKH 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 pF1KE5 HCHKRRTRSCSSASSRSQQSSKRSSRSVEDDKEGHLVCRIGDWLQERYE----------- . :. : : :.... .. .::::::.::::.:. :: :. ::: CCDS23 RIHH----STSHRRSHGKSHRRKRTRSVEDDEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFG 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 pF1KE5 ------------SQVALKIIRNVGKYREAARLEINVLKKIKEKDKENKFLCVLMSDWFNF .::.::..:: .: :::: ::.::.... : .. : :: : .::. CCDS23 KVVECIDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAARSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEH 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 HGHMCIAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLPHVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPEN :::.::.::::: .:..:.:::.: :. : :.:.::::.:... ::: :.:::::::::: CCDS23 HGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLDHIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPEN 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 ILFVNSEFETLYNEHKSCEEKSVKNTSIRVADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILE ::::.:.. :: . . .:... : .:.:.::::::.: :::.:.:.::::: ::::: CCDS23 ILFVQSDYTEAYNPKIKRDERTLINPDIKVVDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILA 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 LGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHENREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFY :::.::::::::::::.::: :::.: ::...:::.:::.::::.:.:::..:::.:::. CCDS23 LGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHDSKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFH 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 KGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQDSLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALL . : :::.:: ::::.. ::::: .::....:: .::::...:::.:::.:::: ::: CCDS23 HDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQDVEHERLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALK 420 430 440 450 460 470 450 460 pF1KE5 HPFFAGLTPEERSFHTSRNPSR :::: CCDS23 HPFFDLLKKSI 480 >>CCDS54427.1 CLK1 gene_id:1195|Hs108|chr2 (526 aa) initn: 1426 init1: 1301 opt: 1330 Z-score: 763.6 bits: 150.8 E(32554): 3.3e-36 Smith-Waterman score: 1476; 47.9% identity (71.1% similar) in 484 aa overlap (1-449:43-519) 10 20 pF1KE5 MHHCKRYRSPE-PDPYLSY-RWK------- :.: :: :. : .: .:. CCDS54 PERRGSPLRGDLLGFQNVREPSSCGETLSGMRHSKRTYCPDWDDKDWDYGKWRSSSSHKR 20 30 40 50 60 70 30 40 50 60 70 pF1KE5 RRRSYSREHEG-RLRYPSRREPPPRRSRSRSHDRLPYQ-RRY-RERRDSDTYRCEERSPS :.::.: .:. : .: . . .::: .. :. ::: : :.. : :: :. CCDS54 RKRSHSSAQENKRCKYNHSKMCDSHYLESRSINEKDYHSRRYIDEYRNDYTQGCE---PG 80 90 100 110 120 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 FGEDYYGPSRSRHRRRSRERGPYRTRKHAHHCHKRRTRSCSSASSRSQQSSKRSSRSVED . . . : .: :. . : :. :. : : :.... .. .::::: CCDS54 HRQRDHESRYQNHSSKSSGRSGRSSYKSKHRIHH----STSHRRSHGKSHRRKRTRSVED 130 140 150 160 170 180 140 150 160 170 pF1KE5 DKEGHLVCRIGDWLQERYE-----------------------SQVALKIIRNVGKYREAA :.::::.:. :: :. ::: .::.::..:: .: ::: CCDS54 DEEGHLICQSGDVLSARYEIVDTLGEGAFGKVVECIDHKAGGRHVAVKIVKNVDRYCEAA 190 200 210 220 230 240 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 RLEINVLKKIKEKDKENKFLCVLMSDWFNFHGHMCIAFELLGKNTFEFLKENNFQPYPLP : ::.::.... : .. : :: : .::. :::.::.::::: .:..:.:::.: :. : CCDS54 RSEIQVLEHLNTTDPNSTFRCVQMLEWFEHHGHICIVFELLGLSTYDFIKENGFLPFRLD 250 260 270 280 290 300 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 HVRHMAYQLCHALRFLHENQLTHTDLKPENILFVNSEFETLYNEHKSCEEKSVKNTSIRV :.:.::::.:... ::: :.::::::::::::::.:.. :: . . .:... : .:.: CCDS54 HIRKMAYQICKSVNFLHSNKLTHTDLKPENILFVQSDYTEAYNPKIKRDERTLINPDIKV 310 320 330 340 350 360 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 ADFGSATFDHEHHTTIVATRHYRPPEVILELGWAQPCDVWSIGCILFEYYRGFTLFQTHE .::::::.: :::.:.:.::::: ::::: :::.::::::::::::.::: :::.: ::. CCDS54 VDFGSATYDDEHHSTLVSTRHYRAPEVILALGWSQPCDVWSIGCILIEYYLGFTVFPTHD 370 380 390 400 410 420 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 NREHLVMMEKILGPIPSHMIHRTRKQKYFYKGGLVWDENSSDGRYVKENCKPLKSYMLQD ..:::.:::.::::.:.:::..:::.:::.. : :::.:: ::::.. ::::: .::.. CCDS54 SKEHLAMMERILGPLPKHMIQKTRKRKYFHHDRLDWDEHSSAGRYVSRRCKPLKEFMLSQ 430 440 450 460 470 480 420 430 440 450 460 pF1KE5 SLEHVQLFDLMRRMLEFDPAQRITLAEALLHPFFAGLTPEERSFHTSRNPSR ..:: .::::...:::.:::.:::: ::: :::: CCDS54 DVEHERLFDLIQKMLEYDPAKRITLREALKHPFFDLLKKSI 490 500 510 520 467 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 04:04:58 2016 done: Tue Nov 8 04:04:59 2016 Total Scan time: 3.270 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]