Result of FASTA (ccds) for pFN21AE3492
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3492, 1843 aa
  1>>>pF1KE3492 1843 - 1843 aa - 1843 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.1547+/-0.00214; mu= -14.9833+/- 0.126
 mean_var=613.1507+/-129.750, 0's: 0 Z-trim(106.9): 293  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.051795
 statistics sampled from 8992 (9230) to 8992 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.284), width:  16
 Scan time:  4.450

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33203.1 CCDC88A gene_id:55704|Hs108|chr2       (1843) 11529 879.0       0
CCDS58710.1 CCDC88A gene_id:55704|Hs108|chr2       (1796) 9097 697.3 1.4e-199
CCDS46288.1 CCDC88A gene_id:55704|Hs108|chr2       (1870) 9094 697.1 1.6e-199
CCDS45151.1 CCDC88C gene_id:440193|Hs108|chr14     (2028) 5148 402.2  1e-110
CCDS8072.2 CCDC88B gene_id:283234|Hs108|chr11      (1476)  866 82.1 1.7e-14


>>CCDS33203.1 CCDC88A gene_id:55704|Hs108|chr2            (1843 aa)
 initn: 11529 init1: 11529 opt: 11529  Z-score: 4678.8  bits: 879.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 11529; 100.0% identity (100.0% similar) in 1843 aa overlap (1-1843:1-1843)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKLE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 SQRVNKKVNNDASLRMHNLSILVRQIKFYYQETLQQLIMMSLPNVLIIGKNPFSEQGTEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SQRVNKKVNNDASLRMHNLSILVRQIKFYYQETLQQLIMMSLPNVLIIGKNPFSEQGTEE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 VKKLLLLLLGCAVQCQKKEEFIERIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VKKLLLLLLGCAVQCQKKEEFIERIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 MSQEDIEPLLKNMALHLKRLIDERDEHSETIIELSEERDGLHFLPHASSSAQSPCGSPGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSQEDIEPLLKNMALHLKRLIDERDEHSETIIELSEERDGLHFLPHASSSAQSPCGSPGM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 KRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQMEIELKRLQQENMNLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQMEIELKRLQQENMNLLS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 DARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESEVSRYKERLHDIEFYKARVEELKEDNQVLLETK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESEVSRYKERLHDIEFYKARVEELKEDNQVLLETK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 TMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 QSMDESLHLGWELEQISRTSELSEAPQKSLGHEVNELTSSRLLKLEMENQSLTKTVEELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QSMDESLHLGWELEQISRTSELSEAPQKSLGHEVNELTSSRLLKLEMENQSLTKTVEELR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 TTVDSVEGNASKILKMEKENQRLSKKVEILENEIVQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TTVDSVEGNASKILKMEKENQRLSKKVEILENEIVQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 TIETLRENSERQIKILEQENEHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TIETLRENSERQIKILEQENEHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 SKLSKIEFEKRQIKKELEHYKEKGERAEELENELHHLEKENELLQKKITNLKITCEKIEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SKLSKIEFEKRQIKKELEHYKEKGERAEELENELHHLEKENELLQKKITNLKITCEKIEA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 LEQENSELERENRKLKKTLDSFKNLTFQLESLEKENSQLDEENLELRRNVESLKCASMKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LEQENSELERENRKLKKTLDSFKNLTFQLESLEKENSQLDEENLELRRNVESLKCASMKM
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 AQLQLENKELESEKEQLKKGLELLKASFKKTERLEVSYQGLDIENQRLQKTLENSNKKIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AQLQLENKELESEKEQLKKGLELLKASFKKTERLEVSYQGLDIENQRLQKTLENSNKKIQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 QLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 LRQQAEIKDTTLEENNVKIGNLEKENKTLSKEIGIYKESCVRLKELEKENKELVKRATID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LRQQAEIKDTTLEENNVKIGNLEKENKTLSKEIGIYKESCVRLKELEKENKELVKRATID
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 IKTLVTLREDLVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDDSRYKLLESK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IKTLVTLREDLVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDDSRYKLLESK
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 LESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEESTNYNQQLRQELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEESTNYNQQLRQELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSS
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 PPISGEDNKWERESQETTRELLKVKDRLIEVERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PPISGEDNKWERESQETTRELLKVKDRLIEVERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQ
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE3 AQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENE
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE3 SVIKEREDLKSLYDSLIKDHEKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKNLEVEHRDLED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SVIKEREDLKSLYDSLIKDHEKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKNLEVEHRDLED
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE3 RYNQLLKQKGQLEDLEKMLKVEQEKMLLENKNHETVAAEYKKLCGENDRLNHTYSQLLKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RYNQLLKQKGQLEDLEKMLKVEQEKMLLENKNHETVAAEYKKLCGENDRLNHTYSQLLKE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE3 TEVLQTDHKNLKSLLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TEVLQTDHKNLKSLLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE3 EEENRHLLDQIQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EEENRHLLDQIQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQ
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE3 YKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLIKSKKDINRERQKSLTLTPTRSDSSEGFLQLPHQDSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLIKSKKDINRERQKSLTLTPTRSDSSEGFLQLPHQDSQ
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE3 DSSSVGSNSLEDGQTLGTKKSSTMNDLVQSMVLAGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DSSSVGSNSLEDGQTLGTKKSSTMNDLVQSMVLAGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELG
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE3 AMAFSTTAINFSTVNSSAGFRSKQLVNNKDTTSFEDISPQGVSDDSSTGSRVHASRPASL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AMAFSTTAINFSTVNSSAGFRSKQLVNNKDTTSFEDISPQGVSDDSSTGSRVHASRPASL
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE3 DSGRTSTSNSNNNASLHEVKAGAVNNQSRPQSHSSGEFSLLHDHEAWSSSGSSPIQYLKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DSGRTSTSNSNNNASLHEVKAGAVNNQSRPQSHSSGEFSLLHDHEAWSSSGSSPIQYLKR
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE3 QTRSSPVLQHKISETLESRHHKIKTGSPGSEVVTLQQFLEESNKLTSVQIKSSSQENLLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QTRSSPVLQHKISETLESRHHKIKTGSPGSEVVTLQQFLEESNKLTSVQIKSSSQENLLD
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE3 EVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCGLARSVSGKTPGDFYDRRTTKPEFLRPGPRKTEDTYFIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCGLARSVSGKTPGDFYDRRTTKPEFLRPGPRKTEDTYFIS
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KE3 SAGKPTPGTQGKIKLVKESSLSRQSKDSNPYATLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLTKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SAGKPTPGTQGKIKLVKESSLSRQSKDSNPYATLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLTKD
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840   
pF1KE3 SRLPISVDSPPAAADSNTTAASNVDKVQESRNSKSRSREQQSS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SRLPISVDSPPAAADSNTTAASNVDKVQESRNSKSRSREQQSS
             1810      1820      1830      1840   

>>CCDS58710.1 CCDC88A gene_id:55704|Hs108|chr2            (1796 aa)
 initn: 7440 init1: 5920 opt: 9097  Z-score: 3696.8  bits: 697.3 E(32554): 1.4e-199
Smith-Waterman score: 10796; 94.4% identity (94.5% similar) in 1871 aa overlap (1-1843:1-1796)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKLE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 SQRVNKKVNNDASLRMHNLSILVRQIKFYYQETLQQLIMMSLPNVLIIGKNPFSEQGTEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SQRVNKKVNNDASLRMHNLSILVRQIKFYYQETLQQLIMMSLPNVLIIGKNPFSEQGTEE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 VKKLLLLLLGCAVQCQKKEEFIERIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VKKLLLLLLGCAVQCQKKEEFIERIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 MSQEDIEPLLKNMALHLKRLIDERDEHSETIIELSEERDGLHFLPHASSSAQSPCGSPGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSQEDIEPLLKNMALHLKRLIDERDEHSETIIELSEERDGLHFLPHASSSAQSPCGSPGM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 KRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQMEIELKRLQQENMNLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQMEIELKRLQQENMNLLS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 DARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESEVSRYKERLHDIEFYKARVEELKEDNQVLLETK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESEVSRYKERLHDIEFYKARVEELKEDNQVLLETK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 TMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 QSMDESLHLGWELEQISRTSELSEAPQKSLGHEVNELTSSRLLKLEMENQSLTKTVEELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QSMDESLHLGWELEQISRTSELSEAPQKSLGHEVNELTSSRLLKLEMENQSLTKTVEELR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 TTVDSVEGNASKILKMEKENQRLSKKVEILENEIVQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TTVDSVEGNASKILKMEKENQRLSKKVEILENEIVQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 TIETLRENSERQIKILEQENEHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TIETLRENSERQIKILEQENEHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 SKLSKIEFEKRQIKKELEHYKEKGERAEELENELHHLEKENELLQKKITNLKITCEKIEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SKLSKIEFEKRQIKKELEHYKEKGERAEELENELHHLEKENELLQKKITNLKITCEKIEA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 LEQENSELERENRKLKKTLDSFKNLTFQLESLEKENSQLDEENLELRRNVESLKCASMKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LEQENSELERENRKLKKTLDSFKNLTFQLESLEKENSQLDEENLELRRNVESLKCASMKM
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 AQLQLENKELESEKEQLKKGLELLKASFKKTERLEVSYQGLDIENQRLQKTLENSNKKIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AQLQLENKELESEKEQLKKGLELLKASFKKTERLEVSYQGLDIENQRLQKTLENSNKKIQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 QLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 LRQQAEIKDTTLEENNVKIGNLEKENKTLSKEIGIYKESCVRLKELEKENKELVKRATID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LRQQAEIKDTTLEENNVKIGNLEKENKTLSKEIGIYKESCVRLKELEKENKELVKRATID
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 IKTLVTLREDLVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDDSRYKLLESK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS58 IKTLVTLREDLVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDD-RYKLLESK
              910       920       930       940       950          

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 LESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEESTNYNQQLRQELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEESTNYNQQLRQELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSS
     960       970       980       990      1000      1010         

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 PPISGEDNKWERESQETTRELLKVKDRLIEVERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PPISGEDNKWERESQETTRELLKVKDRLIEVERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQ
    1020      1030      1040      1050      1060      1070         

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE3 AQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENE
    1080      1090      1100      1110      1120      1130         

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE3 SVIKEREDLKSLYDSLIKDHEKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKNLEVEHRDLED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SVIKEREDLKSLYDSLIKDHEKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKNLEVEHRDLED
    1140      1150      1160      1170      1180      1190         

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE3 RYNQLLKQKGQLEDLEKMLKVEQEKMLLENKNHETVAAEYKKLCGENDRLNHTYSQLLKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RYNQLLKQKGQLEDLEKMLKVEQEKMLLENKNHETVAAEYKKLCGENDRLNHTYSQLLKE
    1200      1210      1220      1230      1240      1250         

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE3 TEVLQTDHKNLKSLLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TEVLQTDHKNLKSLLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNL
    1260      1270      1280      1290      1300      1310         

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE3 EEENRHLLDQIQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EEENRHLLDQIQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQ
    1320      1330      1340      1350      1360      1370         

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE3 YKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLIKSKKDINRERQKSLTLTPTRSDSSEGFLQLPHQDSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLIKSKKDINRERQKSLTLTPTRSDSSEGFLQLPHQDSQ
    1380      1390      1400      1410      1420      1430         

             1450      1460                                  1470  
pF1KE3 DSSSVGSNSLEDGQTLGTKKSS----------------------------TMNDLVQSMV
       ::::::::::::::::::::::                            .:::::::::
CCDS58 DSSSVGSNSLEDGQTLGTKKSSMVALKRLPFLRNRPKDKDKMKACYRRSMSMNDLVQSMV
    1440      1450      1460      1470      1480      1490         

           1480      1490      1500      1510      1520      1530  
pF1KE3 LAGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINFSTVNSSAGFRSKQLVNNKDTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LAGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINFSTVNSSAGFRSKQLVNNKDTT
    1500      1510      1520      1530      1540      1550         

           1540      1550      1560      1570      1580      1590  
pF1KE3 SFEDISPQGVSDDSSTGSRVHASRPASLDSGRTSTSNSNNNASLHEVKAGAVNNQSRPQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SFEDISPQGVSDDSSTGSRVHASRPASLDSGRTSTSNSNNNASLHEVKAGAVNNQSRPQS
    1560      1570      1580      1590      1600      1610         

           1600      1610      1620      1630      1640      1650  
pF1KE3 HSSGEFSLLHDHEAWSSSGSSPIQYLKRQTRSSPVLQHKISETLESRHHKIKTGSPGSEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HSSGEFSLLHDHEAWSSSGSSPIQYLKRQTRSSPVLQHKISETLESRHHKIKTGSPGSEV
    1620      1630      1640      1650      1660      1670         

           1660      1670      1680      1690      1700      1710  
pF1KE3 VTLQQFLEESNKLTSVQIKSSSQENLLDEVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCGLARSVSGKTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::        
CCDS58 VTLQQFLEESNKLTSVQIKSSSQENLLDEVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCGLA--------
    1680      1690      1700      1710      1720      1730         

           1720      1730      1740      1750      1760      1770  
pF1KE3 GDFYDRRTTKPEFLRPGPRKTEDTYFISSAGKPTPGTQGKIKLVKESSLSRQSKDSNPYA
                                                                   
CCDS58 ------------------------------------------------------------
                                                                   

           1780      1790      1800      1810      1820      1830  
pF1KE3 TLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLTKDSRLPISVDSPPAAADSNTTAASNVDKVQESRN
             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ------SVISTAEGTTRRTSIHDFLTKDSRLPISVDSPPAAADSNTTAASNVDKVQESRN
                  1740      1750      1760      1770      1780     

           1840   
pF1KE3 SKSRSREQQSS
       :::::::::::
CCDS58 SKSRSREQQSS
        1790      

>>CCDS46288.1 CCDC88A gene_id:55704|Hs108|chr2            (1870 aa)
 initn: 8330 init1: 5920 opt: 9094  Z-score: 3695.4  bits: 697.1 E(32554): 1.6e-199
Smith-Waterman score: 11443; 98.4% identity (98.5% similar) in 1871 aa overlap (1-1843:1-1870)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKLE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 SQRVNKKVNNDASLRMHNLSILVRQIKFYYQETLQQLIMMSLPNVLIIGKNPFSEQGTEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SQRVNKKVNNDASLRMHNLSILVRQIKFYYQETLQQLIMMSLPNVLIIGKNPFSEQGTEE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 VKKLLLLLLGCAVQCQKKEEFIERIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VKKLLLLLLGCAVQCQKKEEFIERIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 MSQEDIEPLLKNMALHLKRLIDERDEHSETIIELSEERDGLHFLPHASSSAQSPCGSPGM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MSQEDIEPLLKNMALHLKRLIDERDEHSETIIELSEERDGLHFLPHASSSAQSPCGSPGM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 KRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQMEIELKRLQQENMNLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQMEIELKRLQQENMNLLS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 DARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESEVSRYKERLHDIEFYKARVEELKEDNQVLLETK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESEVSRYKERLHDIEFYKARVEELKEDNQVLLETK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 TMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 QSMDESLHLGWELEQISRTSELSEAPQKSLGHEVNELTSSRLLKLEMENQSLTKTVEELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QSMDESLHLGWELEQISRTSELSEAPQKSLGHEVNELTSSRLLKLEMENQSLTKTVEELR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 TTVDSVEGNASKILKMEKENQRLSKKVEILENEIVQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TTVDSVEGNASKILKMEKENQRLSKKVEILENEIVQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 TIETLRENSERQIKILEQENEHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TIETLRENSERQIKILEQENEHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 SKLSKIEFEKRQIKKELEHYKEKGERAEELENELHHLEKENELLQKKITNLKITCEKIEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SKLSKIEFEKRQIKKELEHYKEKGERAEELENELHHLEKENELLQKKITNLKITCEKIEA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 LEQENSELERENRKLKKTLDSFKNLTFQLESLEKENSQLDEENLELRRNVESLKCASMKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LEQENSELERENRKLKKTLDSFKNLTFQLESLEKENSQLDEENLELRRNVESLKCASMKM
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 AQLQLENKELESEKEQLKKGLELLKASFKKTERLEVSYQGLDIENQRLQKTLENSNKKIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AQLQLENKELESEKEQLKKGLELLKASFKKTERLEVSYQGLDIENQRLQKTLENSNKKIQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 QLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 LRQQAEIKDTTLEENNVKIGNLEKENKTLSKEIGIYKESCVRLKELEKENKELVKRATID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LRQQAEIKDTTLEENNVKIGNLEKENKTLSKEIGIYKESCVRLKELEKENKELVKRATID
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 IKTLVTLREDLVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDDSRYKLLESK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS46 IKTLVTLREDLVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDD-RYKLLESK
              910       920       930       940       950          

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 LESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEESTNYNQQLRQELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEESTNYNQQLRQELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSS
     960       970       980       990      1000      1010         

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 PPISGEDNKWERESQETTRELLKVKDRLIEVERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PPISGEDNKWERESQETTRELLKVKDRLIEVERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQ
    1020      1030      1040      1050      1060      1070         

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE3 AQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENE
    1080      1090      1100      1110      1120      1130         

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE3 SVIKEREDLKSLYDSLIKDHEKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKNLEVEHRDLED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SVIKEREDLKSLYDSLIKDHEKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKNLEVEHRDLED
    1140      1150      1160      1170      1180      1190         

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE3 RYNQLLKQKGQLEDLEKMLKVEQEKMLLENKNHETVAAEYKKLCGENDRLNHTYSQLLKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RYNQLLKQKGQLEDLEKMLKVEQEKMLLENKNHETVAAEYKKLCGENDRLNHTYSQLLKE
    1200      1210      1220      1230      1240      1250         

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE3 TEVLQTDHKNLKSLLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TEVLQTDHKNLKSLLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNL
    1260      1270      1280      1290      1300      1310         

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE3 EEENRHLLDQIQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EEENRHLLDQIQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQ
    1320      1330      1340      1350      1360      1370         

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE3 YKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLIKSKKDINRERQKSLTLTPTRSDSSEGFLQLPHQDSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLIKSKKDINRERQKSLTLTPTRSDSSEGFLQLPHQDSQ
    1380      1390      1400      1410      1420      1430         

             1450      1460                                  1470  
pF1KE3 DSSSVGSNSLEDGQTLGTKKSS----------------------------TMNDLVQSMV
       ::::::::::::::::::::::                            .:::::::::
CCDS46 DSSSVGSNSLEDGQTLGTKKSSMVALKRLPFLRNRPKDKDKMKACYRRSMSMNDLVQSMV
    1440      1450      1460      1470      1480      1490         

           1480      1490      1500      1510      1520      1530  
pF1KE3 LAGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINFSTVNSSAGFRSKQLVNNKDTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LAGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINFSTVNSSAGFRSKQLVNNKDTT
    1500      1510      1520      1530      1540      1550         

           1540      1550      1560      1570      1580      1590  
pF1KE3 SFEDISPQGVSDDSSTGSRVHASRPASLDSGRTSTSNSNNNASLHEVKAGAVNNQSRPQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SFEDISPQGVSDDSSTGSRVHASRPASLDSGRTSTSNSNNNASLHEVKAGAVNNQSRPQS
    1560      1570      1580      1590      1600      1610         

           1600      1610      1620      1630      1640      1650  
pF1KE3 HSSGEFSLLHDHEAWSSSGSSPIQYLKRQTRSSPVLQHKISETLESRHHKIKTGSPGSEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HSSGEFSLLHDHEAWSSSGSSPIQYLKRQTRSSPVLQHKISETLESRHHKIKTGSPGSEV
    1620      1630      1640      1650      1660      1670         

           1660      1670      1680      1690      1700      1710  
pF1KE3 VTLQQFLEESNKLTSVQIKSSSQENLLDEVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCGLARSVSGKTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VTLQQFLEESNKLTSVQIKSSSQENLLDEVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCGLARSVSGKTP
    1680      1690      1700      1710      1720      1730         

           1720      1730      1740      1750      1760      1770  
pF1KE3 GDFYDRRTTKPEFLRPGPRKTEDTYFISSAGKPTPGTQGKIKLVKESSLSRQSKDSNPYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GDFYDRRTTKPEFLRPGPRKTEDTYFISSAGKPTPGTQGKIKLVKESSLSRQSKDSNPYA
    1740      1750      1760      1770      1780      1790         

           1780      1790      1800      1810      1820      1830  
pF1KE3 TLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLTKDSRLPISVDSPPAAADSNTTAASNVDKVQESRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLTKDSRLPISVDSPPAAADSNTTAASNVDKVQESRN
    1800      1810      1820      1830      1840      1850         

           1840   
pF1KE3 SKSRSREQQSS
       :::::::::::
CCDS46 SKSRSREQQSS
    1860      1870

>>CCDS45151.1 CCDC88C gene_id:440193|Hs108|chr14          (2028 aa)
 initn: 5219 init1: 2849 opt: 5148  Z-score: 2101.4  bits: 402.2 E(32554): 1e-110
Smith-Waterman score: 5349; 48.0% identity (77.9% similar) in 1872 aa overlap (7-1838:6-1860)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKLE
             . ::: :. ::::::::::::...:.  ::  :. ::::.::::.::::.:.  
CCDS45  MDVTVSELLELFLQSPLVTWVKTFGPFGSGSQDNLTMYMDLVDGIFLNQIMLQIDPRPT
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 SQRVNKKVNNDASLRMHNLSILVRQIKFYYQETLQQLIMMSLPNVLIIGKNPFSEQGTEE
       .::.::.::::..::..::.::::.:: ::::.:::::.:.:::::.::..:.: .. ::
CCDS45 NQRINKHVNNDVNLRIQNLTILVRNIKTYYQEVLQQLIVMNLPNVLMIGRDPLSGKSMEE
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 VKKLLLLLLGCAVQCQKKEEFIERIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTD
       .::.:::.:::::::..::::::::. ::..:.:...::::::::::::::::::.:. :
CCDS45 IKKVLLLVLGCAVQCERKEEFIERIKQLDIETQAGIVAHIQEVTHNQENVFDLQWLELPD
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220           230      
pF1KE3 MSQEDIEPLLKNMALHLKRLIDERDEHSETIIELSEERDGLHFL----PHASSSAQSPCG
       .. :..: : ..:.:::.::::.::: .: :..:..::: :.      :  ::::.:  .
CCDS45 VAPEELEALSRSMVLHLRRLIDQRDECTELIVDLTQERDYLQAQHPPSPIKSSSADSTPS
     180       190       200       210       220       230         

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE3 SPGMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQMEIELKRLQQENM
         .   .:..:::.:::::.::..::.:::::.:::::.: ..:..:. .::....:::.
CCDS45 PTSSLSSEDKQHLAVELADTKARLRRVRQELEDKTEQLVDTRHEVDQLVLELQKVKQENI
     240       250       260       270       280       290         

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE3 NLLSDARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESEVSRYKERLHDIEFYKARVEELKEDNQVL
       .: .:::::: ::::::.::::: ::..:: :..: ::.:::..:::::.:::.::: .:
CCDS45 QLAADARSARAYRDELDSLREKANRVERLELELTRCKEKLHDVDFYKARMEELREDNIIL
     300       310       320       330       340       350         

        360       370       380       390       400       410      
pF1KE3 LETKTMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLE
       .:::.:::.:: ..:::.::.:::::::::::.::::.:..:: :.:.::::.::::.::
CCDS45 IETKAMLEEQLTAARARGDKVHELEKENLQLKSKLHDLELDRDTDKKRIEELLEENMVLE
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pF1KE3 MAQKQSMDESLHLGWELEQISRTSELSEAPQKSLGHEVNELTSSRLLKLEMENQSLTKTV
       .::::::.:: ::::::::.:....::.: .::.  :.:: .:::.:::: ::::: .:.
CCDS45 IAQKQSMNESAHLGWELEQLSKNADLSDASRKSFVFELNECASSRILKLEKENQSLQSTI
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pF1KE3 EELRTTVDSVEGNASKILKMEKENQRLSKKVEILENEIVQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKA
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CCDS45 QGLRDASLVLEESGLKCGELEKENHQLSKKIEKLQTQLEREKQSNQDLETLSEELIREKE
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pF1KE3 QLEKTIETLRENSERQIKILEQENEHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESI
       ::.. .:::. .. :::: ::::..:::... :::.:::.:.:::.::.::::: ::...
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        :...:::..::::::....::. ::::::::.:: ::..:..::  : .:.:.:. . :
CCDS45 TEANGKLSQLEFEKRQLHRDLEQAKEKGERAEKLERELQRLQEENGRLARKVTSLETATE
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       :.::::.:.. :. ::: :.:.::...:...:::.::..:.::: ::::::: ::... .
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CCDS45 STKLAQMERENQQLEREKEELRKNVDLLKALGKKSERLELSYQSVSAENLRLQQSLESSS
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CCDS45 HKTQTLESELGELEAERQALRRDLEALRLANAQLEGAEKDRKALEQEVAQLEKDKKLLEK
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CCDS45 EAKRLWQQVELKDAVLDDSTAKLSAVEKESRALDKELARCRDAAGKLKELEKDNRDLTKQ
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CCDS45 VTVHARTLTTLREDLVLEKLKSQQLSSELDKLSQELEKVGLNRELLLQEDDSGSDTKYKI
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CCDS45 LEGRNESALKTTLAMKEEKIVLLEAQMEEKASLNRQLESELQMLKKECETLRQNQGEGQH
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CCDS45 LQNSFKHPAGKTAASHQGKEAWGPGHKEATMELLRVKDRAIELERNNAALQAEKQLLKEQ
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CCDS45 LQHLETQNVTFSSQILTLQKQSAFLQEHNTTLQTQTAKLQVENSTLSSQSAALTAQYTLL
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CCDS45 HKEKLEEKIMDQYKFYDP-PPKKKNHWIGAKALVKLIKPKKEGSRERLKSTVDSPPWQLE
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pF1KE3 RSDSSEGFLQLP---HQDSQDSSSVGSNSLEDGQTLGTKKSSTMNDLVQSMVLAGQWTGS
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CCDS45 SSDPASPAASQPLRSQAENPDTPALGSNCAEERDAHNGSVGKGPGDLKPKR--GSPHRGS
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pF1KE3 VTLQQFLEESNKLTSVQIKSSSQENLLDEVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCGLARSVSGKTP
       :::..::::::. . ..   : ...::.. ... :    . :.  :     :.. ..: :
CCDS45 VTLEEFLEESNRSSPTHDTPSCRDDLLSDYFRKASDPPAIGGQPGPP----AKKEGAKMP
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pF1KE3 GDFYDRR------TTKPEFLRPGPRKTEDTYFISSAGKPTPGTQGKIKLVKESSLSRQSK
        .:          :.. . :.:: . .. .. .. :  :   .  . .  .  ::.:  .
CCDS45 TNFVAPTVKMAAPTSEGRPLKPG-QYVKPNFRLTEAEAPPSVAPRQAQPPQSLSLGRPRQ
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pF1KE3 DSNP---YATLPRASSV---ISTAEGTTRRTSIHDFLTKDSRLPISVDSPPAAADSNTTA
          :   .:   :..:.   .: : .   :.:  .   ..:  : .. .: : .  .: .
CCDS45 APVPPASHAPASRSASLSRAFSLASADLLRASGPEACKQES--PQKLGAPEALGGRETGS
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        .  . .  : .: .: :                                          
CCDS45 HTLQSPAPPSSHSLARERTPLVGKAGSSCQGPGPRSRPLDTRRFSLAPPKEERLAPLHQS
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>>CCDS8072.2 CCDC88B gene_id:283234|Hs108|chr11           (1476 aa)
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pF1KE3 MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAA----GNGTNLDE-----------YVALVDG
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CCDS80  MEGGKGPRLRDFLSGSLATWALGLAGLVGEAEDSEGEEEEEEEEPPLWLEKRFLRLSDG
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CCDS80 LQTLGFDPLSEEAVEQLEGVLRLLLGASVQCEHRELFIRHIQGLSLEVQSELAAAIQEVT
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CCDS80 QPGAGVVLALSGPDPGELAPAELEMLSRSLMGTLSKLARERDLGAQRLAELLLEREPLCL
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pF1KE3 LPHASSSAQSPCGSPGMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQ
        :.: : :  :  .:.       .::...::.:::..::::::::::.: ::: . :.. 
CCDS80 RPEAPSRA--PAEGPS-------HHLALQLANAKAQLRRLRQELEEKAELLLDSQAEVQG
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pF1KE3 MEIELKRLQQENMNLLSDARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESEVSRYKERLHDIEFYK
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CCDS80 LEAEIRRLRQEAQALSGQAKRAELYREEAEALRERAGRLPRLQEELRRCRERLQAAEAYK
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pF1KE3 ARVEELKEDNQVLLETKTMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRK
       ...:: .  . ::  .:..::.:::..: :  .::: ..::: :...: . . : :  :.
CCDS80 SQLEEERVLSGVLEASKALLEEQLEAARERCARLHETQRENLLLRTRLGEAHAELDSLRH
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pF1KE3 KIEELMEENMTLEMAQKQSMDESLHLGWELEQISRTSELSEAPQKSLGHEVNELTSSRLL
       ....: :::. ::.  ..:..       :    .       ::  ::  :: :  ..:: 
CCDS80 QVDQLAEENVELELELQRSLEPPPGSPGEAPLAG------AAP--SLQDEVREAEAGRLR
              420       430       440               450       460  

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pF1KE3 KLEMENQSLTKTVEELRTTVDSVEGNASKILKMEKENQRLSKKVEILENEIVQEKQSLQN
        :: ::. :   .. :.       :.   .:.  .:.  :    :  .. .. . .: :.
CCDS80 TLERENRELRGLLQVLQGQ----PGGQHPLLEAPREDPVLPVLEEAPQTPVAFD-HSPQG
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pF1KE3 CQNLSKDLMKEKAQLEK-TIETLRENSERQIKILE---QENEHLNQTVSSLRQRSQISAE
         . ..:   .  .:   ..... : : .  .  .   :: :   :...   : :. : .
CCDS80 LVQKARDGGPQALDLAPPALDSVLEASAECPQAPDSDPQEAESPLQAAAMDPQASDWSPQ
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pF1KE3 AR---VKDIEKENKILHESIKETSSKLSKIEFEKRQIKK-ELEHYKEKGERAE--ELENE
            :.  :. .:  ..:  .. ....  .    .:.  .:   . .:..:   ::  :
CCDS80 ESGSPVETQESPEKAGRRSSLQSPASVAPPQGPGTKIQAPQLLGGETEGREAPQGELVPE
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pF1KE3 LHHLEKENELLQKKITNLKITCEKIEALEQENSELERENRKLK-KTLDSFKNLTFQLESL
          :..:.   ..:    . .  ..:  :  :. :.  . . . .  :.  . : .  . 
CCDS80 AWGLRQEGP--EHKPGPSEPSSVQLEEQEGPNQGLDLATGQAEAREHDQRLEGTVRDPAW
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pF1KE3 EKENSQLDEENLELRRNVESLKCASMKMAQLQLENKELESEKEQLKKGLELLKASFKKTE
       .: . : .:  ::..  :      . ..:.   :.. :. :  ::..  : :   ..   
CCDS80 QKPQ-QKSEGALEVQ--VWEGPIPGESLASGVAEQEALREEVAQLRRKAEALGDELEAQA
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pF1KE3 RLEVSYQGLDIENQRLQKTLENSNKKIQQLESELQDLEMENQTLQKNLEELKISSKRLEQ
       :   . .. . :  ::.: : .. .   . . : .    :.  :.. .:    ....::.
CCDS80 R---KLEAQNTEAARLSKELAQARRAEAEAHREAEAQAWEQARLREAVE---AAGQELES
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pF1KE3 LEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKRLRQQAEIKDTTLEENNVKIGNLEKENKTLSKE
         .: ..: .  .   ....: :.:..::: :.:    . ::   ..  ::.:..     
CCDS80 ASQEREALVEALAAAGRERRQWEREGSRLRAQSE----AAEE---RMQVLESEGRQ----
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pF1KE3 IGIYKESCVRLKELEKENKELVKRATIDIKTLVTLREDLVSEKLKTQQMNNDLEKLTHEL
                .:.: :.: .:  :.:         :. .: .  .. ..... ::.: .::
CCDS80 ---------HLEEAERERRE--KEA---------LQAELEKAVVRGKELGDRLEHLQREL
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pF1KE3 EKIGLNKERLLHDEQSTDDSRYKLLESKLESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEESTNYNQQ
       :. .:.....:....: . .::. ::..::. :. .   ::: .  :..:         :
CCDS80 EQAALERQEFLREKES-QHQRYQGLEQRLEAELQAAATSKEEALMELKTR-------ALQ
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pF1KE3 LRQELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSSPPISGEDNKWERESQETTRELLKVKDRLIEVE
       :..::  ....  .:  ..  :      : .         :.:..         ::::::
CCDS80 LEEELFQLRQGPAGLGPKKRAE------PQLV--------ETQNV---------RLIEVE
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pF1KE3 RNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQAQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENS
       :.:: : ::: ::. ::..:: : ..::..      : . :: : .  : ....::.:.:
CCDS80 RSNAMLVAEKAALQGQLQHLEGQLGSLQGRA-----QELLLQSQRA--QEHSSRLQAEKS
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pF1KE3 TLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENESVIKEREDLKSLYDSLIKDHEKLELLHERQAS
       .:. :.  :   . .: .    ::.: ... . .:. ..  ..:..::. :  :..:: .
CCDS80 VLEIQGQEL---HRKLEV----LEEEVRAARQSQEETRGQQQALLRDHKALAQLQRRQEA
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pF1KE3 EYESLISKHGTLKSAHKNLEVEHRDLEDRYNQLLKQKGQLEDLEKMLKVEQEKMLLENKN
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CCDS80 ELEGLLVRHRDLKANMRALELAHRELQGRHEQLQAQRASVEAQEVALLAERERLMQDGHR
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pF1KE3 HETVAAEYKKLCGENDRLNHTYSQLLKETEVLQTDHKNLKSLLNNSKLEQTRLEAEFSKL
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CCDS80 QRGLEEELRRLQSEHDRAQMLLAELSRERGELQGERGELRGRLARLELERAQLEMQSQQL
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CCDS80 RESNQQLDLSACRLTTQCELLTQLRSAQEEENRQLLAEVQALSRENRELLERSLESRDHL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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