FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1167, 598 aa 1>>>pF1KE1167 598 - 598 aa - 598 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1218+/-0.000994; mu= 10.9135+/- 0.060 mean_var=121.0832+/-23.903, 0's: 0 Z-trim(108.5): 40 B-trim: 95 in 2/48 Lambda= 0.116555 statistics sampled from 10212 (10250) to 10212 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.315), width: 16 Scan time: 2.770 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4491.2 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 ( 544) 3512 602.0 6.4e-172 CCDS47364.1 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 ( 412) 2694 464.4 1.3e-130 CCDS35487.1 CDY1B gene_id:253175|Hs108|chrY ( 540) 2288 396.2 5.8e-110 CCDS14802.1 CDY1 gene_id:9085|Hs108|chrY ( 540) 2288 396.2 5.8e-110 CCDS14789.1 CDY2A gene_id:9426|Hs108|chrY ( 541) 2285 395.7 8.2e-110 CCDS35473.1 CDY2B gene_id:203611|Hs108|chrY ( 541) 2285 395.7 8.2e-110 CCDS35486.1 CDY1B gene_id:253175|Hs108|chrY ( 554) 2245 388.9 8.9e-108 CCDS14801.1 CDY1 gene_id:9085|Hs108|chrY ( 554) 2245 388.9 8.9e-108 CCDS32493.1 CDYL2 gene_id:124359|Hs108|chr16 ( 506) 1327 234.6 2.4e-61 CCDS4490.1 ECI2 gene_id:10455|Hs108|chr6 ( 364) 645 119.8 6.2e-27 CCDS43420.2 ECI2 gene_id:10455|Hs108|chr6 ( 394) 645 119.8 6.6e-27 >>CCDS4491.2 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 (544 aa) initn: 3512 init1: 3512 opt: 3512 Z-score: 3200.0 bits: 602.0 E(32554): 6.4e-172 Smith-Waterman score: 3512; 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CCDS32 TWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHMSKDK-----RIKSGKQSSTSKLLRDSRGPSVEKLSHR 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KE1 ALVIGKDHESKNSQLFAASQKFRKNTAPSLSSRKNMDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVDG :: ::.. :.: :: : :.. :. .: . . :. ::. .: CCDS32 PSDPGK---SKGT-----SHK-RKRINPPLAKPKKGYSGKPSSGGDRATKTVSYRTTPSG 100 110 120 130 140 220 230 240 250 260 270 pF1KE1 FQSESPEKLDPVEQGQEDTVAPEVAAEKPVGALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPGPV .: . :....:. ....:: .: :... . .. : : CCDS32 LQ------IMPLKKSQNGMENGDAGSEKDE-RHFGNGSHQPGLDLNDHVGE---QDMGEC 150 160 170 180 190 280 290 300 310 320 330 pF1KE1 TAAMATGLAVNGKGTSPFMDALTANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLHFS . :: :: :: :. ::: :: :... : ::: .. ..: :::::..: CCDS32 DVNHAT-LAENGLGS-----ALT-NGGLNLHSPV------KRK-LEAEKDYVFDKRLRYS 200 210 220 230 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 VRQTESAYRYRDIVVRKQDGFTHILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKLVL :::.:: :.:::::::..::::::::...:.::.:.::.:.::. :: .::.:::::.: CCDS32 VRQNESNCRFRDIVVRKEEGFTHILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLL 240 250 260 270 280 290 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 LSAVGSVFCCGLDFIYFIRRLTDDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIG ::::::::: :::. :.: ::..::..:::..:::::.::..::::::::.::.::::.: CCDS32 LSAVGSVFCSGLDYSYLIGRLSSDRRKESTRIAEAIRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALG 300 310 320 330 340 350 460 470 480 490 500 510 pF1KE1 LGASILPLCDVVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKLTA ::::::::::.:::.:::::::::.:. .: :::. ::.:.: : :::::. :::::: CCDS32 LGASILPLCDIVWASEKAWFQTPYATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTA 360 370 380 390 400 410 520 530 540 550 560 570 pF1KE1 QEACGKGLVSQVFWPGTFTQEVMVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANEREC ::::..::::::::: ::.::::.:.::.:::. ::::::: ::: .: ::..::.:: CCDS32 QEACSRGLVSQVFWPTTFSQEVMLRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKEC 420 430 440 450 460 470 580 590 pF1KE1 EVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQRKIDEF .::..:.:..:.::...::: :: : CCDS32 LMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQDKIYEV 480 490 500 >>CCDS4490.1 ECI2 gene_id:10455|Hs108|chr6 (364 aa) initn: 612 init1: 612 opt: 645 Z-score: 597.1 bits: 119.8 E(32554): 6.2e-27 Smith-Waterman score: 645; 39.0% identity (76.4% similar) in 254 aa overlap (341-594:109-361) 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 SKRKFIDDRRDQPFDKRLHFSVRQTESAYRYRDIVVRKQDGFTHILLSTKSSENNSLNPE .. .:: ..::.:.:... . ...:..: : CCDS44 QNYVDLVSSLSPSLESSSQVEPGTDRKSTGFETLVVTSEDGITKIMFN-RPKKKNAINTE 80 90 100 110 120 130 380 390 400 410 420 430 pF1KE1 VMREVQSALSTAAADDSKLVLLSAVGSVFCCGLDFIYFIRRLTDDRKRESTKMAEAIRNF ...:.. ::..:. ::: ...:.. :. . : :. : .... . : .:.: CCDS44 MYHEIMRALKAASKDDSIITVLTGNGDYYSSGNDLTNFTDIPPGGVEEKAKNNAVLLREF 140 150 160 170 180 190 440 450 460 470 480 490 pF1KE1 VNTFIQFKKPIIVAVNGPAIGLGASILPLCDVVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSTVMF :. ::.: ::.:..:::::.:.....: : :.:.:...: :.::.. .::::.:::. : CCDS44 VGCFIDFPKPLIAVVNGPAVGISVTLLGLFDAVYASDRATFHTPFSHLGQSPEGCSSYTF 200 210 220 230 240 250 500 510 520 530 540 550 pF1KE1 PKIMGGASANEMLLSGRKLTAQEACGKGLVSQVFWPGTFTQEVMVRIKELASCNPVVLEE ::::. :.:.:::. :.:::: :::..:::..:: .:: .:: .:.: .:. : .:. CCDS44 PKIMSPAKATEMLIFGKKLTAGEACAQGLVTEVFPDSTFQKEVWTRLKAFAKLPPNALRI 260 270 280 290 300 310 560 570 580 590 pF1KE1 SKALVRCNMKMELEQANERECEVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQRKIDEF :: ..: . .:. .: .::.::. : : . ......:.:: CCDS44 SKEVIRKREREKLHAVNAEECNVLQGRWLSDECTNAVVNFLSRKSKL 320 330 340 350 360 598 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 02:19:51 2016 done: Tue Nov 8 02:19:52 2016 Total Scan time: 2.770 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]