FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5588, 377 aa 1>>>pF1KE5588 377 - 377 aa - 377 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2134+/-0.000341; mu= 17.3520+/- 0.021 mean_var=69.2104+/-14.314, 0's: 0 Z-trim(114.5): 33 B-trim: 32 in 1/53 Lambda= 0.154166 statistics sampled from 24339 (24372) to 24339 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16 Scan time: 7.650 The best scores are: opt bits E(85289) NP_536356 (OMIM: 608535) actin-related protein T2 ( 377) 2531 571.9 8.1e-163 NP_612146 (OMIM: 300487) actin-related protein T1 ( 376) 1923 436.7 4.1e-122 NP_001092 (OMIM: 102630,243310,607371,608578) acti ( 375) 1241 285.0 1.9e-76 NP_001605 (OMIM: 102560,604717,614583) actin, cyto ( 375) 1238 284.4 3e-76 NP_001186883 (OMIM: 102560,604717,614583) actin, c ( 375) 1238 284.4 3e-76 NP_001604 (OMIM: 102620,611788,613834,614042) acti ( 377) 1235 283.7 4.8e-76 NP_001307784 (OMIM: 102620,611788,613834,614042) a ( 377) 1235 283.7 4.8e-76 NP_001135417 (OMIM: 102620,611788,613834,614042) a ( 377) 1235 283.7 4.8e-76 NP_001606 (OMIM: 102545) actin, gamma-enteric smoo ( 376) 1226 281.7 1.9e-75 NP_001091 (OMIM: 102610,161800,255310,616852) acti ( 377) 1215 279.3 1e-74 NP_005150 (OMIM: 102540,612098,612794,613424) acti ( 377) 1214 279.0 1.2e-74 NP_001017992 (OMIM: 614835) beta-actin-like protei ( 376) 1213 278.8 1.4e-74 NP_115876 (OMIM: 608534) actin-related protein T3 ( 372) 1182 271.9 1.7e-72 XP_016859649 (OMIM: 608914) PREDICTED: POTE ankyri ( 657) 1164 268.1 4.3e-71 XP_011509518 (OMIM: 608914) PREDICTED: POTE ankyri ( 957) 1164 268.2 5.8e-71 XP_016859648 (OMIM: 608914) PREDICTED: POTE ankyri ( 967) 1164 268.2 5.8e-71 NP_001077007 (OMIM: 608914) POTE ankyrin domain fa (1075) 1164 268.2 6.3e-71 XP_016859650 (OMIM: 608914) PREDICTED: POTE ankyri (1075) 1164 268.2 6.3e-71 NP_005726 (OMIM: 605144) beta-centractin [Homo sap ( 376) 1046 241.7 2.2e-63 NP_005727 (OMIM: 605143) alpha-centractin [Homo sa ( 376) 1036 239.4 1e-62 NP_001186822 (OMIM: 102545) actin, gamma-enteric s ( 333) 984 227.8 2.8e-59 XP_016858605 (OMIM: 605144) PREDICTED: beta-centra ( 332) 962 222.9 8.2e-58 NP_006677 (OMIM: 604304) actin-like protein 7B [Ho ( 415) 943 218.8 1.8e-56 XP_005263911 (OMIM: 605144) PREDICTED: beta-centra ( 302) 931 216.0 9.1e-56 NP_006678 (OMIM: 604303) actin-like protein 7A [Ho ( 435) 913 212.1 2e-54 NP_005713 (OMIM: 604221) actin-related protein 2 i ( 394) 806 188.3 2.6e-47 NP_001005386 (OMIM: 604221) actin-related protein ( 399) 797 186.3 1.1e-46 NP_005712 (OMIM: 604222) actin-related protein 3 i ( 418) 453 109.8 1.2e-23 NP_001264069 (OMIM: 604222) actin-related protein ( 367) 392 96.2 1.3e-19 NP_057272 (OMIM: 612458) actin-like protein 6B [Ho ( 426) 345 85.8 2.1e-16 NP_829888 (OMIM: 604958) actin-like protein 6A iso ( 387) 315 79.1 1.9e-14 NP_817126 (OMIM: 604958) actin-like protein 6A iso ( 387) 315 79.1 1.9e-14 NP_004292 (OMIM: 604958) actin-like protein 6A iso ( 429) 315 79.1 2.1e-14 >>NP_536356 (OMIM: 608535) actin-related protein T2 [Hom (377 aa) initn: 2531 init1: 2531 opt: 2531 Z-score: 3044.1 bits: 571.9 E(85289): 8.1e-163 Smith-Waterman score: 2531; 100.0% identity (100.0% similar) in 377 aa overlap (1-377:1-377) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_536 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_536 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_536 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSRRPEEVLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_536 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSRRPEEVLR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 EYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGEIV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_536 EYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGEIV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 LSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMWVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_536 LSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMWVT 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 AADFKEFGTSVVQRRCF ::::::::::::::::: NP_536 AADFKEFGTSVVQRRCF 370 >>NP_612146 (OMIM: 300487) actin-related protein T1 [Hom (376 aa) initn: 1644 init1: 1644 opt: 1923 Z-score: 2313.2 bits: 436.7 E(85289): 4.1e-122 Smith-Waterman score: 1923; 75.3% identity (91.8% similar) in 377 aa overlap (1-377:1-376) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE :::::::: ::::::::::.::::::::.::::..::..:: ::..: :. ::: ::::. NP_612 MFNPHALDVPAVIFDNGSGLCKAGLSGEIGPRHVISSVLGHCKFNVPLARLNQK-YFVGQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR ::::: :::.:: :.::::.:::::.:.::::::: :::::::.::.: ::::::::: : NP_612 EALYKYEALHLHYPIERGLVTGWDDMEKLWKHLFERELGVKPSQQPVLMTEPSLNPREIR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT ::.::.:::.:.::.::::..:: :::::::::::::::::.:::::::::::::::::: NP_612 EKLAEMMFETFSVPGFYLSNHAVAALYASACVTGLVVDSGDGVTCTVPIFEGYSLPHAVT 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSRRPEEVLR :: .::::::: : .::.::: .::: :.:..:..::.::::.:::::::: . ::: NP_612 KLCMAGRDITEHLTRLLFASGFNFPCILNKAVVNNIKEKLCYIALEPEKELRKSRGEVLG 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 EYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGEIV :.::::..: .:: :.:.::.::.:.::: .:::::.:::::: :::::::. :...:: NP_612 AYRLPDGHVIHFGDELYQVPEVLFAPDQLGIHSPGLSKMVSSSIMKCDTDIQNKLYADIV 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 LSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMWVT :::::::. ::..::.::.:::::: ::::::: ::: ::.::::::.::.::::::::: NP_612 LSGGTTLLPGLEERLMKEVEQLASKGTPIKITASPDRCFSAWIGASIMTSMSSFKQMWVT 300 310 320 330 340 350 370 pF1KE5 AADFKEFGTSVVQRRCF .:::::.:::::::::: NP_612 SADFKEYGTSVVQRRCF 360 370 >>NP_001092 (OMIM: 102630,243310,607371,608578) actin, c (375 aa) initn: 1248 init1: 782 opt: 1241 Z-score: 1493.5 bits: 285.0 E(85289): 1.9e-76 Smith-Waterman score: 1241; 48.7% identity (76.9% similar) in 372 aa overlap (8-377:4-375) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE : :.. :::::.::::..:. .:: . ::::. . :. . .:: .::. NP_001 MDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :: :. : :. :.:.:..:.:::.:..:.: : :: : : ..:.: :: :::. :: NP_001 EAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::...:::.:..::.:.. ::::.::::. .::.:.::::.:: ::::.:::.::::. NP_001 EKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAIL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSR--RPEEV .: .::::.:. ::..: :..: .. .: :::.:::::::. :.:.. . NP_001 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LREYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGE . :.::::..:..:. . ::::: :. :: .: :. . . .:: :::.::.: :... NP_001 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IVLSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMW :::::::.. :. ::. ::. :: . ::: :::.: .:.:::.::..:::.:.::: NP_001 TVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMW 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VTAADFKEFGTSVVQRRCF .. .. : : :.:.:.:: NP_001 ISKQEYDESGPSIVHRKCF 360 370 >>NP_001605 (OMIM: 102560,604717,614583) actin, cytoplas (375 aa) initn: 1245 init1: 779 opt: 1238 Z-score: 1489.9 bits: 284.4 E(85289): 3e-76 Smith-Waterman score: 1238; 48.8% identity (77.5% similar) in 369 aa overlap (11-377:7-375) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE :...:::::.::::..:. .:: . ::::. . :. . .:: .::. NP_001 MEEEIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :: :. : :. :.:.:..:.:::.:..:.: : :: : : ..:.: :: :::. :: NP_001 EAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::...:::.:..::.:.. ::::.::::. .::.:.::::.:: ::::.:::.::::. NP_001 EKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAIL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSR--RPEEV .: .::::.:. ::..: :..: .. .: :::.:::::::. :.:.. . NP_001 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LREYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGE . :.::::..:..:. . ::::: :. :: .: :. . . .:: :::.::.: :... NP_001 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IVLSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMW :::::::.. :. ::. ::. :: . ::: :::.: .:.:::.::..:::.:.::: NP_001 TVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMW 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VTAADFKEFGTSVVQRRCF .. .. : : :.:.:.:: NP_001 ISKQEYDESGPSIVHRKCF 360 370 >>NP_001186883 (OMIM: 102560,604717,614583) actin, cytop (375 aa) initn: 1245 init1: 779 opt: 1238 Z-score: 1489.9 bits: 284.4 E(85289): 3e-76 Smith-Waterman score: 1238; 48.8% identity (77.5% similar) in 369 aa overlap (11-377:7-375) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE :...:::::.::::..:. .:: . ::::. . :. . .:: .::. NP_001 MEEEIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :: :. : :. :.:.:..:.:::.:..:.: : :: : : ..:.: :: :::. :: NP_001 EAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::...:::.:..::.:.. ::::.::::. .::.:.::::.:: ::::.:::.::::. NP_001 EKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAIL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSR--RPEEV .: .::::.:. ::..: :..: .. .: :::.:::::::. :.:.. . NP_001 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LREYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGE . :.::::..:..:. . ::::: :. :: .: :. . . .:: :::.::.: :... NP_001 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IVLSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMW :::::::.. :. ::. ::. :: . ::: :::.: .:.:::.::..:::.:.::: NP_001 TVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMW 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VTAADFKEFGTSVVQRRCF .. .. : : :.:.:.:: NP_001 ISKQEYDESGPSIVHRKCF 360 370 >>NP_001604 (OMIM: 102620,611788,613834,614042) actin, a (377 aa) initn: 1242 init1: 783 opt: 1235 Z-score: 1486.2 bits: 283.7 E(85289): 4.8e-76 Smith-Waterman score: 1235; 48.7% identity (76.6% similar) in 372 aa overlap (8-377:6-377) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE :: :.. :::::.::::..:. .:: . ::::. . :. . .:: .::. NP_001 MCEEEDSTALVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :: :. : :. :.:.:.::.:::.:..:.: : :: : : ..: : :: :::. :: NP_001 EAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHSFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::...:::.:.:::.:.. ::::.::::. .::.:.::::.:: .:::.:::.::::. NP_001 EKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIM 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSR--RPEEV .: .::::.:. ::..: :..: .. .: :::.:::::::. :.:.. . NP_001 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LREYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGE . :.::::..:..:. . ::.:: :. .: .: :. . . .:: ::: ::.: :... NP_001 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IVLSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMW :::::::.. :. ::. ::. :: . ::: :::.: .:.:::.::..:::.:.::: NP_001 NVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMW 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VTAADFKEFGTSVVQRRCF .. .. : : :.:.:.:: NP_001 ISKQEYDEAGPSIVHRKCF 360 370 >>NP_001307784 (OMIM: 102620,611788,613834,614042) actin (377 aa) initn: 1242 init1: 783 opt: 1235 Z-score: 1486.2 bits: 283.7 E(85289): 4.8e-76 Smith-Waterman score: 1235; 48.7% identity (76.6% similar) in 372 aa overlap (8-377:6-377) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE :: :.. :::::.::::..:. .:: . ::::. . :. . .:: .::. NP_001 MCEEEDSTALVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :: :. : :. :.:.:.::.:::.:..:.: : :: : : ..: : :: :::. :: NP_001 EAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHSFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::...:::.:.:::.:.. ::::.::::. .::.:.::::.:: .:::.:::.::::. NP_001 EKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIM 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSR--RPEEV .: .::::.:. ::..: :..: .. .: :::.:::::::. :.:.. . NP_001 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LREYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGE . :.::::..:..:. . ::.:: :. .: .: :. . . .:: ::: ::.: :... NP_001 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IVLSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMW :::::::.. :. ::. ::. :: . ::: :::.: .:.:::.::..:::.:.::: NP_001 NVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMW 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VTAADFKEFGTSVVQRRCF .. .. : : :.:.:.:: NP_001 ISKQEYDEAGPSIVHRKCF 360 370 >>NP_001135417 (OMIM: 102620,611788,613834,614042) actin (377 aa) initn: 1242 init1: 783 opt: 1235 Z-score: 1486.2 bits: 283.7 E(85289): 4.8e-76 Smith-Waterman score: 1235; 48.7% identity (76.6% similar) in 372 aa overlap (8-377:6-377) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE :: :.. :::::.::::..:. .:: . ::::. . :. . .:: .::. NP_001 MCEEEDSTALVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :: :. : :. :.:.:.::.:::.:..:.: : :: : : ..: : :: :::. :: NP_001 EAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHSFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::...:::.:.:::.:.. ::::.::::. .::.:.::::.:: .:::.:::.::::. NP_001 EKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIM 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSR--RPEEV .: .::::.:. ::..: :..: .. .: :::.:::::::. :.:.. . NP_001 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LREYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGE . :.::::..:..:. . ::.:: :. .: .: :. . . .:: ::: ::.: :... NP_001 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IVLSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMW :::::::.. :. ::. ::. :: . ::: :::.: .:.:::.::..:::.:.::: NP_001 NVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMW 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VTAADFKEFGTSVVQRRCF .. .. : : :.:.:.:: NP_001 ISKQEYDEAGPSIVHRKCF 360 370 >>NP_001606 (OMIM: 102545) actin, gamma-enteric smooth m (376 aa) initn: 1233 init1: 774 opt: 1226 Z-score: 1475.4 bits: 281.7 E(85289): 1.9e-75 Smith-Waterman score: 1226; 48.1% identity (76.6% similar) in 372 aa overlap (8-377:5-376) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE .. :.. :::::.::::..:. .:: . ::::. . :. . .:: .::. NP_001 MCEEETTALVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :: :. : :. :.:.:.::.:::.:..:.: : :: : : ..: : :: :::. :: NP_001 EAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHSFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::...:::.:.:::.:.. ::::.::::. .::.:.::::.:: .:::.:::.::::. NP_001 EKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIM 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSR--RPEEV .: .::::.:. ::..: :..: .. .: :::.:::::::. :.:.. . NP_001 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LREYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGE . :.::::..:..:. . ::.:: :. .: .: :. . . .:: ::: ::.: :... NP_001 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IVLSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMW :::::::.. :. ::. ::. :: . ::: :::.: .:.:::.::..:::.:.::: NP_001 NVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMW 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VTAADFKEFGTSVVQRRCF .. .. : : :.:.:.:: NP_001 ISKPEYDEAGPSIVHRKCF 360 370 >>NP_001091 (OMIM: 102610,161800,255310,616852) actin, a (377 aa) initn: 1222 init1: 762 opt: 1215 Z-score: 1462.2 bits: 279.3 E(85289): 1e-74 Smith-Waterman score: 1215; 47.8% identity (76.3% similar) in 372 aa overlap (8-377:6-377) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE .. :.. :::::. :::..:. .:: . ::::. . :. . .:: .::. NP_001 MCDEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :: :. : :. :.:.:.::.:::.:..:.: : :: : : ..: : :: :::. :: NP_001 EAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::...:::.:.:::.:.. ::::.::::. .::.:.::::.:: .:::.:::.::::. NP_001 EKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIM 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSR--RPEEV .: .::::.:. ::..: :..: .. .: :::.:::::::. :.:.. . NP_001 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LREYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGE . :.::::..:..:. . ::.:: :. .: .: :. . . .:: ::: ::.: :... NP_001 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IVLSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMW :.:::::.. :. ::. ::. :: . ::: :::.: .:.:::.::..:::.:.::: NP_001 NVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMW 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VTAADFKEFGTSVVQRRCF .: .. : : :.:.:.:: NP_001 ITKQEYDEAGPSIVHRKCF 360 370 377 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 02:05:42 2016 done: Tue Nov 8 02:05:44 2016 Total Scan time: 7.650 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]