FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5588, 377 aa 1>>>pF1KE5588 377 - 377 aa - 377 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4904+/-0.000822; mu= 15.9647+/- 0.049 mean_var=68.2965+/-13.766, 0's: 0 Z-trim(107.3): 36 B-trim: 2 in 1/50 Lambda= 0.155194 statistics sampled from 9438 (9474) to 9438 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16 Scan time: 2.700 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS45.1 ACTRT2 gene_id:140625|Hs108|chr1 ( 377) 2531 575.5 2.6e-164 CCDS14611.1 ACTRT1 gene_id:139741|Hs108|chrX ( 376) 1923 439.4 2.4e-123 CCDS5341.1 ACTB gene_id:60|Hs108|chr7 ( 375) 1241 286.7 2.2e-77 CCDS11782.1 ACTG1 gene_id:71|Hs108|chr17 ( 375) 1238 286.0 3.6e-77 CCDS7392.1 ACTA2 gene_id:59|Hs108|chr10 ( 377) 1235 285.4 5.7e-77 CCDS1930.1 ACTG2 gene_id:72|Hs108|chr2 ( 376) 1226 283.4 2.3e-76 CCDS1578.1 ACTA1 gene_id:58|Hs108|chr1 ( 377) 1215 280.9 1.3e-75 CCDS10041.1 ACTC1 gene_id:70|Hs108|chr15 ( 377) 1214 280.7 1.5e-75 CCDS34163.1 ACTBL2 gene_id:345651|Hs108|chr5 ( 376) 1213 280.5 1.7e-75 CCDS3206.1 ACTRT3 gene_id:84517|Hs108|chr3 ( 372) 1182 273.5 2.1e-73 CCDS59431.1 POTEI gene_id:653269|Hs108|chr2 (1075) 1171 271.3 2.9e-72 CCDS46409.1 POTEF gene_id:728378|Hs108|chr2 (1075) 1168 270.6 4.6e-72 CCDS46414.1 POTEE gene_id:445582|Hs108|chr2 (1075) 1164 269.7 8.5e-72 CCDS59432.1 POTEJ gene_id:653781|Hs108|chr2 (1038) 1160 268.8 1.5e-71 CCDS2033.1 ACTR1B gene_id:10120|Hs108|chr2 ( 376) 1046 243.1 3.1e-64 CCDS7536.1 ACTR1A gene_id:10121|Hs108|chr10 ( 376) 1036 240.8 1.5e-63 CCDS56124.1 ACTG2 gene_id:72|Hs108|chr2 ( 333) 984 229.2 4.3e-60 CCDS6771.1 ACTL7B gene_id:10880|Hs108|chr9 ( 415) 943 220.0 3e-57 CCDS12207.1 ACTL9 gene_id:284382|Hs108|chr19 ( 416) 943 220.0 3e-57 CCDS6772.1 ACTL7A gene_id:10881|Hs108|chr9 ( 435) 913 213.3 3.3e-55 CCDS1881.1 ACTR2 gene_id:10097|Hs108|chr2 ( 394) 806 189.3 4.9e-48 CCDS46307.1 ACTR2 gene_id:10097|Hs108|chr2 ( 399) 797 187.3 2e-47 CCDS183.1 ACTL8 gene_id:81569|Hs108|chr1 ( 366) 618 147.2 2.2e-35 CCDS34782.1 ACTR3B gene_id:57180|Hs108|chr7 ( 348) 470 114.1 1.9e-25 CCDS5934.1 ACTR3B gene_id:57180|Hs108|chr7 ( 418) 470 114.1 2.3e-25 CCDS33277.1 ACTR3 gene_id:10096|Hs108|chr2 ( 418) 453 110.3 3.2e-24 CCDS33463.1 ACTL10 gene_id:170487|Hs108|chr20 ( 245) 394 97.0 1.9e-20 CCDS63000.1 ACTR3 gene_id:10096|Hs108|chr2 ( 367) 392 96.6 3.7e-20 CCDS5702.1 ACTL6B gene_id:51412|Hs108|chr7 ( 426) 345 86.1 6.2e-17 CCDS43174.1 ACTL6A gene_id:86|Hs108|chr3 ( 387) 315 79.4 6e-15 CCDS3231.1 ACTL6A gene_id:86|Hs108|chr3 ( 429) 315 79.4 6.5e-15 CCDS47744.1 ACTR3C gene_id:653857|Hs108|chr7 ( 210) 272 69.6 2.8e-12 >>CCDS45.1 ACTRT2 gene_id:140625|Hs108|chr1 (377 aa) initn: 2531 init1: 2531 opt: 2531 Z-score: 3063.5 bits: 575.5 E(32554): 2.6e-164 Smith-Waterman score: 2531; 100.0% identity (100.0% similar) in 377 aa overlap (1-377:1-377) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSRRPEEVLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSRRPEEVLR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 EYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGEIV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 EYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGEIV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 LSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMWVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 LSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMWVT 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 AADFKEFGTSVVQRRCF ::::::::::::::::: CCDS45 AADFKEFGTSVVQRRCF 370 >>CCDS14611.1 ACTRT1 gene_id:139741|Hs108|chrX (376 aa) initn: 1644 init1: 1644 opt: 1923 Z-score: 2327.8 bits: 439.4 E(32554): 2.4e-123 Smith-Waterman score: 1923; 75.3% identity (91.8% similar) in 377 aa overlap (1-377:1-376) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE :::::::: ::::::::::.::::::::.::::..::..:: ::..: :. ::: ::::. 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CCDS53 MDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :: :. : :. :.:.:..:.:::.:..:.: : :: : : ..:.: :: :::. :: CCDS53 EAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::...:::.:..::.:.. ::::.::::. .::.:.::::.:: ::::.:::.::::. CCDS53 EKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAIL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSR--RPEEV .: .::::.:. ::..: :..: .. .: :::.:::::::. :.:.. . CCDS53 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LREYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGE . :.::::..:..:. . ::::: :. :: .: :. . . .:: :::.::.: :... CCDS53 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IVLSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMW :::::::.. :. ::. ::. :: . ::: :::.: .:.:::.::..:::.:.::: CCDS53 TVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMW 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VTAADFKEFGTSVVQRRCF .. .. : : :.:.:.:: CCDS53 ISKQEYDESGPSIVHRKCF 360 370 >>CCDS11782.1 ACTG1 gene_id:71|Hs108|chr17 (375 aa) initn: 1245 init1: 779 opt: 1238 Z-score: 1499.0 bits: 286.0 E(32554): 3.6e-77 Smith-Waterman score: 1238; 48.8% identity (77.5% similar) in 369 aa overlap (11-377:7-375) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE :...:::::.::::..:. .:: . ::::. . :. . .:: .::. CCDS11 MEEEIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :: :. : :. :.:.:..:.:::.:..:.: : :: : : ..:.: :: :::. :: CCDS11 EAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::...:::.:..::.:.. ::::.::::. .::.:.::::.:: ::::.:::.::::. CCDS11 EKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAIL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSR--RPEEV .: .::::.:. ::..: :..: .. .: :::.:::::::. :.:.. . CCDS11 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LREYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGE . :.::::..:..:. . ::::: :. :: .: :. . . .:: :::.::.: :... CCDS11 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IVLSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMW :::::::.. :. ::. ::. :: . ::: :::.: .:.:::.::..:::.:.::: CCDS11 TVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMW 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VTAADFKEFGTSVVQRRCF .. .. : : :.:.:.:: CCDS11 ISKQEYDESGPSIVHRKCF 360 370 >>CCDS7392.1 ACTA2 gene_id:59|Hs108|chr10 (377 aa) initn: 1242 init1: 783 opt: 1235 Z-score: 1495.3 bits: 285.4 E(32554): 5.7e-77 Smith-Waterman score: 1235; 48.7% identity (76.6% similar) in 372 aa overlap (8-377:6-377) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE :: :.. :::::.::::..:. .:: . ::::. . :. . .:: .::. CCDS73 MCEEEDSTALVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :: :. : :. :.:.:.::.:::.:..:.: : :: : : ..: : :: :::. :: CCDS73 EAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHSFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::...:::.:.:::.:.. ::::.::::. .::.:.::::.:: .:::.:::.::::. CCDS73 EKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIM 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSR--RPEEV .: .::::.:. ::..: :..: .. .: :::.:::::::. :.:.. . CCDS73 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LREYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGE . :.::::..:..:. . ::.:: :. .: .: :. . . .:: ::: ::.: :... CCDS73 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IVLSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMW :::::::.. :. ::. ::. :: . ::: :::.: .:.:::.::..:::.:.::: CCDS73 NVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMW 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VTAADFKEFGTSVVQRRCF .. .. : : :.:.:.:: CCDS73 ISKQEYDEAGPSIVHRKCF 360 370 >>CCDS1930.1 ACTG2 gene_id:72|Hs108|chr2 (376 aa) initn: 1233 init1: 774 opt: 1226 Z-score: 1484.4 bits: 283.4 E(32554): 2.3e-76 Smith-Waterman score: 1226; 48.1% identity (76.6% similar) in 372 aa overlap (8-377:5-376) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE .. :.. :::::.::::..:. .:: . ::::. . :. . .:: .::. CCDS19 MCEEETTALVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :: :. : :. :.:.:.::.:::.:..:.: : :: : : ..: : :: :::. :: CCDS19 EAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHSFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::...:::.:.:::.:.. ::::.::::. .::.:.::::.:: .:::.:::.::::. CCDS19 EKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIM 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSR--RPEEV .: .::::.:. ::..: :..: .. .: :::.:::::::. :.:.. . CCDS19 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LREYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGE . :.::::..:..:. . ::.:: :. .: .: :. . . .:: ::: ::.: :... CCDS19 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IVLSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMW :::::::.. :. ::. ::. :: . ::: :::.: .:.:::.::..:::.:.::: CCDS19 NVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMW 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VTAADFKEFGTSVVQRRCF .. .. : : :.:.:.:: CCDS19 ISKPEYDEAGPSIVHRKCF 360 370 >>CCDS1578.1 ACTA1 gene_id:58|Hs108|chr1 (377 aa) initn: 1222 init1: 762 opt: 1215 Z-score: 1471.1 bits: 280.9 E(32554): 1.3e-75 Smith-Waterman score: 1215; 47.8% identity (76.3% similar) in 372 aa overlap (8-377:6-377) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE .. :.. :::::. :::..:. .:: . ::::. . :. . .:: .::. 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CCDS15 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IVLSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMW :.:::::.. :. ::. ::. :: . ::: :::.: .:.:::.::..:::.:.::: CCDS15 NVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMW 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VTAADFKEFGTSVVQRRCF .: .. : : :.:.:.:: CCDS15 ITKQEYDEAGPSIVHRKCF 360 370 >>CCDS10041.1 ACTC1 gene_id:70|Hs108|chr15 (377 aa) initn: 1221 init1: 762 opt: 1214 Z-score: 1469.9 bits: 280.7 E(32554): 1.5e-75 Smith-Waterman score: 1214; 47.8% identity (76.3% similar) in 372 aa overlap (8-377:6-377) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE .. :.. :::::. :::..:. .:: . ::::. . :. . .:: .::. CCDS10 MCDDEETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :: :. : :. :.:.:.::.:::.:..:.: : :: : : ..: : :: :::. :: CCDS10 EAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::...:::.:.:::.:.. ::::.::::. .::.:.::::.:: .:::.:::.::::. CCDS10 EKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIM 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSR--RPEEV .: .::::.:. ::..: :..: .. .: :::.:::::::. :.:.. . CCDS10 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LREYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGE . :.::::..:..:. . ::.:: :. .: .: :. . . .:: ::: ::.: :... CCDS10 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYAN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IVLSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMW :::::::.. :. ::. ::. :: . ::: :::.: .:.:::.::..:::.:.::: CCDS10 NVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMW 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VTAADFKEFGTSVVQRRCF .. .. : : :.:.:.:: CCDS10 ISKQEYDEAGPSIVHRKCF 360 370 >>CCDS34163.1 ACTBL2 gene_id:345651|Hs108|chr5 (376 aa) initn: 1220 init1: 763 opt: 1213 Z-score: 1468.7 bits: 280.5 E(32554): 1.7e-75 Smith-Waterman score: 1213; 47.6% identity (76.3% similar) in 372 aa overlap (11-377:8-376) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE :.. :::::.::::..:. .:: . :..:. . :. . .:: .::. CCDS34 MTDNELSALVVDNGSGMCKAGFGGDDAPRAVFPSMIGRPRHQGVMVGMGQKDCYVGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR :: :. .: :. :.:.:..:.:::.:..: : : :: : :...:.: :: :::. :: CCDS34 EAQSKRGVLTLKYPIEHGVVTNWDDMEKIWYHTFYNELRVAPDEHPILLTEAPLNPKINR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT :::...::: :..::.:.. ::::.::::. .::.:.::::.:: :::.:::.::::. CCDS34 EKMTQIMFEAFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHIVPIYEGYALPHAIL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSR-----RP .: .::::.:. ::..: :..: .. .: :.:.:::::::. :.:. : : CCDS34 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYNFTTTAEREIVRDVKEKLCYVALDFEQEMVRAAASSSP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 EEVLREYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKIL : : :.::::..:..:. . :::.: :. :: .: :. . . .:: :::.::.: : CCDS34 E---RSYELPDGQVITIGNERFRCPEAIFQPSFLGIESSGIHETTFNSIMKCDVDIRKDL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 FGEIVLSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFK ... :::::.:.. :. ::. ::. :: . ::: :::.: .:.:::.::..:::.:. CCDS34 YANTVLSGGSTMYPGIADRMQKEIITLAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQ 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 QMWVTAADFKEFGTSVVQRRCF :::.. .. : : .:.:.:: CCDS34 QMWISKQEYDEAGPPIVHRKCF 360 370 >>CCDS3206.1 ACTRT3 gene_id:84517|Hs108|chr3 (372 aa) initn: 1143 init1: 1094 opt: 1182 Z-score: 1431.3 bits: 273.5 E(32554): 2.1e-73 Smith-Waterman score: 1182; 46.2% identity (79.2% similar) in 366 aa overlap (12-377:8-372) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MFNPHALDSPAVIFDNGSGFCKAGLSGEFGPRHMVSSIVGHLKFQAPSAEANQKKYFVGE :..:::::. :::..: :. . .:.:. : :. .:... . ::. CCDS32 MNHCQLPVVIDNGSGMIKAGVAGCREPQFIYPNIIGRAKGQSRAAQGGLE-LCVGD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 EALYKQEALQLHSPFERGLITGWDDVERLWKHLFEWELGVKPSDQPLLATEPSLNPRENR .: . .: . : ::::::.:.:.: .:::.....: .:: : :.: :::.::: :: CCDS32 QAQDWRSSLFISYPVERGLITSWEDMEIMWKHIYDYNLKLKPCDGPVLITEPALNPLANR 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 EKMAEVMFENFGVPAFYLSDQAVLALYASACVTGLVVDSGDAVTCTVPIFEGYSLPHAVT ....:..::..::::::.: ::::::.:.. .::::..:: .:: .::::::: :::.: CCDS32 QQITEMFFEHLGVPAFYMSIQAVLALFAAGFTTGLVLNSGAGVTQSVPIFEGYCLPHGVQ 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 KLHVAGRDITELLMQLLLASGHTFPCQLDKGLVDDIKKKLCYVALEPEKELSRRPEEVLR .: .:: :.:. :: :. : . :. .:.:::...::::.. :.:....:. . . CCDS32 QLDLAGLDLTNYLMVLMKNHGIMLLSASDRKIVEDIKESFCYVAMNYEEEMAKKPDCLEK 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 EYKLPDGNIISLGDPLHQAPEALFVPQQLGSQSPGLSNMVSSSITKCDTDIQKILFGEIV :.::::..:.: : : . ::::: : ... ..::.... ::: :::: ... .:..:. CCDS32 VYQLPDGKVIQLHDQLFSCPEALFSPCHMNLEAPGIDKICFSSIMKCDTGLRNSFFSNII 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 LSGGTTLFHGLDDRLLKELEQLASKDTPIKITAPPDRWFSTWIGASIVTSLSSFKQMWVT :.::.: : ::: ::.:.. ..: .: ... :::.: .:.:.:.::..:::.:..::.: CCDS32 LAGGSTSFPGLDKRLVKDIAKVAPANTAVQVIAPPERKISVWMGGSILASLSAFQDMWIT 300 310 320 330 340 350 370 pF1KE5 AADFKEFGTSVVQRRCF ::.::: : ..:..::: CCDS32 AAEFKEVGPNIVHQRCF 360 370 377 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 02:05:42 2016 done: Tue Nov 8 02:05:42 2016 Total Scan time: 2.700 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]