FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5571, 453 aa 1>>>pF1KE5571 453 - 453 aa - 453 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8938+/-0.000387; mu= 15.0644+/- 0.024 mean_var=77.1901+/-15.474, 0's: 0 Z-trim(113.0): 156 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.145980 statistics sampled from 22035 (22205) to 22035 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16 Scan time: 8.690 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000802 (OMIM: 137143) gamma-aminobutyric acid r ( 453) 2968 634.7 1.5e-181 NP_000800 (OMIM: 137141) gamma-aminobutyric acid r ( 554) 1901 410.1 7.8e-114 NP_001191195 (OMIM: 137141) gamma-aminobutyric aci ( 535) 1883 406.3 1e-112 NP_000799 (OMIM: 305660) gamma-aminobutyric acid r ( 492) 1704 368.5 2.2e-101 NP_001121120 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-am ( 456) 1660 359.3 1.3e-98 NP_001121115 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-am ( 456) 1660 359.3 1.3e-98 NP_000797 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-amino ( 456) 1660 359.3 1.3e-98 NP_001121116 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-am ( 456) 1660 359.3 1.3e-98 NP_001121117 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-am ( 456) 1660 359.3 1.3e-98 XP_005268315 (OMIM: 137142) PREDICTED: gamma-amino ( 462) 1575 341.4 3.1e-93 NP_001158509 (OMIM: 137142) gamma-aminobutyric aci ( 462) 1575 341.4 3.1e-93 NP_000801 (OMIM: 137142) gamma-aminobutyric acid r ( 462) 1575 341.4 3.1e-93 XP_006720522 (OMIM: 137142) PREDICTED: gamma-amino ( 462) 1575 341.4 3.1e-93 XP_016863471 (OMIM: 103780,137140) PREDICTED: gamm ( 451) 1532 332.3 1.6e-90 NP_001107647 (OMIM: 103780,137140) gamma-aminobuty ( 451) 1532 332.3 1.6e-90 XP_016863472 (OMIM: 103780,137140) PREDICTED: gamm ( 451) 1532 332.3 1.6e-90 NP_000798 (OMIM: 103780,137140) gamma-aminobutyric ( 451) 1532 332.3 1.6e-90 XP_011511977 (OMIM: 103780,137140) PREDICTED: gamm ( 511) 1532 332.3 1.8e-90 NP_001317619 (OMIM: 103780,137140) gamma-aminobuty ( 511) 1532 332.3 1.8e-90 XP_005248137 (OMIM: 103780,137140) PREDICTED: gamm ( 396) 1324 288.5 2.2e-77 NP_001273756 (OMIM: 103780,137140) gamma-aminobuty ( 456) 1324 288.5 2.5e-77 NP_944494 (OMIM: 137164,607681,611277) gamma-amino ( 475) 1312 286.0 1.5e-76 XP_006724874 (OMIM: 305660) PREDICTED: gamma-amino ( 340) 1265 276.0 1.1e-73 NP_000807 (OMIM: 137164,607681,611277) gamma-amino ( 467) 1260 275.0 2.9e-73 XP_016877545 (OMIM: 137142) PREDICTED: gamma-amino ( 306) 1256 274.1 3.6e-73 XP_016877544 (OMIM: 137142) PREDICTED: gamma-amino ( 306) 1256 274.1 3.6e-73 NP_775807 (OMIM: 137166) gamma-aminobutyric acid r ( 465) 1219 266.4 1.2e-70 NP_150092 (OMIM: 600233) gamma-aminobutyric acid r ( 467) 1186 259.4 1.4e-68 XP_011519732 (OMIM: 600233) PREDICTED: gamma-amino ( 473) 1184 259.0 1.9e-68 NP_001191196 (OMIM: 137141) gamma-aminobutyric aci ( 484) 1179 258.0 4.1e-68 NP_004952 (OMIM: 300093) gamma-aminobutyric acid r ( 506) 1039 228.5 3.2e-59 XP_016863479 (OMIM: 137166) PREDICTED: gamma-amino ( 336) 1021 224.6 3.1e-58 XP_016864119 (OMIM: 600421) PREDICTED: glycine rec ( 424) 978 215.6 2e-55 NP_006520 (OMIM: 600421) glycine receptor subunit ( 464) 978 215.6 2.2e-55 NP_001139512 (OMIM: 138491,149400) glycine recepto ( 457) 975 215.0 3.4e-55 XP_016877548 (OMIM: 600233) PREDICTED: gamma-amino ( 355) 945 208.6 2.2e-53 XP_016877547 (OMIM: 600233) PREDICTED: gamma-amino ( 361) 943 208.2 2.9e-53 XP_016884875 (OMIM: 300093) PREDICTED: gamma-amino ( 393) 913 201.9 2.5e-51 XP_016884878 (OMIM: 300093) PREDICTED: gamma-amino ( 267) 910 201.2 2.8e-51 XP_006724550 (OMIM: 305990) PREDICTED: glycine rec ( 436) 894 197.9 4.4e-50 XP_011543797 (OMIM: 305990) PREDICTED: glycine rec ( 436) 894 197.9 4.4e-50 XP_011543798 (OMIM: 305990) PREDICTED: glycine rec ( 436) 894 197.9 4.4e-50 NP_001036008 (OMIM: 600421) glycine receptor subun ( 449) 894 197.9 4.5e-50 NP_002054 (OMIM: 305990) glycine receptor subunit ( 452) 894 197.9 4.5e-50 NP_001112357 (OMIM: 305990) glycine receptor subun ( 452) 894 197.9 4.5e-50 NP_001112358 (OMIM: 305990) glycine receptor subun ( 452) 892 197.5 6.1e-50 XP_016884916 (OMIM: 305990) PREDICTED: glycine rec ( 452) 892 197.5 6.1e-50 NP_000162 (OMIM: 138491,149400) glycine receptor s ( 449) 872 193.3 1.1e-48 XP_016864838 (OMIM: 138491,149400) PREDICTED: glyc ( 465) 872 193.3 1.2e-48 NP_001243632 (OMIM: 137161) gamma-aminobutyric aci ( 462) 868 192.5 2.1e-48 >>NP_000802 (OMIM: 137143) gamma-aminobutyric acid recep (453 aa) initn: 2968 init1: 2968 opt: 2968 Z-score: 3380.5 bits: 634.7 E(85289): 1.5e-181 Smith-Waterman score: 2968; 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NP_001 PPSGSGTSKIDKYARILFPVTFGAFNMVYWVVYLSKDTMEKSESLM 490 500 510 520 530 >>NP_000799 (OMIM: 305660) gamma-aminobutyric acid recep (492 aa) initn: 1699 init1: 1575 opt: 1704 Z-score: 1941.3 bits: 368.5 E(85289): 2.2e-101 Smith-Waterman score: 1706; 61.2% identity (83.0% similar) in 423 aa overlap (33-445:68-483) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 SSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKTDI .:::: ::.:::::::::.: ::::::::: NP_000 GDFVKQDIGGLSPKHAPDIPDDSTDNITIFTRILDRLLDGYDNRLRPGLGDAVTEVKTDI 40 50 60 70 80 90 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRNGK ::::::::::..::::.:::::::: :::::: :: .:: ::::..::::::::::.::: NP_000 YVTSFGPVSDTDMEYTIDVFFRQTWHDERLKFDGPMKILPLNNLLASKIWTPDTFFHNGK 100 110 120 130 140 150 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 KSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYPKS ::.::::::::::.:...:::.::::::::.:.:::.: .:::: :::::::::::: . NP_000 KSVAHNMTTPNKLLRLVDNGTLLYTMRLTIHAECPMHLEDFPMDVHACPLKFGSYAYTTA 160 170 180 190 200 210 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 EIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRKMGY :..:.: : :::: ...: : ::::.:..:..: :.:.:::::.::..:::.::.:: NP_000 EVVYSWTLGKNKSVEVAQDGSRLNQYDLLGHVVGTEIIRSSTGEYVVMTTHFHLKRKIGY 220 230 240 250 260 270 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYATA :.:: : ::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::: NP_000 FVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYATA 280 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 pF1KE5 MDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFA-----APPTVTISKATEPLE ::::::::.:::::::::::.:::::. . .:. : :.. .:.. .. NP_000 MDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTKRSWAWEGKKVPEALEMKKKTPAAPAKKTSTTFN 340 350 360 370 380 390 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 AEIVLHP-----DSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTPPPLSPAFG . .: :... . :.. . : .::. . . .: .:..:. . ... NP_000 IVGTTYPINLAKDTEF---STISKGAAPSASSTPTIIASPKATYVQDSPTE----TKTYN 400 410 420 430 440 450 420 430 440 450 pF1KE5 GTSKIDQYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE ..::.:. :::.::: :: ::::::..:..... NP_000 SVSKVDKISRIIFPVLFAIFNLVYWATYVNRESAIKGMIRKQ 460 470 480 490 >>NP_001121120 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-aminob (456 aa) initn: 1692 init1: 1557 opt: 1660 Z-score: 1891.7 bits: 359.3 E(85289): 1.3e-98 Smith-Waterman score: 1664; 61.3% identity (80.8% similar) in 416 aa overlap (33-444:43-446) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 SSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKTDI .:::: ::.:::::::::.: :::::::: NP_001 AWILLLSTLTGRSYGQPSLQDELKDNTTVFTRILDRLLDGYDNRLRPGLGERVTEVKTDI 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRNGK .::::::::: .::::.::::::.: :::::: :: .: :::::.::::::::::.::: NP_001 FVTSFGPVSDHDMEYTIDVFFRQSWKDERLKFKGPMTVLRLNNLMASKIWTPDTFFHNGK 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 KSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYPKS ::.::::: ::::.:: ..::.:::::::. :.:::.: .::::.:::::::::::: .. 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NP_001 MDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTK-RGYAWDGKSVVPEKP----KKVKDPL-----I 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 HPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTP---PPL-SPAFGGTSKID . .. : :: . .. .. . ..... .. : : :: . .:...:::: NP_001 KKNNTY--APTATSYTPNLARGDPGLATIAKSATIEPKEVKPETKPPEPKKTFNSVSKID 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 pF1KE5 QYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE . ::: ::. :. ::::::..::... NP_001 RLSRIAFPLLFGIFNLVYWATYLNREPQLKAPTPHQ 430 440 450 >>NP_001121115 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-aminob (456 aa) initn: 1692 init1: 1557 opt: 1660 Z-score: 1891.7 bits: 359.3 E(85289): 1.3e-98 Smith-Waterman score: 1664; 61.3% identity (80.8% similar) in 416 aa overlap (33-444:43-446) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 SSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKTDI .:::: ::.:::::::::.: :::::::: NP_001 AWILLLSTLTGRSYGQPSLQDELKDNTTVFTRILDRLLDGYDNRLRPGLGERVTEVKTDI 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRNGK .::::::::: .::::.::::::.: :::::: :: .: :::::.::::::::::.::: NP_001 FVTSFGPVSDHDMEYTIDVFFRQSWKDERLKFKGPMTVLRLNNLMASKIWTPDTFFHNGK 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 KSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYPKS ::.::::: ::::.:: ..::.:::::::. :.:::.: .::::.:::::::::::: .. NP_001 KSVAHNMTMPNKLLRITEDGTLLYTMRLTVRAECPMHLEDFPMDAHACPLKFGSYAYTRA 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 EIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRKMGY :..: : . : :: : :..: : ::::.::::.: ..:.:::::.::..:::.::.:: NP_001 EVVYEWTREPARSVVVAEDGSRLNQYDLLGQTVDSGIVQSSTGEYVVMTTHFHLKRKIGY 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYATA :.:: : ::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::: NP_001 FVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYATA 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 MDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAPPTVTISKATEPLEAEIVL ::::::::.:::::::::::.:::::. . :. : .:. .:: . 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NP_001 RLSRIAFPLLFGIFNLVYWATYLNREPQLKAPTPHQ 430 440 450 >>NP_000797 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-aminobuty (456 aa) initn: 1692 init1: 1557 opt: 1660 Z-score: 1891.7 bits: 359.3 E(85289): 1.3e-98 Smith-Waterman score: 1664; 61.3% identity (80.8% similar) in 416 aa overlap (33-444:43-446) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 SSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKTDI .:::: ::.:::::::::.: :::::::: NP_000 AWILLLSTLTGRSYGQPSLQDELKDNTTVFTRILDRLLDGYDNRLRPGLGERVTEVKTDI 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRNGK .::::::::: .::::.::::::.: :::::: :: .: :::::.::::::::::.::: NP_000 FVTSFGPVSDHDMEYTIDVFFRQSWKDERLKFKGPMTVLRLNNLMASKIWTPDTFFHNGK 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 KSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYPKS ::.::::: ::::.:: ..::.:::::::. :.:::.: .::::.:::::::::::: .. NP_000 KSVAHNMTMPNKLLRITEDGTLLYTMRLTVRAECPMHLEDFPMDAHACPLKFGSYAYTRA 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 EIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRKMGY :..: : . : :: : :..: : ::::.::::.: ..:.:::::.::..:::.::.:: NP_000 EVVYEWTREPARSVVVAEDGSRLNQYDLLGQTVDSGIVQSSTGEYVVMTTHFHLKRKIGY 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYATA :.:: : ::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::: NP_000 FVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYATA 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 MDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAPPTVTISKATEPLEAEIVL ::::::::.:::::::::::.:::::. . :. : .:. .:: . NP_000 MDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTK-RGYAWDGKSVVPEKP----KKVKDPL-----I 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 HPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTP---PPL-SPAFGGTSKID . .. : :: . .. .. . ..... .. : : :: . .:...:::: NP_000 KKNNTY--APTATSYTPNLARGDPGLATIAKSATIEPKEVKPETKPPEPKKTFNSVSKID 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 pF1KE5 QYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE . ::: ::. :. ::::::..::... NP_000 RLSRIAFPLLFGIFNLVYWATYLNREPQLKAPTPHQ 430 440 450 >>NP_001121116 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-aminob (456 aa) initn: 1692 init1: 1557 opt: 1660 Z-score: 1891.7 bits: 359.3 E(85289): 1.3e-98 Smith-Waterman score: 1664; 61.3% identity (80.8% similar) in 416 aa overlap (33-444:43-446) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 SSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKTDI .:::: ::.:::::::::.: :::::::: NP_001 AWILLLSTLTGRSYGQPSLQDELKDNTTVFTRILDRLLDGYDNRLRPGLGERVTEVKTDI 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRNGK .::::::::: .::::.::::::.: :::::: :: .: :::::.::::::::::.::: NP_001 FVTSFGPVSDHDMEYTIDVFFRQSWKDERLKFKGPMTVLRLNNLMASKIWTPDTFFHNGK 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 KSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYPKS ::.::::: ::::.:: ..::.:::::::. :.:::.: .::::.:::::::::::: .. NP_001 KSVAHNMTMPNKLLRITEDGTLLYTMRLTVRAECPMHLEDFPMDAHACPLKFGSYAYTRA 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 EIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSNTGEYVIMTVYFHLQRKMGY :..: : . : :: : :..: : ::::.::::.: ..:.:::::.::..:::.::.:: NP_001 EVVYEWTREPARSVVVAEDGSRLNQYDLLGQTVDSGIVQSSTGEYVVMTTHFHLKRKIGY 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FMIQIYTPCIMTVILSQVSFWINKESVPARTVFGITTVLTMTTLSISARHSLPKVSYATA :.:: : ::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::::.:::::.:::: NP_001 FVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVPARTVFGVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYATA 260 270 280 290 300 310 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 MDWFIAVCFAFVFSALIEFAAVNYFTNLQTQKAKRKAQFAAPPTVTISKATEPLEAEIVL ::::::::.:::::::::::.:::::. . :. : .:. .:: . 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NP_001 RLSRIAFPLLFGIFNLVYWATYLNREPQLKAPTPHQ 430 440 450 >>NP_001121117 (OMIM: 137160,611136,615744) gamma-aminob (456 aa) initn: 1692 init1: 1557 opt: 1660 Z-score: 1891.7 bits: 359.3 E(85289): 1.3e-98 Smith-Waterman score: 1664; 61.3% identity (80.8% similar) in 416 aa overlap (33-444:43-446) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 SSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFYSENVSRILDNLLEGYDNRLRPGFGGAVTEVKTDI .:::: ::.:::::::::.: :::::::: NP_001 AWILLLSTLTGRSYGQPSLQDELKDNTTVFTRILDRLLDGYDNRLRPGLGERVTEVKTDI 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSLNNLMVSKIWTPDTFFRNGK .::::::::: .::::.::::::.: :::::: :: .: :::::.::::::::::.::: NP_001 FVTSFGPVSDHDMEYTIDVFFRQSWKDERLKFKGPMTVLRLNNLMASKIWTPDTFFHNGK 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 KSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNFPMDGHACPLKFGSYAYPKS ::.::::: ::::.:: ..::.:::::::. :.:::.: .::::.:::::::::::: .. 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NP_001 MDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTK-RGYAWDGKSVVPEKP----KKVKDPL-----I 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 HPDSKYHLKKRITSLSLPIVSSSEANKVLTRAPILQSTPVTP---PPL-SPAFGGTSKID . .. : :: . .. .. . ..... .. : : :: . .:...:::: NP_001 KKNNTY--APTATSYTPNLARGDPGLATIAKSATIEPKEVKPETKPPEPKKTFNSVSKID 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 pF1KE5 QYSRILFPVAFAGFNLVYWVVYLSKDTMEVSSSVE . ::: ::. :. ::::::..::... NP_001 RLSRIAFPLLFGIFNLVYWATYLNREPQLKAPTPHQ 430 440 450 >>XP_005268315 (OMIM: 137142) PREDICTED: gamma-aminobuty (462 aa) initn: 1682 init1: 1558 opt: 1575 Z-score: 1794.9 bits: 341.4 E(85289): 3.1e-93 Smith-Waterman score: 1680; 57.8% identity (80.4% similar) in 455 aa overlap (1-444:11-452) 10 20 30 40 pF1KE5 MASSLPWLCIILWLENALGKLEVEGNFY----SENVS---RILDNLLEGY : ..: .:: . : . .: .. . ..:.. ::::.::.:: XP_005 MDNGMFSGFIMIKNLLLFCISMNLSSHFGFSQMPTSSVKDETNDNITIFTRILDGLLDGY 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE5 DNRLRPGFGGAVTEVKTDIYVTSFGPVSDVEMEYTMDVFFRQTWTDERLKFGGPTEILSL :::::::.: .:.:.:::::::::::::.:::::.::::::.: ::::.: :: . : : XP_005 DNRLRPGLGERITQVRTDIYVTSFGPVSDTEMEYTIDVFFRQSWKDERLRFKGPMQRLPL 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE5 NNLMVSKIWTPDTFFRNGKKSIAHNMTTPNKLFRIMQNGTILYTMRLTINADCPMRLVNF :::..::::::::::.::::::::::::::::.:. ..::.::::::::.:.:::.: .: XP_005 NNLLASKIWTPDTFFHNGKKSIAHNMTTPNKLLRLEDDGTLLYTMRLTISAECPMQLEDF 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 PMDGHACPLKFGSYAYPKSEIIYTWKKGPLYSVEVPEESSSLLQYDLIGQTVSSETIKSN :::.:::::::::::::.::..:.: .: :: : :..: : :: :.::::..:.:... 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XP_005 TSES----KKTYNSISKIDKMSRIVFPVLFGTFNLVYWATYLNREPVIKGAASPK 420 430 440 450 460 453 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 01:57:15 2016 done: Tue Nov 8 01:57:16 2016 Total Scan time: 8.690 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]