FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5333, 275 aa 1>>>pF1KE5333 275 - 275 aa - 275 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0907+/-0.000848; mu= 16.2963+/- 0.051 mean_var=65.9955+/-13.205, 0's: 0 Z-trim(106.2): 45 B-trim: 2 in 1/49 Lambda= 0.157876 statistics sampled from 8795 (8830) to 8795 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.271), width: 16 Scan time: 2.380 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12868.1 CACNG7 gene_id:59284|Hs108|chr19 ( 275) 1840 427.8 4.1e-120 CCDS11665.1 CACNG5 gene_id:27091|Hs108|chr17 ( 275) 1384 323.9 7.6e-89 CCDS11667.1 CACNG4 gene_id:27092|Hs108|chr17 ( 327) 409 101.9 6.2e-22 CCDS13931.1 CACNG2 gene_id:10369|Hs108|chr22 ( 323) 387 96.9 2e-20 CCDS10620.1 CACNG3 gene_id:10368|Hs108|chr16 ( 315) 374 93.9 1.5e-19 CCDS33104.1 CACNG8 gene_id:59283|Hs108|chr19 ( 425) 322 82.2 7e-16 >>CCDS12868.1 CACNG7 gene_id:59284|Hs108|chr19 (275 aa) initn: 1840 init1: 1840 opt: 1840 Z-score: 2269.9 bits: 427.8 E(32554): 4.1e-120 Smith-Waterman score: 1840; 100.0% identity (100.0% similar) in 275 aa overlap (1-275:1-275) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSHCSSRALTLLSSVFGACGLLLVGIAVSTDYWLYMEEGTVLPQNQTTEVKMALHAGLWR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 MSHCSSRALTLLSSVFGACGLLLVGIAVSTDYWLYMEEGTVLPQNQTTEVKMALHAGLWR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VCFFAGREKGRCVASEYFLEPEINLVTENTENILKTVRTATPFPMVSLFLVFTAFVISNI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 VCFFAGREKGRCVASEYFLEPEINLVTENTENILKTVRTATPFPMVSLFLVFTAFVISNI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 GHIRPQRTILAFVSGIFFILSGLSLVVGLVLYISSINDEVMNRPSSSEQYFHYRYGWSFA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 GHIRPQRTILAFVSGIFFILSGLSLVVGLVLYISSINDEVMNRPSSSEQYFHYRYGWSFA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 FAASSFLLKEGAGVMSVYLFTKRYAEEEMYRPHPAFYRPRLSDCSDYSGQFLQPEAWRRG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 FAASSFLLKEGAGVMSVYLFTKRYAEEEMYRPHPAFYRPRLSDCSDYSGQFLQPEAWRRG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 RSPSDISSDVSIQMTQNYPPAIKYPDHLHISTSPC ::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 RSPSDISSDVSIQMTQNYPPAIKYPDHLHISTSPC 250 260 270 >>CCDS11665.1 CACNG5 gene_id:27091|Hs108|chr17 (275 aa) initn: 1384 init1: 1384 opt: 1384 Z-score: 1708.6 bits: 323.9 E(32554): 7.6e-89 Smith-Waterman score: 1384; 70.5% identity (91.6% similar) in 275 aa overlap (1-275:1-275) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MSHCSSRALTLLSSVFGACGLLLVGIAVSTDYWLYMEEGTVLPQNQTTEVKMALHAGLWR :: :. .:::::::::..::: :.:::::::::::.:::...::::.::.::.::.:::: CCDS11 MSACGRKALTLLSSVFAVCGLGLLGIAVSTDYWLYLEEGVIVPQNQSTEIKMSLHSGLWR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VCFFAGREKGRCVASEYFLEPEINLVTENTENILKTVRTATPFPMVSLFLVFTAFVISNI :::.::.:.::: . :: . . .:..:.: :.:: .:.:::::.::::..: .:...:: CCDS11 VCFLAGEERGRCFTIEYVMPMNTQLTSESTVNVLKMIRSATPFPLVSLFFMFIGFILNNI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 GHIRPQRTILAFVSGIFFILSGLSLVVGLVLYISSINDEVMNRPSSSEQYFHYRYGWSFA :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::..:: ...: ::.:.:::::: CCDS11 GHIRPHRTILAFVSGIFFILSGLSLVVGLVLYISSINDEMLNRTKDAETYFNYKYGWSFA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 FAASSFLLKEGAGVMSVYLFTKRYAEEEMYRPHPAFYRPRLSDCSDYSGQFLQPEAWRRG ::: :::: :.::::::::: :::. :.::::::.:::::::.:::::::::.:.:: :: CCDS11 FAAISFLLTESAGVMSVYLFMKRYTAEDMYRPHPGFYRPRLSNCSDYSGQFLHPDAWVRG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 RSPSDISSDVSIQMTQNYPPAIKYPDHLHISTSPC ::::::::..:.::..::: .: ::. ..:.::: CCDS11 RSPSDISSEASLQMNSNYPALLKCPDYDQMSSSPC 250 260 270 >>CCDS11667.1 CACNG4 gene_id:27092|Hs108|chr17 (327 aa) initn: 381 init1: 151 opt: 409 Z-score: 507.3 bits: 101.9 E(32554): 6.2e-22 Smith-Waterman score: 409; 31.9% identity (64.2% similar) in 254 aa overlap (1-244:1-247) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSHCSSRALTLLSSVFGACGLL-LVGIAVSTDYWLY----MEEGTVLPQNQTTEVKMA-- : .:. :.: .: .. :: . . :..::..:::::: . .:: : ... . : CCDS11 MVRCD-RGLQMLLTTAGAFAAFSLMAIAIGTDYWLYSSAHICNGTNLTMDDGPPPRRARG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 --LHAGLWRVCFFAGREKGRCVASEYFLEPEINLVT-ENTENILKTVRTATPFPMVSLFL :.:::::: . : ::.: ..: :: : ...: .:. ::... ::..: .: CCDS11 DLTHSGLWRVCCIEGIYKGHCFRINHF--PEDNDYDHDSSEYLLRIVRASSVFPILSTIL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 VFTAFVISNIGHIRPQRTILAFVSGIFFILSGLSLVVGLVLYISSINDEVMNRPSSSEQY .. . . . :.: ... ... .::.:. .::: ..:...:::: . . .. . ... CCDS11 LLLGGLCIGAGRIYSRKNNIVLSAGILFVAAGLSNIIGIIVYISSNTGDPSDKRDEDKKN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 FHYRYGWSFAFAASSFLLKEGAGVMSVYLFTKRYAEEEMYRPHPAFYRPRLSDCSDYSGQ :: ::::: :.: ::.. : .::..: .. .. .: .. . : . :. : :. . CCDS11 -HYNYGWSFYFGALSFIVAETVGVLAVNIYIEK-NKELRFKTKREFLKA--SSSSPYARM 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 FLQPEAWRRGRSPSDISSDVSIQMTQNYPPAIKYPDHLHISTSPC ::.:: : CCDS11 PSYRYRRRRSRSSSRSTEASPSRDVSPMGLKITGAIPMGELSMYTLSREPLKVTTAASYS 240 250 260 270 280 290 >>CCDS13931.1 CACNG2 gene_id:10369|Hs108|chr22 (323 aa) initn: 359 init1: 129 opt: 387 Z-score: 480.3 bits: 96.9 E(32554): 2e-20 Smith-Waterman score: 387; 30.1% identity (60.8% similar) in 286 aa overlap (7-274:6-284) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSHCSSRALTLLSSVFGACGLL-LVGIAVSTDYWLYME---EGTVLPQNQTTEV--KMAL :.. .: .. :: . . :. :::.:::::: . . . .:.:.. .. 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CCDS13 SYGWSFYFGALSFIIAEMVGVLAVHMFIDRHKQLRATARATDYLQASAITRIPSYRYRYQ 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE5 DCSDYSGQFLQPEAWRRGRSPSDISSDVSIQMTQNYPPAIKYPDHLHISTSPC : :.. .: . : :: :.. .. :. ... : :. .:.: CCDS13 RRSRSSSRSTEP-SHSRDASPVGIKGFNTLPSTEISMYTLSR-DPLKAATTPTATYNSDR 240 250 260 270 280 290 CCDS13 DNSFLQVHNCIQKENKDSLHSNTANRRTTPV 300 310 320 >>CCDS10620.1 CACNG3 gene_id:10368|Hs108|chr16 (315 aa) initn: 331 init1: 147 opt: 374 Z-score: 464.4 bits: 93.9 E(32554): 1.5e-19 Smith-Waterman score: 374; 29.9% identity (64.7% similar) in 224 aa overlap (1-218:1-217) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MSHCSSRALTLLSSVFGACGLL-LVGIAVSTDYWLYME---EGTVLPQNQTTEV--KMAL : :. :.. .: .. :: . . :. :::.:::::: . . .:.:.. .. CCDS10 MRMCD-RGIQMLITTVGAFAAFSLMTIAVGTDYWLYSRGVCRTKSTSDNETSRKNEEVMT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 HAGLWRVCFFAGREKGRCVASEYFLEPEINLVTENTENILKTVRTATPFPMVSLFLVFTA :.::::.: . : .: : ..: : . . ...: .:..::... ::..:. :.: . CCDS10 HSGLWRTCCLEGAFRGVCKKIDHFPE-DADYEQDTAEYLLRAVRASSVFPILSVTLLFFG 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 FVISNIGHIRPQRTILAFVSGIFFILSGLSLVVGLVLYISSINDEVMNRPSSSEQYFHYR . .... .: . . .::::. .::: ..:...:::. . :.. .. : CCDS10 GLCVAASEFHRSRHNVILSAGIFFVSAGLSNIIGIIVYISANAGD----PGQRDSKKSYS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 YGWSFAFAASSFLLKEGAGVMSVYLFTKRYAEEEMYRPHPAFYRPRLSDCSDYSGQFLQP ::::: :.: ::.. : .::..:... ... .. . : : . CCDS10 YGWSFYFGAFSFIIAEIVGVVAVHIYIEKH-QQLRAKSHSEFLKKSTFARLPPYRYRFRR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 EAWRRGRSPSDISSDVSIQMTQNYPPAIKYPDHLHISTSPC CCDS10 RSSSRSTEPRSRDLSPISKGFHTIPSTDISMFTLSRDPSKITMGTLLNSDRDHAFLQFHN 240 250 260 270 280 290 >>CCDS33104.1 CACNG8 gene_id:59283|Hs108|chr19 (425 aa) initn: 391 init1: 119 opt: 322 Z-score: 398.6 bits: 82.2 E(32554): 7e-16 Smith-Waterman score: 360; 32.0% identity (61.3% similar) in 225 aa overlap (4-206:15-233) 10 20 30 pF1KE5 MSHCSSRALTLLSSV--FGACGLLLVGIAVSTDYWLYM----------- : . . .::..: :.: ::. ::.::::::: CCDS33 MESLKRWNEERGLWCEKGVQVLLTTVGAFAAFGLMT--IAISTDYWLYTRALICNTTNLT 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 pF1KE5 ---EEGTVLPQ---NQTTEVKMA---LHAGLWRVCFFAGREKGRCVASEYFLEPEINLVT ..:: :. . ..: : :.::::.: . : ..: :: ..: : . . CCDS33 AGGDDGT--PHRGGGGASEKKDPGGLTHSGLWRICCLEGLKRGVCVKINHFPE-DTDYDH 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 ENTENILKTVRTATPFPMVSLFLVFTAFVISNIGHIRPQRTILAFVSGIFFILSGLSLVV ...: .:..::... ::..: .:.. . : ... .. . . .::.:. .::: .. CCDS33 DSAEYLLRVVRASSIFPILSAILLLLGGVCVAASRVYKSKRNIILGAGILFVAAGLSNII 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 GLVLYISSINDEVMNRPSSSEQYFHYRYGWSFAFAASSFLLKEGAGVMSVYLFTKRYAEE :...:::. : . . :. :: ::::: :.. ::.: : ::..: .. .: : CCDS33 GVIVYISANAGEPGPK-RDEEKKNHYSYGWSFYFGGLSFILAEVIGVLAVNIYIERSREA 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 EMYRPHPAFYRPRLSDCSDYSGQFLQPEAWRRGRSPSDISSDVSIQMTQNYPPAIKYPDH CCDS33 HCQSRSDLLKAGGGAGGSGGSGPSAILRLPSYRFRYRRRSRSSSRSSEPSPSRDASPGGP 240 250 260 270 280 290 275 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 23:52:03 2016 done: Mon Nov 7 23:52:03 2016 Total Scan time: 2.380 Total Display time: 0.000 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]