Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2497
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2497, 842 aa
  1>>>pF1KE2497 842 - 842 aa - 842 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8709+/-0.00123; mu= 13.6899+/- 0.074
 mean_var=165.8838+/-33.526, 0's: 0 Z-trim(107.0): 152  B-trim: 3 in 1/51
 Lambda= 0.099580
 statistics sampled from 9156 (9329) to 9156 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.287), width:  16
 Scan time:  4.020

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34238.1 FSTL4 gene_id:23105|Hs108|chr5         ( 842) 5701 832.5       0
CCDS3802.1 FSTL5 gene_id:56884|Hs108|chr4          ( 847) 3342 493.6 6.1e-139
CCDS47158.1 FSTL5 gene_id:56884|Hs108|chr4         ( 846) 3340 493.3 7.4e-139
CCDS47157.1 FSTL5 gene_id:56884|Hs108|chr4         ( 837) 2589 385.4 2.2e-106


>>CCDS34238.1 FSTL4 gene_id:23105|Hs108|chr5              (842 aa)
 initn: 5701 init1: 5701 opt: 5701  Z-score: 4439.6  bits: 832.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5701; 100.0% identity (100.0% similar) in 842 aa overlap (1-842:1-842)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MKPGGFWLHLTLLGASLPAALGWMDPGTSRGPDVGVGESQAEEPRSFEVTRREGLSSHNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MKPGGFWLHLTLLGASLPAALGWMDPGTSRGPDVGVGESQAEEPRSFEVTRREGLSSHNE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 LLASCGKKFCSRGSRCVLSRKTGEPECQCLEACRPSYVPVCGSDGRFYENHCKLHRAACL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLASCGKKFCSRGSRCVLSRKTGEPECQCLEACRPSYVPVCGSDGRFYENHCKLHRAACL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 LGKRITVIHSKDCFLKGDTCTMAGYARLKNVLLALQTRLQPLQEGDSRQDPASQKRLLVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGKRITVIHSKDCFLKGDTCTMAGYARLKNVLLALQTRLQPLQEGDSRQDPASQKRLLVE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 SLFRDLDADGNGHLSSSELAQHVLKKQDLDEDLLGCSPGDLLRFDDYNSDSSLTLREFYM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLFRDLDADGNGHLSSSELAQHVLKKQDLDEDLLGCSPGDLLRFDDYNSDSSLTLREFYM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 AFQVVQLSLAPEDRVSVTTVTVGLSTVLTCAVHGDLRPPIIWKRNGLTLNFLDLEDINDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AFQVVQLSLAPEDRVSVTTVTVGLSTVLTCAVHGDLRPPIIWKRNGLTLNFLDLEDINDF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 GEDDSLYITKVTTIHMGNYTCHASGHEQLFQTHVLQVNVPPVIRVYPESQAQEPGVAASL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GEDDSLYITKVTTIHMGNYTCHASGHEQLFQTHVLQVNVPPVIRVYPESQAQEPGVAASL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 RCHAEGIPMPRITWLKNGVDVSTQMSKQLSLLANGSELHISSVRYEDTGAYTCIAKNEVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RCHAEGIPMPRITWLKNGVDVSTQMSKQLSLLANGSELHISSVRYEDTGAYTCIAKNEVG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 VDEDISSLFIEDSARKTLANILWREEGLSVGNMFYVFSDDGIIVIHPVDCEIQRHLKPTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VDEDISSLFIEDSARKTLANILWREEGLSVGNMFYVFSDDGIIVIHPVDCEIQRHLKPTE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 KIFMSYEEICPQREKNATQPCQWVSAVNVRNRYIYVAQPALSRVLVVDIQAQKVLQSIGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KIFMSYEEICPQREKNATQPCQWVSAVNVRNRYIYVAQPALSRVLVVDIQAQKVLQSIGV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 DPLPAKLSYDKSHDQVWVLSWGDVHKSRPSLQVITEASTGQSQHLIRTPFAGVDDFFIPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DPLPAKLSYDKSHDQVWVLSWGDVHKSRPSLQVITEASTGQSQHLIRTPFAGVDDFFIPP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 TNLIINHIRFGFIFNKSDPAVHKVDLETMMPLKTIGLHHHGCVPQAMAHTHLGGYFFIQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TNLIINHIRFGFIFNKSDPAVHKVDLETMMPLKTIGLHHHGCVPQAMAHTHLGGYFFIQC
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 RQDSPASAARQLLVDSVTDSVLGPNGDVTGTPHTSPDGRFIVSAAADSPWLHVQEITVRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RQDSPASAARQLLVDSVTDSVLGPNGDVTGTPHTSPDGRFIVSAAADSPWLHVQEITVRG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 EIQTLYDLQINSGISDLAFQRSFTESNQYNIYAALHTEPDLLFLELSTGKVGMLKNLKEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EIQTLYDLQINSGISDLAFQRSFTESNQYNIYAALHTEPDLLFLELSTGKVGMLKNLKEP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 PAGPAQPWGGTHRIMRDSGLFGQYLLTPARESLFLINGRQNTLRCEVSGIKGGTTVVWVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PAGPAQPWGGTHRIMRDSGLFGQYLLTPARESLFLINGRQNTLRCEVSGIKGGTTVVWVG
              790       800       810       820       830       840

         
pF1KE2 EV
       ::
CCDS34 EV
         

>>CCDS3802.1 FSTL5 gene_id:56884|Hs108|chr4               (847 aa)
 initn: 3218 init1: 2260 opt: 3342  Z-score: 2608.0  bits: 493.6 E(32554): 6.1e-139
Smith-Waterman score: 3342; 58.6% identity (84.9% similar) in 807 aa overlap (42-841:42-846)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KE2 LLGASLPAALGWMDPGTSRGPDVGVGESQAEEPRSFEVTRREGLSSHNELLASCGKKFCS
                                     .. .. : .: .:.  ..  ..:: .:.:.
CCDS38 GFIFLESEGRPTKEGGYGLKSYQPLMRLRHKQEKNQESSRVKGFMIQDGPFGSCENKYCG
              20        30        40        50        60        70 

              80        90       100       110       120       130 
pF1KE2 RGSRCVLSRKTGEPECQCLEACRPSYVPVCGSDGRFYENHCKLHRAACLLGKRITVIHSK
        : .:: ::.::. :: :.. :.  : :::::::.::::::..::::::  ..::..:..
CCDS38 LGRHCVTSRETGQAECACMDLCKRHYKPVCGSDGEFYENHCEVHRAACLKKQKITIVHNE
              80        90       100       110       120       130 

             140       150       160        170       180       190
pF1KE2 DCFLKGDTCTMAGYARLKNVLLALQTRLQPLQEGDSRQ-DPASQKRLLVESLFRDLDADG
       :::.::: :  . :...::.:: ::..   .::... . :  :.:.:::...:. .:::.
CCDS38 DCFFKGDKCKTTEYSKMKNMLLDLQNQKYIMQENENPNGDDISRKKLLVDQMFKYFDADS
             140       150       160       170       180       190 

              200       210       220       230       240       250
pF1KE2 NGHLSSSELAQHVLKKQDLDEDLLGCSPGDLLRFDDYNSDSSLTLREFYMAFQVVQLSLA
       :: .. .::.: :.:...: .::. :.   ::..::.:.:. :.:.::: ::::.:::: 
CCDS38 NGLVDINELTQ-VIKQEELGKDLFDCTLYVLLKYDDFNADKHLALEEFYRAFQVIQLSL-
             200        210       220       230       240          

               260       270       280       290       300         
pF1KE2 PED-RVSVTTVTVGLSTVLTCAVHGDLRPPIIWKRNGLTLNFLDLEDINDFGEDDSLYIT
       ::: ..:.:..::: :.::.::..: ::::::::::.. :: ::::::::::.: :::::
CCDS38 PEDQKLSITAATVGQSAVLSCAIQGTLRPPIIWKRNNIILNNLDLEDINDFGDDGSLYIT
     250       260       270       280       290       300         

     310       320       330       340       350       360         
pF1KE2 KVTTIHMGNYTCHASGHEQLFQTHVLQVNVPPVIRVYPESQAQEPGVAASLRCHAEGIPM
       :::: :.:::::.:.:.::..:::..::::::::::::::::.::::.::::::::::: 
CCDS38 KVTTTHVGNYTCYADGYEQVYQTHIFQVNVPPVIRVYPESQAREPGVTASLRCHAEGIPK
     310       320       330       340       350       360         

     370       380       390       400       410       420         
pF1KE2 PRITWLKNGVDVSTQMSKQLSLLANGSELHISSVRYEDTGAYTCIAKNEVGVDEDISSLF
       :.. :::::.:.. ..::::.: :::::.:::.::::::::::::::::.::::::::::
CCDS38 PQLGWLKNGIDITPKLSKQLTLQANGSEVHISNVRYEDTGAYTCIAKNEAGVDEDISSLF
     370       380       390       400       410       420         

     430       440       450       460       470       480         
pF1KE2 IEDSARKTLANILWREEGLSVGNMFYVFSDDGIIVIHPVDCEIQRHLKPTEKIFMSYEEI
       .::::::::::::::::::..::::::: .::: ::.:..::.:::.::.::..   .:.
CCDS38 VEDSARKTLANILWREEGLGIGNMFYVFYEDGIKVIQPIECEFQRHIKPSEKLLGFQDEV
     430       440       450       460       470       480         

     490       500       510       520       530       540         
pF1KE2 CPQREKNATQPCQWVSAVNVRNRYIYVAQPALSRVLVVDIQAQKVLQSIGVDPLPAKLSY
       ::. : . .: : :.:::::....::::::.:.:::.::.:.:::.:....::.:.:: :
CCDS38 CPKAEGDEVQRCVWASAVNVKDKFIYVAQPTLDRVLIVDVQSQKVVQAVSTDPVPVKLHY
     490       500       510       520       530       540         

     550       560       570       580       590            600    
pF1KE2 DKSHDQVWVLSWGDVHKSRPSLQVITEASTGQSQHLIRTPFAG-----VDDFFIPPTNLI
       ::::::::::::: ..:. :.::::: :: .  .: :.:  .:     ::::::: :.::
CCDS38 DKSHDQVWVLSWGTLEKTSPTLQVITLASGNVPHHTIHTQPVGKQFDRVDDFFIPTTTLI
     550       560       570       580       590       600         

          610       620       630       640       650       660    
pF1KE2 INHIRFGFIFNKSDPAVHKVDLETMMPLKTIGLHHHGCVPQAMAHTHLGGYFFIQCRQDS
       :.:.:::::..:.. :..:.:::::  .:::.:. . ::::..:.::::::.:: :. ::
CCDS38 ITHMRFGFILHKDEAALQKIDLETMSYIKTINLKDYKCVPQSLAYTHLGGYYFIGCKPDS
     610       620       630       640       650       660         

          670       680       690       700       710       720    
pF1KE2 PASAARQLLVDSVTDSVLGPNGDVTGTPHTSPDGRFIVSAAADSPWLHVQEITVRGEIQT
        .... :..::.:::::.: :.::::::..::::...::    .  ..:: ::.::::: 
CCDS38 TGAVSPQVMVDGVTDSVIGFNSDVTGTPYVSPDGHYLVSINDVKGLVRVQYITIRGEIQE
     670       680       690       700       710       720         

          730       740       750       760       770       780    
pF1KE2 LYDLQINSGISDLAFQRSFTESNQYNIYAALHTEPDLLFLELSTGKVGMLKNLKEPPAGP
        .:.  :  ::::::: ::::..:::::..  :. :.::.:::.::: :.:.::::  . 
CCDS38 AFDIYTNLHISDLAFQPSFTEAHQYNIYGSSSTQTDVLFVELSSGKVKMIKSLKEPLKAE
     730       740       750       760       770       780         

          790       800       810       820       830       840  
pF1KE2 AQPWGGTHRIMRDSGLFGQYLLTPARESLFLINGRQNTLRCEVSGIKGGTTVVWVGEV
         ::.  .: ..:::::::::.::...:::...:: : : ::.. .. :.::.:::. 
CCDS38 EWPWNRKNRQIQDSGLFGQYLMTPSKDSLFILDGRLNKLNCEITEVEKGNTVIWVGDA
     790       800       810       820       830       840       

>>CCDS47158.1 FSTL5 gene_id:56884|Hs108|chr4              (846 aa)
 initn: 3218 init1: 2260 opt: 3340  Z-score: 2606.4  bits: 493.3 E(32554): 7.4e-139
Smith-Waterman score: 3340; 59.1% identity (85.0% similar) in 801 aa overlap (48-841:47-845)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KE2 PAALGWMDPGTSRGPDVGVGESQAEEPRSFEVTRREGLSSHNELLASCGKKFCSRGSRCV
                                     : .: .:.  ..  ..:: .:.:. : .::
CCDS47 ESEGRPTKEGGYGLKSYQPLMRLRHKEKNQESSRVKGFMIQDGPFGSCENKYCGLGRHCV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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