FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5762, 751 aa 1>>>pF1KB5762 751 - 751 aa - 751 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2581+/-0.000858; mu= 21.0062+/- 0.052 mean_var=77.3815+/-15.289, 0's: 0 Z-trim(107.6): 17 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.145799 statistics sampled from 9667 (9679) to 9667 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.297), width: 16 Scan time: 2.920 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS43679.1 AOC1 gene_id:26|Hs108|chr7 ( 751) 5253 1114.9 0 CCDS64797.1 AOC1 gene_id:26|Hs108|chr7 ( 770) 4303 915.1 0 CCDS11443.1 AOC2 gene_id:314|Hs108|chr17 ( 756) 1357 295.4 2.2e-79 CCDS11444.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 ( 763) 1346 293.1 1.1e-78 CCDS74071.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 ( 634) 905 200.3 8.1e-51 CCDS45690.1 AOC2 gene_id:314|Hs108|chr17 ( 729) 872 193.4 1.1e-48 CCDS62198.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 ( 220) 639 143.9 2.5e-34 >>CCDS43679.1 AOC1 gene_id:26|Hs108|chr7 (751 aa) initn: 5253 init1: 5253 opt: 5253 Z-score: 5967.6 bits: 1114.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5253; 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CCDS45 TQRLGPGLVDAAQAQPSDNCIFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPPAREALAIVLFGGQPQ 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 PNVTEFAVGPLPGPCYMRALS-PRPGYQSSWASRPISTAEYALLYHTLQEATKPLHQFFL :::.:..::::: : ::: .. : : . ::. ::.. ... :.:. : .:: CCDS45 PNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLRAEFTQMWRHLKEVELPKAPIFL 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 NTTGFSFQDCHDRCLAFTDVAPRGVASGQRRSWLIIQRYVEGY--FLHPTGLELLVDHGS ..: :.. . :: . ..:::. ::.: .:. . . . : ::::.:::::.:: . CCDS45 SST-FNY---NGSTLAAVHATPRGLRSGDRATWMALYHNISGVGLFLHPVGLELLLDHRA 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 TDAGHWAVEQVWYNGKFYGSPEELARKYADGEVDVVVLEDPLPGGKGHDSTEEPPLFSSH : .::.:.::.: :..:.. .: :.. .:...:: . ::: .: .: : : . 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CCDS62 PSSSSVFNQNDPWAPTVDFSDFI-NNETIAGKDLVAWVTAGFLHIPHAEDIPNTVTVGNG 100 110 120 130 140 150 700 710 720 730 740 pF1KB5 VGFLLRPFNFFPEDPSLASRDTVIVW-PRDNGPNYVQRW--IPEDRDCSMP--PPFSYNG :::.:::.::: ::::. : :.. .: : :. .:. :. : : ::..: CCDS62 VGFFLRPYNFFDEDPSFYSADSIYFRGDQDAGACEVNPLACLPQAAACA-PDLPAFSHGG 160 170 180 190 200 210 750 pF1KB5 TYRPV CCDS62 FSHN 220 751 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 06:17:35 2016 done: Tue Nov 8 06:17:35 2016 Total Scan time: 2.920 Total Display time: 0.110 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]