FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5680, 519 aa 1>>>pF1KE5680 519 - 519 aa - 519 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0421+/-0.000825; mu= 14.4976+/- 0.049 mean_var=76.3699+/-15.278, 0's: 0 Z-trim(108.0): 70 B-trim: 83 in 1/51 Lambda= 0.146762 statistics sampled from 9879 (9950) to 9879 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16 Scan time: 3.590 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 3464 743.0 2e-214 CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 1879 407.4 2e-113 CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 1674 363.9 2.2e-100 CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 1004 222.1 1.1e-57 CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 966 214.0 3.1e-55 CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 962 213.2 4.9e-55 CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 921 204.5 2e-52 CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 904 200.9 3e-51 CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 742 166.7 1e-40 CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 716 161.2 4.3e-39 CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 665 150.3 4.7e-36 CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 603 137.2 4.3e-32 CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 583 133.0 1e-30 CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 577 131.7 2e-30 CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 572 130.6 3.7e-30 CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 571 130.4 4.6e-30 CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 563 128.7 1.8e-29 CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 550 126.0 1e-28 CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 540 123.9 5e-28 CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 500 115.4 1.7e-25 CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 500 115.4 1.8e-25 CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 500 115.4 1.9e-25 CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 500 115.4 1.9e-25 CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 500 115.4 1.9e-25 CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 500 115.4 1.9e-25 CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 419 98.3 2.8e-20 CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 419 98.3 2.8e-20 CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 400 94.2 3.9e-19 CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 395 93.2 9.6e-19 CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 395 93.2 9.8e-19 CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 390 92.1 2e-18 CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 382 90.4 6.5e-18 CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 307 74.5 3.1e-13 >>CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 (519 aa) initn: 3464 init1: 3464 opt: 3464 Z-score: 3963.3 bits: 743.0 E(32554): 2e-214 Smith-Waterman score: 3464; 99.6% identity (100.0% similar) in 519 aa overlap (1-519:1-519) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MPMPSRDGGLHPRHHHYGSHSPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 MPMPSRDGGLHPRHHHYGSHSPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 ILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 ILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 GVIVSFLAAGKLVLLQEMCALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 GVIVSFLAAGKLVLLQEMCALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 EDVLRQQRETRRPASHSSRWGLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 EDVLRQQRETRRPASHSSRWGLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 STMPDLRAEEDQGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 STMPDLRAEEDQGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 LAISPYYVSLAVSEEPPEDGKRPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTL ::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 LAISPYYVSLAVSEEPPEDGERPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 GLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 GLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 YGDMVPHSVPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQN ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 YGDMVPRSVPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQN 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE5 TGPASECELLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 TGPASECELLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM 490 500 510 >>CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 (513 aa) initn: 1907 init1: 1303 opt: 1879 Z-score: 2149.6 bits: 407.4 E(32554): 2e-113 Smith-Waterman score: 1879; 62.6% identity (84.6% similar) in 447 aa overlap (35-474:34-480) 10 20 30 40 50 pF1KE5 SRDGGLHPRHHHYGSHSPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDA-----SPVDLKK .::: .:::.... : .: : .. CCDS13 LPGDNSDYDYSALSCTSDASFHPAFLPQRQAIKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 EILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSA .:.::::: .: :::.:::.:::.::..:. : ....:...::::: .::::::.:.: CCDS13 RIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 FGVIVSFLAAGKLVLLQEMCALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLH ::.:..:: :::: ::.::::::::::: :::: : ::. :: :. :.:.::. :... . CCDS13 FGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYWGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVERE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 RED--VLRQQRETRRPASHSSRWGLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVS .:: . . :... :: .: : :: :::.::: :.::::::::::::.:::..:::. CCDS13 EEDDALDSEGRDSEGPAEGEGRLGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVN 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LCVSTMPDLRAEEDQGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNI : :::.:.:: ::.::.::. :. .::::..::.:::::: ::..:: .: :...::.. CCDS13 LSVSTLPSLREEEEQGHCSQMCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTL 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 IDILAISPYYVSLAVSEEPPEDGKRPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGL ::..:: :::..: :. : .:.:::.::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 IDLVAILPYYITLLVDGAAAGRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGL 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 QTLGLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMT ::::::.:::::::::::::: :::.::.::.:: :.: . ::::::: ::::.:.:: CCDS13 QTLGLTARRCTREFGLLLLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMT 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 TVGYGDMVPHSVPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRH :::::::::.:.:::.:::::::::::.::::.::::::::.::::::.:::... : CCDS13 TVGYGDMVPRSTPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQ 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 pF1KE5 LQNTGPASECELLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM CCDS13 FLIKTKSQLSVSQDSDILFGSASSDTRDNN 490 500 510 >>CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 (466 aa) initn: 1703 init1: 747 opt: 1674 Z-score: 1915.7 bits: 363.9 E(32554): 2.2e-100 Smith-Waterman score: 1674; 57.5% identity (78.8% similar) in 449 aa overlap (59-506:17-458) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 SPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKL ....::::: : : :..: : ::.:: .: CCDS12 MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARLERL 10 20 30 40 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 RLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMCALSFQEELA : ::........::::: . .:::::::: :: .::..: :::: ::. :::.:..::: CCDS12 RACRGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRDELA 50 60 70 80 90 100 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 YWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHREDVLRQQRETRRPASHSSRWGLCMNRLR ::::.::.:::::::.: :. :: : : : : . .: ::: CCDS12 YWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEARAGPTER--GAQGSPARALGPRGRLQRGRRRLR 110 120 130 140 150 160 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 EMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEEDQGECSRKCYYIFIVETI ..:.::.::: ::.:::.:. :::.:::.::.:::::.::::..:::: :: .:..::. CCDS12 DVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVLETV 170 180 190 200 210 220 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 CVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEPPEDGKRPSGSSY ::::::.:: :: .::..:: :...:::::::::. :.:::: .. :.:.. CCDS12 CVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAG-----PGGTKL 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 LEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITLFSPL ::..:::::.:::::.:::::::::::::..::::.:::.:::::::::: ::..::.:: CCDS12 LERAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPL 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 VYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPHSVPGQMVALSSILSGILIMAF :..::.: : .:.:.:::::::.:::::::::::::.:.:::.:::::::::::.::: CCDS12 VHLAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAF 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KE5 PATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECELLDPHVASEHE-LMNDVNDL :.::::::::.:: :::..:.. . ::. . : : . . : .: : CCDS12 PVTSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADA 400 410 420 430 440 450 510 pF1KE5 ILEGPALPIMHM CCDS12 LWVRAGR 460 >>CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 (477 aa) initn: 863 init1: 358 opt: 1004 Z-score: 1148.9 bits: 222.1 E(32554): 1.1e-57 Smith-Waterman score: 1004; 38.6% identity (70.1% similar) in 435 aa overlap (51-476:8-428) 30 40 50 60 70 pF1KE5 SPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKK-EILINVGGRRYLLPWSTLDR :.: .... :: ::::: . : :: : CCDS62 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLR 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 FPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMC :: .::..: ::.: : :..::::::. ..::.:::.: : .. : .::: .. :.: CCDS62 FPETRLGRLLLCHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELC 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 ALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLL-RKLEELEEL--AKLHREDVLRQQRETRRPASH ..::..:. ::::.: .. :: . ::.: .: . .:.. . : . CCDS62 VFSFSQEIEYWGINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYND 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 SSRW-GLCMNRLREMV----ENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEED .:.. : .. .:... .:: .. ..::. :::: : . ...:....::.. .. CCDS62 ASKFDGQPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDS 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 QGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLA ::. .. . ::: . .:::..:. ::. : : .::.. ::.::...: :.:..:. CCDS62 QGNPGEDPRF-EIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLV 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VSEEPPEDGKRPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREF :. . :. : ..: : .::: .::. ...::::: ::..:: :.. .: CCDS62 VNLVVE---STPT----LANLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEV 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 GLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPHSVPG :::::.:.:.:..:: ..:. ::: .. : ..::: .::: .:::::::::.:: .. : CCDS62 GLLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGL--ATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAG 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 pF1KE5 QMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECELLD ...: . ::.:::....: : ::. ::: : ..:.::.. .: CCDS62 KLTASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFY----RRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVN 390 400 410 420 430 440 500 510 pF1KE5 PHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM CCDS62 LRDYYAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR 450 460 470 >>CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 (491 aa) initn: 910 init1: 354 opt: 966 Z-score: 1105.2 bits: 214.0 E(32554): 3.1e-55 Smith-Waterman score: 966; 39.1% identity (67.8% similar) in 422 aa overlap (54-465:10-417) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 SQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLS : . .. . .:::: . . ::: ::: . CCDS16 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHT 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 RLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMCALSF ::.:: :.: : :..:::::. ..:..:::.:: : ...: .::: ...:.:..:: CCDS16 RLGKLLTCHSEEAILELCDDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSF 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 pF1KE5 QEELAYWGIEEAHLERCCL-RKLLRKLEELEELAKLHREDVLRQQR-------ETRRPAS .:. ::::.: .. :: : :: :. :. . .:: .. : . CCDS16 CQEIEYWGINELFIDSCCSNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKF 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 HSSRWGLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEEDQGEC . :.: ... .::: : .:..: :. : .. :..:: .: ... :. :: CCDS16 DTLRFGQLRKKIWIRMENPAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNED--GEV 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 SRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVS-- . . :: :.:::. :. .:.. : . .:...::::::...: :.:..:::. CCDS16 DDPV--LEGVEIACIAWFTGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTK 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 EEPPEDGKRPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGL :: :: .:..: :...:: .::. ...:::::.::..:: :.:. .: :: CCDS16 EEESED---------IENMGKVVQILRLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGL 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 LLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPHSVPGQM :::::.:.:..:: :.: .::.. .. .:::: .::: :::::::::: : .. :.. CCDS16 LLLFLSVGISIFSVLIYSVEKDD-HTSSLTSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKL 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 pF1KE5 VALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECELLDPH .: . :. :::..:.: : ::. ::. : . : CCDS16 IASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYYQKQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYA 390 400 410 420 430 440 500 510 pF1KE5 VASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM CCDS16 QRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIEDNEDICNTTSLENCTAK 450 460 470 480 490 >>CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (425 aa) initn: 1085 init1: 284 opt: 962 Z-score: 1101.6 bits: 213.2 E(32554): 4.9e-55 Smith-Waterman score: 1152; 44.0% identity (70.7% similar) in 416 aa overlap (61-465:11-409) 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 METPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRL ...:::: :: : : ::: :.:.:. CCDS42 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHG 10 20 30 40 100 110 120 130 140 pF1KE5 CRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAA-GKLVLLQEMCALSFQEELAY ::: ......:::::.. .:.:::: ::: :. .. . ::: . .:: ::: .:. : CCDS42 CRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIY 50 60 70 80 90 100 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 WGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHREDVLRQQRETRRP----ASHSSRWGLCMN ::.: :::: :: :.: .. . . . . :: :. :: :. : :: .. CCDS42 WGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSDTYTFYSADEPGVL--GRDEARPGGAEAAPSRRW---LE 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 RLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLR-AEEDQGECSRKCYYIFI :.:. :.: :.: ....: .:..:: .. : ::.::.:: : : :. . . : CCDS42 RMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSR---I 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 VETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEPPEDGKRPS .:.::..::. : .::. ...::.: . ::::::.:::.:::.:. .. :. CCDS42 IEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGEN----- 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 GSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITL : :...:..::::: .::..:..:::: .::::::::..:: ::. .::.:. ::... CCDS42 --SQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAI 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 pF1KE5 FSPLVYVAEKESGRVLE-----FTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPHSVPGQMVALSSI :: : . :. : :: ::::::. ::.:::::::::::: : .:::.... . CCDS42 FSALSQLLEH--GLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCV 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 pF1KE5 LSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECELLDPHVASEHE .:::...:.: : :.:.: . : ::: CCDS42 VSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN 390 400 410 420 >>CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (436 aa) initn: 940 init1: 291 opt: 921 Z-score: 1054.5 bits: 204.5 E(32554): 2e-52 Smith-Waterman score: 1144; 43.4% identity (69.6% similar) in 424 aa overlap (61-465:11-420) 40 50 60 70 80 90 pF1KE5 METPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRL ...:::: :: : : ::: :.:.:. CCDS18 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHG 10 20 30 40 100 110 120 130 140 pF1KE5 CRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAA-GKLVLLQEMCALSFQEELAY ::: ......:::::.. .:.:::: ::: :. .. . ::: . .:: ::: .:. : CCDS18 CRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIY 50 60 70 80 90 100 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 WGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHREDVLRQQRETRRP----ASHSSRWGLCMN ::.: :::: :: :.: .. . . . . :: :. :: :. : :: .. CCDS18 WGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSDTYTFYSADEPGVL--GRDEARPGGAEAAPSRRW---LE 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 RLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLR-AEEDQGECSRKCYYIF- :.:. :.: :.: ....: .:..:: .. : ::.::.:: : : :. . . : CCDS18 RMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAG 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 pF1KE5 -------IVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEP :.:.::..::. : .::. ...::.: . ::::::.:::.:::.:. .. CCDS18 PGREPSGIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFT 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 PEDGKRPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGLLLL :. : :...:..::::: .::..:..:::: .::::::::..:: ::. .::. CCDS18 GEN-------SQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLV 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 FLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLE-----FTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPHSVPG :. ::...:: : . :. : :: ::::::. ::.:::::::::::: : .::: CCDS18 FICVAMAIFSALSQLLEH--GLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPG 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 pF1KE5 QMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQNTGPASECELLD .... ..:::...:.: : :.:.: . : ::: CCDS18 RILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN 390 400 410 420 430 500 510 pF1KE5 PHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM >>CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 (545 aa) initn: 654 init1: 344 opt: 904 Z-score: 1033.5 bits: 200.9 E(32554): 3e-51 Smith-Waterman score: 904; 34.4% identity (65.4% similar) in 456 aa overlap (52-499:90-544) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 PWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDLKKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFP ..: : . . .::::. : : . : :: CCDS64 DGEEEDQWKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCELAGFP 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 LSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMCAL .::..: : . ..:::::.:...:.::::.:..: .. .: .: :..:. .: CCDS64 KTRLGRLATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLDGLCPR 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 SFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHREDVLRQQRETRRPASHSSR-W : :::.:::.. . ::: . .. .:: : :...: . : : . .. : . CCDS64 RFLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRAQAQVEEAEELFRDMRFY 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 GLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVSTMPDLRAEEDQGECSRKCY : :: ...:.: :.. .:... : :: ...:.: ..:. ... . ::: . CCDS64 GPQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGEGGPDLR 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 pF1KE5 YIFI-VETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEPPED :. :: .:...:.::. ::.... : .: .. ::..:..:: : :..: . : CCDS64 PILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLECFTGEG 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 GKRPSGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGLLLLFLA .: . . . ::: ::::.: .::. ...::::: ::...:.:.:.: .. : ::::.: CCDS64 HQRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGCLLLFIA 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 VAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTVGYGDMVPHSVPGQMVALSSI ..: :: :: .:.. . .::.:: :.::: .:..::::::: :.. :.. :. : CCDS64 MGIFTFSAAVYSVEHDVPST-NFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRFFAFLCI 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 490 pF1KE5 LSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARLRHLQN-----TGPASECEL-LDPH ::.. ..: . ... :: : .:: . : : : .:: : .:. CCDS64 AFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKAYEYTTIRRERGEVNFMQRARKKIAECLLGSNPQ 480 490 500 510 520 530 500 510 pF1KE5 VASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM .. ..: CCDS64 LTPRQEN 540 >>CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 (911 aa) initn: 835 init1: 401 opt: 742 Z-score: 844.6 bits: 166.7 E(32554): 1e-40 Smith-Waterman score: 1169; 39.2% identity (70.1% similar) in 485 aa overlap (31-502:1-466) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MPMPSRDGGLHPRHHHYGSHSPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDL--- : . :: . :.. .: :::. CCDS62 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRS 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 ---KKEILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFD .... ::::: . . : ::::.: .::.::: : ..: ....::::. . .:.::: CCDS62 KTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFD 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 RSPSAFGVIVSFLAAGKLVLLQEMCALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEE : :.:: :..: .::: ...::::::: .:: ::::.: .:: :: . .: :...: CCDS62 RHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNE 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 LAKLHREDVLRQQRETRRPASHSSRWGLCMNR---LREMVENPQSGLPGKVFACLSILFV .:.:: ..:: .. . : .. : ...:.:.:.. .:..: .::::. CCDS62 --ELRREAETMREREGEEFDNTC-----CPDKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFI 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 ATTAVSLCVSTMPDLRAEEDQGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFF . ....: ..:.:.:. .. :. . . . ::..:.:::..:. :::... .: .:: CCDS62 VLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDN-RQLAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFF 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 pF1KE5 QGPLNIIDILAISPYYVSLAVSEEPPEDGKRPSGSSYLE--KVGLVLRVLRALRILYVMR .::::.::.::: ::::.. ..: :..: :. .: :....: .::: ... CCDS62 KGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTE---------SNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILK 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 LARHSLGLQTLGLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASY ::::: :::.::.:.:: :.:::.::::..: .:: ::. :::. . .:::::::. CCDS62 LARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDED-ATKFTSIPASF 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 WWAIISMTTVGYGDMVPHSVPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQE ::: :.::::::::. :... :..:. ..:.:..:.: : ..::. : : :.... CCDS62 WWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEK 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 pF1KE5 QLQAR--LRHLQNTGPASECELLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM .. : :.. . .: .: : : ::.. CCDS62 AIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAF-ARSMELIDVAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSR 440 450 460 470 480 490 CCDS62 WKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKLEMLYNEITKTQ 500 510 520 530 540 550 >>CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 (858 aa) initn: 1005 init1: 397 opt: 716 Z-score: 815.3 bits: 161.2 E(32554): 4.3e-39 Smith-Waterman score: 1135; 38.2% identity (71.3% similar) in 477 aa overlap (38-504:4-464) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 GGLHPRHHHYGSHSPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDASPVDL------KKEI :. . :....: :... .... CCDS13 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRV 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 LINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSAFG .:::: . . : ::::.: .::.::: : ... ....::::. :..:.:::: :.:: CCDS13 RLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFT 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 VIVSFLAAGKLVLLQEMCALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLHRE :..: .:.: ...:::::::..:: ::::.: .:: :: . .: :...: .:.:: CCDS13 SILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNE--ELKRE 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 DVLRQQRETRRPASHSSRWGLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVSLCVS ..:: .. . . ..: ...:.:.:.. .:..: .::.:.. ....: .. CCDS13 AETLREREGEEFDNTCC--AEKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLN 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 TMPDLRAEEDQGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNIIDIL :.:.:.. .. :. : . ::..:.:::..:. :::... : .::.:::: ::.: CCDS13 TLPELQSLDEFGQ-STDNPQLAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLL 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 pF1KE5 AISPYYVSLAVSEEPPEDGKRPSGSSYLE--KVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQT :: ::::.. ..: :..: :. .: :....: .::: ...::::: :::. CCDS13 AILPYYVTIFLTE---------SNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQS 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 LGLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIISMTTV ::.:.:: :.:::.::::..: .:: ::. :::. . .: :::::.::: :.:::: CCDS13 LGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDDT-KFKSIPASFWWATITMTTV 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 GYGDMVPHSVPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQAR--LRH ::::. :... :..:. ..:.:..:.: : ..::. : : :.... .. : :.. CCDS13 GYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALER 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 pF1KE5 LQNTGPASECELLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM . .: .. : . : :.:. : CCDS13 AKRNGSIVSMNMKDAFARSI-EMMDIVVEKNGENMGKKDKVQDNHLSPNKWKWTKRTLSE 440 450 460 470 480 490 519 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 05:48:16 2016 done: Tue Nov 8 05:48:17 2016 Total Scan time: 3.590 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]