Result of FASTA (ccds) for pFN21AE6785
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6785, 640 aa
  1>>>pF1KE6785 640 - 640 aa - 640 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0967+/-0.000819; mu= 12.0046+/- 0.049
 mean_var=118.3724+/-23.740, 0's: 0 Z-trim(110.5): 27  B-trim: 4 in 1/52
 Lambda= 0.117882
 statistics sampled from 11618 (11640) to 11618 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.358), width:  16
 Scan time:  2.800

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9602.1 AP1G2 gene_id:8906|Hs108|chr14          ( 785) 3874 670.0 3.3e-192
CCDS32480.1 AP1G1 gene_id:164|Hs108|chr16          ( 822) 1997 350.8 4.3e-96
CCDS45522.1 AP1G1 gene_id:164|Hs108|chr16          ( 825) 1981 348.1 2.8e-95
CCDS46148.1 AP2A1 gene_id:160|Hs108|chr19          ( 977)  502 96.6 1.7e-19
CCDS46149.1 AP2A1 gene_id:160|Hs108|chr19          ( 955)  492 94.9 5.4e-19
CCDS58362.1 AP4E1 gene_id:23431|Hs108|chr15        (1062)  444 86.8 1.7e-16
CCDS32240.1 AP4E1 gene_id:23431|Hs108|chr15        (1137)  444 86.8 1.8e-16
CCDS44512.1 AP2A2 gene_id:161|Hs108|chr11          ( 939)  431 84.5 7.1e-16
CCDS73234.1 AP2A2 gene_id:161|Hs108|chr11          ( 940)  431 84.5 7.1e-16


>>CCDS9602.1 AP1G2 gene_id:8906|Hs108|chr14               (785 aa)
 initn: 3866 init1: 3866 opt: 3874  Z-score: 3564.2  bits: 670.0 E(32554): 3.3e-192
Smith-Waterman score: 3874; 95.1% identity (96.5% similar) in 635 aa overlap (11-640:151-785)

                                   10        20           30       
pF1KE6                     MDRRIENRMGTPAHRRRVVHTHRHTRNR---LSCPWPPPF
                                     .:  :.... :  :   .   ::  . :: 
CCDS96 GLALCTLSTMGSAEMCRDLAPEVEKLLLQPSPYVRKKAILTAVHMIRKVPELSSVFLPPC
              130       140       150       160       170       180

          40        50        60        70        80        90     
pF1KE6 TS--PTLTPGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQLVHILRTLVTMGYSTEHSISG
       ..       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 AQLLHERHHGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQLVHILRTLVTMGYSTEHSISG
              190       200       210       220       230       240

         100       110       120       130       140       150     
pF1KE6 VSDPFLQVQILRLLRILGRNHEESSETMNDLLAQVATNTDTSRNAGNAVLFETVLTIMDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 VSDPFLQVQILRLLRILGRNHEESSETMNDLLAQVATNTDTSRNAGNAVLFETVLTIMDI
              250       260       270       280       290       300

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE6 RSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVALTSLLRLVQSDHSAVQRHRPTVVECLRETDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 RSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVALTSLLRLVQSDHSAVQRHRPTVVECLRETDA
              310       320       330       340       350       360

         220       230       240       250       260       270     
pF1KE6 SLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQELQAFLESCPPDLRADCASGILLAAERFAPTKRWHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 SLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQELQAFLESCPPDLRADCASGILLAAERFAPTKRWHI
              370       380       390       400       410       420

         280       290       300       310       320       330     
pF1KE6 DTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLIGGAQELHAYSVRRLYNALAEDISQQPLVQVAAWC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 DTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLIGGAQELHAYSVRRLYNALAEDISQQPLVQVAAWC
              430       440       450       460       470       480

         340       350       360       370       380       390     
pF1KE6 IGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEEVLALLEKVLQSHMSLPATRGYALTALMKLSTRLCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 IGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEEVLALLEKVLQSHMSLPATRGYALTALMKLSTRLCG
              490       500       510       520       530       540

         400       410       420       430       440       450     
pF1KE6 DNNRIRQVVSIYGSCLDVELQQRAVEYDTLFRKYDHMRAAILEKMPLVERDGPQADEEAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 DNNRIRQVVSIYGSCLDVELQQRAVEYDTLFRKYDHMRAAILEKMPLVERDGPQADEEAK
              550       560       570       580       590       600

         460       470       480       490       500       510     
pF1KE6 ESKEAAQLSEAAPVPTEPQASQLLDLLDLLDGASGDVQHPPHLDPSPGGALVHLLDLPCV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 ESKEAAQLSEAAPVPTEPQASQLLDLLDLLDGASGDVQHPPHLDPSPGGALVHLLDLPCV
              610       620       630       640       650       660

         520       530       540       550       560       570     
pF1KE6 PPPPAPIPDLKVFEREGVQLNLSFIRPPENPALLLITITATNFSEGDVTHFICQAAVPKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 PPPPAPIPDLKVFEREGVQLNLSFIRPPENPALLLITITATNFSEGDVTHFICQAAVPKS
              670       680       690       700       710       720

         580       590       600       610       620       630     
pF1KE6 LQLQLQAPSGNTVPARGGLPITQLFRILNPNKAPLRLKLRLTYDHFHQSVQEIFEVNNLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 LQLQLQAPSGNTVPARGGLPITQLFRILNPNKAPLRLKLRLTYDHFHQSVQEIFEVNNLP
              730       740       750       760       770       780

         640
pF1KE6 VESWQ
       :::::
CCDS96 VESWQ
            

>>CCDS32480.1 AP1G1 gene_id:164|Hs108|chr16               (822 aa)
 initn: 2258 init1: 1894 opt: 1997  Z-score: 1838.7  bits: 350.8 E(32554): 4.3e-96
Smith-Waterman score: 2272; 57.1% identity (79.7% similar) in 629 aa overlap (45-634:189-816)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KE6 RRRVVHTHRHTRNRLSCPWPPPFTSPTLTPGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQ
                                     :.:  ...:.::.:::::  : ::::.:::
CCDS32 LCAVHVIRKVPELMEMFLPATKNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQ
      160       170       180       190       200       210        

           80        90       100       110       120       130    
pF1KE6 LVHILRTLVTMGYSTEHSISGVSDPFLQVQILRLLRILGRNHEESSETMNDLLAQVATNT
       ::.::..:.  ::: ::..::.:::::::.::::::::::: ..:::.:::.::::::::
CCDS32 LVRILKNLIMSGYSPEHDVSGISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVATNT
      220       230       240       250       260       270        

          140       150       160       170       180       190    
pF1KE6 DTSRNAGNAVLFETVLTIMDIRSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVALTSLLRLVQS
       .::.:.:::.:.:::::::::.: .::::::.:::::::::.:.:::::::::::. ::.
CCDS32 ETSKNVGNAILYETVLTIMDIKSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSLLKTVQT
      280       290       300       310       320       330        

          200       210       220       230       240       250    
pF1KE6 DHSAVQRHRPTVVECLRETDASLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQELQAFLESCPPDLRA
       ::.:::::: :.:.::.. :.:..:::.:::.::::..:.:.::.::  ::.:: :...:
CCDS32 DHNAVQRHRSTIVDCLKDLDVSIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPEFKA
      340       350       360       370       380       390        

          260       270       280       290       300       310    
pF1KE6 DCASGILLAAERFAPTKRWHIDTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLIGGAQELHAYSVRR
       ::::::.::::..::.::::::::..::::::..:::::: :: ::: .. :.:::.:.:
CCDS32 DCASGIFLAAEKYAPSKRWHIDTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQR
      400       410       420       430       440       450        

          320       330       340       350       360       370    
pF1KE6 LYNALAEDISQQPLVQVAAWCIGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEEVLALLEKVLQSHMS
       ::.:.  : ::::::::::::::::::::..:.::: ::.:: :.::: .::.:: :.::
CCDS32 LYKAILGDYSQQPLVQVAAWCIGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMS
      460       470       480       490       500       510        

          380       390       400       410       420       430    
pF1KE6 LPATRGYALTALMKLSTRLCGDNNRIRQVVSIYGSCLDVELQQRAVEYDTLFRKYDHMRA
         .::::::::.::::::.    :::..::::::: .:::::::::::..::.::::::.
CCDS32 TSVTRGYALTAIMKLSTRFTCTVNRIKKVVSIYGSSIDVELQQRAVEYNALFKKYDHMRS
      520       530       540       550       560       570        

          440          450       460       470        480          
pF1KE6 AILEKMPLVER---DGPQADEEAKESKEAAQLSEAAPVPTEPQ-ASQLLDLLDLLDGA--
       :.::.::..:.   .::    ...   : : : :. : :. :: .::  :::::: :   
CCDS32 ALLERMPVMEKVTTNGPTEIVQTNGETEPAPL-ETKPPPSGPQPTSQANDLLDLLGGNDI
      580       590       600       610        620       630       

      490       500        510                                     
pF1KE6 SGDVQHPPHLDPSP-GGALVHLL----------------DLPCVPPPP------------
       .  .   :   ::  :: :. ::                ..: .  ::            
CCDS32 TPVIPTAPTSKPSSAGGELLDLLGDINLTGAPAAAPAPASVPQISQPPFLLDGLSSQPLF
       640       650       660       670       680       690       

         520       530       540       550       560       570     
pF1KE6 ----APIPDLKVFEREGVQLNLSFIRPPENPALLLITITATNFSEGDVTHFICQAAVPKS
           : ::.. .. ..:......: :   ::.. .::: :.: .: :.: :. ::::::.
CCDS32 NDIAAGIPSITAYSKNGLKIEFTFERSNTNPSVTVITIQASNSTELDMTDFVFQAAVPKT
       700       710       720       730       740       750       

         580       590       600       610       620       630     
pF1KE6 LQLQLQAPSGNTVPARGGLPITQLFRILNPNKAPLRLKLRLTYDHFHQSVQEIFEVNNLP
       .:::: .::.. ::: .   :::....:::.:  ::....:::.:  ...:.. ::::. 
CCDS32 FQLQLLSPSSSIVPAFNTGTITQVIKVLNPQKQQLRMRIKLTYNHKGSAMQDLAEVNNFP
       760       770       780       790       800       810       

         640
pF1KE6 VESWQ
            
CCDS32 PQSWQ
       820  

>>CCDS45522.1 AP1G1 gene_id:164|Hs108|chr16               (825 aa)
 initn: 2172 init1: 1808 opt: 1981  Z-score: 1824.0  bits: 348.1 E(32554): 2.8e-95
Smith-Waterman score: 2256; 56.8% identity (79.3% similar) in 632 aa overlap (45-634:189-819)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KE6 RRRVVHTHRHTRNRLSCPWPPPFTSPTLTPGILLGTITLITELCERSPAALRHFRK---V
                                     :.:  ...:.::.:::::  : ::::   .
CCDS45 LCAVHVIRKVPELMEMFLPATKNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKNEKL
      160       170       180       190       200       210        

              80        90       100       110       120       130 
pF1KE6 VPQLVHILRTLVTMGYSTEHSISGVSDPFLQVQILRLLRILGRNHEESSETMNDLLAQVA
       :::::.::..:.  ::: ::..::.:::::::.::::::::::: ..:::.:::.:::::
CCDS45 VPQLVRILKNLIMSGYSPEHDVSGISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVA
      220       230       240       250       260       270        

             140       150       160       170       180       190 
pF1KE6 TNTDTSRNAGNAVLFETVLTIMDIRSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVALTSLLRL
       :::.::.:.:::.:.:::::::::.: .::::::.:::::::::.:.:::::::::::. 
CCDS45 TNTETSKNVGNAILYETVLTIMDIKSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSLLKT
      280       290       300       310       320       330        

             200       210       220       230       240       250 
pF1KE6 VQSDHSAVQRHRPTVVECLRETDASLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQELQAFLESCPPD
       ::.::.:::::: :.:.::.. :.:..:::.:::.::::..:.:.::.::  ::.:: :.
CCDS45 VQTDHNAVQRHRSTIVDCLKDLDVSIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPE
      340       350       360       370       380       390        

             260       270       280       290       300       310 
pF1KE6 LRADCASGILLAAERFAPTKRWHIDTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLIGGAQELHAYS
       ..:::::::.::::..::.::::::::..::::::..:::::: :: ::: .. :.:::.
CCDS45 FKADCASGIFLAAEKYAPSKRWHIDTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYT
      400       410       420       430       440       450        

             320       330       340       350       360       370 
pF1KE6 VRRLYNALAEDISQQPLVQVAAWCIGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEEVLALLEKVLQS
       :.:::.:.  : ::::::::::::::::::::..:.::: ::.:: :.::: .::.:: :
CCDS45 VQRLYKAILGDYSQQPLVQVAAWCIGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLIS
      460       470       480       490       500       510        

             380       390       400       410       420       430 
pF1KE6 HMSLPATRGYALTALMKLSTRLCGDNNRIRQVVSIYGSCLDVELQQRAVEYDTLFRKYDH
       .::  .::::::::.::::::.    :::..::::::: .:::::::::::..::.::::
CCDS45 NMSTSVTRGYALTAIMKLSTRFTCTVNRIKKVVSIYGSSIDVELQQRAVEYNALFKKYDH
      520       530       540       550       560       570        

             440          450       460       470        480       
pF1KE6 MRAAILEKMPLVER---DGPQADEEAKESKEAAQLSEAAPVPTEPQ-ASQLLDLLDLLDG
       ::.:.::.::..:.   .::    ...   : : : :. : :. :: .::  :::::: :
CCDS45 MRSALLERMPVMEKVTTNGPTEIVQTNGETEPAPL-ETKPPPSGPQPTSQANDLLDLLGG
      580       590       600       610        620       630       

         490       500        510                                  
pF1KE6 A--SGDVQHPPHLDPSP-GGALVHLL----------------DLPCVPPPP---------
          .  .   :   ::  :: :. ::                ..: .  ::         
CCDS45 NDITPVIPTAPTSKPSSAGGELLDLLGDINLTGAPAAAPAPASVPQISQPPFLLDGLSSQ
       640       650       660       670       680       690       

            520       530       540       550       560       570  
pF1KE6 -------APIPDLKVFEREGVQLNLSFIRPPENPALLLITITATNFSEGDVTHFICQAAV
              : ::.. .. ..:......: :   ::.. .::: :.: .: :.: :. ::::
CCDS45 PLFNDIAAGIPSITAYSKNGLKIEFTFERSNTNPSVTVITIQASNSTELDMTDFVFQAAV
       700       710       720       730       740       750       

            580       590       600       610       620       630  
pF1KE6 PKSLQLQLQAPSGNTVPARGGLPITQLFRILNPNKAPLRLKLRLTYDHFHQSVQEIFEVN
       ::..:::: .::.. ::: .   :::....:::.:  ::....:::.:  ...:.. :::
CCDS45 PKTFQLQLLSPSSSIVPAFNTGTITQVIKVLNPQKQQLRMRIKLTYNHKGSAMQDLAEVN
       760       770       780       790       800       810       

            640
pF1KE6 NLPVESWQ
       :.      
CCDS45 NFPPQSWQ
       820     

>>CCDS46148.1 AP2A1 gene_id:160|Hs108|chr19               (977 aa)
 initn: 459 init1: 223 opt: 502  Z-score: 463.5  bits: 96.6 E(32554): 1.7e-19
Smith-Waterman score: 616; 29.3% identity (55.7% similar) in 546 aa overlap (45-550:202-719)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KE6 RRRVVHTHRHTRNRLSCPWPPPFTSPTLTPGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQ
                                     :.. ....::: ::...:     :.  :  
CCDS46 LLRLYKASPDLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPD---DFKTCVSL
             180       190       200       210       220           

           80          90       100       110                120   
pF1KE6 LVHILRTLVTMGYST--EHSISGVSDPFLQVQILRLLR---------ILGRNHEESSETM
        :  :  .:. . .   ...   :  :.:.:..::::.         . ::  :    ..
CCDS46 AVSRLSRIVSSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVECLETVL
      230       240       250       260       270       280        

           130       140       150       160       170       180   
pF1KE6 NDLLAQVATNTDTSRNAGNAVLFETVLTIMDIRSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYV
       :       ..     :: ::.::::.  :.   :  .: : : : ::.:: . . :.::.
CCDS46 NKAQEPPKSKKVQHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYL
      290       300       310       320       330       340        

           190         200       210        220       230       240
pF1KE6 ALTSLLRLVQSD--HSAVQRHRPTVVECLR-ETDASLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQE
       :: :.  :..:.  : ::. :  ::.. :. : :.:. .:: .:  :. . ::.. ...:
CCDS46 ALESMCTLASSEFSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAKQIVSE
      350       360       370       380       390       400        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 LQAFLESCPPDLRADCASGILLAAERFAPTKRWHIDTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQL
       .  .::.    .: . .  . . ::..:    :..::::...  :: .: ...   . :.
CCDS46 MLRYLETADYAIREEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVLQI
      410       420       430       440       450       460        

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 IGGAQELHAYSVRRLYNALAEDISQQPLVQVAAWCIGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEE
       . . .....:... ...::     .. .:.:... .::.:.:. ::. .   :.:     
CCDS46 VTNRDDVQGYAAKTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLI-AGDPRSSPPVQ-----
      470       480       490       500       510        520       

              370       380       390       400       410          
pF1KE6 VLALLEKVLQSHMSLPATRGYALTALMKLSTRLCGDNNRIRQVVSIYGSCL---DVELQQ
        ..::..  . :.   :::.  :.. .:.   :  ...   : :   :: :   ::::::
CCDS46 -FSLLHS--KFHLCSVATRALLLSTYIKF-INLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQ
               530       540        550       560       570        

       420        430       440                   450       460    
pF1KE6 RAVEYDTLFR-KYDHMRAAILEKMP------------LVERDGPQADEEAKESKEAAQLS
       ::::: ::       . :..::.::            : .. :: :     ....  . .
CCDS46 RAVEYLTLSSVASTDVLATVLEEMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSN
      580       590       600       610       620       630        

              470        480       490       500          510      
pF1KE6 EAA----PVP-TEPQASQLLDLLDLLDGASGDVQHPPHLDPSPGGA---LVHLLDLPCVP
       .      :.: :    :   ::: :       .  ::   :. .::   :: ..: : . 
CCDS46 DINGGMEPTPSTVSTPSPSADLLGL------RAAPPPAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQ
      640       650       660             670       680       690  

        520       530       540         550       560       570    
pF1KE6 PPPAPIPDLKVFEREGVQLNLSFIRPP--ENPALLLITITATNFSEGDVTHFICQAAVPK
       :  .: :. ..:        :: ..::  :.:  ::                        
CCDS46 PSLGPTPE-EAF--------LSELEPPAPESPMALLADPAPAADPGPEDIGPPIPEADEL
            700                710       720       730       740   

          580       590       600       610       620       630    
pF1KE6 SLQLQLQAPSGNTVPARGGLPITQLFRILNPNKAPLRLKLRLTYDHFHQSVQEIFEVNNL
                                                                   
CCDS46 LNKFVCKNNGVLFENQLLQIGVKSEFRQNLGRMYLFYGNKTSVQFQNFSPTVVHPGDLQT
           750       760       770       780       790       800   

>>CCDS46149.1 AP2A1 gene_id:160|Hs108|chr19               (955 aa)
 initn: 486 init1: 223 opt: 492  Z-score: 454.4  bits: 94.9 E(32554): 5.4e-19
Smith-Waterman score: 606; 29.2% identity (56.0% similar) in 518 aa overlap (45-524:202-700)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KE6 RRRVVHTHRHTRNRLSCPWPPPFTSPTLTPGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQ
                                     :.. ....::: ::...:     :.  :  
CCDS46 LLRLYKASPDLVPMGEWTARVVHLLNDQHMGVVTAAVSLITCLCKKNPD---DFKTCVSL
             180       190       200       210       220           

           80          90       100       110                120   
pF1KE6 LVHILRTLVTMGYST--EHSISGVSDPFLQVQILRLLR---------ILGRNHEESSETM
        :  :  .:. . .   ...   :  :.:.:..::::.         . ::  :    ..
CCDS46 AVSRLSRIVSSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDAAVKGRLVECLETVL
      230       240       250       260       270       280        

           130       140       150       160       170       180   
pF1KE6 NDLLAQVATNTDTSRNAGNAVLFETVLTIMDIRSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYV
       :       ..     :: ::.::::.  :.   :  .: : : : ::.:: . . :.::.
CCDS46 NKAQEPPKSKKVQHSNAKNAILFETISLIIHYDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYL
      290       300       310       320       330       340        

           190         200       210        220       230       240
pF1KE6 ALTSLLRLVQSD--HSAVQRHRPTVVECLR-ETDASLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQE
       :: :.  :..:.  : ::. :  ::.. :. : :.:. .:: .:  :. . ::.. ...:
CCDS46 ALESMCTLASSEFSHEAVKTHIDTVINALKTERDVSVRQRAADLLYAMCDRSNAKQIVSE
      350       360       370       380       390       400        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 LQAFLESCPPDLRADCASGILLAAERFAPTKRWHIDTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQL
       .  .::.    .: . .  . . ::..:    :..::::...  :: .: ...   . :.
CCDS46 MLRYLETADYAIREEIVLKVAILAEKYAVDYSWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVLQI
      410       420       430       440       450       460        

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 IGGAQELHAYSVRRLYNALAEDISQQPLVQVAAWCIGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEE
       . . .....:... ...::     .. .:.:... .::.:.:. ::. .   :.:     
CCDS46 VTNRDDVQGYAAKTVFEALQAPACHENMVKVGGYILGEFGNLI-AGDPRSSPPVQ-----
      470       480       490       500       510        520       

              370       380       390       400       410          
pF1KE6 VLALLEKVLQSHMSLPATRGYALTALMKLSTRLCGDNNRIRQVVSIYGSCL---DVELQQ
        ..::..  . :.   :::.  :.. .:.   :  ...   : :   :: :   ::::::
CCDS46 -FSLLHS--KFHLCSVATRALLLSTYIKF-INLFPETKATIQGVLRAGSQLRNADVELQQ
               530       540        550       560       570        

       420        430       440                   450       460    
pF1KE6 RAVEYDTLFR-KYDHMRAAILEKMP------------LVERDGPQADEEAKESKEAAQLS
       ::::: ::       . :..::.::            : .. :: :     ....  . .
CCDS46 RAVEYLTLSSVASTDVLATVLEEMPPFPERESSILAKLKRKKGPGAGSALDDGRRDPSSN
      580       590       600       610       620       630        

              470        480       490       500          510      
pF1KE6 EAA----PVP-TEPQASQLLDLLDLLDGASGDVQHPPHLDPSPGGA---LVHLLDLPCVP
       .      :.: :    :   ::: :       .  ::   :. .::   :: ..: : . 
CCDS46 DINGGMEPTPSTVSTPSPSADLLGL------RAAPPPAAPPASAGAGNLLVDVFDGPAAQ
      640       650       660             670       680       690  

        520       530       540       550       560       570      
pF1KE6 PPPAPIPDLKVFEREGVQLNLSFIRPPENPALLLITITATNFSEGDVTHFICQAAVPKSL
       :  .: :.                                                    
CCDS46 PSLGPTPEEAFLSPGPEDIGPPIPEADELLNKFVCKNNGVLFENQLLQIGVKSEFRQNLG
            700       710       720       730       740       750  

>>CCDS58362.1 AP4E1 gene_id:23431|Hs108|chr15             (1062 aa)
 initn: 334 init1: 285 opt: 444  Z-score: 409.6  bits: 86.8 E(32554): 1.7e-16
Smith-Waterman score: 506; 25.5% identity (63.0% similar) in 400 aa overlap (45-434:145-530)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KE6 RRRVVHTHRHTRNRLSCPWPPPFTSPTLTPGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQ
                                     :.. ... .  .. ... ..   .. .. .
CCDS58 LALYKFHLIAPNQVQHIHIKFRKALCDRDVGVMAASLHIYLRMIKENSSG---YKDLTGS
          120       130       140       150       160          170 

           80        90       100       110       120       130    
pF1KE6 LVHILRTLVTMGYSTEHSISGVSDPFLQVQILRLLRILGRNHEESSETMNDLLAQVATNT
       .: ::. .:     .: .  .:  :.::.:.::.: .::.. ...:: : :.: .    .
CCDS58 FVTILKQVVGGKLPVEFNYHSVPAPWLQIQLLRILGLLGKDDQRTSELMYDVLDESLRRA
             180       190       200       210       220       230 

          140       150       160       170       180       190    
pF1KE6 DTSRNAGNAVLFETVLTIMDIRSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVALTSLLRLVQS
       . ..:.  :.::: : :...:   . :   :.. .:.:.:.   :..:..: .:  ..:.
CCDS58 ELNHNVTYAILFECVHTVYSIYPKSELLEKAAKCIGKFVLSPKINLKYLGLKALTYVIQQ
             240       250       260       270       280       290 

          200       210       220       230       240       250    
pF1KE6 DHSAVQRHRPTVVECLRETDASLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQELQAFLESCPPD-LR
       : . . .:. :..::: . :  ..:..:::   ..:..:. ...:..  .:..   . . 
CCDS58 DPTLALQHQMTIIECLDHPDPIIKRETLELLYRITNAQNITVIVQKMLEYLHQSKEEYVI
             300       310       320       330       340       350 

           260       270       280       290       300             
pF1KE6 ADCASGILLAAERFAPTKRWHIDTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLIGGA-------QE
       .. .. :   ::..:: . : :.:.  :....:  .. :   :. .:.. .       :.
CCDS58 VNLVGKIAELAEKYAPDNAWFIQTMNAVFSVGGDVMHPDIPNNFLRLLAEGFDDETEDQQ
             360       370       380       390       400       410 

        310        320        330       340       350       360    
pF1KE6 LHAYSVRRLYNAL-AEDI-SQQPLVQVAAWCIGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEEVLAL
       :. :.:.   . :  :..   : ..:: .: .:::. ::     ..  :     :::.: 
CCDS58 LRLYAVQSYLTLLDMENVFYPQRFLQVMSWVLGEYSYLL-----DKETP-----EEVIAK
             420       430       440       450                 460 

          370       380       390       400       410       420    
pF1KE6 LEKVLQSHMSLPATRGYALTALMKLSTRLCGDNNRIRQVVSIYGSCLDVELQQRAVEYDT
       : :.:..      :... ..:. ::...   ..: .....  .   ::. ..:.: :   
CCDS58 LYKLLMNDSVSSETKAWLIAAVTKLTSQ-AHSSNTVERLIHEFTISLDTCMRQHAFELKH
             470       480        490       500       510       520

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pF1KE6 LFRKYDHMRAAILEKMPLVERDGPQADEEAKESKEAAQLSEAAPVPTEPQASQLLDLLDL
       : .. . :..                                                  
CCDS58 LHENVELMKSLLPVDRSCEDLVVDASLSFLDGFVAEGLSQGAAPYKPPHQRQEEKLSQEK
              530       540       550       560       570       580

>>CCDS32240.1 AP4E1 gene_id:23431|Hs108|chr15             (1137 aa)
 initn: 334 init1: 285 opt: 444  Z-score: 409.2  bits: 86.8 E(32554): 1.8e-16
Smith-Waterman score: 506; 25.5% identity (63.0% similar) in 400 aa overlap (45-434:220-605)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KE6 RRRVVHTHRHTRNRLSCPWPPPFTSPTLTPGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQ
                                     :.. ... .  .. ... ..   .. .. .
CCDS32 LALYKFHLIAPNQVQHIHIKFRKALCDRDVGVMAASLHIYLRMIKENSSG---YKDLTGS
     190       200       210       220       230          240      

           80        90       100       110       120       130    
pF1KE6 LVHILRTLVTMGYSTEHSISGVSDPFLQVQILRLLRILGRNHEESSETMNDLLAQVATNT
       .: ::. .:     .: .  .:  :.::.:.::.: .::.. ...:: : :.: .    .
CCDS32 FVTILKQVVGGKLPVEFNYHSVPAPWLQIQLLRILGLLGKDDQRTSELMYDVLDESLRRA
        250       260       270       280       290       300      

          140       150       160       170       180       190    
pF1KE6 DTSRNAGNAVLFETVLTIMDIRSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVALTSLLRLVQS
       . ..:.  :.::: : :...:   . :   :.. .:.:.:.   :..:..: .:  ..:.
CCDS32 ELNHNVTYAILFECVHTVYSIYPKSELLEKAAKCIGKFVLSPKINLKYLGLKALTYVIQQ
        310       320       330       340       350       360      

          200       210       220       230       240       250    
pF1KE6 DHSAVQRHRPTVVECLRETDASLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQELQAFLESCPPD-LR
       : . . .:. :..::: . :  ..:..:::   ..:..:. ...:..  .:..   . . 
CCDS32 DPTLALQHQMTIIECLDHPDPIIKRETLELLYRITNAQNITVIVQKMLEYLHQSKEEYVI
        370       380       390       400       410       420      

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pF1KE6 ADCASGILLAAERFAPTKRWHIDTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLIGGA-------QE
       .. .. :   ::..:: . : :.:.  :....:  .. :   :. .:.. .       :.
CCDS32 VNLVGKIAELAEKYAPDNAWFIQTMNAVFSVGGDVMHPDIPNNFLRLLAEGFDDETEDQQ
        430       440       450       460       470       480      

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pF1KE6 LHAYSVRRLYNAL-AEDI-SQQPLVQVAAWCIGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEEVLAL
       :. :.:.   . :  :..   : ..:: .: .:::. ::     ..  :     :::.: 
CCDS32 LRLYAVQSYLTLLDMENVFYPQRFLQVMSWVLGEYSYLL-----DKETP-----EEVIAK
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pF1KE6 LEKVLQSHMSLPATRGYALTALMKLSTRLCGDNNRIRQVVSIYGSCLDVELQQRAVEYDT
       : :.:..      :... ..:. ::...   ..: .....  .   ::. ..:.: :   
CCDS32 LYKLLMNDSVSSETKAWLIAAVTKLTSQ-AHSSNTVERLIHEFTISLDTCMRQHAFELKH
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pF1KE6 LFRKYDHMRAAILEKMPLVERDGPQADEEAKESKEAAQLSEAAPVPTEPQASQLLDLLDL
       : .. . :..                                                  
CCDS32 LHENVELMKSLLPVDRSCEDLVVDASLSFLDGFVAEGLSQGAAPYKPPHQRQEEKLSQEK
         600       610       620       630       640       650     

>>CCDS44512.1 AP2A2 gene_id:161|Hs108|chr11               (939 aa)
 initn: 457 init1: 243 opt: 431  Z-score: 398.5  bits: 84.5 E(32554): 7.1e-16
Smith-Waterman score: 563; 28.3% identity (55.5% similar) in 654 aa overlap (45-637:202-831)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KE6 RRRVVHTHRHTRNRLSCPWPPPFTSPTLTPGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQ
                                     :.. .. .::: : ...:   ..:.  :  
CCDS44 LLRLYRTSPDLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNP---EEFKTSVSL
             180       190       200       210          220        

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pF1KE6 LVHILRTLVTMGYST--EHSISGVSDPFLQVQILRLLR--------ILGRNHEESSETMN
        :  :  .:: . .   ...   :  :.:.:..::::.        . ::  :     .:
CCDS44 AVSRLSRIVTSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPDPAVRGRLTECLETILN
      230       240       250       260       270       280        

          130       140       150       160       170       180    
pF1KE6 DLLAQVATNTDTSRNAGNAVLFETVLTIMDIRSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVA
              ..     :: ::::::..  :.   :  .: : : : ::.:: . . :.::.:
CCDS44 KAQEPPKSKKVQHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYLA
      290       300       310       320       330       340        

          190         200       210        220       230       240 
pF1KE6 LTSLLRLVQSD--HSAVQRHRPTVVECLR-ETDASLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQEL
       : :.  :..:.  : ::. :  ::.. :. : :.:. .::..:  :. . ::.  .. :.
CCDS44 LESMCTLASSEFSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAEM
      350       360       370       380       390       400        

             250       260       270       280       290       300 
pF1KE6 QAFLESCPPDLRADCASGILLAAERFAPTKRWHIDTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLI
        ..::.   ..: . .  . . ::..:    :..::::...  :: .: ...   . :..
CCDS44 LSYLETADYSIREEIVLKVAILAEKYAVDYTWYVDTILNLIRIAGDYVSEEVWYRVIQIV
      410       420       430       440       450       460        

             310       320       330       340       350       360 
pF1KE6 GGAQELHAYSVRRLYNALAEDISQQPLVQVAAWCIGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEEV
        . .....:... ...::     .. ::.:... .::.:.:. ::. .    .:      
CCDS44 INRDDVQGYAAKTVFEALQAPACHENLVKVGGYILGEFGNLI-AGDPRSSPLIQ------
      470       480       490       500       510        520       

             370       380       390       400       410           
pF1KE6 LALLEKVLQSHMSLPATRGYALTALMKLSTRLCGDNNRIRQVVSIYGSCL---DVELQQR
       . ::..  . :.    ::.  :.. .:. . .   .  :..:.    : :   :::::::
CCDS44 FHLLHS--KFHLCSVPTRALLLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLR-SDSQLRNADVELQQR
               530       540       550       560        570        

      420        430       440                   450       460     
pF1KE6 AVEYDTLFR-KYDHMRAAILEKMP------------LVERDGPQADEEAKESKEAAQLS-
       ::::  :       . :..::.::            : .. ::..  . ...:.  ... 
CCDS44 AVEYLRLSTVASTDILATVLEEMPPFPERESSILAKLKKKKGPSTVTDLEDTKRDRSVDV
      580       590       600       610       620       630        

              470         480       490       500         510      
pF1KE6 ----EAAPVPTEPQA--SQLLDLLDLLDGASGDVQHPPHLDPSPGGA--LVHLL-DLPCV
           : ::. :   .  :   ::: :  ::.  .   :   :: ::.  :: .. :   :
CCDS44 NGGPEPAPASTSAVSTPSPSADLLGL--GAAPPAPAGP--PPSSGGSGLLVDVFSDSASV
      640       650       660         670         680       690    

         520                  530        540       550          560
pF1KE6 PPPPAPIPDLK-----------VFEREGVQLNL-SFIRPPENPALLLITI---TATNFSE
         : ::  . .           .:: . .:..: : .:  .: . ..:     :.:.: .
CCDS44 VAPLAPGSEDNFARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFR--QNLGRMFIFYGNKTSTQFLN
          700       710       720       730         740       750  

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pF1KE6 GDVTHFICQAAVPKSLQLQLQAPSGNTVPARGGLPITQLFRIL---NPNKAPLRLKLRLT
          : .::.  .  .:.:: . :   ::  .::  . :.  :    . ..::. :.... 
CCDS44 FTPT-LICSDDLQPNLNLQTK-PVDPTV--EGGAQVQQVVNIECVSDFTEAPV-LNIQFR
             760       770          780       790       800        

       620         630         640                                 
pF1KE6 YDHFHQ--SVQEIFEVNNL--PVESWQ                                 
       :    :  :::  . .:..  :.:                                    
CCDS44 YGGTFQNVSVQLPITLNKFFQPTEMASQDFFQRWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVTK
       810       820       830       840       850       860       

>>CCDS73234.1 AP2A2 gene_id:161|Hs108|chr11               (940 aa)
 initn: 457 init1: 243 opt: 431  Z-score: 398.5  bits: 84.5 E(32554): 7.1e-16
Smith-Waterman score: 561; 28.2% identity (55.4% similar) in 655 aa overlap (45-637:202-832)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KE6 RRRVVHTHRHTRNRLSCPWPPPFTSPTLTPGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQ
                                     :.. .. .::: : ...:   ..:.  :  
CCDS73 LLRLYRTSPDLVPMGDWTSRVVHLLNDQHLGVVTAATSLITTLAQKNP---EEFKTSVSL
             180       190       200       210          220        

           80          90       100       110                120   
pF1KE6 LVHILRTLVTMGYST--EHSISGVSDPFLQVQILRLLR---------ILGRNHEESSETM
        :  :  .:: . .   ...   :  :.:.:..::::.         . ::  :     .
CCDS73 AVSRLSRIVTSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVKLLRLLQCYPPPEDPAVRGRLTECLETIL
      230       240       250       260       270       280        

           130       140       150       160       170       180   
pF1KE6 NDLLAQVATNTDTSRNAGNAVLFETVLTIMDIRSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYV
       :       ..     :: ::::::..  :.   :  .: : : : ::.:: . . :.::.
CCDS73 NKAQEPPKSKKVQHSNAKNAVLFEAISLIIHHDSEPNLLVRACNQLGQFLQHRETNLRYL
      290       300       310       320       330       340        

           190         200       210        220       230       240
pF1KE6 ALTSLLRLVQSD--HSAVQRHRPTVVECLR-ETDASLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQE
       :: :.  :..:.  : ::. :  ::.. :. : :.:. .::..:  :. . ::.  .. :
CCDS73 ALESMCTLASSEFSHEAVKTHIETVINALKTERDVSVRQRAVDLLYAMCDRSNAPQIVAE
      350       360       370       380       390       400        

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pF1KE6 LQAFLESCPPDLRADCASGILLAAERFAPTKRWHIDTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQL
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CCDS73 -FHLLHS--KFHLCSVPTRALLLSTYIKFVNLFPEVKPTIQDVLR-SDSQLRNADVELQQ
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CCDS73 VNGGPEPAPASTSAVSTPSPSADLLGL--GAAPPAPAGP--PPSSGGSGLLVDVFSDSAS
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       :  : ::  . .           .:: . .:..: : .:  .: . ..:     :.:.: 
CCDS73 VVAPLAPGSEDNFARFVCKNNGVLFENQLLQIGLKSEFR--QNLGRMFIFYGNKTSTQFL
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       .   : .::.  .  .:.:: . :   ::  .::  . :.  :    . ..::. :....
CCDS73 NFTPT-LICSDDLQPNLNLQTK-PVDPTV--EGGAQVQQVVNIECVSDFTEAPV-LNIQF
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CCDS73 RYGGTFQNVSVQLPITLNKFFQPTEMASQDFFQRWKQLSNPQQEVQNIFKAKHPMDTEVT
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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