FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5355, 294 aa 1>>>pF1KE5355 294 - 294 aa - 294 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4360+/-0.00102; mu= 13.7339+/- 0.061 mean_var=55.6214+/-10.798, 0's: 0 Z-trim(102.7): 14 B-trim: 169 in 1/48 Lambda= 0.171970 statistics sampled from 7084 (7090) to 7084 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16 Scan time: 1.590 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7348.1 VDAC2 gene_id:7417|Hs108|chr10 ( 294) 1966 496.1 1.3e-140 CCDS53544.1 VDAC2 gene_id:7417|Hs108|chr10 ( 309) 1884 475.8 1.8e-134 CCDS4168.1 VDAC1 gene_id:7416|Hs108|chr5 ( 283) 1484 376.5 1.2e-104 CCDS6131.1 VDAC3 gene_id:7419|Hs108|chr8 ( 283) 1448 367.6 5.9e-102 CCDS47850.1 VDAC3 gene_id:7419|Hs108|chr8 ( 284) 1436 364.6 4.7e-101 >>CCDS7348.1 VDAC2 gene_id:7417|Hs108|chr10 (294 aa) initn: 1966 init1: 1966 opt: 1966 Z-score: 2638.1 bits: 496.1 E(32554): 1.3e-140 Smith-Waterman score: 1966; 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CCDS47 MCNTPTYCDLGKAAKDVFNKGYGFGMVKIDLKTKSCSGVMEFSTSGHAY 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 TDTGKVTGTLETKYKWCEYGLTFTEKWNTDNTLGTEIAIEDQICQGLKLTFDTTFSPNTG :::::..:.:::::: :.::::::.::::::::::::. :... .:::::.:: : :::: CCDS47 TDTGKASGNLETKYKVCNYGLTFTQKWNTDNTLGTEISWENKLAEGLKLTLDTIFVPNTG 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 KKSGKIKSSYKRECINLGCDVDFDFAGPAIHGSAVFGYEGWLAGYQMTFDSAKSKLTRNN :::::.:.::::.:...: .::.::.::.:.: ::...:::::::::.::.:::::..:: CCDS47 KKSGKLKASYKRDCFSVGSNVDIDFSGPTIYGWAVLAFEGWLAGYQMSFDTAKSKLSQNN 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 FAVGYRTGDFQLHTNVNDGTEFGGSIYQKVCEDLDTSVNLAWTSGTNCTRFGIAAKYQLD ::.::...::::::.::::::::::::::: : ..::.:::::.:.: :::::::::.:: CCDS47 FALGYKAADFQLHTHVNDGTEFGGSIYQKVNEKIETSINLAWTAGSNNTRFGIAAKYMLD 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 PTASISAKVNNSSLIGVGYTQTLRPGVKLTLSALVDGKSINAGGHKVGLALELEA .:.::::::.::::.:::::::::::::::::.:::...::::::::..:::: CCDS47 CRTSLSAKVNNASLIGLGYTQTLRPGVKLTLSALIDGKNFSAGGHKVGLGFELEA 230 240 250 260 270 280 294 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 00:03:52 2016 done: Tue Nov 8 00:03:53 2016 Total Scan time: 1.590 Total Display time: -0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]