Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE5662
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5662, 528 aa
1>>>pF1KE5662 528 - 528 aa - 528 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3914+/-0.00103; mu= 8.7383+/- 0.060
mean_var=235.5770+/-53.557, 0's: 0 Z-trim(111.2): 605 B-trim: 688 in 1/49
Lambda= 0.083562
statistics sampled from 11434 (12183) to 11434 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.728), E-opt: 0.2 (0.374), width: 16
Scan time: 2.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33928.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1038) 3371 420.5 4.8e-117
CCDS77875.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1040) 3371 420.5 4.8e-117
CCDS33927.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1086) 3371 420.5 4.9e-117
CCDS45602.1 TNK1 gene_id:8711|Hs108|chr17 ( 661) 1321 173.1 9e-43
CCDS58510.1 TNK1 gene_id:8711|Hs108|chr17 ( 666) 1303 170.9 4.1e-42
CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7 (1210) 739 103.2 1.7e-21
CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2 (1292) 731 102.3 3.5e-21
CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2 (1308) 731 102.3 3.5e-21
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 720 100.5 4.9e-21
CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1055) 700 98.5 4.1e-20
CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1225) 700 98.6 4.5e-20
CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1240) 700 98.6 4.6e-20
CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1255) 700 98.6 4.6e-20
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 ( 542) 690 96.9 6.3e-20
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1043) 690 97.3 9.5e-20
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1058) 690 97.3 9.5e-20
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1064) 690 97.3 9.6e-20
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1079) 690 97.3 9.7e-20
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1161) 690 97.3 1e-19
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1167) 690 97.3 1e-19
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1182) 690 97.3 1e-19
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052) 686 96.8 1.3e-19
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065) 686 96.8 1.3e-19
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 673 94.8 2.5e-19
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 512) 673 94.8 2.5e-19
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 675 95.5 3.5e-19
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 669 94.3 3.5e-19
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 669 94.3 3.5e-19
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 675 95.5 3.5e-19
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 669 94.3 3.6e-19
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 669 94.3 3.6e-19
CCDS31833.1 ERBB3 gene_id:2065|Hs108|chr12 (1342) 671 95.1 5.4e-19
CCDS47992.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9 ( 612) 663 93.7 6.5e-19
CCDS6688.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9 ( 635) 663 93.7 6.6e-19
CCDS6058.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 ( 967) 666 94.3 6.7e-19
CCDS6057.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 (1009) 666 94.3 6.9e-19
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 663 94.0 8.7e-19
CCDS13524.1 PTK6 gene_id:5753|Hs108|chr20 ( 451) 657 92.8 8.9e-19
CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs108|chr20 ( 488) 650 92.0 1.7e-18
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4 ( 631) 650 92.2 2e-18
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 653 92.8 2e-18
CCDS33255.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 312) 639 90.4 3.2e-18
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4 ( 527) 639 90.7 4.4e-18
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 619) 639 90.8 4.9e-18
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 632 89.8 7.2e-18
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 822) 632 90.1 1e-17
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 ( 986) 631 90.1 1.3e-17
CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 659) 625 89.2 1.6e-17
CCDS76003.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 693) 625 89.2 1.7e-17
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 621 88.5 1.9e-17
>>CCDS33928.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1038 aa)
initn: 3362 init1: 3362 opt: 3371 Z-score: 2214.8 bits: 420.5 E(32554): 4.8e-117
Smith-Waterman score: 3371; 98.2% identity (98.8% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQPEEGTGWLLELLSEVQLQQYFLRLRDDLNVTRLSHFEYVKNEDLEKIGMGRPGQRRLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MQPEEGTGWLLELLSEVQLQQYFLRLRDDLNVTRLSHFEYVKNEDLEKIGMGRPGQRRLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 EAVKRRKALCKRKSWMSKVFSGKRLEAEFPPHHSQSTFRKTSPAPGGPAGEGPLQSLTCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EAVKRRKALCKRKSWMSKVFSGKRLEAEFPPHHSQSTFRKTSPAPGGPAGEGPLQSLTCL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 IGEKDLRLLEKLGDGSFGVVRRGEWDAPSGKTVSVAVKCLKPDVLSQPEAMDDFIREVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IGEKDLRLLEKLGDGSFGVVRRGEWDAPSGKTVSVAVKCLKPDVLSQPEAMDDFIREVNA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MHSLDHRNLIRLYGVVLTPPMKMVTELAPLGSLLDRLRKHQGHFLLGTLSRYAVQVAEGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MHSLDHRNLIRLYGVVLTPPMKMVTELAPLGSLLDRLRKHQGHFLLGTLSRYAVQVAEGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 GYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLVKIGDFGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAWCAPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLVKIGDFGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAWCAPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 SLKTRTFSHASDTWMFGVTLWEMFTYGQEPWIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDCPQDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLKTRTFSHASDTWMFGVTLWEMFTYGQEPWIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDCPQDI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 YNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLLEAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIEGRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLLEAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIEGRA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 ENYWWRGQNTRTLCVGPFPRNVVTSVAGLSAQDISQPLQNSFIHTGHGDSDPRHCWGFPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ENYWWRGQNTRTLCVGPFPRNVVTSVAGLSAQDISQPLQNSFIHTGHGDSDPRHCWGFPD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE5 RIDECPFSAFSPGHPPAETCGQVLWTGRREACASDPRLHPVSSRTKGL
:::: .. .: ::
CCDS33 RIDELYLG--NPMDPPDLLSVELSTSRPPQHLGGVKKPTYDPVSEDQDPLSSDFKRLGLR
490 500 510 520 530
>>CCDS77875.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1040 aa)
initn: 3362 init1: 3362 opt: 3371 Z-score: 2214.8 bits: 420.5 E(32554): 4.8e-117
Smith-Waterman score: 3371; 98.2% identity (98.8% similar) in 496 aa overlap (1-496:33-526)
10 20 30
pF1KE5 MQPEEGTGWLLELLSEVQLQQYFLRLRDDL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AARRFPGLELSFPLLARLRRRLYTRLGGGRMQPEEGTGWLLELLSEVQLQQYFLRLRDDL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 NVTRLSHFEYVKNEDLEKIGMGRPGQRRLWEAVKRRKALCKRKSWMSKVFSGKRLEAEFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NVTRLSHFEYVKNEDLEKIGMGRPGQRRLWEAVKRRKALCKRKSWMSKVFSGKRLEAEFP
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 PHHSQSTFRKTSPAPGGPAGEGPLQSLTCLIGEKDLRLLEKLGDGSFGVVRRGEWDAPSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PHHSQSTFRKTSPAPGGPAGEGPLQSLTCLIGEKDLRLLEKLGDGSFGVVRRGEWDAPSG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 KTVSVAVKCLKPDVLSQPEAMDDFIREVNAMHSLDHRNLIRLYGVVLTPPMKMVTELAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KTVSVAVKCLKPDVLSQPEAMDDFIREVNAMHSLDHRNLIRLYGVVLTPPMKMVTELAPL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 GSLLDRLRKHQGHFLLGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLVKIGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GSLLDRLRKHQGHFLLGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLVKIGD
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 FGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAWCAPESLKTRTFSHASDTWMFGVTLWEMFTYGQEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAWCAPESLKTRTFSHASDTWMFGVTLWEMFTYGQEP
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 WIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDCPQDIYNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLLEAQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 WIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDCPQDIYNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLLEAQP
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 TDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIEGRAENYWWRGQNTRTLCVGPFPRNVVTSVAGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIEGRAENYWWRGQNTRTLCVGPFPRNVVTSVAGLS
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 AQDISQPLQNSFIHTGHGDSDPRHCWGFPDRIDECPFSAFSPGHPPAETCGQVLWTGRRE
:::::::::::::::::::::::::::::::::: .. .: ::
CCDS77 AQDISQPLQNSFIHTGHGDSDPRHCWGFPDRIDELYLG--NPMDPPDLLSVELSTSRPPQ
490 500 510 520 530 540
520
pF1KE5 ACASDPRLHPVSSRTKGL
CCDS77 HLGGVKKPTYDPVSEDQDPLSSDFKRLGLRKPGLPRGLWLAKPSARVPGTKASRGSGAEV
550 560 570 580 590 600
>>CCDS33927.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1086 aa)
initn: 3362 init1: 3362 opt: 3371 Z-score: 2214.6 bits: 420.5 E(32554): 4.9e-117
Smith-Waterman score: 3371; 98.2% identity (98.8% similar) in 496 aa overlap (1-496:64-557)
10 20 30
pF1KE5 MQPEEGTGWLLELLSEVQLQQYFLRLRDDL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AGIWGSMGERSAYQRLAGGEEGPQRLGGGRMQPEEGTGWLLELLSEVQLQQYFLRLRDDL
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE5 NVTRLSHFEYVKNEDLEKIGMGRPGQRRLWEAVKRRKALCKRKSWMSKVFSGKRLEAEFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NVTRLSHFEYVKNEDLEKIGMGRPGQRRLWEAVKRRKALCKRKSWMSKVFSGKRLEAEFP
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE5 PHHSQSTFRKTSPAPGGPAGEGPLQSLTCLIGEKDLRLLEKLGDGSFGVVRRGEWDAPSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PHHSQSTFRKTSPAPGGPAGEGPLQSLTCLIGEKDLRLLEKLGDGSFGVVRRGEWDAPSG
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 KTVSVAVKCLKPDVLSQPEAMDDFIREVNAMHSLDHRNLIRLYGVVLTPPMKMVTELAPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KTVSVAVKCLKPDVLSQPEAMDDFIREVNAMHSLDHRNLIRLYGVVLTPPMKMVTELAPL
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 GSLLDRLRKHQGHFLLGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLVKIGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GSLLDRLRKHQGHFLLGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLVKIGD
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 FGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAWCAPESLKTRTFSHASDTWMFGVTLWEMFTYGQEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAWCAPESLKTRTFSHASDTWMFGVTLWEMFTYGQEP
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 WIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDCPQDIYNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLLEAQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDCPQDIYNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLLEAQP
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 TDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIEGRAENYWWRGQNTRTLCVGPFPRNVVTSVAGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIEGRAENYWWRGQNTRTLCVGPFPRNVVTSVAGLS
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 AQDISQPLQNSFIHTGHGDSDPRHCWGFPDRIDECPFSAFSPGHPPAETCGQVLWTGRRE
:::::::::::::::::::::::::::::::::: .. .: ::
CCDS33 AQDISQPLQNSFIHTGHGDSDPRHCWGFPDRIDELYLG--NPMDPPDLLSVELSTSRPPQ
520 530 540 550 560 570
520
pF1KE5 ACASDPRLHPVSSRTKGL
CCDS33 HLGGVKREPPPRPPQPAFFTQKPTYDPVSEDQDPLSSDFKRLGLRKPGLPRGLWLAKPSA
580 590 600 610 620 630
>>CCDS45602.1 TNK1 gene_id:8711|Hs108|chr17 (661 aa)
initn: 1305 init1: 421 opt: 1321 Z-score: 881.4 bits: 173.1 E(32554): 9e-43
Smith-Waterman score: 1321; 45.3% identity (68.3% similar) in 479 aa overlap (1-472:1-461)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQPEEGTGWLLELLSEVQLQQYFLRLRDDLNVTRLSHFEYVKNEDLEKIGMGRPGQRRLW
: :: :. :::.:: ..:: :.. . ..::::: ::..:: :::. ::::::.::::
CCDS45 MLPEAGSLWLLKLLRDIQLAQFYWPILEELNVTRPEHFDFVKPEDLDGIGMGRPAQRRLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 EAVKRRKALCKRKSWMSKVFSGKRLEAEFPPHHSQSTFRKTSPAPGGPAGEGPLQSLTCL
::.:: .. : :.:. :...: : :.:.. :. . :: : :: :. ::
CCDS45 EALKRLRSGPKSKNWVYKILGG------FAPEHKEPTLPSDSPRHL-PEPEGGLK---CL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE5 IGEKDLRLLEKLGDGSFGVVRRGEWDAPSGKTVSVAVKCLK--PDVLSQPEAMDDFIREV
: : . : ::.: ::::.:: : ::::.: :::: :. :. : . ::.:::
CCDS45 IPEGAVCRGELLGSGCFGVVHRGLWTLPSGKSVPVAVKSLRVGPEGPMGTE-LGDFLREV
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 NAMHSLDHRNLIRLYGVVLTPPMKMVTELAPLGSLLDRLRKHQGH--FLLGTLSRYAVQV
..: .:.: ...::.:.:: :..:: :::::::: :: .:.. : . :.
CCDS45 SVMMNLEHPHVLRLHGLVLGQPLQMVMELAPLGSLHARLTAPAPTPPLLVALLCLFLRQL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AEGMGYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLVKIGDFGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAW
: .:.:: .. ..:::::.::::::. .:..::::.: : .::: : .:.::
CCDS45 AGAMAYLGARGLVHRDLATRNLLLASPRTIKVADFGLVRPLGGARGRYVMGGPRPIPYAW
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 CAPESLKTRTFSHASDTWMFGVTLWEMFTYGQEPWIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDC
::::::. .:: :::.:::::::::::. :.::: :. ::.... .. ::::: :
CCDS45 CAPESLRHGAFSSASDVWMFGVTLWEMFSGGEEPWAGVPPYLILQRLEDRA-RLPRPPLC
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 PQDIYNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLLEAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVI
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CCDS45 SRALYSLALRCWAPHPADRPSFSHLEGLLQEAGPSEACCVRDVTEPGALRMETGDPITVI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 EGRAENYWWRGQNTRTLCVGPFPRNVVTSVAGLSAQDISQPLQNSFIHTG---HGDSDPR
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CCDS45 EGSPDSTIWKGQNGRTFKVGSFPASAVT-LADAGGLPATRP-----VHRGTPARGDQHPG
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KE5 HCWGFPDRIDECPFSAFSPGHPPAETCGQVLWTGRREACASDPRLHPVSSRTKGL
CCDS45 SIDGDRKKANLWDAPPARGQRRNMPLERMKGISRSLESVLSLGPRPTGGGSSPPEIRQAR
470 480 490 500 510 520
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10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQPEEGTGWLLELLSEVQLQQYFLRLRDDLNVTRLSHFEYVKNEDLEKIGMGRPGQRRLW
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CCDS58 MLPEAGSLWLLKLLRDIQLAQFYWPILEELNVTRPEHFDFVKPEDLDGIGMGRPAQRRLS
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 EAVKRRKALCKRKSWMSKVFSGKRLEAEFPPHHSQSTFRKTSPAPGGPAGEGPLQSLTCL
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CCDS58 EALKRLRSGPKSKNWVYKILGG------FAPEHKEPTLPSDSPRHL-PEPEGGLK---CL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE5 IGEKDLRLLEKLGDGSFGVVRRGEWDAPSGKTVSVAVKCLK--PDVLSQPEAMDDFIREV
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CCDS58 IPEGAVCRGELLGSGCFGVVHRGLWTLPSGKSVPVAVKSLRVGPEGPMGTE-LGDFLREV
120 130 140 150 160
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pF1KE5 NAMHSLDHRNLIRLYGVVLTPPMKMVTELAPLGSLLDRLRKHQGH--FLLGTLSRYAVQV
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CCDS58 SVMMNLEHPHVLRLHGLVLGQPLQMVMELAPLGSLHARLTAPAPTPPLLVALLCLFLRQL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 AEGMGYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLVKIGDFGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAW
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CCDS58 AGAMAYLGARGLVHRDLATRNLLLASPRTIKVADFGLVRPLGGARGRYVMGGPRPIPYAW
230 240 250 260 270 280
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pF1KE5 CAPESLKTRTFSHASDTWMFGVTLWEMFTYGQEPWIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDC
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CCDS58 CAPESLRHGAFSSASDVWMFGVTLWEMFSGGEEPWAGVPPYLILQRLEDRA-RLPRPPLC
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 PQDIYNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLLEAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVI
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CCDS58 SRALYSLALRCWAPHPADRPSFSHLEGLLQEAGPSEACCVRDVTEPGALRMETGDPITVI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KE5 EGRA-----ENYWWRGQNTRTLCVGPFPRNVVTSVAGLSAQDISQPLQNSFIHTG---HG
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CCDS58 EGSSSFHSPDSTIWKGQNGRTFKVGSFPASAVT-LADAGGLPATRP-----VHRGTPARG
410 420 430 440 450 460
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pF1KE5 DSDPRHCWGFPDRIDECPFSAFSPGHPPAETCGQVLWTGRREACASDPRLHPVSSRTKGL
:. :
CCDS58 DQHPGSIDGDRKKANLWDAPPARGQRRNMPLERMKGISRSLESVLSLGPRPTGGGSSPPE
470 480 490 500 510 520
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CCDS55 ALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGS
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pF1KE5 GSFGVVRRGEWDAPSGKTVS--VAVKCLKPDVLSQPEAMDDFIREVNAMHSLDHRNLIRL
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CCDS55 GAFGTVYKGLW-IPEGEKVKIPVAIKELREA--TSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRL
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pF1KE5 YGVVLTPPMKMVTELAPLGSLLDRLRKHQGHFLLGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIHRD
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CCDS55 LGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRD
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pF1KE5 LAARNLLLATRDLVKIGDFGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAWCAPESLKTRTFSHASD
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CCDS55 LAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEY-HAEGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSD
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320 330 340 350 360 370
pF1KE5 TWMFGVTLWEMFTYGQEPWIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDCPQDIYNVMVQCWAHKP
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CCDS55 VWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEK-GERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDA
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pF1KE5 EDRPTFVALRDFLLEAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIEGRAENYWWRGQNTRT
..:: : :....:
CCDS55 DSRPKF---RELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEEDMDDVVD
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CCDS42 VGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKRVKVLGS
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pF1KE5 GSFGVVRRGEWDAPSGKTVSVAVKCLKPDVLSQPEAMDDFIREVNAMHSLDHRNLIRLYG
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CCDS42 GAFGTVYKGIW-VPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASMDHPHLVRLLG
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200 210 220 230 240 250
pF1KE5 VVLTPPMKMVTELAPLGSLLDRLRKHQGHFLLGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIHRDLA
: :.: ...::.: : : ::. ...:. .. : . ::.:.:: ::: .:..:::::
CCDS42 VCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLVHRDLA
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pF1KE5 ARNLLLATRDLVKIGDFGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAWCAPESLKTRTFSHASDTW
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CCDS42 ARNVLVKSPNHVKITDFGLARLL-EGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQSDVW
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pF1KE5 MFGVTLWEMFTYGQEPWIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDCPQDIYNVMVQCWAHKPED
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CCDS42 SYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEK-GERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMIDADS
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380 390 400 410 420 430
pF1KE5 RPTFVALRDFLLEAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIEGRAENYWWRGQNTRTLC
:: : :
CCDS42 RPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDLEDMMDAEEYL
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pF1KE5 WMSKVFSGKRLEAEFPPHHSQSTFRKTSPAPGGPAGEGPLQSLTCLIGEKDLRLLEKLGD
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CCDS23 VGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKRVKVLGS
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140 150 160 170 180 190
pF1KE5 GSFGVVRRGEWDAPSGKTVSVAVKCLKPDVLSQPEAMDDFIREVNAMHSLDHRNLIRLYG
:.::.: .: : .: :.::.. : . . :.: .:. :. : :.:: .:.:: :
CCDS23 GAFGTVYKGIW-VPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASMDHPHLVRLLG
730 740 750 760 770 780
200 210 220 230 240 250
pF1KE5 VVLTPPMKMVTELAPLGSLLDRLRKHQGHFLLGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIHRDLA
: :.: ...::.: : : ::. ...:. .. : . ::.:.:: ::: .:..:::::
CCDS23 VCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLVHRDLA
790 800 810 820 830 840
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pF1KE5 ARNLLLATRDLVKIGDFGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAWCAPESLKTRTFSHASDTW
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CCDS23 ARNVLVKSPNHVKITDFGLARLL-EGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQSDVW
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pF1KE5 MFGVTLWEMFTYGQEPWIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDCPQDIYNVMVQCWAHKPED
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CCDS23 SYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEK-GERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMIDADS
910 920 930 940 950 960
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pF1KE5 RPTFVALRDFLLEAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIEGRAENYWWRGQNTRTLC
:: : :
CCDS23 RPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDLEDMMDAEEYL
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CCDS51 GLCVKLGKPCLKIQVPAPFDLSYKTVDQWEIDRNSIQLLKRLGSGQFGEVWEGLWN----
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160 170 180 190 200
pF1KE5 KTVSVAVKCLKPDVLSQPEAMDDFIREVNAMHSLDHRNLIRLYGV-VLTPPMKMVTELAP
.:. :::: ::: .. : .::.::.. :..: : .::.::.: .: :. ..:::
CCDS51 NTTPVAVKTLKPGSMD-P---NDFLREAQIMKNLRHPKLIQLYAVCTLEDPIYIITELMR
260 270 280 290 300 310
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 LGSLLDRLRKHQGHFL-LGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIHRDLAARNLLLATRDLVKI
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CCDS51 HGSLQEYLQNDTGSKIHLTQQVDMAAQVASGMAYLESRNYIHRDLAARNVLVGEHNIYKV
320 330 340 350 360 370
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 GDFGLMRALP-QNDDHYVMQEHRKVPFAWCAPESLKTRTFSHASDTWMFGVTLWEMFTYG
.:::: :.. .:.: : ... :.: : :::.... :: ::.: ::. :.:..:::
CCDS51 ADFGLARVFKVDNEDIYESRHEIKLPVKWTAPEAIRSNKFSIKSDVWSFGILLYEIITYG
380 390 400 410 420 430
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 QEPWIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDCPQDIYNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLLE
. :. :..:.:... . .. :::.: .:::..::.:..:: .:..:::: .:: : .
CCDS51 KMPYSGMTGAQVIQML-AQNYRLPQPSNCPQQFYNIMLECWNAEPKERPTFETLRWKLED
440 450 460 470 480
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pF1KE5 AQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIEGRAENYWWRGQNTRTLCVGPFPRNVVTSVA
::
CCDS51 YFETDSSYSDANNFIR
490 500
>>CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1055 aa)
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CCDS77 VVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGAMPNQAQMRILKETELRKVKVLGS
670 680 690 700 710 720
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 GSFGVVRRGEWDAPSGKTVS--VAVKCLKPDVLSQPEAMDDFIREVNAMHSLDHRNLIRL
:.::.: .: : :.:..:. ::.: :. . ..:.: ... :. .: .. . ::
CCDS77 GAFGTVYKGIW-IPDGENVKIPVAIKVLREN--TSPKANKEILDEAYVMAGVGSPYVSRL
730 740 750 760 770 780
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pF1KE5 YGVVLTPPMKMVTELAPLGSLLDRLRKHQGHFLLGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIHRD
:. :: ...::.: : : :::..:...:.. : . .:.:.::.:::. :..:::
CCDS77 LGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCMQIAKGMSYLEDVRLVHRD
790 800 810 820 830 840
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pF1KE5 LAARNLLLATRDLVKIGDFGLMRALPQNDDHYVMQEHRKVPFAWCAPESLKTRTFSHASD
:::::.:. . . ::: :::: : : .. .: . :::. : : ::. : :.: ::
CCDS77 LAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEY-HADGGKVPIKWMALESILRRRFTHQSD
850 860 870 880 890 900
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pF1KE5 TWMFGVTLWEMFTYGQEPWIGLNGSQILHKIDKEGERLPRPEDCPQDIYNVMVQCWAHKP
.: .:::.::..:.: .:. :. . .: ..: :::::.: : :.: .::.::
CCDS77 VWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEK-GERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDS
910 920 930 940 950 960
380 390 400 410 420 430
pF1KE5 EDRPTFVALRDFLLEAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIEGRAENYWWRGQNTRT
: :: : :
CCDS77 ECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQNEDLGPASPLDSTFYRSLLEDDDMGDLVDAEEY
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528 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 05:38:26 2016 done: Tue Nov 8 05:38:26 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]