FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5353, 325 aa 1>>>pF1KE5353 325 - 325 aa - 325 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2408+/-0.00114; mu= -5.0427+/- 0.067 mean_var=365.6924+/-75.794, 0's: 0 Z-trim(113.2): 38 B-trim: 117 in 2/50 Lambda= 0.067068 statistics sampled from 13807 (13836) to 13807 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.762), E-opt: 0.2 (0.425), width: 16 Scan time: 2.220 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3718.1 TNIP3 gene_id:79931|Hs108|chr4 ( 325) 2190 225.4 4.8e-59 CCDS58925.1 TNIP3 gene_id:79931|Hs108|chr4 ( 369) 1971 204.3 1.2e-52 CCDS58926.1 TNIP3 gene_id:79931|Hs108|chr4 ( 376) 1971 204.3 1.3e-52 CCDS58982.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 ( 583) 572 69.1 9.6e-12 CCDS75359.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 ( 619) 572 69.1 1e-11 CCDS58985.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 ( 635) 572 69.2 1e-11 CCDS34280.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 ( 636) 572 69.2 1e-11 CCDS58984.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 ( 572) 570 68.9 1.1e-11 CCDS58983.1 TNIP1 gene_id:10318|Hs108|chr5 ( 556) 564 68.3 1.6e-11 >>CCDS3718.1 TNIP3 gene_id:79931|Hs108|chr4 (325 aa) initn: 2190 init1: 2190 opt: 2190 Z-score: 1173.5 bits: 225.4 E(32554): 4.8e-59 Smith-Waterman score: 2190; 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