FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3878, 632 aa 1>>>pF1KE3878 632 - 632 aa - 632 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6542+/-0.000974; mu= 17.2680+/- 0.059 mean_var=69.9886+/-13.937, 0's: 0 Z-trim(105.1): 38 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.153306 statistics sampled from 8323 (8359) to 8323 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.615), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16 Scan time: 1.560 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS2669.1 ITGA9 gene_id:3680|Hs109|chr3 (1035) 4169 931.7 0 CCDS42788.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs109|chr2 (1032) 1963 443.8 5.5e-124 CCDS11558.1 ITGA3 gene_id:3675|Hs109|chr17 (1051) 914 211.8 3.9e-54 CCDS8888.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs109|chr12 (1137) 800 186.6 1.6e-46 CCDS44914.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs109|chr12 (1044) 750 175.5 3.2e-43 CCDS55832.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs109|chr12 (1141) 750 175.6 3.4e-43 CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs109|chr2 (1048) 712 167.1 1.1e-40 CCDS45291.1 ITGA11 gene_id:22801|Hs109|chr15 (1188) 695 163.4 1.6e-39 CCDS8880.1 ITGA5 gene_id:3678|Hs109|chr12 (1049) 672 158.3 5e-38 CCDS45461.1 ITGAL gene_id:3683|Hs109|chr16 (1086) 655 154.5 7e-37 CCDS32433.1 ITGAL gene_id:3683|Hs109|chr16 (1170) 647 152.8 2.5e-36 CCDS46471.1 ITGAV gene_id:3685|Hs109|chr2 (1002) 637 150.5 1e-35 CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs109|chr16 (1152) 629 148.8 3.9e-35 CCDS76204.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs109|chr1 (1024) 624 147.7 7.7e-35 CCDS72869.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs109|chr1 (1167) 624 147.7 8.6e-35 CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs109|chr16 (1153) 622 147.2 1.2e-34 CCDS46470.1 ITGAV gene_id:3685|Hs109|chr2 (1012) 619 146.6 1.6e-34 CCDS10711.1 ITGAX gene_id:3687|Hs109|chr16 (1163) 619 146.6 1.8e-34 CCDS67014.1 ITGAX gene_id:3687|Hs109|chr16 (1169) 619 146.6 1.9e-34 CCDS31155.1 ITGA8 gene_id:8516|Hs109|chr10 (1063) 618 146.3 2e-34 CCDS82534.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs109|chr2 ( 954) 611 144.8 5.3e-34 CCDS2249.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs109|chr2 (1073) 604 143.2 1.7e-33 CCDS46451.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs109|chr2 (1091) 604 143.2 1.7e-33 CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs109|chr16 (1161) 604 143.3 1.8e-33 CCDS32665.1 ITGA2B gene_id:3674|Hs109|chr17 (1039) 584 138.8 3.6e-32 CCDS82540.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs109|chr2 ( 195) 574 136.3 3.9e-32 CCDS3957.1 ITGA2 gene_id:3673|Hs109|chr5 (1181) 547 130.7 1.2e-29 CCDS32531.1 ITGAE gene_id:3682|Hs109|chr17 (1179) 461 111.6 6.2e-24 CCDS3955.1 ITGA1 gene_id:3672|Hs109|chr5 (1179) 398 97.7 9.7e-20 >>CCDS2669.1 ITGA9 gene_id:3680|Hs109|chr3 (1035 aa) initn: 4169 init1: 4169 opt: 4169 Z-score: 4976.6 bits: 931.7 E(33420): 0 Smith-Waterman score: 4169; 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CCDS42 CLEERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 RTLIPCYEEYKKKYGEEHGSCQAGIAGFFTEELVVMGAPGSFYWAGTIKVLNLTDNTYLK . . :::..: ::.::. .::::::..:.:..:.::::::: ::.:.. : :.: : : CCDS42 KRIAPCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTNKYKA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 LNDEVIMNRRYTYLGYAVTAGHFSHPSTIDVVGGAPQDKGIGKVYIFRADRRSGTLIKIF . :. . . .::::.: :::: : .::::::: . :::.::: :.. : . CCDS42 FLDKQNQVKFGSYLGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAYIFSIDEKE--LNILH 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 QASGKKMGSYFGSSLCAVDLNGDGLSDLLVGAPMFSEIRDEGQVTVYINRGNGALEEQLA . .:::.:::::.:.::::::.::.::::::::: : ::.::.: :::: :.::. . . CCDS42 EMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPMQSTIREEGRVFVYINSGSGAVMNAME 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 --LTGDGAYNAHFGESIASLDDLDNDGFPDVAIGAPKEDDFAGAVYIYHGDAGGIVPQYS :.:. : :.:::::..: :.::::: :::::::.:::. ::.:::.: : :: .: CCDS42 TNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGAIYIYNGRADGISSTFS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 MKLSGQKINPVLRMFGQSISGGIDMDGNGYPDVTVGAFMSDSVVLLRARPVITVDVSIFL ... : .:. : :::::::: :: :.::: ::.:::: :::.::::.:::. ::.:. CCDS42 QRIEGLQISKSLSMFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLSH 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 PGSINITAPQCHDGQQPVNCLNVTTCFSFHGKHVPEEIGLNYVLMADVAKKEKGQMPRVY : :.: : .: .. : :...: :::..::.:: : : : . :: .: .. :: : CCDS42 PESVNRTKFDCVENGWPSVCIDLTLCFSYKGKEVPGYIVLFYNMSLDVNRKAESP-PRFY 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 FVLLGETMGQVTEKLQLTYMEETCRHYVAHVKRRVQDVISPIVFEAAYSLSEHVTGEEE- : : : .: ..:.. : .:: . : ... :.:...:: .:::: :. :: ... CCDS42 FSSNG-TSDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRST 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 RELPPLTPVLRWKKGQKIAQKNQVRTLKLILSTQGGSCTEQK .:.::: :.:. :: . : .: CCDS42 EEFPPLQPILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHENCSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGS 600 610 620 630 640 650 >>CCDS11558.1 ITGA3 gene_id:3675|Hs109|chr17 (1051 aa) initn: 346 init1: 265 opt: 914 Z-score: 1085.7 bits: 211.8 E(33420): 3.9e-54 Smith-Waterman score: 914; 31.4% identity (60.5% similar) in 646 aa overlap (1-618:1-613) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MG-GPA-APRGAGRLRALLLALVVA--GIPAGAYNLDPQR-PVHFQGPADSFFGYAVLEH :: ::. ::: : :: :::.:: : ..:.::: . :. : :.:::.: : CCDS11 MGPGPSRAPR-APRLMLCALALMVAAGGCVVSAFNLDTRFLVVKEAGNPGSLFGYSVALH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 FHDNTRW---VLVGAPKADSKYSPSVKSPGAVFKCRVHTNPDRRCTELDMARGKNRGTSC . . . .:.:::. . . .. :::. : . .. : : ..... .. : CCDS11 RQTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHKDD-CERMNITVKNDPG--- 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 GKTCREDRDDEWMGVSLARQPKADGRVLACAHRWKNIYYEA--DHILPHGFCYIIPSNLQ .. .: :.::..: : : ::::.::::. .. . . :. : ::. ..:. CCDS11 ----HHIIEDMWLGVTVASQGPA-GRVLVCAHRYTQVLWSGSEDQRRMVGKCYVRGNDLE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 AKGRTLIPCYE-EYKKKYGE--EHGSCQAGIAGFFTEELVVMGAPGSFYWAGTIKVL--- . :. :. .. . : : :: : .: ::.. : .::::.. : :. .. CCDS11 LDSSDDWQTYHNEMCNSNTDYLETGMCQLGTSGGFTQNTVYFGAPGAYNWKGNSYMIQRK 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 --NLTDNTYLKLNDEVIMNRRYTYLGYAVTAGHFS-HPSTIDVVGGAPQDKGIGKVYIFR .:.. .: .:. . :.::.. .: : ::..: .: :::. . .: :... CCDS11 EWDLSEYSYKDPEDQGNL-----YIGYTMQVGSFILHPKNITIVTGAPRHRHMGAVFLL- 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 ADRRSGTLIKIFQASGKKMGSYFGSSLCAVDLNGDGLSDLLVGAPMFSEIRDE--GQVTV ... .: : . :...:.::::.. .:::.:: .:::::::.. : ..: : . : CCDS11 SQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQDLLVGAPYYFERKEEVGGAIYV 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 YINRGNGALEEQLALTGDGAYNAHFGESIASLDDLDNDGFPDVAIGAPKEDDFAGAVYIY ..:... .. . .: : .. :: :.::. :...::: :.:.::: : : :::: CCDS11 FMNQAGTSFPAHPSLLLHGPSGSAFGLSVASIGDINQDGFQDIAVGAPFEG--LGKVYIY 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 HGDAGGIVPQYSMKLSGQKIN-PVLRMFGQSISGGIDMDGNGYPDVTVGAFMSDSVVLLR :... :.. : .. . :.:.. : : :: :.:: .:.: : :::. ::. .:: .:::: CCDS11 HSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLSGQMDVDENFYPDLLVGS-LSDHIVLLR 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 ARPVITVDVSIFLPGSINITAPQCHDGQQPVNCLNVTTCFSFH----GKHVPEEIGLNYV :::::.. . ..: . : ..:..: ::... . . ..: : :. CCDS11 ARPVINIVHKTLVPRPAVLDPALC----TATSCVQVELCFAYNQSAGNPNYRRNITLAYT 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 LMADVAKKEKGQMPRVYFVLLGETMGQVTEKLQLTYMEETCRHYVAHVKRRVQDVISPIV : :: .. ::. :. : . . : . . ... : :.. . ..: . ::. CCDS11 LEADRDRRP----PRLRFA--G-SESAVFHGF-FSMPEMRCQKLELLLMDNLRDKLRPII 520 530 540 550 560 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 FEAAYSLSEHVTGEEERELPPLT--PVLRWKKGQKIAQKNQVRTLKLILSTQGGSCTEQK . ::: .. . . : : :.: ...: . ....:. : CCDS11 ISMNYSLPLRMPDRPRLGLRSLDAYPIL--NQAQALENHTEVQFQKECGPDNKCESNLQM 570 580 590 600 610 620 CCDS11 RAAFVSEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNTRTSERSGEDAHEALLTLVVPPALLLSS 630 640 650 660 670 680 >>CCDS8888.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs109|chr12 (1137 aa) initn: 480 init1: 207 opt: 800 Z-score: 948.9 bits: 186.6 E(33420): 1.6e-46 Smith-Waterman score: 1028; 32.6% identity (60.6% similar) in 668 aa overlap (7-632:9-641) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGGPAAPRGAGRLRALLLALVVAGI--PAGAYNLDPQRPVHFQGPADSFFGYAVLEHF : ::. . :. .:.: . : :.::: . .. .: :.::..: : CCDS88 MAGARSRDPWGASGICYLFGSLLVELLFSRAVAFNLDVMGALRKEGEPGSLFGFSVALHR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 HDNTR---WVLVGAPKADSKYSPSVKSPGAVFKCRVHTNPDRRCTELDMARGKNRGTSCG . . : :.:::::.: . . ... :..: : . . . : ..:. .: . CCDS88 QLQPRPQSWLLVGAPQALALPGQQANRTGGLFACPLSLE-ETDCYRVDIDQGADMQ---- 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 KTCREDRDDEWMGVSLARQPKADGRVLACAHRWKNIYYEADHILPH----GFCYIIPSNL .:.....:.:::. :. :....::::.. ..:.:: : :... ..: CCDS88 ---KESKENQWLGVSV-RSQGPGGKIVTCAHRYEA-RQRVDQILETRDMIGRCFVLSQDL 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 QAK----GRTLIPCYEEYKKKYGEEHGSCQAGIAGFFTEE--LVVMGAPGSFYWAGTIKV . : : : . . :. : :: : :. :. . ...::::.. : : . : CCDS88 AIRDELDGGEWKFC--EGRPQGHEQFGFCQQGTAAAFSPDSHYLLFGAPGTYNWKGLLFV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 LNLT----DNTYLKLND----------EVIMNRRYTYLGYAVTAGH-FSHPSTIDVVGGA :. :. : : .. .: .:::... .:. . . .. :.:: CCDS88 TNIDSSDPDQLVYKTLDPADRLPGPAGDLALN---SYLGFSIDSGKGLVRAEELSFVAGA 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 PQDKGIGKVYIFRADRRSGTLIKIFQASGKKMGSYFGSSLCAVDLNGDGLSDLLVGAPMF :. . : : :.: : : :. . ::... : :: :: ..:::.:: ::.::::.: CCDS88 PRANHKGAVVILRKDSAS-RLVPEVMLSGERLTSGFGYSLAVADLNSDGWPDLIVGAPYF 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 SEIRDE--GQVTVYINRGNGALEEQLALTGDGAYNAHFGESIASLDDLDNDGFPDVAIGA : ..: : : ::.:.: : : :. .. :: :.: : ::..:::::.:.:: CCDS88 FERQEELGGAVYVYLNQG-GHWAGISPLRLCGSPDSMFGISLAVLGDLNQDGFPDIAVGA 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 PKEDDFAGAVYIYHGDAGGIVPQYSMKLSGQKINPVLRMFGQSISGGIDMDGNGYPDVTV : . : : :.::::.. :.: . :. : :. .. .. :: :.::..::::: :::. : CCDS88 PFDGD--GKVFIYHGSSLGVVAKPSQVLEGEAVG--IKSFGYSLSGSLDMDGNQYPDLLV 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 GAFMSDSVVLLRARPVITV--DVSIFLPGSINITAPQCHDGQQPVNCLNVTTCFSF---H :. ..:..::.::::.. : .::: : ::.. :.: :.. :... .:::. CCDS88 GS-LADTAVLFRARPILHVSHEVSI-APRSIDLEQPNCAGGHS--VCVDLRVCFSYIAVP 460 470 480 490 500 510 510 520 530 540 550 pF1KE3 GKHVPEEIGLNYVLMADVAKKEKGQMPRVYFVL--LGETMGQVTEKLQLTYMEE-TCRHY ... : ..:.::: ::. .. .::.::: :. : : :.. . : .... .: CCDS88 SSYSPT-VALDYVLDADTDRRLRGQVPRVTFLSRNLEEPKHQASGTVWLKHQHDRVCGDA 520 530 540 550 560 570 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 VAHVKRRVQDVISPIVFEAAYSLSEHVTGEEE--RELPPLTPVLRWKKGQKIAQKNQVRT . .... :.: . :: .:::. .. . :::..:.: . : .:. ... CCDS88 MFQLQENVKDKLRAIVVTLSYSLQTPRLRRQAPGQGLPPVAPIL--NAHQPSTQRAEIHF 580 590 600 610 620 630 620 630 pF1KE3 LKLILSTQGGSCTEQK :: :: : :.: CCDS88 LK-----QG--CGEDKICQSNLQLVRARFCTRVSDTEFQPLPMDVDGTTALFALSGQPVI 640 650 660 670 680 >>CCDS44914.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs109|chr12 (1044 aa) initn: 500 init1: 207 opt: 750 Z-score: 889.7 bits: 175.5 E(33420): 3.2e-43 Smith-Waterman score: 856; 33.8% identity (60.7% similar) in 547 aa overlap (124-632:27-548) 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 DRRCTELDMARGKNRGTSCGKTCREDRDDEWMGVSLARQPKADGRVLACAHRWKNIYYEA : . :.: .:. .::::.. .. CCDS44 MAPFATPMVQALTTTRIQRQAEGFQCWRECGTRRSP-FEGKE-TCAHRYEA-RQRV 10 20 30 40 50 160 170 180 190 200 pF1KE3 DHILPH----GFCYIIPSNLQAK----GRTLIPCYEEYKKKYGEEHGSCQAGIAGFFTEE :.:: : :... ..: . : : : . . :. : :: : :. :. . CCDS44 DQILETRDMIGRCFVLSQDLAIRDELDGGEWKFC--EGRPQGHEQFGFCQQGTAAAFSPD 60 70 80 90 100 110 210 220 230 240 pF1KE3 --LVVMGAPGSFYWAGTIKV----------LNLTDNTYL----KLND-EVIMNRRYTYLG ...::::.. : :: .: .: :. : : .: ..: .:.: CCDS44 SHYLLFGAPGTYNWKGTARVELCAQGSADLAHLDDGPYEAGGEKEQDPRLIPVPANSYFG 120 130 140 150 160 170 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 YAVTAGH-FSHPSTIDVVGGAPQDKGIGKVYIFRADRRSGTLIKIFQASGKKMGSYFGSS ... .:. . . .. :.:::. . : : :.: : : :. . ::... : :: : CCDS44 FSIDSGKGLVRAEELSFVAGAPRANHKGAVVILRKDSAS-RLVPEVMLSGERLTSGFGYS 180 190 200 210 220 230 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 LCAVDLNGDGLSDLLVGAPMFSEIRDE--GQVTVYINRGNGALEEQLALTGDGAYNAHFG : ..:::.:: ::.::::.: : ..: : : ::.:.: : : :. .. :: CCDS44 LAVADLNSDGWPDLIVGAPYFFERQEELGGAVYVYLNQG-GHWAGISPLRLCGSPDSMFG 240 250 260 270 280 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 ESIASLDDLDNDGFPDVAIGAPKEDDFAGAVYIYHGDAGGIVPQYSMKLSGQKINPVLRM :.: : ::..:::::.:.::: . : : :.::::.. :.: . :. : :. .. .. CCDS44 ISLAVLGDLNQDGFPDIAVGAPFDGD--GKVFIYHGSSLGVVAKPSQVLEGEAVG--IKS 290 300 310 320 330 340 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 FGQSISGGIDMDGNGYPDVTVGAFMSDSVVLLRARPVITV--DVSIFLPGSINITAPQCH :: :.::..::::: :::. ::. ..:..::.::::.. : .::: : ::.. :.: CCDS44 FGYSLSGSLDMDGNQYPDLLVGS-LADTAVLFRARPILHVSHEVSI-APRSIDLEQPNCA 350 360 370 380 390 400 490 500 510 520 530 pF1KE3 DGQQPVNCLNVTTCFSF---HGKHVPEEIGLNYVLMADVAKKEKGQMPRVYFVL--LGET :.. :... .:::. ... : ..:.::: ::. .. .::.::: :. : : CCDS44 GGHSV--CVDLRVCFSYIAVPSSYSPT-VALDYVLDADTDRRLRGQVPRVTFLSRNLEEP 410 420 430 440 450 460 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 MGQVTEKLQLTYMEE-TCRHYVAHVKRRVQDVISPIVFEAAYSLSEHVTGEEE--RELPP :.. . : .... .: . .... :.: . :: .:::. .. . ::: CCDS44 KHQASGTVWLKHQHDRVCGDAMFQLQENVKDKLRAIVVTLSYSLQTPRLRRQAPGQGLPP 470 480 490 500 510 520 600 610 620 630 pF1KE3 LTPVLRWKKGQKIAQKNQVRTLKLILSTQGGSCTEQK ..:.: . : .:. ... :: :: : :.: CCDS44 VAPIL--NAHQPSTQRAEIHFLK-----QG--CGEDKICQSNLQLVRARFCTRVSDTEFQ 530 540 550 560 570 CCDS44 PLPMDVDGTTALFALSGQPVIGLELMVTNLPSDPAQPQADGDDAHEAQLLVMLPDSLHYS 580 590 600 610 620 630 >>CCDS55832.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs109|chr12 (1141 aa) initn: 500 init1: 207 opt: 750 Z-score: 889.1 bits: 175.6 E(33420): 3.4e-43 Smith-Waterman score: 1024; 32.7% identity (60.8% similar) in 669 aa overlap (7-632:9-645) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGGPAAPRGAGRLRALLLALVVAGI--PAGAYNLDPQRPVHFQGPADSFFGYAVLEHF : ::. . :. .:.: . : :.::: . .. .: :.::..: : CCDS55 MAGARSRDPWGASGICYLFGSLLVELLFSRAVAFNLDVMGALRKEGEPGSLFGFSVALHR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 HDNTR---WVLVGAPKADSKYSPSVKSPGAVFKCRVHTNPDRRCTELDMARGKNRGTSCG . . : :.:::::.: . . ... :..: : . . . : ..:. .: . CCDS55 QLQPRPQSWLLVGAPQALALPGQQANRTGGLFACPLSLE-ETDCYRVDIDQGADMQ---- 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 KTCREDRDDEWMGVSLARQPKADGRVLACAHRWKNIYYEADHILPH----GFCYIIPSNL .:.....:.:::. :. :....::::.. ..:.:: : :... ..: CCDS55 ---KESKENQWLGVSV-RSQGPGGKIVTCAHRYEA-RQRVDQILETRDMIGRCFVLSQDL 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 QAK----GRTLIPCYEEYKKKYGEEHGSCQAGIAGFFTEE--LVVMGAPGSFYWAGTIKV . : : : . . :. : :: : :. :. . ...::::.. : :: .: CCDS55 AIRDELDGGEWKFC--EGRPQGHEQFGFCQQGTAAAFSPDSHYLLFGAPGTYNWKGTARV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 ----------LNLTDNTYL----KLND-EVIMNRRYTYLGYAVTAGH-FSHPSTIDVVGG .: :. : : .: ..: .:.:... .:. . . .. :.: CCDS55 ELCAQGSADLAHLDDGPYEAGGEKEQDPRLIPVPANSYFGFSIDSGKGLVRAEELSFVAG 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 APQDKGIGKVYIFRADRRSGTLIKIFQASGKKMGSYFGSSLCAVDLNGDGLSDLLVGAPM ::. . : : :.: : : :. . ::... : :: :: ..:::.:: ::.::::. CCDS55 APRANHKGAVVILRKDSAS-RLVPEVMLSGERLTSGFGYSLAVADLNSDGWPDLIVGAPY 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 FSEIRDE--GQVTVYINRGNGALEEQLALTGDGAYNAHFGESIASLDDLDNDGFPDVAIG : : ..: : : ::.:.: : : :. .. :: :.: : ::..:::::.:.: CCDS55 FFERQEELGGAVYVYLNQG-GHWAGISPLRLCGSPDSMFGISLAVLGDLNQDGFPDIAVG 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 APKEDDFAGAVYIYHGDAGGIVPQYSMKLSGQKINPVLRMFGQSISGGIDMDGNGYPDVT :: . : : :.::::.. :.: . :. : :. .. .. :: :.::..::::: :::. CCDS55 APFDGD--GKVFIYHGSSLGVVAKPSQVLEGEAVG--IKSFGYSLSGSLDMDGNQYPDLL 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 VGAFMSDSVVLLRARPVITV--DVSIFLPGSINITAPQCHDGQQPVNCLNVTTCFSF--- ::. ..:..::.::::.. : .::: : ::.. :.: :.. :... .:::. CCDS55 VGS-LADTAVLFRARPILHVSHEVSI-APRSIDLEQPNCAGGHS--VCVDLRVCFSYIAV 470 480 490 500 510 510 520 530 540 550 pF1KE3 HGKHVPEEIGLNYVLMADVAKKEKGQMPRVYFVL--LGETMGQVTEKLQLTYMEE-TCRH ... : ..:.::: ::. .. .::.::: :. : : :.. . : .... .: CCDS55 PSSYSPT-VALDYVLDADTDRRLRGQVPRVTFLSRNLEEPKHQASGTVWLKHQHDRVCGD 520 530 540 550 560 570 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 YVAHVKRRVQDVISPIVFEAAYSLSEHVTGEEE--RELPPLTPVLRWKKGQKIAQKNQVR . .... :.: . :: .:::. .. . :::..:.: . : .:. ... CCDS55 AMFQLQENVKDKLRAIVVTLSYSLQTPRLRRQAPGQGLPPVAPIL--NAHQPSTQRAEIH 580 590 600 610 620 630 620 630 pF1KE3 TLKLILSTQGGSCTEQK :: :: : :.: CCDS55 FLK-----QG--CGEDKICQSNLQLVRARFCTRVSDTEFQPLPMDVDGTTALFALSGQPV 640 650 660 670 680 >>CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs109|chr2 (1048 aa) initn: 629 init1: 178 opt: 712 Z-score: 844.2 bits: 167.1 E(33420): 1.1e-40 Smith-Waterman score: 903; 32.2% identity (61.3% similar) in 630 aa overlap (7-596:5-607) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MGGPAAPRGAGRLRALLLALVVAGI--P-AGAYNLDPQRPVHFQGPADSFFGYAVLEHF- :: :: : :...:. : :.::: . :....:: :.::.:: . : CCDS22 MAFPPRRRLRLGPRGLPLLLSGLLLPLCRAFNLDVDSPAEYSGPEGSYFGFAV-DFFV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 -HDNTR-WVLVGAPKADSKYSPSVKSPGAVFKCRVHTNPDRRCTELDMARGKNRGTSCGK ..: ..:::::::.. .:.. : :.:: .. ::: ... :: . CCDS22 PSASSRMFLLVGAPKANTT-QPGIVEGGQVLKCDWSST--RRCQPIEFDATGNRDYAKDD 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 TCREDRDDEWMGVSLARQPKADGRVLACA--HRWKNIYYEADHILPHGFCYIIPSNLQAK : .. .:.:.:. . : : ..:::: ..:.. . . . : : :. :: CCDS22 PL-EFKSHQWFGASV--RSKQD-KILACAPLYHWRTEMKQERE--PVGTCF-----LQDG 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KE3 GRTL--IPCYEEYKKKYGEEHGSCQAGIAGFFTE-ELVVMGAPGSFYWAGTI------KV .:. :: . :. : ::.:.. ::. . :..:.:::::: : . .. CCDS22 TKTVEYAPCRSQDIDADGQ--GFCQGGFSIDFTKADRVLLGGPGSFYWQGQLISDQVAEI 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 LNLTD-NTY-LKLNDEVIMNRRY-----TYLGYAVTAGHFSHPSTIDVVGGAPQD-KGIG .. : :.: .: :... .::::.:..: :. . : :.:.:. . .: CCDS22 VSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRAARTLG 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 pF1KE3 KVYIFRADRRSGTLIKIFQASGKKMGSYFGSSLCAVDLNGDGLSDLLVGAPMF------S :::. : .. . .... .:..:..::: :. :.:.::: .:...:::.: . CCDS22 MVYIY--DGKN--MSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDG 290 300 310 320 330 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 EIRDEGQVTVYINRGNGALEEQLALTGDGAYNAHFGESIASLDDLDNDGFPDVAIGAPKE .... :::.: ..:..: .. :.: .. :.:: .:: : :::.::: :.::.:: CCDS22 KLQEVGQVSVSLQRASGDFQTT-KLNGFEVF-ARFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYG 340 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 -DDFAGAVYIYHGDAGGIVPQYSMKLSGQKINPVLR-MFGQSISGGIDMDGNGYPDVTVG .: : :::..: . :. :. : :: . :: :..:. :.: :::::. :: CCDS22 GEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVG 400 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 AFMSDSVVLLRARPVITVDVSIFL-PGSINITAPQCH-DGQQ-PVNCLNVTTCFSFHGKH :: : ..: ::::::::.... . :. .: : : :.:.:: :.. :: CCDS22 AFGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKG 460 470 480 490 500 510 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 V-PEEIGLNYVLMADVAKKEKGQMPRVYFVLLGETMGQVTEKLQLTYME-ETCRHYVAHV : :...... :. : :.:: . :. : : ... .. .... .. :.. .:.. CCDS22 VLPRKLNFQVELLLD-KLKQKGAIRRALF-LYSRSPSH-SKNMTISRGGLMQCEELIAYL 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 K--RRVQDVISPIVFEAAYSLSEHVTGEEERELPPLTPVLRWKKGQKIAQKNQVRTLKLI . . .: ..::.. : : .. :. . : :. CCDS22 RDESEFRDKLTPITIFMEYRL-DYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQAHILLDCGEDNV 580 590 600 610 620 630 630 pF1KE3 LSTQGGSCTEQK CCDS22 CKPKLEVSVDSDQKKIYIGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNE 640 650 660 670 680 690 >>CCDS45291.1 ITGA11 gene_id:22801|Hs109|chr15 (1188 aa) initn: 641 init1: 304 opt: 695 Z-score: 823.1 bits: 163.4 E(33420): 1.6e-39 Smith-Waterman score: 695; 35.6% identity (64.2% similar) in 405 aa overlap (195-583:368-756) 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 IPSNLQAKGRTLIPCYEEYKKKYGEEHGSCQAGIAGFFTEELVVMGAPGSFYWAGTI--- :.:... .:. :..:: :.. : :.. CCDS45 LKDIVDALGDRIFSLEGTNKNETSFGLEMSQTGFSSHVVEDGVLLGAVGAYDWNGAVLKE 340 350 360 370 380 390 230 240 250 260 270 pF1KE3 ----KVLNLTDNTYLKLNDEVIMNRRYTYLGYAVTAGHFSHPSTIDVVGGAPQDKGIGKV ::. : . .::: : . :. .::::.::. :. . . :.:::. . ::: CCDS45 TSAGKVIPLRE-SYLKEFPEELKNHG-AYLGYTVTSVVSSRQGRV-YVAGAPRFNHTGKV 400 410 420 430 440 450 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 YIFRA-DRRSGTLIKIFQA-SGKKMGSYFGSSLCAVDLNGDGLSD-LLVGAPM-FSEIRD .: . :: : : :: :...:::::: . .::..:::..: ::::::: :.: :. CCDS45 ILFTMHNNRSLT---IHQAMRGQQIGSYFGSEITSVDIDGDGVTDVLLVGAPMYFNEGRE 460 470 480 490 500 510 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 EGQVTVYINRGNGALEEQLALTGDGAYNAHFGESIASLDDLDNDGFPDVAIGAPKEDDFA .:.: :: : : . . . . ::.:: ::::. ::..:.. ::..::: ::. : CCDS45 RGKVYVYELRQNLFVYNGTLKDSHSYQNARFGSSIASVRDLNQDSYNDVVVGAPLEDNHA 520 530 540 550 560 570 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 GAVYIYHGDAGGIVPQYSMKLSGQKINPVLRMFGQSISGGIDMDGNGYPDVTVGAFMSDS ::.::.:: :.:. ......... :..:: :: : .:.. .: :..:::. . CCDS45 GAIYIFHGFRGSILKTPKQRITASELATGLQYFGCSIHGQLDLNEDGLIDLAVGAL--GN 580 590 600 610 620 460 470 480 490 500 pF1KE3 VVLLRARPVITVDVSI-FLPGSINITAPQCHDGQQPVNCLNVTTCFS--FHGKHVPEE-I .:.: .:::. ...:. : :..::: .:. . . ..:: . ::. : . : . CCDS45 AVILWSRPVVQINASLHFEPSKINIFHRDCKRSGRDATCLAAFLCFTPIFLAPHFQTTTV 630 640 650 660 670 680 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 GLNYVLMADVAKKEKGQMPRVYFVLLGETMGQVTEK-LQLTYMEETCRHYVAHVKRRVQD :. : : :. ::.. : : . :.. . :. .: :.. :: . : CCDS45 GIRYNATMD----ERRYTPRAH---LDEGGDRFTNRAVLLSSGQELCERINFHVLD-TAD 690 700 710 720 730 740 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 VISPIVFEAAYSLSEHVTGEEERELPPLTPVLRWKKGQKIAQKNQVRTLKLILSTQGGSC ..:..: . ::: . CCDS45 YVKPVTFSVEYSLEDPDHGPMLDDGWPTTLRVSVPFWNGCNEDEHCVPDLVLDARSDLPT 750 760 770 780 790 800 >>CCDS8880.1 ITGA5 gene_id:3678|Hs109|chr12 (1049 aa) initn: 618 init1: 169 opt: 672 Z-score: 796.4 bits: 158.3 E(33420): 5e-38 Smith-Waterman score: 967; 32.4% identity (62.1% similar) in 649 aa overlap (7-614:19-641) 10 20 30 40 pF1KE3 MGGPAAPRGAGRLRALLLALVVAGIPAGAYNLDPQRPVHFQGPADSFF :: : ::: :. .:..::: . :. ..:: ::: CCDS88 MGSRTPESPLHAVQLRWGPRRRPPLLPLLLLLLPPPPRVGGFNLDAEAPAVLSGPPGSFF 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 GYAVLEHFHDNTRWV--LVGAPKADSKYSPSVKSPGAVFKCRVHTNPDRRCTELDMARGK :..: : .. .: : :::::::... .:.: . :::. : ..: . :: ... CCDS88 GFSV-EFYRPGTDGVSVLVGAPKANTS-QPGVLQGGAVYLCPWGASPTQ-CTPIEFDSKG 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 pF1KE3 NR------GTSCGKTCREDRDDEWMGVSLARQPKADGR-VLACA--HRWKNIYYEADHIL .: ..: :. : .. .:.:... .: : .:::: . :.. : . . 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CCDS88 IEDKAQILLDCGEDNICVPDLQLEVFGEQNHVYLGDKNALNLTFHAQNVGEGGAYEAELR 640 650 660 670 680 690 >>CCDS45461.1 ITGAL gene_id:3683|Hs109|chr16 (1086 aa) initn: 411 init1: 183 opt: 655 Z-score: 775.9 bits: 154.5 E(33420): 7e-37 Smith-Waterman score: 655; 33.1% identity (62.4% similar) in 420 aa overlap (196-601:269-671) 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 PSNLQAKGRTLIPCYEEYKKKYGEEHGSCQAGIAGFFTEELVVMGAPGSFYWAGTIKVL- .::.. ... .:.:: :. ::: . : CCDS45 DLFTELQKKIYVIEGTSKQDLTSFNMELSSSGISADLSRGHAVVGAVGAKDWAGGFLDLK 240 250 260 270 280 290 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 -NLTDNTYLKLNDEVIMNRRYTYLGYAVTAGHFSHPSTIDVVGGAPQDKGIGKVYIFRAD .: :.:.. :. . . : ::::.:: :. .: ...:::. . .:.: .:. 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