FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2519, 555 aa 1>>>pF1KE2519 555 - 555 aa - 555 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5517+/-0.000334; mu= 13.8014+/- 0.021 mean_var=106.9923+/-21.869, 0's: 0 Z-trim(117.3): 29 B-trim: 1633 in 1/54 Lambda= 0.123993 statistics sampled from 29167 (29197) to 29167 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.342), width: 16 Scan time: 8.350 The best scores are: opt bits E(85289) XP_011540171 (OMIM: 606713,608317) PREDICTED: grai ( 556) 3749 681.4 2e-195 NP_001181939 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like ( 556) 3749 681.4 2e-195 NP_937816 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like pr ( 602) 3749 681.4 2.2e-195 NP_067003 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like pr ( 607) 3749 681.4 2.2e-195 NP_937817 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like pr ( 626) 3513 639.2 1.1e-182 XP_011540172 (OMIM: 606713,608317) PREDICTED: grai ( 509) 3436 625.4 1.3e-178 XP_016859389 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead- ( 479) 1423 265.3 3.2e-70 XP_011508645 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead- ( 583) 1423 265.3 3.8e-70 XP_006711945 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead- ( 630) 1423 265.3 4e-70 XP_016859390 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead- ( 467) 1386 258.6 3.1e-68 NP_937825 (OMIM: 609786) grainyhead-like protein 1 ( 618) 1386 258.7 3.9e-68 XP_006711947 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead- ( 441) 1377 257.0 9e-68 NP_001317522 (OMIM: 608576,608641,616029) grainyhe ( 609) 1369 255.7 3.2e-67 XP_011515608 (OMIM: 608576,608641,616029) PREDICTE ( 609) 1369 255.7 3.2e-67 NP_079191 (OMIM: 608576,608641,616029) grainyhead- ( 625) 1369 255.7 3.2e-67 XP_005246216 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead- ( 429) 1340 250.4 8.7e-66 XP_011515609 (OMIM: 608576,608641,616029) PREDICTE ( 591) 1255 235.3 4.2e-61 XP_016859394 (OMIM: 609785) PREDICTED: transcripti ( 273) 352 73.5 9.6e-13 XP_016859393 (OMIM: 609785) PREDICTED: transcripti ( 273) 352 73.5 9.6e-13 XP_016859391 (OMIM: 609785) PREDICTED: transcripti ( 406) 352 73.6 1.3e-12 NP_055368 (OMIM: 609785) transcription factor CP2- ( 479) 352 73.7 1.5e-12 NP_001121632 (OMIM: 609784) upstream-binding prote ( 504) 351 73.5 1.8e-12 NP_055332 (OMIM: 609784) upstream-binding protein ( 540) 347 72.8 3.1e-12 NP_001121633 (OMIM: 609784) upstream-binding prote ( 540) 347 72.8 3.1e-12 NP_001166923 (OMIM: 189889) alpha-globin transcrip ( 501) 339 71.4 7.9e-12 NP_005644 (OMIM: 189889) alpha-globin transcriptio ( 502) 339 71.4 7.9e-12 >>XP_011540171 (OMIM: 606713,608317) PREDICTED: grainyhe (556 aa) initn: 3749 init1: 3749 opt: 3749 Z-score: 3629.4 bits: 681.4 E(85289): 2e-195 Smith-Waterman score: 3749; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:2-556) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILSSSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MMRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILSSSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 THLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 THLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLP 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 TTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 LKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 LKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 FDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 FDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNE 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 EAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 EAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAER 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 KMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFS 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 SLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTEEFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTEEFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEV 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 FDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 FDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLL 490 500 510 520 530 540 540 550 pF1KE2 DMGELDGKIQIILKEL :::::::::::::::: XP_011 DMGELDGKIQIILKEL 550 >>NP_001181939 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like pro (556 aa) initn: 3749 init1: 3749 opt: 3749 Z-score: 3629.4 bits: 681.4 E(85289): 2e-195 Smith-Waterman score: 3749; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:2-556) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILSSSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MMRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILSSSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 THLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 THLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLP 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 TTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 TTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 LKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 FDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 FDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNE 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 EAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 EAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAER 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 KMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 KMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFS 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 SLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTEEFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTEEFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEV 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 FDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 FDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLL 490 500 510 520 530 540 540 550 pF1KE2 DMGELDGKIQIILKEL :::::::::::::::: NP_001 DMGELDGKIQIILKEL 550 >>NP_937816 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like protei (602 aa) initn: 3749 init1: 3749 opt: 3749 Z-score: 3628.9 bits: 681.4 E(85289): 2.2e-195 Smith-Waterman score: 3749; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:48-602) 10 20 30 pF1KE2 MRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILS :::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 VNLQKFSYTSEDEAWKTYLENPLTAATKAMMRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILS 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 SSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 SSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEG 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 ALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 ALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDST 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 FKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 FKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQ 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 FYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 FYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDV 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 ADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQID :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 ADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQID 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 TYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 TYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSG 380 390 400 410 420 430 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 FRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 FRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTE 440 450 460 470 480 490 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 EFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 EFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYK 500 510 520 530 540 550 520 530 540 550 pF1KE2 VYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 VYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL 560 570 580 590 600 >>NP_067003 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like protei (607 aa) initn: 3749 init1: 3749 opt: 3749 Z-score: 3628.9 bits: 681.4 E(85289): 2.2e-195 Smith-Waterman score: 3749; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:53-607) 10 20 30 pF1KE2 MRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILS :::::::::::::::::::::::::::::: NP_067 VNLQKFSYTSEDEAWKTYLENPLTAATKAMMRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILS 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 SSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_067 SSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEG 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 ALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_067 ALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDST 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 FKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_067 FKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQ 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 FYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_067 FYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDV 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 ADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQID :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_067 ADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQID 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 TYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_067 TYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSG 390 400 410 420 430 440 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 FRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_067 FRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTE 450 460 470 480 490 500 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 EFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_067 EFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYK 510 520 530 540 550 560 520 530 540 550 pF1KE2 VYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_067 VYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL 570 580 590 600 >>NP_937817 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like protei (626 aa) initn: 3513 init1: 3513 opt: 3513 Z-score: 3400.5 bits: 639.2 E(85289): 1.1e-182 Smith-Waterman score: 3513; 100.0% identity (100.0% similar) in 518 aa overlap (1-518:48-565) 10 20 30 pF1KE2 MRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILS :::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 VNLQKFSYTSEDEAWKTYLENPLTAATKAMMRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILS 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 SSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 SSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEG 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 ALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 ALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDST 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 FKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 FKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQ 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 FYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 FYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDV 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 ADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQID :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 ADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQID 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 TYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 TYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSG 380 390 400 410 420 430 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 FRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 FRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTE 440 450 460 470 480 490 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 EFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_937 EFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYK 500 510 520 530 540 550 520 530 540 550 pF1KE2 VYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL :::::::: NP_937 VYKKCKRGETSLLHPRLSRHPPPDCLECSHPVTQVRNMGFGDGFWRQRDLDSNPSPTTVN 560 570 580 590 600 610 >>XP_011540172 (OMIM: 606713,608317) PREDICTED: grainyhe (509 aa) initn: 3436 init1: 3436 opt: 3436 Z-score: 3327.4 bits: 625.4 E(85289): 1.3e-178 Smith-Waterman score: 3436; 100.0% identity (100.0% similar) in 509 aa overlap (47-555:1-509) 20 30 40 50 60 70 pF1KE2 YDYYMGPKEKRILSSSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEY :::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEY 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KE2 PDLLKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 PDLLKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESI 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KE2 HGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 HGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHI 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 KSGESPMAYLNKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KSGESPMAYLNKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHW 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 HSRQPTAKQRVIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 HSRQPTAKQRVIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSS 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 QKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 QKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCP 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 DSSNSGVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 DSSNSGVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSS 340 350 360 370 380 390 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 NRLPLKRTCSPFTEEFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 NRLPLKRTCSPFTEEFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNA 400 410 420 430 440 450 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 ISEKYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 ISEKYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL 460 470 480 490 500 >>XP_016859389 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead-like (479 aa) initn: 1394 init1: 878 opt: 1423 Z-score: 1381.6 bits: 265.3 E(85289): 3.2e-70 Smith-Waterman score: 1423; 51.8% identity (75.1% similar) in 446 aa overlap (123-555:34-479) 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 PTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDSTFK ..: . .. : : .: .:: :::::. XP_016 HSIKTETQPHGFAVGIPPAVYHPEPTERVVVFDRNLNTDQFSSGAQAPNAQRRTPDSTFS 10 20 30 40 50 60 160 170 180 190 200 pF1KE2 DDPQESM---LFPDILKTSPEPPCPEDY--PSLK-SDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYL . .:.. .::. :. ::: :.. ..::::: . :... : :.: :.:: XP_016 ETFKEGVQEVFFPSDLSLRMPGMNSEDYVFDSVSGNNFEYTLEASKSLRQKPGDSTMTYL 70 80 90 100 110 120 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 NKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQR :::::::.::. ....:. .::.::.:::: ..: .::: ::.::::: ::::: XP_016 NKGQFYPITLKEVSSSEGIHHPISKVRSVIMVVFAEDKSREDQLRHWKYWHSRQHTAKQR 130 140 150 160 170 180 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 VIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLN ::.:: ::.:::. .:::.::::.::.:..:.::::::.::::::::::::::::.::: XP_016 CIDIADYKESFNTISNIEEIAYNAISFTWDINDEAKVFISVNCLSTDFSSQKGVKGLPLN 190 200 210 220 230 240 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 LQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSN-----S .:.:::. . ... :::: ::::.:::::::::.::.:::: .:: :::: :. : XP_016 IQVDTYSYNNRSNKPVHRAYCQIKVFCDKGAERKIRDEERKQSKRKGKCPDPSSQVNAFS 250 260 270 280 290 300 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 GVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLP- :: :: . . . : ..: ::.: ::::::.:::..:::. . : :. .. XP_016 DVKVPLLPSHKRMDITVFKPFIDLDTQPVLFIPDVHFANLQRGTHVLPIASEELEGEGSV 310 320 330 340 350 360 450 460 470 480 490 pF1KE2 LKRTCSPFTEEFEPLPS-KQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISE ::: ..: :: : :. . .:::::::.:.::::::::::::.:::: .:::. XP_016 LKRGPYGTEDDFAVPPSTKLARIEEPKRVLLYVRKESEEVFDALMLKTPSLKGLMEAISD 370 380 390 400 410 420 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 KYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL :: :...: :..::::.:::::::.::..::::. .: :.. : :. .. : :. XP_016 KYDVPHDKIGKIFKKCKKGILVNMDDNIVKHYSNEDTFQLQIEEAGGSYKLTLTEI 430 440 450 460 470 >>XP_011508645 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead-like (583 aa) initn: 1504 init1: 878 opt: 1423 Z-score: 1380.4 bits: 265.3 E(85289): 3.8e-70 Smith-Waterman score: 1509; 45.1% identity (69.0% similar) in 583 aa overlap (1-555:2-583) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILSSSTGGRN---DQGKRYYHGMEYETDL-TP : .:::.::.:::..::::: :.:.: ... .. :..:: . : : . XP_011 MMSINGDEDSAAALGLLYDYYKVPRERRSSTAKPEVEHPEPDHSKRNSIPIVTEQPLISA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE2 LESPTHLMKFLTENVS-------GTPEYPDLLKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKL :. ....: . :. : . : .. ... : : .. . : . XP_011 GENRVQVLKNVPFNIVLPHGNQLGIDKRGHLTAPDTTVTVSIAT-MPTHSIKTETQPHGF 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 EAGSVDSYLLPTTD----MYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESM---LF .: . : ..: . .. : : .: .:: :::::.. .:.. .: XP_011 AVGIPPAVYHPEPTERVVVFDRNLNTDQFSSGAQAPNAQRRTPDSTFSETFKEGVQEVFF 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KE2 PDILKTSPEPPCPEDY--PSLK-SDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQFYPVTLRT :. :. ::: :.. ..::::: . :... : :.: :.:::::::::.::. XP_011 PSDLSLRMPGMNSEDYVFDSVSGNNFEYTLEASKSLRQKPGDSTMTYLNKGQFYPITLKE 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 PAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDVADCKENFN ....:. .::.::.:::: ..: .::: ::.::::: ::::: ::.:: ::.:: XP_011 VSSSEGIHHPISKVRSVIMVVFAEDKSREDQLRHWKYWHSRQHTAKQRCIDIADYKESFN 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 TVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGT :. .:::.::::.::.:..:.::::::.::::::::::::::::.:::.:.:::. . . XP_011 TISNIEEIAYNAISFTWDINDEAKVFISVNCLSTDFSSQKGVKGLPLNIQVDTYSYNNRS 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 ERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSN-----SGVKGCLLSGFRG .. :::: ::::.:::::::::.::.:::: .:: :::: :. : :: :: . . XP_011 NKPVHRAYCQIKVFCDKGAERKIRDEERKQSKRKGKCPDPSSQVNAFSDVKVPLLPSHKR 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 NETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLP-LKRTCSPFTEEF . : ..: ::.: ::::::.:::..:::. . : :. .. ::: ..: XP_011 MDITVFKPFIDLDTQPVLFIPDVHFANLQRGTHVLPIASEELEGEGSVLKRGPYGTEDDF 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 EPLPS-KQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYKV :: : :. . .:::::::.:.::::::::::::.:::: .:::.:: :...: :. XP_011 AVPPSTKLARIEEPKRVLLYVRKESEEVFDALMLKTPSLKGLMEAISDKYDVPHDKIGKI 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 pF1KE2 YKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL .::::.:::::::.::..::::. .: :.. : :. .. : :. XP_011 FKKCKKGILVNMDDNIVKHYSNEDTFQLQIEEAGGSYKLTLTEI 540 550 560 570 580 >>XP_006711945 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead-like (630 aa) initn: 1504 init1: 878 opt: 1423 Z-score: 1379.9 bits: 265.3 E(85289): 4e-70 Smith-Waterman score: 1509; 45.1% identity (69.0% similar) in 583 aa overlap (1-555:49-630) 10 20 30 pF1KE2 MRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILS : .:::.::.:::..::::: :.:.: . XP_006 LYPQRRSYTSEDEAWKSFLENPLTAATKAMMSINGDEDSAAALGLLYDYYKVPRERRSST 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 pF1KE2 SSTGGRN---DQGKRYYHGMEYETDL-TPLESPTHLMKFLTENVS-------GTPEYPDL .. .. :..:: . : : . :. ....: . :. : . : XP_006 AKPEVEHPEPDHSKRNSIPIVTEQPLISAGENRVQVLKNVPFNIVLPHGNQLGIDKRGHL 80 90 100 110 120 130 80 90 100 110 120 130 pF1KE2 LKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTD----MYDNGSLNSLFES .. ... : : .. . : . .: . : ..: . .. : : XP_006 TAPDTTVTVSIAT-MPTHSIKTETQPHGFAVGIPPAVYHPEPTERVVVFDRNLNTDQFSS 140 150 160 170 180 190 140 150 160 170 180 pF1KE2 IHGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESM---LFPDILKTSPEPPCPEDY--PSLK-SDFEYTLG .: .:: :::::.. .:.. .::. :. ::: :.. ..::::: XP_006 GAQAPNAQRRTPDSTFSETFKEGVQEVFFPSDLSLRMPGMNSEDYVFDSVSGNNFEYTLE 200 210 220 230 240 250 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 SPKAIHIKSGESPMAYLNKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQ . :... : :.: :.:::::::::.::. ....:. .::.::.:::: ..: .: XP_006 ASKSLRQKPGDSTMTYLNKGQFYPITLKEVSSSEGIHHPISKVRSVIMVVFAEDKSREDQ 260 270 280 290 300 310 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 LRFWKHWHSRQPTAKQRVIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNC :: ::.::::: ::::: ::.:: ::.:::. .:::.::::.::.:..:.::::::.::: XP_006 LRHWKYWHSRQHTAKQRCIDIADYKESFNTISNIEEIAYNAISFTWDINDEAKVFISVNC 320 330 340 350 360 370 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 LSTDFSSQKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQF :::::::::::::.:::.:.:::. . ... :::: ::::.:::::::::.::.:::: XP_006 LSTDFSSQKGVKGLPLNIQVDTYSYNNRSNKPVHRAYCQIKVFCDKGAERKIRDEERKQS 380 390 400 410 420 430 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 RRKVKCPDSSN-----SGVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRS .:: :::: :. : :: :: . . . : ..: ::.: ::::::.:::..:::. XP_006 KRKGKCPDPSSQVNAFSDVKVPLLPSHKRMDITVFKPFIDLDTQPVLFIPDVHFANLQRG 440 450 460 470 480 490 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 GGAAPSAGPSSSNRLP-LKRTCSPFTEEFEPLPS-KQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDA . : :. .. ::: ..: :: : :. . .:::::::.:.:::::: XP_006 THVLPIASEELEGEGSVLKRGPYGTEDDFAVPPSTKLARIEEPKRVLLYVRKESEEVFDA 500 510 520 530 540 550 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 LMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMG ::::::.:::: .:::.:: :...: :..::::.:::::::.::..::::. .: :.. XP_006 LMLKTPSLKGLMEAISDKYDVPHDKIGKIFKKCKKGILVNMDDNIVKHYSNEDTFQLQIE 560 570 580 590 600 610 550 pF1KE2 ELDGKIQIILKEL : :. .. : :. XP_006 EAGGSYKLTLTEI 620 630 >>XP_016859390 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead-like (467 aa) initn: 1236 init1: 848 opt: 1386 Z-score: 1346.0 bits: 258.6 E(85289): 3.1e-68 Smith-Waterman score: 1386; 51.5% identity (74.8% similar) in 441 aa overlap (123-555:34-467) 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 PTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDSTFK ..: . .. : : .: .:: :::::. XP_016 HSIKTETQPHGFAVGIPPAVYHPEPTERVVVFDRNLNTDQFSSGAQAPNAQRRTPDSTFS 10 20 30 40 50 60 160 170 180 190 200 pF1KE2 DDPQESM---LFPDILKTSPEPPCPEDY--PSLK-SDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYL . .:.. .::. :. ::: :.. ..::::: . :... : :.: :.:: XP_016 ETFKEGVQEVFFPSDLSLRMPGMNSEDYVFDSVSGNNFEYTLEASKSLRQKPGDSTMTYL 70 80 90 100 110 120 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 NKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQR :::::::.::. ....:. .::.::.:::: ..: .::: ::.::::: ::::: XP_016 NKGQFYPITLKEVSSSEGIHHPISKVRSVIMVVFAEDKSREDQLRHWKYWHSRQHTAKQR 130 140 150 160 170 180 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 VIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLN ::.:: ::.:::. .:::.::::.::.:..:.::::::.::::::::::::::::.::: XP_016 CIDIADYKESFNTISNIEEIAYNAISFTWDINDEAKVFISVNCLSTDFSSQKGVKGLPLN 190 200 210 220 230 240 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 LQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGC .:.:::. . ... :::: ::::.:::::::::.::.:::: .::: : :: XP_016 IQVDTYSYNNRSNKPVHRAYCQIKVFCDKGAERKIRDEERKQSKRKV-------SDVKVP 250 260 270 280 290 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 LLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLP-LKRTC :: . . . : ..: ::.: ::::::.:::..:::. . : :. .. ::: XP_016 LLPSHKRMDITVFKPFIDLDTQPVLFIPDVHFANLQRGTHVLPIASEELEGEGSVLKRGP 300 310 320 330 340 350 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 SPFTEEFEPLPS-KQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFP ..: :: : :. . .:::::::.:.::::::::::::.:::: .:::.:: : XP_016 YGTEDDFAVPPSTKLARIEEPKRVLLYVRKESEEVFDALMLKTPSLKGLMEAISDKYDVP 360 370 380 390 400 410 510 520 530 540 550 pF1KE2 EENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL ...: :..::::.:::::::.::..::::. .: :.. : :. .. : :. XP_016 HDKIGKIFKKCKKGILVNMDDNIVKHYSNEDTFQLQIEEAGGSYKLTLTEI 420 430 440 450 460 555 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 03:15:20 2016 done: Tue Nov 8 03:15:22 2016 Total Scan time: 8.350 Total Display time: 0.070 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]