FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6484, 621 aa 1>>>pF1KE6484 621 - 621 aa - 621 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5588+/-0.000419; mu= 17.7136+/- 0.026 mean_var=73.1128+/-14.932, 0's: 0 Z-trim(110.9): 45 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.149995 statistics sampled from 19256 (19297) to 19256 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16 Scan time: 6.120 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001310502 (OMIM: 616476) cytosolic carboxypepti ( 506) 753 172.9 2.5e-42 NP_001310503 (OMIM: 616476) cytosolic carboxypepti ( 515) 753 172.9 2.5e-42 XP_011516722 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c ( 871) 702 162.0 8.1e-39 XP_016870038 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c ( 917) 702 162.0 8.5e-39 XP_016870037 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c ( 961) 702 162.0 8.8e-39 XP_016870036 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c (1064) 702 162.0 9.6e-39 XP_016870035 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c (1068) 702 162.0 9.6e-39 XP_005251906 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c (1108) 702 162.0 9.9e-39 XP_016870034 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c (1142) 702 162.0 1e-38 XP_011516720 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c (1182) 702 162.0 1e-38 NP_056054 (OMIM: 606830) cytosolic carboxypeptidas (1186) 702 162.0 1.1e-38 XP_005251905 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c (1226) 702 162.0 1.1e-38 NP_001317630 (OMIM: 606830) cytosolic carboxypepti (1226) 702 162.0 1.1e-38 XP_016870033 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic c (1226) 702 162.0 1.1e-38 NP_001273646 (OMIM: 606830) cytosolic carboxypepti (1238) 702 162.0 1.1e-38 NP_001273644 (OMIM: 606830) cytosolic carboxypepti (1278) 702 162.0 1.1e-38 XP_016858086 (OMIM: 616476) PREDICTED: cytosolic c ( 464) 627 145.6 3.7e-34 XP_016858085 (OMIM: 616476) PREDICTED: cytosolic c ( 490) 627 145.6 3.9e-34 XP_016858084 (OMIM: 616476) PREDICTED: cytosolic c ( 491) 627 145.6 3.9e-34 NP_001310504 (OMIM: 616476) cytosolic carboxypepti ( 494) 627 145.6 3.9e-34 NP_116174 (OMIM: 616476) cytosolic carboxypeptidas ( 503) 627 145.6 4e-34 XP_011519530 (OMIM: 615496,615523) PREDICTED: cyto ( 795) 494 116.9 2.7e-25 XP_016877409 (OMIM: 615496,615523) PREDICTED: cyto ( 862) 494 116.9 2.9e-25 XP_011519529 (OMIM: 615496,615523) PREDICTED: cyto (1057) 494 117.0 3.4e-25 XP_016877407 (OMIM: 615496,615523) PREDICTED: cyto (1110) 494 117.0 3.5e-25 NP_689549 (OMIM: 615496,615523) cytosolic carboxyp (1112) 494 117.0 3.5e-25 XP_011519528 (OMIM: 615496,615523) PREDICTED: cyto (1121) 494 117.0 3.6e-25 XP_016877408 (OMIM: 615496,615523) PREDICTED: cyto (1093) 475 112.9 6e-24 XP_011540610 (OMIM: 616476) PREDICTED: cytosolic c ( 531) 393 95.0 7.2e-19 XP_016858087 (OMIM: 616476) PREDICTED: cytosolic c ( 258) 379 91.8 3.2e-18 XP_016877410 (OMIM: 615496,615523) PREDICTED: cyto ( 725) 358 87.5 1.8e-16 XP_011540612 (OMIM: 616476) PREDICTED: cytosolic c ( 270) 299 74.5 5.5e-13 NP_001030584 (OMIM: 615900,617023) cytosolic carbo ( 717) 282 71.0 1.6e-11 XP_005264534 (OMIM: 615900,617023) PREDICTED: cyto ( 805) 282 71.1 1.7e-11 XP_011531313 (OMIM: 615900,617023) PREDICTED: cyto ( 886) 282 71.1 1.9e-11 NP_068603 (OMIM: 615900,617023) cytosolic carboxyp ( 886) 282 71.1 1.9e-11 XP_011531315 (OMIM: 615900,617023) PREDICTED: cyto ( 886) 282 71.1 1.9e-11 XP_011531314 (OMIM: 615900,617023) PREDICTED: cyto ( 886) 282 71.1 1.9e-11 >>NP_001310502 (OMIM: 616476) cytosolic carboxypeptidase (506 aa) initn: 620 init1: 342 opt: 753 Z-score: 881.0 bits: 172.9 E(85289): 2.5e-42 Smith-Waterman score: 827; 34.5% identity (63.9% similar) in 441 aa overlap (151-569:21-449) 130 140 150 160 170 pF1KE6 TQPLYPDSKEATVVYLAEDAYKEPCFVYSRVGGNRTP-LKQPVDY----RDNTLMFEARF .::: . . :. : . . :.:.: : NP_001 MAEGSQSAPEAGNDMGNDDAIGGNVSKYIVLPTGYCGQPKKGHLIFDACF 10 20 30 40 50 180 190 200 210 220 pF1KE6 ESGNLQKVVKVAEYEYQLTVRPDLFTNKHTQWYYFQVTNMRAG----------IVYR--F ::::: .: .:.:.::.: .::: . . :. : : :.. . .: : : NP_001 ESGNLGRVDQVSEFEYDLFIRPDTCNPRFRVWFNFTVENVKESQVREIVDTFRVVLRVIF 60 70 80 90 100 110 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 TIVNFTKPASLYSRGMRPLFYSEKEAKAHHIGWQRIGDQIKYYRNNPGQDGRHYFSLTWT .::::.: ::: :: :. : .. : :::. . :: : : :. . .... 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XP_011 YT-----IPEEGDILKFNSKFESGNLRKVIQIRKNEYDLILNSDINSNHYHQWFYFEVSG 350 360 370 380 390 400 220 230 240 250 260 pF1KE6 MRAGIVYRFTIVNFTKPASLYSRGMRPLFYSEKEAKAHHIGWQRIGDQIKYYRNN----- :: :..:::.:.: : : .. ::.::.:: .:: . : :.: .: ::.:. XP_011 MRPGVAYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNARPWWIRMGTDICYYKNHFSRSS 410 420 430 440 450 460 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 ---PGQDGRHYFSLTWTFQFPHNKDTCYFAHCYPYTYTNLQEYLSGINN--DPVRSKFCK :: :. :...:.: .:::. :.::::. :::::..:: .:. ... .: . : : XP_011 VAAGGQKGKSYYTITFTVNFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRK 470 480 490 500 510 520 330 340 350 360 370 pF1KE6 IRVLCHTLARNMVYILTITT-PLKN-----SDSRKRKAVILTARVHPGETNSSWIMKGFL :::.::. : ..:::. : .: :.: :.:.:::::::::.::.::: : XP_011 -DVLCETLSGNSCPLVTITAMPESNYYEHICHFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTL 530 540 550 560 570 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 DYILGNSSDAQLLRDTFVFKVVPMLNPDGVIVGNYRCSLAGRDLNRNYTSLLKESFPSVW .:...:. :: ::....::.:::::::::: ::.::::.:.::::.. : . :... 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XP_011 RTLPKILSHIAP-AFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGCDQGKY 700 710 720 730 740 750 550 560 570 580 590 600 pF1KE6 RGTHFSTKDLESMGYHFCDSLLDYCDPDRTKYYRCLKELEEMERHITLEKVFEDSDTPVI .: ...:..:: :: .:: .:: XP_011 KGLQIGTRELEEMGAKFCVGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESSCKVTSPTTYV 760 770 780 790 800 810 >>XP_016870038 (OMIM: 606830) PREDICTED: cytosolic carbo (917 aa) initn: 1034 init1: 386 opt: 702 Z-score: 817.5 bits: 162.0 E(85289): 8.5e-39 Smith-Waterman score: 1219; 39.5% identity (66.9% similar) in 532 aa overlap (67-567:357-870) 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 CALLTADSFGDPFFPRTTQILLEYQLGRWVPRLREPRDLYGVSSSGPLSPTRWPYHCEVI : :..: ::: .. : : . :: XP_016 LCCTGVETEDDEDTESNSSVEQASVEVPDGPTLHDP-DLYIEIVKNTKSV---PEYSEVA 330 340 350 360 370 380 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 -DEKVQHIDWTPSCPEPVYI-PTGLETQPLYPDSKEATVVYLAEDAYKEPCFVYSRVGGN . :: : ::. : :.. . : .. ... .. . ::. . : XP_016 YPDYFGHIP--PPFKEPILERPYGVQRTKIAQDIER--LIHQSDIIDR---VVYDLDNPN 390 400 410 420 430 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 RTPLKQPVDYRDNTLMFEARFESGNLQKVVKVAEYEYQLTVRPDLFTNKHTQWYYFQVTN : . . . : :...::::::.::... . ::.: . :. .:.. ::.::.:.. 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