FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5544, 381 aa 1>>>pF1KE5544 381 - 381 aa - 381 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8192+/-0.000483; mu= 8.7662+/- 0.029 mean_var=135.5426+/-27.386, 0's: 0 Z-trim(112.1): 119 B-trim: 25 in 1/52 Lambda= 0.110163 statistics sampled from 20738 (20867) to 20738 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16 Scan time: 7.210 The best scores are: opt bits E(85289) NP_062815 (OMIM: 606679) transient receptor potent ( 729) 2491 408.3 2.9e-113 NP_061116 (OMIM: 606680) transient receptor potent ( 765) 1912 316.3 1.5e-85 XP_011522225 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 531) 324 63.8 1.1e-09 XP_005256735 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 548) 324 63.8 1.1e-09 XP_016880221 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 585) 324 63.8 1.2e-09 XP_016880220 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 629) 324 63.9 1.2e-09 XP_005256734 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 630) 324 63.9 1.2e-09 XP_016880219 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 679) 324 63.9 1.3e-09 XP_006721606 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 680) 324 63.9 1.3e-09 XP_011522224 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 719) 324 63.9 1.4e-09 XP_006721604 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 733) 324 63.9 1.4e-09 XP_005256733 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 763) 324 63.9 1.4e-09 NP_057197 (OMIM: 606676) transient receptor potent ( 764) 324 63.9 1.4e-09 NP_671737 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18409 ( 811) 293 59.0 4.5e-08 XP_011536934 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 862) 293 59.0 4.7e-08 XP_011536938 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 603) 256 53.0 2.1e-06 XP_011536937 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 695) 256 53.1 2.4e-06 XP_011536936 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 793) 256 53.1 2.6e-06 NP_001170899 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 824) 256 53.1 2.7e-06 NP_001170902 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 837) 256 53.1 2.7e-06 NP_067638 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18409 ( 871) 256 53.2 2.8e-06 XP_016875263 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 871) 256 53.2 2.8e-06 XP_005253975 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 871) 256 53.2 2.8e-06 XP_011536933 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 875) 256 53.2 2.8e-06 XP_011536932 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 922) 256 53.2 2.9e-06 NP_001170904 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 764) 230 49.0 4.5e-05 XP_011536935 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 815) 230 49.0 4.7e-05 NP_659505 (OMIM: 607066,614594,616400) transient r ( 790) 215 46.6 0.00024 NP_001245134 (OMIM: 607066,614594,616400) transien ( 791) 215 46.6 0.00024 NP_542436 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 192 43.0 0.0032 NP_542437 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 192 43.0 0.0032 NP_061197 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 192 43.0 0.0032 NP_542435 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 192 43.0 0.0032 >>NP_062815 (OMIM: 606679) transient receptor potential (729 aa) initn: 2491 init1: 2491 opt: 2491 Z-score: 2154.5 bits: 408.3 E(85289): 2.9e-113 Smith-Waterman score: 2491; 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