FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2682, 659 aa 1>>>pF1KE2682 659 - 659 aa - 659 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4906+/-0.000894; mu= 13.7923+/- 0.054 mean_var=86.2018+/-16.803, 0's: 0 Z-trim(107.9): 59 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.138139 statistics sampled from 9801 (9861) to 9801 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16 Scan time: 3.870 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 765) 4326 872.3 0 CCDS1542.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 750) 4269 860.9 0 CCDS1541.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 856) 4269 861.0 0 CCDS58062.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 667) 3495 706.7 2.7e-203 CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 ( 980) 798 169.2 2.4e-41 CCDS64710.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1226) 744 158.5 5.1e-38 CCDS5627.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1283) 744 158.5 5.3e-38 CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 ( 893) 719 153.5 1.2e-36 CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 ( 806) 665 142.7 1.9e-33 CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 ( 403) 599 129.4 9.4e-30 CCDS31956.1 KATNAL1 gene_id:84056|Hs108|chr13 ( 490) 593 128.3 2.6e-29 CCDS11859.1 AFG3L2 gene_id:10939|Hs108|chr18 ( 797) 587 127.2 9e-29 CCDS6343.1 ATAD2 gene_id:29028|Hs108|chr8 (1390) 586 127.0 1.7e-28 CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11 ( 439) 577 125.1 2.1e-28 CCDS10977.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 795) 578 125.4 3.1e-28 CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 367) 572 124.0 3.6e-28 CCDS46076.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 387) 572 124.1 3.8e-28 CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 418) 572 124.1 4e-28 CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 440) 572 124.1 4.2e-28 CCDS5217.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 491) 558 121.3 3.2e-27 CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 398) 555 120.7 4e-27 CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 406) 555 120.7 4.1e-27 CCDS46227.1 ATAD2B gene_id:54454|Hs108|chr2 (1458) 550 119.9 2.6e-26 CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7 ( 433) 535 116.7 6.9e-26 CCDS11983.1 VPS4B gene_id:9525|Hs108|chr18 ( 444) 532 116.1 1.1e-25 CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 ( 674) 533 116.4 1.4e-25 CCDS58072.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 683) 528 115.4 2.7e-25 CCDS7151.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 716) 528 115.4 2.8e-25 CCDS7152.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 773) 528 115.4 3e-25 CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 584) 522 114.2 5.4e-25 CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 616) 522 114.2 5.7e-25 CCDS7386.1 ATAD1 gene_id:84896|Hs108|chr10 ( 361) 513 112.3 1.2e-24 CCDS45517.1 VPS4A gene_id:27183|Hs108|chr16 ( 437) 509 111.5 2.5e-24 CCDS10123.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 753) 474 104.6 5.2e-22 CCDS81877.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 620) 462 102.2 2.3e-21 CCDS32828.1 KATNAL2 gene_id:83473|Hs108|chr18 ( 466) 449 99.6 1.1e-20 CCDS2221.2 FIGN gene_id:55137|Hs108|chr2 ( 759) 414 92.7 2.1e-18 CCDS10978.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 489) 367 83.2 9.2e-16 CCDS56456.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 311) 363 82.4 1.1e-15 CCDS42354.1 NSF gene_id:4905|Hs108|chr17 ( 744) 330 75.9 2.2e-13 >>CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 (765 aa) initn: 4326 init1: 4326 opt: 4326 Z-score: 4657.4 bits: 872.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4326; 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96.0% identity (96.0% similar) in 667 aa overlap (20-659:1-667) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MEDYPDPQDSKDSSLLESDMKRKGKLKNKGSKRKKEDLQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEF ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MKRKGKLKNKGSKRKKEDLQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEF 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 QISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHPEVYHHLGVVPPRGVLLHGPPGCGKTLLAHA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 QISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHPEVYHHLGVVPPRGVLLHGPPGCGKTLLAHA 50 60 70 80 90 100 130 140 150 pF1KE2 IAG---------------------------ELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLRELF ::: :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 IAGAECSGMITAHCSFDFSGSNDPPASASQELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLRELF 110 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 EQAVSNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVAQLLTCMDDLNNVAATARVLVIGAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 EQAVSNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVAQLLTCMDDLNNVAATARVLVIGAT 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 NRPDSLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 NRPDSLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFV 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 GADLMALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 GADLMALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQR 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 LLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREGFVTVPNVTWADIGALEDIR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 LLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREGFVTVPNVTWADIGALEDIR 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 EELTMAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 EELTMAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPE 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 LLNMYVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVNQLLTEMD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 LLNMYVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVNQLLTEMD 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 GLEARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 GLEARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPL 530 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 DADVNLEAIAGDLRCDCYTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGELKVSHKHFEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 DADVNLEAIAGDLRCDCYTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGELKVSHKHFEE 590 600 610 620 630 640 640 650 pF1KE2 AFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR :::::::::::::::::::::::::: CCDS58 AFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR 650 660 >>CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 (980 aa) initn: 511 init1: 360 opt: 798 Z-score: 855.8 bits: 169.2 E(32554): 2.4e-41 Smith-Waterman score: 1000; 35.1% identity (61.4% similar) in 598 aa overlap (72-658:437-978) 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 DGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHPEVYHHLGVVPP : . ..:.: .: .: :. CCDS48 TSLYMVGSTLSPVPWLPSEESTLWSSLSPPGLEALVSELCAVLKPRLQPGGALLTGT--- 410 420 430 440 450 460 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 RGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLRELFEQAVSNAP .:::.:::::::: .. : ..: : .::: . . :: : ::. .: .: : CCDS48 SSVLLRGPPGCGKTTVVAAACSHLGLHLLKVPCSSLCAESSGAVETKLQAIFSRARRCRP 470 480 490 500 510 520 170 180 190 200 210 pF1KE2 CIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVA---QLLTCMDDLNNVAATARVLVIGATNRPDS .... .: . :. ..: :..: .:: : ::. ..:...:.: .. CCDS48 AVLLLTAVDLLGRDRDGLGEDA--RVMAVLRHLLLNEDPLNSCPP---LMVVATTSRAQD 530 540 550 560 570 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 LDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFVGADLM : .. : : .:. . .:..: ::..: .: : : .. .::. ::: .::. CCDS48 LPADVQTA--FPHELEVPALSEGQRLSILRALTAHLPLGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLY 580 590 600 610 620 630 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 ALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGLL :: ... : .:. :: . . :. :: :: CCDS48 ALLTHSSRAACTRI---------KNSGL----AGGLTEE-----------DE-------- 640 650 660 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 RDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKRE-GFVTVPNVTWADIGALEDIREELT .: :. . .:: :: ..: . .. : .:.:.: :.:.:.....:. CCDS48 ------GELCAAGFPLLAEDFGQALEQLQTAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVKKEIL 670 680 690 700 710 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 MAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPELLNM .: :...:. . .::: .:.:: :::: ::::::::::.: .:.:.:::::::.:: CCDS48 ETIQLPLEHPELL-SLGL-RRSGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINM 720 730 740 750 760 770 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 YVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRR--SDRETGASVRVVNQLLTEMDGL :::.::. ::.:: ::. .:::.:::::.:.: : : : :. :::.:::.:.::: CCDS48 YVGQSEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGL 780 790 800 810 820 830 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 EARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPLDA .. :.::...::::::..:::.:::::.:: .::: :: . :.... : :. CCDS48 HSTQDVFVIGATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVG--ANEDRASQLRVLSAITRKFKLEP 840 850 860 870 880 890 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 DVNLEAIAGDLRCDC---YTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGE--LKVSHKH .:.: . : : : ::::: .: .: ::.... . : : : : .. . CCDS48 SVSLVNV---LDC-CPPQLTGADLYSLCSDAMTAALKRRVHDLEEGLEPGSSALMLTMED 900 910 920 930 940 950 640 650 pF1KE2 FEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR . .: ... :.:... . :.:.:.... CCDS48 LLQAAARLQPSVSEQELLRYKRIQRKFAAC 960 970 980 >>CCDS64710.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1226 aa) initn: 1006 init1: 578 opt: 744 Z-score: 796.1 bits: 158.5 E(32554): 5.1e-38 Smith-Waterman score: 744; 45.9% identity (72.2% similar) in 266 aa overlap (358-622:756-1014) 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 QDELQRLLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREGFVTVP-NVTWADI :: :: . :.. : . : .. : : CCDS64 DFTVLVDRAIHSRLSRQSISTREKLVLTTLDFQKALRGFLPASLRSVNLHKPRDLGWDKI 730 740 750 760 770 780 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 GALEDIREELTMAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNF :.:...:. : .: :.. :. : : . .:.:: :::: :::::: ..: :: .:: CCDS64 GGLHEVRQILMDTIQLPAKYPELFANLPIRQRTGILLYGPPGTGKTLLAGVIARESRMNF 790 800 810 820 830 840 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 ISVKGPELLNMYVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVN :::::::::. :.: ::.:::..: ::. . ::..:::: ... :::. .::.. :::: CCDS64 ISVKGPELLSKYIGASEQAVRDIFIRAQAAKPCILFFDEFESIAPRRGHDNTGVTDRVVN 850 860 870 880 890 900 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 QLLTEMDGLEARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITK ::::..::.:. : :...:::.:::.::::.:::::::: .. : ..:: ::.... CCDS64 QLLTQLDGVEGLQGVYVLAATSRPDLIDPALLRPGRLDKCVYCPPPDQVSRLEILNVLSD 910 920 930 940 950 960 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 NGTKPPLDADVNLEAIAGDLRCDCYTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGELKV . :: ::.:. .:. : .:::::.::. .:.. ::. . .:: . : CCDS64 SL---PLADDVDLQHVAS--VTDSFTGADLKALLYNAQLEALHGMLL--SSGLQDGSSSS 970 980 990 1000 1010 630 640 650 pF1KE2 SHKHFEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR CCDS64 DSDLSLSSMVFLNHSSGSDDSAGDGECGLDQSLVSLEMSEILPDESKFNMYRLYFGSSYE 1020 1030 1040 1050 1060 1070 >>CCDS5627.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1283 aa) initn: 1006 init1: 578 opt: 744 Z-score: 795.8 bits: 158.5 E(32554): 5.3e-38 Smith-Waterman score: 799; 32.5% identity (58.5% similar) in 597 aa overlap (51-622:537-1071) 30 40 50 60 70 pF1KE2 KRKGKLKNKGSKRKKEDLQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGG-NDMTLKE :. ... ..: . .:. ..:: :.. .. CCDS56 WEKEKDKNIFLLSPNLLQKTTIQVLLDPMVKEENSEEIDFILPFLKLSSLGGVNSLGVSS 510 520 530 540 550 560 80 90 100 110 120 130 pF1KE2 VCKMLIH--MRHPEVYHHLGVVPP-RG--VLLHGPPGCGKTLLAHAIAGE----LDLPIL . . . : . .: . ...: :. .:: : : ::. ::.:: : :: . CCDS56 L-EHITHSLLGRPLSRQLMSLVAGLRNGALLLTGGKGSGKSTLAKAICKEAFDKLDAHVE 570 580 590 600 610 620 140 150 160 170 180 pF1KE2 KVAAPEIVSGVSGESEQKLREL-FEQAVSNAPCIIFIDEIDAIT-----PKREVASKDME .: . . : :. :: :. : .:: : ....:..: :. :..: . .. CCDS56 RVDC-KALRGKRLENIQKTLEVAFSEAVWMQPSVVLLDDLDLIAGLPAVPEHEHSPDAVQ 630 640 650 660 670 680 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 RRIVAQLLTCMDDLNNVAATARVLVIGATNRPDSLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRE . .:. :. : . .. . : .:.... .:: : : : :. . ..: CCDS56 SQRLAHALNDMIK-EFISMGSLVALIATSQSQQSLHPLLVSAQGVHIFQCVQHIQPPNQE 690 700 710 720 730 740 250 260 270 280 290 pF1KE2 RILQTLCR--KLRLP------QAFDFCHLAHLTPGFVGADLMALCREAAMCAVNRVLMKL . . :: : .: .:. :.:. : :::. :. .: :.:.. . CCDS56 QRCEILCNVIKNKLDCDINKFTDLDLQHVAKETGGFVARDFTVL--------VDRAIHS- 750 760 770 780 790 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 QEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIEL ::. . : :...: .: : CCDS56 ---------------------RLSRQSIS-TREKL--VLTTL------------------ 800 810 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 NDFIVALSSVQPSAKREGFVTVP-NVTWADIGALEDIREELTMAILAPVRNPDQFKALGL :: :: . :.. : . : .. : ::.:...:. : .: :.. :. : : . CCDS56 -DFQKALRGFLPASLRSVNLHKPRDLGWDKIGGLHEVRQILMDTIQLPAKYPELFANLPI 820 830 840 850 860 870 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 VTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPELLNMYVGESERAVRQVFQRAKN .:.:: :::: :::::: ..: :: .:::::::::::. :.: ::.:::..: ::. CCDS56 RQRTGILLYGPPGTGKTLLAGVIARESRMNFISVKGPELLSKYIGASEQAVRDIFIRAQA 880 890 900 910 920 930 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 SAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVNQLLTEMDGLEARQQVFIMAATNRPDIIDP . ::..:::: ... :::. .::.. ::::::::..::.:. : :...:::.:::.::: CCDS56 AKPCILFFDEFESIAPRRGHDNTGVTDRVVNQLLTQLDGVEGLQGVYVLAATSRPDLIDP 940 950 960 970 980 990 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 AILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPLDADVNLEAIAGDLRCDCYTGAD :.:::::::: .. : ..:: ::.... . :: ::.:. .:. : .:::: CCDS56 ALLRPGRLDKCVYCPPPDQVSRLEILNVLSDSL---PLADDVDLQHVAS--VTDSFTGAD 1000 1010 1020 1030 1040 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 LSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGELKVSHKHFEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQE :.::. .:.. ::. . .:: . : CCDS56 LKALLYNAQLEALHGMLL--SSGLQDGSSSSDSDLSLSSMVFLNHSSGSDDSAGDGECGL 1050 1060 1070 1080 1090 1100 >>CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 (893 aa) initn: 1428 init1: 570 opt: 719 Z-score: 771.4 bits: 153.5 E(32554): 1.2e-36 Smith-Waterman score: 1505; 41.4% identity (69.8% similar) in 613 aa overlap (49-655:337-886) 20 30 40 50 60 70 pF1KE2 DMKRKGKLKNKGSKRKKEDLQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLK ..:..: . .:... .. .:: . :: CCDS37 ERLLKFSIGAKCNTDTFYFISSTTRVNFTEIDKNSKEQDNQFKVT---YDMIGGLSSQLK 310 320 330 340 350 360 80 90 100 110 120 130 pF1KE2 EVCKML-IHMRHPEVYHHLGVVPPRGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEI . ... . ...::... :. ::::::.:::: :::..:.:.:.:. . . .::: CCDS37 AIREIIELPLKQPELFKSYGIPAPRGVLLYGPPGTGKTMIARAVANEVGAYVSVINGPEI 370 380 390 400 410 420 140 150 160 170 180 190 pF1KE2 VSGVSGESEQKLRELFEQAVSNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVAQLLTCMDD .: ::.: :::..: .:. : ::::::.::. :::: :....:.:.::.::: :: CCDS37 ISKFYGETEAKLRQIFAEATLRHPSIIFIDELDALCPKREGAQNEVEKRVVASLLTLMDG 430 440 450 460 470 480 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 LNNVAATARVLVIGATNRPDSLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLP ... .. ..:::.:::::: .:: :::: ::::.:: .:.:. .: ::: : : :.: CCDS37 IGSEVSEGQVLVLGATNRPHALDAALRRPGRFDKEIEIGVPNAQDRLDILQKLLR--RVP 490 500 510 520 530 540 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 QAF---DFCHLAHLTPGFVGADLMALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGV . . .. .::. . :.::::: .:: ::..::. :.: ::.:.. :. CCDS37 HLLTEAELLQLANSAHGYVGADLKVLCNEAGLCALRRIL-------KKQPNLPDV----- 550 560 570 580 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 QEERLGTEPTSETQDELQRLLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREG .. ::.. : :.::. :.....::: :: CCDS37 ------------------KVAGLVK--------------ITLKDFLQAMNDIRPSAMREI 590 600 610 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 FVTVPNVTWADIGALEDIREELTMAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLL . ::::.:.:::.::.:. .: .:. :...:..: .:. : :::: :::::.::.. CCDS37 AIDVPNVSWSDIGGLESIKLKLEQAVEWPLKHPESFIRMGIQPPKGVLLYGPPGCSKTMI 620 630 640 650 660 670 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 AKAVANESGLNFISVKGPELLNMYVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRS :::.::::::::...:::::.: ::::::::::..:..:. :: .:::::.::: .:. CCDS37 AKALANESGLNFLAIKGPELMNKYVGESERAVRETFRKARAVAPSIIFFDELDALAVERG 680 690 700 710 720 730 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 DRETGASV--RVVNQLLTEMDGLEARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLP . ...: ::. ::::::::.: ..: :.::::::: :: :..::::.:. ..: :: CCDS37 SSLGAGNVADRVLAQLLTEMDGIEQLKDVTILAATNRPDRIDKALMRPGRIDRIIYVPLP 740 750 760 770 780 790 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 PPADRLAILKTITKNGTKPPLDADVNLEAIAGDLRCDCYTGADLSALVREASICALRQEM : : :.: .. :.. .:.:. . :. : :.::.. :. :::.. ::.... CCDS37 DAATRREIFKLQFHSM---PVSNEVDLDELI--LQTDAYSGAEIVAVCREAALLALEEDI 800 810 820 830 840 850 620 630 640 650 pF1KE2 ARQKSGNEKGELKVSHKHFEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR ...: . ..:: .:.. : : .. . .:: :: CCDS37 --------QANL-IMKRHFTQALSTVTPRIPESLRRFYEDYQEKSGLHTL 860 870 880 890 >>CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 (806 aa) initn: 698 init1: 582 opt: 665 Z-score: 713.9 bits: 142.7 E(32554): 1.9e-33 Smith-Waterman score: 900; 43.4% identity (68.5% similar) in 362 aa overlap (59-419:195-511) 30 40 50 60 70 80 pF1KE2 KGSKRKKEDLQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKML-IHM : ....: ..:.:: : .. .:. . . CCDS65 VVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPL 170 180 190 200 210 220 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 RHPEVYHHLGVVPPRGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQ ::: ... .:: ::::.::.:::: ::::.:.:.:.: .. . .:::.: ..::::. CCDS65 RHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESES 230 240 250 260 270 280 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 KLRELFEQAVSNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVAQLLTCMDDLNNVAATARV .::. ::.: .::: ::::::.:::.:::: . ..:::::.:::: :: :.. :.: CCDS65 NLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQ---RAHV 290 300 310 320 330 340 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 LVIGATNRPDSLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAH .:..:::::.:.:::::: ::::::. .:::: ..: .::: ....: . :. ..:. CCDS65 IVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVAN 350 360 370 380 390 400 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 LTPGFVGADLMALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSET : : ::::: ::: :::. :. .:. .. :: CCDS65 ETHGHVGADLAALCSEAALQAI-----------RKKMDLIDL------------------ 410 420 430 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 QDELQRLLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPSAKREGFVTVPNVTWADIG .:: .. : :..: . ..:: :::. .::: :: : ::.::: ::: CCDS65 EDET------------IDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIG 440 450 460 470 480 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 ALEDIREELTMAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFI .:::...:: . ::..::.: .:. ::. CCDS65 GLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGM-TPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANF 490 500 510 520 530 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 SVKGPELLNMYVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDRETGASVRVVNQ CCDS65 ISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADR 540 550 560 570 580 590 >-- initn: 679 init1: 483 opt: 527 Z-score: 565.3 bits: 115.2 E(32554): 3.6e-25 Smith-Waterman score: 713; 47.5% identity (70.8% similar) in 257 aa overlap (420-659:513-764) 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 EDIREELTMAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISV :::. :::::::::::::.::: ::::. CCDS65 EDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISI 490 500 510 520 530 540 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 KGPELLNMYVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRRSDR---ETGASVRVVN ::::::.:. :::: ::..:..:...::::.::::.:.. :. ::. ::.: CCDS65 KGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVIN 550 560 570 580 590 600 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 QLLTEMDGLEARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITK :.::::::. ....:::..:::::::::::::::::::. ... :: .:.::::. CCDS65 QILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKA--- 610 620 630 640 650 570 580 590 600 610 pF1KE2 NGTKPPLDADVNLEAIAGDLRCDCYTGADLSAL--------VREASICALRQEMARQK-- : : :. ::.:: .: . ..::::. . .::. .:.: :: CCDS65 NLRKSPVAKDVDLEFLAK--MTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNP 660 670 680 690 700 710 620 630 640 650 pF1KE2 SGNEKGEL----KVSHKHFEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR :. : : .. . :::::.. .: :.: .: :: . ..:.. CCDS65 SAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGN 720 730 740 750 760 770 CCDS65 QGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG 780 790 800 >>CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 (403 aa) initn: 604 init1: 569 opt: 599 Z-score: 647.7 bits: 129.4 E(32554): 9.4e-30 Smith-Waterman score: 599; 40.5% identity (71.4% similar) in 227 aa overlap (64-289:143-369) 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 KKEDLQEVDGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKML-IHMRHPEV ::.. ..:: . ..:. ... . . .::. CCDS97 ALDMTTLTIMRYLPREVDPLVYNMSHEDPGNVSYSEIGGLSEQIRELREVIELPLTNPEL 120 130 140 150 160 170 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 YHHLGVVPPRGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLREL ....:..::.: ::.:::: ::::::.:.:..:: .:::.. ::. ::: . .::. CCDS97 FQRVGIIPPKGCLLYGPPGTGKTLLARAVASQLDCNFLKVVSSSIVDKYIGESARLIREM 180 190 200 210 220 230 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 FEQAVSNAPCIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVAQLLTCMDDLNNVAATARVLVIGA :. : .. :::::.:::::: .: . . .:.: :. ...... . :: .: : CCDS97 FNYARDHQPCIIFMDEIDAIGGRRFSEGTSADREIQRTLMELLNQMDGFDTLHRVKMIMA 240 250 260 270 280 290 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 TNRPDSLDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGF :::::.::::: : ::.::.: . .:.: .: ::. . .:. ...:. :: CCDS97 TNRPDTLDPALLRPGRLDRKIHIDLPNEQARLDILKIHAGPITKHGEIDYEAIVKLSDGF 300 310 320 330 340 350 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 VGADLMALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQ :::: .: ::.: :. CCDS97 NGADLRNVCTEAGMFAIRADHDFVVQEDFMKAVRKVADSKKLESKLDYKPV 360 370 380 390 400 659 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Mar 10 10:42:00 2017 done: Fri Mar 10 10:42:01 2017 Total Scan time: 3.870 Total Display time: 0.160 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]